一种生物样本管理方法、系统及设备与流程

本发明属于生物技术领域，更具体地，涉及一种生物样本管理方法、系统及设备。

背景技术：

生物样本由于采集量大、实验操作繁多，实验周期长、保存条件不一等问题，管理难度很大。目前虽然由多种生物样本管理方法、系统的出现，大部分是将生物样本的管理记录实现自动化，仍然无法和实验记录、实验员权限管理结合起来，造成管理成本高、实验结果无法追溯、操作随意等问题。

技术实现要素：

针对现有技术的以上缺陷或改进需求，本发明提供了一种生物样本管理方法、系统及设备，其目的在于通过对生物样本进行信息化管理即权限设置，由此解决生物样本量大、信息繁杂、管理成本高的技术问题。

为实现上述目的，按照本发明的一个方面，提供了一种生物样本管理方法，包括以下步骤：

(1)新建样本，将存储在相应位置的生物样本与编码标签一一对应，并记录样本的初始化信息，进行入库操作；

(2)使用样本：按照任务及该任务权限生成调用样本列表，根据所述列表中样本进行出库操作及入库操作，并结束任务；

(3)销毁样本：获取具有销毁该样本权限的销毁任务，对该样本进行出库操作，并对该位置生成新的编码标签。

优选地，所述生物样本管理方法，其步骤(1)所述将存储在相应位置的生物样本与样本编码标签一一对应具体为：

根据样本存储位置进行编码，生成样本编码标签，优选可采用条形码或者二维码标签，粘贴在生物样本容器外部，作为所述生物样本的唯一标识。

优选地，所述生物样本管理方法，其步骤(1)所述记录样本的初始化信息具体为：

对于某一样本，将该样本的初始化信息与样本编号一起作为记录保存在样本数据库中，包括位置信息、权限信息、采集信息。

优选地，所述生物样本管理方法，其步骤(2)所述按照任务及该任务的权限生成调用样本列表具体为：根据实验类型，生成一个或多个任务，并对每个任务进行授权，使得该任务拥有调用样本的权限。

优选地，所述生物样本管理方法，其所述出库操作具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置的样本处于出库状态，进行出库记录并取出样本。所述出库记录记录的信息为出库信息，优选包括出库时间、样本量等信息。

优选地，所述生物样本管理方法，其所述出库操作具体为：

按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置处于入库状态，进行入库记录并存储样本。所述入库记录记录的信息为入库信息，优选包括入库时间、样本量等信息。

按照本发明的另一个方面，提供了一种生物样本管理系统，包括

实验管理模块，用于根据不同的实验类型生成相应的任务；

任务管理模块，用于根据实验管理模块生成的任务，生成所述任务的调用样本列表并进行任务记录；

出库模块，用于根据任务管理模块生成的调用样本列表对相应样本进行相应出库操作；

入库模块，用于根据任务管理模块生成的调用样本列表对相应样本进行相应入库操作。

按照本发明的另一个方面，提供了一种生物样本管理设备，其特征在于，包括标签信息读取装置、样本存储器，以及上位机，所述标签信息读取装置与所述上位机电连接，所述样本存储器与所述上位机电连接。

