用于卵巢癌和其他癌症免疫治疗的新型肽和肽组合物的制作方法

本发明涉及用于免疫治疗方法的肽、蛋白质、核酸和细胞。特别是，本发明涉及癌症的免疫疗法。本发明还涉及单独使用或与其他肿瘤相关肽(刺激抗肿瘤免疫反应或体外刺激t细胞并转入患者的疫苗复合物的活性药物成分)联合使用的肿瘤相关t细胞(ctl)肽表位。与主要组织兼容性复合体(mhc)分子结合的肽或与此同类的肽也可以是抗体、可溶性t细胞受体和其他结合分子的靶标。本发明涉及数种新型肽序列及其变体，它们源自人肿瘤细胞的hla-i类和ii类分子，可用于引发抗肿瘤免疫反应的疫苗组合物中或作为开发药物/免疫活性化合物和细胞的目标。
背景技术：
：卵巢癌卵巢癌2012年的新发病例估计为239000例，是女性第七大最常见的癌症，占女性所有癌症的4％。相对于其他的女性生殖器官癌症，卵巢癌的死亡率往往较高，病死率在资源少的环境下更高。因此，卵巢癌是女性癌症死亡的第八大最常见的原因，有152000人死亡。2012年，所有新发病例中近55％发生在人类发展水准高或非常高的国家；37％的新发病例和39％的死亡病例发生在欧洲和北美。北欧、东欧、北美和澳洲发病率最高，非洲和亚洲大部分地区相对较低。发病率在人类发展水准很高的某些国家一直呈下降趋势，特别是欧洲和北美。最常见的卵巢癌症是卵巢癌，这也是致命性最强的妇科恶性肿瘤。基于组织病理学和分子遗传学，卵巢癌被分成五个主要类型：高级别浆液性癌(70％)、子宫内膜癌(10％)、透明细胞癌(10％)、黏液癌(3％)和低级别浆液性癌(<5％)，共占卵巢癌病例的95％以上。很少见的是恶性生殖细胞瘤(无性细胞瘤、卵黄囊瘤和未成熟畸胎瘤)(占卵巢癌的3％)和潜在恶性性索间质肿瘤(1-2％)(最常见的是颗粒细胞瘤)。卵巢癌最通常影响未生育过的女性，在排卵受怀孕或口服避孕药抑制的女性中发生频率最低。这些肿瘤一般被认为起源于覆盖卵巢表面或盆腔腹膜的细胞。这种间皮细胞的恶性转化已被“不间断排卵”理论解释(la,2001)。10％的病例有卵巢癌家族史；当两个或更多个一级亲属患有卵巢癌时，风险增加3倍。brca1或brca2种系突变的女性在70岁前罹患卵巢癌(主要是高级别浆液性癌)的风险为30-70％(rischetal.,2006)。手术切除是早期和晚期卵巢癌的主要治疗方法。最终目标是完全切除周围健康组织中的肿瘤块。手术切除之后使用铂类似物进行全身化疗，但无手术后化疗适应症的非常低等级的卵巢癌(ia期、1级)除外。对于晚期卵巢癌，一线化学疗法包括卡铂与紫杉醇联合使用，可使用贝伐单抗作为补充。对于铂类耐药的卵巢癌的标准治疗方法包括使用以下其中一种化疗药物的单一治疗：聚乙二醇化脂质体阿霉素、托泊替康、吉西他滨或紫杉醇(s3-leitliniemaligneovarialtumore,2013)。免疫疗法似乎是改善卵巢癌患者治疗的一种有前景的策略，因为存在促炎性肿瘤浸润淋巴细胞，尤其是cd8阳性t细胞与良好的预后相关，肿瘤相关肽特异性t细胞可从癌组织中分离。因此，大量的科学工作投入到卵巢癌不同免疫疗法的研究中。已经进行了相当多的临床前研究和临床研究，进一步的研究目前正在进行中。对于细胞因子疗法、接种疫苗、单克隆抗体治疗、细胞过继转移和免疫调节，目前已有临床资料。使用白介素-2、干扰素-α、干扰素-γ或粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子的细胞因子治疗目的在于增强患者自身的抗肿瘤免疫反应，这些治疗已经在小型研究组中显示出有前景的结果。使用来自几种肿瘤相关蛋白(her2/neu、ny-eso-1、p53、wilms肿瘤-1)的单个或多个肽或来自自体肿瘤细胞的全肿瘤抗原的i期和ii期疫苗接种研究显示了良好的安全性和耐受性特性，但临床效果仅为低至中等。特异性识别肿瘤相关蛋白的单克隆抗体被视为可增强对肿瘤细胞的免疫细胞介导的杀伤力。抗ca-125抗体oregovomab和abagovomab以及抗epcam抗体ca-tumaxomab在ii期和iii期研究中取得了有前景的结果。与此相反，抗muc1抗体hmfg1在iii期研究中未能明确地提高生存期。另一种方法使用单克隆抗体来靶向和阻止肿瘤细胞上的生长因子和存活受体。虽然施用曲妥单抗(抗her2/neu抗体)和mov18与morab-003(抗叶酸受体α抗体)仅对卵巢癌具有有限的临床益处，但是在标准化疗中加入贝伐单抗(抗vegf抗体)对晚期卵巢癌似乎是有利的。免疫细胞的过继转移实现了临床试验中的异质结果。自体、体外扩增的肿瘤浸润性t细胞的过继转移在中试试验中被证明是一种有希望的方法。相反，转移含有叶酸受体α特异性嵌合抗原受体的t细胞在i期试验中没有诱导显著的临床反应。用肿瘤细胞裂解物或肿瘤相关蛋白体外刺激的树突细胞显示可在转移后增强抗肿瘤t细胞反应，但t细胞活化的程度与临床效果无关。在ii期研究中，自然杀伤细胞的转移造成明显的毒性。内在抗肿瘤免疫性以及免疫治疗受免疫抑制肿瘤微环境影响。为了克服这个障碍，免疫调节药物(如环磷酰胺、抗cd25抗体和聚乙二醇化脂质体阿霉素)与免疫疗法组合进行了测试。增强t细胞活性的易普利姆玛(ipilimumab)、抗ctla4抗体目前有最可靠的资料。易普利姆玛被证明可在卵巢癌患者中产生显著的抗肿瘤效果(mantia-smaldoneetal.,2012)。考虑到治疗癌症相关的严重副作用和费用，通常有必要确定可用于治疗癌症的因子，尤其是卵巢癌。通常也有必要确定代表癌症生物标志物的因子，尤其是卵巢癌，从而更好地诊断癌症、评估预后和预测治疗成功性。癌症免疫治疗代表了癌症细胞特异性靶向作用的一个选项，同时最大限度地减少副作用。癌症免疫疗法利用存在的肿瘤相关抗原。肿瘤相关抗原(taa)的目前分类主要包括以下几组：a)癌-睾丸抗原：t细胞能够识别的最先确认的taa属于这一类抗原，由于其成员表达于组织学相异的人肿瘤中、正常组织中、仅在睾丸的精母细胞/精原细胞中、偶尔在胎盘中，因此，它最初被称为癌-睾丸(ct)抗原。由于睾丸细胞不表达hlai类和ii类分子，所以，在正常组织中，这些抗原不能被t细胞识别，因此在免疫学上可考虑为具有肿瘤特异性。ct抗原大家熟知的例子是mage家族成员和ny-eso-1。b)分化抗原：肿瘤和正常组织(肿瘤源自该组织)都含有taa。大多数已知的分化抗原发现于黑色素瘤和正常黑色素细胞中。许多此类黑色素细胞谱系相关蛋白参与黑色素的生物合成，因此这些蛋白不具有肿瘤特异性，但是仍然被广泛用于癌症的免疫治疗。例子包括，但不仅限于，黑色素瘤的酪氨酸酶和melan-a/mart-1或前例腺癌的psa。c)过量表达的taa：在组织学相异的肿瘤中以及许多正常组织中都检测到了基因编码被广泛表达的taa，一般表达水平较低。有可能许多由正常组织加工和潜在提呈的表位低于t细胞识别的阈值水平，而它们在肿瘤细胞中的过量表达能够通过打破先前确立的耐受性而引发抗癌反应。这类taa的典型例子为her-2/neu、生存素、端粒酶或wt1。d)肿瘤特异性抗原：这些独特的taa产生于正常基因(如β-catenin、cdk4等)的突变。这些分子变化中有一些与致瘤性转化和/或进展相关。肿瘤特异性抗原一般可在不对正常组织带来自体免疫反应风险的情况下诱导很强的免疫反应。另一方面，这些taa在多数情况下只与其上确认了有taa的确切肿瘤相关，并且通常在许多个体肿瘤之间并不都共享taa。在含有肿瘤特定(相关)同种型蛋白的情况下，如果肽源自肿瘤(相关)外显子也可能出现肽肿瘤特异性(或相关性)。e)由异常翻译后修饰产生的taa：此类taa可能由肿瘤中既不具有特异性也不过量表达的蛋白产生，但其仍然具有肿瘤相关性(该相关性由主要对肿瘤具有活性的翻译后加工所致)。此类taa产生于变糖基化模式的改变，导致肿瘤产生针对muc1的新型表位或在降解过程中导致诸如蛋白拼接的事件，这可能具有也可能不具有肿瘤特异性。f)肿瘤病毒蛋白：这些tta是病毒蛋白，可在致癌过程中发挥关键作用，并且由于它们是外源蛋白(非人源蛋白)，所以能够激发t细胞反应。这类蛋白的例子有人乳头状瘤16型病毒蛋白、e6和e7，它们在宫颈癌中表达。基于t细胞的免疫治疗靶向作用于主要组织兼容性复合体(mhc)分子提呈的来源于肿瘤相关蛋白或肿瘤特异性蛋白的肽表位。肿瘤特异性t淋巴细胞所识别的抗原，即其表位，可以是源自所有蛋白类型的分子，如酶、受体、转录因子等，它们在相应肿瘤的细胞中被表达，并且与同源未变的细胞相比，其表达通常上调。mhc分子有两类：mhci类和mhcii类。mhci类分子由一条α重链和β-2-微球蛋白，mhcii类分子由一条α和一条β链组成。其三位构造形成一个结合槽，用于与肽进行非共价相互作用。大部分有核细胞上都可发现mhc-i类分子。他们提呈主要为内源性的蛋白、缺陷核糖体产物(drip)和较大肽裂解生成的肽。然而，源自内体结构或外源性来源的肽也经常在mhc-i类分子上发现。这种i-类分子非经典提呈方式在文献中被称为交叉提呈(brossartandbevan,1997；rocketal.,1990)。mhcii类分子主要发现于专业抗原提呈细胞(apc)上，并且主要提呈，例如，在内吞作用过程中由apc占据并且随后被加工的外源性或跨膜蛋白的肽。肽和mhci类的复合体由负载相应t细胞受体(tcr)的cd8阳性t细胞进行识别，而肽和mhcii类分子的复合体由负载相应tcr的cd4阳性辅助t细胞进行识别。因此，tcr、肽和mhc按照1:1:1的化学计量呈现，这一点已是共识。cd4阳性辅助t细胞在诱导和维持cd8阳性细胞毒性t细胞的有效反应中发挥重要作用。肿瘤相关抗原(taa)衍生的cd4阳性t细胞表位的识别对开发能引发抗肿瘤免疫反应的药物产品可能非常重要(gnjaticetal.,2003)。在肿瘤部位，t辅助细胞维持着对细胞毒性t细胞(ctl)友好的细胞因子环境(mortaraetal.,2006)并吸引效应细胞，如ctl、天然杀伤(nk)细胞、巨噬细胞和粒细胞(hwangetal.,2007)。在没有炎症的情况下，mhcii类分子的表达主要局限于免疫系统细胞，尤其是专业抗原提呈细胞(apc)，例如，单核细胞、单核细胞源性细胞、巨噬细胞、树突状细胞。在癌症患者的肿瘤细胞中发现有mhcii类分子的表达(dengjeletal.,2006)。本发明的延长(较长)肽可作为mhc-ii类活性表位。mhc-ii类表位活化的辅助t细胞在编排抗肿瘤免疫的ctl效应子功能中发挥着重要作用。触发th1细胞反应的辅助t细胞表位支援cd8阳性杀伤t细胞的效应子功能，其中包括直接作用于肿瘤细胞的细胞毒性功能(该类肿瘤细胞表面显示有肿瘤相关肽/mhc复合体)。这样，肿瘤相关t辅助细胞表位单独使用或与其他肿瘤相关肽结合使用可作为刺激抗肿瘤免疫反应的疫苗化合物的活性药物成分。哺乳动物(如小鼠)模型显示，即使没有cd8阳性t淋巴细胞，cd4阳性t细胞也能通过分泌干扰素-γ(ifnγ)抑制血管生成而足以抑制肿瘤的表现(beattyandpaterson,2001；mumbergetal.,1999)。没有cd4t细胞作为直接抗肿瘤效应因子的证据(braumulleretal.,2013；tranetal.,2014)。由于hlaii类分子的组成性表达通常仅限于免疫细胞，因此，直接从原发肿瘤中分离ii类肽之前被认为是不可能的事。然而，dengjel等人成功地在肿瘤中直接识别了多个mhcii类表位(wo2007/028574,ep1760088b1)。由于cd8依赖型和cd4依赖型这两种反应共同并协同地促进抗肿瘤作用，因此，确定和表征由cd8+t细胞(配体：mhci类分子+肽表位)或cd4阳性t辅助细胞(配体：mhcii类分子)识别的肿瘤相关抗原对开发肿瘤疫苗非常重要。对于mhci类肽触发(引发)细胞免疫反应的肽，它也必须与mhc分子结合。这一过程依赖于mhc分子的等位基因以及肽氨基酸序列的特异性多态性。mhc-i类-结合肽的长度通常为8-12个氨基酸残基，并且在其与mhc分子相应结合沟槽相互作用的序列中通常包含两个保守残基(“锚”)。这样，每个mhc的等位基因都有“结合基序”，从而确定哪些肽能与结合沟槽特异性结合。在mhc-i类依赖性免疫反应中，肽不仅能与肿瘤细胞表达的某些mhc-i类分子结合，而且它们之后还必须能被t细胞负载的特异性t细胞受体(tcr)识别。对于被t淋巴细胞识别为肿瘤特异性抗原或相关性抗原以及用于治疗的蛋白质，必须具备特殊的条件。该抗原应主要由肿瘤细胞表达，而不由正常健康组织表达，或表达数量相对较少。在一个优选的实施方案中，与正常健康组织相比，所述肽应在肿瘤细胞中过度提呈。更为适宜的情况是，该相应抗原不仅出现于一种肿瘤中，而且浓度(即每个细胞的相应肽拷贝数目)高。肿瘤特异性抗原和肿瘤相关抗原往往是源自直接参与因细胞周期控制或凋亡抑制中的其功能而发生的正常细胞向肿瘤细胞转化的蛋白。另外，这些直接导致转化事件的蛋白的下游靶标可能会被上调，因此可能与肿瘤间接相关。这些间接肿瘤相关抗原也可能是预防接种方法的靶标(singh-jasujaetal.,2004)。至关重要的是，表位存在于抗原氨基酸序列中，以确保这种来自肿瘤相关抗原的肽(“免疫原性肽”)可导致体外或体内t细胞反应。基本上，任何能与mhc分子结合的肽都可能充当一个t细胞表位。诱导体外或体内t细胞反应的前提是存在具有相应tcr的t细胞并且不存在对该特定表位的免疫耐受性。因此，taa是基于t细胞疗法(包括但不限于肿瘤疫苗)研发的起点。识别和表征taa的方法通常基于对患者或健康受试者t细胞的使用情况，或基于肿瘤与正常组织肽之间差别转录特性或差别表达模式的产生。然而，对肿瘤组织或人肿瘤细胞株中过量表达或选择性表达的基因的识别并不提供在免疫疗法中使用这些基因所转录抗原的准确信息。这是因为，有着相应tcr的t细胞必须要存在而且对这个特定表位的免疫耐受性必须不存在或为最低水平，因此，这些抗原的表位只有一部分适合这种应用。因此，在本发明的一非常优选的实施例中，只选择那些针对可发现功能性和/或增殖性t细胞情况的过量提呈或选择性提呈肽，这一点非常重要。这种功能性t细胞被定义为在以特异性抗原刺激后能够克隆地扩展并能够执行效应子功能(“效应子t细胞”)的t细胞。在通过根据本发明的特定tcr(例如可溶性tcr)和抗体或其他结合分子(支架)靶向作用于肽-mhc的情况下，潜在肽的免疫原性是次要的。在这些情况下，提呈是决定因素。技术实现要素：在本发明的第一方面，本发明涉及一种肽或其药用盐，包含选自seqidno:1至seqidno:772的氨基酸序列，或该序列的与seqidno:1至seqidno:772具有至少77％、优选至少88％同源(优选至少77％或至少88％相同)的变体序列，其中变体与mhc结合和/或诱导t细胞与所述肽发生交叉反应，其中所述肽不是基本的全长多肽。本发明进一步涉及本发明的肽，包含选自seqidno:1至seqidno:772的序列、或与seqidno:1至seqidno:772具有至少77％、优选至少88％同源性(优选为至少77％或至少88％相同)的变体，其中所述肽或其变体的总长度为8至100个、优选为8至30个、最优选为8至14个氨基酸。下表显示了根据本发明的肽、它们各自的seqidno、以及这些肽的可能源(潜在)基因。在表1中，含有seqidno:1至seqidno:9的肽与hla-a*02结合，含有seqidno:10至seqidno:19的肽与hla-a*24结合，含有seqidno:20至seqidno:30的肽与hla-a*03结合，含有seqidno:31的肽与hla-a*01结合，含有seqidno:32至seqidno:41的肽与hla-b*07肽结合，含有seqidno:42至seqidno:51的肽与hla-b*08结合，含有seqidno:52至seqidno:59的肽与hla-b*44结合。在表2中，含有seqidno:60至seqidno:75的肽与hla-a*02结合，含有seqidno:76至seqidno:82的肽与hla-a*24结合，含有seqidno:83至seqidno:111的肽与hla-a*03结合，含有seqidno:112至seqidno:116的肽与hla-a*01结合，含有seqidno:117至seqidno:149的肽与hla-b*07肽结合，含有seqidno:150至seqidno:172的肽与hla-b*08结合，含有seqidno:173至seqidno:215的肽与hla-b*44结合。在表3中，含有seqidno:216至seqidno:245的肽与hla-a*02结合，含有seqidno:246至seqidno:255的肽与hla-a*24结合，含有seqidno:256至seqidno:287的肽与hla-a*03结合，含有seqidno:288至seqidno:292的肽与hla-a*01结合，含有seqidno:293至seqidno:392的肽与hla-b*07肽结合，含有seqidno:393至seqidno:395的肽与hla-b*08结合，含有seqidno:396至seqidno:438的肽与hla-b*44结合。在表4中，含有seqidno:439至seqidno:551的肽与几种hlai类等位基因结合，含有seqidno:773的肽与hla-a*02结合，含有seqidno:774的肽与hla-a*24结合。在表5中，含有seqidno:552至seqidno:772的肽与几种hlaii类等位基因结合。表1：本发明中的肽表2：本发明中的其他肽表3：根据本发明的其他肽表4：根据本发明的hla-i类肽表5：根据本发明的hla-ii类肽此外，本发明还一般涉及本发明的肽在治疗增殖性疾病中的用途，增殖性疾病为例如，肝细胞癌、结直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、食管癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾细胞癌、前列腺癌、黑色素瘤、乳腺癌、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、急性骨髓性白血病、胆囊癌和胆管癌、膀胱癌、子宫癌、头颈部鳞状细胞癌、间皮瘤。特别优选的是本发明的肽(单独或组合)，其选自seqidno:1至seqidno:772。更优选的是所述肽(单独或组合)选自seqidno:1至seqidno:215(见表1和表2)并且用于免疫治疗卵巢癌、肝细胞癌、结直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、食管癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾细胞癌、前列腺癌、黑色素瘤、乳腺癌、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、急性骨髓性白血病、胆囊癌和胆管癌、膀胱癌、子宫癌、头颈部鳞状细胞癌、间皮瘤，优选为卵巢癌。此外，本发明的另一个方面涉及本发明中肽在选自卵巢癌、肝细胞癌、结直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、食管癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾细胞癌、前列腺癌、黑色素瘤、乳腺癌、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、急性骨髓性白血病、胆囊癌和胆管癌、膀胱癌、子宫癌、头颈部鳞状细胞癌、间皮瘤中的增殖性疾病的治疗(优选联合疗法)中的用途。本发明还涉及本发明的肽，其具有与主要组织兼容性复合体(mhc)i或以延长形式存在的例如长度变化的mhc-ii类分子结合的能力。本发明进一步涉及本发明中的肽，其中所述肽(每种肽)由或基本由根据seqidno:1至seqidno:772的氨基酸序列组成。本发明进一步涉及本发明的肽，其中所述肽被修饰和/或包含非肽键。本发明进一步涉及本发明的肽，其中所述肽为融合蛋白的一部分，特别是与hla-dr抗原相关不变链(ii)的n-端氨基酸融合，或与抗体(例如，树突状细胞特定抗体)融合，或融合到抗体的序列中。本发明进一步涉及一种核酸，其编码本发明的肽。本发明进一步涉及一种本发明的核酸，为dna、cdna、pna、rna或其组合。本发明进一步涉及一种能表达和/或表达本发明核酸的表达载体。本发明进一步涉及本发明的肽、本发明的核酸或本发明的表达载体在药物中的用途，特别是用于治疗癌症。本发明进一步涉及本发明中肽或本发明中所述肽复合体(含有mhc)的特异性抗体以及制造这些抗体的方法。本发明进一步涉及本发明的t细胞受体(tcr)，特别是可溶性tcr(stcrs)和加工为自体或异体t细胞的克隆tcr，以及制造这些tcr的方法，还涉及载有所述tcr或与所述tcr交叉反应的nk细胞的制造方法。抗体和tcr是本发明现有肽的免疫治疗用途的另外实施方案。本发明进一步涉及含本发明核酸或表达载体的宿主细胞。本发明进一步涉及本发明的宿主细胞，其为抗原提呈细胞，优选为树突细胞。本发明进一步涉及制备本发明肽的一种方法，所述方法包括培养本发明的宿主细胞，以及从所述宿主细胞或其培养基中分离肽。本发明进一步涉及本发明中的方法，其中通过使足量的抗原与抗原提呈细胞接触，抗原被载在表达于合适抗原提呈细胞或人工抗原呈递细胞表面的i或ii类mhc分子上。本发明进一步涉及本发明的方法，其中抗原提呈细胞由能表达含seqidno:1至seqidno:772、优选为含seqidno:1至seqidno:215或其变体氨基酸序列的肽的表达载体。本发明进一步涉及以本发明方法制造的激活的t细胞，其中所述t细胞有选择性地识别一种细胞，该细胞表达含本发明氨基酸序列的多肽。本发明进一步涉及一种杀伤患者靶细胞的方法，其中患者的靶细胞异常地表达含本发明任意氨基酸序列的多肽，该方法包括对患者施用本发明方法制造的有效量t细胞。本发明进一步涉及任何所述肽、本发明的核酸、本发明的表达载体、本发明的细胞、本发明的激活的t淋巴细胞、t细胞受体或抗体或其他肽-和/或肽-mhc结合分子作为药物或在药物制备中的用途。所述药物优选为具有抗癌活性。优选情况为，所述药物为基于可溶性tcr或抗体的细胞治疗药物、疫苗或蛋白质。本发明进一步涉及本发明中的用途，其中所述癌细胞为卵巢癌、肝细胞癌、结直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、食管癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾细胞癌、前列腺癌、黑色素瘤、乳腺癌、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、急性骨髓性白血病、胆囊癌和胆管癌、膀胱癌、子宫癌、头颈部鳞状细胞癌、间皮瘤、优选为卵巢癌细胞。本发明进一步涉及一种基于本发明肽的生物标志物，在此称为“靶标“，其可用于诊断癌症，优选为卵巢癌。所述标志物可以是肽本身的过度提呈，或相应基因的过度表达。标志物也可以用于预测治疗成功的可能性，优选为免疫疗法，最优选为靶向由该生物标志物识别的相同靶的免疫疗法。例如，抗体或可溶性tcr可用于对肿瘤切片进行染色以检测是否存在与mhc复合的相关肽。任选地，抗体具有进一步的效应子功能，如免疫刺激域或毒素。本发明还涉及这些新靶点在癌症治疗中的用途。针对其他癌性疾病的治疗和诊断用途将在以下对于本发明肽的基础表达产物(多肽)的详细描述中进行披露。具体实施方式alpp也称为alp、plap或palp，编码一种碱性磷酸酶，这是一种催化磷酸单酯水解的金属酶(refseq,2002)。alpp被描述为在各种人类肿瘤及其细胞系中高表达，特别是在睾丸和卵巢癌中(millanandfishman,1995)。alpp被确定为骨肉瘤患者生存的独立预后因素，也与肺转移相关。此外，alpp被描述为胃肠道平滑肌肿瘤、生殖细胞肿瘤前体(如原位癌)和性腺母细胞瘤的免疫组织化学标志物，以及一种有前景的卵巢癌生物标志物(ravennietal.,2014；wongetal.,2014b；faureetal.,2016；hanetal.,2012)。alppl2也称为gcap，编码膜结合的糖基化酶，定位于睾丸、胸腺和某些生殖细胞肿瘤，其与胎盘和肠道形式的碱性磷酸酶密切相关(refseq,2002)。alppl2已被证明在精原细胞瘤以及许多胰腺癌细胞系中在mrna和蛋白质水准异位表达，并参与癌细胞生长和浸润。此外，alppl2被描述为胰腺导管腺癌的潜在诊断标志物(hofmannandmillan,1993；duaetal.,2013；fishman,1995)。alppl2的rt-pcr被描述为适用于收集的外周血和祖细胞中残余生殖细胞肿瘤细胞的敏感性检测(hildebrandtetal.,1998)。bcam编码基底细胞黏附分子(lutheran血型)，该分子是免疫球蛋白超家族成员和细胞外基质蛋白层黏连蛋白的受体(refseq,2002)。bcam是层黏连蛋白α5(lama5)的特异性受体，其是层黏连蛋白-511(lm-511)的亚基，是各种组织中基底膜的主要成分；bcam/lama5系统在kras突变型结直肠癌的转移性扩散以及肝细胞癌的迁移中发挥功能作用(kikkawaetal.,2013；kikkawaetal.,2014；bartolinietal.,2016)。bcam血清水准被发现在乳腺癌患者中显著增加，其过量表达被发现与皮肤癌、卵巢癌和胰腺癌以及子宫内膜样癌、卵巢内膜癌和皮肤鳞状细胞癌有关(kikkawaetal.,2008；planagumaetal.,2011；latinietal.,2013；kimetal.,2015a；lietal.,2017)。bcam能够与akt2形成融合蛋白，在高级别浆液性卵巢癌中被确定为akt2激酶活化剂(kannanetal.,2015)。cbx2编码染色盒2，它是polycomb多蛋白复合体的一个组分，是整个发育过程中通过染色质重塑和组蛋白修饰维持许多基因转录抑制状态所必需的组分。cbx2参与细胞增殖和转移(clermontetal.,2016)。cbx2受smarce1调控，导致抑制egfr转录。cbx2参与调节ink4a/arf基因座中编码的三种肿瘤抑制基因(papadakisetal.,2015；agherbietal.,2009；miyazakietal.,2008)。cbx2在癌症(包括乳腺癌、卵巢癌、肺癌、转移性去势抵抗和神经内分泌前列腺癌和基底样子宫内膜样癌种过量表达(parrisetal.,2010；clermontetal.,2016；clermontetal.,2014；clermontetal.,2015；jiangetal.,2015；xuetal.,2016)。cbx2与患者生存率较低和转移进展相关。cbx2与瘤周炎性浸润、转移扩散至颈部淋巴结和肿瘤大小有关(parrisetal.,2014；clermontetal.,2014；xuetal.,2016)。cbx2过量表达导致造血干细胞分化和衰竭(klaukeetal.,2013)。ccna1编码细胞周期蛋白a1，其属于参与cdk激酶调节的高度保守的细胞周期蛋白家族(refseq,2002)。在上皮性卵巢癌、淋巴母细胞白血病细胞系以及儿童急性淋巴细胞白血病患者中检测到ccna1水准升高。其他人观察到ccna1蛋白和mrna在前列腺癌和甲状腺未分化癌患者的肿瘤组织中过度表达(holmetal.,2006；wegieletal.,2008；marlowetal.,2012；arsenicetal.,2015)。最近的研究表明，ccna1在表达ml1白血病细胞的高度细胞周期蛋白a1中的沉寂减慢进入s期、降低增殖和抑制集落形成(jietal.,2005)。cd70编码cd70分子，其属于肿瘤坏死因子(tnf)配体家族的细胞因子。它诱导共刺激的t细胞的增殖，增强细胞溶解性t细胞的产生，并有助于t细胞活化。根据报告，该细胞因子也在调节b细胞活化、天然杀伤细胞的细胞毒性功能和免疫球蛋白合成中发挥作用(refseq,2002)。cd70的靶向作用可用于特异性靶向作用于和杀死癌细胞。它可能是口腔癌的潜在靶点(bundelaetal.,2014；jacobsetal.,2015b；wangetal.,2016a)。cd70在头颈部鳞状细胞癌中表达。它在淋巴瘤、肾细胞癌和胶质母细胞瘤中异位表达。在黑色素瘤进展期间cd70表达水准降低。cd70在来自急性成人t细胞白血病/淋巴瘤患者的cd4+cd25+t细胞上高表达(jacobsetal.,2015b；curranetal.,2015；deetal.,2016；jacobsetal.,2015a；masamotoetal.,2016；pichetal.,2016b；rufetal.,2015a)。cd70参与免疫应答、癌症发生和癌症进展(petrauetal.,2014；pichetal.,2016a)。透明细胞肾细胞癌中cd70上调与较差的生存相关(rufetal.,2015b)。顺铂通过表达相对较高水准cd70的apc介导细胞毒性(beyranvandetal.,2016)。cd70的表达几乎不受电离辐射的影响。这与肺癌的放射敏感性有关。单剂量外束辐射上调pc3细胞中的cd70(bernsteinetal.,2014；kumariandgarnett-benson,2016；puetal.,2014)。cdh3(也称为p-钙黏蛋白)编码钙黏蛋白3，其是钙黏蛋白超家族的经典钙黏蛋白。该钙依赖性细胞-细胞黏附蛋白由5个胞外钙黏蛋白重复序列、一个跨膜区和一个高度保守的细胞质尾组成。该基因位于染色体16长臂上一个区域的基因簇中，该染色体参与乳腺癌和前列腺癌杂合性缺失事件。此外，在宫颈腺癌中观察到该蛋白的异常表达(refseq,2002)。cdh3参与致癌信号传导并启动整合素、受体酪氨酸激酶、小分子gtp酶、emt转录因子和其他钙黏蛋白家族成员。cdh3信号传导诱导侵袭和转移(albergariaetal.,2011；paredesetal.,2012；bryan,2015；vieiraandparedes,2015)。cdh3的致癌活化参与胃癌发生(resendeetal.,2011)。cdh3过度表达促进乳腺癌、膀胱癌、卵巢癌、前列腺癌、子宫内膜癌、皮肤癌、胃癌、胰腺癌和结肠癌(albergariaetal.,2011；paredesetal.,2007；bryanandtselepis,2010；reyesetal.,2013；vieiraandparedes,2015)。cdh3是在基底样乳腺癌中表达的基底上皮标志物。brca1癌的特征在于基底标志物如cdh3的表达，并显示出高级别、高度增殖、er阴性和her3阴性表型(honradoetal.,2006；palaciosetal.,2008；rastellietal.,2010；dewaretal.,2011)。cdh3是黑色素瘤和口腔鳞状细胞癌中的肿瘤抑制因子(haassetal.,2005；vieiraandparedes,2015)。cdh3可用作emt标志物。在肿瘤形成和进展过程中，e-钙黏蛋白转化为n-钙黏蛋白和cdh3表达(piuraetal.,2005；bonitsisetal.,2006；bryanandtselepis,2010；ribeiroandparedes,2014)。cdh3和β-连环蛋白之间的竞争性相互作用导致胃癌中细胞间相互作用和转移受损(moskvinaandmal'kov,2010)。cdh3可能是结肠癌中癌症形成的早期标志物(alrawietal.,2006)。cdh3的失调节是预后不良和恶化程度增加的标志物(knudsenandwheelock,2005)。cdkn2a(也称为p16和p16ink4a)编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2a，其产生第一外显子不同的几种转录物变体。已经报告了至少三个编码不同蛋白质的可变剪接变体，其中两个编码已知作为cdk4激酶抑制剂的结构相关异构体。剩余的转录物包括位于基因其余部分20kb上游的替代性第一外显子；该转录物包含一个替代开放阅读框(arf)，其指定一个与其他变体产物的结构无关的蛋白质。该arf产物作为肿瘤抑制蛋白p53的稳定剂，因为它可与负责p53降解的蛋白e3泛素-蛋白连接酶mdm2相互作用并隔离。cdkn2a在胰腺导管腺癌、皮肤恶性黑色素瘤、外阴鳞状细胞癌和胆道癌中突变。突变可能会遗传，并增加发生胰腺癌的风险。cdkn2a在恶性胸膜间皮瘤中被删除。cdkn2a在膀胱癌中下调(clancyetal.,2016；fabbrietal.,2017；ganetal.,2016；kleeffetal.,2016；nabeshimaetal.,2016；pacholczyketal.,2016；petersen,2016；sohaletal.,2016；tatarianandwinter,2016)。dkn2a参与癌细胞增殖、肿瘤发生、转移、wnt信号传导、衰老、雕亡和dna修复机制(guptaetal.,2016；koetal.,2016；lowetal.,2016；sedgwickandd'souza-schorey,2016；zhaoetal.,2016)。