背景技术:
1、乳腺癌是全球女性最常见的癌症,其中大约15-20%的病例表现为her2(erbb2)过表达或扩增,并且可以通过her2定向靶向药物进行治疗。
2、近几十年来,引入her2定向疗法,尤其是曲妥珠单抗(trastuzumab)、帕妥珠单抗(pertuzumab)、抗体药物联合物(adcs)如t-dm1和ds8201a,以及酪氨酸激酶抑制剂(tkis)如拉帕替尼(lapatinib)、来那替尼(neratinib)、吡咯替尼(pyrotinib)和图卡替尼(tucatinib),显著改善了her2阳性乳腺癌患者的预后。
3、然而,一些患者对这样的her2定向疗法没有反应,甚至在治疗一段时间后显示出药物抵抗性。此外,her2定向疗法可能导致患者基因组发生一些改变,使治疗策略更加复杂。
4、因此,仍然迫切需要开发下一代抗her2药物,以增强治疗效果并逆转药物抵抗性。
技术实现思路
1、在本技术中发现,携带cdk12扩增肿瘤的受试者,和/或her2蛋白和/或cdk12蛋白发生改变的受试者,和/或编码它们的基因发生改变的受试者,对本技术所述的抗her2双特异性抗体更具响应性(例如,更可能出现肿瘤体积显著减少;和/或更可能有更长的无进展生存期(pfs))。
2、本公开提供一种预防、缓解或治疗肿瘤或抑制肿瘤生长的方法,包含:给予蛋白质和/或编码该蛋白质的基因发生改变的受试者本技术的her2抑制剂,其中该蛋白质包含her2和/或cdk12。本技术还提供一种用于检测受试者中该改变以确定本技术的her2抑制剂是否适合该受试者的方法和系统。本技术还提供使用本技术的her2抑制剂、本技术的多重cdk抑制剂和/或本技术的免疫检查点抑制剂治疗肿瘤的方法。此外,本技术还提供一种药物产品,其中包含本技术的her2抑制剂、本技术的多重cdk抑制剂和/或本技术的免疫检查点抑制剂。
3、在一个方面,本技术提供了一种预防、缓解或治疗肿瘤或抑制肿瘤生长的方法,包含:给予受试者her2抑制剂,其中该受试者的蛋白质和/或编码该蛋白质的基因发生改变,且该蛋白质包含her2和/或cdk12。
4、在另一个方面,本技术提供了一种预防、缓解或治疗肿瘤或抑制肿瘤生长的方法,该方法适用于需要的受试者,包含:给予受试者her2抑制剂,其中该肿瘤是cdk12扩增肿瘤。
5、在一些实施例中,her2抑制剂能够抑制人类的her2。
6、在一些实施例中,her2抑制剂是her2抗体或其抗原结合部分和/或其结合物。
7、在一些实施例中,her2抑制剂从以下组合中选择:帕妥珠单抗、曲妥珠单抗和玛格妥昔单抗(margetuximab)。
8、在一些实施例中,her2抑制剂从以下组合中选择:ds8201a和t-dm1。
9、在一些实施例中,her2抑制剂是双特异性抗体或其抗原结合部分,且能够结合到人类her2的不同表位。
10、在一些实施例中,her2抑制剂是双特异性抗体或其抗原结合部分,该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一轻链和第二轻链,其中第一轻链和第二轻链具有相同的氨基酸序列。
11、在一些实施例中,her2抑制剂是双特异性抗体或其抗原结合部分,该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一重链和第二重链,其中第一重链和第二重链能够在生理条件下或体外蛋白表达过程中与轻链分别正确组装。
12、在一些实施例中,第一轻链和第二轻链能够分别与帕妥珠单抗的重链和曲妥珠单抗的重链正确组装。
13、在一些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区包含seq id no:91-96中的任一个所示的氨基酸序列。
14、在一些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区包含seq id no:91中的氨基酸序列。
15、在一些实施例中,第一轻链和第二轻链分别选择自帕妥珠单抗的轻链或其突变体,曲妥珠单抗的轻链或其突变体。
16、在一些实施例中,第一轻链包含seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列,和/或,第二轻链包含seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列。
17、在一些实施例中,重链可变区域分别是帕妥珠单抗的重链可变区域和曲妥珠单抗的重链可变区域。
18、在一些实施例中,第一重链的可变区包含seq id no:87中的氨基酸序列;而第二重链的可变区包含seq id no:88中的氨基酸序列。
19、在一些实施例中,第一重链和第二重链包含恒定区域,并且该恒定区域来源于人类igg的恒定区域。
20、在一些实施例中,重链的fc片段序列包含seq id no:89-90和101-104中的任一个所示的序列。
21、在一些实施例中,其中两个重链包含seq id no:80-81、83-84、97-100中的任一个所示的序列。
22、在一些实施例中,her2抑制剂以约15毫克/千克至约35毫克/千克的剂量给予受试者。
23、在一些实施例中,her2抑制剂的剂量约为20毫克/千克至约30毫克/千克。
24、在一些实施例中,her2抑制剂的剂量约为20毫克/千克。
25、在一些实施例中,her2抑制剂的剂量约为30毫克/千克。
26、在一些实施例中,her2抑制剂每两周左右给予一次,或者每三周左右给予一次。
27、在一些实施例中,her2抑制剂的剂量约为20毫克/千克,并且her2抑制剂每两周左右给予一次。
28、在一些实施例中,her2抑制剂的剂量约为30毫克/千克,并且her2抑制剂每三周左右给予一次。
29、在一些实施例中,her2抑制剂通过静脉注射给药。
30、在一些实施例中,该改变包含基因的突变、扩增、融合和/或重排。
31、在一些实施例中,该改变包含蛋白质和/或编码该蛋白质的mrna的突变和/或扩增。
32、在一些实施例中,该改变包含蛋白质的扩增、编码该蛋白质的mrna的扩增和/或基因的扩增。
