专利名称：蛋白印迹自动判读方法及其判读装置的制作方法
技术领域：
本发明属于生物检测技术领域，涉及一种蛋白印迹自动判读方法以及相应的判读
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背景技术：
随着临床检测技术的发展，蛋白印迹自动检测逐渐普及，相比人工检测，自动检测可一次性检测大量样本。但是检测结果的判断基本上还是靠人眼判断，人工判断由于主观性较强，容易形成个人差异。目前也有通过扫描仪扫描从而实现自动判断的系统，可杜绝传统人工判断的误差，其判读结果具有一致性以及量化性的特点。但是现有扫描仪判读系统的缺陷在于，扫描仪扫描一副蛋白印迹膜条样本图像需I分钟以上，且扫描之前的准备工作耗时较长，必须把每条膜条样本精确粘贴在模板上，只要粘贴位置有纤毫偏移，都会对扫描结果产生影响，操作复杂、效率低下。同时在粘贴扫描过程中，由于经未知血清污染的膜条样本需人手拿取粘贴，还需要直接接触到扫描仪的玻璃上，实验标本及判读设备无法进行有效的清洁和消毒，生物污染的安全隐患非常大。
发明内容
针对现有扫描仪判读系统的上述不足，申请人经过研究改进，提供一种蛋白印迹自动判读方法及其判读装置，可免去样本粘贴扫描的麻烦，一次性完成采集和判读，速度快、识别率高、操作简便，可以自动识别蛋白印迹的阴阳性，并有定量数值。本发明的技术方案如下本发明提供一种蛋白印迹自动判读方法，包括以下步骤(I)将一标准膜条放置在摄像头下方，调整摄像头，使摄像头内预设的与所述标准膜条尺寸相适应的虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示的画面相对准，并计算出所述标虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示画面之间大小关系的识别系数；(2)待测膜条在反应槽中反应完成后，将包含有待测膜条的反应槽整个取出放置在摄像头下方，反应槽的放置方向需保证反应槽内的待测膜条在摄像头拍摄画面内呈水平或垂直，与水平或垂直方向的角度误差不超过10° ;(3)根据所述待测膜条的类型选择与该类型膜条尺寸相适应的虚拟识别框备用；根据步骤(I)中得到的识别系数将备用的虚拟识别框的大小调整至与待测膜条在图像中的显示大小相一致；(4)虚拟识别框在拍摄图像中只可正交放置，根据所述待测膜条的放置方向设定所述备用的虚拟识别框的放置方向为水平或者垂直，并根据待测膜条的参考线往检测项目的方向设定所述备用的虚拟识别框中的定位线的位置；(5)启动摄像头，采集一幅反应槽的实时图像，将采集到的反应槽图像转换成灰度图，并依次进行腐蚀算法、平滑算法、二值化以及轮廓检测，以将采集的反应槽图像中的待测膜条的图像识别出来；(6)在识别出的待测膜条的图像上自动放置已通过步骤(3)、步骤(4)调整好的虚拟识别框，使所述虚拟识别框的定位线与识别出的待测膜条图像中参考线相重合，从而确定虚拟识别框的放置位置；(7)将上述各虚拟识别框所限定的待测膜条图像分别裁剪下来，保存到指定的文件夹；(8)从膜条数据库中取得所测膜条的检测项目的信息参数，根据所测膜条参考线的位置，对所测膜条上各个检测项目的位置进行精确定位；将虚拟识别框分割为多个区域，使所测膜条上各个检测项目分别落入所述区域中；(9)把识别出的膜条根据颜色进行处理转换成结果曲线，识别曲线上的峰值，即为阳性值，得到判读结果；所述判断峰值的算法是将曲线的各个点存入数组，对数组进行微分 运算，对每点进行确定，其在相连的左右一段区域内是否为顶，从而计算出峰值；(10)手动录入或者从外部导入病人资料，把所述病人资料和对应的被测膜条的判读结果进行匹配，依次保存到结果数据库中，生成检测报告；外部系统也可直接调用判读结果数据，整合到其他的检测报告中。本发明还提供一种用于实现上述方法的蛋白印迹自动判读装置，包括转轴、摄像头、可升降支撑杆、专用遮光罩、角度调整臂、控制底座以及电源开关；所述摄像头安装于专用遮光罩内并与所述专用遮光罩一起固定在角度调整臂的一端，所述角度调整臂的另一端通过转轴与可升降支撑杆的一端连接，所述可升降支撑杆的另一端固定在控制底座上，控制底座上设有电源开关。本发明的有益技术效果是本发明采用机器视觉技术用摄像头从上向下直接拍摄检测膜条样本，瞬间获取图像，对于膜条的位置的精度要求不高，也不用担负生物污染的危险，可自动判断膜条位置，根据膜条的类别自动识别出检测结果，保存到数据库中，大大减轻了检验人员的工作强度，提高了工作效率，降低人为误差和人为差异，尤其是降低了实验过程中的生物污染危险，膜条和判读设备及实验人员不再有直接接触，符合实验室生物安全的要求和趋势。
