GITR抗原结合蛋白的制作方法与工艺

文档序号:13015539阅读:来源:国知局
技术特征:
1.一种抗原结合蛋白,其包含:a)分别是重链可变结构域(VH)和轻链可变结构域(VL)的CDRH3和CDRL3,其中所述VH和VL是选自如表1所示的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一种的同一抗原结合蛋白的部分;b)包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的变体VH,其中CDRH1、CDRH2及CDRH3中的一个或多个相对于选自Ab1至Ab59(包括端点)的组的任何单个抗原结合蛋白的VH的相应CDRH1、CDRH2及CDRH3在序列上是不同的,然而前提条件是所述变体VH的CDRH1、CDRH2及CDRH3相对于所述VH序列的相应CDR的序列差异加起来总共不超过1、2、3、4或5个氨基酸;c)包含CDRL1、CDRL2和CDRL3的变体VL,其中CDRL1、CDRL2及CDRL3中的一个或多个相对于选自Ab1至Ab59(包括端点)的组的任何单个抗原结合蛋白的VL的相应CDRL1、CDRL2及CDRL3在序列上是不同的,然而前提条件是所述变体VL的CDRL1、CDRL2及CDRL3相对于所述VL序列的相应CDR的序列差异加起来总共不超过1、2、3、4或5个氨基酸;d)b)的所述变体VH和c)的所述变体VL,前提条件是所述变体VH和所述变体VL分别是如表1所说明的所述同一抗原结合蛋白的所述VH和VL的变体;e)包含CDRH1、CDRH2及CDRH3的VH,其中CDRH1包含序列X1YGMX2(SEQIDNO:436),其中X1是S或N;且X2是H或Y;CDRH2包含序列VIWYX1GSNKYYADSVX2G(SEQIDNO:437),其中X1是E、V、A、P;且X2是K或R;CDRH3包含序列GGX1LX2X3X4YYX5GMDV(SEQIDNO:438),其中X1是Q、L、E或R;X2是G、R或S;X3是K、Y、L、F或R;且X4是Y或D;且X5是Y或S;f)包含CDRL1、CDRL2和CDRL3的VL,其中CDRL1包含序列RASQX1IRNDLG(SEQIDNO:439),其中X1是G或V;CDRL2包含序列X1X2SX3LQS(SEQIDNO:440),其中X1是A或D;X2是A或T;且X3是S或T;CDRL3包含序列X1QX2X3X4YPX5T(SEQIDNO:441),其中X1是L或Q;X2是H或L;X3是N或H;X4是S、N或T,且X5是W、L或I;g)e)的所述VH和f)的所述VL;h)CDRH1、CDRH2及CDRH3,各自来自如表1所说明的Ab1至Ab59(包括端点)的抗原结合蛋白的同一VH;i)CDRL1、CDRL2及CDRL3,各自来自如表1所说明的Ab1至Ab59(包括端点)的抗原结合蛋白的同一VL;j)h)的所述CDRH1、CDRH2及CDRH3和i)的所述CDRH1、CDRH2及CDRH3,其中所述VH和所述VL来自同一抗原结合蛋白;k)与如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的所述VH序列在氨基酸序列方面具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性的VH;l)与如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的所述VL序列在氨基酸序列方面具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性的VL;m)k)的VH和l)的所述VL,其中所述VH和所述VL来自如表1所说明的同一抗原结合蛋白;n)包含如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的所述VH的所述氨基酸序列的VH;o)包含如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的所述VL的所述氨基酸序列的VL;p)n)的所述VH和o)的所述VL,其中所述VH和所述VL来自如表1所说明的同一抗原结合蛋白;q)与如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至AB59(包括端点)中任一个的全长重链序列在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性的全长重链(HC);r)与如表1所说明的抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)的中任一个的全长轻链序列在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性的全长轻链(LC);s)q)的全长重链和r)的全长轻链,其中所述全长重链和所述全长轻链来自如表1所说明的同一抗原结合蛋白;t)包含如表1所说明的所述抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的所述全长重链的氨基酸序列的全长重链;u)包含如表1所说明的所述抗原结合蛋白Ab1至Ab59(包括端点)中任一个的全长轻链的氨基酸序列的全长轻链;或v)t)的全长重链和u)的全长轻链,其中所述全长重链和所述全长轻链来自如表1所说明的同一抗原结合蛋白。2.如权利要求1所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含CDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及CDRH3,且其中CDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及CDRH3中的一个或多个相对于选自Ab1至Ab59(包括端点)的所述组的任何单个抗体的相应CDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及CDRH3在序列上是不同的,然而前提条件是所述CDR中的所述序列差异加起来总共不超过1、2、3、4或5个氨基酸。3.如权利要求1或2所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含CDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及CDRH3,且其中:a)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:11,CDRL3包含SEQIDNO:19,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:36且CDRH3包含SEQIDNO:47;b)CDRL1包含SEQIDNO:5CDRL2包含SEQIDNO:12,CDRL3包含SEQIDNO:18,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:40且CDRH3包含SEQIDNO:52;c)CDRL1包含SEQIDNO:10,CDRL2包含SEQIDNO:17,CDRL3包含SEQIDNO:28,CDRH1包含SEQIDNO:35,CDRH2包含SEQIDNO:45且CDRH3包含SEQIDNO:62;d)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:12,CDRL3包含SEQIDNO:29,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:37且CDRH3包含SEQIDNO:58;e)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:14,CDRL3包含SEQIDNO:30,CDRH1包含SEQIDNO:3,CDRH2包含SEQIDNO:36且CDRH3包含SEQIDNO:63;f)CDRL1包含SEQIDNO:10,CDRL2包含SEQIDNO:17,CDRL3包含SEQIDNO:28,CDRH1包含SEQIDNO:35,CDRH2包含SEQIDNO:45且CDRH3包含SEQIDNO:76;g)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:12,CDRL3包含SEQIDNO:29,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:37且CDRH3包含SEQIDNO:58;h)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:14,CDRL3包含SEQIDNO:30,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:71且CDRH3包含SEQIDNO:63;或i)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:11,CDRL3包含SEQIDNO:19,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:71且CDRH3包含SEQIDNO:47;j)CDRL1包含SEQIDNO:5,CDRL2包含SEQIDNO:12,CDRL3包含SEQIDNO:18,CDRH1包含SEQIDNO:31,CDRH2包含SEQIDNO:73且CDRH3包含SEQIDNO:52。