Dlk1蛋白胞外剪切部分的制药用图_2

文档序号:9224774阅读:来源:国知局
物:5,CGC GGA TCC CTG GCC CTC GGT GAG GAG3,
[0050] 上游引物加的是Nhe I酶切位点;
[0051] 下游引物加的是BamH I酶切位点。
[0052] 斜体部分为保护性碱基,斜体加粗体部分为酶切位点,红色碱基是为了保证和 V152的读码框一致而增加的碱基,扩增FA1DNA片段长度为840bp。
[0053]b.PCR扩增目的基因片段
[0054] 按以下成分分别依次加入PCR管内加以混合
[0055] 成分体积(|Lll) 终浓度 10X Buffer for KOD-Plus 5 IX 2mM dNTPs 5 0.2mM 25mM MgS04 2 1.0 mM 10pmol/)diD丨物 1.5 0.3 ,uM 10pm〇j/|u.l.jri?引物 1.5 0.3jiM 模板DNA 1.5 50ng/^l KOD-Plus多聚i)梅(1 .OU/jd) 1 1.0U/50,ul 双蒸水 .个.50,ul N/A
[0056] 使用琼脂糖凝胶回收试剂盒回收目的基因DNA片段。
[0057] ③目的基因和质粒的酶切和连接
[0058] a?酶切
[0059] 双酶切反应体系成分体积 NEB buffer 4# 5(il BSA 100X 0.5^1 Nhe I l|ul BamH I 0.5(.il 质粒/目的基因DNA 3^g 双蒸水 .个.50|ul
[0060] 轻弹管壁混匀,离心数秒,使得液体积于管底。然后置于37°C水浴箱水浴4小时。 65°C水浴作用10分钟终止酶切反应。酶切反应液直接进行凝胶电泳并回收,具体操作见前 文。
[0061] b?连接
[0062] 经限制性内切酶处理后的载体及目的基因片段进行相互连接,体积按下列方法在 PCR管中建立20ul的连接反应体系:
[0063] 成分 质粒酶切产物 25ng 目的基因酶切产物 l〇ng
[0064] NEB T4缓冲液 2^1 NEB T4连接酶 10 双蒸水个:20pl
[0065] c.向转化混合物中加入900 ill不含抗生素的LB培养基并混合摇匀,置于37°C摇 床150rpm,转振菌培养45分钟;
[0066] d?室温4000rpm离心3分钟;
[0067] e.留底部150 ill培养液,并用枪头使细菌重悬于LB培养液中;
[0068] f.将适量体积已经转化的感受态细菌转移到含抗生素的LB琼脂平板上,用无菌L 棒轻轻涂布均匀,将平板置于室温直至液体被吸收。倒置平皿于37°C恒温箱培养过夜。15 小时后观察出现的菌落。
[0069] ③接菌
[0070] a.挑取白色单个菌落,置入5ml含氨苄青霉素的LB液体培养基(含氨苄青霉素 5iil)中;
[0071] b. 37°C摇床260rpm,16小时振菌培养过夜;
[0072] c.培养菌液取出后留取200 iil,加入200iil40%甘油对半稀释,_80°C冰箱保存留 种,其余菌液送上海生工公司测序。
[0073] 3)重组质粒的抽提
[0074] ①重组质粒的转化扩增
[0075] V152-FA1质粒转化菌液经测序证实重组成功后,取留种菌液重悬后涂板培养,菌 落形成后,挑取单个菌落摇菌培养,具体操作见前文。
[0076] ②重组质粒抽提
[0077] 使用质粒小提试剂盒抽提V152-FA1质粒,具体步骤如下:
[0078] a?柱平衡步骤:向吸附CP3 (吸附柱放入收集管中)加入500iU的平衡液BL, 12, OOOrpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;
[0079]b.取1~5ml过夜培养的菌液,加入离心管中,使用常规台式离心机,12, OOOrpm 离心1分钟,尽量吸除上清;
[0080] C.向留有菌体沉淀的离心管中加入250 ill溶液P1,使用移液器彻底悬浮细菌沉 淀;
[0081] d.向离心管中加入250i!1溶液P2,温和地上下翻转6~8次,使菌体充分裂解, 避免剧烈震荡,以免打断基因DNA,造成提取的质粒中混有基因组DNA片段;
[0082] e.向离心管中加入350 ii 1溶液P3,立即吻合地上下翻转6~8次,充分混匀,此 时将出现白色絮状沉淀,12, OOOrpm离心10分钟,此时在离心管底部形成沉淀;
[0083] f.将上一步收集的上清液用移液器转移到吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中), 注意尽量不要吸出沉淀。12, OOOrpm离心30~60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3 放入收集管中;
