技术特征：
1.检测dna甲基化的方法，其包括在对象的包含基因组dna的生物样品中检测至少一种基因组dna多核苷酸中的dna甲基化的步骤，所述基因组dna多核苷酸选自由具有包含在以下中的序列的多核苷酸组成的组：seq id no：16(madcyap1)，seq id no：56和/或seq id no：61(mankrd13b)，seq id no：41和/或seq id no：46(mclec14a)，seq id no：71(mcrmp1)，seq id no：81和/或seq id no：86(meya4)，seq id no：31(mkhdrbs2)，seq id no：96和/或seq id no：101(mmsc)，seq id no：111和/或seq id no：116(mngfr)，seq id no：126(mnkx2)，seq id no：141和/或seq id no：146(mrassf2)，seq id no：1(msept9)，seq id no：161(msnd1)，seq id no：171(mtbx18)，seq id no：186和/或seq id no：191(mtfap2e)，seq id no：201和/或seq id no：206(mtmeff2)，或seq id no：216(mvax1)，其中所述基因组dna可包含源自结直肠癌(crc)细胞的dna。2.权利要求1所述的方法，其中在选自所述组的至少两种、优选至少三种基因组dna多核苷酸中检测dna甲基化。3.权利要求1或2所述的方法，其包括以下步骤：(a)将所述生物样品的基因组dna中在5位未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶或不与鸟嘌呤杂交的另一碱基；以及(b)通过检测步骤(a)的经转化dna中的未转化胞嘧啶来检测所述基因组dna中的dna甲基化。4.权利要求1至3中任一项所述的方法，其中检测所述dna甲基化包括确定甲基化基因组dna的量。5.权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述生物样品是结肠或直肠组织样品或液体活检物，优选血液样品、包含来自血液的无细胞dna的样品、血液来源的样品或唾液样品。6.权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述基因组dna是无细胞dna。7.权利要求1至6中任一项所述的方法，其中所述对象被怀疑患有crc、具有提高的发生crc的风险、曾患有crc或患有crc。8.用于检测对象中结直肠癌(crc)的存在或不存在的方法，其包括根据权利要求1至7中任一项所述检测dna甲基化，其中存在检测到的甲基化基因组dna表示存在crc，不存在检测到的甲基化基因组dna表示不存在crc。9.用于监测被怀疑患有crc、具有提高的发生结直肠癌(crc)的风险或曾患有crc的对象的方法，其包括重复地根据权利要求8所述检测dna甲基化，其中存在检测到的甲基化基因组dna表示存在crc，不存在检测到的甲基化基因组dna表示不存在crc。10.选自引物和探针的寡核苷酸，其包含与以下之一段连续核苷酸基本上相同的序列：seq id no 17至20中的一者(madcyap1)、seq id no 57至60中的一者和/或seq id no 62至65中的一者(mankrd13b)、seq id no 42至45中的一者和/或seq id no 47至50中的一者(mclec14a)、seq id no 72至75中的一者(mcrmp1)、seq id no 82至85中的一者和/或seq id no 87至90中的一者(meya4)、seq id no 32至35中的一者(mkhdrbs2)、seq id no 97至100中的一者和/或seq id no 102至105中的一者(mmsc)、seq id no 112至115中的一者和/或seq id no 117至120中的一者(mngfr)、seq id no 127至130中的一者(mnkx2)、seq id no 142至145中的一者和/或seq id no 147至150中的一者(mrassf2)、seq id no 2至5
中的一者(msept9)、seq id no 162至165中的一者(msnd1)、seq id no 172至175中的一者(mtbx18)、seq id no 187至190中的一者和/或seq id no 192至195中的一者(mtfap2e)、seq id no 202至205中的一者和/或seq id no 207至210中的一者(mtmeff2)、seq id no 217至220中的一者(mvax1)。11.权利要求10所述的寡核苷酸，其中所述寡核苷酸是甲基化特异性的。12.试剂盒，其至少包含第一和第二根据权利要求10或11所述的寡核苷酸。13.权利要求12所述的试剂盒，其中所述第一和第二寡核苷酸是形成引物对的引物，所述引物对适用于扩增具有包含在以下中的序列的dna：seq id no 17至20中的一者(madcyap1)、seq id no 57至60中的一者和/或seq id no 62至65中的一者(mankrd13b)、seq id no 42至45中的一者和/或seq id no 47至50中的一者(mclec14a)、seq id no 72至75中的一者(mcrmp1)、seq id no 82至85中的一者和/或seq id no 87至90中的一者(meya4)、seq id no 32至35中的一者(mkhdrbs2)、seq id no 97至100中的一者和/或seq id no 102至105中的一者(mmsc)、seq id no 112至115中的一者和/或seq id no 117至120中的一者(mngfr)、seq id no 127至130中的一者(mnkx2)、seq id no 142至145中的一者和/或seq id no 147至150中的一者(mrassf2)、seq id no 2至5中的一者(msept9)、seq id no 162至165中的一者(msnd1)、seq id no 172至175中的一者(mtbx18)、seq id no 187至190中的一者和/或seq id no 192至195中的一者(mtfap2e)、seq id no 202至205中的一者和/或seq id no 207至210中的一者(mtmeff2)、seq id no 217至220中的一者(mvax1)。14.权利要求12或13所述的试剂盒，其中所述试剂盒包含形成至少两个、优选至少三个引物对的多核苷酸，并且其中每个引物对适用于扩增具有以下不同标志物的序列的dna：madcyap1，mankrd13b，mclec14a，mcrmp1，meya4，mkhdrbs2，mmsc，mngfr，mnkx2，mrassf2，msept9，msnd1，mtbx18，mtfap2e，mtmeff2和mvax1。15.权利要求1至7中任一项所述的方法、权利要求10或11所述的寡核苷酸、或者权利要求12至14中任一项所述的试剂盒用于检测结直肠癌(crc)或者用于监测具有提高的发生crc的风险、被怀疑患有crc或曾患有crc的对象的用途。
技术总结
本发明涉及药物基因组学领域，并且特别地涉及在生物样品(例如含有来自癌细胞的循环DNA的体液)中检测源自结直肠癌细胞的甲基化基因组DNA的存在或不存在。这种检测可用于结直肠癌的早期且可靠的诊断，并且本发明提供了适合于该目的的方法和寡核苷酸。适合于该目的的方法和寡核苷酸。
技术研发人员：约恩
受保护的技术使用者：表观基因组股份有限公司
技术研发日：2020.12.16
技术公布日：2022/10/13