鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的制作方法

专利名称：鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的制作方法
技术领域：
本发明涉及用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的方法和系统。
背景技术：
脐带血正在白血病、淋巴瘤和其他致命性血液疾病的治疗中发挥重要和日益增长的作用。脐带血是移植中所用的造血细胞的3种来源之一。其他两个来源是骨髓和外周(循环)血。在1988年进行了首次脐带血(CB)移植。今天，脐带血在移植中发挥重要作用。脐带血从婴儿出生后的脐带和胎盘中收集。这种血液富含造血细胞。在捐赠后，将脐带血检验、冷冻和储藏在脐带血库用于未来使用。储藏的脐带血称作脐带血单元(CBU)。像骨髓一样，脐带血富含造血细胞，所述造血细胞可以用于移植给患有白血病、淋巴瘤和许多其他致命性疾病的患者。当患者需要移植时，他或她的医生将决定什么是最好的造血细胞源。如果最好的选择是使用患者自身的细胞用于移植，则通常在移植之前从患者的血流中收集细胞(自体细胞移植)。然而，如果最好的选择是使用捐赠的细胞用于移植，则医生将寻找组织类型与患者尽可能紧密匹配的供体或脐带血单元(异体细胞移植)。患者找到匹配的最好机会来自兄弟或姐妹。如果兄弟或姐妹是匹配者，则用于移植的细胞可以从同胞的骨髓或外周血或脐带血单元收集。但是10个人中有7个将不得不在他们的家庭以外寻找，因为在他们的家庭内部不存在合适地匹配的人。这些患者依赖于已建立的脐带血库来找到非亲属的骨髓供体或脐带血单元。医生检索成人骨髓或外周血细胞供体的脐带血库和脐带血单元的登记簿，以为他们的需要移植的患者找到合适的HLA匹配者。如果选择到，则将匹配的脐带血移植至患者。移植过程是与骨髓和外周血细胞移植相同的。然而，脐带血库的数据库不是连续更新的，并且医生不能进行CBU的直接订购/输送。目前存在4种采集和储藏脐带血的形式。就第一种而言，“家庭”脐带血储藏业务一从婴儿收集脐带血以便主要由孩子、一级和二级亲属使用。这个家庭通常为处理和储藏CB样品向脐带血库付费。公司为盈利运营脐带血库，在较大库的情况下，利用采集医师、医院和区域代表的网络以国家规模采集脐带血。通过顾客和专业渠道销售使母亲知晓这种选择。采集的脐带血样品是家庭的财产。就第二种而言，“公共”脐带血储藏业务一收集脐带血用于处理并且储藏在匿名库中。样品在异体环境下使用，要求在用临床使用之前进行供体/宿主遗传匹配。公共库不是盈利机构，很大程度上由基金支持，并且在靠近库本身的一小部分地区的医院中运营。在分娩时或就在分娩之前使母亲知晓这种选择，脐带血由工作人员收集，工作人员一般是公共库的直属雇员或地区医院的住院医师。鉴于有限的医院/供体范围和可用的信息窗口，采集具有特定特征(如样本容量、种族背景、家庭健康史等)的脐带血存在有限的能力。收集的脐带血样品是公共库的财产。
就第三种而言，称作指定移植储藏业务一从婴儿收集脐带血主要由已经鉴定患有疾病的一级亲属使用，其中婴儿的脐带血干细胞可以为所述疾病提供有效的治疗选择。对于这项服务，不向家庭收费。脐带血样品一般是DTB的财产。就第四种而言，其称作紧急脐带血储藏业务(也称作低APGAR采集和多种其他名称)基于分娩时由医师测定的度量(metric)，如低APGAR评分或可以预示病状的其他度量，从婴儿收集脐带血，其中对这个孩子而言，收集的干细胞可能对所述病状具有治疗价值。对家庭象征性收费。这种脐带血样品在一段时间内作为“家庭”库的财产，随后可以在“转换”成家庭储藏业务的情况下返还给父母。当前的联邦法规限制家庭库作为公共库运营，并且公共库通过许可证、基金来源和不能在家庭储藏业务方面竞争受到家庭储藏业务的限制。这导致两方面的巨大不便。家庭库不能为它们的高效率、大容量的采集和处理系统举债融资以降低公共储存样品的每份样品的成本，公共库被迫进入高度低效的采集系统，所述采集系统涉及在有限地区的医院的直属雇员。如上文讨论的，公共库也受到它们可以采集的脐带血的特征的限制。