1.一种靶蛋白降解剂,其包括1)靶蛋白结合剂和2)e3泛素连接酶结合剂,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4或人rnf114。
2.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂能够与e3泛素连接酶的半胱氨酸形成共价键。
3.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述靶蛋白结合剂和e3泛素连接酶结合剂通过结合剂接头共价键合。
4.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
5.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
其中
r1独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r1取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
r2独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r2取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基;
r3独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chl2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基或e;
e是亲电部分;
z1为0到4的整数;
z2为0到5的整数;并且
其中仅一个r1或一个r2为与结合剂接头相连的键。
6.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,
其中
r1独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r11-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r11-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r11-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r11-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r11-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r11-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r1取代基可能任选地连接,以形成经r11-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r11-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r11-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r11-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r11独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r12-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r12-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r12-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r12-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r12-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r12-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r12独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基;
r2独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r21-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r21-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r21-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r21-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r21-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r21-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r2取代基可能任选地连接,以形成经r21-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r21-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r21-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r21-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r21独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r22-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r22-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r22-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r22-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r22-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r22-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r22独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基;
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经r3-取代或未经取代的c1-c8亚烷基、经r3-取代或未经取代的2元到8元亚杂烷基、经r3-取代或未经取代的c3-c8亚环烷基、经r3-取代或未经取代的3元到8元亚杂环烷基、经r3-取代或未经取代的c6-c10亚芳基或经r3-取代或未经取代的5元到10元亚杂芳基;
r3独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r31-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r31-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r31-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r31-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r31-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r31-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r31独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r32-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r32-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r32-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r32-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r32-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r32-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r32独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r41-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r41-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r41-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r41-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r41-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r41-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或e;