cdkn2a是一种肿瘤抑制基因，其在致癌蛋白uhrf1过量表达时下调。cdkn2a与p53相互作用以抑制乳腺癌(alhosinetal.,2016；fryetal.,2017)。cdkn2a启动子高甲基化与低级别鳞状上皮内病变、高级别鳞状上皮内病变和宫颈癌的风险增加以及吸烟习惯相关。cdkn2a在肝细胞癌和食管鳞状细胞癌发展过程中表观遗传性失调(hanetal.,2017；khanetal.,2017；maetal.,2016a)。cdkn2a可用于宫颈癌和口咽鳞状细胞癌的诊断(mahajan,2016；savoneetal.,2016；tjalma,2017)。cdkn2a表达是由hpv感染引起，hpv是已知具有致癌可能性的病毒(hoffetal.,2017；lorincz,2016)。cdkn2b(也称为p15)编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2b，其位于肿瘤抑制基因cdkn2a的邻近区域，该区域在多种肿瘤中频繁突变和缺失。该基因编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂，其与cdk4或cdk6形成复合体，并阻止cdk激酶的启动，因此编码的蛋白质起到控制细胞周期g1进程的细胞生长调节剂的作用。发现该基因的表达被tgfβ显著诱导，这表明其在tgfβ诱导的生长抑制中起作用(refseq,2002)。cdkn2b参与调节细胞周期进程和抑制细胞增殖(huandzuckerman,2014；royandbanerjee,2015)。cdkn2b缺失与血吸虫相关膀胱癌有关。cdkn2b突变可能参与神经胶质瘤的遗传易感性。cdkn2b在脑膜瘤中发生改变，在非肌层浸润性尿路上皮癌中发生突变(mawrinandperry,2010；melin,2011；pollardetal.,2010；alentornetal.,2013；idbaih,2011；koonrungsesomboonetal.,2015)。cdkn2b在急性髓性白血病和垂体腺瘤中高甲基化。cdkn2b在皮肤恶性黑色素瘤中异常调节(baileyetal.,2010；jiangetal.,2014；popovandgil,2010；vandenhurketal.,2012；wolffandbies,2013；zhouetal.,2014)。cdkn2b与肿瘤抑制基因rb相互作用，受miz-1和tgf-β调节(zhouetal.,2014；geyer,2010；moroyetal.,2011)。cdkn2b是受长非编码rna影响的肿瘤抑制基因。与as1相关的cdkn2b本身是可能参与癌症发生的长非编码rna(anril)的一部分(popovandgil,2010；aguiloetal.,2016；shietal.,2013；wanliandai,2015)。cldn6也被称为claudin6，编码claudin家族的一个成员，其是紧密连接链和完整膜蛋白的组分(refseq,2002)。cldn6表达被证明与非小细胞肺癌的淋巴结转移和tnm分期有关(wangetal.,2015b)。此外，cldn6低表达被证明与非小细胞肺癌患者的显著降低的存活率有关(wangetal.,2015b)。因此，cldn6低表达是一个独立的预后生物标志物，提示非小细胞肺癌患者的预后较差(wangetal.,2015b)。cldn6被证明在宫颈癌和胃癌中下调(zhangetal.,2015e；linetal.,2013b)。cldn6被证明在brca1相关乳腺癌和卵巢乳头状浆液性癌中上调(wangetal.,2013；heermavanvossetal.,2014)。cldn6被描述为乳腺癌的肿瘤抑制因子(zhangetal.,2015e)。宫颈癌细胞系hela和c33a中cldn6表达增加被证明可在抑制细胞增殖、体外集落形成、体内肿瘤生长，这表明cldn6可充当宫颈癌细胞中的肿瘤抑制因子(zhangetal.,2015e)。cldn6可能在卵巢癌的侵袭和转移中起着积极作用(wangetal.,2013)。cldn6被证明在生殖细胞瘤中始终如一地表达，因此，是原始生殖细胞肿瘤的新型诊断标志物(ushikuetal.,2012)。cldn6表达被证明在接受评估的一组非典型畸胎瘤/中枢神经系统横纹肌样瘤大部分肿瘤中呈阳性，且cldn6呈强阳性，是疾病结局的潜在的独立预后因子(dufouretal.,2012)。ct45a1也称为ct45，编码癌症/睾丸抗原家族45成员a1蛋白，位于染色体区域xq26.3上(refseq,2002)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。通常仅在睾丸生殖细胞中表达的ct45a1蛋白被证明也在肺癌、乳腺癌和卵巢癌中表达(chenetal.,2009)。ct45a1也被证明与多发性骨髓瘤的较差预后和较差结果相关(andradeetal.,2009)。ct45a1被描述为基因上调上皮-间质转化(emt)和转移基因，促进emt和肿瘤的扩散。此外，ct45a1被描述为牵涉癌症干细胞样细胞的启动和维持，促进肿瘤发生和恶性进展(yangetal.,2015b)。ct45a1在乳腺癌模型中过度表达显示可导致各种致癌和转移基因的上调，组成性活化erk和creb信号通路并增加肿瘤发生、浸润和转移。ct45a1的沉寂被证明可降低癌细胞的迁移和侵袭。因此，ct45a1可作为一种新的原癌基因，并能是抗癌药物开发和治疗的靶标(shangetal.,2014)。ct45a2编码几个相似基因簇中的一个，它是癌症/睾丸家族抗原的成员，位于染色体xq26.3上(refseq,2002)。ct45a2被证明是新双表型急性白血病儿科患者的新型剪接mll融合伴侣，因此可能与白血病的发生相关(cerveiraetal.,2010)。癌/睾丸抗原家族45被证明在癌细胞系和肺癌标本中频繁表达(chenetal.,2005)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。ct45a3编码癌症/睾丸抗原家族45成员a3蛋白，位于染色体区域xq26.3上(refseq,2002)。癌/睾丸抗原家族45被证明在癌细胞系和肺癌标本中频繁表达(chenetal.,2005)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。ct45a4编码癌症/睾丸抗原家族45成员a4蛋白，位于染色体区域xq26.3上(refseq,2002)。癌/睾丸抗原家族45被证明在癌细胞系和肺癌标本中频繁表达(chenetal.,2005)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。ct45a5编码癌症/睾丸抗原家族45成员a5，位于染色体区域xq26.3上(refseq,2002)。癌/睾丸抗原家族45被证明在癌细胞系和肺癌标本中频繁表达(chenetal.,2005)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。ct45a6编码癌症/睾丸抗原家族45成员a6蛋白，位于染色体区域xq26.3上(refseq,2002)。癌/睾丸抗原家族45被证明在癌细胞系和肺癌标本中频繁表达(chenetal.,2005)。ct45基因被证明是上皮卵巢癌的潜在预后生物标志物和治疗靶标(zhangetal.,2015d)。ctag2编码癌/睾丸抗原2，其是属于eso/lage家族的癌-睾丸抗原的自身免疫原性肿瘤抗原。该蛋白在许多癌症中表达，包括黑色素瘤、乳腺癌、膀胱癌和前列腺癌。该蛋白也在正常睾丸组织中表达(refseq,2002)。ctag2参与癌细胞迁移和侵袭(maineetal.,2016)。lsamp上调ctag2表达，导致细胞增殖减少(baroyetal.,2014)。ctag2在脂肪肉瘤、肺癌、尿路上皮癌和结直肠癌中表达。ctag2在包括食管鳞状细胞癌的集中实体中过量表达(kimetal.,2012；dyrskjotetal.,2012；hemmingeretal.,2014；forghanifardetal.,2011；mccormacketal.,2013；shanthakumaraetal.,2012)。针对ctag2的工程化t细胞可用于多发性骨髓瘤的治疗。针对ctag2的自身抗体可用于癌症诊断。ctag2可能是免疫治疗的靶点。ctag2表达与无进展生存期较短相关(vanetal.,2011；dyrskjotetal.,2012；hudolinetal.,2013；pollacketal.,2012；rapoportetal.,2015；wangetal.,2015a)。cyp2w1编码酶是细胞色素p450超家族的一员，这些酶是单加氧酶，催化涉及药物代谢和胆固醇、类固醇和其他脂质合成的许多反应(refseq,2002)。cyp2w1在多种人类癌症(包括肝细胞癌、结直肠癌和胃癌)中过度表达。cyp2w1过度表达与肿瘤进展和生存差有关(aungetal.,2006；gomezetal.,2010；zhangetal.,2014a)。由于肿瘤特异性表达，cyp2w1是癌症治疗中的一个令人关注的药物靶标或前体药物酶启动剂(karlgrenandingelman-sundberg,2007；nishidaetal.,2010)。dppa2编码发育多能性相关2，位于染色体区域3q13.13上(refseq,2002)。dppa2在胃癌、非小细胞肺癌、上皮性卵巢癌和结直肠癌中过量表达。dppa2是几种实体中上调的致癌基因。dppa2在畸胎瘤中被相互抑制(tungetal.,2013；ghodsietal.,2015；johnetal.,2008；raeisossadatietal.,2014；shabestarianetal.,2015；tchaboetal.,2009；westernetal.,2011)。dppa2表达与肿瘤浸润深度、分期、淋巴结转移和侵袭性相关(ghodsietal.,2015；raeisossadatietal.,2014；shabestarianetal.,2015)。dppa2参与非小细胞肺癌的发病机制(watabe,2012)。dppa2在甲状腺癌中差异性甲基化(rodriguez-roderoetal.,2013)。entpd4(udp酶)编码三磷酸核苷二磷酸水解酶4，是腺苷三磷酸双磷酸酶蛋白质家族的一员，可能在从溶酶体拯救核苷酸中发挥作用(refseq,2002)。udp酶活性在卵巢癌或睾丸癌患者中增加，化疗后下降(papadopoulou-boutisetal.,1985)。esr1编码一种雌激素受体，是一种配体启动的转录因子，对于激素结合、dna结合和转录活化非常重要，是对性发育和生殖功能必不可少的(refseq,2002)。esr1的突变和单核苷酸多态性与不同癌症类型的风险相关，包括肝癌、前列腺癌、胆囊和乳腺癌。esr1表达的上调与细胞增殖和肿瘤生长相关，但是，esr1阳性肿瘤患者由于使用选择性雌激素受体调节剂成功治疗总体生存更好(sunetal.,2015；hayashietal.,2003；bogushetal.,2009；miyoshietal.,2010；xuetal.,2011；yakimchuketal.,2013；fuquaetal.,2014)。esr1信令干扰负责细胞转化、生长和存活的不同途径，如egfr/igfr、pi3k/akt/mtor、p53、her2、nfκb和tgf-β途径(frasoretal.,2015；bandandlaiho,2011；bergeretal.,2013；skandalisetal.,2014；mehtaandtripathy,2014；ciruelosgil,2014)。etv1编码ets变体1，它是ets(e26)家族转录因子的一员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节生物过程如：细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化(refseq,2002)。etv1涉及上皮-间质转化、dna损伤应答、ar和pten信号传导、癌细胞侵袭和转移。etv1与jmjd2a相互作用以促进前列腺癌形成并增加影响hippo信号传导途径的yap1表达(mesquitaetal.,2015；batyetal.,2015；heegetal.,2016；higginsetal.,2015；kimetal.,2016；lunardietal.,2015)。etv1表达在前列腺癌中降低。etv1在胰腺癌、胃肠道间质瘤、少突胶质细胞瘤和肾细胞癌中过量表达。etv1可能是非小细胞肺癌的一种癌基因(heegetal.,2016；gleizeetal.,2015；taetal.,2016；aletal.,2015；hashimotoetal.,2017；jangetal.,2015)。前列腺癌细胞系微泡中etv1的mrna水准升高与前列腺癌进展相关(lazaro-ibanezetal.,2017)。etv1是与尤文氏肉瘤中断点蛋白ews相互作用的癌基因。etv1与部分介导癌细胞转移和结缔组织增生性基质扩张的sparc和has2相互作用(heegetal.,2016；kedageetal.,2016)。etv1基因融合产物以及etv1启动子甲基化状态在诊断上是有用的(anguloetal.,2016；2015；kumar-sinhaetal.,2015；linnetal.,2015)。etv4(也称为e1af或pea3)编码转录因子ets致癌基因家族的一员，参与调节转移基因表达和诱导胚胎干细胞的分化相关基因(akagietal.,2015；coutteetal.,1999；ishidaetal.,2006)。etv4在包括乳腺癌、肺癌、结直肠癌和胃癌在内的不同癌症实体中过量表达，并且与迁移、侵袭、转移和不良预后有关(benzetal.,1997；horiuchietal.,2003；yamamotoetal.,2004；keldetal.,2011；hiroumietal.,2001)。etv4在诱导包括mmp和il-8在内的几个靶点后被erk/mapk、her2、pi3k和ras等不同的途径上调(marutaetal.,2009；keldetal.,2010；chenetal.,2011b；aytesetal.,2013)。etv5编码ets变体5蛋白，位于染色体区域3q28上(refseq,2002)。包括etv5在内的途径被描述与子宫内膜癌的上皮-间充质过程密切相关(colasetal.,2012)。etv5被证明与ov90卵巢癌细胞系中的几种信号传导途径(如：细胞周期进程和tgf-β信号传导途径)相互作用，并且etv5表达显示与致癌转录因子foxm1在卵巢癌中的表达相关(llauradoetal.,2012b)。此外，etv5被证明在卵巢癌中上调。在球体模型中，etv5的抑制和上调影响细胞增殖、细胞迁移、细胞对细胞外基质成分的黏附、细胞-细胞黏附和细胞存活。因此，etv5可能在卵巢癌进展、细胞扩散和转移中发挥作用(llauradoetal.,2012a)。致癌pea3亚家族其他成员中etv5的染色体重排被描述为在前列腺肿瘤中发生，并被认为是前列腺癌发生的主要驱动力之一。此外，etv5也被描述为涉及黑色素瘤、乳腺癌和一些其他类型癌症的癌蛋白(ohetal.,2012)。研究表明etv5在调节基质金属蛋白酶2表达中具有重要作用，因此在人类软骨肉瘤的吸收方面也具有重要作用，因而可能是该癌症中转移级联的可成为靶点的上游效应子(poweretal.,2013)。eya2编码eya转录共启动因子和磷酸酶2，是参与眼睛发育的眼睛缺失(eya)家族蛋白的一员(refseq,2002)。在几种肿瘤类型中，如上皮性卵巢肿瘤、前列腺癌、乳腺癌、泌尿道癌、胶质母细胞瘤、肺腺癌、宫颈癌、结肠癌和造血癌症中观察到eya2过度表达(bierkensetal.,2013；zhangetal.,2005；guoetal.,2009；patricketal.,2013；kohrtetal.,2014)。研究表明，eya2影响tgfβ途径成员的转录以及tgfbr2的磷酸化，这意味着eya2在胰腺中具有双重作用(vincentetal.,2014)。fam111b编码具有序列相似性111家族成员b，是在c-末端具有胰蛋白酶样半胱氨酸/丝氨酸肽酶结构域的蛋白质，其在突变的情况下导致斑点色素沉着、毛细血管扩张、表皮萎缩、肌腱挛缩和进行性肺纤维化(refseq,2002)。fam111b被发现在二甲双胍和阿司匹林诱导的胰腺癌发展抑制过程中下调(yueetal.,2015)。fam83h编码序列相似性83家族成员h，在牙釉质结构发育和钙化中起重要作用。该基因的缺陷是造成3型釉质发育不全(ai3)的原因(refseq,2002)。长的非编码rnafam83h-as1参与细胞增殖、迁移和侵袭并调节met/egfr信号传导(zhangetal.,2017)。长的非编码rnafam83h-as1在肺癌和结直肠癌中过量表达。fam83h是在包括乳腺癌和结直肠癌在内的几种实体中过量表达的癌基因(zhangetal.,2017；kugaetal.,2013；snijdersetal.,2017；yangetal.,2016c；yangetal.,2016b)。长的非编码rnafam83h-as1表达增加与总体存活期较短有关。fam83h-as1与不良预后有关(yangetal.,2016c；yangetal.,2016b)。fam83h可能参与雄激素非依赖性前列腺癌(nallaetal.,2016)。fam83h与ck1α相互作用形成角蛋白丝和桥粒(kugaetal.,2016)。fbn2也称为原纤维蛋白2，编码是结缔组织中一种成分的一种蛋白质，可能参与弹性纤维组装(refseq,2002)。fbn2被描述为tgf-β信号传导活性的细胞外基质调节蛋白(lilja-maulaetal.,2014)。fbn2的超甲基化被描述为透明细胞肾细胞癌的表观遗传生物标志物和用于早期检测结直肠癌并且与结直肠癌患者的不良预后相关(rickettsetal.,2014；rasmussenetal.,2016；yietal.,2012)。fbn2被证明是富含成神经管细胞瘤的候选细胞表面靶标，其可用于开发肿瘤特异性探针用于引导切除髓母细胞瘤(haeberleetal.,2012)。folr1编码叶酸受体1，其与叶酸及其还原衍生物结合，并将5-甲基四氢叶酸转运入细胞；folr1是一种分泌蛋白，通过糖基-磷脂酰肌醇键锚定到膜上，或以可溶形式存在(refseq,2002)。folr1作为folr1/csrc/erk1/2/nfκb/p53途径的重要组成部分，是叶酸摄取所必需的，其能够调节乳腺癌、肺癌和结肠癌等癌细胞的增殖(kuoandlee,2016；cheungetal.,2016)。folr1被发现在上皮性卵巢癌中广泛表达，其表达随肿瘤期别而增加并且可能代表潜在的治疗靶标(leungetal.,2016；ponteetal.,2016；mooreetal.,2016；houetal.,2017；notaroetal.,2016；bergaminietal.,2016)。结直肠癌治疗期间降低folr1表达下降被证明可增加5-氟尿嘧啶治疗的有效性(tsukiharaetal.,2016)。folr1是三阴乳腺癌和结肠癌免疫治疗的理想肿瘤相关标志物(liangetal.,2016；songetal.,2016)。gpr64编码黏附g蛋白偶联受体g2(g蛋白偶联受体家族的一员)，该蛋白被描述为附睾特异性跨膜蛋白(refseq,2002)。在乳腺癌细胞系中，gpr64敲减导致细胞黏附和细胞迁移大大降低(peetersetal.,2015)。hoxa10编码同源异型盒a10。该基因是染色体7上a簇的一部分，编码可调节基因表达、形态发生和分化的dna结合转录因子。更具体地说，它可能在生育力、胚胎生存力和造血谱系提交调节中起作用。该基因与下游同源异型盒a9(hoxa9)基因之间存在读出转录(refseq,2002)。hoxa10是一种干细胞因子，其表达与胶质瘤中的cd133表达相关，并可能参与癌症进展。hoxa10参与癌细胞增殖、迁移、侵袭和转移。hoxa10通过诱导p-gp和mrp1的表达参与多药耐药性。hoxa10促进上皮-间质转化。hoxa10可能是mir-218/pten/akt/pi3k信号传导的下游靶点。hoxa10促进aml相关转录因子prdm16的表达。hoxa10可能以p21依赖性方式介导g1细胞周期阻滞。hoxa10以mmp-3依赖性方式参与促进癌细胞侵袭的tgf-β2/p38mapk信号传导(carreraetal.,2015；cuietal.,2014；emmrichetal.,2014；hanetal.,2015；lietal.,2014a；lietal.,2016a；sunetal.,2016；xiaoetal.,2014；yangetal.,2016a；yietal.,2016；yuetal.,2014；zhangetal.,2014b；zhangetal.,2015b)。hoxa10在胃癌和急性髓系白血病中上调。hoxa10在口腔鳞状细胞癌中差异表达。hoxa10在非浆液性卵巢癌和成胶质细胞瘤中差异性甲基化(carreraetal.,2015；hanetal.,2015；kurscheidetal.,2015；niskakoskietal.,2014；oueetal.,2015；shimaetal.,2014)。hoxa10甲基化状态可用于诊断乳腺癌。hoxa10和cd44共表达与胃癌的肿瘤大小和患者存活相关。hoxa10和mir-196b共表达与胃癌不良预后相关(hanetal.,2015；limetal.,2013；uehiroetal.,2016)。sgi-110治疗使hoxa10低甲基化，而使卵巢癌细胞对化疗敏感(fangetal.,2014a)。hoxa9编码同源异型盒蛋白a9。该基因是染色体7上a簇的一部分，编码可调节基因表达、形态发生和分化的dna结合转录因子。引起该基因与nup98基因融合的特定易位事件与髓细胞白血病发生有关(refseq,2002)。hoxa9在急性髓系白血病中表达，高表达与不良预后相关。hoxa9和meis1共表达诱导aml。hoxa9在宫颈癌中下调。hoxa9在子宫内膜癌中经常被甲基化(alvarado-ruizetal.,2016；chenetal.,2015；lietal.,2016b；lietal.,2016e；sykesetal.,2016)。基因融合产物nup98-hoxa9充当致癌基因(abeetal.,2016；sontakkeetal.,2016)。对顺铂化疗的反应与hoxa9启动子甲基化状态有关。hoxa9、meis1和mn1在白血病中的共表达使细胞对药物抑制dot1l敏感(lietal.,2016c；riedeletal.,2016；xylinasetal.,2016)。hoxa9是一种肿瘤抑制因子，其表达可用于诊断癌症(maetal.,2016b)。hoxa9介导白血病干细胞自我更新，hif-2α缺失加速这一过程(vukovicetal.,2015；zhuetal.,2016)。hoxb9编码同源异型盒b9，它是abd-b同源盒家族的成员，并编码具有同源异型盒dna结合结构域的蛋白质。它包含在位于17号染色体上的同源异型盒b基因簇中。编码的核蛋白充当一种序列特异性转录因子，参与细胞增殖和分化。该基因的表达增加与白血病、前列腺癌和肺癌的一些病例有关(refseq,2002)。hoxb9参与由mir-192调控的血管生成途径。hoxb9是由n-乙酰半乳糖胺转移酶诱导的wnt/β-连环蛋白信号传导的下游靶标，可导致转移。hoxb9可能通过tgf-β1依赖性方式调控胃癌和结肠腺癌的间质-上皮转化以及乳腺癌和肝细胞癌的上皮-间质转化。hoxb9参与细胞增殖、迁移和侵袭。tgf-β1以kindlin-2/pdac依赖性方式下调hoxb9(changetal.,2015b；dardaetal.,2015；hoshinoetal.,2014；huangetal.,2014；kwonetal.,2015；sekietal.,2012；shaetal.,2015；wuetal.,2016；zhanetal.,2014；zhanetal.,2015；zhussupovaetal.,2014)。hoxb9在pbrm1突变的透明细胞肾细胞癌中差异表达。hoxb9在铂类耐药的高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌、神经胶质瘤、结肠腺癌、肝细胞癌和头颈部鳞状细胞癌中过量表达。hoxb9在胃癌中的表达下降。hoxb9在白血病中突变(menezesetal.,2014；changetal.,2015b；dardaetal.,2015；zhanetal.,2014；zhussupovaetal.,2014；fangetal.,2014b；hayashidaetal.,2010；kellyetal.,2016；shaetal.,2013；shresthaetal.,2012；wangetal.,2016b；yuanetal.,2014)。hoxb9的表达受e2f1和fat10调节(zhussupovaetal.,2014；yuanetal.,2014)。hoxb9的表达与口腔癌的肿瘤大小相关。hoxb9的表达与胶质瘤的晚期临床期别相关。hoxb9下调与胃癌患者生存期下降相关(fangetal.,2014b；shaetal.,2013；oliveira-costaetal.,2015；tomiokaetal.,2010)。hoxb9调节膀胱癌进展(zhangetal.,2016b)。长的非编码rnanc-hoxb9-205在膀胱尿路上皮癌中下调(luoetal.,2014)。bcas3-hoxb9基因融合产物在乳腺癌中表达(schulteetal.,2012)。hoxc10编码属于同源盒基因家族的同源异型盒c10。同源盒基因编码高度保守的转录因子家族，在所有多细胞生物体的形态发生中起重要作用。该基因是多个同源盒hoxc基因中的一个，位于第12号染色体上的簇。蛋白质水准在细胞分化和增殖期间受到控制，这可能表明该蛋白质在起源活化中起作用(refseq,2002)。hoxc10通过抑制细胞雕亡和上调nf-κb和dna损伤修复而参与化学耐药。hoxc10诱导雕亡并抑制细胞生长。hoxc10可能参与宫颈癌的发展和侵袭(pathirajaetal.,2014；sadiketal.,2016；zhaietal.,2007)。hoxc10在甲状腺癌、宫颈鳞状细胞癌和乳腺癌中上调(abbaetal.,2007；zhaietal.,2007；ansarietal.,2012；fengetal.,2015)。hoxc10表达与er阴性乳腺癌的较短无复发生存期和总生存期相关。hoxc10的表达与甲状腺癌的较晚期别、病理分期差、预后差、细胞因子-细胞因子受体相互作用和趋化因子信号传导通路有关(sadiketal.,2016；fengetal.,2015)。hoxc10在口腔鳞状细胞癌和小b细胞淋巴瘤中差异甲基化(marcinkiewiczandgudas,2014a；marcinkiewiczandgudas,2014b；rahmatpanahetal.,2006)。hoxc9编码属于同源盒基因家族的同源异型盒c9。同源盒基因编码高度保守的转录因子家族，在所有多细胞生物体的形态发生中起重要作用。该基因是多个同源盒hoxc基因中的一个，位于第12号染色体上的簇(refseq,2002)。hoxc9参与癌细胞的侵袭和增殖。hoxc9敲减导致细胞活力、迁移、侵袭、致瘤性下降和自噬增加。hoxc9以mir-193a-3p依赖性方式参与膀胱癌的化学耐药。hoxc9参与视黄酸信号转导并参与细胞生长和分化(huretal.,2016；kocaketal.,2013；lvetal.,2015a；maoetal.,2011；simeoneetal.,1991；stornaiuoloetal.,1990；xuanetal.,2016；zhaetal.,2012)。hoxc9在乳腺癌、肺癌和神经母细胞瘤中差异表达。hoxc9在i期非小细胞肺癌中被甲基化。hoxc9在星形细胞瘤中上调。hoxc9在食管癌和宫颈癌中表达(huretal.,2016；xuanetal.,2016；guetal.,2007；linetal.,2009；lopezetal.,2006；okamotoetal.,2007)。hoxc9可能被smad4转录抑制(zhouetal.,2008)。hoxc9的表达与乳腺癌的无病生存期和无远处转移生存期呈负相关。hoxc9表达与胶质母细胞瘤不良预后有关(huretal.,2016；xuanetal.,2016)。hoxc9抑制dapk1，导致由beclin-1诱导的自噬(xuanetal.,2016)。hoxd10编码同源异型盒d10蛋白，其功能是在肢芽发育中表达的并且参与分化和肢体发育的序列特异性转录因子(refseq,2002)。hoxd10被确定为mir-10b的靶基因，其在胃癌(gc)中上调，可能在gc发病和发展中起关键作用(maetal.,2015；wangetal.,2015c)。发现hoxd10在颈部鳞状细胞癌和尿路上皮癌中上调，促进细胞增殖和侵袭，并且可能代表浸润性乳腺导管癌的一种新标志物(sharpeetal.,2014；vardhinietal.,2014；heubachetal.,2015)。但是，hoxd10还通过灭活rhoc/akt/mapk通路和诱导g1期细胞周期停滞来显示在胆管细胞癌中的肿瘤抑制功能(yangetal.,2015a)。作为mir-224/hoxd10/p-pak4/mmp-9信号通路的一部分，hoxd10有助于细胞迁移和侵袭的调节，为肝细胞癌治疗提供了一种新的生物靶点(lietal.,2014b)。hoxd9编码属于同源盒基因家族的同源异型盒d9。同源盒基因编码高度保守的转录因子家族，在所有多细胞生物体的形态发生中起重要作用。该基因是几种同源异型盒hoxd基因之一，位于染色体区域2q31-2q37。去除整个hoxd基因簇或该簇的5'端的缺失与严重的肢体和生殖器异常相关。该基因的确切作用尚未确定(refseq,2002)。hoxd9以zeb1依赖性方式参与上皮-间质转化、癌细胞迁移、侵袭和转移。过量表达的hoxd9增加了锚定非依赖性生长并降低了接触抑制。hoxd9参与生长停滞和神经元分化。hoxd9的耗竭导致细胞增殖减少、细胞周期停滞和诱导细胞雕亡(zhaetal.,2012；lawrensonetal.,2015b；lvetal.,2015b；tabuseetal.,2011)。hoxd9在肺鳞癌和浸润性肝细胞癌中上调。hoxd9在食管癌、星形细胞瘤和胶质母细胞瘤中表达。hoxd9在宫颈癌中差异表达(baoetal.,2016；guetal.,2007；lvetal.,2015b；tabuseetal.,2011；lietal.,2002；liuetal.,2005)。hoxd9表达由视黄酸和wnt信号传导诱导(ishikawaandito,2009)。hoxd9可能参与宫颈癌变(lopez-romeroetal.,2015)。hoxd9高甲基化与淋巴结转移较差的无病生存和总生存相关(marzeseetal.,2014)。hoxd9在胆管癌和黑色素瘤脑转移中被高甲基化(marzeseetal.,2014；sriraksaetal.,2013)。hoxd9可能参与卵巢黏液癌的易感性(kelemenetal.,2015)。hoxd9可能是一种癌基因(wuetal.,2013)。htr3a编码属于配体-门控离子通道受体超家族的一种5羟色胺(血清素)受体，其导致神经元在启动后快速去极化反应(refseq,2002)。htr3a(也称为5-ht3)在几种癌症类型中失调节，例如，在套细胞淋巴瘤中下调，在不同的b细胞肿瘤中差异表达，在乳腺癌细胞系中表达降低(paietal.,2009；rinaldietal.,2010；eketal.,2002)。igf2bp1，也称为crd-bp，编码胰岛素样生长因子2mrna结合蛋白家族中的一员，其通过结合到某些基因的mrna和调节它们的翻译发挥作用(refseq,2002)。igf2mrna结合蛋白家族的两个成员，包括igf2bp1被描述为真正的癌胚蛋白，在各种人类癌症中重新合成，并且可能是肿瘤生长、耐药性和转移的强大的转录后癌基因(ledereretal.,2014)。据报告，igf2bp1的表达与各种人类癌症的总体预后差和转移相关(ledereretal.,2014)。