近年来，已经出现了一方面在采集中心和脐带血库之间并且另一方面在医院和移植中心之间分配脐带血(UCB)制备物的多种过程和方法。全部的这些流程和方法源于配骨髓分配时所需流程。然而，迄今没有自动化流程可用。需要用于患者/受体移植的UCB制备物的医院将查询登记簿以查询它们否具有可用于它们的患者的UCB制备物，所述UCB制备物相应地符合若干生物学和医学特征。例如，登记的数据可以涉及所谓HLA匹配或涉及制备物中存在的细胞数目或其他医学或生物学数据(例如血型)。医院和移植中心具有所谓的协调员，其参考提交的数据进行特定UCB移植物的选择。协调员向主治医师建议制备物的选择。如果有的话，医师决定使用哪种移植物。对于每种制备物，需要医院查询涉及各自的制备物的全部重要数据，以便能够订购恰当的脐带血单元。然而，未曾对所谓单元报告中存储的信息定义世界范围的标准。另外，仍未形成各个制备物的数据之间的相关性。当选择制备物时，协调员经历耗时的易出错的反复过程。现有技术中不存在涉及选择制备物的确切方法的描述。通常已知应当最低程度使用哪种参数以选择合适的制备物，但是不可能从所分析的制备物中推断出“最好的”制备物。另外，现有技术中不存在涉及选择系统的描述，该选择系统选择合适的制备物，相应地向协调员呈现结果并可以任选地以自动化方式进行。现有技术公开了主要基于HLA分型做出的合适的制备物的选择，并且基本上未提供进一步的标准。另外，现有技术没有公开多重移植(multiple transplantation)的任何解决方案。这是在未找到适当大的制备物的情况下使用的解决策略。随后检索问题扩展至两个或更多个制备物，所述制备物一起包括足够的细胞并且在彼此之间和相对于患者都还具有充分匹配的HLA值。

发明内容
根据现有技术，作为本发明基础的技术问题是提供以高效和快速方式检索脐带血库的系统或方法。该问题由独立权利要求的特征解决。本发明的优选实施方案由从属权利要求提供。
因此本发明涉及用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的方法，所述方法包括a.输入脐带血单元的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码，b.输入受体的HLA基因座位、等位基因型及其他标准的血清学代码和/或分子代码，c.将根据a.和b.的输入转换成标准化命名，d.生成检索向量，其含有与受体的HLA基因座位和等位基因型的血清学命名和/或分子命名匹配的全部可能的值，其中将可能的值赋值为确定单元在结果列表中出现的位置的排序，其中所述排序取决于可能的单兀的HLA基因座位及等位基因型和受体的HLA基因座位及等位基因型之间的匹配，e.将检索向量的HLA基因座位和等位基因型与a比较，f.生成列表，所述列表包含对于受体可能的脐带血单元连同检索向量中事先确定的排序，g.按照一组定义的标准对所述列表过滤，h.按照匹配等级对可能的单元进行分组，以及1.至少按照匹配等级对所述单元进行分选。还优选按照其他值如TNC、TNC覆盖、⑶34+细胞或体积分选所述单元。可以基于仅一个或多个值分选所述单元。本发明进一步涉及用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的系统，所述系统包括a.通过输入单元如计算机中的键盘，输入脐带血单元的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码，并将其存储在存储介质上，b.通过计算机中的输入单元，输入受体的HLA基因座位、等位基因型及其他标准的血清学代码和/或分子代码，并将其存储在存储介质上，c.将根据a.和b.的输入转换成标准化命名，d.生成检索向量，其含有与受体的HLA基因座位和等位基因型的血清学命名和/或分子命名匹配的全部可能的值，其中将可能的值赋值为确定单元在结果列表中出现的位置的排序，其中所述排序取决于可能的单兀的HLA基因座位和等位基因型与受:体的的HLA基因座位和等位基因型之间的匹配，特别地，将所述检索标准存储于存储介质和/或处理单元上，e.将检索向量的HLA基因座位和等位基因型与a进行比较，f.生成列表，所述列表包含对于受体可能的脐带血单元连同检索向量中事先确定的排序，g.