用于鉴定、评价和治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法与流程

文档序号:15298846发布日期:2018-08-31 19:53阅读:396来源:国知局

本公开涉及用于治疗具有一个或多个细胞遗传学改变的患者体内的多发性骨髓瘤的方法。特定来说,本公开提供用于通过以下方式来治疗具有一个或多个细胞遗传学改变的患者体内的多发性骨髓瘤的方法:如果通过评估所述细胞遗传学改变的存在而将患者鉴定为对包括蛋白酶体抑制剂或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式的治疗方案的可能响应者,那么向所述患者施用所述治疗方案。

相关申请

本申请要求以下美国临时申请号的优先权:2015年11月4日提交的62/250,844、2015年12月4日提交的62/263,261、2015年12月10日提交的62/265,768、2016年1月8日提交的62/276,645和2016年5月10日提交的62/334,172。前述申请的整个内容以引用的方式整体并入本文。

背景

尽管在用蛋白酶体抑制剂(pi)、免疫调节药物和干细胞移植(sct)疗法达成的新型疗法方面取得进步,但多发性骨髓瘤作为骨髓内恶性浆细胞的b细胞肿瘤仍然是不可治愈的。多发性骨髓瘤的特征在于浆细胞在骨髓(和其它器官)中积累,并且可导致骨髓衰竭、骨破坏、高钙血症和肾衰竭。它占全世界所有报道赘瘤的约1%以及血液学癌症的约13%。在美国、加拿大和西欧国家,每年每100,000人中有约5至7例新发多发性骨髓瘤被诊断出。palumbo和anderson,nengljmed2011;364(11):1046-60;landgren和weiss,leukemia2009;23(10):1691-7;harousseau等,annalsofoncology2008;19增刊2:ii55-7。尽管在亚洲国家不太常见,但在过去25年中,多发性骨髓瘤的发病率已增加几乎4倍,并且特征在于发病年龄较轻、疾病更具侵袭性以及预后不太有利(huang等,cancer2007;110(4):896-905;qiu等,clinicalepidemiologicalstudyonmultiplemyelomainchina(ashannualmeetingabstracts)2008;112(11):摘要2723)。

多发性骨髓瘤对用于初始治疗与复发疾病两者的许多细胞毒性药物敏感,所述药物包括烷基化剂、蒽环霉素(anthracycline)和皮质类固醇(corticosteroid)。在过去的十年中,已在用新型疗法诸如沙利度胺(thalidomide)、硼替佐米(bortezomib)和来那度胺(lenalidomide)扩大针对多发性骨髓瘤的治疗选项方面取得显著成就。这些方案已使无进展存活期(pfs)和/或进展时间(ttp)延长(palumbo等,leukemia2008;22(2):414-23;mateos等,journalofclinicaloncology2010;28(13):2259-66;gay等,haematologica2010;94:0507;richardson等,hematology2007:317-23;dimopoulos等,leukemia2009;23(11):2147-52)。引入新型疗法和增加使用高剂量疗法(hdt)使适合于自体同源干细胞移植(asct)的患有新诊断的多发性骨髓瘤(ndmm)的患者的总体存活期显著提高(kumar等,blood2008;111(5):2516-20;brenner等,blood2008;111(5):2521-6;libby等,decliningmyelomamortalityratesintheunitedstatesfollowingintroductionofnoveltherapies,internationalmyelomaworkshopparis,france;2011)。

尽管治疗选项变得更多,但多发性骨髓瘤仍然是不可治愈的,并且患有早期癌症的患者在他们的初始疗法之后仍然处于复发风险下。当患者在他们的初始疗法之后复发时,他们显示对后续治疗的可变响应,伴有响应可能性和响应持续时间(dor)降低。患者变成核准疗法所难治,并且最终处于不具有替代性治疗选项的状况下。重要的是,尽管采用并有几乎每种可用药物和治疗模态的侵入疗法,但某一子组的具有某些细胞遗传学异常或改变(总称为高风险多发性骨髓瘤)的患者的存活仍然不良。因此,仍然需要用以在这个患者群体中克服高风险预后因素以及改进响应率和存活率的新型且更好的药物和方案或策略。

描述

除非另外定义,否则本文所用的所有技术和科学术语都具有与由本公开所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。

除非另外指示,否则本文所用的术语将被给予以下定义的含义。

“治疗”将意指使用疗法来预防或抑制进一步肿瘤生长,以及导致肿瘤或肿瘤负荷缩减,并且提供较长存活时间。治疗也意图包括预防肿瘤转移。如果癌症或肿瘤的至少一种症状(如通过响应性/非响应性、进展时间或本领域中已知和本文所述的指标所确定)得以减轻、终止、减缓、最小化或预防,那么肿瘤被“抑制”或“治疗”。

如本文所用的“治疗方案”是指用单独分子治疗或与另一分子组合治疗。治疗方案也指施用分子或分子组合的剂量、给药频率和次数。

如本文所用,“有利”结果或预后是指长期存活、长久进展时间(ttp)和/或良好响应。相反,“不利”结果或预后是指短期存活、短暂进展时间(ttp)和/或不良响应。

如本文所用,“长久进展时间”、“长久ttp”和“短暂进展时间”、“短暂ttp”是指直至当由治疗所致的稳定疾病转变成活动性疾病时的时间量。有时,治疗导致既不是良好响应也不是不良响应的稳定疾病,例如mr,疾病只是持续一段时期不变得更糟,例如变为进行性疾病。这个时期可为至少4-8周、至少3-6个月或超过6个月。

术语“存活”是指患者保持活着,并且包括无进展存活(pfs)和总体存活(os)。存活可通过卡普兰-迈耶(kaplan-meier)方法来估计,并且使用分层对数秩检验计算任何存活差异。

术语“无进展存活期(pfs)”是指从治疗(或随机化)开始直至首次疾病进展或死亡的时间。举例来说,它是从启动治疗开始或从初始诊断开始,患者在不恢复癌症下保持活着的时间(例如持续确定时期,诸如约一个月、两个月、三个月、三个半月、四个月、五个月、六个月、七个月、八个月、九个月、约一年、约两年、约三年、约五年、约10年、约15年、约20年、约25年等)。可通过使用国际骨髓瘤工作组(internationalmyelomaworkinggroup,imwg)标准来测量在多发性骨髓瘤的情况下的无进展存活期。

术语“总体存活”是指从启动治疗开始或从初始诊断开始,患者持续确定时期(诸如约一年、约两年、约三年、约四年、约五年、约10年、约15年、约20年、约25年等)保持活着。

术语“蛋白酶体介导的病症”是指由蛋白酶体表达或活性增加引起或特征在于蛋白酶体表达或活性增加,或需要蛋白酶体活性的任何病症、疾病或病状。术语“蛋白酶体介导的病症”也包括其中抑制蛋白酶体活性是有益的任何病症、疾病或病状。蛋白酶体抑制剂是阻断蛋白酶体的作用的药物,所述蛋白酶体是使如p53蛋白的蛋白质分解的细胞复合物。蛋白酶体抑制剂正在对尤其是多发性骨髓瘤的癌症的治疗中进行研究。蛋白酶体抑制剂的实例是硼替佐米、卡非佐米(carfilzomib)、艾沙佐米(ixazomib)、双硫仑(disulfiram)、表没食子儿茶素-3-没食子酸(epigallocatechin-3-gallate)、盐孢菌酰胺a(salinosporamida)、onx0912、cep-18770和环氧霉素(epoxomicin)。

术语“约”在本文中用于意指近似、在……左右、大致或大约。当术语“约”与数值范围联合使用时,它通过使边界延伸高于和低于阐述的数值来修饰那个范围。一般来说,术语“约”在本文中用于以高于和低于陈述的值变化10%来修饰数值。