因此，igf2bp1被认为是一种有力的生物标志物，是癌症治疗的候选靶标(ledereretal.,2014)。igf2bp家族成员被描述为与癌症转移和致癌因子(如kras、myc和mdr1)表达高度相关(belletal.,2013)。igf2bp1被证明与c-myc相互作用，并被发现在绝大多数结肠和乳腺肿瘤和肉瘤以及良性肿瘤(如乳房纤维腺瘤和脑膜瘤)中表达(ioannidisetal.,2003)。igf2bp1被证明在肝细胞癌和基底细胞癌中上调(noubissietal.,2014；zhangetal.,2015c)。igf2bp1和其他基因的上调被证明与肝细胞癌手术后预后差显著相关(zhangetal.,2015c)。igf2bp1被证明分别是肝细胞癌和肾细胞癌中mir-9和mir-372肿瘤抑制因子的一个靶标(huangetal.,2015；zhangetal.,2015c)。基质igf2bp1的减少被证明可促进结肠中致瘤微环境，这表明igf2bp1在结肠基质细胞中起着肿瘤抑制作用(hamiltonetal.,2015)。igf2bp1被证明与4期肿瘤、患者生存期降低以及神经母细胞瘤mycn基因扩增相关，因此可能是神经母细胞瘤的一种潜在致癌基因和一种独立的负预后因子(belletal.,2015)。igf2bp1被描述为wnt/钙-连环蛋白信号通路的直接靶标，其在基底细胞癌的发展中调节gli1表达和活性(noubissietal.,2014)。igf2bp3编码胰岛素样生长因子iimrna结合蛋白3，这是一种癌胚蛋白，其压制胰岛素样生长因子ii的翻译(refseq,2002)。几项研究表明，igf2bp3在细胞功能的各个重要方面发挥作用，例如细胞极化、迁移、形态、代谢、增殖和分化。体外研究表明，igf2bp3促进肿瘤细胞的增殖、黏附和侵袭。此外，igf2bp3已经显示与侵袭性和晚期癌症相关(belletal.,2013；gongetal.,2014)。igf2bp3过度表达在许多肿瘤类型中进行了说明，并与预后较差、肿瘤期别高和转移相关，例如在神经母细胞瘤、结直肠癌、肝内胆管癌、肝细胞癌、前列腺癌和肾细胞癌中过度表达(belletal.,2013；findeis-hoseyandxu,2012；huetal.,2014；szarvasetal.,2014；jengetal.,2009；chenetal.,2011a；chenetal.,2013；hoffmannetal.,2008；linetal.,2013a；yuanetal.,2009)。irf4编码干扰素调节因子4，一种负调节淋巴细胞中toll样受体(tlr)信号传导的转录因子，对于固有和适应性免疫系统的启动起着核心作用(refseq,2002)。irfa被认为是淋巴样、髓样和树突状细胞分化和成熟中几个步骤的关键调节因子，其特征在于在造血系统内以谱系和阶段特异性方式变化(shafferetal.,2009；gualcoetal.,2010)。irf4在慢性粒细胞白血病、原发性中枢神经系统淋巴瘤、t细胞淋巴瘤、htlv-i诱导的成人t细胞白血病和血管内大b细胞淋巴瘤的适应性免疫、细胞生长、分化和肿瘤发生中发挥关键作用(mamaneetal.,2002；orwatandbatalis,2012；bisigetal.,2012；ponzonietal.,2014；manzellaetal.,2016)。irf4是一种众所周知的致癌基因，由多发性骨髓瘤中的zeste同源物2(ezh2)增强子调节(alzrigatetal.,2016)。klk14编码激肽释放酶相关肽酶14，它是丝氨酸蛋白酶的激肽释放酶亚家族的一员，丝氨酸蛋白酶具有不同的生理功能，如调节血压和脱皮。该基因的表达改变涉及不同的癌症(包括乳腺癌和前列腺肿瘤)的进展。编码的蛋白质是经蛋白水解加工以产生功能性酶的前体。该基因是位于19号染色体上的15个激肽释放酶亚家族成员之一(refseq,2002)。klk14通过erk1/2/map激酶磷酸化和肿瘤发生参与细胞增殖。klk14诱导par-2信号传导。klk14可能参与肿瘤进展、生长、侵袭和血管生成(walkeretal.,2014；borgonoetal.,2007；chungetal.,2012a；devetzietal.,2013；gratioetal.,2011；sanchezetal.,2012；zhangetal.,2012a)。klk14被mir-378/422a和雄激素受体信号传导下调。雄激素受体信号传导上调乳腺癌中的klk14表达(paliourasanddiamandis,2008b；loseetal.,2012；paliourasanddiamandis,2007；paliourasanddiamandis,2008a；samaanetal.,2014)。klk14在慢性淋巴细胞白血病、非小细胞肺癌、唾液腺肿瘤和卵巢癌中过量表达。klk14在乳腺癌中差异表达(planqueetal.,2008b；fritzscheetal.,2006；hashemetal.,2010；kontosetal.,2016；papachristopoulouetal.,2013；planqueetal.,2008a)。klk14表达与总生存呈负相关。klk14表达可用作一种生物标志物并预测疾病复发的风险。klk14表达与临床肿瘤分期和淋巴结阳性状态相关(devetzietal.,2013；loseetal.,2012；fritzscheetal.,2006；kontosetal.,2016；borgonoetal.,2003；obiezuanddiamandis,2005；rabienetal.,2008；rajapakseandtakahashi,2007；talierietal.,2009)。klk8编码激肽释放酶相关肽酶8，一种丝氨酸蛋白酶，可能参与皮肤中的蛋白水解级联，并可作为卵巢癌的生物标志物(refseq,2002)。klk8的表达被证明与乳腺癌、结直肠癌(crc)、子宫内膜癌和卵巢癌的进展相关，并且可能是结直肠癌、乳腺癌和卵巢癌的潜在独立预后指标(liuetal.,2017；jinetal.,2006；kountourakisetal.,2009；darlingetal.,2008；michaelidouetal.,2015；borgonoetal.,2006)。klk8能够进行选择性剪接，产生缺少外显子4的mrna转录物；与klk8相反，这种选择性变体在癌细胞中显著下调(angelopoulouandkaragiannis,2010)。然而，单独或联合使用klk8-t4选择性剪接变异体可能是肺癌不良预后的一个新的独立标志物(planqueetal.,2010)。klk8表达通过抑制肿瘤细胞侵袭性为非小细胞肺癌带来有利的临床结果(sheretal.,2006)。lama1编码层黏连蛋白的α1亚基，其为具有异源三聚体结构的细胞外基质糖蛋白，其构成基底膜的主要成分(refseq,2002)。lama1在不同的癌症类型中失调，包括在成胶质细胞瘤中上调、在结直肠癌中高甲基化、在乳腺癌中异常甲基化和在胃癌中移码突变(scridelietal.,2008；choietal.,2015；simonovaetal.,2015；kimetal.,2011)。tgfβ可以诱导lama1表达。lama1反过来促进胶原酶iv的产生，导致良性肿瘤细胞的侵袭性表型，但不足以带来转移可能性(chakrabartyetal.,2001；royceetal.,1992)。lamc2属于层黏连蛋白家族——细胞外基质糖蛋白家族。层黏连蛋白是基底膜的主要非胶原成分。它们牵涉多种生物学过程，包括细胞黏附、分化、迁移、信令、神经突向外生长和转移。lamc2编码在几种胎儿组织中表达的一种蛋白，并且特定定位于皮肤、肺、肾的上皮细胞(refseq,2002)。lamc2在未分化甲状腺癌中高度表达，并且通过调节egfr的信号传导与肿瘤进展、迁移和浸润相关(gargetal.,2014)。lamc2表达预测ii期结直肠癌患者的预后较差(kevansetal.,2011)。lamc2与其他三个生物标志物一起的表达被发现与口腔鳞状细胞癌患者的淋巴结转移显著相关(zanaruddinetal.,2013)。lilrb4(也称为ilt-3)编码白细胞免疫球蛋白样受体b4，其是白细胞免疫球蛋白样受体(lir)家族的一员，其在染色体区域19q13.4的基因簇中发现。该受体在免疫细胞上表达，在免疫细胞上其与抗原呈递细胞上的mhci类分子结合并转导抑制刺激免疫应答的负信号。受体还可以在抗原捕获和提呈中起作用。它被认为可控制炎症反应和细胞毒性，以帮助集中于免疫反应和限制自主反应(refseq,2002)。lilrb4过量表达可能参与癌症期间树突状细胞的耐受性。lilrb4可能参与免疫抑制。lilrb4参与癌症免疫逃逸(zhangetal.,2012b；trojandtetal.,2016；cortesini,2007；degoejeetal.,2015；suciu-focaetal.,2007)。lilrb4表达由tnf-α诱导。lilrb4过量表达抑制nf-κb活化、炎性细胞因子的转录和共刺激分子。lilrb4由环孢菌素过量表达，导致天然杀伤细胞的肿瘤细胞毒性降低(sietal.,2012；thorneetal.,2015；vladandsuciu-foca,2012)。lilrb4在癌症的树突细胞上过量表达。lilrb4在单核细胞急性骨髓性白血病中表达。lilrb4在卵巢癌中过量表达(dobrowolskaetal.,2013；khanetal.,2012；orsinietal.,2014)。lilrb4表达与非小细胞肺癌较短的生存期相关。lilrb4表达可用于预测慢性淋巴细胞白血病预后(colovaietal.,2007；degoejeetal.,2015)。loxl2编码细胞外的铜依赖性胺氧化酶，称为赖氨酰氧化酶2。该酶对结缔组织的生物发生至关重要，并催化胶原蛋白和弹性蛋白之间交联形成的第一步(refseq,2002)。loxl2被证明参与细胞外和细胞内细胞信号传导途径的调节。在细胞外，loxl2重塑肿瘤微环境的细胞外基质。在细胞内，它调节上皮-间质转化(canoetal.,2012；moonetal.,2014)。一般来说，loxl2与肿瘤进展有关，包括促进癌细胞侵袭、转移、血管生成以及各种肿瘤中实体瘤的恶性转化。loxl2的高表达与预后不良有关(wuandzhu,2015)。loxl2显示在结肠癌、食管鳞状细胞癌、乳腺癌、透明细胞肾细胞癌、肝细胞癌、胆管癌、肺鳞状细胞癌和头颈部鳞状细胞癌中过量表达。在各种癌症类型中，loxl2的高表达与较高的复发、进展或转移相关。在各种癌细胞系中，loxl2的高表达与细胞迁移和侵袭增加相关，其沉寂显示出相反的效果(xuetal.,2014a；kimetal.,2014；wongetal.,2014a；haseetal.,2014；lvetal.,2014；torresetal.,2015)。在胃癌中，成纤维细胞衍生loxl2显示可能刺激胃癌细胞的运动性。loxl2在基质细胞中的表达可作为预后标志物(kasashimaetal.,2014)。许多微rna家族在癌症组织中显著减少。loxl2被证明是这些肿瘤抑制性微rna的直接调节因子(fukumotoetal.,2016；mizunoetal.,2016)。egf诱导lrrk1易位，因为它是egf受体特异性相互作用伴侣(ishikawaetal.,2012；hanafusaandmatsumoto,2011；reyniersetal.,2014)。lrrk1是grb2/gab2/shc1复合体的一个组分，与arap1相互作用。它可能是应对细胞应激的mapk信号传导的一个组成部分(titzetal.,2010)。用于急性早幼粒细胞白血病治疗的三氧化二砷上调乳腺癌细胞中的lrrk1(wangetal.,2011)。lrrk1在家族性胰腺癌中显示出极端等位元基因特异性表达(tanetal.,2008)。lrrk1编码富含亮氨酸的重复激酶1，位于染色体区域15q26.3上。它属于roco蛋白，ras样gtp酶的一个新亚组(refseq,2002；korretal.,2006)。lypd1编码含ly6/plaur结构域1，位于染色体区域2q21.2上(refseq,2002)。lypd1在来自乳腺癌的脑转移癌中过量表达。lypd1在转移癌中过量表达。lypd1在卵巢癌中差异表达。lypd1是一种肿瘤抑制因子，该因子在来自子宫癌肉瘤的cd133+癌干细胞样细胞中下调(burnettetal.,2015；choijamtsetal.,2011；datetal.,2012；geetal.,2015b；lawrensonetal.,2015a)。lypd1是细胞增殖的负调因子(salazaretal.,2011)。magea11编码mage家族成员a11，它是magea基因家族的成员。该家族的成员将具有50至80％序列同一性的蛋白质进行相互编码。magea基因的启动子和第一个外显子显示出相当大的变异性，表明该基因家族的存在能够在不同的转录控制下表达相同的功能。magea基因聚簇于染色体位置xq28(refseq,2002)。magea11是癌胚系抗原，参与肿瘤进展并与预后不良和在电脑上类比存活相关。magea11参与pr-b信号传导并作为雄激素受体的共同调节因子。magea11直接与tif2相互作用。magea11参与缺氧信号转导，敲减导致hif-1α表达下降(aprelikovaetal.,2009；askewetal.,2009；jamesetal.,2013；liuetal.,2011；suetal.,2012；wilson,2010；wilson,2011)。magea11在口腔鳞状细胞癌、紫杉醇耐药卵巢癌以及前列腺癌进展期间上调(duanetal.,2003；wilson,2010；geetal.,2015a；karpfetal.,2009)。magea11表达与前列腺癌和上皮性卵巢癌的低甲基化相关(jamesetal.,2013)。magea12编码mage家族成员a12，并与x染色体上聚集的其他几个基因密切相关(refseq,2002)。magea12在20.5％的多发性骨髓瘤患者中表达(andradeetal.,2008)。据报告，为了回应于特定的疫苗接种，单一黑色素瘤转移暂时消退后，全身性免疫反应性从magea12向隐蔽表位表面化(lallyetal.,2001)。在恶性黑色素瘤的早期病变中，相对于其他mage抗原，magea12以最高的频率表达(gibbsetal.,2000)。magea3编码黑素瘤相关抗原家族成员a3。magea3被广泛地称为癌-睾丸抗原(refseq,2002；pinedaetal.,2015；deetal.,1994)。长期以来，magea3已知用于转移性黑色素瘤癌的治疗性疫苗接种试验中。用晚期黑色素瘤患者的magea3和4个其他抗原目前执行的经皮肽免疫被证明与不完全应答者相比显著有助于延长完全应答者的总生存期(coulieetal.,2002；fujiyamaetal.,2014)。在nsclc中，magea3被证明频繁表达。magea3的表达与nsclc组织样本中较高数目的肿瘤坏死相关，并显示可抑制增殖和侵袭并促进肺癌细胞系的细胞雕亡。对于腺癌患者，magea3的表达与更好的生存期相关。目前，全细胞抗magea3疫苗正在有前途的iii期临床试验中进行研究，用于治疗nsclc(perezetal.,2011；reck,2012；halletal.,2013；grahetal.,2014；liuetal.,2015b)。magea3与其他4个基因被证明在hcc中频繁表达。那些基因的表达与hcc患者的回圈肿瘤细胞数量、高肿瘤分级和较晚期别相关。肝转移的频率被证明在表达mage3的肿瘤样本的病例中显著高于那些不表达该基因的病例(bahnassyetal.,2014；hasegawaetal.,1998)。从膀胱癌细胞系以及肺癌、结肠癌或乳腺癌细胞系分离出来的癌干细胞样侧群细胞显示表达其他癌症-睾丸抗原中的magea3。总体来说，癌症干细胞已知为对当前癌症治疗产生抗性，并导致治疗后癌症复发和进展。因此，magea3可作为免疫治疗特别是膀胱癌治疗的新靶点(yamadaetal.,2013；yinetal.,2014)。在头颈部鳞状细胞癌中，magea3的表达被证明与更好的无病生存期相关(zamuneretal.,2015)。此外，magea3可用作卵巢癌的预后标志物(szajniketal.,2013)。magea4，也被称为mage4，编码magea基因家族的一员，位于染色体xq28上(refseq,2002)。magea4被描述为一种癌症睾丸抗原，发现于在一小部分典型精原细胞瘤中表达，但不在非精睾丸生殖细胞肿瘤中表达，在乳腺癌、霍奇金淋巴瘤eb病毒阴性病例、食管癌、肺癌、膀胱癌、头颈部癌、结直肠癌、口腔鳞状细胞癌和肝细胞癌中表达(riesetal.,2005；bodeetal.,2014；lietal.,2005；ottavianietal.,2006；hennardetal.,2006；chenetal.,2003)。magea4被证明在头颈部原发性黏膜黑色素瘤中频繁表达，因此可能是基于癌症睾丸抗原的免疫治疗的潜在靶标(prasadetal.,2004)。magea4被证明在来自lhk2肺腺癌细胞的癌干细胞样细胞、sw480结肠腺癌细胞和mcf7乳腺癌细胞中优先表达(yamadaetal.,2013)。magea4在自发转化的正常口腔角质中过度表达表明可通过阻止细胞周期阻滞和通过抑制p53转录靶标bax和cdkn1a介导的细胞雕亡而促进生长(bhanetal.,2012)。magea4被证明在丙型肝炎病毒感染的肝硬化和晚期肝细胞癌患者中比早期肝细胞癌患者中更频繁表达，从而使magea4转录物的检测潜在有助于预测预后(husseinetal.,2012)。magea4被证明是几种癌症/睾丸抗原之一，其在肺癌中表达并可作为肺癌患者的多价免疫治疗的潜在候选抗原(kimetal.,2012)。magea4被描述为在食管癌和肝细胞癌中上调(zhaoetal.,2002；wuetal.,2011)。称为p286-1y2l9l的magea4衍生原生肽类似物被描述为适用于开发针对食管癌肽疫苗的一个新候选表位(wuetal.,2011)。magea6编码黑素瘤相关抗原家族成员a6。magea3被广泛地称为癌-睾丸抗原(refseq,2002；pinedaetal.,2015；deetal.,1994)。magea6被证明在黑色素瘤、晚期骨髓瘤、儿童横纹肌肉瘤、肉瘤、肺癌、膀胱癌、前列腺癌、乳腺癌、结直肠癌、头颈部鳞状上皮细胞癌、食道鳞状细胞癌、口腔鳞状细胞癌中频繁表达(riesetal.,2005；hasegawaetal.,1998；gibbsetal.,2000；dalerbaetal.,2001；otteetal.,2001；vanderbruggenetal.,2002；linetal.,2004；tanakaetal.,1997)。magea6表达与多发性骨髓瘤患者较短的无进展生存期有关。相比较而言，在头颈部鳞状细胞癌中，magea6的表达被证明与更好的无病生存期相关(vanetal.,2011；zamuneretal.,2015)。magea6是在耐紫杉醇卵巢癌细胞系中过度表达的一组基因中的一员。此外，magea6转染也增加了紫杉醇敏感性细胞的耐药性(duanetal.,2003)。magea6可用作卵巢癌的预后标志物(szajniketal.,2013)。从肺、结肠或乳腺癌细胞系分离出来的癌干细胞样侧群细胞显示表达其他癌症-睾丸抗原中的magea6(yamadaetal.,2013)。mageb2被归类为癌症睾丸抗原，因为它在睾丸和胎盘、很大一部分各种组织学类型肿瘤以及其他多发性骨髓瘤和头颈部鳞状细胞癌中表达(pattanietal.,2012；vanetal.,2011)。melk编码母系胚胎亮氨酸拉链激酶，位于染色体区域9p13.2上(refseq,2002)。melk是丝氨酸-苏氨酸激酶snf1/ampk家族的成员，是一种细胞周期依赖性蛋白激酶。它在增殖、细胞周期进程、有丝分裂和剪接体装配等多个细胞过程中起着关键的作用，并且近来已经在多种癌症干细胞中作为癌基因和生物标志物出现(duetal.,2014)。melk在包括结肠癌、胃癌、乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌和脑癌在内的多种癌症中过量表达，并且过量表达与预后不良相关(pickardetal.,2009；kuneretal.,2013；guetal.,2013；liuetal.,2015a)。melk的抑制作用正在作为包括乳腺癌、肺癌和前列腺癌在内的多种癌症的治疗策略进行研究。melk-t1抑制催化活性和melk蛋白稳定性，并可能通过降低dna损伤阈值使肿瘤对dna损伤剂或放射疗法敏感。melk抑制剂otssp167正在进行i期临床试验(chungetal.,2012b；gangulyetal.,2014；bekeetal.,2015)。mex3a编码mex-3rna结合家族的成员，其由募集至处理小体的进化保守的rna结合蛋白组成，并且可能参与转录后调节机制(buchet-poyauetal.,2007)。mex3a过度表达，并且改进因在于晚期复发相关的wilms肿瘤中扩增(krepischietal.,2016)。mex3a通过影响肠分化、极性和干细胞特性的转录后机制调节cdx2，这有助于肠内稳态和致癌作用(pereiraetal.,2013)。mmp-11，也称为基质溶素-3，为属于蛋白酶超家族基质溶素子亚组的一员，这已在癌症细胞、基质细胞和邻近微环境中检测到。不同的是，mmp-11对肿瘤具有双重作用。一方面，mmp-11通过抑制细胞雕亡以及增强癌细胞的迁移和侵袭促进癌症进展；另一方面，在动物模型中，mmp-11通过抑制转移而对癌症发展起着负作用。与正常对照组相比，mmp-11在癌症患者的血清中发现呈过度表达，在多种肿瘤组织样本(如胃癌、乳腺癌和胰腺癌)中也呈过度表达(zhangetal.,2016c)。mmp-11被证明与相应的正常粘膜相比在crc组织中在mrna水准和蛋白水准呈过度表达。此外，mmp-11的表达与crc淋巴结转移、远处转移和tnm分期相关(tianetal.,2015)。mmp-11过度表达与上尿路尿道上皮细胞癌(utuc)和膀胱尿道上皮细胞癌(ubuc)的侵袭性肿瘤表现型和不良临床结果相关，这表明它可作为一种新的预后和治疗靶标(lietal.,2016d)。mmp12(也称为mme)编码基质金属蛋白酶家族的成员，其在正常生理过程(如胚胎发育、生殖和组织重塑)以及疾病过程(如关节炎和转移)中参与细胞外基质的破坏(refseq,2002)。在不同癌症实体中显示mmp12失调。mmp12在肺癌、皮肤癌、胰腺癌和胃癌中表达上调，并与肿瘤侵袭和转移有关。相反，在胃癌和结直肠癌中发现mmp12mrna过量表达，并且与预后较好相关(zhangetal.,2007；yangetal.,2001；balazetal.,2002；zhengetal.,2013；wenandcai,2014；zhangetal.,2015f)。mmp12通过nf-κb/mapk和jnk/ap-1途径被tnf-α或egf上调(yuetal.,2010；yangetal.,2012)。myo3b编码肌球蛋白iiib——肌球蛋白类的成员，其特征在于有一个氨基端激酶结构域，并显示出现在光感受器中(refseq,2002)。myo3b被鉴定为her2+细胞系中曲妥珠单抗治疗的拮抗剂(lapinetal.,2014)。前列腺癌放疗后发现myob3基因中的核苷酸多态性与aua症状评分的变化有关(kernsetal.,2013)。nfe2l3编码核因子红细胞2样3——帽和领(cap'n'colla)碱性区域亮氨酸拉链转录因子家族成员(refseq,2002)。最近的研究表明，nfe2l3损失容易使小鼠发生淋巴瘤。其他人观察到在结肠癌细胞中有高水准的nfe2l3，而nfe2l3的异常表达发现于霍奇金淋巴瘤中。此外，nfe2l3在er阳性肿瘤中显示出超甲基化(kuppersetal.,2003；chevillardetal.,2011；palmaetal.,2012；rauscheretal.,2015)。nlrp2(也称为nalp2)编码nlr家族——含热蛋白结构域(pyrindomain)2蛋白，参与胱天蛋白酶-1的活化，并且还可形成启动促炎性胱天蛋白酶的蛋白质复合体。nlrp7是nlrp2的旁系同源物(refseq,2002；wuetal.,2010；slimetal.,2012)。nlrp2的pyrin结构域抑制胶质母细胞瘤的细胞增殖和肿瘤生长(wuetal.,2010)。atm/nlrp2/mdc1依赖性途径可能会关闭应对染色体断裂的核糖体基因转录(kruhlaketal.,2007)。nlrp2突变可引起罕见的人类印迹障碍，如家族性葡萄胎、beckwith-wiedemann综合征和家族性短暂性新生儿糖尿病(aghajanovaetal.,2015；diasandmaher,2013；ulkeretal.,2013)。nlrp2抑制活化(kinoshitaetal.,2005；kinoshitaetal.,2006；fontalbaetal.,2007；brueyetal.,2004)。nlrp7编码包含nlr家族热蛋白结构域(pyrindomain)蛋白7——nacht、富含亮氨酸重复和含有pyd(nlrp)蛋白质家族的成员，其可能充当胱天蛋白酶-1-依赖性白细胞介素1-β分泌的回馈调节剂(refseq,2002)。nlrp7的表达与子宫内膜癌的肿瘤浸润深度和预后差异显著相关，被确定为胚胎癌中高表达的基因之一(ohnoetal.,2008；skotheimetal.,2005)。nlrp7可能在睾丸肿瘤发生的细胞增殖中起关键作用，并且代表睾丸生殖细胞肿瘤的有前景的治疗靶标(okadaetal.,2004)。ovgp1或输卵管特异性糖蛋白编码大的富含碳水化合物的上皮糖蛋白，其由非纤毛输卵管上皮细胞分泌并与排卵的卵母细胞、卵裂球和精子跨体区域相关联(refseq,2002)。ovgp1增加被证明与子宫内膜增生和子宫内膜癌的发生相关(wooetal.,2004)。ovgp1被描述为子宫内膜肿瘤发生的分子标志物和不同卵巢癌的基于分化的标志物(maines-bandieraetal.,2010；wangetal.,2009)。page2编码page蛋白家族的成员，其主要在睾丸中表达(brinkmannetal.,1998)。在结直肠癌细胞的自发分化过程中，癌-睾丸基因page2通过去甲基化被上调，导致间质-上皮转化(met)。因此，在emt中显示page2下调(yilmaz-ozcanetal.,2014)。全基因组筛查将page2鉴定为人类细胞中端粒信号传导的可能调节因子(leeetal.,2011)。pnoc编码孤啡肽前体，它是一种经蛋白水解处理产生多种蛋白质产物的前蛋白原。这些产物包括痛敏肽、痛稳素和孤啡肽fq2(ofq2)。痛敏肽也称为孤啡肽fq，是一种17-氨基酸神经肽，与痛敏肽受体结合以诱导疼痛敏感性增加，并且还可以调节体温、学习和记忆以及饥饿。编码的前原蛋白的另一种产物痛稳素可抑制痛敏肽的作用(refseq,2002)。抑制癌症疼痛也可抑制肿瘤生长和肺转移。pnoc参与吗啡耐受性的发展。pnoc参与神经元生长。pnoc参与细胞损伤、活力、炎症和免疫功能受损(caputietal.,2013；chanetal.,2012；kirkovaetal.,2009；kuraishi,2014；stameretal.,2011)。pnoc在神经节胶质瘤中上调。pnoc表达在末期癌症中下调。pnoc在肝细胞癌患者的血浆中高表达(chanetal.,2012；stameretal.,2011；horvathetal.,2004；spadaroetal.,2006；szalayetal.,2004)。cebranopadol是一种镇痛pnoc肽，可用于骨癌治疗，丁丙诺啡用于肺癌治疗(davis,2012；linzetal.,2014)。pnoc参与c-fos表达(gottliebetal.,2007；kazietal.,2007)。prame编码在人黑色素瘤中优先表达的抗原，并且充当视黄酸受体的抑制因子，可能通过该功能赋予癌细胞生长优势(refseq,2002)。prame在多发性骨髓瘤、透明细胞肾细胞癌、乳腺癌、急性骨髓性白血病、黑色素瘤、慢性粒细胞白血病、头颈部鳞状细胞癌和骨肉瘤细胞系中上调(dannenmannetal.,2013；yaoetal.,2014；zouetal.,2012；szczepanskiandwhiteside,2013；zhangetal.,2013；beardetal.,2013；abdelmalaketal.,2014；qinetal.,2014)。prame与黏液样和圆形细胞脂肪肉瘤相关(hemmingeretal.,2014)。prame与接受r-chop治疗的弥漫性大b细胞淋巴瘤的较短无进展生存期和化疗反应、头颈部鳞状细胞癌不良预后的指标、尿路上皮癌的化疗反应不佳以及骨肉瘤的不良预后和肺转移相关(tanetal.,2012；dyrskjotetal.,2012；szczepanskietal.,2013；mitsuhashietal.,2014)。prame与急性淋巴细胞性白血病的较低复发、较低死亡率和总生存率相关(abdelmalaketal.,2014)。prame可能是接受r-chop疗法治疗的弥漫性大b细胞淋巴瘤的预后标志物(mitsuhashietal.,2014)。rad54编码属于dead样解旋酶家族的一种蛋白质。酿酒酵母rad54和rdh54具有相似性，两者均参与dna同源重组和修复。该蛋白结合至双链dna，并在存在dna时显示atp酶活性。该基因在睾丸和脾脏中高度表达，这表明在减数分裂和有丝分裂重组中具有活性作用(refseq,2002)。在原发性淋巴瘤和结肠癌中观察到了rad54b的纯合突变(hiramotoetal.,1999)。rad54b抵消了人类肿瘤细胞中rad51直接结合至dsdna的基因组不稳定影响(masonetal.,2015)。rnf17编码环指蛋白17，其与编码含有环指状结构域的睾丸特异性蛋白的小鼠基因相似。另外，已发现了编码不同异构体的剪接转录变体(refseq,2002)。rnf17参与细胞因子的产生和雕亡。rnf17增强c-myc的功能(jnawalietal.,2014；leeetal.,2013；yinetal.,1999；yinetal.,2001)。rhoxf1敲减后rnf17上调(seifi-alanetal.,2014)。rnf17在肝癌中表达(yoonetal.,2011)。rnf17是一种癌症相关标志物(dematosetal.,2015)。sdk2编码附体细胞黏附分子2，其是包含两个免疫球蛋白结构域和代表dna、肝素和细胞表面结合位点的十三个纤连蛋白iii型结构域的免疫球蛋白超家族成员(refseq,2002)。研究显示，sdk2将轴索末端引导至正在发育神经元中的特定突触，并促进内网状层中视网膜树突的特异性靶向作用(kaufmanetal.,2004；yamagataandsanes,2012)。spdef(也称为pdef)编码含有ets转录因子的sam指向结构域，ets转录因子是e26转录特异性(ets)转录因子家族的成员。它在前列腺上皮细胞中高度表达，其作为前列腺特异性抗原(psa)启动子的雄激素非依赖型反式启动因子(refseq,2002)。spdef表达在肿瘤进展后期往往丢失或下调，这意味着它在肿瘤细胞侵袭和转移中起作用。在肿瘤进展的早期阶段，spdef有时被上调。针对包括乳腺癌、前列腺癌和结直肠癌在内的多种癌症实体描述了spdef的失调(moussaetal.,2009；schaeferetal.,2010；steffanandkoul,2011)。spdef诱导e-钙黏蛋白的转录并抑制细胞侵袭和迁移(paletal.,2013)。spdef与β-连环蛋白相互作用并阻断转录活性，导致癌基因细胞周期蛋白d1和c-myc的蛋白水准较低(noahetal.,2013)。spon1编码spondin1，位于染色体区域11p15.2上(refseq,2002)。spon1参与癌细胞增殖、迁移、侵袭和转移。spon1参与fak和src信号传导。spon1通过mekk/p38mapk/nf-κb信号途径参与il-6的维持，这可以支持鼠神经母细胞瘤的生存(changetal.,2015a；chengetal.,2009；daietal.,2015)。spon1被mir-506下调(daietal.,2015)。