按照一组定义的标准对所述列表进行过滤，h.按照匹配等级对可能的单元进行分组，以及1.至少根据匹配等级对所述单元进行分选。该系统尤其可以在至少一个采集中心和/或储藏地点和至少一个门诊部、移植中心和/或研究设施之间提供用于移植、治疗和/或研究目的脐带血制备物，通过一个或多个处理单元(尤其计算机、医疗系统、存储设备和/或专用处理器)上的有线和/或无线连接提供彼此之间近来的通信，以及提供通过所述多个处理单元的网络借助于数据交换的连接。人白细胞抗原(HLA)分型法优选地用来匹配为了骨髓或脐带血移植(也称作BMT)的患者和供体。HLA是在身体的大部分细胞上存在的蛋白质或标记。免疫系统使用这些标记来识别哪些细胞属于身体内，哪些不属于身体内。HLA标记和供体之间的紧密匹配可以降低移植后免疫细胞将攻击供体的细胞或供体的免疫细胞将攻击受体身体的风险。已经显示，HLA紧密匹配提高了成功移植的几率、促进植活、降低称作移植物抗宿主病(GVHD)的移植后并发症的风险。 优选地所述基因座位选自包含HLA-A、-B、-C、_DR、-DP和-DQ的组。还优选的是，所述标准包含关于脐带血供体、脐带血单元和受体的数据，所述数据选自包含种族性、认证、血型、猕因子、疾病、遗传缺陷、脐带血单元年龄、脐带血体积的组。另外，优选地所述分子代码以标准化命名归类，所述标准化命名包括a.高分辨率，其中直接指定等位基因，b.中等分辨率，其中给处可能的值的范围，和c.低分辨率，其中仅指定HLA基因座位和等位基因型。优选地所述血清学代码也以标准化命名归类，所述标准化命名包括a.抗原，b.宽特异性抗原(broad antigen),c.表面抗原(split antigen)和d.相关抗原(associate antigen)。优选的是所述分子代码可以由所述血清学代码补偿，反之亦然。优选地该方法可以为异体移植鉴定脐带血单元。优选的是可以将鉴定的脐带血单元组合成多重脐带血移植物(multicordtransplant)。有利地，可以将鉴定的匹配单元合并成双重或多重脐带血移植物。优选的方法和系统可以用来鉴定完全配合并可用于多重脐带血移植(multicord transplantation)的脐带血单元。本发明还涉及用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的系统，所述系统包括a.输入脐带血单元的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码，b.输入受体的HLA基因座位、等位基因型及其他标准的血清学代码和/或分子代码，c.将根据a.和b.的输入转换成标准化命名，d.生成检索向量，其含有与受体的HLA基因座位和等位基因型的血清学命名和/或分子命名匹配的全部可能值，其中将可能值赋值为确定单元在结果列表中出现的位置的排序，其中所述排序取决于可能的单兀的HLA基因座位及等位基因型和受:体的HLA基因座位及等位基因型之间的匹配，e.将检索向量的HLA基因座位和等位基因型与a比较，f.生成列表，所述列表包含对于受体可能的脐带血单元连同检索向量中事先确定的排序。g.基于脐带血单元和/或受体的参数，按照一组定义的标准对所述列表进行过滤，h.按照匹配等级对可能的单元进行分组，以及1.至少按照匹配等级对所述单元进行分选。还优选的是所述脐带血单元以下述参数为特征
· UCB储藏库(UCB库)的名称和标识，·就国际认证、优选地FACT而言，UCB储藏库的状态，·按照分类UCB库的处理可靠性， 各自库的联系，包括联系方式，·制备物的标识号，·依照产科诊所病历表的母亲、孩子和家庭的病史，·母亲、父亲和/或孩子的种族， 孩子的性别，·最初储藏制备物的日期，·处理制备物的细节，·制备物的血型， 制备物的HLA型，·制备物的细胞计数(TNC)，·制备物的细胞计数(CD34+)，·制备物的病毒状态，·制备物的等位基因特征，和/或·分子诊断和分析的参数，·存储在存储介质和/或处理单元上的所述数据集。在一个优选实施方案中，所述受体以下述参数为特征·门诊部或移植中心的名称和标识，·协调员和主治医师的姓名，包括联系方式，·就国际认证(例如FACT)而言，门诊部的状态，·过去3年期间在查询门诊中UCB移植物的平均数目，·患者的姓名、保险号和其他会计信息，·患者的病史， 适应症和主治医师的治疗建议，·按照定义的分类的紧急性， 患者的HLA型，·患者的血型，·患者的重量，·患者的种族，·患者的性别，·患者的年龄，
