一种与家兔重要经济性状相关的分子标记及其检测方法和应用的制作方法
【专利摘要】本发明公开了一种与家兔重要经济性状相关的分子标记及其检测方法和应用。通过对家兔UCP2基因编码区SNPs位点的检测和分析筛选，以c.72G>A位点为候选SNP，分析了该位点与家兔生长性状、屠体性状和肉质性状三大重要经济性状的关联性，为家兔重要经济性状的分子标记辅助选择提供了一个新的分子标记，有利于家兔早期选种、缩短世代间隔和提高育种效率，同时，针对难以测定的屠体性状和肉质性状，有利于提高选种的准确性和效率。
【专利说明】一种与家兔重要经济性状相关的分子标记及其检测方法和应用
【技术领域】
[0001]本发明涉及分子标记辅助选择技术，尤其涉及的是一种与家兔重要经济性状相关的分子标记及其检测方法和应用。
【背景技术】
[0002]分子标记辅助选择(marker assisted selection, MAS)是在分子遗传学、数量遗传学和生物技术的基础上，发展起来的一种对家养动物进行科学选种的方法。MAS的核心技术是寻找到与育种目标性状显著关联的分子标记，而单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphism, SNP)是人类和动物基因组中广泛分布的一类遗传标记，是继限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)和微卫星多态性(microsatellite polymorphism)之后最具潜力的第三代分子遗传标记。因此,SNP已成为目前应用于MAS最广泛的一类分子标记。
[0003]MAS的一般步骤包括:候选基因的选择；SNP位点的检测；与性状的关联分析；关联分析的验证试验；在寻找到与性状显著关联的分子标记后，结合表型和系谱信息，进行选种。在寻找到有效分子标记后，开发快速简便的检测该分子标记的技术方法是MAS应用的关键。
[0004]目前在家畜育种中最常用的选种方法是表型选择。表型选择是指对动物自身及与之有血缘关系的个体的表型性状进行测定，结合系谱信息和性状的遗传参数，利用数量遗传学的方法，同时对环 境效应进行校正后，估计出后备个体的育种值，以育种值的高低决定是否留种。
[0005](I)传统表型选择利用的是所测得的表型性状的数据，动物生产性能的表型性状是由遗传因素和环境因素的共同作用形成的，决定选种准确性就在于对遗传因素部分的准确估计。而现有的数量遗传学方法对环境因素百分之百校正的难度较大。
[0006](2)传统选种方法受到年龄的限制，如家兔的出栏体重，只能等到出栏时才能进行测定和选种，不能进行早期选择，世代间隔较长，选种效率不高。
[0007](3)对难于测定和度量的性状，如屠体性状和肉质性状，传统方法通常采用间接测定和遗传相关来获得，信息准确性不高，选择的准确性和效率低下。
[0008]缩略语和关键术语定义
[0009]MAS:marker assisted selection,分子标记辅助选择；
[0010]UCP2:uncoupling protein2,解偶联蛋白 2 ；
[0011]SNP:single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性；
[0012]RFLP !restriction ragment length polymorphism,限制性片段长度多态性。
【发明内容】
[0013]本发明所要解决的技术问题是针对现有技术的不足提供一种与家兔重要经济性状相关的分子标记及其检测方法和应用。
[0014]本发明的技术方案如下:
[0015]一种与家兔重要经济性状相关的分子标记，该分子标记为UCP2基因c.72G>A位点。
[0016]所述的分子标记的检测方法，包括以下步骤:
[0017](I)、引物设计:根据NCBI数据库家兔UCP2基因的参考序列，采用PrimerPremier5.0软件设计引物；
【权利要求】
1.一种与家兔重要经济性状相关的分子标记，该分子标记为UCP2基因c.72G>A位点。
2.根据权利要求1所述的分子标记的检测方法，其特征在于，包括以下步骤: (1)、引物设计:根据NCBI数据库家兔UCP2基因的参考序列，采用PrimerPremier5.0软件设计引物；
3.根据权利要求1所述的分子标记的应用，其特征在于，应用于家兔分子标记辅助选择育种。
【文档编号】C12Q1/68GK103937791SQ201410201690
【公开日】2014年7月23日 申请日期:2014年5月13日 优先权日:2014年5月13日
【发明者】刘文超, 赖松家, 陈仕毅, 贾先波, 王杰 申请人:四川农业大学