所述样本存储器，包括多个与标签一一对应的样本存储装置，所述存储装置，用于根据上位机所指示的状态开启或关闭，使得相应样本处于出库或入库状态；

所述标签信息读取装置，为条码或二维码扫描装置，样本出库或入库时对样本容器表面的标签码进行读取，从而采集样本出库信息和/或入库信息；

所述上位机，用于按照实验生成的任务记录所述标签信息读取装置采集的样本出库信息以及入库信息；并根据任务使得样本存储器相应位置的存储装置的处于出库或入库状态。

9、如权利要求8所述的样本管理设备，其特征在于，所述上位机中保存有实验数据库、任务数据库以及样本数据库。

总体而言，通过本发明所构思的以上技术方案与现有技术相比，由于针对实验室的操作流程及权限设计生物样本管理方法、系统及设备，能够取得下列有益效果：

1、可以查找单个，或者批量查找某一特点的样本，包括原始样本，DNA样本或RNA样本；

2、可以实时跟踪任务状态，包括任务是否完成，完成进度，是否包含失败样本，失败样本重做等信息；

3、可以跟踪具体样本状态，剩余量，使用量，保存期限，是否正在进行实验等信息；

4、可以通过权限管理，避免操作随意性，样本使用更加安全，实验过程可追溯，权责明确。

附图说明

图1是本发明提供的生物样本管理方法流程示意图；

图2是本发明提供的生物样本管理系统结构示意图；

图3是本发明提供的生物样本管理设备结构示意图。

具体实施方式

为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合附图及实施例，对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。此外，下面所描述的本发明各个实施方式中所涉及到的技术特征只要彼此之间未构成冲突就可以相互组合。

本发明提供的生物样本管理方法，如图1所示，包括以下步骤：

(1)新建样本，将存储在相应位置的生物样本与编码标签一一对应，并记录样本的初始化信息，进行入库操作；

(1-1)所述将存储在相应位置的生物样本与样本编码标签一一对应具体为：

根据样本存储位置进行编码，生成样本编码标签，优选可采用条形码或者二维码标签，粘贴在生物样本容器外部，作为所述生物样本的唯一标识。

所述编码规则，例如将冰箱编号、置物篮编号、样本板编号、以及样本类型作数位组合形成编号，将所述编号表示为编码形成编码标签，所述编码优选为条形码或者二维码。所述样本类型包括：原始样本、DNA样本、RNA样本、以及其他样本。

(1-2)所述记录样本的初始化信息具体为：

对于某一样本，将该样本的初始化信息与样本编号一起作为记录保存在样本数据库中，包括位置信息、权限信息、采集信息。

所述位置信息，为该样本的存储位置，包括冰箱编号、置物篮编号、样本板编号。

所述权限信息包括权限级别和/或授权用户。所述权限级别可采用数字等级，所述数字等级，即任务等级大于或等于样本等级才能调用所述样本，否则调用所述样本；所述用户私有权限，即用户生成的任务仅能调用其为授权用户的样本。结合以上两种权限，例如，用户数字等级等于样本等级为授权用户时，才能调用样本；当用户数字等级超过样本等级时即能调用样本。

所述采集信息包括样本来源、采集方式、采集量、有效期等采集样本时的实验信息。

(1-3)进行入库操作。

(2)使用样本：按照任务及该任务权限生成调用样本列表，根据所述列表中样本进行出库操作及入库操作，并结束任务。

(2-1)所述按照任务及该任务的权限生成调用样本列表具体为：根据实验类型，生成一个或多个任务，并对每个任务进行授权，使得该任务拥有调用样本的权限。

例如提取实验，生成两个任务，对原始样本进行操作任务，以及新建样本任务。授予对原始样本进行操作的任务对原始样本的调用权限，新建样本的任务同步骤(1)。

(2-2)进行出库操作，并记录实验结果为操作记录；

(2-3)进行入库操作。

(3)销毁样本：获取具有销毁该样本权限的销毁任务，对该样本进行出库操作，并对该位置生成新的编码标签。

所述出库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置的样本处于出库状态，进行出库记录并取出样本。所述出库记录记录的信息为出库信息，优选包括出库时间、样本量等信息。

所述入库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置处于入库状态，进行入库记录并存储样本。所述入库记录记录的信息为入库信息，优选包括入库时间、样本量等信息。

本发明提供的生物样本管理系统，如图2所示，包括：

实验管理模块，根据不同的实验类型生成相应的任务。例如采集实验，则生成新建样本任务；提取实验则生成使用样本及新建样本任务；鉴定实验则生成使用样本任务；实验结束则生成销毁样本任务。

任务管理模块，用于根据实验管理模块生成的任务，生成所述任务的调用样本列表并进行任务记录，所述调用样品列表包括调用样品及该样本分配的出库操作及入库操作。

出库模块，用于根据任务管理模块生成的任务的调用样本列表对相应样本进行相应出库操作；所述出库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置的样本处于出库状态，进行出库记录并取出样本。所述出库记录记录的信息为出库信息，优选包括出库时间、样本量等信息。