·已知的患者等位基因特征和/或DNA分型数据，和/或·首次治疗或再治疗，·存储在存储介质和/或处理单元上的所述分类和/或排除标准。本发明还涉及所述系统用于为需要这种移植的患者鉴定至少一个匹配的脐带血单元的用途。发明详述在本发明的意义下，系统描述了一组彼此相关和相互作用的独立技术组件。有利地，系统可以包含程序和数据处理设备以及元件如运输容器、UCB制备物。在本发明的意义下，处理单元优选地描述借以优选地以数字形式将数据或信息输入并存储的输入装置。处理单元优选地包括适于输入和存储的计算机、医疗系统、存储设备和/或专用处理器。在一个优选实施方案中，处理单元可以单独地和/或以硬件、软件和/或固件的多种形式存在。因此，如果医疗系统(如分析仪)自动地将分析的数据转移至系统中并且不需要手工输入到终端，这可以是有利的。在本发明的意义下，优选的实施方式适用于所述方法和系统。在本发明的意义下，术语“受体”也可以指“患者”。本发明的教导还代表上述元件协作以提供用于分配和选择生物移植物的系统或方法的组合发明，其中实施复杂的HLA分型分析并且根据这种分析对移植物进行分类。系统或方法组件的有效协作产生协同效应，其特征在于单一系统或方法是可使用的，从而可以通过所述方法或系统以中央或分散方式监测和控制全部操作。参与移植的全部机构(包括医院、UCB库或医师)可以使用方法或系统并且监视移植进展。使用多级兼容性矩阵和不同的分类标准，本发明的方法将进入的患者数据与登记的脐带血单元的数据比较。有利地，比较是完全自动的，并且主治医师可以方便地在线访问数据。因此，不一定需要协调员。有利地，可以为医师自动提供关于哪种单个制备物(单一移植物)或哪些相互匹配的制备物(多重移植物)可能用于移植的建议解决方案。以这种方式，与协调员执行的冗长对比检索相比，可以根本改变并且大幅度改善储藏的即用型UCB制备物的实际利用。所述系统适于在移植或其他(医学)应用中经历时延敏感分配的全部生物学、生物化学或化工材料。通过处理单元如计算机输入UCB制备物的特征性经验值。使用一种或多种分析装置自动地分析制备物以及自动地将检验的值传输至处理单元中也可以是有利的。例如，可以在体现一种串联布置的多个分析装置的实验室流水线(laboratory line)中快速地、高效地检验并表征UCB制备物。将分析的值自动地输入系统中，因此是快速可获得的。有利地，UCB制备物的值的特异性和特征性存储在存储介质上。在本发明的意义下，存储介质或数据存储器用于存储数据或信息。有利地，数据可以在任何时间用额外的数据补充并且优选地为数字形式。可以优选的是，存储介质是海量存储设备，其优选地具有磁记录技术或半导体存储技术。在本发明的意义下，海量存储设备代表存储大量数据或信息的存储介质，优选存储很长一段时间的存储介质。有利地，可以使用具有磁记录技术的海量存储设备，所述设备在转动的铁磁硬盘的表面上写入二进制数据。在本发明的意义下，半导体存储器是由半导体组成的数据存储器，其中借助半导体技术完成集成电路。数据优选地以二进制电子开关状态存储于集成电路中。这使得数据的存储永久和安全。
同样，将表征受体的数据借助处理单元输入系统中并存储在存储介质上。在本发明的意义下，受体或潜在受体是经过分析的个体，其中尤其已经发现可以优选地借助生物学移植治疗的疾病或易患疾病。有利地，涉及患者和制备物(例如HLA值或重量和细胞数)的数据由信息处理系统而被关联，并用于评价匹配。有利地，由脐带血库提供并本地更新涉及可用的脐带血制备物(UCBP)的数据。例如将涉及可用的UCBP的详细目录的数据收集于存储库(数据库)中并且将其提供给其中的检索。受体或负责受体的门诊部可以精确地定义将据此进行匹配检索的标准。为提高效率并最小化差错，例如可以为主治医师和医院集中存储在加权和自动化选择中使用的检索参数。因此，默认检索参数集合可以在检索开始时提取并且任选地由专家修改(专家模式)。