r41独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r42-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r42-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r42-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r42-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r42-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r42-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r42独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基。
7.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中r2独立地为卤素、-cf3、-no2、经r21-取代或未经取代的c1-c3烷基、未经取代的2元到3元杂烷基或与结合剂接头相连的键;两个r2取代基可能任选地连接,以形成未经取代的苯基;并且
r21独立地为-oh。
8.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中z2为1并且r2为与结合剂接头相连的键。
9.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中r1独立地为卤素。
10.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中z1为0。
11.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中l3为-n(r3)-;
r3独立地为经r31-取代的甲基、未经取代的苯基或未经取代的5元到6元杂芳基;并且
r31独立地为未经取代的苯基或未经取代的5元到6元杂芳基。
12.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中e为
r15、r16和r17独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
并且x17为卤素。
13.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中e为
r15、r16和r17独立地为氢。
14.根据权利要求6所述的靶蛋白降解剂,其中e为
15.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
16.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
其中
r1和r2独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r1取代基或两个r2取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
r5和r6独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基或与结合剂接头相连的键;
r7独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r7取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基;
r3独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基或e;
e是亲电部分;
z1为0到4的整数;
z2为0到5的整数;
z7为0到10的整数;并且
其中仅一个r1、r2、r5、r6或r7独立地为与结合剂接头相连的键。
17.根据权利要求16所述的靶蛋白降解剂,其中
r1、r2和r7独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl,-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r51-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r51-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r1取代基或两个r2取代基可能任选地连接,以形成经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r5和r6独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r51-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r51-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或与结合剂接头相连的键;
r7独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r51-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r51-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或与结合剂接头相连的键;两个r7取代基可能任选地连接,以形成经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基
r51独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基。
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经r3-取代或未经取代的c1-c8亚烷基、经r3-取代或未经取代的2元到8元亚杂烷基、经r3-取代或未经取代的c3-c8亚环烷基、经r3-取代或未经取代的3元到8元亚杂环烷基、经r3-取代或未经取代的c6-c10亚芳基或经r3-取代或未经取代的5元到10元亚杂芳基;
r3独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r31-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r31-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r31-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r31-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r31-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r31-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r31独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r32-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r32-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r32-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r32-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r32-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r32-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r32独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r41-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r41-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r41-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r41-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r41-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r41-取代或未经取代的5元到10元杂芳基或e;
