中国仓鼠凋亡相关基因的制作方法

专利名称：：中国仓鼠凋亡相关基因的制作方法中国仓鼠凋亡相关基因领域本发明涉及生物技术和分子生物学领域。本发明特别涉及来自中国仓鼠(Chinesehamster)(CWce/w/wsgn'se船)的新的基因，所述基因涉及凋亡过程的介导。背景随着人类基因组计划的完成，每天都发现更多具有治疗潜力的蛋白质。许多这些新的生物治疗剂常常需要开发高产的生产过程来满足全球的需求。用于复杂的治疗性生物产品生产的最常用的细胞系之一是中国仓鼠卵巢(CHO)细胞，其最初来源于中国仓鼠。然而，中国仓鼠的基因组很少被表征，特别是，缺少对该有才几体中控制生理学上重要的过程的基因的了解。美国专利号6,562,797描述了称为FADD的纯化的哺乳动物蛋白质，其具有结合Fas受体的细胞质区域或结构域的能力。这个文件还描述了调节FAS相关的凋亡的方法。然而，所公开的唯一的序列是人类来源的。美国专利号6,683，168和美国专利申请公开号US2004/0121389描述了许多形式的FAIM序列的序列短的、长的、超长的和肺癌相关的。所述序列是人类和小鼠序列。美国专利号6,544,523列出了编码Fas配体的DNA的序列。美国专利号6,451,759描述了这种配体的非可裂解形式。概述我们首次描述了中国仓鼠(CWce化/wsgr/化iw)FAIM、FADD、PDCD6和Requiem的序歹'J。根据本发明的第l方面，我们提供了包含选自以下的序列的分离的多肽，所述分离的多肽能够介导细胞的凋亡(a)与SEQIDNO:1所示序列具有至少97%的序列同一性的cgFAIM序列；(b)与SEQIDNO:2所示序列具有至少69%序列同一性的cgFADD序列；(c)与SEQIDNO:3所示序列具有至少89%序列同一性的cgPDCD6序列；(d)与SEQIDNO:4所示序列具有至少90%序列同一性的cgRequiem序列;(e)以上(a)到(d)的任一项的至少15个连续残基的片段的序列。根据本发明的第2方面，提供了包含能够介导细胞凋亡的中国仓鼠序列的分离的多肽，所述序列选自SEQIDNO:1所示的cgFAIM序列；SEQIDNO:2所示的cgFADD序列；SEQIDNO:3所示的cgPDCD6序列；和SEQIDNO:4所示的cgRequiem序列。根据本发明的第1方面，我们提供了包含能够介导细胞的凋亡的中国仓鼠序列的分离的多肽，所述序列选自SEQIDNO:1所示的cgFAIM序列；SEQIDNO:2所示的cgFADD序列；SEQIDNO:3所示的cgPDCD6序列;和SEQIDNO:4所示的cgRequiem序列。根据本发明的第2方面，提供了包含选自以下的序列的分离的多肽(a)与SEQIDNO:1所示序列具有至少97%序列同一性的egFAIM序列；(b)与SEQIDNO:2所示序列具有至少69%序列同一性的cgFADD序列；(c)与SEQIDNO:3所示序列具有至少89%序列同一性的cgPDCD6序列；(d)与SEQIDNO:4所示序列具有至少90%序列同一性的cgRequiem序列；(e)以上(a)到(d)的任一项的至少15个连续残基的片段的序列。根据本发明的第3方面，我们提供了包含序列的分离的多核苷酸，所述序列编码所列出的多肽，其中所述序列优选的选自由SEQIDNO:5、SEQIDNO:6、SEQIDNO:7和SEQIDNO:8组成的组。作为本发明的第4方面，提供了包含选自以下的序列的分离的多核苷酸，或与其互补的序列，其能够在严谨条件下与其杂交，或作为遗传密码结果的其简并序列(a)与SEQIDNO:5所示序列具有90%或更高序列同一性的cgFAIM序列；(b)与SEQIDNO:6所示序列具有90%或更高序列同一性的cgFADD序列；(c)与SEQIDNO:7所示序列具有93%或更高序列同一性的cgPDCD6序列；(d)与SEQIDNO:8所示序列具有89%或更高序列同一性的cgRequiem序列；(e)以上(a)到(d)的任一项的至少15个连续残基的片段的序列。根据本发明的第5方面，我们提供了表达序列，其包含与调控序列可操作连接的如上列出的多核苷酸或其部分，所述调控序列能够指导所述多核苷酸的表达。优选的，这种表达序列是表达载体。在第6方面，本发明提供了包含根据如上列出的多核苦酸的载体，当暴露于细胞时，所述载体能够调节细胞的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6或cgRequiem的表达。优选的，所述载体包含中国仓鼠FAIM序列或其部分，所述载体能够导致细胞中cgFAIM，优选pcDNA3.1(+)FAIM(SEQIDNO:37)的增量调节。