spon1在卵巢癌中过量表达(davidsonetal.,2011；jiaoetal.,2013；pyle-chenaultetal.,2005)。spon1可能在癌症预后方面具有诊断潜力(pagnottaetal.,2013)。stag3编码基质抗原3，其在细胞核中表达并且是在细胞分裂过程中调节姐妹染色单体内聚力的黏附素复合体的亚基(refseq,2002)。研究人员报告了一种常见的stag3等位基因参与上皮性卵巢癌的发生。另一组确定了stag3能够有效区分肺癌、慢性阻塞性肺病和纤维化间质性肺病。其他人在p53突变的淋巴瘤细胞中检测到了stag3基因表达(notaridouetal.,2011；wielscheretal.,2015；kalejsetal.,2006)。tdrd5编码含tudor结构域蛋白5，并位于染色体区域1q25.2上(refseq,2002)。tdrd5可能在乳腺癌中过量表达(jiangetal.,2016)。三重阴性乳腺癌中，白藜芦醇治疗后tdrd5发生甲基化改变(medina-aguilaretal.,2017)。tdrd5是与甲状腺癌相关的纯合子的一部分(thomsenetal.,2016)。tenm4编码在神经系统和间充质组织中表达的teneurin跨膜蛋白4，并且是软骨形成的调节因子(suzukietal.,2014)。在四个最频繁突变的基因中，tenm4在原发性cns淋巴瘤中表现出蛋白改变性突变(vateretal.,2015)。mda-mb-175细胞系含有一个染色体易位，导致tenm4和erbb家族受体融合。在神经母细胞瘤中也发现嵌合基因(wangetal.,1999；boevaetal.,2013)。tmprss3编码跨膜蛋白酶丝氨酸3，其是属于丝氨酸蛋白酶家族的蛋白质。编码的蛋白质含有丝氨酸蛋白酶结构域、跨膜结构域、ldl受体样结构域和清道夫受体半胱氨酸富集结构域。已知丝氨酸蛋白酶参与各种生物学过程，其失常经常导致人类疾病和紊乱。该基因与先天性和儿童期常染色体隐性遗传耳聋相关。该基因在胎儿耳蜗等多种组织中表达，被认为参与内耳的发育和维持或外淋巴和内淋巴的内容物形成。该基因也被鉴定为在卵巢肿瘤中过量表达的肿瘤相关基因(refseq,2002)。tmprss3参与细胞增殖、侵袭和迁移。tmprss3诱导erk1/2信号传导(zhangetal.,2016a)。tmprss3影响e-钙黏蛋白、波形蛋白和twist表达。tmprss3被六亚甲基双乙酰胺下调(zhangetal.,2016a；zhangetal.,2004)。tmprss3在乳腺癌、胰腺癌和卵巢癌中上调。tmprss3在胃癌和胰腺导管腺癌中失调(ruietal.,2015；zhangetal.,2016a；zhangetal.,2004；amsterdametal.,2014；iacobuzio-donahueetal.,2003；luoetal.,2017；underwoodetal.,2000；wallrappetal.,2000)。tmprss3与tnm分期、淋巴结转移、远处器官转移、生存期较短、无病生存期较短和预后差有关。tmprss3可用作癌症的生物标志物。tmprss3突变与癌症风险有关。tmprss3可用于早期胰腺导管腺癌检测(ruietal.,2015；amsterdametal.,2014；luoetal.,2017；dornetal.,2014；luostarietal.,2014；pelkonenetal.,2015；sawasakietal.,2004)。tmprss3在癌症中低甲基化(guerreroetal.,2012)。vtcn1也称为b7-h4，编码存在于抗原提呈细胞表面的b7共刺激蛋白家族成员，并与结合于t细胞表面受体的配体相互作用(refseq,2002)。vtcn1被证明在肺癌、结直肠癌、肝细胞癌、骨肉瘤、乳腺癌、宫颈癌、尿路上皮细胞癌、胃癌、子宫内膜癌、甲状腺癌和喉癌中上调(klatkaetal.,2013；zhuetal.,2013；vanderstraetenetal.,2014；shietal.,2014；fanetal.,2014；wangetal.,2014；leongetal.,2015；dongandma,2015；zhangetal.,2015a；pengetal.,2015；xuetal.,2015a)。vtcn1与肝细胞癌的较差总体生存和较高复发可能性，骨肉瘤、尿路上皮细胞癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、黑色素瘤和甲状腺癌的较差总体生存相关(zhuetal.,2013；seliger,2014；liuetal.,2014b；chenetal.,2014；fanetal.,2014；dongandma,2015；zhangetal.,2015a)。vtcn1与肾透明细胞癌相关(xuetal.,2014b)。vtcn1表达水准被证明与卵巢癌的患者生存期呈负相关(smithetal.,2014)。vtcn1可能是尿路上皮细胞癌和胃癌的一个潜在预后指标(shietal.,2014；fanetal.,2014)。wnt7a编码wnt家族成员7a，其是wnt基因家族的成员。这些蛋白质涉及肿瘤发生和几个发育过程，包括胚胎发育过程中细胞命运和模式的调节。该基因参与女性生殖道前后轴的发育，并在子宫平滑肌成形和成人子宫功能维持方面起着关键作用。该基因突变与fuhrmann和al-awadi/raas-rothschild/schinzelphocomelia综合征有关(refseq,2002)。wnt7a由stat4诱导，导致癌症相关成纤维细胞的活化。wnt7a增强tgf-β受体信号传导。wnt7a参与细胞增殖和迁移。wnt7a是衰老的上游诱导物。pg545与wnt7a相互作用，导致细胞增殖抑制。wnt7a抑制肿瘤生长。wnt7a参阅wnt/β-连环蛋白信号传导并调节hsa-mir29b(avasaralaetal.,2013；avgustinovaetal.,2016；bikkavillietal.,2015；borowiczetal.,2014；jungetal.,2015；kingetal.,2015；ramos-solanoetal.,2015；zhaoetal.,2017)。wnt7a受mir-15b调控并被dnmt1下调。硫丹干扰wnt7a。wnt7a是mir-199a-5p和mir-195/497的靶基因。wnt7a通过长期乙醇暴露下调并且通过ppar-δ激动剂治疗获救。dkk-1影响wnt7a。银杏内酯可增强wnt7a的表达(kimetal.,2015a；chandraetal.,2014；ingaramoetal.,2016；itesakoetal.,2014；liuetal.,2014a；macleanetal.,2016；merceretal.,2014；merceretal.,2015；xuetal.,2015b)。wnt7a在宫颈癌中下调和高甲基化。wnt7a在肺癌中丢失。wnt7a在子宫内膜癌中过量表达(ramos-solanoetal.,2015；kimetal.,2015b；liuetal.,2013)。wnt7a表达与预后不良和患者结局不良相关。wnt7a启动子甲基化与晚期肿瘤分期、远处转移和e-钙黏蛋白丢失相关。wnt7a表达降低与恶性胸膜间皮瘤总生存率降低相关，可用于预测化疗敏感度(avgustinovaetal.,2016；kingetal.,2015；kimetal.,2015b；hirataetal.,2015)。wnt7a可能是鼻咽癌的肿瘤抑制基因(nawazetal.,2015)。是否能刺激免疫反应取决于是否存在被宿主免疫系统视为异物的抗原。发现肿瘤相关抗原的存在增加了运用宿主免疫系统干预肿瘤生长的可能性。目前，针对癌症免疫治疗，正在探索利用免疫系统的体液和细胞进行免疫的各种机制。细胞免疫反应的特定元素能特异性地识别和破坏肿瘤细胞。从肿瘤浸润细胞群或外周血中分离出的t-细胞表明，这些细胞在癌症的天然免疫防御中发挥了重要作用。特别是cd8阳性t细胞在这种反应中发挥重要作用，tcd8+能识别通常8至10个源自蛋白或位于细胞质的缺损核糖体产物(drip)的氨基酸残基的主要组织兼容性复合体(mhc)所载的肽中所含的i类分子。人mhc分子也称为人白细胞-抗原(hla)。术语“t细胞反应”是指由一种肽在体外或体内诱导的效应子功能的特异性扩散和激活。对于mhci类限制性细胞毒性t细胞，效应子功能可能为溶解肽脉冲的、肽前体脉冲的或天然肽提呈的靶细胞、分泌细胞因子，优选为肽诱导的干扰素-γ，tnf-α或il-2，分泌效应分子，优选为肽诱导的颗粒酶或穿孔素，或脱颗粒。本文所用“肽”这一术语，是指一系列氨基酸残基，通常通过相邻氨基酸的α-氨基和羰基之间的肽键来连接。这些肽的长度优选为9个氨基酸，但至短可为8个氨基酸长度，至长可为10、11、12或13个氨基酸或更长，如果为mhc-ii类肽时(本发明肽的延长变体)，至长可为14、15、16、17、18、19或20个氨基酸长度或更长。因此，“肽”这一术语应包括一系列氨基酸残基的盐，通常通过相邻氨基酸的α-氨基和羰基之间的肽键来连接。优选的情况是，盐为肽的药用盐，例如：氯化物或乙酸(三氟乙酸)盐。必须注意的是，本发明肽的盐与其体内状态的肽基本上不同，因为该不是体内的盐。术语“肽”应也包括“寡肽”。本文使用的术语“寡肽”是指一系列氨基酸残基，通常通过相邻氨基酸的α-氨基和羰基之间的肽键来连接。寡肽的长度对于本发明来说并不十分关键，只要在寡肽中保持正确的表位即可。通常，寡肽长度约小于30个氨基酸残基，约长于15个氨基酸。“多肽”这一术语是指一系列氨基酸残基，通常通过相邻氨基酸的α-氨基和羰基之间的肽键来连接。多肽的长度对于本发明来说并不十分关键，只要保持正确的表位即可。与术语肽或寡肽相对，“多肽”这一术语是指包含多于约30个氨基酸残基的分子。一种肽、寡肽、蛋白质或编码该分子的核苷酸如果能诱导免疫反应，则具有“免疫原性”(因此是本发明中的一种“免疫原”)。在本发明的情况下，免疫原性的更具体定义是诱导t细胞反应的能力。因此，“免疫原”是一种能够诱导免疫反应的分子，并且在本发明的情况下，是一种能诱导t细胞反应的分子。在另一方面，所述免疫原可以是肽，肽与mhc的复合体、和/或用于提高特异性抗体或tcr抗性的蛋白。i类t细胞“表位”要求的是一种结合至mhci类受体上的短肽，从而形成一种三元复合体(mhci类α链、β-2-微球蛋白和肽)，其可以通过t细胞负载匹配t细胞受体与具有适当亲和力的mhc/肽复合物结合来识别。结合至mhci类分子的肽的典型长度为8-14个氨基酸，最典型为9个氨基酸长度。在人类中，有三种编码mhci类分子的不同基因位点(人mhc分子也是指定的人白细胞抗原(hla))：hla-a、hla-b和hla-c。hla-a*01、hla-a*02和hla-b*07是可从这些基因位点表达的不同mhci类等位基因的实例。表6：hla-a*02、hla-a*01、hla-a*03、hla-a*24、hla-b*07、hla-b*08和hla-b*44血清类型的表达频率f。单体型频率gf来源于一项研究，该研究使用了来自美国超过650万名志愿捐献者登记的hla分型资料(gragertetal.,2013)。该单体型频率是个体染色体上独特等位元基因的频率。由于哺乳动物细胞内的二倍体染色体组，该等位元基因的基因型出现频率较高，可以使用hardy-weinberg定律(f＝1–(1-gf)2)进行计算。本发明的肽，优选当如本文描述纳入本发明的疫苗时与a*02、a*01、a*03、a*24、b*07、b*08或b*44结合。疫苗还可能包括泛结合mhcii类肽。因此，本发明的疫苗可用于治疗a*02、a*01、a*03、a*24、b*07、b*08或b*44阳性患者中的癌症，但不因为这些肽的广泛结核性而必须选择ii类mhc同种异型。如果本发明的a*02肽与结合至另一等位基因例如a*24的肽组合，与单独的mhci类等位基因相比，可治疗更高比例的患者群体。虽然在大多数人群中，低于50％的患者可由单独的等位基因来解决问题，但是本发明中一种含hla-a*24和hla-a*02表位的疫苗可以治疗任何相关人群中至少60％的患者。具体来说，各区域中，以下比例的患者这些等位基因中的至少一个有肯定效果：美国61％、西欧62％、中国75％、韩国77％、日本86％(根据www.allelefrequencies.net计算)。表7：欧洲白人人群中hla等位元基因覆盖(根据(gragertetal.,2013)中所述的方法计算)。在一项优选的实施方案中，术语“核苷酸序列”是指脱氧核苷酸的杂聚物。编码特定肽、寡肽或多肽的核苷酸序列可为天然核苷酸序列，也可为合成核苷酸序列。一般来说，编码肽、多肽以及本发明蛋白的dna片段由cdna片段和短寡核苷酸衔接物，或一系列寡核苷酸组成，以提供一种合成基因，该基因能够在包含源自微生物或病毒操纵子的调节元素的重组转录单元中被表达。如本文所用的术语“肽的核苷酸编码”是指对肽进行核苷酸序列编码，其中该肽包括与将由用于产生tcr的树突细胞或另一细胞系统所表达该序列的生物系统兼容的人工(人造)启动密码子和终止密码子。本文提到的核酸序列既包括单链核酸也包括双链核酸。因此，除非本文另有所指，否则，例如对于dna，具体的序列是该序列的单链dna、该序列与其互补序列的双工(双链dna)以及该序列的互补序列。“编码区”这一术语是指在基因的天然基因组环境中天然或正常编码该基因的表达产物的那部分基因，即，体内编码该基因的天然表达产物的区域。编码区可来自非突变(“正常”)基因、突变基因或异常基因，甚至还可以来自dna序列，完全可在实验室中使用本领域熟知的dna合成方法合成。“表达产物”这一术语是指多肽或蛋白，它是基因和遗传码退化并因而编码同样的氨基酸所造成的任何核酸序列编码同等物的翻译产物。“片段”这一术语，当指的是一种编码序列时，表示包含非完整编码区的dna的一部分，其表达产物与完整编码区表达产物基本上具有相同的生物学功能或活性。“dna片段”这一术语是指一种dna聚合物，以单独的片段形式或一种较大dna结构的组分形式存在，它们从至少分离过一次的dna中以基本纯净的形式获得，即不含污染性内源性材料，并且获得的数量或浓度能够使用标准生化方法，例如使用克隆载体，进行识别、操纵和回收该片段及其组分核苷酸序列。此类片段以开放阅读框架(未被内部未翻译序列打断)或内含子(通常提呈于真核基因中)的形式存在。未翻译dna序列可能存在于开放阅读框架的下游，在那里其不会干预编码区的操纵或表达。“引物”这一术语表示一种短核酸序列，其可与一个dna链配对，并在dna聚合酶开始合成脱氧核糖核酸链之处提供一个游离的3'-oh末端。“启动子”这一术语表示参与rna聚合酶的结合从而激活转录的dna区域。术语“分离”表示一种物质从其原来的环境(例如，如果是天然发生的则是天然环境)中被移走。例如，活体动物中的天然核苷酸或多肽不是分离的，但是，从天然系统中一些或所有共存物质中分离出来的核苷酸或多肽是分离的。此类多核苷酸可能是载体的一部分和/或此类多核苷酸和多肽可能是一种组合物的一部分，并且由于该载体或组合物不是其天然环境的一部分，因此它仍然是分离的。本发明中披露的多核苷酸和重组或免疫原性多肽也可能以“纯化”的形式存在。术语“纯化”并非要求绝对的纯度；它只是一个相对的定义，可以包括高度纯化或部分纯化的制剂，相关领域技术人员能理解这些术语。例如，各个从已用传统方法纯化为具有电泳同构型的cdna库中分离出的各种克隆物。明确考虑到将起始材料或天然物质纯化至少一个数量级，优选为两或三个数量级，更优选为四或五个数量级。此外，明确涵盖所述多肽的纯度优选为99.999％，或至少为99.99％或99.9％；甚而适宜为以重量计99％或更高。根据本发明公开的核酸和多肽表达产物，以及包含此类核酸和/或多肽的表达载体可能以“浓缩的形式”存在。本文使用的术语“浓缩”是指材料的浓度至少是其自然浓度的大约2、5、10、100或1000倍，有优势的是，按重量计为0.01％，优选为至少0.1％。也明确考虑到，按重量计约为0.5％、1％、5％、10％和20％的浓缩制剂。序列、构型、载体、克隆物以及包含本发明的其他材料可有优势地以浓缩或分离的形式存在。“活性片段”这一术语是指产生免疫反应的片段(即具有免疫原性活性)，通常是一种肽、多肽或核酸序列的片段，不论是单独或可选地与合适的佐剂一起或在载体中给予一种动物，比如哺乳动物，例如兔子或小鼠，也包括人；这种免疫反应采用的形式是在接受动物(如：人)体内刺激t细胞反应。或者，“活性片段”也可用于诱导体外t细胞反应。本文使用的“部分”(portion)、“节段”(segment)、“片段”(fragment)这几个术语，当与多肽相关地使用时是指残基的连续序列，比如氨基酸残基，其序列形成一个较大序列的子集。例如，如果一个多肽以任一种肽链内切肽酶(如胰蛋白酶或糜蛋白酶)进行处理，则该处理获得的寡肽会代表起始多肽的部分、节段或片段。当与多核苷酸相关地使用时，这些术语是指用任何核酸内切酶处理所述多核苷酸产生的产物。根据本发明，术语“等同度百分比”或“等同百分比”，如果指的是序列，则表示在待对比序列(“被对比序列”)与所述序列或权利要求的序列(“参考序列”)对准之后将被对比序列与所述序列或权利要求的序列进行比较。然后根据下列公式计算等同度百分比：等同度百分比＝100[1-(c/r)]其中c是参考序列与被对比序列之间对准长度上参考序列与被对比序列之间的差异数量，其中(i)参考序列中每个碱基或氨基酸序列在被对比序列中没有对应的对准碱基或氨基酸；(ii)参考序列中每个空隙，以及(iii)参考序列中每个对准碱基或氨基酸与被比对比序列中对准碱基或氨基酸不同，即构成一个差异以及(iiii)必须在对准序列的第1位置开始对准；并且r是参考序列与被对比序列对准长度上在参考序列中产生任何空隙也计算为一个碱基或氨基酸的参考序列中的碱基或氨基酸数目。如果“被对比序列”和“参考序列”之间存在的一个对准按上述计算的等同度百分比大致等于或大于指定的最低等同度百分比，则被对比序列与参考序列具有指定的最低等同度百分比，虽然可能存在按本文上述计算的等同度百分比低于指定等同度百分比的对准。因此，如上所述，本发明提出了一种肽，其包括选自seqidno:1至seqidno:772的一个序列、或与seqidno:1至seqidno:772具有88％同源性的其变体、或诱导与该肽发生t细胞交叉反应的一个变体。本发明所述的肽具有与主要组织兼容性复合体(mhc)i或所述肽延长版本的ii类分子结合的能力。在本发明中，“同源性”一词是指两个氨基酸序列之间的同一度(参见上文的等同度百分比，如肽或多肽序列。前文所述的“同源”是通过将理想条件下调整的两个序列与待比较序列进行比对后确定的。此类序列同源性可通过使用clustalw等算法创建一个排列而进行计算。也可用使用一般序列分析软件，更具体地说，是vectornti、genetyx或由公共数据库提供的其他工具。本领域技术人员能评估特定肽变体诱导的t细胞是否可与该肽本身发生交叉反应(appayetal.,2006；colombettietal.,2006；fongetal.,2001；zarembaetal.,1997)。发明人用给定氨基酸序列的“变体”表示，一个或两个氨基酸残基等的侧链通过被另一个天然氨基酸残基的侧链或其他侧链取代而发生改变，这样，这种肽仍然能够以含有给定氨基酸序列(由seqidno:1至seqidno:772组成)的肽大致同样的方式与hla分子结合。例如，一种肽可能被修饰以便至少维持(如没有提高)其能与hla-a*02或-dr等合适mhc分子的结合槽相互作用和结合，以及至少维持(如没有提高)其与激活t细胞的tcr结合的能力。随后，这些t细胞可与细胞和杀伤细胞发生交叉反应，这些细胞表达多肽(其中包含本发明中定义的同源肽的天然氨基酸序列)。正如科学文献和数据库(rammenseeetal.,1999；godkinetal.,1997)中所述，hla-a结合肽的某些位点通常为锚定残基，可形成一种与hla结合槽的结合模序相称的核心序列，其定义由构成结合槽的多肽链的极性、电物理、疏水性和空间特性确定。因此，本领域技术人员能够通过保持已知的锚残基来修饰seqidno:1至seqidno:772提出的氨基酸序列，并且能确定这些变体是否保持与mhci或ii类分子结合的能力。本发明的变体保持与激活t细胞的tcr结合的能力，随后，这些t细胞可与表达一种包含本发明定义的同源肽的天然氨基酸序列的多肽的细胞发生交叉反应并杀死该等细胞。如果无另有说明，那么本文公开的原始(未修饰)肽可以通过在肽链内的不同(可能为选择性)位点上取代一个或多个残基而被修饰。优选情况是，这些取代位于氨基酸链的末端。此取代可能是保守性的，例如，其中一个氨基酸被具有类似结构和特点的另一个氨基酸所取代，比如其中一个疏水性氨基酸被另一个疏水性氨基酸取代。更保守的取代是具有相同或类似的大小和化学性质的氨基酸间的取代，例如，亮氨酸被异亮氨酸取代。在天然同源蛋白质家族序列变异的研究中，某些氨基酸的取代往往比其他氨基酸更具有耐受性，这些氨基酸往往表现出与原氨基酸的大小、电荷、极性和疏水性之间的相似性相关，这是确定“保守取代”的基础。在本文中，保守取代定义为在以下五种基团之一的内部进行交换：基团1—小脂肪族、非极性或略具极性的残基(ala,ser,thr,pro,gly)；基团2—极性、带负电荷的残基及其酰胺(asp,asn,glu,gln)；基团3—极性、带正电荷的残基(his,arg,lys)；基团4—大脂肪族非极性残基(met,leu,ile,val,cys)以及基团5—大芳香残基(phe,tyr,trp)。较不保守的取代可能涉及一个氨基酸被另一个具有类似特点但在大小上有所不同的氨基酸所取代，如：丙氨酸被异亮氨酸残基取代。高度不保守的取代可能涉及一个酸性氨基酸被另一个具有极性或甚至具有碱性性质的氨基酸所取代。然而，这种“激进”取代不能认为是无效的而不予考虑，因为化学作用是不完全可预测的，激进的取代可能会带来其简单化学原理中无法预见的偶然效果。当然，这种取代可能涉及普通l-氨基酸之外的其他结构。因此，d-氨基酸可能被本发明的抗原肽中常见的l-氨基酸取代，也仍在本公开的范围之内。此外，非标准氨基酸(即，除了常见的天然蛋白原氨基酸)也可以用于取代之目的，以生产根据本发明的免疫原和免疫原性多肽。如果在一个以上位置上的取代发现导致肽的抗原活性基本上等于或大于以下定义值，则对这些取代的组合进行测试，以确定组合的取代是否产生对肽抗原性的迭加或协同效应。肽内被同时取代的位置最多不能超过4个。基本上由本文所指氨基酸序列组成的一种肽可能有一个或两个非锚定氨基酸(见下面锚基序相关内容)被交换，而不存在这种情况，即相比于未修饰的肽，与人类主要组织兼容性复合体(mhc)–i或ii类分子的能力基本上被改变或受到不利影响。在另一实施方案中，在基本上由本文所述氨基酸序列组成的肽中，一个或两个氨基酸可与其保守交换伙伴交换(见下文)，而不存在这种情况，即相比于未修饰的肽，与人类主要组织兼容性复合体(mhc)–i或ii类分子的能力基本上被改变或受到不利影响。这些基本不与t细胞受体互动的氨基酸残基可通过取代其他几乎不影响t细胞反应并不妨碍与相关mhc结合的氨基酸而得到修饰。因此，除了特定限制性条件外，本发明的肽可能为任何包括给定氨基酸序列或部分或其变体的肽(发明人所用的这个术语包括寡肽或多肽)。表8：根据seqidno:3、225、13、17、84、108、113、114、147、36、51、172、54和57的肽的变体和基序较长(延长)的肽也可能适合。mhci类表位(通常长度为8至11个氨基酸)可能由肽从较长的肽或包含实际表位的蛋白中加工而产生。两侧有实际表位的残基优选为在加工过程中几乎不影响暴露实际表位所需蛋白裂解的残基。本发明的肽可被延长多达四个氨基酸，即1、2、3或4个氨基酸，可按照4:0与0:4之间的任何组合添加至任意一端。本发明的延长组合可见表9。表9：本发明肽的延长组合c-端n-端4030或120或1或210或1或2或300或1或2或3或4n-端c-端4030或120或1或210或1或2或300或1或2或3或4拉伸/延长的氨基酸可以是所述蛋白或任何其他氨基酸的原序列肽。延长可用于增强所述肽的稳定性或溶解性。因此，本发明所述的表位可能与天然肿瘤相关表位或肿瘤特异性表位相同，也可能包括来自参考肽的不超过四个残基的不同肽，只要它们有基本相同的抗原活性即可。在一项替代实施方案中，肽的一边或双边被延长4个以上的氨基酸，优选最多30个氨基酸的总长度。这可形成mhc-ii类结合肽。结合至mhcii类肽可通过本领域中已知的方法进行测试。因此，本发明提出了mhci类表位的肽和变体，其中所述肽或抗体的总长度为8至100个、优选为8至30个、最优选为8至14个氨基酸长度(即8、9、10、11、12、13、14个氨基酸，如果为延长ii类结合肽时，长度也可为15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个氨基酸)。当然，本发明的肽或变体能与人主要组织兼容性复合体(mhc)i或ii类分子结合。肽或变体与mhc复合物的结合可用本领域内的已知方法进行测试。优选情况是，当本发明的肽特异性t细胞相比于取代肽受到检测时，如果取代肽在相对于背景肽溶解度增加达到最大值的一半，则该肽浓度不超过约1mm，优选为不超过约1μm，更优选为不超过约1nm，再优选为不超过约100pm，最优选为不超过约10pm。也优选为，取代肽被一个以上的t细胞识别，最少为2个，更优选为3个。在本发明的一个特别优选实施方案中，肽由或基本由根据seqidno:1至seqidno:772所选的氨基酸序列组成。“基本由...组成”是指本发明的肽，除了根据seqidno:1至seqidno:772中的任一序列或其变体组成外，还含有位于其他n和/或c端延伸处的氨基酸，而它们不一定能形成作为mhc分子表位的肽。但这些延伸区域对有效将本发明中的肽引进细胞具有重要作用。在本发明的一实施例中，该肽为融合蛋白的一部分，含来自ncbi、genbank登录号x00497的hla-dr抗原相关不变链(p33，以下称为“ii”)的80个n-端氨基酸等。在其他的融合中，本发明的肽可以被融合到本文所述的抗体、或其功能性部分，特别是融合入抗体的序列，以便所述抗体进行特异性靶向作用，或者，例如进入本文所述的树突状细胞特异性抗体。此外，该肽或变体可进一步修饰以提高稳定性和/或与mhc分子结合，从而引发更强的免疫反应。肽序列的该类优化方法是本领域内所熟知的，包括，例如，反式肽键和非肽键的引入。在反式肽键氨基酸中，肽(-co-nh-)并未连接其残基，但是其肽键是反向的。这种逆向反向模拟肽(retro-inversopeptidomimetics)可通过本领域已知的方法制备，例如：meziere等人在(meziereetal.,1997)中所述的方法，以引用的方式并入本文。这种方法涉及制备包含骨架(而并非侧链)改变的模拟肽。meziere等人(meziereetal.,1997)的研究显示，这些模拟肽有利于mhc的结合和辅助性t细胞的反应。以nh-co键替代co-nh肽键的逆向反向肽大大地提高了抗水解性能。非肽键为-ch2-nh、-ch2s-、-ch2ch2-、-ch＝ch-、-coch2-、-ch(oh)ch2-和-ch2so-等。美国4897445号专利提出了多肽链中非肽键(-ch2-nh)的非固相合成法，该方法涉及按标准程序合成的多肽以及通过氨基醛和一种含nacnbh3的氨基酸相互作用而合成的非肽键。含上述序列的肽可与其氨基和/或羧基末端的其他化学基团进行合成，从而提高肽的稳定性、生物利用度、和/或亲和力等。例如，苄氧羰基、丹酰基等疏水基团或叔丁氧羰基团可加入肽的氨基末端。同样，乙酰基或9-芴甲氧羰基可能位于肽的氨基末端。此外，疏水基团、叔丁氧羰基团或氨基团都可能被加入肽的羧基末端。另外，本发明中的所有肽都可能经合成而改变其空间构型。例如，可能使用这些肽的一个或多个氨基酸残基的右旋体，通常不是其左旋体。更进一步地，本发明中肽的至少一个氨基酸残基可被熟知的一个非天然氨基酸残基取代。诸如此类的改变可能有助于增加本发明肽的稳定性、生物利用度和/或结合作用。同样，本发明中的肽或变体可在合成肽之前或之后通过特异氨基酸的反应而进行化学修饰。此类修饰的实施例为本领域所熟知，例如，在r.lundblad所著的《chemicalreagentsforproteinmodification》(3rded.crcpress,2004)(lundblad,2004)中有概述，以参考文献的方式并入本文。虽然氨基酸的化学修饰方法无限制，但其包括(但不限于)通过以下方法修饰：酰基化、脒基化、赖氨酸吡哆基化、还原烷基化、以2,4,6-三硝基苯磺酸(tnbs)三硝基苯基化氨基团、通过将半胱氨酸过甲酸氧化为磺基丙氨酸而对羧基团和巯基进行氨基修饰、形成易变衍生物、与其他巯基化合物形成混合二硫化合物、与马来酰亚胺反应，与碘乙酸或碘乙酰胺羧甲基化、在碱性ph值下与氰酸盐甲氨酰化。在这方面，技术人员参考了《currentprotocolsinproteinscience》(eds.coliganetal.(johnwileyandsonsny1995-2000))(coliganetal.,1995)中第15章所述的在蛋白质化学修饰相关的广泛方法。简言之，修饰蛋白质的精氨酰残基等往往基于于邻二羰基化合物(如苯甲酰甲醛、2,3–丁二酮以及1,2-烯巳二酮)的反应而形成加合物。另一个实施例是丙酮醛与精氨酸残基的反应。半胱氨酸可在赖氨酸和组氨酸等亲核位点不作随同修饰的情况下就得到修饰。因此，有大量试剂可进行半胱氨酸的修饰。sigma-aldrich(http://www.sigma-aldrich.com)等公司的网站含有具体试剂的信息。蛋白质中二硫键的选择性还原也很普遍。二硫键可在生物制药热处理中形成和氧化。伍德沃德氏试剂k可用于修饰特定的谷氨酸残基。n-(3-二甲氨基丙基)-n′-乙基-碳二亚胺可用于形成赖氨酸残基和谷氨酸残基的分子内交联。例如：焦碳酸二乙酯是修饰蛋白质组氨酸残基的试剂。组氨酸也可使用4-羟基-2-壬烯醛进行修饰。赖氨酸残基与其他α-氨基团的反应，例如，有利于肽结合到蛋白/肽的表面或交联处。赖氨酸聚是多(乙烯)乙二醇的附着点，也是蛋白质糖基化的主要修饰位点。蛋白质的蛋氨酸残基可通过碘乙酰胺、溴乙胺、氯胺t等被修饰。四硝基甲烷和n-乙酰基咪唑可用于酪氨酸残基的修饰。经二酪氨酸形成的交联可通过过氧化氢/铜离子完成。对色氨酸修饰的最近研究中使用了n-溴代琥珀酰亚胺、2-羟基-5-硝基苄溴或3-溴-3-甲基-2-(2–硝苯巯基)-3h-吲哚(bpns-粪臭素)。当蛋白与戊二醛、聚乙二醇二丙烯酸酯和甲醛的交联用于配制水凝胶时，治疗性蛋白和含聚乙二醇的肽的成功修饰往往可延长循环半衰期。针对免疫治疗的变态反应原化学修饰往往通过氰酸钾的氨基甲酰化实现。一种肽或变体，其中肽被修饰或含非肽键，优选为本发明的实施例。本发明的另一实施方案涉及一种非天然肽，其中所述肽由或基本由根据seqidno:1至seqidno:772的氨基酸序列组成，并经合成产生(即，合成)为一种药用盐。合成产生肽的方法是本领域公知的。本发明肽的盐与其体内状态的肽基本上不同，因为这些体内产生的肽不是盐。该肽的非天然盐形式介导肽的溶解度，特别是包含所述肽的药物组合物的情况下，例如，本文所公开的肽疫苗。为了向需治疗的受试者有效地提供肽，需要肽具有充分、至少基本的溶解度。优选地，盐为肽的药用盐。本发明的这些盐包括碱和碱土盐类，诸如hofmeister系列的盐，包含阴离子po43-、so42-、ch3coo-、cl-、br-、no3-、clo4-、i-、scn-和阳离子nh4+、rb+、k+、na+、cs+、li+、zn2+、mg2+、ca2+、mn2+、cu2+和ba2+。特别地，盐选自(nh4)3po4、(nh4)2hpo4、(nh4)h2po4、(nh4)2so4、nh4ch3coo、nh4cl、nh4br、nh4no3、nh4cio4、nh4i、nh4scn、rb3po4、rb2hpo4、rbh2po4、rb2so4、rb4ch3coo、rb4cl、rb4br、rb4no3、rb4cio4、rb4i、rb4scn、k3po4、k2hpo4、kh2po4、k2so4、kch3coo、kcl、kbr、kno3、kclo4、ki、kscn、na3po4、na2hpo4、nah2po4、na2so4、nach3coo、nacl、nabr、nano3、nacio4、nai、nascn、znci2cs3po4、cs2hpo4、csh2po4、cs2so4、csch3coo、cscl、csbr、csno3、cscio4、csi、csscn、li3po4、li2hpo4、lih2po4、li2so4、lich3coo、licl、libr、lino3、liclo4、lii、liscn、cu2so4、mg3(po4)2、mg2hpo4、mg(h2po4)2、mg2so4、mg(ch3coo)2、mgcl2、mgbr2、mg(no3)2、mg(clo4)2、mgi2、mg(scn)2、mncl2、ca3(po4),、ca2hpo4、ca(h2po4)2、caso4、ca(ch3coo)2、cacl2、cabr2、ca(no3)2、ca(clo4)2、cai2、ca(scn)2、ba3(po4)2、ba2hpo4、ba(h2po4)2、baso4、ba(ch3coo)2、bacl2、babr2、ba(no3)2、ba(clo4)2、bai2和ba(scn)2。