33、在一些实施例中,该改变包含her2蛋白质的至少一个突变,其中该突变包含t862a、h878y和/或r897w。
34、在一些实施例中,该改变包含her2蛋白质的突变,其中该突变包含t862a、h878y和r897w。
35、在一些实施例中,该改变包含cdk12基因的改变。
36、在一些实施例中,该改变包含cdk12基因的扩增。
37、在一些实施例中,该改变包含cdk12基因和her2基因的共同扩增。
38、在一些实施例中,扩增包含cdk12基因和/或her2基因的dna复制数增加。
39、在一些实施例中,扩增包含cdk12蛋白质和/或her2蛋白质的mrna和/或蛋白质表达水平增强。
40、在一些实施例中,该受试者对于her2相关肿瘤的传统治疗方法没有反应。
41、在一些实施例中,对于her2相关肿瘤的传统治疗方法包含给予her2-adc、吡咯替尼、来那替尼、图卡替尼、曲妥珠单抗和/或帕妥珠单抗。
42、在一些实施例中,对于her2相关肿瘤的传统治疗方法包含给予多西他赛(docetaxel)、卡培他滨(capecitabine)和/或拉帕替尼。
43、在一些实施例中,肿瘤是实体肿瘤。
44、在一些实施例中,肿瘤可以是转移性肿瘤、早期肿瘤和/或局部晚期肿瘤。
45、在一些实施例中,肿瘤可以是her2阳性肿瘤和/或her2低表达肿瘤。
46、在一些实施例中,肿瘤可以是乳腺癌和/或胃癌。
47、在一些实施例中,乳腺癌可以是her2阳性乳腺癌和/或her2低表达乳腺癌。
48、在一些实施例中,乳腺癌可以是早期乳腺癌、局部晚期乳腺癌和/或转移性乳腺癌;而胃癌可以是早期胃癌、局部晚期胃癌和/或转移性胃癌。
49、在一些实施例中,该方法包含以下步骤:检测受试者的改变,以确定是否适合给予her2抑制剂。
50、在一些实施例中,检测包含对受试者的her2蛋白质进行测序。
51、在一些实施例中,检测包含对受试者的cdk12基因进行测序。
52、在一些实施例中,检测包含对受试者的her2基因进行测序。
53、在一些实施例中,测序包含新一代测序(ngs)和/或微滴式数字pcr(ddpcr)。
54、在一些实施例中,测序使用来自受试者的循环肿瘤dna(ctdna)。
55、在一些实施例中,测序使用来自受试者的外周血和/或肿瘤组织。
56、在一些实施例中,该方法进一步包含给予多重cdk抑制剂。
57、在一些实施例中,多重cdk抑制剂抑制cdk1、cdk2、cdk5、cdk9和/或cdk12。
58、在一些实施例中,多重cdk抑制剂抑制cdk12。
59、在一些实施例中,cdk12是人类cdk12。
60、在一些实施例中,多重cdk抑制剂不抑制cdk4、cdk6。
61、在一些实施例中,多重cdk抑制剂选自以下药物中的一组:thz531、dinaciclib和sr-3029。
62、在一些实施例中,多重cdk抑制剂是dinaciclib。
63、在一些实施例中,该方法进一步包含给予免疫检查点抑制剂。
64、在一些实施例中,免疫检查点抑制剂能够特异性地结合pd-l1和ctla4。
65、在一些实施例中,免疫检查点抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合片段。
66、在一些实施例中,免疫检查点抑制剂是一种抗原结合片段,该抗原结合片段包含fab、fab'、f(ab)2、fv片段、f(ab')2、scfv、di-scfv和/或dab。
67、在一些实施例中,免疫检查点抑制剂是一种双特异性抗体,且该双特异性抗体是全人源抗体。
68、在一些实施例中,免疫检查点抑制剂是一种二聚体,该二聚体由两条多肽链组成,其中每条多肽链包含一个抗体fc亚基。该二聚体包含两个或更多的免疫球蛋白单可变结构域(isvds),其中至少一个isvd能够特异结合pd-l1,至少一个isvd能够特异结合ctla4。
69、在一些实施例中,两条多肽链中的至少其中一条多肽链包含能够特异结合pd-l1的isvd和能够特异结合ctla4的isvd。
70、在一些实施例中,两条多肽链中的每一条都包含能够特异结合pd-l1的isvd和能够特异结合ctla4的isvd。
71、在一些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接体(linker)与能够特异结合ctla4的isvd融合。
72、在一些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条:能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接体与能够特异结合ctla4的isvd融合;以及,能够特异结合ctla4的isvd任选地通过连接体与与抗体fc亚单位融合。
73、在一些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条:能够特异结合pd-l1的isvd的c端任选地通过连接体与能够特异结合ctla4的isvd的n端融合;以及,能够特异结合ctla4的isvd的c端任选地通过连接体与抗体fc亚基的n端融合。
74、在一些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条:能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接体与能够特异结合ctla4的isvd融合;而能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接体与抗体fc亚基融合。
75、在一些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条:能够特异结合ctla4的isvd的c端任选地通过连接体与特异结合pd-l1的isvd的n端融合;而能够特异结合pd-l1的isvd的c端任选地通过连接体与抗体fc亚基的n端。
76、在一些实施例中,抗体fc亚基是源自igg抗体的fc亚基。
77、在一些实施例中,igg是人类的igg1。
