技术特征：
1.与西瓜全缘叶形基因clll紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记命名为dcaps2和/或dcaps3，扩增dcaps2分子标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.1所示，下游引物序列如seq.id.no.2所示；扩增dcaps3分子标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.3所示，下游引物序列如seq.id.no.4所示。2.权利要求1所述与西瓜全缘叶形基因clll紧密连锁的分子标记在西瓜分子育种中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述分子标记用于鉴定或辅助鉴定西瓜全缘叶形性状。4.一种鉴定西瓜全缘叶形性状的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：(1)提取西瓜植株组织的dna；(2)pcr扩增：利用权利要求1所述的引物对，对步骤(1)所提取样品进行pcr扩增；(3)对步骤(2)中的扩增产物进行酶切处理，之后进行电泳检测；(4)根据步骤(3)的电泳条带结果进行判定，具体标准为：对于分子标记dcaps2，如果酶切产物为长度122bp的特征条带，则待测西瓜植株为全缘叶形的西瓜材料，如果酶切扩增产物为146bp的特征条带，该待测西瓜植株为纯合裂刻叶形的西瓜材料，如果酶切产物为两条长度分别为146bp、122bp的特征条带，该待测西瓜植株为杂合裂刻叶形的西瓜材料；对于分子标记dcaps3，如果酶切产物为长度119bp的特征条带，则待测西瓜植株为全缘叶形的西瓜材料，如果酶切扩增产物为89bp的特征条带，该待测西瓜植株为纯合裂刻叶形的西瓜材料，如果酶切产物为两条长度分别为119bp、89bp的特征条带，该待测西瓜植株为杂合裂刻叶形的西瓜材料。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，步骤(2)所述pcr扩增的反应体系为：dna 1μl、2
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pcr mix 5μl、上游引物0.5μl、下游引物0.5μl、灭菌蒸馏水3μl，总体积10μl；pcr扩增条件为：95℃、5min；94℃、30s，57℃、30s，72℃、50s，共35个循环；72℃、10min；4℃保存；步骤(3)中所述的酶切反应体系为：pcr产物5μl，10x buffer1.5μl，dde1限制性内切酶0.5μl，灭菌蒸馏水3.5μl，总体积10μl。酶切条件为37℃、4h。6.一个用于检测西瓜全缘叶形的snp位点，其特征在于，所述snp位点为西瓜基因组4 号染色体上第21233313位核苷酸t缺失。7.一对用于检测西瓜全缘叶形性状的snp2标记，其特征在于，扩增所述snp2标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.9所示，下游引物序列如seq.id.no.10所示。8.一种鉴定西瓜全缘叶形性状的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：(1)提取西瓜植株组织的dna；(2)pcr扩增：利用权利要求7所述的引物对，对步骤(1)所提取样品进行pcr扩增；(3)对产物进行sanger测序(4)根据步骤(3)的测序结果进行判定，具体标准为：若克隆产物第253至258位碱基为gtttcc，其序列如序列表中seq id no.11所示，则待测西瓜植株为全缘叶形的材料；若克隆产物第253至258位碱基为gttttc，其序列如序列表中seq id no.12所示，则待测西瓜植株为纯合裂刻叶形材料；若克隆产物第253至258位碱基为gtttcc或gttttc，待测西瓜植株为杂合裂刻叶形材料。
9.一种用于鉴定西瓜全缘叶形性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求1中所述的一对或者两对引物对或包含权利要求7中所述的引物对。10.用于检测dcaps标记或snp2标记是否存在的试剂在全缘叶形基因clll定位中的应用，其特征在于，扩增所述dcaps2标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.1所示，下游引物序列如seq.id.no.2所示；和/或扩增所述dcaps3标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.3所示，下游引物序列如seq.id.no.4所示；扩增所述snp2标记的引物对的上游引物序列如seq.id.no.9所示，下游引物序列如seq.id.no.10所示。
技术总结
本发明属于基因工程技术领域，具体涉及用于检测西瓜全缘叶形的SNP位点、紧密连锁分子标记及应用。本发明的分子标记能够从分子水平鉴定西瓜叶形性状，可以直接用于西瓜全缘叶形材料的分子标记辅助育种，提高育种的选择效率，加快育种进程；另外利用该分子标记可获得这两分子标记之间的物理图谱，从而为最终西瓜全缘叶形ClLL基因的克隆、分子标记辅助育种体系的建立奠定基础，同时也为西瓜叶片发育调控网络的研究奠定基础。网络的研究奠定基础。网络的研究奠定基础。
技术研发人员：杨路明 豆峻岭 杨森 朱华玉 刘东明 牛欢欢 段世享
受保护的技术使用者：河南农业大学
技术研发日：2022.03.15
技术公布日：2022/7/12