术语“包含”是指“包括但不限于”。

术语“药学上可接受的载体”在本文中用于指代可与优选是哺乳动物,更优选是人的接受受试者相容,并且适于将活性剂递送至靶标部位而不使所述药剂的活性终止的物质。与载体相关的毒性或不利作用如果有的话,那么应与合理的风险/益处比率相称以达成活性剂的预定用途。

术语“口服”是指施用意图加以摄取的组合物。口服形式的实例包括但不限于片剂、丸剂、胶囊、粉剂、颗粒剂、溶液或混悬液以及滴剂。所述形式可被完整吞咽,或可呈可咀嚼形式。

如本文所用的术语“患者”意指动物,优选是哺乳动物,更优选是人。

“细胞遗传学改变”是染色体变化诸如染色体中的缺失、重复或易位。

“试剂盒”是包括至少一种用于特异性检测本公开的一个或多个细胞遗传学改变的试剂例如探针的任何制品(例如包装或容器)。制品可以用于例如在体外例如对已从患者获得的样品进行本公开方法的单元形式推销、销售、售卖或提供以进行出售。这种试剂盒中包括的试剂可包括用于检测一个或多个细胞遗传学改变的探针/引物和/或抗体。此外,本公开的试剂盒可含有描述适合检测测定的说明书。这种试剂盒可宜例如在临床或合同测试环境中用于产生待记录、储存、传递或接收的信息以允许诊断、评价或治疗展现多发性骨髓瘤的症状的患者。

如本文所用,术语“评价患者”是指审阅或分析患者的细胞遗传学改变的举动。评价可进一步包括以下中的一者或多者:获得来自患者的样品,例如来自体液的样品(例如血液样品、血清样品、尿液样品、滑膜液样品、泪液样品、唾液样品)或组织样品(例如皮肤样品或从活检体获得的组织样品)或在体内分析样品;测定所述样品或请求使用所述样品进行测定以获得关于所述患者的细胞遗传学改变的基因组信息;使用用所述样品得到的测定结果和/或患者的医学记录,审阅所述患者的信息。可接着任选将患者的信息(例如关于患者的细胞遗传学改变的基因组信息或数值)与参照标准例如可公开获得的信息(即相对于参照群体)进行比较以作出关于针对那个患者的治疗选项的知情决定。

术语“硼酸酯(boronateester)”和“硼酸酯(boronicester)”可互换使用,并且是指含有–b(z1)(z2)部分的化合物,其中z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开提供一种治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(i)确定所述患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变,以及

(ii)如果所述患者在染色体17处具有细胞遗传学改变,那么向有此需要的患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(i)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中

环a是

并且

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(ia):

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开提供一种治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(i)确定所述患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变,以及

(ii)如果所述患者在染色体17处具有细胞遗传学改变,那么向有此需要的患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(ii):

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:

环a在以上定义;r1和r2独立地是-(ch2)p-co2h;其中一个羧酸任选与硼原子形成另一键;n是0或1;并且p是0或1。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(iii):

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中环a在以上定义。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(iiia):

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(iv):

或其酯或药学上可接受的盐。

在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(iiia)。在一些实施方案中,式(i)化合物的特征在于具有式(iv)。在一些实施方案中,式(ia)化合物的特征在于具有式(iiia)。在一些实施方案中,式(ia)化合物的特征在于具有式(iv)。

式(iv)化合物,也称为艾沙佐米,是由millenniumpharmaceuticals,inc开发的肽硼酸。艾沙佐米是强力、可逆以及选择性抑制蛋白酶体的生物活性分子。式(iiia)化合物是艾沙佐米的柠檬酸酯,在本文中被称为柠檬酸艾沙佐米。柠檬酸艾沙佐米在与血浆或水溶液接触后快速水解成艾沙佐米。

在一些实施方案中,口服施用式(i)、(ia)、(ii)、(iii)、(iiia)或(iv)化合物。在一些实施方案中,以固体剂型施用式(i)、(ia)、(ii)、(iii)、(iiia)或(iv)化合物。在一些实施方案中,固体剂型是胶囊。在某一实施方案中,胶囊包含式(iiia)化合物或其药学上可接受的盐、微晶纤维素、滑石和硬脂酸镁的混合物。在一些实施方案中,胶囊包含式(iiia)化合物、微晶纤维素、滑石和硬脂酸镁的混合物。

用于制备式(i)、(ia)、(ii)、(iii)、(iiia)和(iv)化合物和式(i)、(ia)、(ii)、(iii)、(iiia)和(iv)化合物的药物组合物的合成方法例如描述于美国专利7,442,830、美国专利7,687,662、美国专利8,003,819、美国专利8,530,694和国际专利公布wo2009/154737中,所述专利据此以引用的方式明确且整体并入本文。

在一些实施方案中,在28天循环的第1、8和15天中的每一天施用式(i)化合物。在一些实施方案中,在28天循环的第1、8和15天中的每一天施用式(ia)化合物。在一些实施方案中,在28天循环的第1、8和15天中的每一天施用式(iiia)化合物。在一些实施方案中,在28天循环的第1、8和15天中的每一天施用式(iv)化合物。

在一些实施方案中,施用的式(iv)化合物的量是4mg、3mg或2.3mg。在一些实施方案中,施用的式(iv)化合物的量是4mg。在一些实施方案中,施用的式(iv)化合物的量是3mg。在一些实施方案中,施用的式(iv)化合物的量是2.3mg。在一些实施方案中,胶囊中含有的式(iiia)化合物的量是5.7mg,等效于4mg式(iv)化合物。在一些实施方案中,胶囊中含有的式(iiia)化合物的量是4.3mg,等效于3mg式(iv)化合物。在一些实施方案中,胶囊中含有的式(iiia)化合物的量是3.3mg,等效于2.3mg式(iv)化合物。

在一些实施方案中,治疗方案进一步包括额外治疗剂。在一些实施方案中,额外治疗剂是免疫调节药物。免疫调节药物的实例包括来那度胺和泊马度胺(pomalidomide)。在一些实施方案中,免疫调节药物是来那度胺。在一些实施方案中,施用的来那度胺的量是25mg。在一些实施方案中,在28天循环的第1-21天中的每一天施用来那度胺。

在一些实施方案中,额外治疗剂是类固醇。类固醇的实例包括地塞米松(dexamethasone)和泼尼松(prednisone)。在一些实施方案中,额外治疗剂是地塞米松。在一些实施方案中,施用的地塞米松的量是40mg。在一些实施方案中,在28天循环的第1、8、15和22天中的每一天施用地塞米松。

在一些实施方案中,额外治疗剂是来那度胺和地塞米松。在一些实施方案中,在28天循环的第1-21天中的每一天施用来那度胺,并且在28天循环的第1、8、15和22天中的每一天施用地塞米松。

在一些实施方案中,患有多发性骨髓瘤的患者患有新诊断的多发性骨髓瘤。在一些实施方案中,患有多发性骨髓瘤的患者患有复发的和/或难治性多发性骨髓瘤。在一些实施方案中,患有多发性骨髓瘤的患者患有复发的多发性骨髓瘤。在一些实施方案中,患有多发性骨髓瘤的患者患有难治性骨髓瘤。

多发性骨髓瘤的启始和进展可受浆细胞的不同路径和基因中的多个突变的影响。可存在导致疾病进展和治疗抗性疾病的多个通用事件。主要遗传事件包括igh易位和超二倍性,而次要遗传事件包括拷贝数异常、dna低甲基化和获得性突变。biran等,riskstratificationinmultiplemyeloma,part1,characterizationofhigh-riskdisease,hematologyandoncology,11,2013年8月(8)第489-503页。

