1.一种用于检测患有或疑似患有癌症的受试者的一种或多种基因或蛋白质的表达水平的方法,所述方法包括:
a)从所述受试者获得生物样品;以及
b)检测所述生物样品中的所述一种或多种基因或蛋白质的所述表达水平,其中所述基因或蛋白质选自cd68、cd163、birc5、bst1、card11、ccl2、ccl3、ccl7、ccl24、ccne1、cd14、cd300e、cd86、cd93、cdk1、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、ehf、fut7、galm、gbp6、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il5、il6、il8、inhba、lap3、layn、loc100505585、mrpl11、nid1、ost4、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、tbx21、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、cxcl2、hamp、hsd11b1、itgam、lif、saa1、tfrc、tlr5、tnfrsf11a、tnfsf14、trem1、trem2、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh1、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、mif、notch1、nrp1、prkce、rora、tlr3、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、s100a8和/或wdr83os。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl2、ccl3、ccl7、cd300e、cd93、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl8、ecel1、has1、il-1β、il8、il23、inhba、padi2、pid1、ptgs2、scl747、serpinb2、st6galnac2和/或thbs1。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、serpinb2、il8和/或il-1β。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自il1β、ptgs2、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6和/或cxcl8。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os和/或tbx21。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ehf、fut7和/或ost4。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括ccl20和cx3cl1。
8.根据权利要求1到7中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il6。
9.根据权利要求1到8中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il8。
10.根据权利要求1到8中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd68。
11.根据权利要求1到8中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd163。
12.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl2、ccl3、ccl7、cd14、cd300e、cd86、cd93、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il6、il8、inhba、layn、loc100505585、nid1、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、hamp、hsd11b1、itgam、lif、s100a8、saa1、tfrc、tlr5、tnfsf14、trem2、birc5、bst1、card11、cdk1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、map2k2、prame、psmd7和/或tnfsf18。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自birc5、bst1、card11、cdk1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、map2k2、prame、psmd7和/或tnfsf18。
14.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os、tbx21、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、cd36、cdh1、mif、rora、tlr3和/或vegfa。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、cdh1、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、mif、pparg、rora、rorc、spa17、stat5b、tlr3和/或tollip。
16.根据权利要求1到15中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
17.根据权利要求1到16中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
18.根据权利要求17所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
19.根据权利要求1到18中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
20.根据权利要求1到19中任一项所述的方法,其进一步包括:
(c)将所述样品中的所述一种或多种基因或蛋白质的所述表达水平与合适对照物中的所述一种或多种基因或蛋白质的表达水平进行比较。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
22.根据权利要求1到21中任一项所述的方法,其进一步包括测定所述癌症中的cd68蛋白水平和/或cd163蛋白水平。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述cd68蛋白水平和/或所述cd163蛋白水平是通过免疫组织化学测定的。
