中医药生物信息处理方法、装置和系统的制作方法_3

文档序号:9274823阅读:来源:国知局
内外各个中医药生物信息数据库,而不用单独再去通过搜索引 擎查找了。
[0102] 结合图2所示,与本发明的客户端对应,本发明实施例的中医药生物信息处理方 法,包括:
[0103] S21,发送中医药生物信息处理请求。
[0104] S22,接收携带有处理结果的处理响应;其中,所述处理结果为针对所述中医药生 物信息处理请求的处理结果。
[0105] 下面举例说明本发明的实施例具体应用
[0106] 一、使用本发明进行组方预测。
[0107] 首先,获取桂枝茯苓丸的成分信息。该桂枝茯苓丸的药材包括桂枝、茯苓、牡丹 (使用"牡丹花"代替)、桃仁、芍药(使用"赤芍"和"白芍")。通过查询药材-成分关系表 可获得桂枝茯苳丸所包含的各种成分。该桂枝茯苳丸包含了 292种不同的成分。
[0108] 其次,获取其中每种成分的分子同各靶点的对接情况,通过查询成分-靶点关系 表,获取其中每种成分的分子同各靶点的对接情况。其中,靶点为不重复的靶点,其数目有 1673种,而成分同靶点的对接的信息条数共计12837条。
[0109] 然后,基于每种成分的分子同各革E点的对接情况并利用Cytoscape软件构建药 材-成分生物网络,以对方剂及其有效成分进行分析,获取方剂的君药、臣药、佐药、使药 及其对应的靶点。如图6所示,Degree(度)最高的药材是"桂枝"(度为75),其次是"茯 苓"(度为73),再次为"桃仁"(度为69),其次为"芍药"(赤芍加白芍共为67),最后是"牡 丹"(为49);此外,从药效的物质基础上来看,茯苓的药效分子同其他药材有明显的区别, 这些分子的数目多且在本方剂中有着独特的作用,提示茯苓在方剂的疗效中可能有独特的 疗效;药材桂枝的药效分子数目最多,其在本方剂中扮演者"君药"的角色,起主要药效的 作用。药材桃仁和桂枝有着最多的共有药效物质基础,提示桃仁在方剂中可能扮演着通过 增加药效分子量来提高君药药效的角色,其还有一些独特的药效分子群可能针对不同的病 症。芍药(包括赤芍和白芍)也有较多的药效分子群也比较多,药材赤芍的药效分子群多 余白芍且有着一定特有的药效分子群,提示桂枝茯苓丸可以根据治疗目的不同选择不同的 芍药品种,选用赤芍可能会增加其适用症也可能会引入部分副作用,这需要进一步的药效 分子同靶点的作用分析。牡丹花同芍药的共有药效物质数目最多,其可能协同芍药以增强 其功能,此外牡丹花还对桃仁有一定的辅助作用。牡丹也有自身独特的药效分子群,其在本 方中也可能有独特的药效。
[0110] 最后,基于方剂的君药、臣药、佐药、使药各自对应的靶点构建药材-疾病生物网 络,以预测君药、臣药、佐药和使药各自对应的靶点同疾病的作用关系。如图7所示,方剂和 疾病的相关性是建立在药材、成分和靶点的层层关系上的。具体作用关系过程获取请参见 上述步骤S13相关内容。
[0111] 本发明实施例首先接收中医药生物信息处理请求;然后响应于中医药生物信息处 理请求,从预先配置的信息处理策略库中查找出与该请求匹配的信息处理策略,并根据匹 配的信息处理策略对所述中医药生物信息处理请求进行处理,生成处理结果;最后返回携 带有处理结果的处理响应。从而实现了对中医药生物信息处理请求的自动处理,提高了中 医药生物信息处理的效率。
[0112] 本领域技术人员还可以了解到本发明实施例列出的各种说明性逻辑块、单元和步 骤可以通过硬件、软件或两者的结合来实现。至于是通过硬件还是软件来实现取决于特定 的应用和整个系统的设计要求。本领域技术人员可以对于每种特定的应用,可以使用各种 方法实现所述的功能,但这种实现不应被理解为超出本发明实施例保护的范围。
