一种无酶法全核酸提取试剂盒的制作方法

文档序号:19160128发布日期:2019-11-16 01:15阅读:753来源:国知局
一种无酶法全核酸提取试剂盒的制作方法

本发明属于分子生物学领域,尤其涉及细菌核酸提取纯化方面。



背景技术:

核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,根据化学组成不同,核酸可分为核糖核酸(简称rna)和脱氧核糖核酸(简称dna)。dna是储存、复制和传递遗传信息的主要物质基础。rna在蛋白质合成过程中起着重要作用,因而核酸在生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起决定性的作用。核酸的研究可从本质上揭示微生物的结构、组成,甚至是致病机理的神秘面纱,可以更有效的研究如何预防、治疗由此产生的疾病,因此,对核酸的研究有着至关重要的意义。

细菌(学名:bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域,也是所有生物中数量最多的一类,形状相当多样,主要有球状、杆状,以及螺旋状。将细菌做革兰氏染色,可将细菌分为两大类,不被酒精脱色而保留紫色者为革兰氏阳性菌(g+),被酒精脱色复染成红色者为革兰氏阴性菌(g-)。革兰氏阳性细菌的细胞壁主要是由肽聚糖形成的网状结构组成,革兰氏阴性细菌的细胞壁中肽聚糖含量低,没有磷壁酸,其细胞壁中游肽桥、肽尾和双糖形成的网状结构较为疏松,而脂类物质含量高,因此在核酸提取过程中,革兰氏阳性菌不易裂解,造成了一定提取困难,往往科学工作者会使用溶菌酶来破碎菌体细胞,不利于后续的纯化过程,影响产物的纯度。本发明的提取方法可应用于革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌,提取过程不需要使用任何酶试剂。

生物磁珠是指磁珠一般具有超强的顺磁性,在磁场中能够迅速聚集,离开磁场后又能够有助于磁分离地均匀分散;具有合适的且差别较小的粒径,保证了足够强的磁响应性又不会沉降;具有丰富的表面活性基团,以便可以和生化物质偶联,并在外磁场的作用下实现与被待测样品的分离。与传统的分离方法相比,把磁珠用于生化样品复杂组分的分离,能够实现分离和富集的同时进行,有效地提高了分离速度和富集效率,同时也使分析检测的灵敏度大大提升。通过在磁珠表面包被上特异性抗体、受体等,用于分离纯化样品中的靶体。磁珠已被广泛应用于免疫分析、核酸分离提取、细胞分选、酶的固定等多个领域。



技术实现要素:

本发明的目的是提供一种无酶法全核酸提取试剂盒,可以快速安全地进行核酸提取,期间无需使用任何酶试剂,所得产物纯度高。

本发明提供了一种无酶法全核酸提取试剂盒,其特征在于所述试剂盒包含:裂解液、结合液、磁珠液、洗涤液a、洗涤液b以及溶解液。

本发明的试剂盒配合了一种核酸提取纯化方法,具体操作步骤如下。

1)取1ml过夜培养的菌液,以10,000rpm的转速进行离心,所述时间为1~2分钟。

2)弃掉步骤1所述上清液。

3)向根据步骤2所述得到的菌体沉淀中加入裂解液,震荡混匀并静置5分钟,使菌体细胞完全裂解;

其中所述裂解液使用体积为300~600ul,所述的裂解液成分为2~5m胍盐、10~50mm三羟甲基氨基甲烷(tris-hcl)、5~30mm乙二胺四乙酸(edta)、0.1~2m醋酸钠(naac)、0.01~1%(体积比)聚乙二醇辛基苯基醚(triton-x100);

所述胍盐可以是盐酸胍、硝酸胍、碳酸胍、乙酸胍、硫氰酸胍、异硫氰酸胍等任意一种,其优选浓度为4~5m,所述tris-hcl优选浓度为10~30mm,所述edta优选浓度为10~20mm,所述triton优选浓度为0.1~0.5%,所述naac优选浓度为0.5~1.2m。其中裂解液的ph值为8.2;

