胰腺癌相关癌基因突变信息收集分析系统及分析方法

文档序号:9489644阅读:397来源:国知局
胰腺癌相关癌基因突变信息收集分析系统及分析方法
【技术领域】
[0001]本发明属于生物医学领域,涉及一种胰腺癌相关癌基因突变信息收集分析系统及分析方法。
【背景技术】
[0002]胰腺癌为消化道常见肿瘤,早期诊断困难且预后极差,其侵袭性强,恶性度高,手术切除率低,五年生存率极低。其起病隐匿,缺乏典型临床症状,,成为目前国内外肿瘤专家的研究热点,胰腺癌的早期诊断和早期治疗是提高和改善胰腺癌预后的关键。
[0003]胰腺癌是一种基因变异性疾病,目前研究证明许多基因的突变与胰腺癌的发生发展有关,如KRAS、SMAD4、CDKN2A、TP53、ZIP4、PDX-1基因等,但是单独的基因诊断或者少量的基因组合的诊断往往准确略不高,目前仍缺乏一种行之有效的胰腺癌诊断或预测方法。

【发明内容】

[0004]为了弥补现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种胰腺癌相关癌基因突变的信息收集分析系统及分析方法,所述的信息收集系统整合了目前报道的胰腺癌相关癌基因的突变信息,能预测患者患胰腺癌的风险,为医生提供诊断参考,从而实现早发现早治疗,提高患者的生存率。
[0005]为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
[0006]本发明提供了一种胰腺癌相关癌基因突变的信息收集分析系统,所述的信息收集分析系统包括:信息收集模块1、用户模块2、数据库模块3、基因风险分析模块4和报告输出模块5。
[0007]所述的信息收集模块1包括数据库端口子模块11、数据检索子模块12、数据分析子模块13、数据传输子模块14、数据更新子模块15。
[0008]所述的用户模块2为用户所使用的界面,该界面实现用户与系统的交互,并接受来自报告输出模块的结果。
[0009]所述的数据库模块3包括标准数据库模块31和待检测数据库模块32。标准数据库模块31用来存储已经确诊的胰腺癌的基因突变数据及来自各数据库的胰腺癌的基因突变数据;待检测数据库子模块32用来存储未确诊患者的基因检验数据;
[0010]所述的基因风险分析模块4包括诊断规则模块41、患病概率模块42和报告生成子模块43。
[0011]所述的报告输出模块5是用来存储来自基因风险分析模块4的数据并输出到用户丰旲块2。
[0012]进一步,所述的数据库端口子模块11与各数据库相连,所述的数据库包括英文数据库和中文数据库。所述的英文数据库包括NCB1、nature、science等,所述的中文数据库包括万方、知网等。
[0013]进一步,所述的数据更新子模块15与数据检索子模块12相连,用于发出指令,开启新一轮的信息收集任务。
[0014]进一步,所述的报告输出模块5包括健康综合评估报告单元51和医学建议报告单元52,用于存储患者的健康综合评估报告和医学建议报告。
[0015]本发明提供了一种上述的信息收集分析系统收集分析胰腺癌相关癌基因突变的方法,所述的方法包括以下步骤:
[0016]1)所述信息收集模块1收集信息,包括已经确诊的胰腺癌的基因突变数据及来自各数据库的胰腺癌的基因突变数据;
[0017]2)所述用户模块2收集用户相关信息,并上传到所述信息收集模块1 ;
[0018]3)将所述信息收集模块1中的数据上传到所述数据库模块3的相应的标准数据库子模块31或待检测数据库子模块32 ;
[0019]4)所述基因风险分析模块4调取所述数据库模块3中的数据,并对待检测数据进行胰腺癌风险评估;
[0020]5)将风险评估结果输出到所述报告输出模块5 ;
[0021]6)将所述报告输出模块5中的报告反馈给用户,使用户知道患者患胰腺癌的概率,从而有所警觉,实现胰腺癌的早期治疗。
[0022]上述步骤1)信息的收集包括以下步骤:
[0023]1)所述数据库端口子模块11连接各数据库;
[0024]2)所述数据检索子模块12中设定关键词,自动检索各数据库的相关信息;
[0025]3)所述数据分析子模块13对步骤2)中的信息进一步提取,去除冗余的信息,将所需信息进行格式的统一;
[0026]4)所述数据传输子模块14连接所述数据库模块3,将来自步骤3)的信息上传到所述数据库模块3 ;
[0027]5)所述数据更新子模块15定期发出指令,重复步骤1) -4),以更新数据。
[0028]所述的用户相关信息上传到所述数据检索子模块12,然后进行数据分析及传输上传到所述数据库模块3。如果相关信息来自已经确诊的胰腺癌患者则上传到所述标准数据库子模块31,如果相关信息来自未诊断的患者则上传到所述待检测数据库子模块32。
[0029]上述的基因风险分析模块4基因进行胰腺癌风险评估的具体步骤如下:
[0030]1)所述诊断规则子模块41调取所述数据库模块3中的标准数据库子模块31中的数据进行分析,生成胰腺癌的诊断规则,作为诊断患者患胰腺癌风险的标准;
[0031]2)所述患病概率子模块42调取所述数据库模块3中的待检测数据库子模块32中的数据,以所述诊断规则子模块41生成的诊断规则为标准分析患者患胰腺癌的概率;
[0032]3)所述报告生成子模块43接受经所述患病概率子模块42分析的数据,生成健康综合评估报告和/或医学建议报告。
[0033]本发明的优点和有益效果:
[0034]本发明中的胰腺癌相关癌基因突变信息的收集分析系统能自动更新数据库,使得数据库信息更全面,进而使得基因风险分析模块的诊断规则更为优化,从而提高胰腺癌风险评估的准确率。
[0035]本发明中的胰腺癌相关癌基因突变信息的收集分析系统综合了已经报道的与胰腺癌有关的基因突变的信息,能够对患者的检查数据进行更全面的分析,提高诊断率。从而能实现胰腺癌的早期发现,进而进行早期治疗,提高患者的生存率。
【附图说明】
[0036]图1显示了胰腺癌相关癌基因突变信息的收集分析系统;
[0037]图2显示了信息收集模块的结构图;
[0038]具体的实施方式
[0039]下面结合附图和实施例对本发明作进一步详细的说明,以下实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。
[0040]实施例1 一种胰腺癌相关癌基因突变的信息收集分析系统
[0041]—种胰腺癌相关癌基因突变的信息收集分析系统,包括:信息收集模块1、用户模块2、数据库模块3、基因风险分析模块4和报告输出模块5。
[0042]信息收集模块1包括数据库端口子模块11、数据检索子模块12、数据分析子模块13、数据传输子模块14、数据更新子模块15。数据库模块3包括标准数据库模块31和待检测数据库模块32。数据库端口子模块11与各数据库相连,所述的数据库包括英文数据库和中文数据库。其中,英文数据库包括NCB1、nature、science等,中文数据库包括万方、知网等。数据检索模块12通过设定关键词,自动检索各数据库的相关信息,数据分析模块13分析来自数据检索模块12的数据,对数据进一步提取,去除冗余的数据,统一所需要的数据的格式,然后经数据传输模块14上传到数据库模块3的标准数据库模块31。数据更新模块15会定期发出指令,启动数据检索、分析的任务,以更新数据库。
[0043]数据检索模块12还可以接受来自用户模块2的数据,通过设定的关键词,检索相关信息并上传到数据分析模块13进行进一步的分析加工,生成统一格式的数据经数据传输模块1
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