技术总结
一种基于距离约束选择策略的群体构象空间优化方法，包括以下步骤：在差分进化算法框架下，采用Rosetta Score3粗粒度知识能量模型来有效降低构象空间搜索维数、提高算法的收敛速度；引入基于知识的片段组装技术可以有效提高预测精度；利用距离谱在蛋白质结构上的特性约束，使更多结构上相似的蛋白质构象进入种群，减少能量函数不精确带来的误差，以得到更为优良的局部构象；结合差分进化算法较强的全局搜索能力，可以对构象空间进行更为有效的采样，从而得到和天然态结构相似度较高的构象。本发明采用Rosetta Score3粗粒度知识能量模型来有效降低构象空间搜索维数、提高算法的收敛速度，提高预测精度。
技术研发人员：张贵军;俞旭锋;周晓根;郝小虎;徐东伟;李章维
受保护的技术使用者：浙江工业大学
技术研发日：2015.09.22
技术公布日：2018.09.18