r41独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r42-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r42-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r42-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r42-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r42-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r42-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;
r42独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基。
18.根据权利要求17所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
19.根据权利要求17所述的靶蛋白降解剂,其中l3为-ch2nh-。
20.根据权利要求17所述的靶蛋白降解剂,其中e为
r15、r16和r17独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
并且x17为卤素。
21.根据权利要求17所述的靶蛋白降解剂,其中e为
r15、r16和r17独立地为氢。
22.根据权利要求17所述的靶蛋白降解剂,其中e为
23.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
r1、r2、r3、r4、r5、r6、r7、r8、r9和r10独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;或与结合剂接头相连的键;
其中仅一个r1、r2、r3、r4、r5、r6、r7、r8、r9或r10为与结合剂接头相连的键;并且
24.根据权利要求23所述的靶蛋白降解剂,其中
r1、r2、r3、r4、r5、r6、r7、r8、r9和r10独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经r51-取代或未经取代的c1-c8烷基、经r51-取代或未经取代的2元到8元杂烷基、经r51-取代或未经取代的c3-c8环烷基、经r51-取代或未经取代的3元到8元杂环烷基、经r51-取代或未经取代的c6-c10芳基或经r51-取代或未经取代的5元到10元杂芳基;或与结合剂接头相连的键;
其中仅一个r1、r2、r3、r4、r5、r6、r7、r8、r9或r10为与结合剂接头相连的键;
r51独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基。
25.根据权利要求23所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
26.根据权利要求24所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
27.根据权利要求24所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
28.根据权利要求24所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂具有下式:
29.根据权利要求24所述的靶蛋白降解剂,其中所述e3泛素连接酶结合剂具有下式:
30.根据权利要求3所述的靶蛋白降解剂,其中所述结合剂接头为l11-l12-l13-l14;
l11直接连接到所述e3泛素连接酶结合剂;
l11为-n(r61)-、-c(o)-、-c(o)n(r61)-、-n(r61)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、-oc(o)-、-s(o)2-、-s(o)-、-o-、-s-、-nhc(o)nh-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基或生物缀合物接头;并且
l12、l13和l14独立地为键、-n(r61)-、-c(o)-、-c(o)n(r61)-、-n(r61)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、-oc(o)-、-s(o)2-、-s(o)-、-o-、-s-、-nhc(o)nh-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基或生物缀合物接头。
31.根据权利要求30所述的靶蛋白降解剂,其中
l11为-n(r61)-、-c(o)-、-c(o)n(r61)-、-n(r61)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、-oc(o)-、-s(o)2-、-s(o)-、-o-、-s-、-nhc(o)nh-、经r61-取代或未经取代的c1-c20亚烷基、经r61-取代或未经取代的2元到20元亚杂环基、经r61-取代或未经取代的c3-c8亚环烷基、经r61-取代或未经取代的3元到8元亚杂环烷基、经r61-取代或未经取代的c6-c10亚芳基、经r61-取代或未经取代的5元到10元亚杂芳基或生物缀合物接头;
l12、l13和l14独立地为键、-n(r61)-、-c(o)-、-c(o)n(r61)-、-n(r61)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、-oc(o)-、-s(o)2-、-s(o)-、-o-、-s-、-nhc(o)nh-、经r61-取代或未经取代的c1-c20亚烷基、经r61-取代或未经取代的2元到20元亚杂环基、经r61-取代或未经取代的c3-c8亚环烷基、经r61-取代或未经取代的3元到8元亚杂环烷基、经r61-取代或未经取代的c6-c10亚芳基、经r61-取代或未经取代的5元到10元亚杂芳基或生物缀合物接头;
r61独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、未经取代的c1-c8烷基、未经取代的2元到8元杂烷基、未经取代的c3-c8环烷基、未经取代的3元到8元杂环烷基、未经取代的c6-c10芳基或未经取代的5元到10元杂芳基。
32.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述靶蛋白结合剂能够结合与疾病相关的靶蛋白。
33.根据权利要求1所述的靶蛋白降解剂,其中所述靶蛋白结合剂是
34.一种药物组合物,其包括根据权利要求1到33中任一项所述的靶蛋白降解剂和药学上可接受的赋形剂。
35.一种降低细胞蛋白水平的方法方法,所述方法包括使所述细胞蛋白与靶蛋白降解剂接触。
36.根据权利要求35所述的方法,其进一步包括以下步骤:
a)使与靶蛋白降解剂接触的细胞蛋白泛素化,并由此形成泛素化的细胞蛋白;
b)使泛素化的细胞蛋白与蛋白酶体接触,并由此形成泛素化的细胞蛋白-蛋白酶体复合物;以及
c)通过蛋白酶体对细胞蛋白进行蛋白水解。
37.根据权利要求35所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
38.根据权利要求37所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价结合e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
39.根据权利要求37所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
40.根据权利要求39所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c132。
41.根据权利要求39所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c135。
42.根据权利要求37所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