[0113] 本发明实施例中所描述的各种说明性的逻辑块,或单元都可以通过通用处理器, 数字信号处理器,专用集成电路(ASIC),现场可编程门阵列或其它可编程逻辑装置,离散门 或晶体管逻辑,离散硬件部件,或上述任何组合的设计来实现或操作所描述的功能。通用处 理器可以为微处理器,可选地,该通用处理器也可以为任何传统的处理器、控制器、微控制 器或状态机。处理器也可以通过计算装置的组合来实现,例如数字信号处理器和微处理器, 多个微处理器,一个或多个微处理器联合一个数字信号处理器核,或任何其它类似的配置 来实现。
[0114] 本发明实施例中所描述的方法或算法的步骤可以直接嵌入硬件、处理器执行的软 件模块、或者这两者的结合。软件模块可以存储于RAM存储器、闪存、ROM存储器、EPROM存 储器、EEPR0M存储器、寄存器、硬盘、可移动磁盘、⑶-ROM或本领域中其它任意形式的存储 媒介中。示例性地,存储媒介可以与处理器连接,以使得处理器可以从存储媒介中读取信 息,并可以向存储媒介存写信息。可选地,存储媒介还可以集成到处理器中。处理器和存储 媒介可以设置于ASIC中,ASIC可以设置于用户终端中。可选地,处理器和存储媒介也可以 设置于用户终端中的不同的部件中。
[0115] 在一个或多个示例性的设计中,本发明实施例所描述的上述功能可以在硬件、软 件、固件或这三者的任意组合来实现。如果在软件中实现,这些功能可以存储与电脑可读的 媒介上,或以一个或多个指令或代码形式传输于电脑可读的媒介上。电脑可读媒介包括电 脑存储媒介和便于使得让电脑程序从一个地方转移到其它地方的通信媒介。存储媒介可以 是任何通用或特殊电脑可以接入访问的可用媒体。例如,这样的电脑可读媒体可以包括但 不限于RAM、ROM、EEPROM、CD-ROM或其它光盘存储、磁盘存储或其它磁性存储装置,或其它 任何可以用于承载或存储以指令或数据结构和其它可被通用或特殊电脑、或通用或特殊处 理器读取形式的程序代码的媒介。此外,任何连接都可以被适当地定义为电脑可读媒介,例 如,如果软件是从一个网站站点、服务器或其它远程资源通过一个同轴电缆、光纤电缆、双 绞线、数字用户线(DSL)或以例如红外、无线和微波等无线方式传输的也被包含在所定义 的电脑可读媒介中。所述的碟片(disk)和磁盘(disc)包括压缩磁盘、镭射盘、光盘、DVD、 软盘和蓝光光盘,磁盘通常以磁性复制数据,而碟片通常以激光进行光学复制数据。上述的 组合也可以包含在电脑可读媒介中。
[0116] 以上所述的具体实施例,对本发明的目的、技术方案和有益效果进行了进一步详 细说明,所应理解的是,以上所述仅为本发明的具体实施例而已,并不用于限定本发明的保 护范围,凡在本发明的精神和原则之内,所做的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本 发明的保护范围之内。
【主权项】
1. 一种中医药生物信息处理方法,其特征在于,包括以下步骤: 接收中医药生物信息处理请求; 响应于所述中医药生物信息处理请求,从预先配置的信息处理策略库中查找出与该请 求匹配的信息处理策略; 根据所述匹配的信息处理策略对所述中医药生物信息处理请求进行处理,生成处理结 果; 返回携带有所述处理结果的处理响应。2. 根据权利要求1所述的中医药生物信息处理方法,其特征在于,所述信息处理策略 为预先设置的中医药生物信息处理路径。3. 根据权利要求1所述的中医药生物信息处理方法,其特征在于,所述根据匹配的信 息处理策略对所述中医药生物信息处理请求进行处理,包括: 查找第一关系表,获取与所述中医药生物信息处理请求中携带的功能主治信息相对应 的各种药材; 查找第二关系表,获取其中每种药材的有效成分; 查找第三关系表,获取所述每种药材的有效成分与其所作用的靶点的分子对接情况; 对每种药材的有效成分与其所作用的靶点的分子对接情况进行排序
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