[0084] g.向吸附柱CP3中加入500 ill去蛋白液H),12, OOOrpm离心30~60秒,倒掉收 集管中的废液,将吸附柱CP3重新放回收集管中;
[0085] h.向吸附柱CP3中加入600 ill漂洗液PW,12, OOOrpm离心30~60秒,倒掉收集 管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中;
[0086] i.重复操作步骤h ;
[0087] j.将吸附柱CP3放入收集管中,12,OOOrpm离心2分钟,目的是将吸附柱中残余的 漂洗液去除,将吸附柱CP3开盖,置于室温放置20分钟,以彻底晾干吸附材料中残余漂洗液 中的乙醇;
[0088] k.将吸附柱CP3置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位滴加50~ 100 yl洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,12, OOOrpm离心2分钟,将质粒溶液收集到离心管 中;
[0089] 1.回收得到的重组质粒用紫外分光光度计检测浓度和纯度后,置-20°C保存。
[0090] 4) V152-FA1表达蛋白载体转染EBNA-293细胞
[0091] ①准备细胞:EBNA-293细胞使用含10%胎牛血清、100U/ml青霉素、0? lmg/ml链霉 素的DMEM培养基,于5%C02、37°C恒温培养箱中培养,转染前一天细胞消化传代至6孔培养 皿中,生长过夜至70~90%的覆盖度;
[0092]②准备转染复合物:
[0093] a. 100 ill无血清培养基或Opti-MEM I培养基;
[0094] b?加入 3 ~6 ii 1X-tremeGENEOTNA转染试剂;
[0095] c.短暂轻柔漩涡(不超过10秒);
[0096] d?加入 1-2ii gV152-FA1 重组质粒;
[0097] e?短暂轻柔漩涡;
[0098] f ?室温孵育15~30分钟(15至25 °C )。
[0099] ③将转染复合物逐滴均匀加入到EBNA-293细胞中,转染48小时后细胞换液,改用 含有2 y g/ml puromycin的DMEM全培液培养筛选细胞;
[0100] ④细胞puromycin筛选4~5天后,传代至2~3个10cm培养皿。长满后一部分 冻存,另一部分传代至多个l〇cm培养皿,长至60~70%覆盖度,更换新鲜培养基,分别在第 2、4和6天收集培养液,离心去除细胞碎片后,冻存至-20°C,以备抽提纯化蛋白。
[0101] 5)亲和层析法纯化蛋白
[0102] ①清洗柱子:柱子储存于4~8°C,将柱子上面的帽子拧开,用2CVs的缓冲液W清 洗Strep-Tactin柱。注意重力沉降过程中不要使柱子干燥;
[0103] ②样品上柱:样品上柱体积在0. 5~lOCVs。上样体积过大或浓度过稀可能会造 成得率下降;
[0104] ③洗柱:等样品完全进柱后,用5CV的缓冲液W(对于重力沉降来说,应该5次分批 加入)洗柱,并收集每部分的洗脱液;
[0105] ④目的蛋白的洗脱:加入6倍的0. 5CVS的缓冲液E并在每段(0. 5CV)收集。收集 每一部分并各取20 iiL SDS-PAGE鉴定,融合标签蛋白通常在2nd到5nd部分;
[0106] ⑤柱子再生:首先,用15CVs的缓冲液R去除D-脱硫生物素(分3次加入)。缓冲 液R上柱后显示红色,若整个柱子完全变为红色,则依此来判断D-脱硫生物素去除完全(若 仍然没有完全变红,则需要加入更多的缓冲液R)。最后再用8CVs缓冲液W洗柱子,洗过之 后,可以做下次纯化。
[0107] 6)纯化蛋白的鉴定
[0108] 层析洗脱液用紫外分光光度计检测蛋白浓度和纯度,并分别使用目的蛋白DLK1 抗体及标签蛋白Strep II -tag抗体,Western blot免疫印记法鉴定抽提纯化的FA1蛋白 (图 2C)。
[0109]DLK1蛋白胞外剪切部分重组蛋白序列(280个氨基酸):AECFPACNPQNGFCEDDNVCRC QPGWQGPLCDQCVTSPGCLHGLCGEPGQCICTDGWDGELCDRDVRACSS APCANNGTCVSLDDGLYECSCAPGYSGK DCQKKDGPCVINGSPCQHGGTCVDDEGRASHASCLCPPGFSGN
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