24.一种治疗患有癌症的受试者的方法,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测所述生物样品中的一种或多种基因或蛋白质的表达水平,其中所述基因或蛋白质选自cd68、cd163、birc5、bst1、card11、ccl2、ccl3、ccl7、ccl24、ccne1、cd14、cd300e、cd86、cd93、cdk1、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、ehf、fut7、galm、gbp6、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il5、il6、il8、inhba、lap3、layn、loc100505585、mrpl11、nid1、ost4、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、tbx21、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、cxcl2、hamp、hsd11b1、itgam、lif、saa1、tfrc、tlr5、tnfrsf11a、tnfsf14、trem1、trem2、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh1、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、mif、notch1、nrp1、prkce、rora、tlr3、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、s100a8和/或wdr83os;以及
(c)向所述受试者施用有效量的腺苷途径抑制剂,由此治疗所述癌症。
25.根据权利要求24所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
26.根据权利要求25所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
27.根据权利要求24所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
28.根据权利要求27所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
29.根据权利要求24到28中任一项所述的方法,其进一步包括向所述受试者施用cxcr2抑制剂。
30.根据权利要求29所述的方法,其中所述cxcr2抑制剂选自azd5069、抗cxcr2抗体和纳瓦利辛(navarixin)。
31.根据权利要求24到30中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括ccl20和cx3cl1。
32.根据权利要求31所述的方法,其中高ccl20表达和低cx3cl1表达表明所述受试者是用所述腺苷途径抑制剂进行的治疗的候选者。
33.根据权利要求24到32中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il6。
34.根据权利要求33所述的方法,其中高il6表达表明所述受试者是用所述腺苷途径抑制剂进行的治疗的候选者。
35.根据权利要求24到34中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il8。
36.根据权利要求35所述的方法,其中高il8表达表明所述受试者是用所述腺苷途径抑制剂进行的治疗的候选者。
37.根据权利要求24到30中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl2、ccl3、ccl7、cd300e、cd93、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、ecel1、has1、il-1β、il8、il23、inhba、padi2、pid1、ptgs2、scl747、serpinb2、st6galnac2和/或thbs1。
38.根据权利要求37所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、serpinb2、il8和/或il-1β。
39.根据权利要求37所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自il1β、ptgs2、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6和/或cxcl8。
40.根据权利要求24到39中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd68。
41.根据权利要求24到39中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd163。
42.根据权利要求1到30任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os和/或tbx21。
43.根据权利要求42所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ehf、fut7和/或ost4。
44.根据权利要求1到30中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自birc5、bst1、c4bpa、card11、ccl11、cdk1、clec5a、cxcl1、cxcl2、cxcl6、lif、ptgs2、saa1、slc11a1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c1r、c1s、c2、ccl20、ccl8、cd14、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、il8、irak4、ly96、lyn、plaur、ripk2、stat2、stat3、tlr5、tnfsf14、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcl3、cxcl5、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7和/或tnfsf18。
45.根据权利要求1到30中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、cdh1、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、mif、pparg、rora、rorc、spa17、stat5b、tlr3和/或tollip。
46.根据权利要求1到45中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
47.根据权利要求1到46中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
48.根据权利要求47所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
49.根据权利要求1到48中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
50.根据权利要求24到49中任一项所述的方法,其进一步包括测定所述癌症中的cd68蛋白水平和/或cd163蛋白水平。
51.根据权利要求50所述的方法,其中所述cd68蛋白水平和/或所述cd163蛋白水平是通过免疫组织化学测定的。