图I是校准摄像头时的示意图。图2是包含有待测膜条的反应槽的示意图。图3是垂直方向放置的膜条的示意图。图4是在识别出的膜条图像上放置虚拟识别框的示意图。图5是将虚拟识别框内的膜条图像分割个多个区域的示意图。图6是蛋白印迹自动判读装置的主视图。图7是蛋白印迹自动判读装置的左视图。图8是蛋白印迹自动判读装置的附视图。
具体实施方式
下面结合附图对本发明的具体实施方式
做进一步说明。本发明所提供的蛋白印迹自动判读方法，包括以下步骤步骤(I):校准摄像头。在第一次使用或者更换过摄像头后，需要校准摄像头。将一标准膜条放置在摄像头下方，调整摄像头，使摄像头内预设的与所述标准膜条尺寸相适应的虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示的画面相对准，要放置水平(如图I所示)。计算出所述标虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示画面之间大小关系的识别系数。步骤(2):放置反应槽。待测膜条在反应槽中反应完成后，将包含有待测膜条的反应槽(如图2所示)整个取出放置在摄像头下方，反应槽无论横放还是竖放都可以，只要确保反应槽内的待测膜条在摄像头拍摄画面内基本呈水平或垂直，与水平或垂直方向的角度误差不超过10°。
步骤(3):根据待测膜条的类型选择与该类型膜条尺寸相适应的虚拟识别框以备用；根据步骤(I)中得到的识别系数将备用的虚拟识别框的大小调整至与待测膜条在图像中的显示大小相一致。步骤(4):图3示出了一个垂直方向放置的膜条的示意图，其从上至下依次为参考线、检测功能线、临界值线、Ul-snRNP、SmDl, SSA/60kD、SSA/52kd、SSB/La、Scl_70、Jo-I 等检测项目。由于虚拟识别框在拍摄图像中只可正交放置，因此要根据待测膜条的放置方向设定所述备用的虚拟识别框的放置方向为水平或者垂直，并根据待测膜条的参考线往检测项目的方向设定备用的虚拟识别框中的定位线的位置。步骤(5):完成了以上步骤(3)至步骤(4)的设置后，可以开始识别膜条了。启动摄像头，采集一幅反应槽的实时图像，将采集到的图像转换成灰度图，然后依次进行腐蚀算法、平滑算法、二值化以及轮廓检测，以将采集的反应槽图像中的待测膜条的图像识别出来，以及识别出膜条的参考线的位置。腐蚀算法用3x3的结构元素，扫描图像的每一个像素，用3x3的结构元素与其覆盖的二值图像做“与”操作，如果都为1，结果图像的该像素为I;否则为O。结果使二值图像减小一圈。定义E=BS={x, y | SxyB}腐蚀算法属于形态学运算，腐蚀可以用来提取骨干信息，去除噪声。平滑算法对图像进行核大小为指定参数的高斯卷积。卷积是一种线性运算，用于图像滤波。二值化根据指定的阀值参数，使图像变成非O即I的数字。轮廓检测从二值化的图像中检索轮廓，判断与膜条的定位线相似的轮廓，根据轮廓尺寸、位置，筛选出最有可能的轮廓。步骤(6):在识别出的待测膜条的图像上自动放置已通过步骤(3)、步骤(4)调整好的虚拟识别框，使所述虚拟识别框的定位线与识别出的待测膜条图像中参考线相重合，以此确定虚拟识别框的放置位置(如图4所示)。步骤(7):将上述各虚拟识别框所限定的待测膜条图像分别裁剪下来，保存到指定的文件夹。如果发现有待测膜条未被识别出来，在白色背景反应槽的情况下，可以减少二值化的阀值，并再次识别；在黑色背景反应槽的情况下，一般都会识别出来，如果没识别到，可以提高二值化的阀值，并再次识别。二值化的阀值最高不能超过250。如果发现有待测膜条未被识别出来，在图像过亮的情况下，降低亮度，并再次识别；在图像过暗的情况下，提高亮度，并再次识别。在图像对比度过高的情况下，降低对比度，并再次识别；在图像对比度过低的情况下，提高对比度，并再次识别。对偏色图像采用基于灰度世界模型的算法进行白平衡，再次进行识别，直到成功识别。