78、在一些实施例中,抗体fc亚基包含如seq id no:35、38和39中所列出的任一个所示的氨基酸序列。
79、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd(或者特异于pd-l1的isvd)能够与人类pd-l1的n端igv结构域结合。
80、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1n端igv结构域的i54、y56、e58、q66和/或r113残基结合,其中人类pd-l1n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
81、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd还与人类pd-l1n端igv结构域的d61、n63、v68、m115、s117、y123和/或r125残基结合,其中人类pd-l1n端igv结构域包含如seq idno:64所示的氨基酸序列。
82、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1n端igv结构域的构象表位结合,其中构象表位包括人类pd-l1n端igv结构域的i54、y56、e58、q66和r113残基,并且其中人类pd-l1n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
83、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd与人类pd-l1n端igv结构域的构象表位结合,其中构象表位包括人类pd-l1n端igv结构域的i54、y56、e58、q66、r113、d61、n63、v68、m115、s117、y123和r125残基,并且其中人类pd-l1n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
84、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够阻断pd-l1与pd1的结合。
85、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够阻断pd-l1与cd80的结合。
86、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与参考抗pd-l1抗体交叉竞争结合pd-l1,其中参考抗pd-l1抗体包含重链cdr3,重链包含如seq id no:1所示的氨基酸序列。
87、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr3,其包含如seq id no:5和9中的任一个所示的氨基酸序列。
88、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr1,其包含如seq id no:2中所示的氨基酸序列。
89、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr1,其包含如seq id no:3和7中的任一个所示的氨基酸序列。
90、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr2,其包含如seq id no:4、8、11中的任一个所示的氨基酸序列。
91、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体是特异结合pd-l1的isvd。
92、在一些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链可变区域,其包含如seq id no:6、10、12、13、14和15中的任一个所示的氨基酸序列。
93、在一些实施例中,参考的抗pd-l1抗体包含重链可变结构域,其包含如seq id no:6中所示的氨基酸序列。
94、在一些实施例中,特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr3,其包含如seq id no:1中所示的氨基酸序列。
95、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr3,其包含如seq id no:5或9中的任一个所示的氨基酸序列。
96、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr1,其包含如seq id no:2所示的氨基酸序列。
97、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr1,其包含如seq id no:3或7中的任一个所示的氨基酸序列。
98、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr2,其包含如seq id no:4、8或11中的任一个所示的氨基酸序列。
99、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链可变区域,其包含如seq idno:6、10、12、13、14或15中的任一个所示的氨基酸序列。
100、在一些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链可变区域,其包含如seq idno:6所示的氨基酸序列。
101、在一些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd(或者特异于ctla4的isvd)能够特异性地与人ctla4结合。
102、在一些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd能够阻断ctla4与cd80的结合。
103、在一些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd能够阻断ctla4与cd86的结合。