特别优选为nh乙酸、mgcl2、kh2po4、na2so4、kcl、nacl和cacl2，例如：氯化物或乙酸盐(三氟乙酸)盐。一般来说，肽和变体(至少含氨基酸残基之间的肽联接)可使用lukas等人(lukasetal.,1981)以及此处引用的参考文献所披露的固相肽合成fmoc-聚酰胺模式进行合成。芴甲氧羰基(fmoc)团对n-氨基提供临时保护。使用n,n-二甲基甲酰胺中的20％二甲基呱啶中对这种碱高度敏感的保护基团进行重复分裂。由于它们的丁基醚(在丝氨酸苏氨酸和酪氨酸的情况下)、丁基酯(在谷氨酸和天门冬氨酸的情况下)、叔丁氧羰基衍生物(在赖氨酸和组氨酸的情况下)、三苯甲基衍生物(在半胱氨酸的情况下)及4-甲氧基-2,3,6-三甲基苯磺酰基衍生物(在精氨酸的情况下)，侧链功能可能会受到保护。只要谷氨酰胺和天冬酰胺为c-末端残基，侧链氨基功能保护所使用的是由4,4'-二甲氧基二苯基团。固相支撑基于聚二甲基丙烯酰胺聚合物，其由三个单体二甲基丙烯酰胺(骨架单体)、双丙烯酰乙烯二胺(交联剂)和n-丙烯酰肌胺酸甲酯(功能剂)构成。使用的肽-树脂联剂为酸敏感的4-羟甲基苯氧乙酸衍生物。所有的氨基酸衍生物均作为其预制对称酸酐衍生物加入，但是天冬酰胺和谷氨酰胺除外，它们使用被逆转的n,n-二环己基碳二亚胺/1-羟基苯并三唑介导的耦合程序而加入。所有的耦合和脱保护反应用茚三酮、硝基苯磺酸或isotin测试程序监测。合成完成后，用浓度为95％含50％清道夫混合物的三氟醋酸，从伴随去除侧链保护基团的树脂支承物中裂解肽。常用的清道夫混合物包括乙二硫醇、苯酚、苯甲醚和水，准确的选择依据合成肽的氨基酸组成。此外，固相和液相方法结合使用对肽进行合成是可能的(例如，请参阅(bruckdorferetal.,2004)以及本文引用的参考文献)。三氟乙酸用真空中蒸发、随后用承载粗肽的二乙基乙醚滴定进行去除。用简单萃取程序(水相冻干后，该程序制得不含清道夫混合物的肽)清除任何存在的清道夫混合物。肽合成试剂一般可从calbiochem-novabiochem(诺丁汉，英国)获得。纯化可通过以下技术的任何一种或组合方法进行，如：再结晶法、体积排阻色谱法、离子交换色谱法、疏水作用色谱法以及(通常)反相高效液相色谱法(如使用乙腈/水梯度分离)。可以使用薄层色谱法、电泳特别是毛细管电泳、固相萃取(cspe)、反相高效液相色谱法、酸解后的氨基酸分析、快原子轰击(fab)质谱分析以及maldi和esi-q-tof质谱分析进行肽分析。对于通过质谱法对hla配体的识别和相对定量，对来自冲击冷冻组织样本的hla分子进行纯化并对hla相关肽进行分离。分离的肽分开，并通过在线纳米-电喷雾-电离(nanoesi)液相色谱-谱(lc-ms)实验进行鉴定。由此产生的肽序列的验证方法是，将卵巢癌样本(n≥80份样本)中记录的自然肿瘤相关肽(tumap)的片段模式与相同序列相应合成参考肽的片段模式进行比较。由于这些肽被直接鉴定为原发性肿瘤hla分子的配体，因此这些结果为来自n≥80名卵巢癌患者的原发癌症组织上确定肽的自然加工和提呈提供了直接证据(参阅实施例1)。发现管道v2.1(例如，参见us2013-0096016，并在此通过引用将其整体并入本文)考虑到识别和选择相关过量提呈的候选肽疫苗，这基于与几种不同的非癌组织和器官相比癌症或其他受感染组织的hla限制肽水平直接相对定量结果。这通过以下方法实现：使用专有数据分析管道处理的lc-ms采集数据、结合序列识别算法、谱聚类、计算离子、保留时间调整、充电状态卷积以及正态化而开发无标记差异化定量方法。对来自卵巢癌组织样本的hla肽复合物进行纯化，并且对hla相关肽使用lc-ms进行分离和分析(见实施例1)。本申请中包含的所有tumap使用原发性卵巢癌样本的方法进行鉴定，确认其在原发性卵巢癌上的提呈。除了过量提呈肽之外，也测试了潜在基因的mrna表达。mrna数据通过rna测序分析正常组织和癌组织获得(见实施例2、图1)。获得自蛋白的肽在癌组织中显示高表达编码mrna，但是在重要正常组织中非常低或不存在，这些肽作为优选肽纳入本发明。本发明提出了有利于治疗癌肿/肿瘤，优选为治疗过量提呈或只提呈本发明肽的卵巢癌。这些肽由质谱分析法直接显示出，而由hla分子自然提呈于原发性卵巢癌样本中。与正常组织相比，癌症中高度过量表达肽来源的许多源基因/蛋白质(也指定为“全长蛋白”或“基础蛋白”)-本发明相关的“正常组织”是健康乳腺细胞或其他正常组织细胞，这表明肿瘤与这些源基因的高度关联性(见实施例2)。此外，这些肽本身也在肿瘤组织中提呈(本发明相关的“肿瘤组织”是指来自卵巢癌患者的样本)。hla结合肽能够被免疫系统识别，特别是t淋巴细胞。t细胞可破坏提呈被识别hla/肽复合体的细胞(如：提呈衍生肽的卵巢癌细胞)。本发明的所有肽已被证明具有刺激t细胞反应的能力，并过量提呈，因而可用于制备本发明的抗体和/或tcr，例如可溶性tcr(参见实施例3和实施例4)。此外，肽与相应的mhc组合时，也可用于制备本发明的抗体和/或tcr，特别是stcr。各个方法均为技术人员所熟知，并在各个文献中可找到(参见下文)。因此，本发明的肽可用于在患者中产生免疫反应，从而能够毁灭肿瘤细胞。患者的免疫反应能够通过直接给予患者所述肽或前体物质(如，加长肽、蛋白或编码这些肽的核酸)，较理想是与加强免疫原性的制剂相结合，而进行诱导。源自该治疗性疫苗的免疫反应预期能够高度特异性地对抗肿瘤细胞，因为本发明的目标肽在正常组织上提呈的复制数目较少，防止患者发生对抗正常细胞的不良自体免疫反应的风险。本说明书还涉及包含一个α链和一个β链(“α/βtcr”)的t细胞受体(tcr)。还提供了由mhc分子提呈时可与tcr和抗体结合的本发明的肽。本说明书还涉及能够与本发明的由hla分子提呈的肽抗原结合的本发明的tcr片段。该术语特别涉及可溶性tcr片段，例如缺失跨膜部分和/或恒定区的tcr、单链tcr及其与例如ig的融合物。本说明书还涉及用于表达本说明书的tcr和肽的核酸、载体和宿主细胞；以及使用它们的方法。术语“t细胞受体”(缩写tcr)是指一种异二聚体分子，其包含一个α多肽链(α链)和一个β多肽链(β链)，其中所述异二聚体受体能够结合由hla分子提呈的肽抗原。该术语还包括所谓的γ/δtcr。在一个实施方案中，本说明书提供了如本文中所描述的产生tcr的方法，该方法包括在适于促进tcr表达的条件下培养能够表达tcr的宿主细胞。另一个方面，本说明书涉及一种根据本说明书的方法，其中通过使足量的抗原与抗原提呈细胞接触，将抗原加载到于合适抗原提呈细胞或人工抗原呈递细胞表面表达的i或ii类mhc分子上，或者通过将i或ii类mhc复合单体四聚体化，使抗原加载到i或ii类mhc四聚体上。α/βtcr的α和β链和γ/δtcr的γ和δ链通常被视为各自有两个“结构域”，即可变和恒定结构域。可变结构域由可变区(v)和连接区(j)的组合。可变结构域还可能包括一个前导区(l)。β和δ链还可能包括一个多样区(d)。α和β恒定结构域还可能包括锚定α和β链至细胞膜的c末端跨膜(tm)结构域。相对于γ/δ的tcr，如本文所用的术语“tcrγ可变域”是指无前导区(l)的tcrγv(trgv)区与tcrγ(trgj)区的组合，术语tcrγ恒定结构域是指细胞外trgc区域，或c-末端截短trgc序列。同样地，“tcrδ可变域”是指无前导区(l)的tcrδv(trdv)区与tcrδd/j(trdd/trdj)区的组合，术语“tcrδ恒定结构域”是指细胞外trdc区域，或c-末端截短trdc序列。本说明书的tcr优选结合至肽hla分子复合体，其具有约100μm或更小、约50μm或更小、约25μm或更小或约10μm或更小的结合亲和力(kd)。更为优选的情况是具有约1μm或更小、约100nm或更小、约50nm或更小或约25nm或更小结合亲和力的高亲和力tcr。本发明tcr优选结合亲和力范围的非限制性示例包括约1nm至约10nm；约10nm至约20nm；约20nm至约30nm；约30nm至约40nm；约40nm至约50nm；约50nm至约60nm；约60nm至约70nm；约70nm至约80nm；约80nm至约90nm；以及约90nm至约100nm。与本说明书tcr相关，本文使用的“特异性结合”及其语法变体用于表示对100μm或更小的肽-hla分子复合体有结合亲和力(kd)的tcr。本说明书的α/β异二聚体tcr可能具有其恒定结构域之间的引入二硫键。这种类型的优选tcr包括那些具有一个trac恒定域序列和trbc1或trbc2恒定域序列的tcr，除非trac的苏氨酸48和trbc1或trbc2的丝氨酸57被半胱氨酸残基取代，所述半胱氨酸形成trac恒定域序列和tcr的trbc1或trbc2恒定区序列之间的二硫键。不论具有或不具有上述的引入链间键，本说明书的α/β杂二聚体tcr可能具有一个trac恒定域序列和一个trbc1或trbc2恒定结构域序列，并且trac恒定结构域序列和tcr的trbc1或trbc2恒定结构域序列可能通过trac外显子2的cys4和trbc1或trbc2外显子2的cys4之间的天然二硫键相连。本说明书的tcr可能包括选自由放射性核素、荧光团和生物素组成组中的可检测标记。本说明书的tcr可能结合至治疗活性剂，如放射性核素、化学治疗剂或毒素。在一个实施方案中，具有在α链中至少一个突变和/或具有在β链中至少一个突变的tcr与未突变tcr相比，已经修改了糖基化。在一个实施方案中，在tcrα链和/或tcrβ链中包括至少一个突变的tcr对肽hla分子复合体有结合亲和力和/或结合半衰期，其是包含未突变tcrα链和/或未突变tcrβ链的tcr的结合亲和力的至少两倍。肿瘤特异性tcr亲和力增强及其开发依赖于存在最佳tcr亲和力的窗口。这样窗口的存在是根据观察结果：hla-a2限制性病原体特异性tcr与hla-a2限制性肿瘤相关自身抗原特异性tcr相比，kd值通常大约低10倍。现已知，尽管肿瘤抗原可能具有免疫原性，但是因为肿瘤来自个体自身的细胞，因此仅突变蛋白质或翻译加工改变的蛋白将被免疫系统视为外来物质。上调或过度表达(所谓的自体抗原)的抗原不一定诱导针对肿瘤的功能免疫应答：表达对这些抗原具有高度反应性的tcr的t细胞会在一种称为中枢耐受的程序中在胸腺内被不利选择，也就是说只有对自身抗原具有低亲和力tcr的细胞才仍然存在。因此，本说明书的tcr或变体对肽的亲和力可通过本领域熟知的方法来增强。本说明书还涉及一种识别和分离本发明tcr的一种方法，所述方法包括：用a2/肽单体从hla-a*02阴性健康供体孵育pbmc，用四聚体-藻红蛋白(pe)孵育pbmc并通过荧光激活细胞分选(facs)–calibur方法分析分离高亲和力t细胞。本说明书还涉及一种识别和分离本发明tcr的一种方法，所述方法包括：获得含整个人体tcrαβ基因位点(1.1和0.7mb)的转基因小鼠(其t细胞表达多样化人类tcr，用于补偿小鼠tcr缺乏)，用一种肽对小鼠进行免疫处理，用四聚体-藻红蛋白(pe)孵育从转基因小鼠中获得的pbmc，并通过荧光激活细胞分选(facs)–calibur方法分析分离高亲和力t细胞。一方面，为了获得表达本说明书tcr的t细胞，编码本说明书tcr-α和/或tcr-β链的核酸被克隆入表达载体，诸如γ反转录病毒或慢病毒。重组病毒产生，然后测试功能，如抗原专一性和功能性亲合力。然后，最终产品的等分试样被用于转导靶t细胞群体(一般纯化自患者的pbmc)，在输入患者前展开。另一方面，为了获得表达本说明书tcr的t细胞，tcrrna通过本领域中已知的技术(例如，体外转录系统)合成。然后，体外合成的tcrrna通过电穿孔来重新表达肿瘤特异性tcr-α和/或tcr-β链被引入获得自健康供体的初级cd8+t细胞。为了增加表达，编码本说明书tcr的核酸在操作上可连接到强启动子，例如逆转录病毒长末端重复序列(ltr)、巨细胞病毒(cmv)、鼠干细胞病毒(mscv)u3、磷酸甘油酸激酶(pgk)、β肌动蛋白、泛素蛋白和猿猴病毒40(sv40)/cd43复合启动子、延伸因子(ef)-1a和脾脏病灶形成病毒(sffv)启动子。在一优选实施方案中，启动子与被表达的核酸异源。除了强启动子外，本说明书的tcr表达盒可能含有附加的元素，可提高转基因表达，包括中枢多聚嘌呤区(cppt)，其促进了慢病毒构建体的核易位(follenzietal.,2000)，和土拨鼠肝炎病毒转录后调控元素(wpre)，其通过提高rna稳定性增加转基因表达水平(zuffereyetal.,1999)。本发明tcr的α和β链可由位于分开的载体核酸进行编码，或者可通过位于同一载体的多核苷酸编码。实现高水平的tcr表面表达需要引入tcr的tcr-α和tcr-β链高水平转录。为了实现它，本说明书的tcr-α和tcr-β链可在单一的载体中被克隆入双顺反子构建体，其已被证明能够克服这一障碍。使用tcr-α和tcr-β链在之间的病毒核糖体间进入位点(ires)导致两链的协同表达，因为tcr-α和tcr-β链均由在翻译过程中分成两个蛋白质的单一转录物产生，从而确保了产生tcr-α和tcr-β链的相等摩尔比。(schmittetal.2009)。编码本说明书tcr的核酸可以是被优化以从宿主细胞增加表达的密码子。遗传密码冗余让一些氨基酸被一个以上的密码子编码，但某些密码子没有其他密码子“优化”，因为匹配trna以及其他因子的相对可用性(gustafssonetal.,2004)。修改tcr-α和tcr-β基因序列使得每个氨基酸被用于哺乳动物基因表达的最佳密码子编码，以及消除mrna不稳定性基序或隐蔽剪接位点，已显示可显著提高tcr-α和tcr-β基因表达(scholtenetal.,2006)。此外，引入的和内源性tcr链之间的错配可能会导致获得特异性，其构成自身免疫的显著风险。例如，混合tcr二聚体的形成可能会减少可用以形成正确配对tcr复合体的cd3分子数目，因此，可以显著降低表达所引入tcr的细胞的功能性亲合力(kuballetal.,2007)。为了减少错配，本说明书引入的tcr链的c-末端结构域可以进行修改以促进链间亲和力，同时降低引入链与内源tcr配对的能力。这些策略可能包括用鼠配对物取代人类tcr-α和tcr-βc端结构域(鼠化c端结构域)；通过引入第二个半胱氨酸残基到引入tcr的tcr-α和tcr-β链产生c末端结构域的第二个链间二硫键(半胱氨酸修饰)；交换tcr-α和tcr-β链c端结构域的相互作用残基(“杵臼结构”)；直接融合tcr-α和tcr-β链可变结构域至cd3ζ(cd3ζ融合)(schmittetal.2009)。在一实施方案中，宿主细胞被改变结构以表达本说明书的tcr。在一优选实施方案中，宿主细胞为人t细胞或t细胞祖细胞。在一些实施方案中，t细胞或t细胞祖细胞从癌症患者中获得。在另一些实施方案中，t细胞或t细胞祖细胞从健康供体中获得。本说明书的宿主细胞相对于待治疗的患者可以为同种异体或自体的。在一实施方案中，宿主是被转化以表达α/βtcr的γ/δt细胞。“药物组合物”是指适合在医疗机构用于人体的组合物。优选地，药物组合物为无菌状态，并根据gmp指南生产。药物组合物包括游离形式或以一种药用盐形式存在的肽(也参见上文)。此处使用的“药用盐”是指所公开的肽的一种衍生物，其中该肽由制酸或药剂的碱盐进行改性。例如，用与适合的酸反应的游离碱(通常其中的中性药物有一个中性–nh2基团)制备酸式盐。适合制备酸盐的酸包括有机酸，如：乙酸、丙酸、羟基酸、丙酮酸、草酸、苹果酸、丙二酸、丁二酸、马来酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸酸、肉桂酸、扁桃酸、甲磺酸、甲磺酸、苯磺酸、水杨酸等等、以及无机酸，如：盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸和磷酸等。相反，可在一种肽上提呈的酸性基团的碱盐制剂使用药用碱基进行制备，如氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化铵、氢氧化钙、三甲胺等等。在特别优选的实施方案中，药物组合物包括乙酸(醋酸盐)，三氟乙酸盐或盐酸(氯化物)形式的肽。本发明中所述的药剂优选为一种免疫治疗药剂，例如，一种疫苗。该疫苗可直接给到患者的受影响器官，也可i.d.、i.m.、s.c.、i.p.和i.v.注射方式全身给药，或体外应用到来自患者或其细胞株的细胞(随后再将这些细胞注入到患者中)，或体外用于从来自患者的免疫细胞的一个细胞亚群(然后再将细胞重新给予患者)。如果核酸体外注入细胞，可能有益于细胞转染，以共同表达免疫刺激细胞因子(如白细胞介素-2)。肽可完全单独给药，也可与免疫刺激佐剂相结合(见下文)、或与免疫刺激细胞因子联合使用、或以适当的输送系统给药(例如脂质体)。该肽也可结合形成一种合适的载体(如钥孔虫戚血蓝蛋白(klh)或甘露)到合适的载体(参阅wo95/18145及(longeneckeretal.,1993))。肽也可能被标记，可能是融合蛋白，或可能是杂交分子。在本发明中给出序列的肽预计能刺激cd4或cd8t细胞。然而，在有cd4t-辅助细胞的帮助时，cd8t细胞刺激更加有效。因此，对于刺激cd8t细胞的mhc-i类表位，一种杂合分子的融合伙伴或片段提供了刺激cd4阳性t细胞的适当表位。cd4-和cd8刺激表位为本领域所熟知、并包括本发明中确定的表位。一方面，疫苗包括至少含有seqidno:1至seqidno:32中提出的一种肽以及至少另外一种肽，优选为2至50个、更优选为2至25个、再优选为2至20个、最优选为2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17或18个肽。肽可能从一个或多个特定taa中衍生，并且可能与mhci类分子结合。另一方面，本发明提出了一种编码本发明中肽或肽变体的核酸(如多聚核苷酸)。多聚核苷酸可能为，例如，dna、cdna、pna、rna或其组合物，它们可为单链和/或双链、或多聚核苷酸的原生或稳定形式(如：具有硫代磷酸骨架的多聚核苷酸)，并且只要它编码肽，就可能包含也可能不包含内含子。当然，多聚核苷酸只能编码加入天然肽键并含有天然氨基酸残基的肽。另一个方面，本发明提出了一种可根据本发明表达多肽的表达载体。对于连接多核苷酸，已经开发出多种方法，尤其是针对dna，可通过向载体补充可连接性末端等方法进行连接。例如，可向dna片段加入补充性均聚物轨道，之后dna片段被插入到载体dna。然后，通过补充性均聚物尾巴的氢键结合，将载体和dna片段结合，从而形成重组dna分子。含有一个或多个酶切位点的合成接头为dna片段与载体连接提供了另一种方法。含各种限制性核酸内切酶的合成接头可通过多种管道购得，其中包括从国际生物技术公司(internationalbiotechnologiesinc,newhaven,康涅狄格州,美国)购得。编码本发明多肽的dna理想修饰方法是使用saiki等人(saikietal.,1988)所采用的聚合酶链反应方法。此方法可用于将dna引入合适的载体(例如，通过设计合适的酶切位点)，也可用于本领域已知的其他有用方法修饰dna。如果使用病毒载体，痘病毒载体或腺病毒载体为优选。之后，dna(或在逆转录病毒载体情况下，rna)可能表达于合适的宿主，从而制成含本发明肽或变体的多肽。因此，可根据已知技术使用编码本发明肽或变体的dna，用本文所述方法适当修饰后，构建表达载体，然后表达载体用于转化合适宿主细胞，从而表达和产生本发明中的多肽。此类技术包括那些公开于，例如，美国专利4,440,859、4,530,901、4,582,800、4,677,063、4,678,751、4,704,362、4,710,463、4,757,006、4,766,075和4,810,648。编码含本发明化合物多肽的dna(或在逆转录病毒载体情况下，rna)可能被加入到其他多种dna序列，从而引入到合适的宿主中。同伴dna将取决于宿主的性质、dna引入宿主的方式、以及是否需要保持为游离体还是要相互结合。一般来说，dna可以适当的方向和正确的表达阅读框架附着到一种表达载体(如质粒)中。如有必要，该dna可能与所需宿主所识别的相应转录和翻译调节控制核苷酸序列连接，尽管表达载体中一般存在此类控制功能。然后，该载体通过标准方法被引入宿主。一般来说，并不是所有的宿主都会被载体转化。因此，有必要选择转化过的宿主细胞。选择方法包括用任何必要的控制元素向表达载体插入一个dna序列，该序列对转化细胞中的可选择性属性(如抗生素耐药性)进行编码。另外，有这种选择属性的基因可在另外一个载体上，该载体用来协同转化所需的宿主细胞。然后，本发明中的重组dna所转化的宿主细胞在本文中所述本领域技术人员熟悉的合适条件下培养足够长的时间，从而表达之后可回收的肽。有许多已知的表达系统，包括细菌(如大肠杆菌和枯草芽孢杆菌)、酵母(如酵母菌)、丝状真菌(如曲霉菌)、植物细胞、动物细胞及昆虫细胞。该系统可优选为哺乳动物细胞，如来自atcc细胞生物学库(cellbiologycollection)中的cho细胞。典型的哺乳动物细胞组成型表达载体质粒包括cmv或含一个合适的多聚a尾巴的sv40启动子以及抗性标志物(如新霉素)。一个实例为从pharmacia公司(piscataway，新泽西州，美国)获得的psvl。一种可诱导型哺乳动物表达载体的例子是pmsg，也可以从pharmacia公司获得。有用的酵母质粒载体是prs403-406和prs413-416，一般可从stratagenecloningsystems公司(lajolla,加州92037，美国)获得。质粒prs403、prs404、prs405和prs406是酵母整合型质粒(yip)，并插入了酵母可选择性标记物his3、trp1、leu2和ura3。prs413-416质粒为酵母着丝粒质粒(ycp)。基于cmv启动子的载体(如，来自于sigma-aldrich公司)提供了瞬时或稳定的表达、胞浆表达或分泌，以及flag、3xflag、c-myc或matn不同组合物中的n-端或c-端标记。这些融合蛋白可用于检测、纯化及分析重组蛋白。双标融合为检测提供了灵活性。强劲的人巨细胞病毒(cmv)启动子调控区使得cos细胞中的组成蛋白表达水平高达1mg/l。对于较弱的细胞株，蛋白水平一般低于0.1mg/l。sv40复制原点的出现将导致dna在sv40复制容纳性cos细胞中高水平复制。例如，cmv载体可包含细菌细胞中的pmb1(pbr322的衍生物)复制原点、细菌中进行氨苄青霉素抗性选育的钙-内酰胺酶基因、hghpolya和f1的原点。含前胰岛素原引导(ppt)序列的载体可使用抗flag抗体、树脂和板引导flag融合蛋白分泌到进行纯化的培养基中。其他与各种宿主细胞一起应用的载体和表达系统是本领域熟知众所周知的。在另一个实施方案中，对本发明的两个或更多的肽或肽变体进行编码，因此，以一个连续顺序(类似于“一串珠子”的构建体)表达。在达到目标，所述肽或肽变体可能通过连接符氨基酸的延伸处(例如llllll)连接或融合一起，也可能他们之间没有任何附加的肽而被连接。这些构建体也可用于癌症治疗，可诱导涉及mhci和mhcii类分子的免疫应答。本发明还涉及一种宿主细胞，其以本发明的多核苷酸载体构建转化而来。宿主细胞可为原核细胞，也可为真核细胞。在有些情况下，细菌细胞为优选原核宿主细胞，典型为大肠杆菌株，例如，大肠杆菌菌株dh5(从bethesdaresearchlaboratories公司(bethesda,马里兰州,美国)获得)和rr1(从美国菌种保藏中心(atcc,rockville,马里兰州,美国)，atcc编号31343获得)。首选的真核宿主细胞包括酵母、昆虫和哺乳动物细胞，优选为脊椎动物细胞，如：小鼠、大鼠、猴子或人成纤维细胞和结肠癌细胞株中的细胞。酵母宿主细胞包括yph499、yph500和yph501，一般可从stratagenecloningsystems公司(lajolla,ca92037,美国)获得。首选哺乳动物宿主细胞包括中国仓鼠卵巢(cho)细胞为atcc中的ccl61细胞、nih瑞士小鼠胚胎细胞nih/3t3为atcc中的crl1658细胞、猴肾源性cos-1细胞为atcc中的crl1650细胞以及人胚胎肾细胞的293号细胞。首选昆虫细胞为sf9细胞，可用杆状病毒表达载体转染。有关针对表达选择合适宿主细胞的概要，可从教科书(paulinabalbásandargelialorence《methodsinmolecularbiologyrecombinantgeneexpression,reviewsandprotocols》partone,secondedition,isbn978-1-58829-262-9)和技术人员知道的其他文献中查到。含本发明dna结构的适当宿主细胞的转化可使用大家熟知的方法完成，通常取决于使用载体的类型。关于原核宿主细胞的转化，请参见，例如，cohen等人的文献(cohenetal.,1972)和(greenandsambrook,2012)。酵母细胞的转化在sherman等人的文章(shermanetal.,1986)中进行了描述。beggs(beggs,1978)中所述的方法也很有用。对于脊椎动物细胞，转染这些细胞的试剂等，例如，磷酸钙和deae-葡聚糖或脂质体配方，可从stratagenecloningsystems公司或lifetechnologies公司(gaithersburg,md20877，美国)获得。电穿孔也可用于转化和/或转染细胞，是本领域用于转化酵母细胞、细菌细胞、昆虫细胞和脊椎动物细胞大家熟知的方法。被成功转化的细胞(即含本发明dna结构的细胞)可用大家熟知的方法(如pcr)进行识别。另外，上清液存在的蛋白可使用抗体进行检测。应了解，本发明中的某些宿主细胞用于制备本发明中的肽，例如细菌细胞、酵母细胞和昆虫细胞。但是，其他宿主细胞可能对某些治疗方法有用。例如，抗原提呈细胞(如树突状细胞)可用于表达本发明中的肽，使他们可以加加载相应的mhc分子中。因此，本发明提出了含本发明中核酸或表达载体的一种宿主细胞。在一个优选实施方案中，宿主细胞为抗原提呈细胞，尤其是树突状细胞或抗原提呈细胞。2010年4月29日，美国食品和药物管理局(fda)批准载有含前例腺酸性磷酸酶(pap)的重组融合蛋白可用于治疗无症状或症状轻微的转移性hrpc(rinietal.,2006；smalletal.,2006)。另一方面，本发明提出了一种配制一种肽及其变体的方法，该方法包括培养宿主细胞和从宿主细胞或其培养基中分离肽。在另一个实施方案中，本发明中的肽、核酸或表达载体用于药物中。例如，肽或其变体可制备为静脉(i.v.)注射剂、皮下(s.c.)注射剂、皮内(i.d.)注射剂、腹膜内(i.p.)注射剂、肌肉(i.m.)注射剂。肽注射的优选方法包括s.c.、i.d.、i.p.、i.m.和i.v.注射。dna注射的优选方法为i.d.、i.m.、s.c.、i.p.和i.v.注射。例如，给予50μg至1.5mg，优选为125μg至500μg的肽或dna，这取决于具体的肽或dna。上述剂量范围在以前的试验中成功使用(walteretal.,2012)。用于主动免疫接种的多聚核苷酸可为基本纯化形式，也可包被于载体或输送系统。核酸可能为dna、cdna、pna、rna，也可能为其组合物。这种核酸的设计和引入方法为本领域所熟知。例如，文献中有其概述(teufeletal.,2005)。多核苷酸疫苗很容易制备，但这些载体诱导免疫反应的作用模式尚未完全了解。合适的载体和输送系统包括病毒dna和/或rna，如基于腺病毒、牛痘病毒、逆转录病毒、疱疹病毒、腺相关病毒或含一种以上病毒元素的混合病毒的系统。非病毒输送系统包括阳离子脂质体和阳离子聚合物，是dna输送所属领域内熟知的系统。也可使用物理输送系统，如通过“基因枪”。肽或核酸编码的肽可以是一种融合蛋白，例如，含刺激t细胞进行上述cdr的表位。本发明的药物也可能包括一种或多种佐剂。佐剂是那些非特异性地增强或加强免疫反应的物质(例如，通过cd8-阳性t细胞和辅助t(th)细胞介导的对一种抗原的免疫应答，因此被视为对本发明的药剂有用。适合的佐剂包括(但不仅限于)1018iss、铝盐、as15、bcg、cp-870,893、cpg7909、cyaa、dslim、鞭毛蛋白或鞭毛蛋白衍生的tlr5配体、flt3配体、gm-csf、ic30、ic31、咪喹莫特resiquimod、imufactimp321、白细胞介素il-2、il-13、il-21、干扰素α或β，或其聚乙二醇衍生物、ispatch、iss、iscomatrix、iscoms、lipovac、malp2、mf59、单磷酰脂a、montanideims1312、montanideisa206、montanideisa50v、montanideisa-51、水包油和油包水乳状液、ok-432、om-174、om-197-mp-ec、ontak、ospa、载体系统、基于聚丙交酯复合乙交酯[plg]和右旋糖苷微粒、重组人乳铁传递蛋白srl172、病毒颗粒和其他病毒样颗粒、yf-17d、vegftrap、r848、β-葡聚糖、pam3cys、源自皂角苷、分支杆菌提取物和细菌细胞壁合成模拟物的aquila公司的qs21刺激子，以及其他专有佐剂，如：ribi'sdetox、quil或superfos。优选佐剂如：弗氏佐剂或gm-csf。前人对一些树突状细胞特异性免疫佐剂(如mf59)及其制备方法进行了描述(allisonandkrummel,1995)。也可能使用细胞因子。一些细胞因子直接影响树突状细胞向淋巴组织迁移(如，tnf-)，加速树突状细胞成熟为t淋巴细胞的有效抗原提呈细胞(如，gm-csf、il-1和il-4)(美国5849589号专利，特别以其完整引用形式并入本文)，并充当免疫佐剂(如il-12、il-15、il-23、il-7、ifn-α、ifn-β)(gabrilovichetal.,1996)。据报告，cpg免疫刺激寡核苷酸可提高佐剂在疫苗中的作用。如果没有理论的约束，cpg寡核苷酸可通过toll样受体(tlr)(主要为tlr9)激活先天(非适应性)免疫系统从而起作用。cpg引发的tlr9活化作用提高了对各种抗原的抗原特异性体液和细胞反应，这些抗原包括肽或蛋白抗原、活病毒或被杀死的病毒、树突状细胞疫苗、自体细胞疫苗以及预防性和治疗性疫苗中的多糖结合物。更重要的是，它会增强树突状细胞的成熟和分化，导致th1细胞的活化增强以及细胞毒性t淋巴细胞(ctl)生成加强，甚至cd4t细胞说明的缺失。甚至有疫苗佐剂的存在也能维持tlr9活化作用诱发的th1偏移，这些佐剂如：正常促进th2偏移的明矾或弗氏不完全佐剂(ifa)。cpg寡核苷酸与以下其他佐剂或配方一起制备或联合给药时，表现出更强的佐剂活性，如微粒、纳米粒子、脂肪乳或类似制剂，当抗原相对较弱时，这些对诱发强反应尤为必要。他们还能加速免疫反应，使抗原剂量减少约两个数量级，在有些实验中，对不含cpg的全剂量疫苗也能产生类似的抗体反应(krieg,2006)。美国6406705b1号专利对cpg寡核苷酸、非核酸佐剂和抗原结合使用促使抗原特异性免疫反应进行了描述。一种cpgtlr9拮抗剂为mologen公司(德国柏林)的dslim(双干环免疫调节剂)，这是本发明药物组合物的优选成分。也可使用其他如tlr结合分子，如：rna结合tlr7、tlr8和/或tlr9。其他有用的佐剂例子包括(但不限于)化学修饰性cpg(如cpr、idera)、dsrna模拟物，如，poly(i:c)及其衍生物(如：ampligen、hiltonol、多聚-(iclc)、多聚(ic-r)、多聚(i:c12u))、非cpg细菌性dna或rna以及免疫活性小分子和抗体，如：环磷酰胺、舒尼替单抗、西乐葆、ncx-4016、西地那非、他达拉非、伐地那非、索拉非尼、替莫唑胺、temsirolimus、xl-999、cp-547632、帕唑帕尼、vegftrap、zd2171、azd2171、抗-ctla4、免疫系统的其他抗体靶向性主要结构(如：抗-cd40、抗-tgfβ、抗-tnfα受体)和sc58175，这些药物都可能有治疗作用和/或充当佐剂。技术人员无需过度进行不当实验就很容易确定本发明中有用的佐剂和添加剂的数量和浓度。首选佐剂是抗-cd40、咪喹莫特、瑞喹莫德、gm-csf、环磷酰胺、舒尼替尼、贝伐单抗、干扰素α、cpg寡核苷酸及衍生物、多聚(i:c)及衍生物、rna、西地那非和plg或病毒颗粒的微粒制剂。本发明药物组合物的一个优选实施方案中，佐剂从含集落刺激因子制剂中选择，如粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(gm-csf，沙格司亭)、环磷酰胺、咪喹莫特、resiquimod和干扰素-α。本发明药物组合物的一个优选实施方案中，佐剂从含集落刺激因子制剂中选择，如粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(gm-csf，沙格司亭)、环磷酰胺、咪喹莫特和resimiquimod。在本发明药物组合物的一个优选实施方案中，佐剂为环磷酰胺、咪喹莫特或resiquimod。更优选的佐剂是montanideims1312、montanideisa206、montanideisa50v、montanideisa-51、聚-iclc和抗cd40mab或其组合物。此组合药物为非肠道注射使用，如皮下、皮内、肌肉注射，也可口服。为此，肽和其他选择性分子在药用载体中分解或悬浮，优选为水载体。此外，组合物可包含辅料，如：缓冲剂、结合剂、冲击剂、稀释剂、香料、润滑剂等。这些肽也可与免疫刺激物质合用，如：细胞因子。可用于此类组合物的更多辅料可在从a.kibbe所著的handbookofpharmaceuticalexcipients(kibbe,2000)等书中获知。此组合药物可用于阻止、预防和/或治疗腺瘤或癌性疾病。例如，ep2112253中有示例制剂。重要的是要认识到，通过本发明的疫苗引发的免疫应答在不同的细胞阶段和开发的不同阶段攻击癌症。而且不同的癌症相关信号通路被攻击。这相对于其他疫苗的优势，这些疫苗只针对一个或几个靶标，这可能会导致肿瘤很容易适应于攻击(肿瘤逃逸)。此外，并非所有的个体肿瘤都表达相同模式的抗原。因此，几个肿瘤相关肽的组合确保了每个肿瘤都承担至少一些靶标。该组合物以这样的方式设计，预期每个肿瘤可表达几种抗原并覆盖肿瘤生长和维持所需要的几种独立的途径。因此，疫苗可易于“现成的”用于较大患者群体。这意味着，预选择接受疫苗治疗的患者可限制为hla分型，无需抗原表达的任何额外的生物标志物评估，但仍然确保多个靶标同时被诱导的免疫应答攻击，这对于疗效很重要(banchereauetal.,2001；walteretal.,2012)。本文所用的“支架”一词是指与(如抗原)决定因子特异性结合的分子。在一项实施方案中，支架是能够引导其所连接的实体(例如，(第二)抗原结合部分)至目标靶点，例如，至特定类型的肿瘤细胞或承载抗原决定簇的肿瘤基质(如根据目前申请中肽和mhc的复合体)。在另一项实施例中，支架能够通过其靶抗原(例如t细胞受体复合体抗原)激活信号通路。支架包括但不限于抗体及其片段，抗体的抗原结合区，其包含抗体重链可变区和抗体轻链可变区，结合的蛋白包括至少一个锚蛋白重复序列基元和单域抗原结合(sdab)分子、适体、(可溶)tcr和(经修饰的)细胞，例如同种异体或自体t细胞。为了评估某个分子是否是结合至靶点的支架，可进行结合测定。“特定”结合是指，与其他天然肽-mhc复合体相比，该支架与感兴趣的肽-mhc复合体更好地结合，结合程度为，拥有能够杀死承载特定靶点细胞的活性分子的支架不能够杀死无特定靶点但提呈一个或多个其他肽-mhc复合体的另一细胞。如果交叉反应性肽-mhc的肽并不是天然的，即，并非来自人hla-多肽组，则结合至其他肽-mhc复合体是无关紧要的。评估靶细胞杀伤的测试在本领域中是公知的。它们应该含有未改变的肽-mhc提呈的靶细胞(原发细胞或细胞系)或载有肽的细胞进行，以便达到天然肽-mhc的水平。各支架可包括一个标记，其通过确定是否存在或不存在卷标所提供的信号可检测到结合支架。例如，该支架可用荧光染料或任何其他适用的细胞标记分子进行标记。此类标记分子是本领域中公知的。例如，通过荧光染料进行的荧光标记可通过荧光或激光扫描显微术或流式细胞术提供结合适体的可视化。各支架可与第二个活性分子(例如il-21、抗cd3、抗cd28)结合。关于多肽支架的进一步信息，可参阅，例如，在wo2014/071978a1
