一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法

文档序号:9810882阅读:287来源:国知局
一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法
【专利说明】一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法 【技术领域】
[0001] 本发明涉及乳腺肿瘤诊断技术领域,特别是基于聚类分析与软测量建模的乳腺肿 瘤诊断方法的技术领域。 【【背景技术】】
[0002] 目前,乳腺肿瘤已经成为世界上妇女发病率最高的癌症,研究表明,乳腺恶性肿瘤 若能早期发现、早期诊断、早期治疗,可以取得良好的效果。现有的研究与诊断方法,尤其是 对乳腺图像的分析日趋成熟。医学研究表明,乳腺肿瘤病灶组织的细胞核显微图像与正常 组织的细胞核显微图像不同,但是用一般的图像处理技术很难对其进行区分。因此,运行科 学的方法,根据乳腺肿瘤病灶组织的细胞核显微图像来对乳腺肿瘤进行良性、恶性的诊断 显得十分重要。
[0003] 本发明是获取乳腺肿瘤病灶组织的细胞核显微图像数据库的数据,将细胞核图像 的量化特征作为输入,来建立与肿瘤性质的关系,即是可以根据该细胞核显微图像的量化 特征来诊断乳腺肿瘤是良性还是恶性。 【
【发明内容】

[0004] 本发明的目的就是解决现有技术中的问题,提出一种乳腺肿瘤的建模与诊断方 法,可以根据组织细胞核显微图像的量化特征来直观的诊断肿瘤性质。
[0005] 为实现上述目的,本发明提出了一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,所述方法利用 传播仿射聚类方法(AP)来对数据库的细胞核显微图像进行样本分类,再通过偏最小二乘算 法(PLS)对聚类结果进行软测量建模,最后利用开关连接的方式得到多模型的输出,即乳腺 肿瘤的性质,具体步骤包括:
[0006] (a)数据预处理:确定样本数量与样本维数,划分训练样本与测试样本,对所有样 本中的数据进行"3σ"筛选;
[0007] (b)聚类分析:利用ΑΡ算法自动对训练样本进行聚类分析,得到聚类中心与每一类 的样本集;
[0008] (c)软测量建模:通过PLS对聚类获得的每一类样本集进行软测量建模,分别获得 对应的输出结果,即良性为"0",恶性为"Γ ;
[0009] (d)多模型连接:利用测试样本测试(c)步骤中建立的多模型,并计算各测试样本 的隶属度作为多模型开关连接的判断依据。
[0010] 作为优选,所述(a)步骤中,样本维数为10,组织细胞核显微图像的量化特征分别 为细胞核半径、质地、周长、面积、光滑性、紧密度、凹陷度、凹陷点数、对称度、断裂度。
[0011] 作为优选,所述(b)步骤中,传播仿射聚类算法(AP)不需要初始化确定聚类数与聚 类中心,可以对训练样本实现自动分类。
[0012] 作为优选,所述(d)步骤中,测试样本测试多模型时,各个子模型的输出可能不同, 在最后诊断肿瘤性质时,需计算测试样本与聚类中心的隶属度,隶属度最大所对应的输出 结果即是最终的诊断结果。
[0013] 本发明的有益效果:本发明通过采集病灶组织细胞核显微图像的量化特征,来建 立与肿瘤性质之间的关系,建模方法直观,而利用传播仿射聚类算法(AP)与偏最小二乘算 法(PLS)来建模的多模型使得最终的诊断结果精度高,大大降低了误诊率。
[0014] 本发明的特征及优点将通过实施例进行详细说明。 【【具体实施方式】】
[0015] 本发明一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,具体步骤包括:
[0016] 步骤一、确定样本数量与样本维数,划分训练样本与测试样本,对所有样本中的数 据进行"3σ"筛选;
[0017] 步骤二、利用ΑΡ算法自动对训练样本进行聚类分析,得到聚类中心与每一类的样 本集;
[0018]步骤三、通过PLS对聚类获得的每一类样本集进行软测量建模,分别获得对应的输 出结果,即良性为"〇",恶性为"Γ;
[0019] 步骤四、利用测试样本测试(c)步骤中建立的多模型,并计算各测试样本的隶属度 作为多模型开关连接的判断依据。
[0020] 其中,步骤二的传播仿射聚类算法(ΑΡ)避免了传统聚类算法中需要事先确定初始 聚类数目和聚类中心的问题,且所得聚类中心必定是样本中的点,防止产生没有实际意义 的聚类中心。
[0021 ]仿射聚类算法的基本步骤为:
[0022] 1、设置参考度Ρ,计算相似度矩阵,令S(i,i) =p,i = 1,2,…η,初始化阻尼系数lam =median(S),证据矩阵 R(i,k) = 0,A(i,k)=0,(i = l,2,.",n;k=l,2,.",n)〇
[0023] 2、根据下列公式,更新证据矩阵R(i,k)及A(i,k):
[0024] R(i,k)=S(i,k)-max[A(i, j)+S(i, j)] je (1,2, ???k-l ,k+l, ··· ,η)
[0026] R(i,k)=p(k)-max(A(k,j)+S(k,j)) je[l,n],j^k
[0027] 为了调节聚类算法的更新速度,使用阻尼系数lam对证据矩阵进行控制:
[0028] R(i,k) = (l_lam)*R(i,k)+lam*R,(i,k)
[0029] A(i,k) = (l_lam)*A(i,k)+lam*A,(i,k)
[0030] 其中1?'(1,1〇^'(11〇为上一次迭代的证据矩阵;5(1,」)用来描述样本1和样本」 的相似性,一般使用欧式距离来计算,可以取为S(i,j)=_| |(Xl-Xj)2+(ym)2| |,若样本越 相似,则s(i,j)的值越大;p(i)表示样本i作为聚类中心的参考度;R(i,k)用来描述样本k适 合作为样本i的聚类中心的程度;A(i,k)用来描述样本i选择样本k作为其聚类中心的适合 程度;lam为阻尼系数,用于算法迭代过程中证据矩阵的更新。
[0031] 3、更新完成后,寻找每个样本的聚类中心,若1?仏,1〇+4仏,1〇>0则可将样本1^作为 聚类中心。对于样本i而言,聚类中心k使得以1,1〇+4(1,1〇氺=1,2,~,11取为最大值。
[0032] 4、判断是否满足迭代终止条件,若达到算法迭代次数,或者在若干次迭代中聚类 中心均无变化,则转向步骤(5),否则转步骤(2)。
[0033] 5、仿射传播聚类迭代算法结束,输出各个聚类中心,以及属于这个聚类对应的样 本。
[0034] 参考度P可以根据实际的工况而调整,而阻尼参数lam常设定在[0.5,0.9],适当调 整lam可以改进算法的收敛性。
[0035]步骤四中的开关连接是指:
[0036]对测试样本X进行预测时,首先按照式(6)计算该样本对各个子模型的隶属度,然 后使用开关切换的形式将多个模型的输出进行比较,得到组合模型的预测结果y。
[0039] 其中,在计算样本隶属度时,需要考虑辅助变量对模型输出的影响。
[0040] 本发明工作过程:
[0041] 本发明通过采集病灶组织细胞核显微图像的量化特征,来建立与肿瘤性质之间的 关系,建模方法直观,而利用传播仿射聚类算法(AP)与偏最小二乘算法(PLS)来建模的多模 型使得最终的诊断结果精度高,大大降低了误诊率。
[0042]上述实施例是对本发明的说明,不是对本发明的限定,任何对本发明简单变换后 的方案均属于本发明的保护范围。
【主权项】
1. 一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,其特征在于:所述方法利用传播仿射聚类方法 (AP)来对数据库的细胞核显微图像进行样本分类,再通过偏最小二乘算法(PLS)对聚类结 果进行软测量建模,最后利用开关连接的方式得到多模型的输出,即乳腺肿瘤的性质,具体 步骤包括: (a) 数据预处理:确定样本数量与样本维数,划分训练样本与测试样本,对所有样本中 的数据进行"3σ"筛选; (b) 聚类分析:利用ΑΡ算法自动对训练样本进行聚类分析,得到聚类中心与每一类的样 本集; (c) 软测量建模:通过PLS对聚类获得的每一类样本集进行软测量建模,分别获得对应 的输出结果,即良性为"0",恶性为"Γ ; (d) 多模型连接:利用测试样本测试(c)步骤中建立的多模型,并计算各测试样本的隶 属度作为多模型开关连接的判断依据。2. 如权利要求1所述的一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,其特征在于:所述(a)步骤中, 样本维数为10,组织细胞核显微图像的量化特征分别为细胞核半径、质地、周长、面积、光滑 性、紧密度、凹陷度、凹陷点数、对称度、断裂度。3. 如权利要求1所述的一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,其特征在于:所述(b)步骤中, 传播仿射聚类算法(AP)不需要初始化确定聚类数与聚类中心,可以对训练样本实现自动分 类。4. 如权利要求1所述的一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,其特征在于:所述(d)步骤中, 测试样本测试多模型时,各个子模型的输出可能不同,在最后诊断肿瘤性质时,需计算测试 样本与聚类中心的隶属度,隶属度最大所对应的输出结果即是最终的诊断结果。
【专利摘要】本发明公开了一种乳腺肿瘤的建模与诊断方法,具体步骤包括:(a)数据预处理;(b)聚类分析:利用AP算法自动对训练样本进行聚类分析,得到聚类中心与每一类的样本集;(c)软测量建模:通过PLS对聚类获得的每一类样本集进行软测量建模,分别获得对应的输出结果,即良性为“0”,恶性为“1”;(d)多模型连接:利用测试样本测试(c)步骤中建立的多模型,并计算各测试样本的隶属度作为多模型开关连接的判断依据。本发明通过采集病灶组织细胞核显微图像的量化特征,来建立与肿瘤性质之间的关系,建模方法直观,而利用传播仿射聚类算法(AP)与偏最小二乘算法(PLS)来建模的多模型使得最终的诊断结果精度高,大大降低了误诊率。
【IPC分类】G06F19/00
【公开号】CN105574356
【申请号】CN201610094313
【发明人】周栋
【申请人】周栋
【公开日】2016年5月11日
【申请日】2016年2月20日
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