52.一种用于选择用腺苷途径抑制剂进行的治疗的受试者的方法,所述受试者患有或疑似患有癌症,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测所述生物样品中的一种或多种基因或蛋白质的高表达水平,其中所述基因或蛋白质选自cd68、cd163、lbp、ccl2、ccl3、ccl7、cd14、cd300e、cd86、cd93、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il6、il8、inhba、layn、loc100505585、nid1、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、hamp、hsd11b1、itgam、lif、s100a8、saa1、tfrc、tlr5、tnfsf14、trem2、birc5、bst1、card11、cdk1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、map2k2、prame、psmd7和/或tnfsf18;以及
(c)选择所述受试者进行用腺苷途径抑制剂进行的治疗。
53.根据权利要求52所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il6。
54.根据权利要求52或53所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il8。
55.根据权利要求52所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl2、ccl3、ccl7、cd300e、cd93、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl8、ecel1、has1、il-1β、il8、il23、inhba、padi2、pid1、ptgs2、scl747、serpinb2、st6galnac2和/或thbs1。
56.根据权利要求52到55中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自birc5、bst1、c4bpa、card11、ccl11、cdk1、clec5a、cxcl1、cxcl2、cxcl6、lif、ptgs2、saa1、slc11a1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c1r、c1s、c2、ccl20、ccl8、cd14、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、il8、irak4、ly96、lyn、plaur、ripk2、stat2、stat3、tlr5、tnfsf14、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcl3、cxcl5、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7和/或tnfsf18。
57.根据权利要求52到56中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd68。
58.根据权利要求52到56中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd163。
59.根据权利要求52到58中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
60.根据权利要求57所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
61.根据权利要求52到60中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
62.根据权利要求61所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
63.根据权利要求52到62中任一项所述的方法,其中对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
64.根据权利要求52到63中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
65.根据权利要求52到64中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
66.根据权利要求65所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
67.根据权利要求52到66中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
68.根据权利要求53到67中任一项所述的方法,其进一步包括测定所述癌症中的cd68蛋白水平和/或cd163蛋白水平。
69.根据权利要求68所述的方法,其中所述cd68蛋白水平和/或所述cd163蛋白水平是通过免疫组织化学测定的。
70.一种用于选择用腺苷途径抑制剂进行的治疗的受试者的方法,所述受试者患有或疑似患有癌症,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;以及
(b)检测所述生物样品中的一种或多种基因或蛋白质的低表达水平,其中所述基因或蛋白质选自ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os、tbx21、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、cd36、cdh1、mif、rora、tlr3和/或vegfa;以及
(c)选择所述受试者进行用腺苷途径抑制剂进行的治疗。
71.根据权利要求70所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ehf、fut7和/或ost4。
72.根据权利要求70所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、cdh1、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、mif、pparg、rora、rorc、spa17、stat5b、tlr3和/或tollip。
73.根据权利要求70到72中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
74.根据权利要求73所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
75.根据权利要求70到74中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
76.根据权利要求75所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
77.根据权利要求70到76中任一项所述的方法,其中对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