背景技术：
部分，并作为参考文献引用。本发明还涉及适体。适体(例如，参见wo2014/191359及其中引用的文献)是短的单链核酸分子，其可以折迭为所定义的三维结构并识别特定的靶标结构。它们似乎是开发靶向治疗的合适替代方法。适体已显示可选择性与具有高亲和力和特异性的复合体靶标相结合。识别细胞表面分子的适体在过去十年内已经确定，并为开发诊断和治疗方法提供了手段。由于适体已显示几乎无毒性和免疫原性，因此，它们是生物医学应用中有前景的候选物质。事实上适体，例如前例腺特异性膜抗原识别适体，已被成功地用于靶向治疗并在体内模型的异种移植物中显示出功能。此外，认识到特定肿瘤细胞系的适体也已确定。可选择dna适体来揭示各种癌细胞的广谱标识属性，特别是那些来自于实体瘤的细胞，而非致瘤和主要健康细胞不被识别。如果所识别的适体不仅识别肿瘤特异性子类型，而且与一系列肿瘤相互作用，这使适体适用于作为所谓的广谱诊断和治疗手段。此外，用流式细胞仪对细胞结合行为的研究显示，适体在纳摩尔范围内显示出很好的亲和力。适体用于诊断和治疗目的。此外，也可能显示，一些适体被肿瘤细胞吸取，因而可作为抗癌剂靶向递送的分子赋形剂，例如sirna进入肿瘤细胞。可选择适体针对复合体的靶标，如细胞和组织以及包含、优选包括根据任何seqidno:1至seqidno:772的一个序列、根据当前发明的肽复合体与mhc分子，使用细胞selex(通过指数富集的配体系统进化)技术。本发明中的肽可用于生成和开发出针对mhc/肽复合物的特定抗体。这些抗体可用于治疗，将毒素或放射性物质靶向病变组织。这些抗体的另一用途是为了成像之目的(如pet)将放射性核素靶向病变组织。这可有助于检测小转移灶或确定病变组织的大小和准确位置。因此，本发明的另一方面是提出产生特异性结合至与hla限制性抗原络合的i或ii类人主要组织兼容性复合体(mhc)的一种重组抗体的方法，该方法包括：用可溶形式的与hla限制性抗原络合的(mhc)i或ii类分子对包含表达所述主要组织兼容性说复合体(mhc)i或ii类的基因工程非人哺乳动物进行免疫；将mrna分子与产生所述非人哺乳动物细胞的抗体分离；产生一个噬菌体显示库，显示由所述mrna分子编码的蛋白分子；以及将至少一个噬菌体与所述噬菌体显示库分离，所述的至少一个噬菌体显示所述抗体特异性地结合至与hla限制性抗原络合的所述人主要组织兼容性说复合体(mhc)i或ii类。本发明的另一方面提出一种抗体，其特异性结合至与一种hla限制性抗原络合的i或ii类人主要组织兼容性说复合体(mhc)，其中该抗体优选为多克隆抗体、单克隆抗体、双特异性抗体和/或嵌合抗体。产生这种抗体和单链i类主要组织兼容性复合物的相应方法，以及产生这些抗体的其他工具在wo03/068201、wo2004/084798、wo01/72768、wo03/070752以及出版物(cohenetal.,2003a；cohenetal.,2003b；denkbergetal.,2003)中进行了披露，为了本发明之目的，所有参考文献通过引用被完整地并入本文。优选地，该抗体与复合体的结合亲和力低于20纳摩尔，优选为低于10纳摩尔，这在本发明情况下也被视为具有“特异性”。本发明涉及一种肽，包含选自seqidno:1至seqidno:772的序列或该序列的与seqidno:1至seqidno:772具有88％同源性(优选为相同)的变体，或诱导t细胞与其发生交叉反应的变体，其中，所述肽不是基本的全长多肽。本发明进一步涉及一种肽，包含选自seqidno:1至seqidno:772的序列、或与seqidno:1至seqidno:772具有至少88％同源性(优选为相同)的变体，其中所述肽或变体的总长度为8至100个、优选为8至30个、最优选为8至14个氨基酸。本发明进一步涉及本发明的肽，其具有与主要组织兼容性复合体(mhc)i或ii类分子结合的能力。本发明进一步涉及本发明中的肽，其中肽由或基本由根据seqidno:1至seqidno:772的氨基酸序列组成。本发明进一步涉及本发明的肽，其中该肽(在化学上)被修饰和/或包含非肽键。本发明进一步涉及本发明的肽，其中该肽为融合蛋白的一部分，特别包括hla-dr抗原相关不变链(ii)的n-端氨基酸，或其中该肽与一种抗体(例如，树突状细胞特定抗体)融合。本发明进一步涉及一种核酸，其编码本发明所述肽，前提是该肽并非完整(完全)的人蛋白。本发明进一步涉及一种本发明的核酸，为dna、cdna、pna、rna或其组合。本发明进一步涉及一种能表达或正在表达本发明核酸的表达载体。本发明进一步涉及本发明的肽、本发明的核酸或本发明的表达载体在药物中的用途，特别是用于治疗卵巢癌。本发明进一步涉及含本发明核酸或本发明表达载体的宿主细胞。本发明进一步涉及本发明的宿主细胞，其为抗原提呈细胞，优选为树突细胞。本发明进一步涉及制备本发明肽的方法，所述方法包括培养本发明的宿主细胞以及从所述宿主细胞或其培养基中分离肽。本发明进一步涉及本发明中的方法，其中通过使足量的抗原与抗原提呈细胞接触，抗原被载在表达于合适抗原提呈细胞或人工抗原呈递细胞表面的i或ii类mhc分子上。本发明进一步涉及本发明的方法，其中该抗原提呈细胞包括一个表达载体，该载体有能力表达含seqidno:1至seqidno:772或其变体氨基酸序列的肽。本发明进一步涉及以本发明方法制造的激活的t细胞，其中所述t细胞有选择性地识别一种细胞，该细胞异常表达含本发明氨基酸序列的多肽。本发明进一步涉及一种杀伤患者靶细胞的方法，其中患者的靶细胞异常表达含本发明任何氨基酸序列的多肽，该方法包括给予患者有效量的本发明t细胞。本发明进一步涉及本发明的任意肽、本发明的核酸、本发明的表达载体、本发明的细胞、本发明的激活细胞毒性t淋巴细胞作为药物或在制造药物中的用途。本发明进一步涉及本发明的用途，其中药剂可有效抗癌。本发明进一步涉及本发明的用途，其中该药剂为一种疫苗。本发明进一步涉及一种本发明的用途，其中药剂可有效抗癌。本发明进一步涉及本发明中的用途，其中所述癌细胞为卵巢癌细胞或其他实体或血液肿瘤细胞，例如：肝细胞癌、结直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、食管癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾细胞癌、前列腺癌、黑色素瘤、乳腺癌、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、急性骨髓性白血病、胆囊癌和胆管癌、膀胱癌、子宫癌、头颈部鳞状细胞癌、间皮瘤。本发明进一步涉及一种基于本发明肽的特定标志物蛋白和生物标志物，在此称为“靶标”，其可用于诊断和/或判断卵巢癌的预后。本发明还涉及这些新靶点在癌症治疗中的用途。本文中术语“抗体”为广义上的定义，既包括多克隆也包括单克隆抗体。除了完整或“全部”的免疫球蛋白分子，“抗体”这一术语还包括这些免疫球蛋白分子和人源化免疫球蛋白分子的片段(如，cdr、fv、fab和fc片段)或聚合物，只要它们表现出本发明的任何期望属性(例如，卵巢癌标志物(多)肽的特异性结合、将毒素传递给癌症标志物基因表达水平增加时的卵巢癌细胞和/或抑制卵巢癌标志物多肽的活性)。只要有可能，本发明的抗体可从商业来源购买。本发明的抗体也可能使用已知的方法制得。技术人员会了解全长卵巢癌标志物多肽或其片段可用于制备本发明的抗体。用于产生本发明抗体的多肽可部分或全部地由天然源经纯化而得，也可利用重组dna技术生产。例如，本发明的编码肽的cdna，例如，该肽为根据seqidno:1至seqidno:772多肽的肽，或其中一个变体或片段，可在原核细胞中(如：细菌)或真核细胞(如：酵母、昆虫或哺乳动物细胞)中表达，之后，可纯化重组蛋白，并用于产生一种特异性结合用于产生本发明抗体的卵巢癌标志物多肽的单克隆或多克隆抗体制剂。本领域的技术人员会认识到，两种或两种以上不同集合的单克隆抗体或多克隆抗体能最大限度地增加获得一种含预期用途所需的特异性和亲和力(例如，elisa法、免疫组织化学、体内成像、免疫毒素疗法)的抗体的可能性。根据抗体的用途，用已知的方法对其期望活性进行测试(例如，elisa法、免疫组织化学、免疫治疗等；要获取产生和测试抗体的进一步指导，请参阅，例如，greenfield,2014(greenfield,2014))。例如，该抗体可用elisa法或免疫印迹法、免疫组织化学染色福尔马林固定的癌组织或冰冻的组织切片进行检测。在初次体外表征后，用于治疗或体内诊断用途的抗体根据已知的临床测试方法进行检测。此处使用的术语“单克隆抗体”是指从大量同质抗体中获得的一种抗体，即，由相同的抗体组成的抗体群，但可能少量提呈的自然突变除外。此处所述的单克隆抗体具体包括嵌合“抗体，其中一部分重链和/或轻链与从特定物种中获得的抗体或属于特定抗体类型和分类型抗体的相应序列相同(同质)，同时，剩余链与从其他物种中获得的抗体或属于特定抗体类型和子类型抗体的相应序列以及这些抗体的片段相同(同质)，只要他们表现出预期的拮抗活性(美国4816567号专利，其在此以其整体并入)。本发明的单克隆抗体可能使用杂交瘤方法制得。在杂交瘤方法中，老鼠或其他适当的宿主动物，通常用免疫制剂以引发产生或能产生将特异性结合至免疫制剂的抗体。或者，淋巴细胞可在体外进行免疫。单克隆抗体也可由dna重组方法制得，如：美国4816567号专利所述。编码本发明单克隆抗体的dna可很容易地使用传统程序进行分离和测序(例如：通过使用能与编码鼠抗体重链和轻链的基因特异性结合的寡核苷酸探针)。体外方法也适用于制备单价抗体。抗体消化以产生抗体的片段，尤其是fab片段，可以通过使用本领域已知的常规技术完成。例如，可以通过使用木瓜蛋白酶完成消化。木瓜蛋白酶消化的实施例在wo94/29348和美国4342566号专利中有描述。抗体的木瓜蛋白酶消化通常产生两种相同的抗原结合性片段，称为fab片段(每个片段都有一个抗原结合点)和残余fc片段。胃蛋白酶处理产生一个f(ab')2片段和一个pfc'片段。抗体片段，不论其是否附着于其他序列，均可包括特定区域或特定氨基酸残基的插入、删除、替换、或其他选择性修饰，但前提是，片段的活性与非修饰的抗体或抗体片段相比没有显著的改变或损害。这些修饰可提供一些额外的属性，如：删除/添加可与二硫键结合的氨基酸，以增加其生物寿命、改变其分泌特性等。在任何情况下，抗体片段必须拥有生物活性的特性，如：结合活性、调节结合域的结合力等。抗体的功能性或活性区域可通过蛋白特定区域的基因突变、随后表达和测试所表达的多肽进行确定。这些方法为本行业技术人员所熟知，可包括编码抗体片段的核酸的特定位点基因突变。本发明的抗体可进一步包括人源化抗体或人抗体。非人(如：鼠)抗体的人源化形式为嵌合抗体免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其片段(如：fv、fab、fab'或抗体的其他抗原结合序列)，其中包含从非人免疫球蛋白中获得的最小序列。人源化抗体包括人免疫球蛋白(受体抗体)，其中来自受体互补决定区(cdr)的残基被来自非人物种(供体抗体)(如具有与其特异性、亲和力和能力的小鼠、大鼠或兔子)cdr的残基取代。在某些情况下，人类免疫球蛋白的fv框架(fr)残基被相应的非人残基取代。人源化抗体可能还包括既非受体抗体、也非输入cdr或框架序列中发现的残基。一般来说，人源化抗体将包括几乎所有的至少一个、通常为二个可变域，其中，全部或几乎全部的cdr区域均对应于非人免疫球蛋白的区域并且全部或几乎全部的fr区域均为人免疫球蛋白相同序列的区域。理想情况是，人源化抗体还将包括至少免疫球蛋白恒定区(fc)的一部分，通常是人免疫球蛋白的恒定区的一部分。人源化非人抗体的方法为本行业所熟知。一般来说，人源化抗体具有一个或多个从非人源头引入的氨基酸残基。这些非人氨基酸残基往往被称为“输入”残基，通常从“输入”可变域中获得。人源化基本上可以通过将啮齿动物cdr或cdr序列取代为相应的人抗体序列而完成。因此，这种“人源化”抗体为嵌合抗体(美国4816567号专利)，其中大大少于完整的人可变域被来自于非人物种的相应序列取代。在实践中，人源化抗体通常为人抗体，其中有些cdr残基以及可能的一些fr残基被来自啮齿动物抗体中的类似位点的残基取代。可使用免疫后在内源性免疫球蛋白产生缺失时能产生完整人抗体的转基因动物(如：小鼠)。例如，它被描述为，嵌合和种系突变小鼠中的抗体重链连接区域基因的纯合性缺失导致内源性抗体生成的完全抑制。在此种系变种小鼠中人种系免疫球蛋白基因数组的转移在抗原挑战后将导致人抗体的生成。人抗体也可在噬菌体展示库中产生。本发明的抗体优选为通过药用载体的形式给予受试者。通常，在制剂中使用适量的药用盐，以使制剂等渗。药用载体的例子包括生理盐水、林格氏液和葡萄糖溶液。溶液的ph值优选为约5至8，更优选为约7至7.5。此外，载体还包括缓释制剂，如：含有抗体的固体疏水性聚合物半透性基质，其中基质为有形物品形式，如：薄膜、脂质体或微粒。本行业的技术人员熟知，某些载体可能为更优选，取决于例如，抗体的给药途径和浓度。该抗体可通过注射(如：静脉内、腹腔内、皮下、肌肉内)或通过输注等其他方法给予受试者、患者或细胞，确保其以有效的形式传输到血液中。这些抗体也可以通过瘤内或瘤周途径给予，从而发挥局部和全身的治疗作用。局部或静脉注射为优选。抗体给药的有效剂量和时间表可根据经验确定，并且作出此类决定属本行业的技术范围内。本行业的技术人员会明白，必须给予的抗体剂量根据以下因素会有所不同，例如：接受抗体的受试者、给药途径、使用的抗体以及其他正在使用的药物的特定类型。单独使用的抗体的通常日剂量可能为约1μg/kg至最多100mg/kg体重或更多，这取决于上述因素。给予抗体，优选为治疗卵巢癌后，治疗抗体的疗效可通过技术人员熟知的不同方法评估。例如：接受治疗的受试者癌症的大小、数量和/或分布可使用标准肿瘤成像技术进行监测。因治疗而给予的抗体与不给予抗体时的病程相比，可阻止肿瘤生长、导致肿瘤缩小、和/或阻止新肿瘤的发展，这样的抗体是一种有效治疗癌症的抗体。本发明的另一方面提出了制备识别特异性肽-mhc复合物的可溶性t细胞受体(stcr)的一种方法。这种可溶性t细胞受体可从特异性t细胞克隆中产生，并且它们的亲和力可以通过互补决定区靶向诱变而增加。为了t细胞受体选择之目的，可以使用噬菌体展示(美国2010/0113300，(liddyetal.,2012))。为了在噬菌体展示期间以及实际使用为药物时稳定t细胞受体之目的，可通过非天然二硫键、其他共价键(单链t细胞受体)或通过二聚化结构域连接α和β链(boulteretal.,2003；cardetal.,2004；willcoxetal.,1999)。t细胞受体可以连接到毒素、药物、细胞因子(参见us2013/0115191)、域招募效应细胞，如抗cd3域等，以便对靶细胞执行特定的功能。此外，它可能表达于用于过继转移的t细胞。进一步的信息可在wo2004/033685a1和wo2004/074322a1中找到。stcr的组合在wo2012/056407a1中进行了描述。wo2013/057586a1中公开了制备的进一步的方法。此外，可用本发明的肽和/或tcr或抗体或其他结合分子在活检样本的基础上验证病理师对癌症的诊断。该抗体或tcr也可用于体内诊断实验。一般来说，抗体用放射性核素标记(如：111in、99tc、14c、131i、3h、32p或35s)，从而可免疫闪烁扫描法使肿瘤局限化。在一实施方案中，其中的抗体或片段与两个或两个以上选自包括上述蛋白的组的蛋白质靶目标细胞外域结合，并且亲和力值(kd)低于1x10μm。诊断用抗体可通过各种影像学方法使用适合检测的探针进行标记。探针检测方法包括但不限于，荧光、光、共聚焦和电镜方法；磁共振成像和光谱学技术；透视、计算机断层扫描和正电子发射断层扫描。合适的探针包括但不限于，荧光素、罗丹明、曙红及其它荧光团、放射性同位素、黄金、钆和其他稀土、顺磁铁、氟-18和其他正电子发射放射性核素。此外，探针可能是双功能或多功能的，并且用一种以上的上述方法可进行检测。这些抗体可用所述的探针直接或间接进行标记。抗体探针的连接，包括探针的共价连接、将探针融合入抗体、以及螯合化合物的共价连接从而结合探针、以及其他本行业熟知的方法。对于免疫组织化学方法，疾病组织样本可能是新鲜或冷冻或可能包埋于石蜡中以及用福尔马林等防腐剂固定。固定或包埋的切片包括与标记一抗和二抗接触的样本，其中该抗体用于检测原位蛋白的表达。本发明的另一方面包括一种体外制备激活的t细胞的方法，该方法包括将t细胞与载有抗原的人mhc分子在体外接触足够的一段时间，这些分子在合适的抗原提呈细胞表面表达，从而以抗原特异性方式激活t细胞，其中所述抗原为根据本发明所述的一种肽。优选情况是足够量的抗原与抗原提呈细胞一同使用。优选情况是，哺乳动物细胞的tap肽转运载体缺乏或水平下降或功能降低。缺乏tap肽转运载体的适合细胞包括t2、rma-s和果蝇细胞。tap是与抗原加工相关的转运载体。人体肽载入的缺陷细胞株t2从属美国菌种保藏中心(atcc,12301parklawndrive,rockville,马里兰州20852，美国)目录号crl1992；果蝇细胞株schneider2号株从属atcc目录crl19863；小鼠rma-s细胞株ljunggren等人描述过(ljunggrenandkarre,1985)。优选情况是，宿主细胞在转染前基本上不表达mhci类分子。刺激因子细胞还优选为表达对t细胞共刺激信号起到重要作用的分子，如，b7.1、b7.2、icam-1和lfa3中的任一种分子。大量mhci类分子和共刺激分子的核酸序列可从genbank和embl数据库中公开获得。当mhci类表位用作一种抗原时，t细胞为cd8阳性t细胞。如果抗原提呈细胞受到转染而表达这种表位，则优选的细胞包括一个表达载体，该载体有能力表达含seqidno:1至seqidno:772的肽或变体氨基酸序列。可使用其他一些方法来体外生成t细胞。例如，自体肿瘤浸润性淋巴细胞可用于生成ctl。plebanski等人在(plebanskietal.,1995)使用自体外周血淋巴细胞(plb)制得t细胞。另外，也可能用肽或多肽脉冲处理树突状细胞或通过与重组病毒感染而制成自体t细胞。此外，b细胞可用于制备自体t细胞。此外，用肽或多肽脉冲处理或用重组病毒感染的巨噬细胞可用于配制自体t细胞。s.walter等人在(walteretal.,2003)中描述了通过使用人工抗原提呈细胞(aapc)体外激活t细胞，这也是生成作用于所选肽的t细胞的一种合适方法。在本发明中，根据生物素：链霉素生物化学方法通过将预制的mhc：肽复合物耦合到聚苯乙烯颗粒(微球)而生成aapc。该系统实现了对aapc上的mhc密度进行精确调节，这使得可以在血液样本中选择地引发高或低亲合力的高效抗原特异性t细胞反应。除了mhc：肽复合物外，aapc还应携运含共刺激活性的其他蛋白，如耦合至表面的抗-cd28抗体。此外，此类基于aapc的系统往往需要加入适当的可溶性因子，例如，诸如白细胞介素12的细胞因子。也可用同种异体细胞制得t细胞，在wo97/26328中详细描述了一种方法，以参考文献方式并入本文。例如，除了果蝇细胞和t2细胞，也可用其他细胞来提呈肽，如cho细胞、杆状病毒感染的昆虫细胞、细菌、酵母、牛痘感染的靶细胞。此外，也可使用植物病毒(例如，参阅porta等人在(portaetal.,1994)中描述了将豇豆花叶病毒开发为一种提呈外来肽的高产系统。被激活的t细胞直接针对本发明中的肽，有助于治疗。因此，本发明的另一方面提出了用本发明前述方法制得的激活t细胞。按上述方法制成的激活t细胞将会有选择性地识别异常表达含seqidno:1至seqidno32氨基酸序列的多肽。优选情况是，t细胞通过与其含hla/肽复合物的tcr相互作用(如，结合)而识别该细胞。t细胞是杀伤患者靶细胞方法中有用的细胞，其靶细胞异常表达含本发明中氨基酸序列的多肽。此类患者给予有效量的激活t细胞。给予患者的t细胞可能源自该患者，并按上述方法激活(即，它们为自体t细胞)。或者，t细胞不是源自该患者，而是来自另一个人。当然，优选情况是该供体为健康人。发明人使用“健康个体”是指一个人一般状况良好，优选为免疫系统合格，更优选为无任何可很容易测试或检测到的疾病。根据本发明，cd8-阳性t细胞的体内靶细胞可为肿瘤细胞(有时表达mhc-ii类抗原)和/或肿瘤周围的基质细胞(肿瘤细胞)(有时也表达mhc-ii类抗原；(dengjeletal.,2006))。本发明所述的t细胞可用作治疗性组合物中的活性成分。因此，本发明也提出了一种杀伤患者靶细胞的方法，其中患者的靶细胞异常表达含本发明中氨基酸序列的多肽，该方法包括给予患者上述有效量的t细胞。发明人所用的“异常表达”的意思还包括，与正常组织表达水平相比，多肽过量表达，或该基因在肿瘤起源的组织中未表达而在肿瘤中表达。“过量表达”是指多肽水平至少为正常组织中的1.2倍；优选为至少为正常组织中的2倍，更优选为至少5或10倍。t细胞可用本领域已知的方法制得(如，上述方法)。t细胞继转移方案为本领域所熟知的方案。综述可发现于：gattionietal.和morganetal.(gattinonietal.,2006；morganetal.,2006)。本发明的另一个方面包括使用与mhc复合的肽，以生成t细胞受体，其核酸被克隆并被引入至宿主细胞，优选为t细胞。然后，该通过基因工程改变的t细胞可转给患者用于癌症治疗。本发明的任一分子(即肽、核酸、抗体、表达载体、细胞，激活t细胞、t细胞受体或编码核酸)都有益于治疗疾病，其特点在于细胞逃避免疫反应的打击。因此，本发明的任一分子都可用作药剂或用于制造药剂。这种分子可单独使用也可与本发明中的其他分子或已知分子联合使用。本发明还涉及一种试剂盒，其包括：(a)一个容器，包含上述溶液或冻干粉形式的药物组合物；(b)可选的第二个容器，其含有冻干粉剂型的稀释剂或重构液；和(c)可选的(i)溶液使用或(ii)重构和/或使用冻干制剂的说明。该试剂盒还步包括一个或多个(iii)缓冲剂，(iv)稀释剂，(v)过滤液，(vi)针，或(v)注射器。容器最好是瓶子、小瓶、注射器或试管，可以为多用途容器。药物组合物最好是冻干的。本发明中的试剂盒优选包含一种置于合适容器中的冻干制剂以及重组和/或使用说明。适当的容器包括，例如瓶子、西林瓶(如双室瓶)、注射器(如双室注射器)和试管。该容器可能由多种材料制成，如玻璃或塑料。试剂盒和/或容器最好有容器或关于容器的说明书，指明重组和/或使用的方向。例如，标签可能表明冻干剂型将重组为上述肽浓度。该标签可进一步表明制剂用于皮下注射。存放制剂的容器可使用多用途西林瓶，使得可重复给予(例如，2-6次)重组剂型。该试剂盒可进一步包括装有合适稀释剂(如碳酸氢钠溶液)的第二个容器。稀释液和冻干制剂混合后，重组制剂中的肽终浓度优选为至少0.15mg/ml/肽(＝75μg)，不超过3mg/ml/肽(＝1500μg)。该试剂盒还可包括商业和用户角度来说可取的其他材料，包括其他缓冲剂、稀释剂，过滤液、针头、注射器和带有使用说明书的包装插页。本发明中的试剂盒可能有一个单独的容器，其中包含本发明所述的药物组合物制剂，该制剂可有其他成分(例如，其他化合物或及其药物组合物)，也可无其他成分，或者每种成分都有其不同容器。优选情况是，本发明的试剂盒包括与本发明的一种制剂，包装后与第二种化合物(如佐剂(例如gm-csf)、化疗药物、天然产品、激素或拮抗剂、抗血管生成剂或抑制剂、凋亡诱导剂或螯合剂)或其药物组合物联合使用。该试剂盒的成分可进行预络合或每种成分在给予患者之前可放置于单独的不同容器。该试剂盒的成分可以是一种或多种溶液，优选为水溶液，更优选为无菌水溶液。该试剂盒的成分也可为固体形式，加入合适的溶剂后转换为液体，最好放置于另一个不同的容器中。治疗试剂盒的容器可能为西林瓶、试管、烧瓶、瓶子、注射器、或任何其他盛装固体或液体的工具。通常，当成分不只一种时，试剂盒将包含第二个西林瓶或其他容器，使之可以单独定量。该试剂盒还可能包含另一个装载药用液体的容器。优选情况是，治疗试剂盒将包含一个设备(如，一个或多个针头、注射器、滴眼器、吸液管等)，使得可注射本发明的药物(本试剂盒的组合物)。本发明的药物配方适合以任何可接受的途径进行肽给药，如口服(肠道)、鼻内、眼内、皮下、皮内、肌内，静脉或经皮给药。优选为皮下给药，最优选为皮内给药，也可通过输液泵给药。由于本发明的肽从卵巢癌中分离而得，因此，本发明的药剂优选用于治疗卵巢癌。本发明进一步涉及为个体患者制备个体化药物的一种方法，其中包括：制造含选自预筛选tumap存储库至少一种肽的药物组合物，其中药物组合物中所用的至少一种肽选择为适合于个体患者。在一项实施方案中，药物组合物为一种疫苗。该方法也可以改动以产生下游应用的t细胞克隆物，如：tcr隔离物或可溶性抗体和其他治疗选择。“个体化药物”是指专门针对个体患者的治疗，将仅用于该等个体患者，包括个体化活性癌症疫苗以及使用自体组织的过继细胞疗法。如本文所述，“存储库”应指已经接受免疫原性预筛查和/或在特定肿瘤类型中过量提呈的一组或一系列肽。“存储库”一词并不暗示，疫苗中包括的特定肽已预先制造并储存于物理设备中，虽然预期有这种可能性。明确预期所述肽可以用于新制造每种个体化疫苗，也可能被预先制造和储存。存储库(例如，数据库形式)由肿瘤相关肽组成，其在各种hla-ahla-b和hla-c等位基因卵巢癌患者的肿瘤组织中高度过度表达。其可能含有包括mhci类和mhcii类肽或延长的mhci类肽。除了从几种卵巢癌组织中采集的肿瘤相关肽外，存储库还可能包含hla-a*02和hla-a*24标记肽。这些肽可对tumap诱导的t细胞免疫进行量化比较，从而可得出疫苗抗肿瘤反应能力的重要结论。其次，在没有观察到来自患者“自身”抗原tumap的任何疫苗诱导的t细胞反应时，它们可作为来自“非自身”抗原的重要阳性对照肽。第三，它还可对患者的免疫功能状态得出结论。存储库的tumap通过使用一种功能基因组学方法进行鉴定，该方法结合了基因表达分析、质谱法和t细胞免疫学该方法确保了只选择真实存在于高百分比肿瘤但在正常组织中不表达或仅很少量表达的tumap用于进一步分析。对于初始肽的选择，患者卵巢癌样本和健康供体的血液以循序渐进的方法进行分析：1.肿瘤材料的hla配体用质谱法确定；2.使用全基因组信使核糖核酸(mrna)表达分析法用于确定恶性肿瘤组织(小细胞肺癌)与一系列正常器官和组织相比过度表达的基因；3.确定的hla配体与基因表达数据进行比较。肿瘤组织上过度提呈或选择性提呈的肽，优选为第2步中检测到的选择性表达或过量表达基因所编码的考虑为多肽疫苗的合适候选tumap；4.文献检索以确定更多证据以支持确认为tump的肽的相关性；5.mrna水平过度表达的相关性通过由第3步选定的在肿瘤组织上的tumap的重新检测以及在健康组织上的缺乏(或低频率)而确定；6.为了评估通过选定的肽诱导体内t细胞反应是否可行，使用健康供体以及小细胞肺癌患者的人t细胞进行体外免疫原性测定。一方面，在将所述肽加入存储库之前，对其进行筛查以了解免疫原性。举例来说(但不限于此)，纳入存储库的肽的免疫原性的确定方法包括体外t细胞激活，具体为：用装载肽/mhc复合物的人工抗原提呈细胞和抗cd28抗体反复刺激来自健康供体的cd8+t细胞。这种方法优选用于罕见癌症以及有罕见表达谱的患者。与含目前开发为固定组分的多肽鸡尾酒相反的是，存储库可将肿瘤中抗原的实际表达于疫苗进行更高程度的匹配。在多目标方法中，每名患者将使用几种“现成”肽的选定单一肽或组合。理论上来说，基于从50抗原肽库中选择例如5种不同抗原肽的一种方法可提供大约170万种可能的药物产品(dp)组分。在一方面，使用本发明此处或后文所述的方法，基于个体患者的适合性，选择所述肽以包含在疫苗中。hla表型、转录和肽组学资料从患者的肿瘤材料和血液样本中收集，以确定最合适每名患者且含有“存储库”和患者独特(即突变)tumap的肽。将选择的那些肽选择性地或过度表达于患者肿瘤中，并且可能的情况下，如果用患者个体pbmc进行检测，则表现出很强的体外免疫原性。优选的情况是，疫苗所包括的肽的一种确定方法包括：(a)识别由来自个体患者肿瘤样本提呈的肿瘤相关肽(tumap)；(b)将(a)中鉴定的肽与上述肽的存储库(数据库)进行比对；且(c)从存储库(数据库)中选择与患者中确定的肿瘤相关肽相关的至少一种肽。例如，肿瘤样本提呈的tumap的鉴定方法有：(a1)将来自肿瘤样本的表达数据与所述肿瘤样本组织类型相对应的正常组织样本的表达数据相比对，以识别肿瘤组织中过量表达或异常表达的蛋白；以及(a2)将表达数据与结合到肿瘤样本中i类mhc和/或ii类分子的mhc配体序列相关联，以确定来源于肿瘤过量表达或异常表达的蛋白质的mhc配体。优选情况是，mhc配体的序列的确定方法是：洗脱来自肿瘤样本分离的mhc分子结合肽，并对洗脱配体进行测序。优选情况是，肿瘤样本和正常组织从同一患者获得。除了使用存储库(数据库)模型选择肽以外，或作为一种替代方法，tumap可能在新患者中进行鉴定，然后列入疫苗中。作为一种实施例，患者中的候选tumap可通过以下方法进行鉴定：(a1)将来自肿瘤样本的表达数据与所述肿瘤样本组织类型相对应的正常组织样本的表达数据相比对，以识别肿瘤组织中过量表达或异常表达的蛋白；以及(a2)将表达数据与结合到肿瘤样本中i类mhc和/或ii类分子的mhc配体序列想关联，以确定来源于肿瘤过量表达或异常表达的蛋白质的mhc配体。