来自国际骨髓瘤工作组的指导方针支持在诊断时以及在复发时在所有患者中进行全面细胞遗传学评价。这些推荐包括通过在纯化浆细胞中进行的间期fish(荧光原位杂交)或与免疫荧光检测轻链限定的浆细胞(cig-fish)组合来检测细胞遗传学改变。

在多发性骨髓瘤中,可通过fish检测的细胞遗传学改变包括但不限于t(4:14)、t(14:16)和del(17)。

del(17p)

大多数染色体17缺失是半合的,或影响整个p臂。这个遗传事件在约10%的新发骨髓瘤病例中观察到,其中在较晚疾病阶段中频率增加(fonseca等,blood.2003年6月1日;101(11):4569-75;tiedemann等,leukemia(2008)22,1044–1052)。在del(17p)的情况下去调控的相关基因被认为是肿瘤抑制基因即肿瘤蛋白p53(tp53),例如与genbank登记号nm_000546相关的基因,因为基因表达谱分析(gep)已显示具有单等位基因17p缺失的骨髓瘤样品相较于非缺失样品表示显著更少tp53(walker等,blood.2010年10月14日;116(15):e56-65)。因此,在一些细胞中,tp53基因可由于del17p缺失而缺失。在不具有del(17p)的情况下,tp53突变率<1%,而在具有del(17p)的情况下,此升高至25–37%(lode等,haematologica11/2010;95(11):1973-6);这个研究结果提供一定证据表明单等位基因17p缺失促进对剩余等位基因的破坏。tp53基因已被定位于17p13,并且已知应答于dna损害来充当影响细胞周期阻滞、dna修复和凋亡的转录调控子。del(17p)是对于在多发性骨髓瘤的情况下进行预后最重要的分子研究结果,因为它与侵袭性疾病表型、更大程度的髓质外疾病以及缩短的存活期相关联(fonseca等,blood.2003年6月1日;101(11):4569-75,avet-loiseau等,blood.2007年4月15日;109(8):3489-95)。

t(4:14)和t(14:16)

igh易位可在约40%的多发性骨髓瘤(mm)患者中检测到。在mm中检测到的大多数易位导致细胞周期控制改变,此是mm的早期发病机理中的统一事件(bergsagel等,blood,2005;106(1):296-303)。t(4:14)易位在约15%的患者中检测到。t(4:14)导致两个基因的上调,即多发性骨髓瘤set结构域(mmset,也称为沃夫-贺许宏综合征(wolf-hirschhornsyndrome)候选物1,whsc1)和作为受体酪氨酸激酶的纤维母细胞生长因子受体3(fgfr3)。mmset蛋白具有组蛋白甲基化活性,并且在受它的活性影响的若干基因之中,存在若干细胞周期相关基因诸如周期素(cyclin)e2、e2f转录因子2(e2f2)、肿瘤蛋白p53诱导性核蛋白质1(tp53inp1)和细胞分裂周期25a(cdc25a)蛋白。

易位t(14:16)见于约6%的多发性骨髓瘤患者中,并且也已与在多发性骨髓瘤的情况下的不利预后相关联。它含有maf转录因子家族,其由于这个易位而上调。(bergsagel等,blood.2005;106(1):296-303)。

在一些方面,本公开提供用于治疗具有一个或多个上述细胞遗传学改变的患者体内的多发性骨髓瘤的方法。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是染色体17中的缺失。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)。如本文所用,术语del(17)和del(17p)可互换使用。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17p13)。在一些实施方案中,存在至少一个其它细胞遗传学改变。在一些实施方案中,至少一个其它细胞遗传学改变是t(4:14)。在一些实施方案中,至少一个其它细胞遗传学改变是t(14:16)。在一些实施方案中,存在至少两个其它细胞遗传学改变。在一些实施方案中,至少两个其它细胞遗传学改变是t(4:14)和t(14:16)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)、t(4:14)或t(14:16)中的至少一者。

在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)和t(4:14)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)和t(14:16)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)、t(4:14)和t(14:16)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是t(4:14)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是t(14:16)。在一些实施方案中,细胞遗传学改变是del(17)以及t(4:14)和t(14:16)中的至少一者。

在一些实施方案中,本公开涉及治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(i)基于患者在染色体17处具有细胞遗传学改变来选择所述患者;以及

(ii)向所述患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开涉及评价患有多发性骨髓瘤的患者对治疗方案的响应性的方法,所述治疗方案包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯;所述方法包括以下步骤:

i)确定患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变;

ii)记录在染色体17处存在或不存在细胞遗传学改变,以及

iii)基于在染色体17处存在或不存在细胞遗传学改变来确定、推荐或选择适当治疗方案。

在一些实施方案中,步骤iii)包括基于细胞遗传学改变在染色体17处的存在性,确定是否开始或继续包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式的治疗方案。

鉴定患有多发性骨髓瘤的患者具有的细胞遗传学改变与对包括式(ia)化合物的治疗方案的临床响应性之间的关联可为用于设计用以预测将对包括式(ia)化合物的治疗方案起响应的那些个体的诊断方法的基础。或者,所述方法也可用于预测相对于不包括式(ia)化合物的治疗方案,将对包括式(ia)化合物的治疗方案起响应的个体。

用于评价患有多发性骨髓瘤的患者对包括式(ia)化合物的治疗方案的响应性或非响应性的方法可包括记录与所述患者的细胞遗传学改变状况相关的参数的值的额外步骤。

如本文所用的“记录”是指进行能够在稍后日期被访问或参照的记录的举动或过程。在一个实施方案中,以书面方式进行记录。在一个实施方案中,在纸上进行记录(例如写在患者的医学记录中或写在批记录上),或在电子介质中进行记录(例如将记录输入计算机中,例如将记录输入电子版的患者医学记录中,或将记录输入数据库中)。在另一实施方案中,通过记录某人的声音来以声音方式进行记录。在一个实施方案中,在例如磁带或光盘上进行声音记录。在一个实施方案中,记录的信息含有参照标准值。

用于评价患有多发性骨髓瘤的患者对包括式(ia)化合物的治疗方案的响应性或非响应性的方法可包括确定、推荐或选择适当治疗方案的另一步骤。

如本文所用,“确定适当治疗方案”是指审阅患者的基因型;以及任选审阅所述患者的医学史(例如关于对某些类型的药物的过敏或不耐受,或关于药物不相容性)和评估所述患者将对给定治疗方案起响应的可能性的举动或过程。

在一些实施方案中,确定患者是否具有细胞遗传学改变是指检测例如来自所述患者的样品中的细胞遗传学改变。在一些实施方案中,检测细胞遗传学改变可继之以如本文所述的治疗。

如本文所用,“推荐适当治疗方案”是指例如向患者,向患者的家庭成员或护理者,或向医务人员(例如患者的主要护理医师)建议被视为有利于患者的治疗方案的举动或过程。如本文所用,推荐可为书面推荐或口头推荐。

如本文所用,“选择适当治疗方案”是指为患者从其它治疗方案选项挑选或选择治疗方案的举动或过程。在一个实施方案中,在审阅i)患者的基因型;和/或ii)患者的医学史(例如关于对某些类型的药物的过敏或不耐受,关于药物不相容性以及关于治疗史),以及评估患者将对给定治疗方案起响应的可能性后进行选择。在另一实施方案中,基于推荐来进行选择。

在一些实施方案中,本公开提供一种治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(iii)确定所述患者是否具有处于细胞遗传学改变t(4:14)下的细胞遗传学改变;以及

(iv)如果所述患者具有细胞遗传学改变t(4:14),那么向有此需要的患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(i)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中

环a是

并且

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开提供一种治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(i)确定所述患者是否具有细胞遗传学改变t(4:14);以及