104、在一些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd与参考抗-ctla4抗体发生交叉竞争,其中参考抗-ctla4抗体包含重链cdr3,其包含如seq id no:19所示的氨基酸序列。
105、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体包含重链cdr1,其包含如seq id no:17所示的氨基酸序列。
106、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体包含重链cdr2,其包含如seq id no:16所示的氨基酸序列。
107、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体包含重链cdr2,其包含如seq id no:18、21或23中的任一个所示的氨基酸序列。
108、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体是一种能够特异性结合ctla4的isvd。
109、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体包括重链可变区域,其包含如seq id no:20、22和24-32中的任何一个中所示的氨基酸序列。
110、在一些实施例中,参考抗-ctla4抗体包含重链可变区域,其包含如seq id no:20所示的氨基酸序列。
111、在一些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链cdr3,其包含如seq idno:19所示的氨基酸序列。
112、在一些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链cdr1,其包含如seq idno:17所示的氨基酸序列。
113、在一些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链cdr2,其包含如seq idno:16所示的氨基酸序列。
114、在一些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链cdr2,其包含如seq idno:18、21和23中的任一个所示的氨基酸序列。
115、在一些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链可变区域,其包含如seqid no:20、22和24-32中的任一个所示的氨基酸序列。
116、在某些实施例中,能够特异性结合ctla4的isvd包含重链可变区域,其包含如seqid no:20所示的氨基酸序列。
117、在某些实施例中,该二聚体是同源二聚体。
118、在某些实施例中,连接体包含如seq id no:33-34中的任一个所示的氨基酸序列。
119、在某些实施例中,两条多肽链中的一条或两条包含如seq id no:40-43、46、48和50中的任一个所示的氨基酸序列。
120、在某些实施例中,两条多肽链中的一条或两条包含如seq id no:40中所示的氨基酸序列。
121、在某些实施例中,该二聚体能够阻断pd-l1与pd-1的结合。
122、在某些实施例中,该二聚体能够阻断pd-l1与cd80的结合。
123、在某些实施例中,该二聚体能够阻断ctla4与cd80的结合。
124、在某些实施例中,该二聚体能够阻断ctla4与cd86的结合。
125、在另一方面,本技术提供了一种药物产品,包含her2抑制剂和多重cdk抑制剂。
126、某些实施例中,该her2抑制剂能够抑制人类her2。
127、在某些实施例中,该her2抑制剂是her2抗体或其抗原结合部分和/或其缀合物。
128、在某些实施例中,该her2抑制剂可从帕妥珠单抗、曲妥珠单抗和玛格妥昔单抗中选择。
129、在某些实施例中,该her2抑制剂可从ds8201a和t-dm1中选择。
130、在某些实施例中,该her2抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合部分,能够与人类her2的不同表位结合。
131、在某些实施例中,该her2抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合部分,该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一轻链和第二轻链,且第一轻链和第二轻链包含相同的氨基酸序列。
132、在某些实施例中,her2抑制剂是双特异性抗体或其抗原结合部分,其中该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一重链和第二重链,并且在生理条件下或体外蛋白质表达期间,第一重链和第二重链能够正确地与轻链分别组装。
133、在某些实施例中,双特异性抗体或其抗原结合部分的第一轻链和第二轻链能够分别与帕妥珠单抗的重链和曲妥珠单抗的重链组装。
134、在某些实施例中,双特异性抗体或其抗原结合部分的第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91-96中的任一个所示的氨基酸序列。
135、在某些实施例中,双特异性抗体或其抗原结合部分的第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91中所示的氨基酸序列。
136、在某些实施例中,第一轻链和第二轻链分别从帕妥珠单抗或其突变体的轻链中选择的,曲妥珠单抗或其突变体的轻链中选择。
137、在某些实施例中,第一轻链包含如seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列,和/或,第二轻链包含如seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列。
