分析试样内靶分析物的方法及装置与流程

文档序号:20708169发布日期:2020-05-12 16:45阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种试样内靶分析物的分析方法,其包括:

获取与上述靶分析物有关的数据集的步骤,上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包含具有循环号码及信号值的多个数据位置;

校准上述数据集的步骤;

生成对于校准的上述数据集的非线性函数的步骤;

确定对于校准的上述数据集的上述非线性函数的匹配准确度的步骤;以及

利用上述匹配准确度来确定上述试样内靶分析物的存在或不存在的步骤。

2.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述非线性函数为s型函数。

3.根据权利要求2所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述s型函数为包括通过以下数学式3表示的4个参数的s型函数,

数学式3

在上述数学式中,f(x)作为匹配函数,表示s型函数,x为上述信号发生反应的循环号,而且,a1、a2、a3及a4为分别表示上述s型函数的参数。

4.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述匹配准确度为与校准的上述数据集有关的上述非线性函数的x2值或r2值。

5.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述试样内靶分析物的存在或不存在的确定通过对上述匹配准确度与上述匹配准确度有关阈值进行比较来实施。

6.根据权利要求5所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述试样内靶分析物的存在或不存在的确定如下实施,即,对上述匹配准确度与上述匹配准确度有关阈值进行比较,判断上述匹配准确度是否大于上述阈值来实施。

7.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述试样内靶分析物的存在或不存在的确定追加利用选自由(i)上述数据集、校准的上述数据集或上述非线性函数的变位及(ii)上述非线性函数的最大斜率组成的组中的最小一个参数来实施。

8.根据权利要求3所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述试样内靶分析物的存在或不存在的确定追加利用选自由(i)包含上述数据集、校准的上述数据集或上述4个参数的s型函数的变位及(ii)包含上述4个参数的s型函数的最大斜率及a4组成的组中的最小一个参数来实施。

9.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述靶分析物为靶核酸分子。

10.根据权利要求9所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述信号发生反应为通过上述靶核酸分子的扩增或没有扩增地扩增信号值的过程。

11.根据权利要求10所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述信号发生单元生成依赖于二聚物的形成的信号。

12.根据权利要求10所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述信号发生单元生成依赖于检测寡核苷酸的切割的信号。

13.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述数据集的校准步骤包括:

利用(i)在基准循环中的信号值或(ii)在上述基准循环中的上述信号值的变形值来生成标准化系数的步骤;以及

将上述标准化系数适用于上述数据集的信号值来生成校准的上述数据集的步骤。

14.根据权利要求13所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述信号发生反应包含在不同的反应环境中对于相同靶分析物的多个信号发生反应,上述数据集为多个数据集,多个上述数据集从多个上述信号发生反应的多个集获取,上述基准循环或上述基准循环与上述基准值相同地适用于多个上述数据集。

15.根据权利要求14所述的试样内靶分析物的分析方法,其中多个上述信号发生反应在包括不同的多个设备、不同的多个反应管或容器、不同的多个试样、不同量的靶分析物或不同的多个引物或探针的其他反应环境中实施。

16.根据权利要求13所述的试样内靶分析物的分析方法,其中校准的上述数据集(i)通过在上述数据集适用上述标准化系数来生成标准化的数据集,或者(ii)对上述数据集或上述标准化的数据集进行基线来生成。

17.根据权利要求1所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述数据集包含(i)作为在相对高的检测温度条件下检测的信号的与第一靶核酸序列有关的信号和/或(ii)与从在相对低的检测温度条件下检测的信号提取的第二靶核酸序列有关的信号,而且,上述第一靶核酸序列及上述第二靶核酸序列从一个反应容器检测。

18.根据权利要求17所述的试样内靶分析物的分析方法,其中与上述第一靶核酸序列有关的信号及与上述第二靶核酸序列有关的信号通过如下的步骤获取:

步骤(a),在上述反应容器中,与上述试样一同培养能够发生与上述第一靶核酸序列有关的信号的第一信号发生单元及能够发生与上述第二靶核酸序列有关的信号的第二信号发生单元,在上述相对高的检测温度及上述相对低的检测温度条件下检测信号,上述第一靶核酸序列及第二靶核酸序列通过相应的信号发生单元检测,在上述第一靶核酸序列不存在于上述试样中的情况下,上述第一信号发生单元在上述相对高的检测温度及上述相对低的检测温度条件下发生信号,在上述第二靶核酸序列存在于上述试样中的情况下,在上述相对低的检测温度条件下发生信号;

