1.大口黑鲈HSC70-1的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.权利要求1所述大口黑鲈HSC70-1的基因序列为SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,其第821位S为碱基C或G,第2804位W为碱基A或T。
3.权利要求2所述大口黑鲈HSC70-1基因序列在判断大口黑鲈生长快慢中的应用。
4.大口黑鲈生长速度相关的SNP位点,其位于HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2所示的第821位碱基、第2804位碱基。
5.权利要求4所述SNP位点在判断大口黑鲈生长快慢中的应用。
6.权利要求4所述SNP位点在筛选快速生长大口黑鲈中的应用。
7.一种筛选快速生长大口黑鲈的方法,其特征在于,检测大口黑鲈HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2的第821位碱基处的SNP位点是否为CC纯合体,若是,则为快速生长的大口黑鲈;或/和,检测HSC70-1基因序列SEQ ID NO:2的第2804位碱基处的SNP位点是否为TT纯合体,若是,则为快速生长的大口黑鲈。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取大口黑鲈DNA;
2)以提取得到的DNA为模板,PCR检测大口黑鲈HSC70-1基因序列第821、2804位碱基处的SNP位点是否分别为CC、TT纯合体。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR检测的具体操作为,分别利用引物
P1F和P1R、P2F和P2R对大口黑鲈DNA进行初次PCR扩增,得到初次PCR产物,
P1F:5'-TGAAGCCTACCTCGGAAAAGT-3'(SEQ ID NO.3),
P1R:5'-AGCATCCTTAGTGGCCTGGCGC-3'(SEQ ID NO.4),
P2F:5'-TCCACCAGCTTATCAGACTGT-3'(SEQ ID NO.5),
P2R:5'-GGTCAACCCTCCAAGTAACTT-3'(SEQ ID NO.6);
再将初次PCR产物分别用引物P1和P2进行延伸扩增,将所得产物经测序分析,确定大口黑鲈HSC70-1基因序列第821、2804位碱基处的SNP位点是否分别为CC、TT纯合体;
P1:5'-TTACTTAGCATAGCTCTGGACA-3'(SEQ ID NO.7),
P2:5'-CTGTAGGGGGTAACTGAAGGGT-3'(SEQ ID NO.8)。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,初次PCR扩增的反应体系为:
初次PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min;94℃变性15s,56℃退火15s,72℃延伸30s,24个循环;72℃延伸3min。