4.如权利要求1至3中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含VL和VH,且其中:a)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:119具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:138具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;b)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:124具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:143具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;c)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:134具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:153具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;d)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:135具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:154具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;e)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:136具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:155具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;f)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:242具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:282具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;g)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:255具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:295具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;h)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:262具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:302具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;i)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:267具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:307具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性;j)所述VL的氨基酸序列与SEQIDNO:272具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性且VH的氨基酸序列与SEQIDNO:312具有至少80%、85%、90%、95%、97%或99%同一性。5.如权利要求1至4中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含VL和VH,且其中:a)所述VL包含SEQIDNO:119且所述VH包含SEQIDNO:138;b)所述VL包含SEQIDNO:124且所述VH包含SEQIDNO:143;c)所述VL包含SEQIDNO:134且所述VH包含SEQIDNO:153;d)所述VL包含SEQIDNO:135且所述VH包含SEQIDNO:154;e)所述VL包含SEQIDNO:136且所述VH包含SEQIDNO:155;f)所述VL包含SEQIDNO:242且所述VH包含SEQIDNO:282;g)所述VL包含SEQIDNO:255且所述VH包含SEQIDNO:295;h)所述VL包含SEQIDNO:262且所述VH包含SEQIDNO:302;i)所述VL包含SEQIDNO:267且所述VH包含SEQIDNO:307;j)所述VL包含SEQIDNO:272且所述VH包含SEQIDNO:312。6.如权利要求1至5中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含LC和HC,且其中:a)所述LC与SEQIDNO:317在氨基酸序列方面至少具有90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:336在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;b)所述LC与SEQIDNO:322在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:341在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;c)所述LC与SEQIDNO:332在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:351在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;d)所述LC与SEQIDNO:333在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:352在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;e)所述LC与SEQIDNO:334在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:353在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;f)所述LC与SEQIDNO:360在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:400在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;g)所述LC与SEQIDNO:373在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:413在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;h)所述LC与SEQIDNO:380在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:420在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;i)所述LC与SEQIDNO:385在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:425在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性;j)所述LC与SEQIDNO:390在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性且所述HC与SEQIDNO:430在氨基酸序列方面具有至少90%、95%、97%或99%同一性。