专利名称：一段淋球菌dna序列(5)特异性的确定及其应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列(5)特异性的确定及其应用，属于生物医学技术领域。
本发明的技术方案为本发明利用现有的方法确定了长度为187bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特异DNA序列(5)及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其序列如下acagcaggtc aggccatatc caatattcca caaaatgcca gtaataatga attactgaag 60atcagcgata aaacacgccg tatgttggaa ttaattcctg aaggtggaaa ttttaccgat 120attcctaaag atcatccttt atatgtgaaa ggtatgatta gccacgttta tcgtcgtatg 180catcgga 187引物序列为1. 5’-acagcaggtcaggccatatc-3’2. 5’-tccgatgcatacgacgataa-3’上述的淋球菌特异DNA序列(5)用于诊断淋球菌的基因芯片的探针序列，并通过上述的引物序列进行PCR扩增，标记后进行杂交检测或直接用于PCR诊断。
用本发明建立的临床检测技术所使用的方法具有快速、准确、操作简便、成本低等优点。
图2、图2续是测序图。其中图2是测定的序列、图2续是原始测序图谱。
图3是用Blast软件对PCR扩增产物的测序结果与预计序列的比较分析。
图4、图4续是基因数据库中Blast搜索结果。
图5为基因芯片杂交结果。
本发明可用于PCR方法或基因芯片方法进行淋球菌的临床检测。用本发明提供的序列进行PCR扩增，根据PCR方法获得产物是否出现和大小判断是否为淋球菌感染。也可用本序列为探针，作为基因芯片中的一个检测位点，然后用本发明中的PCR引物序列扩增临床标本，并标记后进行杂交检测。
说明书序列表<110>昆明寰基生物芯片开发有限公司<120>一段白色淋球菌DNA序列(5)特异性的确定及其应用<140><141><160>1<210>1<211>187<212>DNA<213>淋球菌(Neisseria gonorrhoease)<220><221>gene<222>(1)…(187)<400>1acagcaggtc aggccatatc caatattcca caaaatgcca gtaataatga attactgaag 60atcagcgata aaacacgccg tatgttggaa ttaattcctg aaggtggaaa ttttaccgat 120attcctaaag atcatccttt atatgtgaaa ggtatgatta gccacgttta tcgtcgtatg 180catcgga18权利要求
1.一段淋球菌DNA序列(5)特异性的确定，其特征在于该序列的长度为187bp，用引物进行PCR扩增，其序列如下acagcaggtc aggccatatc caatattcca caaaatgcca gtaataatga attactgaag 60atcagcgata aaacacgccg tatgttggaa ttaattcctg aaggtggaaa ttttaccgat 120attcctaaag atcatccttt atatgtgaaa ggtatgatta gccacgttta tcgtcgtatg 180catcgga187引物序列为1. 5’-acagcaggtcaggccatatc-3’2. 5’-tccgatgcatacgacgataa-3’
2.一段淋球菌特异DNA序列(5)特异性的应用，其特征在于该序列用于诊断淋球菌的基因芯片的探针序列，并通过上述的引物序列进行PCR扩增，标记后进行杂交检测或直接用于PCR诊断。
全文摘要
本发明涉及一段淋球菌DNA序列(5)特异性的确定及其应用，属于生物医学技术领域。本发明通过基因数据库资料的搜寻和分析，确定了一段淋球菌DNA序列(5)的特异性及PCR扩增引物，该序列长度为187bp。通过对人类生殖道淋球菌感染标本的PCR扩增，克隆，获得该序列，测序证明与预计序列一致。再经生物信息学方法分析，基因芯片杂交分析，结果证实了该序列对于淋球菌的特异性。本发明作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于淋球菌的诊断。用本发明建立的临床检测技术所使用的方法具有快速、准确、操作简便、成本低等优点。
文档编号C07H21/04GK1465715SQ0213337
公开日2004年1月7日 申请日期2002年6月26日 优先权日2002年6月26日
发明者谭德勇, 朱宝生 申请人:昆明寰基生物芯片开发有限公司