优选的，所述载体包含中国仓鼠FADD序列或其部分，所述载体能够导致细胞中cgFADD,优选pcDNA3.1(+)FADDDN(SEQIDNO:38)的减量调节。优选的，所述载体包含中国仓鼠PDCD6序列或其部分，所述载体能够导致细胞中cgPDCD6，优选pSUPER.neo.PDCD6siRNA(SEQIDNO:39)的减量调节。优选的，所述载体包含中国仓鼠Requiem序列或其部分，并能够导致细胞cgRequiem,优选pSUPER.neo.R叫uiemsiRNA(SEQIDNO:40)的减量调节。在本发明的第7方面，提供了包含所描述的表达序列或所描述的载体的细胞，其中所述表达序列优选已被转化到所述细胞中。根据本发明的第8方面，我们提供了包含如所列的多肽、如所列的多核香酸、如所列的表达序列、如所列的载体或如所列的细胞，连同药学上可接受的运载体(carrier)或稀释剂的药物组合物。根据本发明的第9方面，我们提供了生产多肽的方法，包括(a)提供包含如所列的多核苷酸序列和调控序列的表达序列，其中所述调控序列能够指导所述多肽从所述多核苷酸序列的表达，(b)容许在所述调控序列的控制下从所述表达序列表达所述多肽，以及(c)任选的纯化所述多肽。优选的，所述表达序列包含转染到细胞，优选的中国仓鼠细胞中的表达载体，以容许所述多肽-波所述细胞表达。根据本发明的第10方面，提供了一种方法，包括在细胞，优选的中国仓鼠细胞中调节，优选增量调节具有SEQIDNO:l所示序列的cgFAIM多肽或具有SEQIDNO:5所示序列的cgFAIM多核苷酸的表达。作为本发明的第11方面，我们提供了一种方法，包括在细胞中，伊C选的中国仓鼠细胞中，调节，优选的减量调节具有SEQIDNO:2所示序列的cgFADD多肽、具有SEQIDNO:3所示序列的cgPDCD6多肽或具有SEQIDNO:4所示序列的cgR叫uiem多肽，或者具有SEQIDNO:6所示序列的cgFAIM多核苷酸、具有SEQIDNO:7所示序列的cgPDCD6多核苷酸或具有SEQIDNO:8所示序列的cgRequiem多核苷酸的表达。优选的，所述方法包括使如所列的载体暴露于细胞，优选的用所述载体转染所述细胞。根据本发明的第12方面，我们提供了一种细胞，优选的中国仓鼠细胞，其已被修饰，优选的被遗传工程化，以与没有被如此修饰的细胞相比，增量调节具有SEQIDNO:1所示序列的多肽或具有SEQIDNO:5所示序列的多核苷酸的表达。根据本发明的第13方面，我们提供了一种细胞，优选的中国仓鼠细胞，其已被修饰，优选的被遗传工程化，以与没有被如此修饰的细月包相比，减量调节具有SEQIDNO:2、SEQIDNO:3或SEQIDNO:4所示序列的多肽或具有SEQIDNO:6、SEQIDNO:7或SEQIDNO:8所示序列的多核苷酸的表达。根据本发明的第14方面，提供了一种细胞系，其包含所描述的细胞，或其后代，优选的中国仓鼠细胞系。根据本发明的第15方面，我们提供了一种细胞培养物，其包含所描述的细胞，或其后代，或所描述的细胞系。根据本发明的第16方面，我们提供了包含所描述的细胞，或其后代的转基因非人类动物，优选的中国仓鼠。优选的，与其中所述多肽的表达不被如此调节的细胞相比，(i)细胞的细胞生存力被提高或增强，优选其中细胞的凋亡被降低；(ii)细胞的蛋白质产量，优选的重组表达的蛋白质的产量被提高或增强；和/或(iii)细胞表达的蛋白的糖基化、优选的唾液酸化作用被提高或增强。根据本发明的第17方面，我们提供了如所列方法、如所列细胞、如所列细胞系、如所列细胞培养物、或如所列转基因非人动物的用途，用于蛋白质、优选的异源蛋白质、更优选的从外源导入的序列，最优选的重纟且蛋白质的生产。根据本发明的第18方面，我们提供了生产重组蛋白质的方法，所述方法包括提供如所列的细胞，用能够表达所述重组蛋白质的表达载体转染所述细胞，并引起所述细胞中的重组蛋白表达。根据本发明的第19方面，我们提供了包含具有SEQIDNO:9的cgFADD显性阴性序列的多肽，或能够编码这种多肽的多核苷酸，优选的SEQIDNO:10,或其片段、同源物、变体或衍生物。作为本发明的第20方面，我们提供了多肽，优选的重组蛋白质，更优选的干扰素Y,可通过根据本发明的第17或第18方面的方法产生，与可从不被如此修饰的细胞产生的多肽相比，所述多肽具有提高的唾液酸化作用。优选的，所述唾液酸化作用大于2.9mol唾液酸/mol产生的多肽，优选的约3.5mol唾液酸/mol产生的多肽。本发明的进一步特别的和优选的方面在附随的独立和从属权利要求中列出。