78.根据权利要求70到77中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
79.根据权利要求70到78中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
80.根据权利要求79所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
81.根据权利要求70到80中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
82.根据权利要求24所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自cd68、cd163、lbp、ccl2、ccl3、ccl7、cd14、cd300e、cd86、cd93、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il6、il8、inhba、layn、loc100505585、nid1、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、hamp、hsd11b1、itgam、lif、s100a8、saa1、tfrc、tlr5、tnfsf14、birc5、bst1、card11、cdk1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18和/或trem21;其中所述一种或多种基因或蛋白质的表达水平高于对照物的表达水平表明所述受试者是用腺苷途径抑制剂进行的治疗的候选者。
83.根据权利要求82所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il6。
84.根据权利要求82或83所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il8。
85.根据权利要求82到84中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl2、ccl3、ccl7、cd300e、cd93、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl8、ecel1、has1、il-1β、il8、il23、inhba、padi2、pid1、ptgs2、scl747、serpinb2、st6galnac2和/或thbs1。
86.根据权利要求82到85中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自birc5、bst1、c4bpa、card11、ccl11、cdk1、clec5a、cxcl1、cxcl2、cxcl6、lif、ptgs2、saa1、slc11a1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c1r、c1s、c2、ccl20、ccl8、cd14、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、il8、irak4、ly96、lyn、plaur、ripk2、stat2、stat3、tlr5、tnfsf14、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcl3、cxcl5、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7和tnfsf18。
87.根据权利要求82到86中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd68。
88.根据权利要求82到87中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括cd163。
89.根据权利要求82到88中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
90.根据权利要求82到87中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
91.根据权利要求90所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
92.根据权利要求82到91中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
93.根据权利要求82到92中任一项所述的方法,其中对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
94.根据权利要求82到93中任一项所述的方法,其进一步包括测定所述癌症中的cd68蛋白水平和/或cd163蛋白水平。
95.根据权利要求94所述的方法,其中所述cd68蛋白水平和/或所述cd163蛋白水平是通过免疫组织化学测定的。
96.根据权利要求24所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os、tbx21、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、cd36、cdh1、mif、rora、tlr3和/或vegfa,其中所述一种或多种基因或蛋白质的表达水平低于对照物的表达水平表明所述受试者是用腺苷途径抑制剂进行的治疗的候选者。
97.根据权利要求82到96中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
98.根据权利要求97所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
99.根据权利要求82到96中任一项所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
100.根据权利要求82到96中任一项所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
101.根据权利要求96到100中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自ehf、fut7和/或ost4。
102.根据权利要求96到100中任一项所述的方法,其中所述基因或蛋白质选自akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、cdh1、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、mif、pparg、rora、rorc、spa17、stat5b、tlr3和/或tollip。
103.根据权利要求82到102中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
104.根据权利要求82到103中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
105.根据权利要求104所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
106.根据权利要求82到105中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测量的。
