长链非编码rna基因loc553103在制备鼻咽癌细胞抑制剂上的应用_4

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[0155] 2. 5 BART6-3p低表达的胃癌患者预后较差
[0156] 我们对胃癌组织中BART6-3p的表达与病人的生存时间和状态进行的生存分析, 发现胃癌中BART6-3p的表达与胃癌患者的预后密切相关,BART6-3p高表达(High)的患者 生存时间要明显长于BART6-3p低表达(Low)的患者(图7)。
[0157] 实施例3,过表达BART6-3p抑制肿瘤细胞的生长增殖及侵袭转移
[0158] 1.材料方法
[0159] 1.1细胞培养与转染
[0160] EBV阴性的鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS均购自中南大学细胞中心,细 胞培养所用RPMI 1640培基和胎牛血清,及消化细胞所用的胰蛋白酶均为美国Gibco公司 产品。
[0161] BART6-3p由Invitrogen公司通过化学合成法合成,序列为:
[0162] CGGGGAUCGGACUAGCCUUAGA
[0163] 将生长状态良好的肿瘤细胞系按2X 105个细胞/孔接种于6孔板中,将6孔板置 于37°(:,5%〇)2培养箱中,待培养细胞生长至50-70%密度即可开始84訂6-3?的转染;转 染过程如下:
[0164] 在无菌EP管中加入8 μ 1的Hiperfect转染试剂(Qiagen公司产品)于100 μ 1 无血清培养基中混匀静置5min ;
[0165] 将BART6-3p加入100 μ 1无血清培养基中;然后与上述包含Hiperfect转染试剂 100 μ 1无血清培养基温和混匀,室温静置30分钟,使它们形成复合体;
[0166] 用D-Hank' s液洗涤细胞3次;
[0167] 将上述混合物中加入800 μ 1无血清培养基(无抗生素),温和混匀后加入6孔板 中的1个孔;
[0168] 将6孔板置于C02培养箱中,37°C培养6小时,然后弃上清,加入完全培养基继续 培养48小时。
[0169] 1. 2实时定量PCR检测BART6-3p表达的效果:
[0170] 细胞转染成功后,抽提总RNA,逆转录,实时荧光定量PCR法检测BART6-3p的表达, 方法和步骤同实施例1。
[0171] 1.3细胞增殖实验
[0172] MTT实验[3_ (4, 5-dimethylthiazole_2-yl)-2. 5-dipheny-tetrazolium bromide assay]是检测肿瘤细胞增殖的常用手段,具体实验步骤如下:
[0173] 1)将细胞消化,计数,每孔接种500个细胞于96孔板中,每天需要设置5个复孔最 后求平均值,一共设置5天;
[0174] 2)放置培养箱培养至少5小时,待细胞贴壁后,加 MTT液(5mg/ml)20yl。继续培 养4小时,弃去培养液。每孔加入200 μ 1 DMS0,摇床上放置10分钟;
[0175] 3)选择490nm波长,在酶联免疫检测仪上,测定各孔吸光度值并记录结果,此后每 隔24小时重复步骤2,记录一次数值,共计检测5天;
[0176] 4)实验重复三次。以各时间点为横坐标,吸光度值为纵坐标,绘制MTT曲线。
[0177] 1.4细胞划痕实验
[0178] 细胞划痕实验是验证肿瘤细胞迀移能力的实验方法。转染了 BART6-3p或对照 (scramble)序列的鼻咽癌或胃癌细胞接种于6孔板,待细胞密度达到90 %时,用200ul pipet在每个6孔板中划一条直线(划痕),随后在0、8、12、16、24、32、48小时等各个时间 点(视不同细胞迀移能力而定)在显微镜下观察划痕愈合情况,拍照,并计算各组细胞迀移 速度。
[0179] 1.5细胞穿膜实验
[0180] 细胞穿膜((transwell)实验是验证肿瘤细胞侵袭能力的实验方法。Transwell小 室(孔径8μπι)及基质胶(Matrigel)购自美国BD公司,4%多聚甲醛固定液、结晶紫染液 (0· 1% g/ml)购自Sigma公司。将Matrigel按1:8稀释,包被在Transwell小室底部膜的 上室面,置37°C 30分钟使Matrigel聚合成凝胶。使用前按BD公司说明书进行基质胶膜水 化。
[0181] 在每个Transwell小室上层加入无血清培养基和1 X 105个转染了 BART6-3p或对 照(scramble)序列的鼻咽癌或胃癌细胞,在Transwell小室下层加入含20%胎牛血清的培 养基。细胞继续培养36小时后,用4%多聚甲醛固定液固定,结晶紫染色,用棉签轻轻擦掉 上层未迀移细胞,用PBS洗3遍。在显微镜下观察穿过基质胶膜的肿瘤细胞。
[0182] 2.结果
[0183] 2. 1转染BART6-3p后,肿瘤细胞中BART6-3p的表达水平显著升高
[0184] 在EBV阴性的鼻咽癌细胞5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS中转染BART6-3p后,BART6-3p 在鼻咽癌和胃癌细胞中的表达均显著升高(图8),表明BART6-3p转染成功。
[0185] 2. 2转染BART6-3p后肿瘤细胞增殖速度减慢
[0186] MTT细胞增殖实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2,胃癌细胞系AGS中转入 BART6-3p后,3株肿瘤细胞的生长增殖速度均明显减慢(图9)。
[0187] 2. 3转染BART6-3p后细胞迀移能力减弱
[0188] 细胞划痕实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2及胃癌细胞AGS中转入BART6-3p 后3株肿瘤细胞从划痕两边往划痕中央迀移的速度减慢,划痕愈合的时间延长,表明细胞 运动迀移能力降低(图10)。
[0189] 2. 4转染BART6-3p后细胞侵袭能力降低
[0190] 细胞穿膜(transwell)实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2及胃癌细胞AGS中 转入BART6-3p后,能穿过基质胶膜的肿瘤细胞数目显著减少,表明细胞侵袭能力减弱(图 11) 〇