(ii)如果所述患者具有处于t(4:14)下的细胞遗传学改变,那么向有此需要的患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开提供式(ia)化合物用于治疗患有多发性骨髓瘤的患者的用途,其中所述用途包括:

(i)确定所述患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变,以及

(ii)如果所述患者在染色体17处具有细胞遗传学改变,那么选择所述患者以施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开涉及治疗患有多发性骨髓瘤的患者的方法,其包括:

(i)基于患者具有细胞遗传学改变t(4:14)来选择所述患者;以及

(ii)向所述患者施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开涉及式(ia)化合物用于治疗患有多发性骨髓瘤的患者的用途,其包括:

i)基于患者在染色体17处具有细胞遗传学改变来选择所述患者以施用治疗方案,所述治疗方案包括式(ia)化合物:

或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:

z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开涉及评价患有多发性骨髓瘤的患者对治疗方案的响应性的方法,所述治疗方案包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中:z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯,所述方法包括以下步骤:

(i)确定患者是否具有细胞遗传学改变t(4:14);

(ii)记录存在或不存在细胞遗传学改变t(4:14),以及

(iii)基于存在或不存在细胞遗传学改变t(4:14)来确定、推荐或选择适当治疗方案。

在一些实施方案中,步骤iii)包括基于细胞遗传学改变t(4:14)的存在性,确定是否开始或继续包括式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式的治疗方案。

在一些实施方案中,确定患者是否具有细胞遗传学改变包括以下步骤:

(i)提供来自所述患者的骨髓抽吸物样品;

(ii)从所述样品分离cd138阳性浆细胞;以及

(iii)对所述cd138富集的阳性浆细胞进行fish分析。

在一些实施方案中,样品是骨髓抽吸物样品。在一些实施方案中,样品是血液。在一些实施方案中,使用荧光激活的细胞分选从样品分离cd138阳性浆细胞。在一些实施方案中,使用磁激活的细胞分选(macs)从样品分离cd138阳性浆细胞。磁珠或免疫磁珠可从包括miltenyibiotec(ca,usa)或stemcelltechnologies(vancouver,canada)的许多商业来源获得。

预后测定的一般原理涉及制备可含有标志物或细胞遗传学改变和探针的样品或反应混合物,所述制备在适当条件下并持续足以允许所述标志物和所述探针相互作用和结合,由此形成可被移除和/或在所述反应混合物中检测的复合物的时间来进行。这些测定可以多种方式进行。举例来说,一种用以进行这种测定的方法将涉及使标志物或探针锚定于也被称为基底的固相支撑物上,以及检测在反应结束时锚定在所述固相上的靶标标志物/探针复合物。在这种方法的一个实施方案中,可使来自受试者的待测定标志物的存在性和/或浓度的样品锚定于载体或固相支撑物上。在另一实施方案中,相反情况是可能的,其中可使探针锚定于固相,并且可使来自受试者的样品作为测定的未锚定组分进行反应。这种实施方案的一个实例包括使用含有锚定的预测标志物或标志物组的阵列或芯片以对样品进行表达分析。

存在许多建立的用于使测定组分锚定于固相的方法。这些方法包括标志物、染色体或探针分子通过缀合生物素和链霉亲和素来固定。所述生物素化测定组分可使用本领域中已知的技术(例如生物素化试剂盒,piercechemicals,rockford,il)从生物素-nhs(n-羟基-丁二酰亚胺)制备,并且固定在链霉亲和素涂布的96孔板(piercechemical)的孔中。在某些实施方案中,具有固定的测定组分的表面可提前制备并储存。

其它适于所述测定的载体或固相支撑物包括能够结合标志物、染色体或探针所属类别的分子的任何材料。支撑物或载体的实例包括但不限于玻璃、聚苯乙烯、尼龙、聚丙烯、尼龙、聚乙烯、右旋糖苷、淀粉酶、天然和改性纤维素、聚丙烯酰胺、辉长岩(gabbros)和磁铁矿。本领域技术人员可了解许多其它适于结合抗体或抗原的载体,并且将能够采用所述支撑物来与本公开一起使用。举例来说,可使从细胞分离的蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶电泳上跑动,并且固定于固相支撑物诸如硝化纤维素上。支撑物可接着用适合缓冲液洗涤,随后用以可检测方式加以标记的抗体处理。固相支撑物可接着再次用缓冲液洗涤以移除未结合抗体。可接着通过常规手段检测结合在固体支撑物上的标记的量。

为用以上提及的方法进行测定,将非固定组分添加至其上锚定有第二组分的固相。在反应完成之后,可在使得形成的任何复合物都将保持固定在固相上的条件下移除(例如通过洗涤)未复合组分。对锚定于固相的标志物/探针复合物的检测可以本文概述的许多方法实现。

在一实施方案中,探针在它是未锚定测定组分时可出于测定的检测和读出目的,用本文讨论以及为本领域技术人员所熟知的可检测标记直接或间接标记。关于探针(例如核酸或抗体)的术语“标记”意图涵盖通过使可检测物质偶联(即物理连接)于探针来直接标记探针,以及通过与经直接标记的另一试剂的反应性来间接标记探针。间接标记的实例包括使用经荧光标记的二级抗体检测初级抗体。也有可能直接检测标志物/探针复合物形成而不进一步操作或标记任一组分(标志物或探针),例如通过利用荧光能量转移(fet,参见例如lakowicz等,美国专利号5,631,169;stavrianopoulos等,美国专利号4,868,103)的技术。选择第一‘供体’分子上的荧光团标记以使在用适当波长的入射光激发后,它的发射荧光能量将由第二‘接受体’分子上的荧光标记吸收,所述荧光标记转而能够由于吸收的能量而发荧光。或者,‘供体’蛋白质分子可仅利用色氨酸残基的天然荧光能量。选择发射不同波长的光的标记,以使‘接受体’分子标记可与‘供体’的标记区分。因为标记之间的能量转移的效率与使分子分隔的距离相关,所以可评估分子之间的空间关系。在其中结合发生在分子之间的情况下,‘接受体’分子标记在测定中的荧光发射应最大。fet结合事件可宜通过本领域中熟知的标准荧光检测手段(例如使用荧光计)来测量。