107.根据权利要求82到106中任一项所述的方法,其中对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
108.一种治疗患有癌症的受试者的方法,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)接收患者的标识,所述标识将所述患者标识为生物样品中的选自以下的一种或多种基因或蛋白质的表达水平降低:ccl24、ccne1、ehf、fut7、galm、gbp6、il5、lap3、mrpl11、ost4、wdr83os、tbx21、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、cd36、cdh1、mif、rora、tlr3和/或vegfa,和/或选自以下的一种或多种基因或蛋白质的表达水平增加:cd68、cd163、lbp、ccl2、ccl3、ccl7、cd14、cd300e、cd86、cd93、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il6、il8、inhba、layn、loc100505585、nid1、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、hamp、hsd11b1、itgam、lif、s100a8、saa1、tfrc、tlr5、tnfsf14、birc5、bst1、card11、cdk1、tnfrsf11a、trem1、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18和/或trem21;以及
(c)向所述受试者施用有效量的腺苷途径抑制剂,由此治疗所述癌症。
109.根据权利要求108所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il6。
110.根据权利要求108所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括il8。
111.根据权利要求108所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质包括ccl20和cx3cl1。
112.根据权利要求111所述的方法,其中所述生物样品中的ccl20的所述表达水平高于对照物的表达水平,并且所述生物样品中的cx3cl1的所述表达水平低于对照物的表达水平。
113.根据权利要求108到112中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因的所述表达水平是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序来测定的。
114.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中蛋白质表达是通过elisa测量的。
115.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中蛋白质表达是通过免疫组织化学测量的。
116.一种用于测定生物样品中的基因表达水平的试剂盒,所述试剂盒包括:
(i)选自以下的一种或多种基因的引物:cd68、cd163、lbp、ccl2、ccl3、ccl7、ccl24、ccne1、cd14、cd300e、cd86、cd93、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、ehf、fut7、galm、gbp6、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il5、il6、il8、inhba、lap3、layn、loc100505585、mrpl11、nid1、ost4、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、tbx21、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、cxcl2、hamp、hsd11b1、itgam、lif、saa1、tfrc、tlr5、tnfsf14、trem2、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、notch1、nrp1、prkce、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa和/或wdr83os;以及
(ii)用于处理所述生物样品的试剂。
117.根据权利要求116所述的试剂盒,其中用于处理所述生物样品的所述试剂是用于从所述生物样品制备cdna的试剂。
118.根据权利要求116或117所述的试剂盒,其进一步包括用于rna测序的一种或多种试剂。
119.根据权利要求116到118中任一项所述的试剂盒,其进一步包括被配置用于所述一种或多种基因的测序的微阵列。
120.根据权利要求116到119中任一项所述的试剂盒,其进一步包括用于所述一种或多种基因的定量pcr的试剂。
121.根据权利要求116到120中任一项所述的试剂盒,其进一步包括用于rna-seq的试剂。
122.根据权利要求116到121中任一项所述的试剂盒,其进一步包括用于测定所述生物样品中的所述基因表达水平的说明书。
123.根据权利要求116到122中任一项所述的试剂盒,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片和免疫细胞。
124.根据权利要求116到123中任一项所述的试剂盒,其进一步包括抗cd68和/或抗cd163抗体。
125.一种用于检测患有或疑似患有癌症的受试者的cd68和/或cd163的表达水平的方法,所述方法包括:
a)从所述受试者获得生物样品;以及
b)检测所述生物样品中的cd68和/或cd163的所述表达水平。
126.根据权利要求125所述的方法,其中检测cd68蛋白的水平。
127.根据权利要求125所述的方法,其中检测cd68基因表达的水平。
128.根据权利要求125所述的方法,其中检测cd163蛋白的水平。
129.根据权利要求125所述的方法,其中检测cd163基因表达的水平。
130.根据权利要求126或128所述的方法,其中所述蛋白水平是使用免疫组织化学检测的。
131.根据权利要求125到130中任一项所述的方法,其进一步包括检测所述样品中的一种或多种另外的基因或蛋白质的表达水平。
132.根据权利要求131所述的方法,其中所述一种或多种另外的基因或蛋白质选自cd68、cd163、birc5、bst1、card11、ccl2、ccl3、ccl7、ccl24、ccne1、cd14、cd300e、cd86、cd93、cdk1、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、ehf、fut7、galm、gbp6、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il5、il6、il8、inhba、lap3、layn、loc100505585、mrpl11、nid1、ost4、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、tbx21、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、cxcl2、hamp、hsd11b1、itgam、lif、saa1、tfrc、tlr5、tnfrsf11a、tnfsf14、trem1、trem2、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh1、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、mif、notch1、nrp1、prkce、rora、tlr3、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、s100a8和/或wdr83os。