[0191] 实施例4,过表达BART6-3p抑制肿瘤细胞中IncRNA基因 L0C553103的表达
[0192] 1.材料方法
[0193] 1.1细胞培养与转染
[0194] EBV阴性的鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS均购自中南大学细胞中心,细 胞培养所用RPMI 1640培基和胎牛血清,及消化细胞所用的胰蛋白酶均为美国Gibco公司 产品。
[0195] BART6-3p由Invitrogen公司通过化学合成法合成,序列为:
[0196] CGGGGAUCGGACUAGCCUUAGA
[0197] 在肿瘤细胞中转染BART6-3p的方法和步骤同实施例3。
[0198] 1. 2实时定量PCR检测转染BART6-3p后IncRNA基因 L0C553103的表达:
[0199] 细胞转染成功后,抽提总RNA,逆转录,实时荧光定量PCR法检测IncRNA基因 L0C553103的表达,方法和步骤同实施例1,所用引物序列如下:
[0200] 用于实时荧光定量检测L0C553103表达的引物序列:
[0201] L0C553103 正向引物:5' -acagtagtgcgatcaaggct-3'
[0202] L0C553103 反向引物:5' -tcaccacctccctgttcttc-3'
[0203] 内参基因 GAPDH特异性PCR引物:
[0204] 正向引物 5 ' -ACCACAGTCCATGCCATCAC-3 '
[0205] 反向引物 5 ' -TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3 '。
[0206] 2.结果
[0207] 转染BART6-3p后,肿瘤细胞中L0C553013的表达水平显著降低
[0208] 在EBV阴性的鼻咽癌细胞5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS中转染BART6-3p后,IncRNA 基因 L0C553103的表达均显著降低(图12),表明BART6-3p可抑制L0C553010的表达,或者 说IncRNA基因 L0C553103是BART6-3p的靶基因。
[0209] 实施例5,RNA干扰法抑制肿瘤细胞中L0C553103的表达可以抑制肿瘤细胞的生长 增殖及侵袭转移
[0210] 1.材料方法
[0211] 1.1细胞培养与转染
[0212] 鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS均购自中南大学细胞中心,细胞培养所用 RPMI1640培基和胎牛血清,及消化细胞所用的胰蛋白酶均为美国Gibco公司产品。
[0213] 特异性针对L0C553103的RNA干扰序列(siRNA)如下:
[0214] siRNA-Ι :5' -AUAACAUGACAGCUUGCU腳CUCC-3,
[0215] s i RNA-2 :5 ' -CUUCCAAGCUCACUCAAGGUU⑶UG-3 '
[0216] s i RNA-3 :5 ' -CUAAUAUUCCCUCAGAGCUGGGCUG-3 '
[0217] 上述特异性针对L0C553103的RNA干扰序列由Invitrogen公司合成,阴性对照 (NC,scramble)序列也由Invitrogen公司合成并提供。
[0218] 细胞转染的方法和步骤同实施例3.
[0219] 1. 2RNA干扰L0C553103的表达后,通过细胞增殖实验、细胞穿膜实验和细胞划痕 实验检测了人为下调L0C553103表达后细胞的生长、增殖、侵袭和转移能力的变化。具体方 法和步骤同实施例3.
[0220] 2.结果
[0221] 2. 1转染特异性针对L0C553103的RNA干扰序列后,肿瘤细胞中L0C553103的表达 水平显著降低
[0222] 在鼻咽癌细胞5-8F、HNE2,胃癌细胞AGS中转染特异性针对L0C553103的RNA干扰 序列后,L0C553103在上述细胞中的表达均显著降低(图13),表明针对L0C553103的RNA 干扰序列转染成功,抑制L0C553103表达的效果明显。
[0223] 2. 2干扰L0C553103表达后肿瘤细胞增殖速度减慢
[0224] MTT细胞增殖实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2,胃癌细胞系AGS中转入特异 性针对L0C553103的RNA干扰序列后,3株肿瘤细胞的生长增殖速度均明显减慢(图14)。
[0225] 2. 3干扰L0C553103表达后细胞迀移能力减弱
[0226] 细胞划痕实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2及胃癌细胞AGS中转入特异性针 对L0C553103的RNA干扰序列后鼻咽癌和胃癌细胞从划痕两边往划痕中央迀移的速度减 慢,划痕愈合的时间延长,表明细胞运动迀移能力降低(图15)。
[0227] 2. 4干扰L0C553103表达后细胞侵袭能力降低
[0228] 细胞穿膜(transwell)实验证实,在鼻咽癌细胞系5-8F、HNE2及胃癌细胞AGS中 转入特异性针对L0C553103的RNA干扰序列后,能穿过基质胶膜的肿瘤细胞数目显著减少, 表明细胞侵袭能力减弱(图16)。
[0229] 实施例6,在动物模型中进一步证实过表达BART6-3p或用RNA干扰法抑制肿瘤细 胞中L0C553103的表达可以抑制肿瘤细胞的生长增殖及侵袭转移
[0230] 1.材料方法
[0231] 1.1细胞培养与转染
[0232] 鼻咽癌细胞系5-8F购自中南大学细胞中心,细胞培养所用RPMI 1640培基和胎牛 血清,及消化细胞所用的胰蛋白酶均为美国Gibco公司产品。
[0233] 在5-8F细胞中过表达BART6-3p的方法同实施例3 ;
[0234] 在5-8F细胞中转染特异性针对L0C553103的RNA干扰序列以抑制细胞内 L0C553103表
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