138、在某些实施例中,重链可变区域分别是帕妥珠单抗的重链可变区域和曲妥珠单抗的重链可变区域。
139、在某些实施例中,第一重链的可变区域包含如seq id no:87中的氨基酸序列;第二重链的可变区域包含如seq id no:88中的氨基酸序列。
140、在某些实施例中,第一重链和第二重链包含恒定区域,并且该恒定区域源自人体igg的恒定区域。
141、在某些实施例中,重链的fc片段序列包含如seq id no:89-90和101-104中的任一个所示的序列。
142、在某些实施例中,其中两条重链包含如seq id no:80-81、83-84和97-100中的任个中所示的序列。
143、在某些实施例中,多重cdk抑制剂抑制cdk1、cdk2、cdk5、cdk9和/或cdk12。
144、在某些实施例中,多重cdk抑制剂抑制cdk12。
145、在某些实施例中,cdk12是人类cdk12。
146、在某些实施例中,多重cdk抑制剂不抑制cdk4和cdk6。
147、在某些实施例中,多重cdk抑制剂是选自:thz531、dinaciclib和sr-3029。
148、在某些实施例中,多重cdk抑制剂是dinaciclib。
149、在某些实施例中,her2抑制剂和多重cdk抑制剂不包含在同一个容器中。
150、在某些实施例中,her2抑制剂和多重cdk抑制剂分别包含在不同的容器中。
151、在某些实施例中,药物制剂还包含免疫检查点抑制剂。
152、在某些实施例中,免疫检查点抑制剂能够特异性地与pd-l1和ctla4结合。
153、在某些实施例中,免疫检查点抑制剂是双特异性抗体或其抗原结合片段。
154、在某些实施例中,免疫检查点抑制剂是抗原结合片段,且该抗原结合片段包含fab、fab'、f(ab)2、fv片段、f(ab')2、scfv、二聚scfv和/或dab。
155、在某些实施例中,免疫检查点抑制剂是双特异性抗体,且该双特异性抗体是全人源抗体。
156、在某些实施例中,免疫检查点抑制剂是二聚体,该二聚体由两条多肽链组成,每条多肽链包含抗体fc亚基,其中该二聚体包括两个或更多的免疫球蛋白单可变结构域(isvds),至少一个isvd能够特异结合pd-l1,至少一个isvd能够特异结合ctla4。
157、在某些实施例中,两条多肽链中至少有一条包含能够特异结合pd-l1的isvd和能够特异结合ctla4的isvd。
158、在某些实施例中,两条多肽链中的每一条都包含能够特异结合pd-l1的isvd和能够特异结合ctla4的isvd。
159、在某些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合pd-l1的isvd与能够特异结合ctla4的isvd融合,可以通过连接子连接。
160、在某些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接子与能够特异结合ctla4的isvd融合;以及,能够特异结合ctla4的isvd任选地通过连接子与抗体fc亚基融合。
161、在某些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合pd-l1的isvd的c端任选地通过连接子与能够特异结合ctla4的isvd的n端融合;以及,能够特异结合ctla4的isvd的c端任选地通过连接子与抗体fc亚基的n端融合。
162、在某些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接子与能够特异结合ctla4的isvd融合;以及,能够特异结合pd-l1的isvd任选地通过连接子与抗体fc亚基融合。
163、在某些实施例中,对于两条多肽链中的一条或两条,能够特异结合ctla4的isvd的c端任选地通过连接子与能够特异结合pd-l1的isvd的n端融合;以及,能够特异结合pd-l1的isvd的c端任选地通过连接子与抗体fc亚基的n端融合。
164、在某些实施例中,抗体fc亚基源自igg fc亚基。
165、在某些实施例中,igg是人类igg1。
166、在某些实施例中,抗体fc亚基的氨基酸序列包含如seq id no:35、38和39中的任一个所示的序列。
167、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1的n端igv结构域结合。
168、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1的n端igv结构域的氨基酸残基i54、y56、e58、q66和/或r113结合,其中人类pd-l1的n端igv结构域包含如seqid no:64所示的氨基酸序列。
169、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够进一步与人类pd-l1的n端igv结构域的氨基酸残基d61、n63、v68、m115、s117、y123和/或r125结合,其中人类pd-l1的n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
170、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1的n端igv结构域的构象表位结合,该构象表位包含人类pd-l1的n端igv结构域的氨基酸残基i54、y56、e58、q66和r113,其中人类pd-l1的n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
171、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够与人类pd-l1的n端igv结构域的构象表位结合,该构象表位包含人类pd-l1的n端igv结构域的氨基酸残基i54、y56、e58、q66、r113、d61、n63、v68、m115、s117、y123和r125,其中人类pd-l1的n端igv结构域包含如seq id no:64所示的氨基酸序列。
