使用数字PCR的产前诊断方法与流程

文档序号:12697612阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种为诊断胎儿染色体非整倍性提供信息的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:

(a)从孕妇血液中提取DNA;

(b)根据大小分级DNA,以获得具有1,000bp或更小的DNA;

(c)使用步骤(b)获得的DNA为染色体上与染色体异常无关的对照基因和染色体上与染色体非整倍性相关的靶基因进行数字PCR;

(d)计算靶基因的定量数字PCR值与对照基因的定量数字PCR值的比率;和

(e)当步骤(d)中计算的比例为0.70-1.14时,确定胎儿的染色体数目是正常的。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法包括:当步骤(d)中计算的比率为0.95-1.10时,确定胎儿的染色体数目是正常的。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,根据大小对所述DNA进行分级的步骤(b)包括步骤:

(a)将第一磁珠(珠A)添加到所述DNA中,并且分离出未结合至珠A的DNA;和

(b)将第二磁珠(珠B)添加到分离的DNA中,并且洗脱出结合至珠B的DNA,其中所述珠A和珠B以0.75-1.25:1的比例(珠A或珠B:DNA)添加至所述DNA中。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,珠A或珠B以0.75-1.0:1的比例(珠A或珠B:DNA)添加至所述DNA中。

5.一种为诊断胎儿染色体非整倍性提供信息的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:

(a)从孕妇血液中提取DNA;

(b)根据大小分级DNA,以获得具有1,000bp或更小的DNA;

(c)使用步骤(b)获得的DNA、位于染色体上与染色体非整倍性无关的对照基因、位于染色体上与染色体非整倍性相关的靶基因进行数字PCR;

(d)计算靶基因的定量数字PCR值与对照基因的定量数字PCR值的比率;和

(e)当步骤(d)中计算的比例为0.10-0.69或1.15-1.80时,确定胎儿的染色体数目是异常的。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,当步骤(d)中计算的比率为0.45-0.69或1.15-1.31时,确定胎儿的染色体数目是异常的。

7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,当步骤(d)中计算的比例为0.10-0.69时,确定胎儿的染色体数目是单体的。

8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述单体是特纳综合征。

9.如权利要求5所述的方法,其特征在于,当步骤(d)中计算的比例为1.15-1.80时,确定胎儿的染色体数目是三体的。

10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述三体是唐氏综合征、爱德华氏综合征或帕陶综合征。

11.如权利要求5所述的方法,其特征在于,根据大小对DNA进行分级的步骤(b)包括步骤:

(a)将第一磁珠(珠A)添加到DNA中,并且分离出未结合至珠A的DNA;和

(b)将第二磁珠(珠B)添加到分离的DNA中,并且洗脱出结合至珠B的DNA,其中所述珠A和珠B以0.75-1.25:1的比例(珠A或珠B:DNA)添加至DNA中。

12.如权利要求11所述的方法,其特征在于,珠A或珠B以0.75-1.0:1的比例(珠A或珠B:DNA)加入DNA。

13.如权利要求1-12任一所述的方法,其特征在于,所述靶基因可以是选自下组的任何一种或多种基因:具有SEQ ID NO:1至4所示核苷酸序列的基因。

14.如权利要求13所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:7和8所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的靶基因,并且,SEQ ID NO:9所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的靶基因的扩增产物。

15.如权利要求13所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:10和11所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的靶基因,并且,SEQ ID NO:12所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的靶基因的扩增产物。

16.如权利要求13所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:13和14所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的靶基因,并且,SEQ ID NO:15所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的靶基因的扩增产物。

17.如权利要求13所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:16和17所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的靶基因,并且,SEQ ID NO:18所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的靶基因的扩增产物。

18.如权利要求1-12任一所述的方法,其特征在于,所述对照基因可以是选自下组的任何一种或多种基因:具有SEQ ID NO:5至6所示核苷酸序列的基因。

19.如权利要求18所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:19和20所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:5所示核苷酸序列的对照基因,并且,SEQ ID NO:21所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:5所示核苷酸序列的对照基因的扩增产物。

20.如权利要求18所述的方法,其特征在于,SEQ ID NO:22和23所示的一对引物作为引物对用于扩增具有SEQ ID NO:6所示核苷酸序列的对照基因,并且,SEQ ID NO:24所示寡核苷酸作为探针用于检测具有SEQ ID NO:6所示核苷酸序列的对照基因的扩增产物。

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