有利地，对合适的UCBP检索自动地进行但是也可以由本领域技术人员逐步执行或检测。基于检索的评价，可以从脐带血库或医院订购UCB制备物。有利地，通过网络下订单并且因此可以在长距离范围内进行而不需要与各自的库联系。为此目的，处理单元和/或存储介质配备本领域已知的能够快速传输数据的数据传输单元。实例包括可以用于处理单元之间通信的DSL、ISDN或其他连接。为了准备订购处理，与血库的交互作用可以有利于进一步地安排或缺失调查。直至现在，这仍是手工和耗时的步骤。有利地，通过自动化工作流，即以预定的活动顺序在组织内部进行工作过程，该方法或系统支持该过程。工作流连续地通知关于待决订单和各个订单状态的信息，从而改善结果的质量并且使得自身过程更高效和快速。当追踪已交付和移植的制备物时，该系统能够收集所需要的医学和药理学方面的信息。当输入数据(即经验数据)时，优选的是获得尤其在该系统中登记并且储藏在世界各地多个UCB库和采集中心内的全部UCB制备物作为方便统一的数据集合(单元报告，Unit Report)中的参数。尤其，参数包括
0115]-UCB储臧库的名称和标识0116]-就国际认证而言，UCB储藏库的状态0117]-按照分类的UCB库的处理可靠性0118]-各自的库中的联系，包括联系方式0119]-制备物的标识号0120]-依照产科诊所病历表，母亲、孩子和家庭的病史0121]-母亲、父亲和/或孩子的种族0122]-孩子的性别0123]-最初储藏制备物的日期0124]-处理制备物的细节0125]-制备物的血型0126]-制备物的HLA型0127]-制备物的细胞计数(TNC)0128]-制备物的细胞计数(⑶34+)0129]-制备物的病毒状态0130]-制备物的等位基因特征，和/或
-分子诊断和分析的参数优选地所述数据集存储在存储介质和/或处理单元上。有利地，将所述参数输入至系统中，并令人惊讶地使脐带血制备物(UCBP)的表征明确，原因是，由于所输入的数据或参数组合，每种制备物定义为其特定的性质或参数。有利地，通过参数的组合采集而实现。相当令人惊讶地，参数的组合导致本发明目的得到特别好的解决。在本发明的意义下，参数描述了在系统中以数据形式插入的特征量，即特征性质。有利地，数据包含患者、医院、医师、供体、血库、UCB制备物(实验室值、物理和信息性质)、订单与包含检索/排除标准、阈值、加权因子的处理信息和控制信息的操作细节(属性)。优选地，分子诊断和分析的参数包含对某些疾病特异性的生物标记的量。以这种方式，该系统可以提供涉及可能有害于移植的代谢途径的活性的快速声明。除涉及UCB库(如UCB库的名称和标识)的信息之外，存储了就国际认证(例如FACT :〃细胞疗法认证基金会〃)而言库的状态，从而确保符合关于制备物质量的规定标准。有利地，也可以将各自库中的联系人与联系方式一起输入。例如，联系人可以是主治医师或负责维护该库中数据库的协调员。另外，优选地分配使其明确分配的系统标准化标识号(ID)。而且，可以对来自UCB库的制备物进行综合检索。此外，每个脐带血库的处理可靠性细节由系统自动采集并包含于检索结果。另外，依照产科医院的病历表，在数据库中包括涉及母亲、孩子和家庭病史的数据。有利地，这允许就特殊病如遗传疾病而评估制备物。母亲、父亲和/或孩子的种族作为信息是有益的，因为特异性的遗传性变异可能与种族背景相关并因此使移植复杂化。有利地,还将参数如血型、HLA型、细胞计数(TNC :总有核细胞和⑶34+)、病毒状态输入数据库中。这种综合的信息允许表征和鉴定制备物以及相应地允许受体的最佳分配。该系统或方法可以使用这种数据用于找到最佳匹配。在本发明的意义下，包含这种数据或参数的数据库也可以称作中央数据采集，其内容由来自不同源的数据组成。这个数据库不仅管理每个UCB库中各个制备物的全部数据，还动态地将每种插入的制备物与多种UCB库中的全部其他制备物匹配，从而将哪个制备物组合可以用于潜在的后续双重或多重移植(多重脐带血)自动记录到每种制备物的登记薄上。在登记的制备物之间这种多重脐带血匹配的第一分类标准是HLA匹配，但是也可以优选第一分类标准是血型或TNC计数。优选地在6个HLA特征的至少4个特征中存在匹配，并且具有最多HLA匹配的那些制备物位于适合作为多重脐带血的顺序的顶部。