入库模块，用于根据任务管理模块生成的任务的调用样本列表对相应样本进行相应入库操作；所述入库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置处于入库状态，进行入库记录并存储样本。所述入库记录记录的信息为入库信息，优选包括入库时间、样本量等信息。

本发明提供的生物样本管理设备，如图3所示，包括：标签信息读取装置、样本存储器，以及上位机，所述标签信息读取装置与所述上位机电连接，所述样本存储器与所述上位机电连接。

所述样本存储器，包括多个与标签一一对应的样本存储装置，所述存储装置，用于根据上位机所指示的状态开启或关闭，使得相应样本处于出库或入库状态；

所述标签信息读取装置，为条码或二维码扫描装置，样本出库或入库时对样本容器表面的标签码进行读取，从而采集样本出库信息和/或入库信息；

所述上位机，用于按照实验生成的任务记录所述标签信息读取装置采集的样本出库信息以及入库信息；并根据任务使得样本存储器相应位置的存储装置的处于出库或入库状态。

以下为实施例：

实施例1

一种生物样本管理系统，包括：

实验管理模块，根据不同的实验类型生成相应的任务。例如采集实验，则生成新建样本任务；提取实验则生成使用样本及新建样本任务；鉴定实验则生成使用样本任务；实验结束则生成销毁样本任务。

同时实验管理模块采用权限级别和用户权限管理实验任务，所述权限级别包括三级：超级管理员为3级，项目管理员为2级，实验员为1级，用户权限为相应用户。具体而言，实验员能进行新建样本任务，并能对自己具有用户权限的样本建立样本使用任务，项目管理员可对本项目所有样本建立样本使用任务；超级管理员能新建样本任务，对所有样本进行样本使用任务，并建立销毁样本任务。

任务管理模块，用于根据实验管理模块生成的任务，生成所述任务的调用样本列表并进行，对列表中的样本分配出库操作及入库操作。

出库模块，用于根据任务管理模块生成的任务对相应样本进行相应出库操作；所述出库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置的样本处于出库状态，进行出库记录并取出样本。所述出库记录记录的信息为出库信息，优选包括出库时间、样本量等信息。

入库模块，用于根据任务管理模块生成的任务对相应样本进行相应入库操作；所述入库操作，具体为：按照所述样本的编码查找所述样本的位置信息，使得相应位置处于入库状态，进行入库记录并存储样本。所述入库记录记录的信息为入库信息，优选包括入库时间、样本量等信息。

实施例2

一种生物样管理方法，具体为对人口腔唾液样本的管理方法，包括以下步骤：

(1)新建样本，将存储在相应位置的生物样本与编码标签一一对应，并记录样本的初始化信息；此过程自动生成样本板，并和实际样本板对应，同时生成的还包括样本板具体保存位置。

(1-1)将一次性采集的2000份与2000份编码标签一一对应，具体操作如下：将2000份条码标签，粘贴在唾液样本的取样管外部；

所述标签按照如下规则编码：所述标签第一位为类别标记，第二至第四位为样本板编号，第五位为置物篮编号，第六位为冰箱编号。类别标记包括原始样本记作A、DNA样本记作B、RNA样本记作C、以及其他样本记作D。

由于2000份样本皆为原始样本，两个冰箱才能存储下，因此编号为A000？1至A999？、1至A000？2至A999？2；其中“？”表示相应置物篮编号。

(1-2)所述记录样本的初始化信息具体为：

对于每一份样本，将该样本的初始化信息与样本编号一起作为记录保存在样本数据库中，包括位置信息、权限信息、采集信息。

所述位置信息为，该样本的冰箱编号、植物篮编号、样本板编号。所述权限信息，权限级别为1，用户权限为实验主管分配的相应实验员。实验主管的权限级别为2，实验员的权限级别为1，当权限级别相同时，即实验员操作时，只有拥有该样本用户权限的实验员，能操作样本；当权限级别高于样本的权限级别时，能使用该样本。