步骤(b),在上述相对低的检测温度条件下检测的信号是否满足通过第一阈值或第一信号变位定义的第一基准,当在上述相对低的检测温度条件下检测的信号满足上述第一基准时,进行下一个步骤(c),当在上述相对低的检测温度条件下检测的信号不满足上述第一基准时,确定为上述第一靶核酸序列及上述第二靶核酸序列不存在于上述试样中,不进行下一个步骤(c);以及

步骤(c),利用(i)用于从在上述相对低的检测温度条件下检测的信号去除与上述第一靶核酸序列有关的信号的基准值及(ii)在上述相对低的检测温度条件下检测的信号来从在上述相对低的检测温度条件下检测的信号提取与上述第二靶核酸序列有关的信号。

19.根据权利要求18所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述与第二靶核酸序列有关的信号通过以下数学式6提供,

数学式6

与第二靶核酸序列有关的信号=[在相对低的检测温度条件下检测的信号]-[(在相对高的检测温度条件下检测的信号)×(与第一靶核酸序列有关的基准值)]。

20.根据权利要求13所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述基线利用具有对称轴的二次函数来实施。

21.一种试样内靶分析物的分析装置,其包括:

存储器;以及

处理器,

上述存储器存储与上述靶分析物有关的数据集,利用上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包括具有循环号及信号值的多个数据点,

上述处理器校准上述数据集,生成对于校准的上述数据集的非线性函数,确定对于校准的上述数据集的上述非线性函数的匹配准确度,利用上述匹配准确度确定上述试样内靶分析物的存在或不存在。

22.一种计算机可读记录介质,包括多个指示,上述多个指示体现用于执行方法的处理器,其中所述方法包括:

获取与上述靶分析物有关的数据集的步骤,上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包含具有循环号码及信号值的多个数据位置;

校准上述数据集的步骤;

生成对于校准的上述数据集的非线性函数的步骤;

确定对于校准的上述数据集的上述非线性函数的匹配准确度的步骤;以及

利用上述匹配准确度来确定上述试样内靶分析物的存在或不存在的步骤。

23.一种试样内靶分析物的分析方法,其包括:

获取与上述靶分析物有关的数据集的步骤,上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包含具有循环号及信号值的多个数据点;

在上述数据集的基础线区域的匹配区间生成与上述数据集匹配的二次函数的步骤;以及

在上述数据集扣除上述二次函数来校准上述数据集的步骤。

24.根据权利要求23所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述二次函数具有对称轴。

25.根据权利要求23所述的试样内靶分析物的分析方法,其中所述匹配区间为从开始匹配循环至最小匹配循环。

26.根据权利要求25所述的试样内靶分析物的分析方法,其中在上述数据集的变位大于与上述变位有关的阈值的情况下,上述匹配区间为从开始匹配循环至最小匹配循环。

27.根据权利要求23所述的试样内靶分析物的分析方法,其中

在上述方法中,在上述匹配区间生成二次函数的步骤之前,追加包括在整个区域生成与上述数据集匹配的第一二次函数的步骤,

上述匹配区间以上述第一二次函数具有最小信号值的循环为基础确定。

28.根据权利要求23所述的试样内靶分析物的分析方法,其中

上述方法追加包括确定上述二次函数的匹配准确度的步骤,

在上述匹配准确度大于与上述匹配准确度有关的阈值的情况下,实施扣除上述二次函数的步骤。

29.一种试样内靶分析物的分析装置,其包括:

存储器;以及

处理器,

上述存储器存储与上述靶分析物有关的数据集,上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包含具有循环号及信号值的多个数据点,

上述处理器在上述数据集的基础线区域的匹配区间生成对上述数据集匹配的二次函数,在上述数据集扣除上述二次函数来校准上述数据集。

30.一种计算机可读记录介质,包括多个指示,上述多个指示体现用于执行方法的处理器,其中所述方法包括:

获取与上述靶分析物有关的数据集的步骤,上述数据集从利用信号发生单元的信号发生反应获取,包含具有循环号码及信号值的多个数据位置;

在上述数据集的基础线区域的匹配区间中生成对于上述数据集的二次函数的步骤;以及

在上述数据集扣除上述二次函数来校准上述数据集的步骤。


技术总结
本发明涉及确定试样内靶分析物的存在或不存在的方法及装置。本发明将对于数据集非线性函数的匹配准确度用为用于分析靶分析物的直接指标,从而,可以在没有假阳性及假阴性结果,尤其,没有假阳性的情况下分析靶分析物。

技术研发人员:金英旭;朴永用;高成文;李荣祚;H·B·李
受保护的技术使用者:SEEGENE株式会社
技术研发日:2018.09.28
技术公布日:2020.05.12
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