大口黑鲈生长相关的SNP位点及其应用的制作方法

文档序号:18259138发布日期:2019-07-24 10:34阅读:来源:国知局

技术特征:

1.大口黑鲈HSC70-1的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。

2.权利要求1所述大口黑鲈HSC70-1的基因序列为SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,其第821位S为碱基C或G,第2804位W为碱基A或T。

3.权利要求2所述大口黑鲈HSC70-1基因序列在判断大口黑鲈生长快慢中的应用。

4.大口黑鲈生长速度相关的SNP位点,其位于HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2所示的第821位碱基、第2804位碱基。

5.权利要求4所述SNP位点在判断大口黑鲈生长快慢中的应用。

6.权利要求4所述SNP位点在筛选快速生长大口黑鲈中的应用。

7.一种筛选快速生长大口黑鲈的方法,其特征在于,检测大口黑鲈HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2的第821位碱基处的SNP位点是否为CC纯合体,若是,则为快速生长的大口黑鲈;或/和,检测HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2的第2804位碱基处的SNP位点是否为TT纯合体,若是,则为快速生长的大口黑鲈。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,包括如下步骤:

1)提取大口黑鲈DNA;

2)以提取得到的DNA为模板,PCR检测大口黑鲈HSC70-1基因序列第821、2804位碱基处的SNP位点是否分别为CC、TT纯合体。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR检测的具体操作为,分别利用引物

P1F和P1R、P2F和P2R对大口黑鲈DNA进行初次PCR扩增,得到初次PCR产物,

P1F:5'-TGAAGCCTACCTCGGAAAAGT-3'(SEQ ID NO.3),

P1R:5'-AGCATCCTTAGTGGCCTGGCGC-3'(SEQ ID NO.4),

P2F:5'-TCCACCAGCTTATCAGACTGT-3'(SEQ ID NO.5),

P2R:5'-GGTCAACCCTCCAAGTAACTT-3'(SEQ ID NO.6);

再将初次PCR产物分别用引物P1和P2进行延伸扩增,将所得产物经测序分析,确定大口黑鲈HSC70-1基因序列第821、2804位碱基处的SNP位点是否分别为CC、TT纯合体;

P1:5'-TTACTTAGCATAGCTCTGGACA-3'(SEQ ID NO.7),

P2:5'-CTGTAGGGGGTAACTGAAGGGT-3'(SEQ ID NO.8)。

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,初次PCR扩增的反应体系为:

初次PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min;94℃变性15s,56℃退火15s,72℃延伸30s,24个循环;72℃延伸3min。

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