43.根据权利要求42所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf114的c8。
44.根据权利要求35所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
45.根据权利要求44所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
46.一种降低细胞蛋白水平的方法方法,所述方法包括使所述细胞蛋白与根据权利要求1到33中任一项所述的靶蛋白降解剂接触。
47.根据权利要求46所述的方法,其进一步包括以下步骤:
a)使与靶蛋白降解剂接触的细胞蛋白泛素化,并由此形成泛素化的细胞蛋白;
b)使泛素化的细胞蛋白与蛋白酶体接触,并由此形成泛素化的细胞蛋白-蛋白酶体复合物;以及
c)通过蛋白酶体对细胞蛋白进行蛋白水解。
48.根据权利要求46所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
49.根据权利要求48所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价结合e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
50.根据权利要求48所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
51.根据权利要求50所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c132。
52.根据权利要求50所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c135。
53.根据权利要求48所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
54.根据权利要求53所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf114的c8。
55.根据权利要求46所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
56.根据权利要求55所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
57.一种治疗癌症的方法,所述方法包括使与癌症相关的细胞蛋白与靶蛋白降解剂接触。
58.一种治疗癌症的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的根据权利要求1到33中任一项所述的靶蛋白降解剂。
59.一种降低细胞蛋白水平的方法,所述方法包括使所述细胞蛋白与靶蛋白降解剂接触,并由此形成靶蛋白降解剂-细胞蛋白复合物;其中所述靶蛋白降解剂包括:
i)e3泛素连接酶结合剂;
ii)靶蛋白结合剂;以及
iii)与所述e3泛素连接酶结合剂和所述靶蛋白结合剂直接键合的结合剂接头。
60.根据权利要求59中任一项所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
61.根据权利要求60所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价结合e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
62.根据权利要求60所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
63.根据权利要求62所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c132。
64.根据权利要求62所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c135。
65.根据权利要求60所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
66.根据权利要求65所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf114的c8。
67.根据权利要求59所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
68.根据权利要求67所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
69.根据权利要求59所述的方法,其中在接触之前,通过使e3泛素连接酶结合剂、结合剂接头和靶蛋白结合剂共价反应以产生靶蛋白降解剂,来合成所述靶蛋白降解剂。
70.根据权利要求69所述的方法,其中在合成之前,从候选e3泛素连接酶粘结合剂中鉴定出所述e3泛素连接酶结合剂。
71.根据权利要求70所述的方法,其中通过包括以下步骤的方法来鉴定所述e3泛素连接酶结合剂:
i)使e3泛素连接酶蛋白与候选e3泛素连接酶结合剂的混合物接触,并由此形成e3泛素连接酶蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物;以及
ii)将来自e3泛素连接酶蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物的候选e3泛素连接酶结合剂鉴定为e3泛素连接酶结合剂。
72.根据权利要求71所述的方法,其中所述候选e3泛素连接酶结合剂包括共价半胱氨酸修饰剂部分,并且候选e3泛素连接酶结合剂通过检测e3泛素连接酶结合剂与e3泛素连接酶蛋白的共价结合以形成e3泛素连接酶蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物而被鉴定为e3泛素连接酶结合剂。
73.根据权利要求72所述的方法,其中e3泛素连接酶蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物的检测包括使用可检测标记物或质谱。
74.根据权利要求59所述的方法,其中在合成之前,鉴定所述靶蛋白结合剂。
75.根据权利要求74所述的方法,其中通过包括以下步骤的方法来鉴定所述靶蛋白结合剂:
i)使细胞蛋白与候选靶蛋白结合剂的混合物接触,并由此形成细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物;以及
ii)鉴定形成细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物的靶蛋白结合剂。
76.根据权利要求75所述的方法,其中通过检测细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物,将形成细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物的候选靶蛋白结合剂鉴定为靶蛋白结合剂。
77.根据权利要求76所述的方法,其中细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物的检测包括使用可检测标记物或质谱。
78.根据权利要求59所述的方法,其中在合成之前,修饰e3泛素连接酶结合剂以去除共价半胱氨酸修饰剂部分。
79.一种鉴定被靶蛋白结合剂接触的细胞蛋白的方法,所述方法包括:
a)使细胞蛋白质组或细胞的第一样品与所述靶蛋白结合剂接触,从而形成细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物;
b)使步骤a的细胞蛋白质组或细胞的所得第一样品和尚未与所述靶蛋白结合剂接触的所述细胞蛋白质组或细胞的第二样品与具有下式的化合物接触:
c)使步骤b的所得第一样品与第一可检测剂接触,并使步骤b的所得第二样品与第二可检测剂接触;
d)测量结合至选定蛋白质的所述第一可检测剂和所述第二可检测剂的水平;以及
e)通过测量所述第一可检测剂和所述第二可检测剂的水平之间的差异来鉴定细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物中的所述细胞蛋白,所述第一可检测剂和所述第二可检测剂结合至能够形成所述细胞蛋白-靶蛋白结合剂复合物的所述细胞蛋白。
80.根据权利要求79所述的方法,其中
a)第一可检测剂或第二可检测剂中的一个可检测剂包括原子的轻同位素,而第一可检测剂或第二可检测剂中的第二个可检测剂包括原子的重同位素;
b)通过液相色谱质谱法测定所选蛋白质的第一可检测剂和第二可检测剂的水平;以及
c)通过与第一可检测剂结合的细胞蛋白的水平和与第二可检测剂结合的细胞蛋白的水平之间的差异来鉴定能够结合靶蛋白结合剂的细胞蛋白。
81.根据权利要求79所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
82.根据权利要求81所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价结合e3泛素连接酶半胱氨酸残基。