172、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够阻断pd-l1与pd1的结合。
173、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd能够阻断pd-l1与cd80的结合。
174、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd与参考抗pd-l1抗体交叉竞争结合pd-l1,其中参考抗pd-l1抗体包含重链cdr3,该重链cdr3的氨基酸序列包含如seq id no:1所示的氨基酸序列。
175、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr3,该重链cdr3的氨基酸序列包含如seq id no:5和9中的任一个所示的氨基酸序列。
176、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr1,该重链cdr1的氨基酸序列包含如seq id no:2所示的氨基酸序列。
177、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr1,该重链cdr1的氨基酸序列包含如seq id no:3和7中的任一个所示的氨基酸序列。
178、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链cdr2,该重链cdr2的氨基酸序列包含如seq id no:4、8和11中的任一个所示的氨基酸序列。
179、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体是对pd-l1特异的isvd。
180、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:6、10、12、13、14和15中的任一个所示的氨基酸序列。
181、在某些实施例中,参考抗pd-l1抗体包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:6所示的氨基酸序列。
182、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr3,该重链cdr3包含如seq id no:1所示的氨基酸序列。
183、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr3,该重链cdr3包含如seq id no:5和9中的任一个所示的氨基酸序列。
184、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr1,该重链cdr1包含如seq id no:2所示的氨基酸序列。
185、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr1,该重链cdr1包含如seq id no:3和7中的任一个所示的氨基酸序列。
186、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链cdr2,该重链cdr2包含如seq id no:4、8和11中的任一个所示的氨基酸序列。
187、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:6、10、12、13、14和15中的任一个所示的氨基酸序列。
188、在某些实施例中,能够特异结合pd-l1的isvd包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:6所示的氨基酸序列。
189、在某些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd能够与人类ctla4特异结合。
190、在某些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd能够阻断ctla4与cd80的结合。
191、在某些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd能够阻断ctla4与cd86的结合。
192、在某些实施例中,能够特异结合ctla4的isvd与参考抗ctla4抗体竞争结合ctla4,其中参考抗ctla4抗体包含重链cdr3,该重链cdr3包含如seq id no:19所示的氨基酸序列。
193、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体包含重链cdr1,该重链cdr1包含如seq id no:17所示的氨基酸序列。
194、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体包含重链cdr2,该重链cdr2包含如seq id no:16所示的氨基酸序列。
195、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体包含重链cdr2,该重链cdr2包含如seq id no:18、21和23中的任一个所示的氨基酸序列。
196、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体是能够特异结合ctla4的isvd。
197、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:20、22和24-32中的任一个所示的氨基酸序列。
198、在某些实施例中,参考抗ctla4抗体包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:20所示的氨基酸序列。
199、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链cdr3,该重链cdr3包含如seq idno:19所示的氨基酸序列。
