X. Zhang, et al. 2010. Cloning and characterization of repetitive sequences and development of SCAR markers specific for the P genome of Agropyron cristatum. Euphytica 172:363-372.)〇
[0029] 小麦-冰草附加系5043 (具有42条小麦染色体+1对冰草P染色体）：中国农业 科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心。
[0030] 小麦-冰草附加系II-30-5 (具有42条小麦染色体+1对冰草P染色体）：中国农 业科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心。
[0031] 小麦-冰草附加系5114(具有42条小麦染色体+1对冰草P染色体）：中国农业 科学院作物科学研究所作物种质资源保护与研究中心（Han，H.，L. Bai，J. Su，J. Zhang，L. Song,A. Gao, et al. 2014. Genetic rearrangements of six Wheat - Agropyron cristatum 6P addition lines revealed by molecular markers. PloS one 9:e91066.)〇
[0032] pAsl ：Mukai, Y. , Y. Nakahara and M. Yamamoto. 1993. Simultaneous discrimination of the three genomes in hexaploid wheat by multicolor fluorescence in situ hybridization using total genomic and highly repeated DNA probes. Genome 36:489-494. 〇
[0033] 实施例UpAcTRTl的发现及其在冰草染色体上的分布特征
[0034] 一、pAcTRT 1 的发现
[0035] 以小麦-冰草6P短臂端体系为材料，通过显微切割和D0P-PCR的方法得到了 6P 短臂的DNA序列片段。将这些序列连接到pMD19-T载体，导入大肠杆菌中，得到6P短臂的 DNA序列片段库。用斑点杂交筛选出冰草Z559和小麦Fukuho有差异的DNA克隆进行测序。
[0036] 经BLAST分析，存在一个长度为962bp、GC含量为44. 3%的DNA片段，将该DNA片 段命名为pAcTRTl，如序列表的序列1所示。
[0037] pAcTRTl与黑麦中的串联重复序列pSc200有90%的序列相似性。
[0038] 二、pAcTRTl在冰草染色体上的分布特征
[0039] 以pAcTRTl为探针，分别对小麦-冰草6P二体附加系4844-12、冰草Z1842、冰草 Z1842的两个不同单株、小麦-冰草附加系5043、小麦-冰草附加系5038、小麦-冰草附加 系II-30-5和小麦-冰草附加系5114进行FISH(荧光原位杂交）分析。
[0040] 小麦-冰草6P二体附加系4844-12的FISH结果见图1。结果表明，pAcTRTl在6P 染色体的短臂上有分布，而在小麦源的42条染色体上均无信号。
[0041] 冰草Z1842的FISH结果见图2。pAcTRTl主要分布在冰草大部分染色体的端部。
[0042] 冰草为异花授粉植物，pAcTRTl在冰草Z1842不同单株不同染色体上的分布特征 能将冰草染色体鉴别出来，见FISH结果见图3 (a和b为两个单株）。
[0043] 小麦-冰草附加系5043的FISH结果见图4。结果表明，pAcTRTl在来源于冰草的 染色体的端部上有分布，而在小麦源的42条染色体上均无信号。
[0044] 小麦-冰草附加系5038的FISH结果见图5。结果表明，pAcTRTl在来源于冰草的 染色体的端部上有分布，而在小麦源的42条染色体上均无信号。
[0045] 小麦-冰草附加系II-30-5的FISH结果见图6。结果表明，pAcTRTl在来源于冰 草的染色体的端部上有分布，而在小麦源的42条染色体上均无信号。
[0046] 小麦-冰草附加系5114的FISH结果见图7。结果表明，pAcTRTl在来源于冰草的 染色体的端部上有分布，而在小麦源的42条染色体上均无信号。
[0047] 结果表明，pAcTRTl可以对小麦背景下冰草染色体端部的染色质进行检测，并可以 作为一个鉴别冰草不同染色体的探针。
[0048] 以pAsl为探针，分别对小麦Fukuho和冰草Z1842进行FISH(荧光原位杂交）分 析。
[0049] 小麦Fukuho的FISH结果见图8。冰草Z1842的FISH结果见图9。采用pAsl作 为探针，pAsl主要在普通小麦D基因组的端部有信号，在冰草染色体的端部也产生信号，但 它们的分布特征是不同的，并且pAsl与pAcTRTl在冰草染色体的分布特征不同。
【主权项】
1. 一种DNA分子，为序列表的序列1所7K的DNA分子。2. 权利要求1所述DNA分子在鉴定待测植物材料的基因组中是否含有来源于冰草染色 体端部的遗传物质中的应用。3. -种检测待测植物材料的基因组中是否含有来源于冰草染色体端部的遗传物质的 方法，包括如下步骤：采用权利要求1所述DNA分子作为探针，对待测植物材料进行荧光原 位杂交，如果具有荧光信号、待测植物材料的基因组中含有来源于冰草染色体端部的遗传 物质，如果不具有荧光信号、待测植物材料的基因组中可能不含有来源于冰草染色体端部 的遗传物质。4. 序列表的序列1所示的DNA分子作为鉴别冰草染色体的探针的应用。5. 序列表的序列1所7K的DNA分子作为逆转座子的应用。
【专利摘要】本发明公开了一种冰草染色体端部特异的串联重复序列及其应用。本发明提供的冰草染色体端部特异的串联重复序列(分子标记，命名为特异DNA分子)，为序列表的序列1所示的DNA分子。本发明还保护所述特异DNA分子在鉴定待测植物材料的基因组中是否含有来源于冰草染色体端部的遗传物质中的应用。本发明的意义如下：(1)pAcTRT1的获得使冰草的染色体的识别更容易、准确，填补了冰草染色体鉴定上无理想探针可用的空缺；(2)pAcTRT1可以对小麦背景下冰草染色体端部的P染色质进行检测。
【IPC分类】C12N15/11, C12Q1/68
【公开号】CN105441427
【申请号】CN201410386450
【发明人】李立会, 刘伟华, 韩海明, 宋利强, 胡赞民, 张锦鹏, 鲁玉清, 高爱农
【申请人】中国农业科学院作物科学研究所
【公开日】2016年3月30日
【申请日】2014年8月7日