如本文所用,术语“杂交”意图描述彼此显著同一或同源的核苷酸序列保持彼此杂交所处的杂交和洗涤条件。在一些实施方案中,条件是如此以致彼此至少约70%、至少约80%、至少约85%、90%或95%同一的序列保持彼此杂交以进行后续扩增和/或检测。严格条件根据涉及的核苷酸序列的长度而不同,但为本领域技术人员所知,并且可基于currentprotocolsinmolecularbiology,ausubel等人编,johnwiley&sons,inc.(1995),第2、4和6章节中的教导来得到或确定。额外严格条件和用于确定所述条件的公式可见于molecularcloning:alaboratorymanual,sambrook等,coldspringharborpress,coldspringharbor,ny(1989),第7、9和11章中。用于长度是至少10个碱基对的杂交物的严格杂交条件的一非限制性实例包括在约65-70℃下在4x氯化钠/柠檬酸钠(ssc)中杂交(或在约42-50℃下在4xssc加50%甲酰胺中杂交),随后在约65-70℃下在1xssc中洗涤一次或多次。用于所述杂交物的高度严格杂交条件的一非限制性实例包括在约65-70℃下在1xssc中杂交(或在约42-50℃下在1xssc加50%甲酰胺中杂交),随后在约65-70℃下在0.3xssc中洗涤一次或多次。用于所述杂交物的降低严格性杂交条件的一非限制性实例包括在约50-60℃下在4xssc中杂交(或替代地,在约40-45℃下在6xssc加50%甲酰胺中杂交),随后在约50-60℃下在2xssc中洗涤一次或多次。处于以上叙述的值(例如在65-70℃下或在42-50℃下)的中间的范围也意图由本公开涵盖。严格杂交条件的另一个实例是在约45℃下在6x氯化钠/柠檬酸钠(ssc)中杂交,随后在50-65℃下在0.2xssc、0.1%sds中洗涤一次或多次。严格杂交缓冲的另一个实例是在1mnacl、50mm2-(n-吗啉代基)乙烷磺酸(mes)缓冲液(ph6.5)、0.5%肌氨酸钠和30%甲酰胺中杂交。在杂交和洗涤缓冲液中,sspe(1xsspe是0.15mnacl、10mmnah2po4和1.25mmedta,ph7.4)可替代ssc(1xssc是0.15mnacl和15mm柠檬酸钠);在杂交完成之后进行洗涤,各次15分钟。用于预期长度小于50个碱基对的杂交物的杂交温度应比杂交物的解链温度(tm)低5-10℃,其中tm根据以下等式确定。对于长度小于18个碱基对的杂交物,tm(℃)=2(a+t碱基数)+4(g+c碱基数)。对于长度在18与49个碱基对之间的杂交物,tm(℃)=81.5+16.6(log10[na+])+0.41(%g+c)-(600/n),其中n是杂交物中的碱基数目,并且[na+]是杂交缓冲液中的钠离子浓度(1xssc的[na+]=0.165m)。熟练从业者也将认识到可将额外试剂添加至杂交和/或洗涤缓冲液中以使核酸分子与膜例如硝化纤维素或尼龙膜的非特异性杂交降低,所述试剂包括但不限于阻断剂(例如bsa或鲑鱼或鲱鱼精子载体dna)、清洁剂(例如sds)、螯合剂(例如edta)、ficoll、聚乙烯吡咯烷酮(pvp)等。当使用尼龙膜时,特定来说,严格杂交条件的一额外非限制性实例是在约65℃下在0.25-0.5mnah2po4、7%sds中杂交,随后在65℃下在0.02mnah2po4、1%sds下洗涤一次或多次,参见例如church和gilbert(1984)proc.natl.acad.sci.usa81:1991-1995,(或替代地,0.2xssc、1%sds)。引物或核酸探针可单独用于检测方法中,或引物可连同至少一种其它引物或核酸探针一起用于检测方法中。引物也可用于扩增核酸的至少一部分。本公开的核酸探针是指杂交于目标区域以及不进一步延伸的核酸。举例来说,核酸探针是特异性杂交于生物标志物的突变区域,以及通过与患者的dna的杂交或不存在杂交或形成的杂交物的类型,可指示生物标志物的突变的存在性或身份或标志物活性的量的核酸。

在一种形式中,使rna固定在固体表面上,并且与探针接触,例如通过使经分离rna在琼脂糖凝胶上跑动以及将rna从凝胶转移至诸如硝化纤维素膜的膜中。在一替代性形式中,使核酸探针固定在固体表面上,并且使rna与探针接触,例如在基因芯片阵列或snp芯片(santaclara,ca)或使用包含至少一种指示治疗结果的标志物的标志物组定制的阵列中。熟练技术人员可易于采用已知rna和dna检测方法来用于检测本公开的标志物的量。举例来说,高密度微阵列或分支dna测定可受益于样品中肿瘤细胞的较高浓度,所述样品诸如已如较早章节中所述被改变以分离肿瘤细胞的样品。在一相关实施方案中,使从样品获得的转录多核苷酸的混合物与已向其固定与标志物核酸的至少一部分(例如至少7、10、15、20、25、30、40、50、100、500个或更多个核苷酸残基或10至50、15至40或15至30个连续核苷酸)互补或同源的多核苷酸的基底接触。如果与标志物互补或同源的多核苷酸可在基底上差异性检测(例如可使用不同发色团或荧光团检测,或固定于不同所选位置),那么可使用单一基底(例如固定在所选位置处的多核苷酸的“基因芯片”微阵列)同时评估多种标志物的表达水平。在一实施方案中,当使用涉及一种核酸与另一核酸的杂交的评估标志物表达的方法时,杂交可在严格杂交条件下进行。

在一实施方案中,标志物中的突变可通过对核酸例如dna、rna、cdna、基因组dna或与标志物基因相关联的蛋白质测序来鉴定。存在本领域中已知的用以对核酸测序的若干测序方法。引物可被设计来结合包含潜在突变位点的区域,或可被设计来互补于突变序列而非野生型序列。引物对可被设计来围住标志物基因中包含潜在突变的区域。引物或引物对可用于对对应于标志物基因的dna的一个链或两个链测序。引物可与探针联合在测序之前用于扩增目标区域以使用于检测标志物基因中的突变的序列量加强。可被测序的区域的实例包括整个基因、基因的转录物和基因或转录物的片段,例如外显子或非翻译区中的一者或多者。待进行靶向以达成引物选择和序列或组成分析的突变的实例可见于收集突变信息的公共数据库诸如cosmic和dbgap中。

在一实施方案中,对应于野生型或突变标志物的dna例如基因组dna可使用本领域中已知的方法通过原位形式与用生物样品进行的体外形式两者来分析。dna可直接从样品分离,或在分离另一细胞组分例如rna或蛋白质之后分离。试剂盒可用于dna分离,例如dna微型试剂盒(qiagen,valencia,ca)。dna也可使用所述试剂盒来扩增。

在一个实施方案中,通过从患者样品中的细胞制备mrna/cdna(即转录多核苷酸),以及通过使mrna/cdna与是标志物核酸或其片段的互补序列的参照多核苷酸杂交来评估标志物的表达。cdna可任选在与参照多核苷酸杂交之前使用多种聚合酶链式反应方法中的任一者来扩增。一种或多种标志物的表达同样可使用定量pcr检测以评估标志物的表达水平。使用对mrna水平进行测量的一个实例是标志物基因中的失活突变可导致细胞中mrna水平改变。水平可由于鉴于蛋白质非功能性或蛋白质不存在性的反馈信号传导蛋白质产生而上调,或由于经改变mrna序列的不稳定性而下调。或者,检测本公开的标志物的突变或变体(例如以上讨论的单核苷酸多态性、缺失等)的许多已知方法中的任一者可用于检测突变在患者中的标志物基因中的出现。

直接测量的一个实例是对转录物的定量。如本文所用,表达水平或表达量是指由标志物编码的mrna的绝对表达量,或由标志物编码的蛋白质的绝对表达量。作为基于所选标志物的绝对表达量来进行测定的一替代方案,测定可基于标准化表达量。表达量可通过在将标志物的表达与不是组成型表达的例如起持家作用的标志物的对照标志物的表达进行比较后对所述标志物的绝对表达水平进行校正来加以标准化。适于进行标准化的标志物也包括持家基因诸如肌动蛋白基因或β-2微球蛋白。用于数据标准化目的的参照标志物包括遍在表达和/或其表达不由致癌基因调控的标志物。组成型表达的基因在本领域中是已知的,并且可根据相关组织和/或患者情况以及分析方法来鉴定和选择。所述标准化使得可将一个样品中的表达水平与另一样品进行比较,例如在来自不同时间或不同受试者的样品之间比较。此外,表达水平可以相对表达水平形式提供。基因组dna样品的基线例如二倍体拷贝数可通过测量来自不具有肿瘤的受试者的细胞中或来自患者的非肿瘤细胞中的量来测定。为测定标志物或标志物组的相对量,在测定所论述的样品的表达水平之前,测定至少1或2、3、4、5个或更多个样品例如7、10、15、20或50个或更多个样品的所述标志物或标志物组的量以建立基线。为建立基线测量,对较大数目的样品中所测定的标志物或标志物组各自的平均量或平均水平进行测定,并且将此用作所论述的生物标志物或生物标志物组的基线表达水平。接着用对测试样品测定的标志物或标志物组的量(例如绝对表达水平)除以对那个标志物或标志物组获得的基线值。这提供相对量,并且有助于鉴定标志物蛋白质活性的异常水平。