133.根据权利要求125到132中任一项所述的方法,其中所述生物样品中的cd68表达高于对照物。
134.根据权利要求125到133中任一项所述的方法,其中所述生物样品中的cd163表达高于对照物。
135.根据权利要求125到134中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
136.根据权利要求125到135中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
137.根据权利要求136所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
138.根据权利要求125到137中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序(例如,nanostring)来测量的。
139.根据权利要求125到138中任一项所述的方法,其进一步包括:
(c)将所述样品中的cd68和/或cd163的所述表达水平与合适对照物中的cd68和/或cd163的表达水平进行比较。
140.根据权利要求139所述的方法,其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
141.一种治疗患有癌症的受试者的方法,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测所述生物样品中的cd68和/或cd163的表达水平;以及
(c)向所述受试者施用有效量的腺苷途径抑制剂,由此治疗所述癌症。
142.根据权利要求141所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
143.根据权利要求142所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
144.根据权利要求141所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
145.根据权利要求144所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
146.根据权利要求141到145中任一项所述的方法,其进一步包括向所述受试者施用cxcr2抑制剂。
147.根据权利要求146所述的方法,其中所述cxcr2抑制剂选自azd5069、抗cxcr2抗体和纳瓦利辛。
148.根据权利要求141到147中任一项所述的方法,其中检测cd68蛋白的水平。
149.根据权利要求141到147中任一项所述的方法,其中检测cd68基因表达的水平。
150.根据权利要求141到147中任一项所述的方法,其中检测cd163蛋白的水平。
151.根据权利要求141到147中任一项所述的方法,其中检测cd163基因表达的水平。
152.根据权利要求148或150所述的方法,其中所述蛋白水平是使用免疫组织化学检测的。
153.根据权利要求141到152中任一项所述的方法,其进一步包括检测所述样品中的一种或多种另外的基因或蛋白质的表达水平。
154.根据权利要求153所述的方法,其中所述一种或多种另外的基因或蛋白质选自cd68、cd163、birc5、bst1、card11、ccl2、ccl3、ccl7、ccl24、ccne1、cd14、cd300e、cd86、cd93、cdk1、clec5a、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcl8、dfna5、ecel1、epb41l3、ehf、fut7、galm、gbp6、gpr157、has1、il1a、il-1β、il23、il24、il5、il6、il8、inhba、lap3、layn、loc100505585、mrpl11、nid1、ost4、padi2、pid1、plaur、ppbp、ptgs2、rhcg、serpinb2、slc11a1、slc7a7、spon1、st6galnac2、tbx21、thbs1、c1r、c1s、c4bpa、ccl11、ccl20、cxcl16、cxcl2、hamp、hsd11b1、itgam、lif、saa1、tfrc、tlr5、tnfrsf11a、tnfsf14、trem1、trem2、ttk、ada、bcl6、c2、ccl8、cebpb、cfd、csf1、csf2rb、cxcr4、fcgr2a、ifi16、irak4、ly96、lyn、ripk2、stat2、stat3、tnfsf4、alcam、c9、ccr6、ceacam6、ct45a1、cxcr1、cxcr2、dmbt1、foxj1、itch、lbp、map2k2、prame、psmd7、tnfsf18、app、atg10、bcl2、ccl15、cd24、cd46、cd59、creb5、cx3cl1、cxcl14、cyfip2、defb1、dpp4、ecsit、epcam、ifit1、igf1r、itga6、itgb3、map2k4、mapk1、masp1、pparg、rorc、spa17、stat5b、tollip、akt3、bmi1、cd164、cd34、cd36、cdh1、cdh5、creb1、dock9、eng、hmgb1、itga1、jam3、maf、mapk3、mapk8、mcam、mfge8、mif、notch1、nrp1、prkce、rora、tlr3、smad2、tal1、thy1、tnfsf12、traf6、txnip、vegfa、s100a8和/或wdr83os。
155.根据权利要求141到154中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
156.根据权利要求141到155中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
157.根据权利要求156所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
158.根据权利要求141到157中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序(例如,nanostring)来测量的。
159.根据权利要求141到158中任一项所述的方法,其进一步包括:
(d)将所述样品中的cd68和/或cd163的所述表达水平与合适对照物中的cd68和/或cd163的表达水平进行比较。
160.根据权利要求159所述的方法,其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
161.一种选择用腺苷途径抑制剂进行的治疗的受试者的方法,所述受试者患有或疑似患有癌症,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测cd68和/或cd163的高表达水平;以及