83.根据权利要求81所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
84.根据权利要求83所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c132。
85.根据权利要求83所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf4的c135。
86.根据权利要求81所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
87.根据权利要求86所述的方法,其中所述半胱氨酸残基是人rnf114的c8。
88.根据权利要求79所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
89.根据权利要求88所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
90.一种制备e3泛素连接酶-e3泛素连接酶结合剂-细胞蛋白复合物的方法,所述方法包括:
a)使所述e3泛素连接酶与e3泛素连接酶结合剂接触,并由此形成e3泛素连接酶-e3泛素连接酶结合剂复合物;以及
b)使所述e3泛素连接酶-e3泛素连接酶结合剂复合物与所述细胞蛋白接触,并由此形成e3泛素连接酶-e3泛素连接酶结合剂-细胞蛋白复合物。
91.根据权利要求90所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价键合e3泛素连接酶的半胱氨酸。
92.根据权利要求90所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
93.一种制备细胞蛋白-e3泛素连接酶结合剂-e3泛素连接酶复合物的方法,所述方法包括:
a)使所述细胞蛋白与e3泛素连接酶结合剂接触,并由此形成细胞蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物;以及
b)使所述细胞蛋白-e3泛素连接酶结合剂复合物与所述e3泛素连接酶接触,并由此形成细胞蛋白-e3泛素连接酶结合剂-e3泛素连接酶复合物。
94.根据权利要求93所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价键合e3泛素连接酶的半胱氨酸。
95.根据权利要求93所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
96.一种抑制细胞蛋白-e3泛素连接酶复合物的形成的方法,所述方法包括使所述e3泛素连接酶与e3泛素连接酶结合剂接触,并由此抑制细胞蛋白-e3泛素连接酶复合物的形成。
97.根据权利要求96所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂共价键合e3泛素连接酶的半胱氨酸。
98.根据权利要求96所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂在e3泛素连接酶的氨基酸处接触e3泛素连接酶,所述e3泛素连接酶能够在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下接触细胞蛋白以形成细胞蛋白-e3泛素连接酶复合物。
99.根据权利要求96所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf4。
100.根据权利要求97所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是rnf4,并且半胱氨酸是人rnf4的c132。
101.根据权利要求97所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是rnf4,并且半胱氨酸是人rnf4的c135。
102.根据权利要求90到101中任一项所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
其中
r1独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;两个r1取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
r2独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;两个r2取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基;
r3独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o、)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基或e;
e是亲电部分;
z1为0到4的整数;并且
z2为0到5的整数。
103.根据权利要求102所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
104.根据权利要求103所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
105.根据权利要求90到98中任一项所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114。
106.根据权利要求97到98中任一项所述的方法,其中所述e3泛素连接酶是人rnf114,并且半胱氨酸是人rnf114的c8。
107.根据权利要求105所述的方法,其中所述细胞蛋白是p21。
108.根据权利要求105所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
r1和r2独立地为卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;两个r1取代基或两个r2取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
r5和r6独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
r7独立地为氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;两个r7取代基可能任选地连接,以形成经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基或经取代或未经取代的杂芳基;
l3为键、-n(r3)-、-c(o)-、-c(o)n(r3)-、-n(r3)c(o)-、-n(h)-、-c(o)n(h)-、-n(h)c(o)-、-c(o)o-、经取代或未经取代的亚烷基、经取代或未经取代的亚杂烷基、经取代或未经取代的亚环烷基、经取代或未经取代的亚杂环烷基、经取代或未经取代的亚芳基或经取代或未经取代的亚杂芳基;
r3独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;
r4独立地为氢、氧代、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基或e;
e是亲电部分;
z1为0到4的整数;
z2为0到5的整数;并且
z7为0到10的整数。
109.根据权利要求108所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
110.根据权利要求109所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。
111.根据权利要求105所述的方法,其中所述e3泛素连接酶结合剂是下式的单价形式:
r1、r2、r3、r4、r5、r6、r7、r8、r9和r10独立地为氢、卤素、-ccl3、-cbr3、-cf3、-ci3、-chcl2、-chbr2、-chf2、-chi2、-ch2cl、-ch2br、-ch2f、-ch2i、-cn、-oh、-nh2、-cooh、-conh2、-no2、-sh、-so3h、-so4h、-so2nh2、-nhnh2、-onh2、-nhc(o)nhnh2、-nhc(o)nh2、-nhso2h、-nhc(o)h、-nhc(o)oh、-nhoh、-occl3、-ocf3、-ocbr3、-oci3、-ochcl2、-ochbr2、-ochi2、-ochf2、-och2cl、-och2br、-och2i、-och2f、-n3、-sf5、经取代或未经取代的烷基、经取代或未经取代的杂烷基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环烷基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基;并且
112.根据权利要求111所述的方法,其中e3泛素连接酶结合剂接触e3泛素连接酶的氨基酸,所述氨基酸在不存在e3泛素连接酶结合剂的情况下缺乏稳定的二级或三级构象结构。
113.根据权利要求112所述的方法,其中与e3泛素连接酶结合剂接触的氨基酸在接触e3泛素连接酶结合剂时采用稳定的二级或三级构象结构。