本实施例实验主管将选定的样本的用户权限设置为相应实验员，从而实现样本分配。

实验员获得任务后，按照样本清单进行采集，并记录采集信息。所述采集信息包括样本来源、采集方式、采集量、有效期等采集样本时的实验信息。

(1-3)进行入库操作：实验员将样本进行扫码，根据扫码获得的位置信息，将样本存储在相应编号的样本板上。

(2)使用样本：按照任务及该任务权限生成调用样本列表，根据所述列表中样本进行出库操作及入库操作，并结束任务。

(2-1)所述按照任务及该任务的权限生成调用样本列表具体为：根据实验类型，生成一个或多个任务，并对每个任务进行授权，使得该任务拥有调用样本的权限。

本实施例以唾液样本DNA提取实验为例，提取实验实验员收到提取实验任务后，相应样本被赋予实验员的用户权限。实验主管生成5个任务，将其分配给五个实验员，每人执行96个样本的DNA提取，提取完成后将实验结果上传，实验主管可以跟踪整个项目进展，以及样本提取成功率，并根据样本成功与否决定是否重做实验。

实验员生成两个任务，DNA样本提取任务和提取后的样本新建样本任务。

提取任务具体为：

(2-2)进行出库操作，并记录实验结果为操作记录；

实验员根据自己的任务，获得调用的样本清单，相应样本板上的锁定开启，取出样本并进行扫码记录，记录出库时间、样本量。

进行DNA提取实验，并将实验结果上传。

(2-3)进行入库操作。

实验员对样本进行扫码，相应样本板处于可存放样本状态，放置样本，并记录入库信息，包括入库时间和样本量。

新建样本任务如步骤(1)，仅样本编号中样本类别标记为B。

将实验结果发送给实验主管。实验主管确认实验完毕后，请求超级主管进行样本销毁。

(3)销毁样本：获取具有销毁该样本权限的销毁任务，对该样本进行出库操作，并对该位置生成新的编码标签。

本实施例，在样本过期、样本异常或者样本使用完毕后，超级管理员可进行样本销毁处理，对样本进行出库操作，将样本取出，记录销毁理由、销毁时间后，对该位置生成新的编码标签。

实施例3

一种生物样本管理设备，即水稻样本管理管理设备，包括

标签信息读取装置、样本存储器，以及上位机，所述标签信息读取装置与所述上位机电连接，所述样本存储器与所述上位机电连接。

所述样本存储器，包括多个与标签一一对应的样本存储装置，所述存储装置，用于根据上位机所指示的状态开启或关闭，使得相应样本处于出库或入库状态；

所述标签信息读取装置，为条码或二维码扫描装置，样本出库或入库时对样本容器表面的标签码进行读取，从而采集样本出库信息和/或入库信息；

所述上位机，用于记录所述标签信息读取装置采集的样本出库信息以及入库信息；并根据任务使得样本存储器相应位置的存储装置的处于出库或入库状态。

所述上位机中保存有实验数据库、任务数据库以及样本数据库；

所述实验数据库由项目管理员根据实验生成的任务的执行结果，录入实验数据库，对于每条试验记录其时间、项目管理员、生成的相关任务、实验结果信息；

所述任务数据库，用于记录每个任务对应的实验、任务执行人、任务使用的样本、执行结果；

所述样本数据库，用于记录每个样本的初始信息、出库信息、入库信息以及销毁信息。

所述实验数据库、任务数据库以及样本数据库可用于查询，例如实验室主管想了解去年五月份采集的水稻样本，原始样本的剩余量，存放位置，以及是否适合继续试验。根据实验室样本管理系统，通过时间信息查找到五月份录入的水稻样本，根据类型区分，筛选出原始样本，并根据原始样本的剩余情况选择具体试验样本，并进行试验。

本领域的技术人员容易理解，以上所述仅为本发明的较佳实施例而已，并不用以限制本发明，凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。