(c)选择所述受试者进行用所述腺苷途径抑制剂进行的治疗。
162.根据权利要求161所述的方法,其中与合适对照物相比,所述水平较高,并且其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
163.根据权利要求161或162所述的方法,其中检测cd68蛋白的水平。
164.根据权利要求161或162所述的方法,其中检测cd68基因表达的水平。
165.根据权利要求161或162所述的方法,其中检测cd163蛋白的水平。
166.根据权利要求161或162所述的方法,其中检测cd163基因表达的水平。
167.一种用于检测患有或疑似患有癌症的受试者的一种或多种基因或蛋白质的表达水平的方法,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;以及
(b)检测所述生物样品中的选自以下的一种或多种基因或蛋白质的所述表达水平:actbl2、adam8、alox5ap、anxa2p2、aqp9、areg、arhgap9、bcl2a1、bcl3、bdkrb2、birc3、c10orf55、c15orf48、c19orf59、c1orf38、c1r、c1s、c3、c5ar1、c8orf4、casp4、ccl18、ccl2、ccl20、ccl3、ccl3l1、ccl4、ccl4l2、ccl7、ccl8、ccr1、cd14、cd300a、cd300e、cd300lb、cd53、cd69、cd86、cdcp1、ceacam3、cfb、clec4a、clec4d、clec4e、clec5a、clec7a、csf2、csf2rb、csf3、csf3r、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcr1、cxcr2、cxorf21、cyr61、cyth4、cytip、dapp1、dusp1、dusp5、egr3、emp1、emr2、emr3、ereg、f3、fcar、fcer1g、fcgr2a、fcgr2b、fcgr3b、ffar2、fgr、fos、fosl1、fpr1、fpr2、g0s2、glipr1、gna15、gpr109a、gpr109b、gpr183、gpr84、gpr97、gprc5a、has1、hbegf、hck、hk3、icam1、ier3、il10、il1a、il1b、il1r2、il1rl1、il1rn、il4r、il6、il7r、il8、junb、klf6、lamc2、lcp2、lif、lilra5、lilra6、lilrb2、lilrb3、lrg1、lyn、maff、map3k8、mcl1、mefv、mmp1、mmp12、mmp3、mmp7、mnda、myo1g、nampt、ncf2、ncf4、ncoa7、nfe2、nfkbiz、nlrp3、nnmt、obfc2a、osm、osmr、p2ry6、pf4v1、phlda1、pi3、plau、plaur、plek、plk3、ppbp、ppp1r15a、prdm1、ptgs2、ptpn22、rarres1、rasgrp4、rgs1、rgs2、rnd1、rnd3、s100a12、s100a8、s100a9、saa1、saa2、saa4、samsn1、sat1、sele、serpina1、serpinb2、serpinb4、serpinb7、serpinb8、serpine1、slc11a1、slc2a14、slc2a3、snai1、socs3、sod2、spi1、srgn、stx11、tdo2、tgm2、thbs1、tlr2、tnf、tnfaip2、tnfaip3、tnfaip6、tnip3、trem1、vnn1、vnn2、vnn3、zc3h12a、zfp36。
168.根据权利要求167所述的方法,其进一步包括:
(c)将所述样品中的所述一种或多种基因或蛋白质的所述表达水平与合适对照物中的所述一种或多种基因或蛋白质的表达水平进行比较。
169.根据权利要求168所述的方法,其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
170.一种治疗患有癌症的受试者的方法,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测所述生物样品中的选自以下的一种或多种基因或蛋白质的表达水平:actbl2、adam8、alox5ap、anxa2p2、aqp9、areg、arhgap9、bcl2a1、bcl3、bdkrb2、birc3、c10orf55、c15orf48、c19orf59、c1orf38、c1r、c1s、c3、c5ar1、c8orf4、casp4、ccl18、ccl2、ccl20、ccl3、ccl3l1、ccl4、ccl4l2、ccl7、ccl8、ccr1、cd14、cd300a、cd300e、cd300lb、cd53、cd69、cd86、cdcp1、ceacam3、cfb、clec4a、clec4d、clec4e、clec5a、clec7a、csf2、csf2rb、csf3、csf3r、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcr1、cxcr2、cxorf21、cyr61、cyth4、cytip、dapp1、dusp1、dusp5、egr3、emp1、emr2、emr3、ereg、f3、fcar、fcer1g、fcgr2a、fcgr2b、fcgr3b、ffar2、fgr、fos、fosl1、fpr1、fpr2、g0s2、glipr1、gna15、gpr109a、gpr109b、gpr183、gpr84、gpr97、gprc5a、has1、hbegf、hck、hk3、icam1、ier3、il10、il1a、il1b、il1r2、il1rl1、il1rn、il4r、il6、il7r、il8、junb、klf6、lamc2、lcp2、lif、lilra5、lilra6、lilrb2、lilrb3、lrg1、lyn、maff、map3k8、mcl1、mefv、mmp1、mmp12、mmp3、mmp7、mnda、myo1g、nampt、ncf2、ncf4、ncoa7、nfe2、nfkbiz、nlrp3、nnmt、obfc2a、osm、osmr、p2ry6、pf4v1、phlda1、pi3、plau、plaur、plek、plk3、ppbp、ppp1r15a、prdm1、ptgs2、ptpn22、rarres1、rasgrp4、rgs1、rgs2、rnd1、rnd3、s100a12、s100a8、s100a9、saa1、saa2、saa4、samsn1、sat1、sele、serpina1、serpinb2、serpinb4、serpinb7、serpinb8、serpine1、slc11a1、slc2a14、slc2a3、snai1、socs3、sod2、spi1、srgn、stx11、tdo2、tgm2、thbs1、tlr2、tnf、tnfaip2、tnfaip3、tnfaip6、tnip3、trem1、vnn1、vnn2、vnn3、zc3h12a和/或zfp36;以及
(c)向所述受试者施用有效量的腺苷途径抑制剂,由此治疗所述癌症。
171.根据权利要求170所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是a2a受体(adora2a)拮抗剂。