基于本公开的核酸分子的序列的探针可用于检测对应于本公开的一种或多种标志物的转录物或基因组序列。探针可包含与其连接的标记基团,例如放射性同位素、荧光化合物、酶或酶辅因子。所述探针可用作诊断测试试剂盒的一部分,所述试剂盒用于鉴定表达蛋白质的细胞或组织,诸如通过测量来自受试者的细胞样品中编码蛋白质的核酸分子的水平,例如检测mrna水平或确定编码蛋白质的基因是否已被突变或缺失。

引物或核酸探针包含与特定标志物或其突变区域互补的核苷酸序列,并且具有足以与标志物基因或相关于标志物基因的核酸选择性杂交的长度。引物和探针可用于辅助对标志物核酸的分离和测序。在一个实施方案中,引物或核酸探针例如大致上纯化的寡核苷酸包含具有核苷酸序列的区域,所述核苷酸序列在严格条件下杂交于被怀疑具有细胞遗传学改变的标志物基因或染色体的约6、8、10、12或15、20、25、30、40、50、60、75、100个或更多个连续核苷酸。举例来说,引物或核酸探针包含具有标志物基因或染色体的至少约15个连续核苷酸,至少约25个核苷酸,或具有约15至约20个连续核苷酸,10至50个连续核苷酸,12至35个连续核苷酸,15至50个连续核苷酸,20至100个连续核苷酸,50至500个连续核苷酸,或100至1000个连续核苷酸的核苷酸序列。在一些实施方案中,用以检测细胞遗传学改变的包含具有染色体的至少约15个连续核苷酸的核苷酸序列的引物或核酸探针由染色体的至多200、500、750、1000、1500或2000个连续核苷酸组成。核酸类似物可用作杂交的结合位点。适合核酸类似物的一个实例是肽核酸(参见例如egholm等,nature363:566568(1993);美国专利号5,539,083)。

引物或核酸探针可使用考虑结合能量、碱基组成、序列复杂性、交叉杂交结合能量和二级结构的算法来选择(参见friend等,2001年1月25日公开的国际专利公布wo01/05935;hughes等,nat.biotech.19:342-7(2001))。本公开的适用引物或核酸探针结合各转录物独有的序列例如靶标突变区域,并且可在pcr中用于扩增、检测和测序仅仅那个特定核酸例如转录物或突变转录物。本领域技术人员可使用本领域中的技能设计针对本文公开的标志物或具有类似特征的相关标志物(例如在染色体基因座上的标志物)或本文所述的同一标志物基因的不同区域中的突变的引物和核酸探针,例如通过操作引物或核酸探针中的简并性或gc含量来调整引物或核酸探针结合标准序列、突变体或等位基因变体的潜力。本领域中熟知的计算机程序适用于设计具有所需特异性和最优扩增性质的引物,所述计算机程序诸如5.0版oligo(nationalbiosciences,plymouth,mn)。尽管完全互补性核酸探针和引物可用于检测本文所述的标志物及其突变体、多态性或等位基因,但涵盖与完全互补性的偏离,其中所述偏离不阻止分子特异性杂交于靶标区域。举例来说,寡核苷酸引物可在它的5'末端具有非互补性片段,其中引物的其余部分互补于靶标区域。或者,可使非互补性核苷酸分散至核酸探针或引物中,只要所得探针或引物仍然能够特异性杂交于靶标区域即可。

fish(荧光原位杂交)是一种由生物医学研究者在1980年代早期开发的用于检测和定位在染色体上存在或不存在特定dna序列的细胞遗传学技术。参见speicher和carter,nat.rev.genet.2005年10月;6(10)782-792。fish使用荧光探针,所述荧光探针仅结合染色体的它们显示与其具有高度序列互补性的那些部分。imwg对于多发性骨髓瘤患者推荐对来自纯化浆细胞的核进行fish测试;shi等,actamedicainternational,2015年7月-12月2(2),第168-174页。

针对细胞遗传学改变del(17)、t(4:14)和t(14:16)的探针可从多种商业来源,包括例如empiregenomics(buffalo,ny)、kreatechinc.(leicabiosystems的一部分,illinois,usa)和biocaremedical(ca,usa)获得。荧光显微术可用于查明荧光探针在何处结合于染色体。使细胞固定,接着进行可渗透化处理以允许到达靶标。靶标特异性探针例如由20对寡核苷酸组成的探针杂交于靶标rna或dna。单独但可相容的信号放大系统使得能够进行多路测定(每个测定超过两种靶标,诸如四种、六种、八种或更多种靶标)。信号放大通过一系列依序杂交步骤实现。在测定结束时,在荧光显微镜或能够激发染料以及检测来自染料的发射,任选对图像进行记录的仪器下观察样品。

制备和杂交过程:首先,构建探针。探针必须足够大以与它的靶标特异性杂交,但非如此之大以致妨碍杂交过程。探针直接用荧光团、抗体靶标或生物素加以标签化。标签化可以各种方式进行,诸如切口平移或使用标签化核苷酸进行的pcr。

其次,产生间期或中期染色体制剂。使染色体坚固连接于基底,通常是玻璃。重复dna序列必须通过将短dna片段添加至样品中来阻断。接着将探针施加于染色体dna,并且孵育约12小时,同时杂交。若干洗涤步骤移除所有未杂交或部分杂交探针。对于显微检测,接着使用能够激发染料以及对图像进行记录的显微镜观察和定量结果。

如果荧光信号微弱,那么信号的放大可为超过显微镜的检测阈值所必需。荧光信号强度取决于许多因素,诸如探针标记效率、探针的类型和染料的类型。使荧光标签化抗体或链霉亲和素结合于染料分子。选择这些二级组分以使它们具有强烈信号。一种用以使荧光信号放大的方式是使用基于酪酰胺的信号放大技术,其采用辣根过氧化物酶(hrp)以在探针杂交位点处产生高密度荧光标记。

基于测定针对del(17)的可商购获得的探针的噪声水平,每百个细胞对应5个细胞(5%)的截断值用于将个体分类为具有del(17)。在一些实施方案中,5%的截断值将个体分类为具有del(17)。在一些实施方案中,20%的截断值将个体分类为具有del(17)。在一些实施方案中,60%的截断值将个体分类为具有del(17)。

药物组合物

本文公开的化合物和药物组合物可通过任何途径来施用,包括真皮内、皮下、口服、动脉内或静脉内。在一个实施方案中,施用将通过静脉内途径来进行。胃肠外施用可以团注或通过输注来提供。

所公开化合物在药学上可接受的混合物中的浓度将视若干因素而变化,所述因素包括待施用的化合物的剂量、所用化合物的药物动力学特征和施用途径。药剂可以单次剂量或以重复剂量施用。治疗可视许多因素而定每日或更频繁施用,所述因素包括患者的总体健康状况以及所选化合物的制剂和施用途径。

如果本公开的化合物的药学上可接受的盐用于这些组合物中,那么盐优选由无机酸或碱或有机酸或碱获得。对于适合盐的综述,参见例如berge等,j.pharm.sci.66:1-19(1977)以及remington:thescienceandpracticeofpharmacy,第20版,a.gennaro编,lippincottwilliams&wilkins,2000。