如果发现还有待测膜条未被识别出来，可以在图像中未被识别出的待测膜条位置处手动添加虚拟识别框。识别完成后，如果发现所识别出的待测膜条有少量倾斜(如图4所示)，则在图像中手动上下移动虚拟识别框的位置，确保待测膜条图像贯穿虚拟识别框；如果倾斜严重，需要重新调整反应槽或待测膜条位置，并重新进行识别并裁剪。步骤(8):从膜条数据库中取得所测膜条的检测项目的信息参数，根据所测膜条参考线的位置，对所测膜条上各个检测项目的位置进行精确定位；将虚拟识别框分割为多个区域，使所测膜条上各个检测项目分别落入所述区域中。图5示出了编号为“08”的某膜条裁剪后的图像进行区域分割后的示意图，其中的检测项目实际应为深度值，在此用宽度来表示深度值。步骤(9):把识别出的膜条根据颜色进行处理转换成结果曲线，识别曲线上的峰值，就是阳性值，得到判读结果。这里判断峰值的算法是将曲线的各个点存入数组，对数组进行微分运算，对每点进行确定，其在相连的左右一段区域内是否为顶，从而计算出峰值。如果觉得结果数值与实际有差异需要修改，可以手动修改。如图5所示的膜条的判读结果如下表
rm
cut-off control220
dsDNA00
核小体0O
组蛋白
SmDlOO
PCNA3O
"Τ000
SSA/60kD97+++
权利要求
1.一种蛋白印迹自动判读方法，其特征在于包括以下步骤 (1)将一标准膜条放置在摄像头下方，调整摄像头，使摄像头内预设的与所述标准膜条尺寸相适应的虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示的画面相对准，并计算出所述标虚拟识别框与所述标准膜条在摄像头中实时显示画面之间大小关系的识别系数； (2)待测膜条在反应槽中反应完成后，将包含有待测膜条的反应槽整个取出放置在摄像头下方，反应槽的放置方向需保证反应槽内的待测膜条在摄像头拍摄画面内呈水平或垂直，与水平或垂直方向的角度误差不超过10° ; (3)根据所述待测膜条的类型选择与该类型膜条尺寸相适应的虚拟识别框备用；根据步骤(I)中得到的识别系数将备用的虚拟识别框的大小调整至与待测膜条在图像中的显示大小相一致； (4)虚拟识别框在拍摄图像中只可正交放置，根据所述待测膜条的放置方向设定所述备用的虚拟识别框的放置方向为水平或者垂直，并根据待测膜条的参考线往检测项目的方向设定所述备用的虚拟识别框中的定位线的位置； (5)启动摄像头，采集一幅反应槽的实时图像，将采集到的反应槽图像转换成灰度图，并依次进行腐蚀算法、平滑算法、二值化以及轮廓检测，以将采集的反应槽图像中的待测膜条的图像识别出来； (6)在识别出的待测膜条的图像上自动放置已通过步骤(3)、步骤(4)调整好的虚拟识别框，使所述虚拟识别框的定位线与识别出的待测膜条图像中参考线相重合，从而确定虚拟识别框的放置位置； (7)将上述各虚拟识别框所限定的待测膜条图像分别裁剪下来，保存到指定的文件夹; (8)从膜条数据库中取得所测膜条的检测项目的信息参数，根据所测膜条参考线的位置，对所测膜条上各个检测项目的位置进行精确定位；将虚拟识别框分割为多个区域，使所测膜条上各个检测项目分别落入所述区域中； (9)把识别出的膜条根据颜色进行处理转换成结果曲线，识别曲线上的峰值，即为阳性值，得到判读结果；所述判断峰值的算法是将曲线的各个点存入数组，对数组进行微分运算，对每点进行确定，其在相连的左右一段区域内是否为顶，从而计算出峰值； (10)手动录入或者从外部导入病人资料，把所述病人资料和对应的被测膜条的判读结果进行匹配，依次保存到结果数据库中，生成检测报告；外部系统也可直接调用判读结果数据，整合到其他的检测报告中。
2.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于 步骤(5)中的所述腐蚀算法属于形态学运算，用于提取骨干信息，去除噪声；用3x3的结构元素，扫描图像中的每一个像素，将所述3x3的结构元素与其覆盖的二值图像做“与”操作，如果结果都为1，则图像中的该像素为I ;否则图像中的该像素为0 ; 步骤(5)中的所述平滑算法是对图像进行核大小为指定参数的高斯卷积；卷积是一种线性运算，用于图像滤波； 步骤(5)中的所述二值化是根据指定的阀值参数，使图像变成非0即I的数字； 步骤(5)中的所述轮廓检测是从二值化的图像中检索轮廓，判断与膜条的定位线相似的轮廓，根据轮廓尺寸、位置，筛选出最有可能的膜条的轮廓。