172.根据权利要求171所述的方法,其中所述adora2a拮抗剂是cpi-444。
173.根据权利要求171所述的方法,其中所述腺苷途径抑制剂是cd73拮抗剂、cd38拮抗剂、cd39拮抗剂或腺苷脱氨酶。
174.根据权利要求173所述的方法,其中所述cd73拮抗剂是抗cd73抗体。
175.根据权利要求170到174中任一项所述的方法,其进一步包括向所述受试者施用cxcr2抑制剂。
176.根据权利要求175所述的方法,其中所述cxcr2抑制剂选自azd5069、抗cxcr2抗体和纳瓦利辛。
177.根据权利要求170到176中任一项所述的方法,其进一步包括:
(d)将所述样品中的所述一种或多种基因或蛋白质的所述表达水平与合适对照物中的所述一种或多种基因或蛋白质的表达水平进行比较。
178.根据权利要求177所述的方法,其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
179.一种选择用腺苷途径抑制剂进行的治疗的受试者的方法,所述受试者患有或疑似患有癌症,所述方法包括:
(a)从所述受试者获得生物样品;
(b)检测所述生物样品中的选自以下的一种或多种基因或蛋白质的高表达水平:actbl2、adam8、alox5ap、anxa2p2、aqp9、areg、arhgap9、bcl2a1、bcl3、bdkrb2、birc3、c10orf55、c15orf48、c19orf59、c1orf38、c1r、c1s、c3、c5ar1、c8orf4、casp4、ccl18、ccl2、ccl20、ccl3、ccl3l1、ccl4、ccl4l2、ccl7、ccl8、ccr1、cd14、cd300a、cd300e、cd300lb、cd53、cd69、cd86、cdcp1、ceacam3、cfb、clec4a、clec4d、clec4e、clec5a、clec7a、csf2、csf2rb、csf3、csf3r、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcr1、cxcr2、cxorf21、cyr61、cyth4、cytip、dapp1、dusp1、dusp5、egr3、emp1、emr2、emr3、ereg、f3、fcar、fcer1g、fcgr2a、fcgr2b、fcgr3b、ffar2、fgr、fos、fosl1、fpr1、fpr2、g0s2、glipr1、gna15、gpr109a、gpr109b、gpr183、gpr84、gpr97、gprc5a、has1、hbegf、hck、hk3、icam1、ier3、il10、il1a、il1b、il1r2、il1rl1、il1rn、il4r、il6、il7r、il8、junb、klf6、lamc2、lcp2、lif、lilra5、lilra6、lilrb2、lilrb3、lrg1、lyn、maff、map3k8、mcl1、mefv、mmp1、mmp12、mmp3、mmp7、mnda、myo1g、nampt、ncf2、ncf4、ncoa7、nfe2、nfkbiz、nlrp3、nnmt、obfc2a、osm、osmr、p2ry6、pf4v1、phlda1、pi3、plau、plaur、plek、plk3、ppbp、ppp1r15a、prdm1、ptgs2、ptpn22、rarres1、rasgrp4、rgs1、rgs2、rnd1、rnd3、s100a12、s100a8、s100a9、saa1、saa2、saa4、samsn1、sat1、sele、serpina1、serpinb2、serpinb4、serpinb7、serpinb8、serpine1、slc11a1、slc2a14、slc2a3、snai1、socs3、sod2、spi1、srgn、stx11、tdo2、tgm2、thbs1、tlr2、tnf、tnfaip2、tnfaip3、tnfaip6、tnip3、trem1、vnn1、vnn2、vnn3、zc3h12a和/或zfp36;以及
(c)选择所述受试者进行用所述腺苷途径抑制剂进行的治疗。
180.根据权利要求179所述的方法,其中与合适对照物相比,所述表达水平较高,并且其中所述合适对照物是来自健康受试者的样品、来自非癌性组织的样品或群体中的平均表达水平。
181.根据权利要求167到180中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质选自alox5ap、aqp9、bcl2a1、bcl3、birc3、c15orf48、c19orf59、c5ar1、ccl2、ccl20、ccl3、ccl4、ccl7、cd300a、cd300e、ceacam3、cfb、clec5a、clec7a、csf3、csf3r、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、cxcr1、cxcr2、emr3、ereg、fcar、fcgr3b、ffar2、fos、fosl1、fpr1、fpr2、g0s2、gna15、gpr109a、gpr109b、gpr183、gpr84、gpr97、hbegf、icam1、ier3、il10、il1a、il1b、il1rn、il6、il8、junb、lif、lilra5、map3k8、mefv、mnda、nampt、ncoa7、nfkbiz、nlrp3、osm、pi3、plau、plaur、ppbp、ptgs2、rnd3、s100a12、s100a8、s100a9、saa1、saa2、samsn1、serpinb2、serpinb8、serpine1、slc11a1、slc2a3、socs3、sod2、srgn、tnf、tnfaip3、tnfaip6、trem1、vnn3、zc3h12a和/或zfp36。
182.根据权利要求167到180中任一项所述的方法,其中所述一种或多种基因或蛋白质选自bcl2a1、ccl2、ccl20、csf3、cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl5、cxcl6、fcgr3b、fpr2、ier3、il1b、il6、il8、nfkbiz、osm、plaur、ptgs2、s100a8、s100a9、socs3和/或trem1。
183.根据权利要求167到182中任一项所述的方法,其中检测蛋白质水平。
184.根据权利要求183所述的方法,其中所述蛋白质水平是使用免疫组织化学检测的。
185.根据权利要求167到182中任一项所述的方法,其中检测基因表达水平。
186.根据权利要求167到185中任一项所述的方法,其进一步包括检测所述样品中的一种或多种另外的基因和/或一种或多种另外的蛋白质的表达水平。
187.根据权利要求186所述的方法,其中所述一种或多种另外的基因和/或一种或多种另外的蛋白质选自表1-9中的基因/蛋白质。
188.根据权利要求167到187中任一项所述的方法,其中所述生物样品中的所述表达水平高于对照物中的表达水平。
189.根据权利要求167到188中任一项所述的方法,其中不检测其它基因或蛋白质的表达。
190.根据权利要求167到189中任一项所述的方法,其中所述生物样品选自血液样品、肿瘤活检切片或免疫细胞。
191.根据权利要求190所述的方法,其中所述生物样品是肿瘤活检切片。
192.根据权利要求167到191中任一项所述的方法,其中基因表达是通过rna测序、纳米孔测序、微阵列或基于杂交的测序(例如,nanostring)来测量的。