作为另一实施例，蛋白的鉴定方法为可包含突变，其对于肿瘤样本相对于个体患者的相应正常组织是独特的，并且tumap可通过特异性靶向作用于变异来鉴定。例如，肿瘤以及相应正常组织的基因组可通过全基因组测序方法进行测序：为了发现基因蛋白质编码区域的非同义突变，从肿瘤组织中萃取基因组dna和rna，从外周血单核细胞(pbmc)中提取正常非突变基因组种系dna。运用的ngs方法只限于蛋白编码区的重测序(外显子组重测序)。为了这一目的，使用供货商提供的靶序列富集试剂盒来捕获来自人样本的外显子dna，随后使用hiseq2000(illumina公司)进行测序。此外，对肿瘤的mrna进行测序，以直接定量基因表达，并确认突变基因在患者肿瘤中表达。得到的数以百万计的序列读数通过软件算法处理。输出列表中包含突变和基因表达。肿瘤特异性体突变通过与pbmc衍生的种系变化比较来确定，并进行优化。然后，为了存储库可能测试新确定的肽了解如上所述的免疫原性，并且选择具有合适免疫原性的候选tumap用于疫苗。在一个示范实施方案中，疫苗中所含肽通过以下方法确定：(a)用上述方法识别由个体患者肿瘤样本提呈的肿瘤相关肽(tumap)；(b)将(a)中鉴定的肽与肿瘤中(与相应的正常组织相比)经过免疫原性和过量提呈预筛查的肽库进行比对；(c)从存储库中选择与患者中确定的肿瘤相关肽相关的至少一种肽；及(d)可选地选择至少一种在(a)中新确定的肽，确认其免疫原性。在一个示范实施方式中，疫苗中所含肽通过以下方法确定：(a)识别由来自个体患者肿瘤样本提呈的肿瘤相关肽(tumap)；以及(b)在(a)中选择至少一种新确定的肽，并确认其免疫原性。一旦选定了用于个体化肽疫苗的肽时，则产生疫苗。该疫苗优选为一种液体制剂，包括溶解于20-40％dmso之间，优选为约30-35％dmso，例如，约33％dmso中的个体肽。列入产品的每种肽都溶于dmso中。单个肽溶液浓度的选择取决于要列入产品中的肽的数量。单肽-dmso溶液均等混合，以实现一种溶液中包含所有的肽，且浓度为每肽～2.5mg/ml。然后该混合溶液按照1：3比例用注射用水进行稀释，以达到在33％dmso中每肽0.826mg/ml的浓度。稀释的溶液通过0.22μm无菌筛检程序进行过滤。从而获得最终本体溶液。最终本体溶液填充到小瓶中，在使用前储存于-20℃下。一个小瓶包含700μl溶液，其中每种肽含有0.578mg。其中的500μl(每种肽约400μg)将用于皮内注射。本发明的肽除了用于治疗癌症，也可用于诊断。由于肽由卵巢癌细胞产生，并且已确定这些肽在正常组织中不存在或水平较低，因此这些肽可用于诊断癌症是否存在。血液样本中组织活检物含权利要求的肽，可有助于病理师诊断癌症。用抗体、质谱或其他本领域内已知的方法检测某些肽可使病理师判断该组织样本为恶性的还是炎症或一般病变，也可用作卵巢癌的生物标志物。肽基团的提呈使得能对病变组织进行分类或进一步分成子类。对病变标本中肽的检测使得能对免疫系统治疗方法的利益进行判断，特别是如果t-淋巴细胞已知或预计与作用机制有关。mhc表达的缺失是一种机制，充分说明了哪些受感染的恶性细胞逃避了免疫监视。因此，肽的提呈表明，分析过的细胞并没有利用这种机制。本发明的肽可用于分析淋巴细胞对肽的反应(如t细胞反应)，或抗体对肽或mhc分子络合的肽发生的反应。这些淋巴细胞反应可以作为预后指标，决定是否采取进一步的治疗。这些反应也可以用作免疫疗法中的替代反应指标，旨在以不同方式诱导淋巴细胞反应，如接种蛋白疫苗、核酸、自体材料、淋巴细胞过继转移。基因治疗中，淋巴细胞对肽发生的反应可以在副作用的评估中考虑。淋巴细胞反应监测也可能成为移植疗法随访检查中的一种有价值的工具，如，用于检测移植物抗宿主和宿主抗移植物疾病。下列描述优选方案的实施例将对本发明进行说明，并参照随附图表(但是不仅限于此)。考虑到本发明的目的，文中引用的所有参考文献通过引用的方式并入在本文中。附图说明图1a至图1s显示了本发明的在不同癌样本中过量表达的源基因的代表性表达谱。肿瘤(黑点)和正常(灰色点)样本按照器官起源分组，箱须图代表了中位数、第25和第75百分位(箱)以及最小和最大(须)rpkm值。正常器官根据风险类别排列顺序。rpkm＝每百万映射读数每千碱基读数。正常样本：血细胞；血管；脑；心；肝；肺；脂肪：脂肪组织；adren.gl.：肾上腺；胆管；膀胱；bm：骨髓；软骨；esoph：食管；眼睛；gallb：胆囊；头颈部；肾；large_int：大肠；ln：淋巴结；神经；胰腺；parathyr：甲状旁腺；pituit：垂体；skel.mus：骨骼肌；皮肤；small_int：小肠；脾；胃；甲状腺；气管；膀胱；乳房；卵巢；胎盘；前列腺；睾丸；胸腺；子宫。肿瘤样本：aml：急性髓性白血病；brca：乳腺癌；cll：慢性淋巴细胞白血病；crc：结直肠癌；galb：胆囊癌；gb:胶质母细胞瘤；gc：胃癌；hcc：肝细胞癌；hnscc：头颈癌；mel：黑色素瘤；nhl：非霍奇金淋巴瘤；nsclc：非小细胞肺癌；oc：卵巢癌；osc_gc：食管/胃癌；oscar：食管癌；pc：胰腺癌；pca:前列腺癌；rcc：肾细胞癌；sclc：小细胞肺癌；ubc：膀胱癌；uec：子宫和子宫内膜癌。图1a)基因符号：ct45a2，肽：kyekifeml(seqidno.:12)，图1b)基因符号：nlrp2，肽：vlygpaglgk(seqidno.:27)，图1c)基因符号：nlrp7，肽：lldegamlly(seqidno.:31)，图1d)基因符号：htr3a，肽：gllqelssi(seqidno.:66)，图1e)基因符号：vtcn1，肽：kvvsvlynv(seqidno:75)，图1f)基因符号：cyp2w1，肽：rygpvftv(seqidno.:98)，图1g)基因符号：mmp11，肽：llqpppllar(seqidno.:98)，图1h)基因符号：mmp12，肽：fvdnqywry(seqidno.:115)，图1i)基因符号：ctag2，肽：aplprpgavl(seqidno.:119)，图1j)基因符号：fam111b，肽：kpsesiysal(seqidno.:123)，图1k)基因符号：ccna1，肽：hlllkvlaf(seqidno.:151)，图1l)基因符号：fam83h，肽：hvkekfll(seqidno.:156)，图1m)基因符号：magea11，肽：kevdptshsy(seqidno.:194)，图1n)基因符号：mmp11，肽：ytfryplsl(seqidno.:227)，图1o)基因符号：znf560，肽：vfvsfsslf(seqidno.:255)，图1p)基因符号：igf2bp1，肽：isysgqflvk(seqidno.:266)，图1q)基因符号：cldn6，肽：lpmwkvtaf(seqidno.:303)，图1r)基因符号：igf2bp3，肽：iealsgkiel(seqidno.:413)，图1s)基因符号：prame，肽：eeqyiaqf(seqidno.:432)。图1t至1v显示了本发明的在不同癌症样本中过度表达的源基因的代表性表达谱。肿瘤(黑点)和正常(灰点)样本根据器官起源进行分组。盒须图代表中位fpkm值、第25和第75百分位数(盒)加上延伸到下四分位数的1.5四分位数范围(iqr)内的最低数据点以及在上四分位数的1.5iqr内的最高数据点的须。正常器官根据风险类别排列顺序。fpkm：每百万映射读数每千碱基片段。正常样本：血细胞；bloodvess(血管)；脑；心；肝；肺；脂肪(脂肪组织)；adrenalgl(肾上腺)；胆管；膀胱；骨髓；软骨；esoph(食管)；眼；gallbl(胆囊)；头颈部；intest.la(大肠)；intest.sm(小肠)；肾；淋巴结；nerveperith(外周神经)；胰腺；parathyr(甲状旁腺)；perit(腹膜)；pituit(垂体)；胸膜；skel.musskel(骨骼肌)；皮肤；脾；胃；甲状腺；气管；输尿管；乳房；卵巢；胎盘；前列腺；睾丸；胸腺；子宫。肿瘤样本：aml(急性髓性白血病)；brca(乳腺癌)；ccc(胆管细胞癌)；cll(慢性淋巴细胞性白血病)；crc(结直肠癌)；gbc(胆囊癌)；gbm(胶质母细胞瘤)；gc(胃癌)；hcc(肝细胞癌)；hnscc(头颈部鳞状细胞癌)；mel(黑色素瘤)；nhl(非霍奇金淋巴瘤)；nsclcadeno(非小细胞肺癌腺癌)；nsclcother(nsclc样本，不能明确分配为nsclcadeno或nsclcsquam)；nsclcsquam(鳞状细胞非小细胞肺癌)；oc(卵巢癌)；oscar(食管癌)；paca(胰腺癌)；prca(前列腺癌)；rcc(肾细胞癌)；sclc(小细胞肺癌)；ubc(膀胱癌)；uec(子宫和子宫内膜癌)。图1t)，基因符号：magea4，肽：spdaeslfrealsnkvdel(seqidno.:597)，图1u)基因符号：magea4，肽：lsnkvdelahfllrk(seqidno.:601)，图1v)基因符号：mageb3，肽：klitqdlvklkyleyrq(seqidno.:604)。图2显示了健康hla-a*02+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和与seqidno773肽(alygkllkl,seqidno:773)复合的hla-a*02的人工apc进行致敏(a，左图)。经过3个周期的刺激后，用a*02/seqidno773(a)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a)显示了用不相关a*02/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图3显示了健康hla-a*24+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和与seqidno774肽复合的hla-a*24的人工apc进行致敏(a，左图)。经过3个周期的刺激后，用a*24/seqidno774(vyvddiyvi,seqidno:774)(a)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a)显示了用不相关a*24/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图4显示了健康hla-a*02+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno67肽slllpsifl(a，左图)或seqidno75肽kvvsvlynv(b，左图)复合的hla-a*02的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用a*02/seqidno67(a)或a*02/seqidno75(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关a*02/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图5显示了健康hla-a*24+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno11肽sysdlhygf(a，左图)或seqidno79肽synehwnyl(b，左图)复合的hla-a*24的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用a*24/seqidno11(a)或a*24/seqidno79(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关a*24/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图6显示了健康hla-b*07+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno33肽sptfhltl(a，左图)或seqidno40肽kpgtsyrvtl(b，左图)复合的hla-b*07的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用b*07/seqidno33(a)或b*07/seqidno40(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关b*07/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图7显示了健康hla-a*01+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno113肽qldsnrlty(a，左图)或seqidno115肽fvdnqywry(b，左图)复合的hla-a*01的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用a*01/seqidno113(a)或a*01/seqidno115(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关a*01/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图8显示了健康hla-a*03+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno23肽gmmkggirk(a，左图)或seqidno90肽kvageryvyk(b，左图)复合的hla-a*03的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用a*03/seqidno23(a)或a*03/seqidno90(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关a*03/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。图9显示了健康hla-b*44+供体的肽特异性cd8+t细胞体外反应的示例性结果。cd8+t细胞通过使用包覆有cd28mab和分别与seqidno200肽aesiptvsf(a，左图)或seqidno211肽eekvfpsplw(b，左图)复合的hla-b*44的人工apc进行致敏。经过3个周期的刺激后，用b*44/seqidno200(a)或b*44/seqidno211(b)的2d多聚体染色法对肽反应性细胞进行检测。右图(a和b)显示用不相关b*44/肽复合体刺激的细胞的对照染色。活单细胞通过cd8+淋巴细胞门控。boolean门控帮助排除用对不同肽特异的多聚体检测出的假阳性事件。提示了cd8+淋巴细胞中特异性多聚体+细胞的频率。实施例实施例1细胞表面提呈的肿瘤相关肽的识别组织样本患者的肿瘤组织和正常组织从蒂宾根大学医院(蒂宾根，德国)获得。所有患者在手术或尸检前都获得了书面知情同意。切除后组织立即进行冷休克处理，在分离tumap前储存于-70℃或以下。从组织样本中分离hla肽根据方案(falketal.,1991；seegeretal.,1999)略加修改，使用hla-a*02特异性抗体bb7.2，hla-a、hla-b、hla-c特异性抗体w6/32，hla-dr特异性抗体l243和泛hlaii类特异性抗体tü39，cnbr活化的琼脂糖凝胶，酸处理和超滤方法以免疫沉淀法从实体组织中获得冷冻组织样本中的hla肽库。质谱分析获得的hla肽库根据其疏水性用反相色谱(ultimate3000rslcnanouhplcsystem,dionex)分离，洗脱肽用装有电喷雾源的ltq-orbitrap和融合lumos杂交质谱(thermoelectron)进行了分析。在2cmpepmap100c18nanotrap柱(dionex)上以4μl/min的流速将肽样本载入3％的溶剂b(20％h2o，80％乙腈和0.04％甲酸)10分钟。分离在装载到50℃下运行的柱式烘箱中具有2μm粒度的25cm或50cmpepmapc18柱(dionex)上进行。所施加的梯度在300nl/min(对于25cm柱)的流速下在90min内或在175nl/min(对于50cm柱)的流速下在140min内为3％至32％溶剂b。(溶剂a：99％h2o、1％acn和0.1％甲酸；溶剂b：20％h2o、80％acn和0.1％甲酸)。质谱分析采用前五种方法(即在每次调查扫描中选择五种最丰富的前体离子用于破碎)以数据依赖性采集模式进行。或者，采用topspeed方法在fusionlumos仪器上进行分析。在orbitrap上以60,000(对于orbitrapxl)或120,000(对于orbitrapfusionlu-mos)的解析度记录检查扫描结果。通过碰撞诱导解离(cid，归一化碰撞能量35％、活化时间30ms、分离宽度1.3m/z)进行ms/ms分析，随后在线性阱四极杆(ltq)中进行分析。对于hla-i类配体，品质范围限于400-650m/z，破碎选定的可能电荷状态为2+和3+。对于hla-ii类配体，品质范围设置为300-1500m/z，允许所有正电荷状态≥2的碎片化处理。串联质谱由mascot或sequest以固定的错误发现率(q≤0.05)和额外的手动控制器进行解读。在确定的肽序列不确定的情况下，通过比较生成的天然肽片段化模式与合成序列相同参考肽的片段化模式，进一步验证所述肽序列。表19显示了选定肽在各种癌症实体上的提呈，从而显示出所提及的肽在诊断和/或治疗所示癌症(例如，用于结直肠癌、胆囊癌、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌和子宫和子宫内膜癌的肽seqidno.1，用于乳腺癌、胆管细胞癌、结直肠癌、胆囊癌、胃癌、头颈部鳞状细胞癌、黑色素瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、小细胞肺癌、子宫和子宫内膜癌的肽seqidno.2)中的特别相关性。表19：本发明选定肿瘤相关肽在各类肿瘤中提呈的概述。aml：急性髓性白血病；brca：乳腺癌；ccc：胆管细胞癌；cll：慢性淋巴细胞白血病；crc：结直肠癌；gbc：胆囊癌；gbm:胶质母细胞瘤；gc：胃癌；gejc：胃食管交界癌；hcc：肝细胞癌；hnscc：头颈部鳞状细胞癌；mel：黑色素瘤；nhl：非霍奇金淋巴瘤；nsclc：非小细胞肺癌；oc：卵巢癌；oscar：食管癌；paca：胰腺癌；prca:前列腺癌；rcc：肾细胞癌；sclc：小细胞肺癌；ubc：膀胱癌；uec：子宫和子宫内膜癌实施例2编码本发明肽的基因的表达谱与正常细胞相比，在肿瘤细胞上过度提呈或特定提呈的肽足以说明其在免疫治疗中的有用性，且一些肽为肿瘤特异性的，尽管其源蛋白也存在于正常组织中。而且，mrna表达谱增加了选择免疫治疗目标肽的额外安全度。特别是对于具有高安全风险的治疗选项，诸如亲和力成熟的tcr，理想的目标肽将来源于对该肿瘤独一无二且不出现于正常组织中的蛋白。rna来源与制备在获得每名患者的书面知情同意后，如上所述提供手术中切除的组织标本(参见实施例1)。手术后立即速冻肿瘤组织标本，之后在液态氮中用杵臼匀浆。使用tri试剂(ambion公司,darmstadt，德国)之后用rneasy(qiagen公司，hilden，德国)清理从这些样本中制备总rna；这两种方法都根据制造商的方案进行。用于rnaseq实验的来自健康人体组织的总rna获得自：asterand(detroit,密西根州,美国&royston,赫特福德,英国)、bio-optionsinc.(brea,加州,美国)、geneticistinc.(glendale,加州,美国)、proteogenexinc.(culvercity,加州,美国)、tissuesolutionsltd(格拉斯哥,英国)。用于rnaseq实验的来自肿瘤组织的总rna获得自：asterand(detroit,密西根州,美国&royston,赫特福德,英国)、biocatgmbh(海德堡,德国)、bioserve(beltsville,马里兰州，美国)、geneticistinc.(glendale,加州,美国)、istitutonazionaletumori"pascale"(那不勒斯,义大利)、proteogenexinc.(culvercity,加州,美国)、海德堡大学医院(海德堡,德国)。所有rna样本的品质和数量都在agilent2100bioanalyzer分析仪(agilent公司，waldbronn，德国)上使用rna6000picolabchipkit试剂盒(agilent公司)进行评估。rnaseq实验通过新一代测序技术(rnaseq)由cegat(tübingen,germany)对肿瘤和正常组织的rna样本进行基因表达分析。简言之，根据供应商的方案(illuminainc.,sandiego,ca,usa)，其中包括rna碎片化、cdna转化和测序接头的加入，利用illuminahiseqv4试剂盒准备测序文库。从多个样本获得的文库根据制造商的说明等摩尔混合并在illuminahiseq2500定序器上测序，产生50bp的单端读数。处理的读数使用star软件映射至人类基因组(grch38)。根据ensembl序列资料库的说明(ensembl77)，表达资料在转录水准设置为rpkm(每百万映射读数每千碱基读数，由cufflinks软件生成)并在外显子水准上设置(总读数，由bedtools软件生成)。外显子读数被归为外显子长度和校准尺寸，以获得rpkm值。本发明的在卵巢癌中高度过量表达的代表性源基因表达谱如图1所示。其他示例性基因的表达分数见表10。表10：表达分数。该表列出了与一系列正常组织相比在oc肿瘤上非常高度过量表达(+++)、与一系列正常组织相比在oc肿瘤上高度过量表达(++)或与一系列正常组织相比在oc肿瘤上过量表达(+)的基因的肽。本基线得分根据以下相关正常组织的测量值计算：脂肪组织、肾上腺、胆管、血细胞、血管、骨髓、脑、软骨、食管、眼、胆囊、心脏、头颈、肾、大肠、肝、肺、淋巴结、神经、甲状旁腺、胰腺、垂体、骨胳肌、皮肤、小肠、脾、胃、甲状腺、气管、膀胱。如果获得同一组织类型几个样本的表达数据，则使用各样本的算术平均值进行计算。实施例3mhc-i类提呈肽的体外免疫原性为了获得关于本发明tumap的免疫原性信息，发明人使用体外t细胞致敏检测方法进行了研究，其中该检测方法基于装载有肽/mhc复合物和cd28抗体的人工抗原提呈细胞(aapc)对cd8+t细胞的反复刺激。用这种方法，发明人可显示出本发明的hla-a*0201、hla-a*24:02、hla-a*01:01、hla-a*03:01、hla-b*07:02和hla-b*44:02限制tumap具有免疫原性，这表明这些肽是人体内存在的针对人cd8+前体t细胞的t细胞表位(表11)。cd8+t细胞体外致敏为了用载有肽-mhc复合物(pmhc)和cd28抗体的人工抗原提呈细胞进行体外刺激，发明人首先从universityclinicsmannheim,germany中获取健康供体cd8微珠(miltenyibiotec,bergisch-gladbach,germany)通过积极选择白细胞清除术后新鲜hla-a*02、hla-a*24、hla-a*01、hla-a*03、hla-b*07或hla-b*44产物而分离出cd8+t细胞。pbmc和分离出的cd8+淋巴细胞使用前在t细胞培养基(tcm)中培养，培养基包括rpmi-glutamax(invitrogen公司，karlsruhe，德国)并补充10％热灭活人ab血清(pan-biotech公司，aidenbach，德国)、100u/ml青霉素/100μg/ml链霉素(cambrex公司，cologne，德国)，1mm丙酮酸钠(ccpro公司，oberdorla，德国)和20μg/ml庆大霉素(cambrex公司)。在此步骤，2.5ng/ml的il-7(promocell公司，heidelberg，德国)和10u/ml的il-2(novartispharma公司，nürnberg，德国)也加入tcm。对于pmhc/cd28涂层珠的生成、t细胞的刺激和读出，使用每刺激条件四个不同pmhc分子以及每个读出条件8个不同的pmhc分子在高度限定的体外系统中进行。纯化的共刺激小鼠igg2a抗人cd28抗体9.3(jungetal.,1987)使用制造商(perbio公司，波恩，德国)推荐的n-羟基琥珀酰亚胺生物素进行化学生物素化处理。所用珠为5.6μm的链霉抗生物素蛋白包裹的多聚苯乙烯颗粒(bangslabooratories，伊利诺州，美国)。用于阳性和阴性对照刺激物的pmhc分别为a*0201/mla-001(从melan-a/mart-1中修饰制得的肽elagigiltv(seqidno.775))和a*0201/ddx5-001(从ddx5中获得的yllpaivhi(seqidno.776))。800.000珠/200μl包裹于含有4x12.5ng不同生物素-pmhc的96孔板、进行洗涤，随后加入体积为200μl的600ng生物素抗-cd28。在37℃下，在含5ng/mlil-12(promocell)的200μltcm中共培养1x106cd8+t细胞与2x105的清洗涂层珠3天，从而启动刺激。之后，一半培养基与补充80u/mlil-2的新鲜tcm进行交换，并且培养在37℃下持续4天。这种刺激性周期总共进行3次。对于使用每条件8种不同pmhc分子的pmhc多聚体读出，二维组合编码方法如前述使用(andersenetal.,2012)，稍作修饰，涵盖耦合至5种不同的萤光染料。最后，用live/deadnearir染料(invitrogen公司，karlsruhe，德国)、cd8-fitc抗体克隆sk1(bd公司，heidelberg，德国)和萤光pmhc多聚体而执行多聚体分析。对于分析，使用了配有合适镭射仪和筛检程序的bdlsriisorp细胞仪。肽特异性细胞以占总cd8+细胞的百分比形式进行计算。多聚体分析结果使用flowjo软件(treestar公司，oregon，美国)进行评估。特定多聚体+cd8+淋巴细胞的体外致敏通过与阴性对照刺激比较而进行检测。如果健康供体中的至少一个可评价的体外刺激孔在体外刺激后发现含有特异性cd8+t细胞株(即该孔包含至少1％特定多聚体+cd8+t细胞，并且特定多聚体+的百分比至少为阴性对照刺激中位数的10倍)，则检测出给定抗原的免疫原性。卵巢癌肽的体外免疫原性对于所测试的hla-i类肽，可通过肽特异性t细胞株的生成来证明其体外免疫原性。本发明14种肽的tumap特异性多聚体染色后的流式细胞仪检测的典型结果如图2至9所示，同时也含有相应的阴性对照信息。本发明118种肽的结果汇总于表11a和表11b。表11a：本发明中hlai类肽的体外免疫原性。申请人对本发明的肽所做的体外免疫原性实验的示例性结果。<20％＝+；20％-49％＝++；50％-69％＝+++；>＝70％＝++++序列号序列阳性孔[％]773alygkllkl+++774vyvddiyvi+++表11b：本发明中hlai类肽的体外免疫原性。申请人对本发明的肽所做的体外免疫原性实验的示例性结果。<20％＝+；20％-49％＝++；50％-69％＝+++；>＝70％＝++++实施例4肽的合成所有的肽通过使用fmoc策略以标准、广为接受的固相肽合成法合成。每个肽的身份和纯度已使用质谱和rp-hplc分析法确定。用冻干法(三氟乙酸盐)获得白色至类白色的肽，纯度为>50％。所有的tumap优选作为三氟乙酸盐或乙酸盐进行给药，其他药用盐形式也可以。实施例5mhc结合测定对本发明基于t细胞疗法的候选肽进一步测试其mhc结合能力(亲和性)。单个肽-mhc复合体通过uv-配体交换而产生，其中紫外线敏感肽经紫外线照射后裂解，与所分析的相关肽交换。只有能够有效地结合并稳定肽-接受mhc分子的候选肽才能阻止mhc复合物的解离。为了确定交换反应的产率，进行基于稳定mhc复合物的轻链(β2m)检测的elisa。检测总体上按照rodenko等人在(rodenkoetal.,2006)中描述的方法进行。96孔maxisorp板(nunc)在室温下在pbs中以2ug/ml链霉包被过夜，用4倍洗涤并在37℃下在含封闭缓冲液的2％bsa中封闭1小时。折迭的hla-a*02:01/mla-001单体作为标准品，涵盖15-500ng/ml的范围。紫外线交换反应的肽-mhc单体在封闭缓冲液中稀释100倍。样本在37℃下孵育1小时，洗涤四次，在37℃下以2ug/mlhrp缀合抗-β2m温育1小时，再次洗涤，并以nh2so4封堵的tmb溶液进行检测。在450nm处测量吸收。显示出高交换产率(优选为高于50％，最优选为高于75％)的候选肽通常优选用于抗体或其片段时和/或t细胞受体或其片段的生成和生产，这是因为它们对mhc分子表现出足够的亲合力，并能防止mhc复合物的解离。表12：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-a*02:01的结合根据肽交换产量分类：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++表13：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-a*24:02的结合根据肽交换产量分类：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++表14：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-a*01:01的结合根据肽交换产量分类：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++序列id号序列肽交换31lldegamlly++++112tvtgaeqiqy++113qldsnrlty+++114vmeqsagimy++115fvdnqywry+++116vlldegamlly++288spvtsvhggty++289rwektdlty++290dmdeeieaey++291etirsvgyy+++292nvtmkvvsvly+++表15：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-a*03:01的结合根据肽交换产量分类：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++表16：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-b*07:02的结合根据肽交换产量分类：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++表17：mhc-i类结合分数。hla-i类限制肽与hla-b*44:02的结合根据肽交换产量测量：>10％＝+；>20％＝++；>50＝+++；>75％＝++++实施例6肽-mhci类复合体的稳定性hla-b*08:01肽进行了肽-mhc稳定性测定。使用基于近似数、均一即时测定方法来获得数据，以测量hlai类分子的肽解离度。首先，在大肠杆菌中表达人重组hla-b*08:01和b2m，并在一系列基于液相色谱的步骤中纯化(ferreetal.,2003；ostergaardetal.,2001)。然后，通过在37℃下测量与mhc重链相关的b2m随时间的含量来确定肽-mhc复合体(pmhc)的稳定性(harndahletal.,2012)。通过将数据拟合成单相解离方程来计算每个pmhc的稳定性，表示为与相应重链相关的b2m的半衰期。在目标肽的三个独立实验中测量pmhc稳定性，并且发现hla-b*08:01跨越弱结合剂(+)至非常稳定结合剂(++++)的范围。平均半衰期(t1/2)见表18。表18：基于三次单独测量的平均半衰期(t1/2)。t1/2>2h＝+；t1/2>4h＝++；t1/2>6h＝+++；t1/2>10h＝++++序列id号序列平均半衰期(t1/2)43alkartvtf+++44lnkqkvtf++++45vgrekklal++46dmkkakeql+47mpnlrsvdl++48dvkkkikev+49lprlkafmi++50dmkyknrv+51slrlknvql+150maavkqal++151hlllkvlaf++152mgsarvael++153namlrkvav+154mlrkiavaa+156hvkekfll++157eamkrlsyi+158lpklagll+159vlkhkldel+160ypkarlaf+++161alkttttal+162qakthstl+163qgllrpvf++164siktksaem+++166tpklretsi++167tsherlttl++169tsmprssam+++170ylleksrvi++171fafrkeal++172klkernrel+++394mykmkkpi+395vllprlvsc+实施例7选定肽对hlaii类同种异型的结合分数主要组织相容性复合体ii类(mhc-ii)分子主要在专门的抗原提呈细胞表面上表达，其中它们将肽展示给t辅助细胞，其协调许多宿主免疫应答的发生及结果。