该系统能够计算不相容性并且提供其清楚的表示。可以鉴定增加排斥风险的某些特征。早期(即在移植之前)识别这种风险可以在选择期间避免不相容性制备物。如果没有替代性制备物可用，早期开始治疗可以减少或甚至完全抑制排斥反应。令人惊讶地，由于这种分类标准，系统能够只使用充分相容性UCB制备物用于移植。在本发明的意义下，分类描述了要素的规定顺序。要素的分类可以与它们的特性，例如参数或属性(例如，UCB制备物)相关。在本发明的意义下，分类标准描述了其中产生分类的方式(例如，根据其TNC大小从最大向下至最小制备物的全部UCB制备物)。有利地，可以向分类应用过滤标准，这意指例如仅在检索结果中包括具有定义的TNC大小的那些制备物。特别有利的是，在相对大量数据的情况下，可以使用这些分类作为执行例如高效检索的索引(也用作使用众多标准的组合)。
在优选的方式中，查询医院进行患者检索，其中患者相容性制备物的确定包含以下分类和/或排除标准-门诊部或移植中心的名称和ID-协调员和主治医师的姓名，包括联系方式-就国际认证(例如FACT)而言，门诊部的状态，-过去3年期间在查询门诊中UCB移植的平均数目-患者姓名、保险号和其他会计信息-患者的病史-适应症和主治医师的治疗建议-按照定义的分类的紧急性-患者的HLA型-患者的血型-患者的重量-患者的种族-患者的性别-患者的年龄-已知的患者等位基因特征和/或DNA分型数据-首次治疗或再治疗，存储在存储介质和/或处理单元上的所述分类和/或排除标准。还优选使用并且单独地对以下的分类标准和/或排除标准进行加权-⑶34+细胞计数高于TNC计数10%的制备物-排除其中少于75%的CD34+细胞存活和/或在CA(集落测定法)中活化的制备物-血型一致-种族一致-性别-制备物的年龄-认证标准-UCB库的排序优选的实施方案可以确保制备物的最佳质量，从而使移植成功。有利地，为了这个目的对⑶34+细胞计数高于TNC计数10%的制备物进行差异性地加权。排除其中少于75%的CD34+细胞存活和/或在CA(集落测定法)中活化的制备物，从而确保高数目的造血干细胞。类似地，将其应用到⑶133+细胞上。其他标准如血型一致、种族一致和性别可以进一步限制制备物的选择。另外，可以通过确定制备物的年龄排除旧的制备物，以使仅那些未超过定义的年龄的制备物有利地用于移植，从而确保惊人的高质量。也可以考虑将UCB库的认证标准排序用于选择。以这种方式，可以排除例如在储藏或移植脐带血方面具有微薄经验的库。分类和/或排除标准的组合允许定性地表征制备物，从而减少在移植时制备物的排斥并确保患者接受“最好”即最佳耐受的制备物。在异体移植中，移植的组织不源自受体，而源自相同生物学物种的供体。为避免外来组织的严重或致命性排斥，对成功的异体移植优选地需要由免疫系统识别的特征与宿主组织完全匹配。通过高分辨率分析详细地表征脐带血单元制备物和受体，这种方法或系统可以检测并且避免标准方法(例如血液分析法)检测不到的不相容性。基于预设的参数，借助优选的实施方案，可能对合适(即匹配性)的制备物进行容易、快速和方便地自动化的检索，从而-相当令人惊讶地-使排斥风险最小化并且使成功的移植不以任何方式受阻。在另一个优选实施方案中，进行单一脐带血或多重脐带血移植物的自动和全范围选择，其中将适宜的制备物建议给主治医师和/或协调员，所述制备物在它们的参数方面匹配并且不产生任何排斥反应。有利地，适当地显示和患者彼此匹配的制备物，从而大幅度促进和加速选择。主治医师可以因此接收两种选择的表示并就是否应当进行多重脐带血或单一脐带血移植做出自己的判断。令人惊讶地，自动选择可以避免差错，并且可以向主治医师提出单一脐带血或多重脐带血移植。有利地，表示以清晰和简洁的方式进行，从而方便医师选择制备物。因此，可以形成对单一脐带血或多重脐带血移植的解决方案的自动和完整建议。有利地，协调员和医师可以关注多种明确定义和完好记录的解决方案的建议的适当性。检索参数和结果以清晰和简洁的方式呈现，从而大大方便选择。另外，形成检索基础的参数是变量并且可以针对患者和/或所需的制备物修改。这是对现有状态的巨大改进，在现有状态下协调员不得不在极早期阶段根据多种的标准评估潜在移植物。目前，这导致令人不满意的结果并且是极度耗时和费力的。