所述的菌体沉淀特征其为可以是革兰氏阳性菌或革兰氏阴性菌,若为革兰氏阴性菌,裂解时间可按5分钟静置裂解;若为革兰氏阳性菌,可将裂解时间增加至8~10分钟。

4)向根据步骤3所述得到的溶液中加入10~30ul磁珠液和200~300ul结合液,震荡混匀,室温静置3分钟;

其中所述磁珠液特征为包含20mg/ml磁性微球、0.1~1m氯化钠(nacl)、10~50mmtris-hcl,其所述的磁性微球特征为表面修饰有硅羟基且具有超顺磁性,直径为50~1000nm。其中所述的结合液特征为包括60~80%乙醇(体积比)、10~30mmtris-hcl、0.2~0.4mnacl、0.1~0.5%吐温80(tween80)(体积比);

优选的磁性液成分为0.4~0.5mnacl、15~25mmtris-hcl。优选的结合液成分为65~75%乙醇、10~25mmtris-hcl、0.2~0.25mnacl、0.1~0.2%tween80。

5)将离心管放置于磁力架上吸附1~2分钟,吸出并弃掉上清液。

6)向离心管中加入600~1000ul的洗涤液a,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

其中所述洗涤a特征为包括50~500mm柠檬酸钠、10~50mmtris-hcl、10%~40%乙醇(体积比);

优先的洗涤液a成分为150~250mm柠檬酸钠、13~25mmtris-hcl、15~25%乙醇。

7)根据所述步骤6的操作重复完成一次。

8)向离心管中加入600ul洗涤液b,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

其中所述洗涤b特征为包括50~85%乙醇、10~30mmtris-hcl;

优选地洗涤液b成分为60~75%乙醇、20~25mmtris-hcl。

9)将离心管开盖置于55℃烘箱中2~3分钟。

10)向离心管中加入20~500ul溶解液,震荡混匀,放于56℃烘箱中2~3分钟后放于磁力架上吸附1分钟,吸取上清液转移至新的离心管中,做好标记放于-20℃保存;

其中所述溶解液的特征为包含10~50mmtris-hcl、1~20mmedta;

优选地溶解液成分为15~25mmtris-hcl、2~5mmedta;

其所述的溶解液ph值为8.2。

本发明实验操作简单便捷,可以在15到20分钟内完成提取工作,在提取过程中无需使用复杂、价格高的仪器或试剂,且试剂盒内中不含有酚氯仿等有毒的有机试剂,可以保证实验人员长期操作的安全性,并且在提取过程中无需应用任何的酶试剂,最后所得到的核酸包含有dna和rna,若菌体细胞含有质粒,产物中会存有少量质粒,其各类核酸片段完整性较好,产物纯度较高,260/280可在1.82~1.97之间,260/230可在1.93~2.02之间,可以很好应用于下游的各种检测、测序等实验。

附图说明

附图为实施例1的大肠杆菌的琼脂糖凝胶电泳检测图和实施例2的变形杆菌的琼脂糖凝胶电泳检测图,其中泳道1、2、3、4为实施例1提取效果,泳道5、6、7、8为实施例2提取效果。

具体实施方式

本发明的试剂盒目的是将细菌的核酸提取出来,得到纯度高、完整性好的dna和rna。试剂盒包括:裂解液、结合液、磁珠液、洗涤液a、洗涤液b、溶解液。以下实施例是通过具体实施方式对本发明进行更加明确的说明,但并不是说本发明仅局限于以下实施方式。

实施例1。

大肠杆菌全核酸的提取。

1)取1ml过夜培养的大肠杆菌菌液,以10,000rpm的转速进行离心2分钟。

2)弃掉步骤1所述上清液。

3)向根据步骤2所述得到的大肠杆菌菌体沉淀中加入400ul裂解液,震荡混匀并静置5分钟,使大肠杆菌菌体细胞完全裂解;