因此了解哪些肽将由mhc-ii分子提呈对于理解t辅助细胞的活化非常重要，并且可以用于鉴定t细胞表位。由mhcii类分子提呈的肽结合于由mhcα-和β-链的残基形成的结合凹槽。肽-mhc结合亲和力主要由肽结合核心的氨基酸序列决定。hlaii类结合预测演算法仅适用于最重要的ii类等位基因，并且已经使用syfpeithi演算法进行了检验(rammenseeetal.,1999)。该演算法已被成功地用于确定来自广泛抗原，如，来自人类肿瘤相关抗原trp2(i类)(sunetal.,2000)和ssx2(ii类)(neumannetal.,2004)的i类和ii类表位。表20显示了可能结合所选肽的hlaii类同种异型。如果syfpeithi分数等于或高于18，则认为该肽与hla分子结合。引用的参考文献：themoleculartaxonomyofprimaryprostatecancer.cell163(2015):1011-1025abba,m.c.etal.,mol.cancerres5(2007):881-890abdelmalak,c.a.etal.,clinlab60(2014):55-61abe,a.etal.,geneschromosomes.cancer55(2016):242-250aghajanova,l.etal.,hum.reprod.30(2015):232-238agherbi,h.etal.,plos.one.4(2009):e5622aguilo,f.etal.,curr.top.microbiol.immunol.394(2016):29-39akagi,t.etal.,jbiolchem290(2015):22460-22473al,zeyadim.etal.,biotechnol.biotechnol.equip.29(2015):111-118albergaria,a.etal.,int.jdev.biol55(2011):811-822alentorn,a.etal.,pressemed42(2013):806-813alhosin,m.etal.,jexp.clincancerres35(2016):174allison,j.p.etal.,science270(1995):932-933alrawi,s.j.etal.,anticancerres26(2006):107-119alvarado-ruiz,l.etal.,asianpac.jcancerprev.17(2016):1037-1047alzrigat,m.etal.,oncotarget.(2016)amsterdam,a.etal.,actahistochem.116(2014):781-787andersen,r.s.etal.,nat.protoc.7(2012):891-902andrade,v.c.etal.,cancerimmun.8(2008):2andrade,v.c.etal.,exp.hematol.37(2009):446-449angelopoulou,k.etal.,mamm.genome21(2010):516-524angulo,j.c.etal.,jurol.195(2016):619-626ansari,k.i.etal.,jmol.endocrinol.48(2012):61-75appay,v.etal.,eur.jimmunol.36(2006):1805-1814aprelikova,o.etal.,cancerres69(2009):616-624arsenic,r.etal.,bmc.cancer15(2015):784askew,e.b.etal.,jbiolchem284(2009):34793-34808aung,p.p.etal.,oncogene25(2006):2546-2557avasarala,s.etal.,biolopen.2(2013):675-685avgustinova,a.etal.,natcommun.7(2016):10305aytes,a.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a110(2013):e3506-e3515bahnassy,a.a.etal.,worldjgastroenterol.20(2014):18240-18248bailey,v.j.etal.,methods52(2010):237-241balaz,p.etal.,ann.surg.235(2002):519-527banchereau,j.etal.,cell106(2001):271-274band,a.m.etal.,jmammary.gland.biolneoplasia.16(2011):109-115bao,l.etal.,cellbioltoxicol.32(2016):419-435baroy,t.etal.,mol.cancer13(2014):93bartolini,a.etal.,clincancerres22(2016):4923-4933baty,f.etal.,jbiomed.inform.58(2015):175-185beard,r.e.etal.,clincancerres19(2013):4941-4950beatty,g.etal.,jimmunol166(2001):2276-2282beggs,j.d.,nature275(1978):104-109beke,l.etal.,biosci.rep.35(2015)bell,j.l.etal.,jclinoncol33(2015):1285-1293bell,j.l.etal.,cellmollifesci.70(2013):2657-2675benz,c.c.etal.,oncogene15(1997):1513-1525bergamini,a.etal.,expert.opin.investig.drugs25(2016):1405-1412berger,c.etal.,curr.mol.med.13(2013):1229-1240bernstein,m.b.etal.,cancerbiother.radiopharm.29(2014):153-161beyranvand,nejade.etal.,cancerres76(2016):6017-6029bhan,s.etal.,oncolrep.28(2012):1498-1502bierkens,m.etal.,geneschromosomes.cancer52(2013):56-68bikkavilli,r.k.etal.,oncogene34(2015):5317-5328bisig,b.etal.,best.pract.resclinhaematol.25(2012):13-28bode,p.k.etal.,mod.pathol.27(2014):899-905boeva,v.etal.,plos.one.8(2013):e72182bogush,t.a.etal.,antibiot.khimioter.54(2009):41-49bonitsis,n.etal.,exp.oncol28(2006):187-193borgono,c.a.etal.,cancerres63(2003):9032-9041borgono,c.a.etal.,clincancerres12(2006):1487-1493borgono,c.a.etal.,jbiolchem282(2007):2405-2422borowicz,s.etal.,jvis.exp.(2014):e51998boulter,j.m.etal.,proteineng16(2003):707-711braumuller,h.etal.,nature(2013)brinkmann,u.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a95(1998):10757-10762brossart,p.etal.,blood90(1997):1594-1599bruckdorfer,t.etal.,curr.pharm.biotechnol.5(2004):29-43bruey,j.m.etal.,jbiolchem279(2004):51897-51907bryan,r.t.,philos.trans.rsoc.londbbiolsci.370(2015):20140042bryan,r.t.etal.,jurol.184(2010):423-431buchet-poyau,k.etal.,nucleicacidsres35(2007):1289-1300bundela,s.etal.,plos.one.9(2014):e102610burnett,r.m.etal.,oncotarget.6(2015):12682-12696cano,a.etal.,future.oncol8(2012):1095-1108caputi,f.f.etal.,jmol.neurosci.51(2013):532-538card,k.f.etal.,cancerimmunolimmunother.53(2004):345-357carrera,m.etal.,int.jclinexp.pathol.8(2015):3613-3623cerveira,n.etal.,bmc.cancer10(2010):518chakrabarty,s.etal.,jcellphysiol186(2001):47-52chan,m.h.etal.,pediatr.bloodcancer59(2012):1173-1179chandra,v.etal.,celldeath.dis.5(2014):e1380chang,h.etal.,biochem.biophys.rescommun.464(2015a):45-50chang,q.etal.,oncotarget.6(2015b):42838-42853chen,h.s.etal.,zhonghuaganzang.bing.zazhi.11(2003):145-148chen,s.t.etal.,cancersci.102(2011a):2191-2198chen,y.etal.,cancerbiolther.11(2011b):497-511chen,y.etal.,onco.targets.ther.7(2014):1465-1472chen,y.c.etal.,taiwan.jobstet.gynecol.54(2015):572-579chen,y.l.etal.,intjsurg.11(2013):85-91chen,y.t.etal.,int.jcancer124(2009):2893-2898chen,y.t.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a102(2005):7940-7945cheng,y.c.etal.,jneurochem.110(2009):947-955cheung,a.etal.,oncotarget.7(2016):52553-52574chevillard,g.etal.,blood117(2011):2005-2008choi,m.r.etal.,apmis123(2015):65-71choijamts,b.etal.,stemcells29(2011):1485-1495chung,h.etal.,biolchem393(2012a):413-420chung,s.etal.,oncotarget.3(2012b):1629-1640ciruelosgil,e.m.,cancertreat.rev40(2014):862-871clancy,a.a.etal.,ann.oncol27(2016):1696-1705clermont,p.l.etal.,clinepigenetics.8(2016):16clermont,p.l.etal.,clinepigenetics.7(2015):40clermont,p.l.etal.,br.jcancer111(2014):1663-1672cohen,c.j.etal.,jmolrecognit.16(2003a):324-332cohen,c.j.etal.,jimmunol170(2003b):4349-4361cohen,s.n.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a69(1972):2110-2114colas,e.etal.,clintransl.oncol14(2012):715-720coligan,j.e.etal.,currentprotocolsinproteinscience(1995)colombetti,s.etal.,jimmunol.176(2006):2730-2738colovai,a.i.etal.,cytometrybclincytom.72(2007):354-362cortesini,r.,jop.8(2007):697-703coulie,p.g.etal.,immunol.rev188(2002):33-42coutte,l.etal.,gene240(1999):201-207cui,x.p.etal.,dig.dis.sci.59(2014):1442-1451curran,k.j.etal.,mol.ther.23(2015):769-778dai,w.etal.,am.jcancerres5(2015):2697-2707dalerba,p.etal.,int.jcancer93(2001):85-90dannenmann,s.r.etal.,cancerimmunol.res.1(2013):288-295darda,l.etal.,plos.one.10(2015):e0122285darling,m.r.etal.,headneckpathol.2(2008):169-174dat,let.etal.,int.joncol40(2012):1455-1469davidson,b.etal.,jcellmol.med.15(2011):535-544davis,m.p.,cleve.clinjmed79electronicsuppl1(2012):es51-es55degoeje,p.l.etal.,oncoimmunology4(2015):e1014242dematos,simoesr.etal.,bmc.syst.biol9(2015):21de,meulenaerea.etal.,pathobiology83(2016):327-333de,plaene.etal.,immunogenetics40(1994):360-369dengjel,j.etal.,clincancerres12(2006):4163-4170denkberg,g.etal.,jimmunol171(2003):2197-2207devetzi,m.etal.,thromb.haemost.109(2013):716-725dewar,r.etal.,arch.pathol.labmed135(2011):422-429dias,r.p.etal.,epigenomics.5(2013):331-340dobrowolska,h.etal.,cytometrybclincytom.84(2013):21-29dong,q.etal.,biomed.resint.2015(2015):156432dorn,j.etal.,critrevclinlabsci.51(2014):63-84du,t.etal.,mol.cancer13(2014):100dua,p.etal.,cancerres73(2013):1934-1945duan,z.etal.,clincancerres9(2003):2778-2785dufour,c.etal.,cancer118(2012):3812-3821dyrskjot,l.etal.,br.jcancer107(2012):116-122ek,s.etal.,cancerres62(2002):4398-4405emmrich,s.etal.,genesdev.28(2014):858-874fabbri,c.etal.,dig.endosc.(2017)falk,k.etal.,nature351(1991):290-296fan,m.etal.,int.jclinexp.pathol.7(2014):6768-6775fang,f.etal.,clincancerres20(2014a):6504-6516fang,l.etal.,biochem.biophys.rescommun.446(2014b):272-279faure,a.etal.,natrevurol.13(2016):141-150feng,x.etal.,mol.biosyst.11(2015):2946-2954ferre,h.etal.,proteinsci.12(2003):551-559findeis-hosey,j.j.etal.,biotech.histochem.87(2012):24-29fishman,w.h.,tumour.biol16(1995):394-402follenzi,a.etal.,natgenet.25(2000):217-222fong,l.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a98(2001):8809-8814fontalba,a.etal.,jimmunol.179(2007):8519-8524forghanifard,m.m.etal.,cancerbiolther.12(2011):191-197frasor,j.etal.,mol.cellendocrinol.418pt3(2015):235-239fritzsche,f.etal.,br.jcancer94(2006):540-547fry,e.a.etal.,int.jcancer140(2017):495-503fujiyama,t.etal.,jdermatol.sci.75(2014):43-48fukumoto,i.etal.,jhum.genet.61(2016):109-118fuqua,s.a.etal.,breastcancerrestreat.144(2014):11-19gabrilovich,d.i.etal.,natmed.2(1996):1096-1103gan,x.etal.,dis.markers2016(2016):5259602ganguly,r.etal.,mol.cancerther.13(2014):1393-1398garg,m.etal.,jclinendocrinol.metab99(2014):e62-e72gattinoni,l.etal.,natrev.immunol6(2006):383-393ge,l.etal.,jbiomed.res29(2015a)ge,l.etal.,eur.revmedpharmacol.sci.19(2015b):2703-2710geyer,c.r.,epigenetics.5(2010):696-703ghodsi,m.etal.,int.jsurg.13(2015):193-197gibbs,p.etal.,melanomares10(2000):259-264gleize,v.etal.,ann.neurol.78(2015):355-374gnjatic,s.etal.,procnatl.acad.sci.u.s.a100(2003):8862-8867godkin,a.etal.,int.immunol9(1997):905-911gomez,a.etal.,mol.pharmacol.78(2010):1004-1011gong,y.etal.,adv.anat.pathol.21(2014):191-200gottlieb,h.b.etal.,jneuroendocrinol.19(2007):531-542gragert,l.etal.,hum.immunol.74(2013):1313-1320grah,j.j.etal.,tumori100(2014):60-68grat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death.dis.4(2013):e586kohrt,d.etal.,cellcycle13(2014):62-71kontos,c.k.etal.,clinchemlabmed54(2016):315-324koonrungsesomboon,n.etal.,cancerepidemiol.39(2015):487-496korr,d.etal.,cellsignal.18(2006):910-920kountourakis,p.etal.,thromb.haemost.101(2009):541-546krepischi,a.c.etal.,mol.cytogenet.9(2016):20krieg,a.m.,natrev.drugdiscov.5(2006):471-484kruhlak,m.etal.,nature447(2007):730-734kuball,j.etal.,blood109(2007):2331-2338kuga,t.etal.,jcellsci.126(2013):4721-4731kuga,t.etal.,sci.rep.6(2016):26557kumar-sinha,c.etal.,genomemed7(2015):129kumari,a.etal.,bmc.resnotes9(2016):92kuner,r.etal.,jmol.med(berl)91(2013):237-248kuo,c.t.etal.,cancerlett.378(2016):104-110kuppers,r.etal.,jclininvest111(2003):529-537kuraishi,y.,yakugakuzasshi134(2014):1125-1142kurscheid,s.etal.,genomebiol16(2015):16kwon,o.s.etal.,oncotarget.6(2015):41916-41928la,vecchiac.,eur.jcancerprev.10(2001):125-129lally,k.m.etal.,int.jcancer93(2001):841-847lapin,v.etal.,oncogenesis.3(2014):e133latini,f.r.etal.,bloodcellsmol.dis.50(2013):161-165lawrenson,k.etal.,int.jcancer136(2015a):1390-1401lawrenson,k.etal.,natcommun.6(2015b):8234lazaro-ibanez,e.etal.,bmc.cancer17(2017):92lederer,m.etal.,semin.cancerbiol29(2014):3-12lee,e.etal.,bmb.rep.46(2013):594-599lee,o.h.etal.,mol.cellproteomics.10(2011):m110leong,s.r.etal.,mol.pharm.12(2015):1717-1729leung,f.etal.,cancerepidemiol.biomarkersprev.25(2016):1333-1340li,b.etal.,cellbiochem.biophys.70(2014a):1363-1368li,b.etal.,oncotarget.(2016a)li,h.etal.,gynecol.oncol84(2002):216-221li,l.etal.,cytokine89(2017):173-178li,l.etal.,zhongguoshiyan.xue.ye.xue.zazhi.24(2016b):326-331li,m.etal.,oncotarget.7(2016c):51503-51514li,m.etal.,clincancerres11(2005):1809-1814li,q.etal.,jgastroenterol.hepatol.29(2014b):835-842li,w.m.etal.,jsurg.oncol(2016d)li,z.etal.,cancerres76(2016e):619-629liang,x.etal.,oncotarget.7(2016):52207-52217liddy,n.etal.,natmed.18(2012):980-987lilja-maula,l.etal.,jcomppathol.150(2014):399-407lim,j.y.etal.,worldjgastroenterol.19(2013):7078-7088lin,j.etal.,clincancerres10(2004):5708-5716lin,l.etal.,oncollett.6(2013a):740-744lin,q.etal.,jcancerresclinoncol135(2009):1675-1684lin,z.etal.,diagn.pathol.8(2013b):133linn,d.e.etal.,plos.one.10(2015):e0120628linz,k.etal.,jpharmacol.exp.ther.349(2014):535-548liu,d.b.etal.,worldjgastroenterol.11(2005):1562-1566liu,m.etal.,cellmol.neurobiol.34(2014a):913-923liu,q.etal.,jbiolchem286(2011):29951-29963liu,r.etal.,cancerbiolther.16(2015a):317-324liu,w.etal.,mol.clinoncol2(2014b):219-225liu,x.etal.,biomed.pharmacother.88(2017):595-602liu,x.etal.,int.immunopharmacol.25(2015b):416-424liu,y.etal.,int.jgynecol.cancer23(2013):304-311ljunggren,h.g.etal.,jexp.med.162(1985):1745-1759llaurado,m.etal.,int.jcancer130(2012a):1532-1543llaurado,m.etal.,mol.cancerres10(2012b):914-924longenecker,b.m.etal.,annn.y.acad.sci.690(1993):276-291lopez,r.etal.,int.jgynecol.cancer16(2006):1289-1296lopez-romero,r.etal.,revmedinst.mex.seguro.soc.53suppl2(2015):s188-s193lorincz,a.t.,actacytol.60(2016):501-512lose,f.etal.,biolchem393(2012):403-412low,g.m.etal.,oraloncol61(2016):27-30lukas,t.j.etal.,proc.natl.acad.sci.u.s.a78(1981):2791-2795lunardi,a.etal.,cancerdiscov5(2015):550-563lundblad,r.l.,chemicalreagentsforproteinmodification3rd(2004)luo,h.etal.,int.jclinexp.med7(2014):1244-1254luo,p.etal.,oncolrep.(2017)luostari,k.etal.,plos.one.9(2014):e102519lv,g.q.etal.,biochem.cellbiol92(2014):379-389lv,l.etal.,cancerlett.357(2015a):105-113lv,x.etal.,jexp.clincancerres34(2015b):133ma,k.etal.,clinepigenetics.8(2016a):43ma,y.etal.,biosens.bioelectron.85(2016b):641-648ma,z.etal.,int.jclinexp.pathol.8(2015):5071-5079maclean,j.a.etal.,plos.one.11(2016):e0156109mahajan,a.,hum.pathol.51(2016):64-74maine,e.a.etal.,oncotarget.7(2016):14708-14726maines-bandiera,s.etal.,int.jgynecol.cancer20(2010):16-22mamane,y.etal.,jinterferoncytokineres22(2002):135-143mantia-smaldone,g.m.etal.,hum.vaccin.immunother.8(2012):1179-1191manzella,l.etal.,curr.cancerdrugtargets.16(2016):594-605mao,l.etal.,cancerres71(2011):4314-4324marcinkiewicz,k.m.etal.,exp.cellres320(2014a):128-143marcinkiewicz,k.m.etal.,jcellphysiol229(2014b):1405-1416marlow,l.a.etal.,jcellsci.125(2012):4253-4263maruta,s.etal.,apmis117(2009):791-796marzese,d.m.etal.,hum.mol.genet.23(2014):226-238masamoto,i.etal.,leuk.lymphoma57(2016):685-691mason,j.m.etal.,nucleicacidsres.43(2015):3180-3196mawrin,c.etal.,jneurooncol.99(2010):379-391mccormack,e.etal.,cancerimmunol.immunother.62(2013):773-785medina-aguilar,r.etal.,databrief.11(2017):169-182mehta,a.etal.,breast23(2014):2-9melin,b.,curr.opin.oncol23(2011):643-647menezes,j.etal.,leukemia28(2014):823-829mercer,k.e.etal.,adv.exp.medbiol815(2015):185-195mercer,k.e.etal.,cancerprev.res(phila)7(2014):675-685mesquita,d.etal.,oncotarget.6(2015):5217-5236meziere,c.etal.,jimmunol159(1997):3230-3237michaelidou,k.etal.,breastcancerrestreat.152(2015):323-336millan,j.l.etal.,critrevclinlabsci.32(1995):1-39mitsuhashi,k.etal.,int.jhematol.100(2014):88-95miyazaki,m.etal.,immunity.28(2008):231-245miyoshi,y.etal.,med.mol.morphol.43(2010):193-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