因此，优选的实施方案允许在短时间内对一个或多个合适的制备物进行检索和订购。虽然已经相对于具体实施方案和实施例描述本发明，但是应当理解，使用本发明构思的其他实施方案是可能的且不脱离本发明范围的。本发明由要求保护的要素和落入基础性原理的真实精神及范围内的任何及全部修改、变型或等同物限定。实施例和附1优选方法的概述图2血清学等同物结构图3和4找到血清学等同物图5主检索向量结构图6分子至血清学转换图7转换不同的分辨率图8过滤和分组图9对结果进行分选所述方法或系统比较患者的HLA数据并且找到匹配这些数据的CBU。根据患者HLA数据与每个CBU中的数据怎样密切地匹配，将匹配排序。为进行这一点(见

图1)，该方法首先确定患者HLA数据的检索向量。检索向量含有与患者HLA值的全部可能匹配，连同确定匹配的CBU位于结果列表中的位置的排序。为确定检索向量中的要素，使用众多映射表· SER-SER-将血清学类型映射至等同的血清学类型。· DNA-SER-将分子类型映射至等同的血清学类型。·等位基因代码表(ALLELE-CODE-LIST)解析中等分辨率分子类型中所用的代码。
在SER-SER中，映射至C、DRB1和DQBl的血清学位点是Cw、DR和DQ。用于匹配的优选前提是分子患者和CBU值已经转换成新命名(2010)。使用N0MENCLATUR_2009[sic]表进行这种映射。使用该检索向量，所述方法检查每个CBU单元以确定它是否含有患者检索向量值之一。如果含有，该方法返回匹配的CBU连同检索向量中事先确定的排序。随后对匹配的CBU ·按照使用者定义的一组标准进行过滤。 按照使用者定义的一组分组标准进行分组。一般而言，将根据已经做了多少次匹配进行分组。将匹配分类为实际匹配或潜在匹配。当患者和CBU均已经进行分子分型并且分子代码匹配时，为实际匹配。当患者和CBU值均不是(分子或血清学)高分辨率并且匹配或转换成另一个分辨率产生匹配时，存在潜在匹配。·在每个组内部根据匹配的总体排序以及使用者确定的其他因素(如TNC)排序最后，由优选的方法或系统返回和显示匹配CBU的过滤、分组和排序列表。患者和CBU含有由这种方法考虑的每个HLA基因座位的几个值。然而,所述方法或系统优选地考虑以下HLA-基因座位A、B和DRBl。每个值由代码代表。取决于HLA基因座位是否已经进行分子或血清学分型并且还取决于分型的“分辨率”，使用不同 的代码结构。下表中显示这些代码。表1:
权利要求
1.用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的方法，所述方法包括 a.输入脐带血单元的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码， b.输入受体的HLA基因座位、等位基因型及其他标准的血清学代码和/或分子代码， c.将根据a.和b.的输入转换成标准化命名， d.生成检索向量，其含有与受体的HLA基因座位和等位基因型的血清学命名和/或分子命名匹配的全部可能的值，其中将可能的值赋值为确定单元在结果列表中出现的位置的排序，其中所述排序取决于可能的单兀的HLA基因座位及等位基因型和受:体的HLA基因座位及等位基因型之间的匹配， e.将检索向量的HLA基因座位和等位基因型与根据a的输入进行比较， f.生成列表，所述列表包含对于受体可能的脐带血单元连同检索向量中事先确定的排序， g.基于脐带血单元和/或受体的参数，按照一组定义的标准对所述列表进行过滤， h.按照匹配等级对可能的单元进行分组，以及1.至少按照匹配等级对所述单元进行分选。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因座位选自包含HLA-A、-B、-C、-DR、-DP和-DQ的组。
3.根据权利要求1或2的方法，其中所述标准包含关于脐带血供体、脐带血单元和受体的数据，所述数据选自包含种族、认证、血型、猕因子、疾病、遗传缺陷、脐带血单元年龄、脐带血体积的组。
4.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述分子代码以标准化命名归类，所述标准化命名包括 a.高分辨率，其中直接指定等位基因， b.中等分辨率，其中给出可能的值的范围，和 c.低分辨率，其中仅指定HLA基因座位和等位基因型。