其中裂解液成分为4m异硫氰酸胍、20mmtris-hcl、12mmedta、0.8mnaac、0.15%(体积比)triton-x100。

4)向根据步骤3所述得到的溶液中加入10ul磁珠液和200ul结合液,震荡混匀后于室温静置3分钟;

磁珠液含有20mg/ml磁性微球、0.4mnacl、20mmtris-hcl,其所述的磁性微球特征为表面修饰有硅羟基且具有超顺磁性,直径为300nm,其中结合液成分为70%乙醇(体积比)、25mmtris-hcl、0.21mnacl、0.1%(体积比)tween80。

5)将离心管放置于磁力架上吸附1分钟,吸出并弃掉上清液。

6)向离心管中加入600ul洗涤液a,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

洗涤a成分为200mm柠檬酸钠、20mmtris-hcl、20%(体积比)乙醇。

7)根据所述步骤6的操作重复完成一次。

8)向离心管中加入600ul洗涤液b,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

洗涤b成分为65%乙醇、20mmtris-hcl。

9)将离心管开盖置于55℃烘箱中3分钟。

10)向离心管中加入100ul的溶解液,震荡混匀,放于56℃烘箱中3分钟后放于磁力架吸附1分钟,吸取上清转移至新的离心管中,做好标记放于-20℃保存;

溶解液成分为20mmtris-hcl、2mmedta。

所得100ul产物使用nanodrop2000进行荧光分光光度检测,其a260值为9.31,核酸浓度为465.5ng/µl,a260/a280值为1.95,a260/a230值为2.08;

对大肠杆菌提取纯化得率为46.5微克/ml菌液。

实施例2。

变形杆菌全核酸的提取。

1)取1ml过夜培养的变形杆菌菌液,以10,000rpm的转速进行离心2分钟。

2)弃掉步骤1所述上清液。

3)向根据步骤1和步骤2所述得到的变形杆菌菌体沉淀中加入500ul裂解液,震荡混匀并静置10分钟,使变形杆菌菌体细胞完全裂解;

裂解液成分为4.5m盐酸胍、30mmtris-hcl、10mmedta、1.2mnaac、0.5%(体积比)triton-x100。

4)向根据步骤3所述得到的溶液中加入20ul磁珠液和250ul结合液,震荡混匀后于室温静置3分钟;

其中磁珠液成分为20mg/ml磁性微球、0.42mnacl、20mmtris-hcl,其磁性微球为表面修饰有硅羟基且具有超顺磁性,直径为300nm,其中结合液成分为包括75%乙醇(体积比)、15mmtris-hcl、0.24mnacl、0.2%吐温80(tween80)(体积比)。

5)将离心管放置于磁力架上吸附2分钟,吸出并弃掉上清液。

6)向离心管中加入600ul洗涤液a,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

洗涤a成分为200mm柠檬酸钠、20mmtris-hcl、20%(体积比)乙醇。

7)根据所述步骤6的操作重复完成一次。

8)向离心管中加入600ul洗涤液b,震荡混匀,放置于磁力架上吸附30秒,吸出并弃掉上清液;

洗涤b成分为65%乙醇、20mmtris-hcl。

9)将离心管开盖置于55℃烘箱中3分钟。

10)向离心管中加入100ul溶解液,震荡混匀,放于56℃烘箱中3分钟后放于磁力架吸附1分钟,吸取上清转移至新的离心管中,做好标记放于-20℃保存;

溶解液成分为20mmtris-hcl、2mmedta。

所得100ul产物使用nanodrop2000进行荧光分光光度检测,其a260值为7.82,核酸浓度为390.8ng/µl,a260/a280值为2.02,a260/a230值为1.98;

对变形杆菌提取纯化得率为39.1ug/ml菌液。

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