7.如权利要求1至6中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含LC和HC,且其中:a)所述LC包含SEQIDNO:317且所述HC包含SEQIDNO:336;b)所述LC包含SEQIDNO:322且所述HC包含SEQIDNO:341;c)所述LC包含SEQIDNO:332且所述HC包含SEQIDNO:351;d)所述LC包含SEQIDNO:333且所述HC包含SEQIDNO:352;e)所述LC包含SEQIDNO:334且所述HC包含SEQIDNO:353;f)所述LC包含SEQIDNO:360且所述HC包含SEQIDNO:400;g)所述LC包含SEQIDNO:373且所述HC包含SEQIDNO:413;h)所述LC包含SEQIDNO:380且所述HC包含SEQIDNO:420;i)所述LC包含SEQIDNO:385且所述HC包含SEQIDNO:425;j)所述LC包含SEQIDNO:390且所述HC包含SEQIDNO:430。8.一种抗原结合蛋白,其与参考抗原结合蛋白竞争结合至人GITR,其中所述参考抗原结合蛋白是如权利要求5所述的抗原结合蛋白。9.如权利要求8所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白与所述参考抗体交叉竞争结合至人GITR。10.如权利要求1至9中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白具有以下一种或多种特征:a)是单克隆抗体;b)是人抗体、人源化抗体、或嵌合抗体;c)是多特异性抗体;d)具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4型;e)是抗原结合抗体片段;f)是Fab片段、Fab’片段、F(ab’)2片段或Fv片段;g)是双抗体、单链抗体、结构域抗体或纳米抗体;h)是经标记的。11.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其是全人抗体。12.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其激动人GITR的活性。13.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其具有以下一种或多种活性:a)与GITRL交叉竞争结合至GITR;b)可以内化到人CD4细胞中;c)抑制调节性T细胞的抑制作用;d)减少循环调节性T细胞;e)活化效应T细胞;f)在人血清中具有至少6、7、9或12天的半衰期。14.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其是全人IgG1抗体。15.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其能够结合Fcγ受体(FcγR)。16.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其能够结合Fcγ受体(FcγR)以便形成抗原结合蛋白簇。17.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白结合人GITR。18.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白具有以下一种或多种特征:a)以小于≤10nM的KD结合至SEQIDNO:1的人GITR多肽;b)以小于≤500nM的KD结合至SEQIDNO:2的食蟹猴GITR多肽。19.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是激动人GITR的IgG1型全人单克隆抗体。20.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其以KD≤10nM结合SEQIDNO:1的人GITR且以KD≤500nM结合SEQIDNO:2的食蟹猴GITR。21.一种核酸,其编码a)如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白的VL、VH或两者;或b)如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白的LC或HC或两者。22.如权利要求21所述的核酸,其中a)所述VL核酸和所述VH核酸分别包含如为选自表4中所说明的Ab1至Ab59(包括端点)的所述组的任何单个抗体所陈述的所述VL核苷酸序列和所述VH核苷酸序列;b)所述LC核酸或所述HC核酸分别包含如为选自表4中所说明的Ab1至Ab59(包括端点)的所述组的任何单个抗体所陈述的所述LC核苷酸序列或所述HC核苷酸序列。23.一种载体,其包含如权利要求21或22所述的核酸。24.一种细胞,其包含如权利要求21或22所述的核酸或如权利要求23所述的载体。25.一种制备如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白的方法,所述方法包括在允许所述抗原结合蛋白表达的条件下培养如权利要求24所述的细胞并且任选地从所述培养物中分离所述抗原结合蛋白。26.一种药物组合物,其包含至少一种根据权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白及药学上可接受的载体或稀释剂。27.如权利要求26所述的药物组合物,其进一步包含选自由以下组成的组的其它种活性成分:免疫刺激剂、抗血管生成剂及化疗剂。28.如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物,其用于疗法中。29.如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物,其用于诱导或增强受试者的免疫应答的方法中,所述方法包括向所述受试者施用所述抗原结合蛋白。30.一种用于诱导或增强受试者中的免疫应答的方法,所述方法包括以有效诱导或增强所述免疫应答的量向受试者施用的如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物。31.如权利要求30所述的方法,其中所述免疫应答针对肿瘤抗原产生。32.如权利要求30所述的方法,其中所述免疫应答针对感染性因子产生。33.如权利要求30至32中任一项所述的方法,其中所述抗原结合蛋白以足以在所述受试者中实现以下一项或多项的量施用:a)减轻效应T细胞活性的调节性T细胞抑制;b)降低循环调节性T细胞的水平;c)活化效应T细胞;d)诱导或增强效应T细胞增殖;e)抑制肿瘤生长;及f)诱导肿瘤消退。34.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物。35.如权利要求34所述的方法,其中所述癌症是实体癌。36.如权利要求34所述的方法,其中所述癌症是血液癌。37.如权利要求34所述的方法,其中所述癌症是黑色素瘤、肺癌、头颈癌、肾细胞癌或结肠直肠癌。38.如权利要求34所述的方法,其中所述癌症是非小细胞肺癌、头颈部的鳞状细胞癌或膀胱癌。39.一种用于抑制患有癌症的受试者中的转移的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物。40.如权利要求30-39中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括以下一项或多项a)施用化疗;b)施用放射疗法;和/或c)施用一种或多种另外的治疗剂。41.如权利要求40所述的方法,其中所述另外的治疗剂是免疫刺激剂。42.如权利要求41所述的方法,其中所述免疫刺激剂选自由以下组成的组:T-VEC、PD1拮抗剂、PDL1拮抗剂、CTLA-4拮抗剂及BiTE。43.如权利要求40所述的方法,其中所述化疗、放射疗法或治疗剂是在所述抗原结合蛋白之前、同时或之后施用。44.一种用于治疗患有感染的受试者的方法,所述方法包括以有效治疗所述感染的量施用如权利要求1至20中任一项所述的抗原结合蛋白或如权利要求26或27所述的药物组合物。
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