3.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现有待测膜条未被识别出来，则调节二值化的阀值在白色背景反应槽的情况下，在O 250的范围内减少二值化的阀值，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别；在黑色背景反应槽的情况下，在0 250的范围内提高二值化的阀值，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别。
4.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现有待测膜条未被识别出来，则调节图像亮度在图像过亮的情况下，降低亮度，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别；在图像过暗的情况下，提高亮度，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别。
5.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现有待测膜条未被识别出来，则调节图像对比度在图像对比度过高的情况下，降低对比度，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别；在图像对比度过低的情况下，提高对比度，并再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别。
6.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现有待测膜条未被识别出来，则对偏色图像采用基于灰度世界模型的算法进行白平衡，再次进行步骤(5)及步骤(6)的识别。
7.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现有待测膜条未被识别出来，则在图像中未被识别出的待测膜条位置手动添加虚拟识别框。
8.根据权利要求I所述蛋白印迹自动判读方法，其特征在于在步骤(7)后，若发现所识别出的待测膜条有少量倾斜，则在图像中手动调节虚拟识别框的位置，确保待测膜条图像贯穿虚拟识别框；若发现所识别出的待测膜条倾斜严重，则重新调整反应槽或待测膜条位置，并重新进行步骤(5)及步骤(6)的识别以及步骤(7)的裁剪。
9.一种用于实现权利要求I所述方法的蛋白印迹自动判读装置，其特征在于包括转轴(I)、摄像头(2)、可升降支撑杆(3)、专用遮光罩(4)、角度调整臂(5)、控制底座(6)以及电源开关(7);所述摄像头(2)安装于专用遮光罩(4)内并与所述专用遮光罩(4) 一起固定在角度调整臂(5)的一端，所述角度调整臂(5)的另一端通过转轴(I)与可升降支撑杆(3)的一端连接，所述可升降支撑杆(3)的另一端固定在控制底座(6)上，控制底座(6)上设有电源开关(7)。
全文摘要
本发明公开一种蛋白印迹自动判读方法及其判读装置，采用机器视觉技术用摄像头从上向下直接拍摄检测膜条样本，瞬间获取膜条图像，对于膜条的位置的精度要求不高，也不用担负生物污染的危险，可通过虚拟识别框自动判断膜条位置，根据膜条的类别自动识别出检测结果，保存到数据库中，大大减轻了检验人员的工作强度，提高了工作效率，降低人为误差和人为差异，尤其是降低了实验过程中的生物污染危险，膜条和判读设备及实验人员不再有直接接触，符合实验室生物安全的要求和趋势。
文档编号G01N33/53GK102759617SQ20121025372
公开日2012年10月31日 申请日期2012年7月20日 优先权日2012年7月20日
发明者周君早, 杨俊 申请人:无锡市东林科技发展有限责任公司