5.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述血清学代码以标准化命名归类，所述标准化命名包括 a.抗原， b.宽特异性抗原， c.表面抗原，和 d.相关抗原。
6.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述分子代码可以由所述血清学代码补偿，反之亦然。
7.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述方法可以为异体移植鉴定脐带血单元。
8.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中可以将鉴定的脐带血单元组合成多重脐带血移植物。
9.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述脐带血单元以下述参数为特征 UCB储藏库(UCB库)的名称和标识， 就国际认证、优选地FACT而言，UCB储藏库的状态， 按照分类UCB库的处理可靠性， 各自库的联系，包括联系方式， 制备物的标识号， 依照产科诊所病历表的母亲、孩子和家庭的病史， 母亲、父亲和/或孩子的种族， 孩子的性别， 最初储藏制备物的日期， 处理制备物的细节， 制备物的血型， 制备物的HLA型 制备物的细胞计数(TNC) 制备物的细胞计数(⑶34+) 制备物的病毒状态， 制备物的等位基因特征，和/或 分子诊断和分析的参数， 存储在存储介质和/或处理单元上的所述数据集。
10.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其中所述受体以下述参数为特征 门诊部或移植中心的名称和标识， 协调员和主治医师的姓名，包括联系方式， 就国际认证(例如FACT)而言，门诊部的状态， 过去3年期间在查询门诊中UCB移植的平均数目， 患者的姓名、保险号和其他会计信息， 患者的病史， 适应症和主治医师的治疗建议， 按照定义的分类的紧急性， 患者的HLA型， 患者的血型， 患者的重量， 患者的种族， 患者的性别， 患者的年龄， 已知的患者等位基因特征和/或DNA分型数据，和/或 首次治疗或再治疗， 存储在存储介质和/或处理单元上的所述分类和/或排除标准。
11.用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的系统，所述系统包括 a.在计算机中输入脐带血单元的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码，并将其存储在存储介质上，b.在计算机中输入受体的HLA基因座位、等位基因型和其他标准的血清学代码和/或分子代码，并将其存储在存储介质上， c.将根据a.和b.的输入转换成标准化命名， d.生成检索向量，其含有与受体的HLA基因座位和等位基因型的血清学命名和/或分子命名匹配的全部可能的值，其中将可能的值赋值为确定单元在结果列表中出现的位置的排序，其中所述排序取决于可能的单兀的的HLA基因座位及等位基因型与受:体的HLA基因座位和等位基因型之间的匹配，特别地，将所述检索标准存储于存储介质和/或处理单元上， e.将检索向量的HLA基因座位和等位基因型与a进行比较， f.生成列表，所述列表包含对于受体可能的脐带血单元连同检索向量中事先确定的排序。
g.按照一组定义的标准对所述列表进行过滤， h.按照匹配等级对可能的单元进行分组，以及1.至少根据匹配等级对所述单元进行分选。
12.根据权利要求11所述的系统在为需要这种移植的患者鉴定至少一个匹配的脐带血单元中的应用。
全文摘要
本发明描述了用于鉴定和选择至少一个用于移植的脐带血单元的方法。
文档编号G06F19/24GK103003820SQ201180035323
公开日2013年3月27日 申请日期2011年5月20日 优先权日2010年5月20日
发明者托马斯·克莱因 申请人:赛特龙股份公司