适合酸加成盐的非限制性实例包括以下:乙盐酸、己二酸盐、海藻酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、丁酸盐、柠檬酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡萄糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡萄糖庚酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙烷磺酸盐、乳酸盐、顺丁烯二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、草酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐(pectinate)、过硫酸盐、3-苯基-丙酸盐、苦味酸盐、特戊酸盐、丙酸盐、丁二酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐和十一酸盐。

适合碱加成盐包括铵盐、碱金属盐诸如钠盐和钾盐、碱土金属盐诸如钙盐和镁盐、与诸如二环己胺、n-甲基-d-还原葡糖胺、叔丁胺、乙二胺、乙醇胺和胆碱的有机碱的盐、以及与诸如精氨酸、赖氨酸等的氨基酸的盐。

此外,碱性含氮基团可用诸如以下的试剂加以季铵化:卤代低级烷烃,诸如氯代甲烷、溴代甲烷和碘代甲烷、氯代乙烷、溴代乙烷和碘代乙烷、氯代丙烷、溴代丙烷和碘代丙基烷、以及氯代丁烷、溴代丁烷和碘代丁烷;硫酸二烷基酯,诸如硫酸二甲酯、硫酸二乙酯、硫酸二丁酯和硫酸二戊酯;长链卤化物,诸如氯代癸烷、氯代十二烷、氯代十四烷和氯代十八烷、溴代癸烷、溴代十二烷、溴代十四烷和溴代十八烷、以及碘代癸烷、碘代十二烷、碘代十四烷和碘代十八烷;卤代芳烷烃,诸如溴代苯甲烷和溴代苯乙烷和其它。由此获得水溶性或油溶性或可分散产物。

术语“药学上可接受的载体”在本文中用于指代可与优选是哺乳动物,更优选是人的接受受试者相容,并且适于将活性剂递送至靶标部位而不使所述药剂的活性终止的物质。与载体相关的毒性或不利作用如果有的话,那么应与合理的风险/益处比率相称以达成活性剂的预定用途。

术语“载体”、“佐剂”或“媒介物”在本文中可互换使用,并且包括如适合于所需特定剂型的任何和所有溶剂、稀释剂和其它液体媒介物、分散或混悬助剂、表面活性剂、等张剂、增稠剂或乳化剂、防腐剂、固体粘合剂、润滑剂等。remington:thescienceandpracticeofpharmacy,第20版,a.gennaro编,lippincottwilliams&wilkins,2000公开用于配制药学上可接受的组合物的各种载体和用于制备所述组合物的已知技术。除非任何常规载体介质诸如由于产生任何不合需要的生物作用或另外以有害方式与药学上可接受的组合物的任何其它组分相互作用而与本公开化合物不相容,否则预期它的使用在本公开的范围内。可充当药学上可接受的载体的物质的一些实例包括但不限于离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白质诸如人血清白蛋白、缓冲物质诸如磷酸氢二钠、磷酸氢二钾、碳酸钠、碳酸氢钠、碳酸钾、碳酸氢钾、氢氧化镁和氢氧化铝、甘氨酸、山梨酸或山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的偏甘油酯混合物、水、无热原水、盐或电解质诸如硫酸鱼精蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢二钾、氯化钠和锌盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯嵌段聚合物、羊毛脂、糖诸如乳糖、葡萄糖、蔗糖、淀粉诸如玉米淀粉和马铃薯淀粉、纤维素和它的衍生物诸如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素、粉状黄蓍胶;麦芽、明胶、滑石、赋形剂诸如可可脂和栓剂蜡、油诸如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油、二醇诸如丙二醇和聚乙二醇、酯诸如油酸乙酯和月桂酸乙酯、琼脂、海藻酸、等张盐水、林格氏溶液(ringer'ssolution)、醇诸如乙醇、异丙醇、十六醇和甘油、环糊精、润滑剂诸如月桂基硫酸钠和硬脂酸镁、石油烃诸如矿物油和矿脂。根据配制者的判断,着色剂、释放剂、包衣剂、甜味剂、调味剂和芳香剂、防腐剂和抗氧化剂也可存在于组合物中。

本公开的药物组合物可通过本领域中已知的方法制造,所述方法诸如常规粒化、混合、溶解、囊封、冻干或乳化过程以及其它。组合物可以各种形式产生,所述形式包括颗粒剂、沉淀物或散粒、粉剂,包括冷冻干燥粉剂、旋转干燥粉剂或喷雾干燥粉剂,非晶粉剂、片剂、胶囊、糖浆、栓剂、注射液、乳液、酏剂、混悬液或溶液。制剂可任选含有如适合于所需特定剂型的溶剂、稀释剂和其它液体媒介物、分散或混悬助剂、表面活性剂、ph调节剂、等张剂、增稠剂或乳化剂、稳定剂和防腐剂、固体粘合剂、润滑剂等。

根据另一实施方案,配制本公开的组合物以向优选是人类的哺乳动物进行药物施用。本公开的所述药物组合物可口服、胃肠外、通过吸入喷雾、经表面、经直肠、经鼻、经颊、经阴道或通过植入储集器加以施用。如本文所用的术语“胃肠外“包括皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病变内和颅内注射或输注技术。优选地,口服、静脉内或皮下施用组合物。本公开的制剂可被设计成具有短效性、快速释放性或长效性。更进一步,化合物可以局部手段而非全身性手段施用,诸如在肿瘤部位处施用(例如通过注射)。

供口服施用的液体剂型包括但不限于药学上可接受的乳液、微乳液、溶液、混悬液、糖浆和酏剂。除活性化合物之外,液体剂型也可含有通常用于本领域中的惰性稀释剂,诸如像水或其它溶剂;增溶剂和乳化剂,诸如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙脂、苯甲醇、苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、环糊精、二甲基甲酰胺、油(特定来说,棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢呋喃甲醇、聚乙二醇和脱水山梨醇的脂肪酸酯及其混合物。除惰性稀释剂之外,口服组合物也可包括佐剂,诸如湿润剂、乳化剂和混悬剂、甜味剂、调味剂和芳香剂。

例如无菌可注射水性或油性混悬液的可注射制剂可使用适合分散剂或湿润剂和混悬剂根据已知技术加以配制。无菌可注射制剂也可为于无毒胃肠外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液、混悬液或乳液,例如呈于1,3-丁二醇中的溶液形式。在可采用的可接受媒介物和溶剂之中的是水、u.s.p.林格氏溶液和等张氯化钠溶液。此外,无菌不挥发性油被常规用作溶剂或混悬介质。出于这个目的,可采用任何温和不挥发性油,包括合成甘油单酯或甘油二酯。此外,诸如油酸的脂肪酸用于制备可注射剂。可注射制剂可例如通过经细菌截留性过滤器过滤,或通过以可在使用之前溶解或分散于无菌水或其它无菌可注射介质中的无菌固体组合物形式并入灭菌剂来灭菌。被配制来供胃肠外施用的组合物可通过团式注射或通过定时推动来注射,或可通过连续输注来施用。

供口服施用的固体剂型包括胶囊、片剂、丸剂、粉剂和颗粒剂。在所述固体剂型中,使活性化合物与至少一种惰性药学上可接受的赋形剂或载体(诸如柠檬酸钠或磷酸二钙)和/或:a)填充剂或增量剂,诸如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇和硅酸,b)粘合剂,诸如像羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯胶,c)保湿剂,诸如甘油,d)崩解剂,诸如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠,e)溶解阻滞剂,诸如石蜡,f)吸收加速剂,诸如季铵化合物,g)湿润剂,诸如像鲸蜡醇和甘油单硬脂酸酯,h)吸收剂,诸如高岭土(kaolin)和膨润土(bentoniteclay),和i)润滑剂,诸如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠及其混合物混合。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,剂型也可包含缓冲剂诸如磷酸盐或碳酸盐。