200、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链cdr1,该重链cdr1包含如seq idno:17所示的氨基酸序列。
201、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链cdr2,该重链cdr2包含如seq idno:16所示的氨基酸序列。
202、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链cdr2,该重链cdr2包含如seq idno:18、21和23中的任一个所示的氨基酸序列。
203、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:20、22和24-32中的任一个所示的氨基酸序列。
204、在某些实施例中,特异结合ctla4的isvd包含重链可变区域,该重链可变区域包含如seq id no:20所示的氨基酸序列。
205、在某些实施例中,二聚体是同源二聚体。
206、在某些实施例中,连接子包含如seq id no:33-34中的任一个所示的氨基酸序列。
207、在某些实施例中,两条多肽链中的一条或两条包含如seq id no:40-43、46、48和50中的任一个所示的氨基酸序列。
208、在某些实施例中,两条多肽链中的一条或两条包含如seq id no:40所示的氨基酸序列。
209、在某些实施例中,二聚体能够阻断pd-l1与pd-1的结合。
210、在某些实施例中,二聚体能够阻断pd-l1与cd80的结合。
211、在某些实施例中,二聚体能够阻断ctla4与cd80的结合。
212、在某些实施例中,二聚体能够阻断ctla4与cd86的结合。
213、在某些实施例中,药物产品是一种药物组合物。
214、在某些实施例中,her2抑制剂、免疫检查点抑制剂和多重cdk抑制剂不包含在同一个容器中。
215、在某些实施例中,her2抑制剂、免疫检查点抑制剂和多重cdk抑制剂分别包含在不同的容器中。
216、在另一方面,本技术还提供her2抑制剂与多重cdk抑制剂和/或免疫检查点抑制剂联合在用于制备缓解、治疗肿瘤或抑制肿瘤生长的药物中的用途,其中her2抑制剂、多重cdk抑制剂和免疫检查点抑制剂的定义如本技术所述。
217、在另一方面,本技术提供了将本技术中定义的药物产品用于制备缓解或治疗肿瘤或抑制肿瘤生长的药物用途。
218、在另一方面,本技术提供了一种确定受试者是否适合使用her2抑制剂的方法,包括:检测受试者的一种改变,如果存在这种改变则该受试者适合使用her2抑制剂,其中该改变位于蛋白质和/或编码该蛋白质的基因中,该蛋白质包含her2和/或cdk12。
219、在某些实施例中,her2抑制剂能够抑制人类her2。
220、在某些实施例中,her2抑制剂是her2抗体或其抗原结合部分和/或其结合物。
221、在某些实施例中,her2抑制剂选自帕妥珠单抗、曲妥珠单抗和玛格妥昔单抗等药物。
222、在某些实施例中,her2抑制剂选自ds8201a和t-dm1等药物。
223、在某些实施例中,her2抑制剂是能够特异性结合人her2不同表位的双特异性抗体或其抗原结合部分。
224、在某些实施例中,her2抑制剂是能够特异结合人her2的不同表位的双特异性抗体或其抗原结合部分,且该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一轻链和第二轻链,其中第一轻链和第二轻链具有相同的氨基酸序列。
225、在某些实施例中,her2抑制剂是能够特异结合人her2不同表位的双特异性抗体或其抗原结合部分,且该双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一重链和第二重链,其中第一重链和第二重链能够在生理条件下或体外蛋白质表达过程中与相应的轻链正确组装。
226、在某些实施例中,第一轻链和第二轻链能够分别与与帕妥珠单抗的重链和曲妥珠单抗的重链组装。
227、在某些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91-96中的任一个所示的氨基酸序列。
228、在某些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91中所示的氨基酸序列。
229、在某些实施例中,第一轻链和第二轻链分别选自帕妥珠单抗的轻链或其突变体、曲妥珠单抗的轻链或其突变体。
230、在某些实施例中,第一轻链包含如seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列,和/或第二轻链包含如seq id no:65-70中的任一个所示的氨基酸序列。
231、在某些实施例中,重链可变区域分别为帕妥珠单抗和曲妥珠单抗的重链可变区域。
232、在某些实施例中,第一重链的可变区域包含如seq id no:87中所示的氨基酸序列;第二重链的可变区域包含如seq id no:88中所示的氨基酸序列。
233、在某些实施例中,第一重链和第二重链包含恒定区,该恒定区源于人类igg恒定区。
234、在某些实施例中,重链的fc片段包含如seq id no:89-90、101-104中的任一个所示的序列。
235、在某些实施例中,两条重链中的一条或两条包含如seq id no:80-81、83-84、97-100中的任一个所示的序列。
236、在某些实施例中,改变包含基因的突变、扩增、融合和/或重排。
237、在某些实施例中,改变包含蛋白质和/或编码该蛋白质的mrna的突变和/或扩增。
238、在某些实施例中,改变包含蛋白质的扩增、编码该蛋白质的mrna的扩增和/或基因的扩增。
239、在某些实施例中,改变包含her2蛋白质的至少一个位点的突变,其中该突变包含t862a、h878y和/或r897w。
240、在某些实施例中,改变包含her2蛋白质的突变,其中该突变包含t862a、h878y和r897w。
241、在某些实施例中,改变包含cdk12基因的改变。
242、在某些实施例中,改变包含cdk12基因的扩增。
243、在某些实施例中,改变包含cdk12基因和her2基因的共扩增。
244、在某些实施例中,扩增包含cdk12基因和/或her2基因dna拷贝的增强。
245、在某些实施例中,扩增包含cdk12蛋白质和/或her2蛋白质mrna和/或蛋白质表达水平的增强。
246、在某些实施例中,检测过程包含对受试者的her2蛋白质进行测序。
247、在一些实施例中,检测包含对cdk12基因进行测序。
248、在一些实施例中,检测包含对her2基因进行测序。
249、在一些实施例中,测序包含使用ngs和/或ddpcr技术。
250、在一些实施例中,测序使用来自受试者的ctdna。
251、在一些实施例中,测序使用来自受试者的外周血液和/或肿瘤组织。
252、在另一方面,本技术提供了一个用于确定受试者是否适合接受her2抑制剂治疗的系统,包含检测模块,其配置为检测受试者中蛋白质和/或编码该蛋白质的基因的改变,其中所述蛋白质包含her2和/或cdk12。
253、在一些实施例中,所述改变包含基因中的突变、扩增、融合和/或重排。
254、在一些实施例中,所述改变包含蛋白质和/或编码该蛋白质的mrna中的突变和/或扩增。
255、在一些实施例中,所述改变包含蛋白质的扩增、编码该蛋白质的mrna的扩增和/或基因的扩增。
256、在一些实施例中,所述改变包含her2蛋白质的至少一个突变,其中该突变包含t862a、h878y和/或r897w。
257、在一些实施例中,改变包含her2蛋白质的突变,其中该突变包含t862a、h878y和r897w。
258、在一些实施例中,改变包含cdk12基因的改变。
259、在一些实施例中,改变包含cdk12基因的扩增。
260、在一些实施例中,改变包含cdk12基因和her2基因的共扩增。
261、在一些实施例中,改变包含增加cdk12基因和/或her2基因的dna拷贝数。
262、在一些实施例中,扩增包含增加cdk12蛋白质和/或her2蛋白质的mrna和/或蛋白质表达水平。
263、在一些实施例中,检测模块被配置为对her2蛋白质进行测序。
264、在一些实施例中,检测模块包含用于对her2蛋白质进行测序的试剂。
265、在一些实施例中,检测模块被配置为对cdk12基因进行测序。
266、在一些实施例中,检测模块被配置为对her2基因进行测序。
267、在一些实施例中,检测模块包含用于对cdk12基因进行测序的试剂和/或用于对her2基因进行测序的试剂。
268、在一些实施例中,该系统包含样本收集模块。
269、在一些实施例中,样本收集模块被配置为从受试者收集ctdna。
270、在一些实施例中,样本收集模块从受试者收集外周血液和/或肿瘤组织。
271、在一些实施例中,样本收集模块包含用于收集和/或分离ctdna和/或肿瘤组织dna的试剂。
272、在一些实施例中,her2抑制剂能够抑制人类her2。
273、在一些实施例中,her2抑制剂是her2抗体或其抗原结合部分和/或其缀合物。
274、在一些实施例中,her2抑制剂从帕妥珠单抗、曲妥珠单抗和玛格妥昔单抗等药物中选择。
275、在一些实施例中,her2抑制剂从ds8201a和t-dm1等药物中选择。
276、在一些实施例中,her2抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合部分,并且能够与人类her2的不同表位结合。
277、在一些实施例中,her2抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合部分,其中双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一轻链和第二轻链,且第一轻链和第二轻链具有相同的氨基酸序列。
278、在一些实施例中,her2抑制剂是一种双特异性抗体或其抗原结合部分,其中双特异性抗体或其抗原结合部分具有第一重链和第二重链,其中第一重链和第二重链能分别与轻链在生理条件下或体外蛋白质表达状态下正确组装。
279、在一些实施例中,第一轻链和第二轻链能够分别与帕妥珠单抗的重链和曲妥珠单抗的重链组装。
280、在一些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91-96中任一个所示的氨基酸序列。
281、在一些实施例中,第一轻链和/或第二轻链的可变区域包含如seq id no:91中所示的氨基酸序列。
282、在一些实施例中,第一轻链和第二轻链分别选自帕妥珠单抗的轻链或其突变体,以及曲妥珠单抗的轻链或其突变体。
283、在一些实施例中,第一轻链包含如seq id no:65-70中任一个所示的氨基酸序列,和/或第二轻链包含如seq id no:65-70中任一个所示的氨基酸序列。
284、在一些实施例中,重链的可变区域分别为帕妥珠单抗的重链可变区域和曲妥珠单抗的重链可变区域。
285、在一些实施例中,第一重链的可变区域包含如seq id no:87中所示的氨基酸序列,第二重链的可变区域包含seq id no:88中所示的氨基酸序列。
286、在一些实施例中,第一重链和第二重链具有一个恒定区域,并且该恒定区域源自人igg的恒定区域。
287、在一些实施例中,重链的fc片段序列包含如seq id no:89-90和101-104中任一个所示的序列。
288、在一些实施例中,两条重链的序列包含如seq id no:80-81、83-84和97-100中任一个所示的序列。
289、本技术的其他方面和优势将通过以下详细描述而变得显而易见,其中仅显示和描述了本技术的示例实施方式。正如将要认识到的,本技术能够具有其他和不同的实施方式,并且其多个细节能够在各种明显的方面进行修改,所有这些都不脱离本公开内容。因此,图纸和描述应被视为具有说明性质,而不是限制性质。
290、通过引用并入
291、本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请,均按照引用并入,就像每个单独的出版物、专利或专利申请都明确且个别地被指明为引用纳入的范围内一样。