类似类型的固体组合物也可在使用诸如乳糖(lactose/milksugar)以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂的软质和硬质填充明胶胶囊中用作填充剂。可将片剂、糖衣片、胶囊、丸剂和颗粒剂的固体剂型制备有包衣和外壳,诸如肠溶性包衣和药物配制领域中熟知的其它包衣。它们可任选含有遮光剂,并且也可具有它们仅仅或优先在肠道的某一部分中任选以延迟方式释放活性成分的组成。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。类似类型的固体组合物也可在使用诸如乳糖以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂的软质和硬质填充明胶胶囊中用作填充剂。

活性化合物也可呈具有一种或多种如上指示的赋形剂的微囊封形式。可将片剂、糖衣片、胶囊、丸剂和颗粒剂的固体剂型制备有包衣和外壳,诸如肠溶性包衣、释放控制包衣和药物配制领域中熟知的其它包衣。在所述固体剂型中,可使活性化合物与至少一种惰性稀释剂诸如蔗糖、乳糖或淀粉掺混。如同正常实践,所述剂型也可包含除惰性稀释剂以外的额外物质,例如制片润滑剂和其它制片助剂诸如硬脂酸镁和微晶纤维素。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,剂型也可包含缓冲剂。它们可任选含有遮光剂,并且也可具有它们仅仅或优先在肠道的某一部分中任选以延迟方式释放活性成分的组成。可使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。

供经表面或经皮施用本公开化合物的剂型包括软膏剂、糊剂、乳膏剂、洗剂、凝胶剂、粉剂、溶液、喷雾剂、吸入剂或贴片。使活性组分在无菌条件下与药学上可接受的载体和如可需要的任何所需防腐剂或缓冲剂掺混。眼用制剂、滴耳剂和滴眼剂也被涵盖为在本公开的范围内。另外,本公开涵盖使用经皮贴片,其具有向身体提供对化合物的控制递送的附加优势。所述剂型可通过将化合物溶解或分配于适当介质中来制备。吸收增强剂也可用于使化合物跨越皮肤的通量增加。速率可通过提供速率控制膜或通过将化合物分散于聚合物基质或凝胶中加以控制。

供在本公开方法中使用的组合物可以单位剂型配制以易于施用和达成剂量均一性。如本文所用的表达“单位剂型”是指适于待治疗的患者的药剂的物理离散单元。然而,应了解,本公开的化合物和组合物的总体每日用量将由主治医师在合理医学判断的范围内决定。供胃肠外施用的单位剂型可处于安瓿中或多次剂量容器中。

制品

在一些实施方案中,本公开涉及一种制品,其包括:

i)式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯;以及

ii)用于通过确定患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变来确定使用所述组合物的适当性的说明书。

在一些实施方案中,本公开涉及一种制品,其包括:

i)用于确定患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变的试剂,以及

ii)用于基于所述确定来确定使用药物组合物的适当性的说明书,所述药物组合物包含式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯。

在一些实施方案中,本公开涉及一种制品,其包括:

i)包含式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式的药物组合物,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯;

ii)用于确定患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变的试剂;以及

iii)用于基于所述确定来确定使用药物组合物的适当性的说明书,所述药物组合物包含式(ia)化合物或药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式。

在一些实施方案中,本公开涉及用以确定患者是否在染色体17处具有细胞遗传学改变的试剂在制造用于基于所述确定来确定使用药物组合物的适当性的试剂盒中的用途,所述药物组合物包含式(ia)化合物或其药学上可接受的盐、立体异构形式或互变异构形式,其中z1和z2各自独立地是羟基;或z1和z2一起形成具有2-20个碳原子,以及任选一个或多个选自n、s或o的杂原子的环状硼酸酯;所述用途包括鉴定所述患者是否具有所述细胞遗传学改变以及如果所述患者具有所述细胞遗传学改变,那么确定用所述化合物治疗所述患者。

实施例

c16010临床试验

研究是国际随机化双盲安慰剂对照临床试验,其被设计来比较在患有复发和/或难治性多发性骨髓瘤的成年患者中施用直至疾病进展或不可接受毒性的两种治疗方案的功效和安全性;艾沙佐米加来那度胺和地塞米松相对于安慰剂加来那度胺和地塞米松。

研究中包括的受试者具有对多发性骨髓瘤的确诊,已接受1至3种先前疗法,并且满足其它合格标准。为先前来那度胺或蛋白酶体抑制剂-基的疗法所难治的患者被排除。主要终点是无进展存活期(pfs),如由对治疗不知情的独立审查委员会根据imwg标准所评估。

下表1提供关于各患者组的条件和干预的信息。

表1:

样品处理

接收骨髓样品,使用磁珠分选技术分离cd138阳性浆细胞。10,000个cd138阳性富集的浆细胞接着用于使用特定fish探针进行的细胞遗传学测试以鉴定任何细胞遗传学改变。fish探针可从商业来源获得,并且根据制造商说明书加以储存和使用(双色/双融合或双色或三色探针):

(i)atm-p53dna探针(asr)[del(17);kreatech,inc.(目录号11q001i495;17p001i550)

(ii)4;14dna探针(asr)[t(4:14)]kreatech,inc.(目录号04p001i495,14q001i550)

(iii)14;16dna探针(asr)[t(14:16)]kreatech,inc.(目录号16q001i49,14q001i550)

对于各探针,通常由2名技术人员使用荧光显微镜对总计100个核计数。如果他们的评分不一致,那么第3名技术人员对额外核进行计数。以下截断值用于将载片评分为异常(呈细胞遗传学改变阳性):

(i)atm/p53del(17)>5

(ii)4;14dna探针[t(4:14)]>3

(iii)14;16dna探针[t(14:16)]>3

结果(研究c16010)

在首次期中分析时,已使722名患者随机化;360名处于艾沙佐米臂中,并且362名处于安慰剂比较物臂中。有76%的患者的细胞遗传学分析结果可用。主要基于中心实验室评价(97%),根据fish,19%的患者被确定具有高风险细胞遗传学改变[del(17)、t(4:14)或t(14;16),包括10%del(17)]。在具有高风险细胞遗传学改变的患者中,75名处于艾沙佐米组中,并且62名处于安慰剂组中。艾沙佐米组和安慰剂组中分别有36名患者和33名患者具有单独或与t(4;14)和t(14;16)中的任一者或两者组合的del(17p),分别有36名患者和25名患者具有单独t(4;14),并且分别有3名患者和4名患者具有单独t(14;16)。

对由至少del(17)限定的患者的分析显示相对于安慰剂臂,艾沙佐米臂的患者的中值pfs得以改进(21.4个月相对于9.7个月,hr=0.596)。对由三种高风险细胞遗传学改变(del(17)、t(4:14)和t(14:16))中的任一者限定的患者的分析显示艾沙佐米臂相对于安慰剂臂,pfs得以提高(21.4个月相对于9.7个月,hr=0.543)。响应率的额外数据以下显示在表2中。

表2:

*对于方案之间的比较,p<0.05。单独或与t(4;14)或t(14;16)组合;orr=总体响应率,vgpr=极其良好的部分响应,cr=完全响应。a95%置信区间,0.321,0.918;b95%置信区间,0.29,1.24;c95%置信区间,0.25,1.66。

如上所述,每百个细胞的5个细胞(5%)的截断值用于对具有del(17)的患者进行分类。使用20%和60%的截断值对数据的进一步分析显示于下表3中。

表3:

如上所述,每百个细胞的3个细胞(3%)的截断值用于对具有单独t(4:14)的患者进行分类。使用10%和20%的截断值对数据的进一步分析显示于下表4中。

表4

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