从属权利要求的特征可以酌情与独立权利要求的特征组合，并且与未在权利要求中明确列出的特征组合。除非另有陈述，本发明的实践将采用化学、分子生物学、微生物学、重组DNA和免疫学的常规技术，所有这些都处在本领域普通技术人员的能力范围内。这些技术已经在文献中说明了。参见，例如，J.Sambrook,E.F.Fritsch,andT.Maniatis,1989，Afo/ecw/a/"C7om'"g:j丄a6orato/^Afawwa/,SecondEdition,Books1-3，ColdSpringHarborLaboratoryPress;Ausubel,F.M.etal.(1995andperiodicsupplements;CM^rewf/Votoco/sz."她/ecw/arB/o/ogy，ch.9,13，and16，JohnWiley&Sons,NewYork,N.Y.);B.Roe,J.Crabtree,andA.Kahn,1996，Z)福Zso/加'o"S^we腦Vzg.,j&se"""/rec/7m々wM，JohnWiley&Sons;J.M.PolakandJamesO'D.McGee,1990,/"幼w砂6厂W2:a"0":尸〃'腦》fes朋dPrac"ce;OxfordUniversityPress;M.J.Gait(Editor)，1984，0//go"wc/eo"'(iejS声/ze57's..7Vac"ca/j，raac/2,IrlPress;D.M.J.LilleyandJ.E.Dahlberg，1992,Afe//zo<is0/五w27mo/ogy:Z)iV/4Sfrwc/^re户aW爿Sy/^/zew's尸/;戸'ca/Jw"/，、q/"￡WJMethodsinEnzymology,AcademicPress;UsingAntibodies:ALaboratoryManual:PortableProtocolNO.IbyEdwardHarlow,DavidLane,EdHarlow(1999,ColdSpringHarborLaboratoryPress,ISBN0-87969-544-7);Antibodies:ALaboratoryManualbyEdHarlow(Editor)，DavidLane(Editor)(1988，ColdSpringHarborLaboratoryPress,ISBN0-87969-314-2)，1855,Lars-IngeLarsson"/wwimoqy/oc/^m/Wry77^or_yawt/尸rac"ce"，CRCPressinc.,BacaRaton,Florida,1988,ISBN0-8493-6078-1，JohnD.Pound(ed);"T/wmwwoc/zew/ca//Votoco/s，vo/SO",intheseries:"MethodsinMolecularBiology",HumanaPress,Totowa,NewJersey,1998，ISBN0-89603-493-3,HandbookofDrugScreening,editedbyRamakrishnaSeethala，PrabhavathiB.Femandes(2001，NewYork,NY，MarcelDekker,ISBN0-8247-0562-9);LabRef:AHandbookofRecipes,Reagents,andOtherReferenceToolsforUseattheBench,EditedJaneRoskamsandLindaRodgers,2002,ColdSpringHarborLaboratory,ISBN0-87969-630-3;和TheMerckManualofDiagnosisandTherapy(17thEdition,Beers,M.H.,andBerkow,R,Eds，ISBN:0911910107，JohnWiley&Sons)。这些普通的教科书的每一个通过参考在此引入。附图的简要说明仅通过举例的方式，参考在附图中举例说明的其优选的实施方式，将进一步描述本发明，其中附图1是显示在用相关的构建体转染的细胞中FADD显性阴性(DominantNegative)和FAIM的过量表达、以及Requiem和PDCD6表达的抑制的图表。附图2A、2B、2C和2D是显示过量表达FAIM的CHOIFN，细胞的生长动力学的图表。附图2A显示了相对于时间的活细胞密度(细胞/ml),附图2B显示了相对于时间的总细胞密度，附图2C显示了相对于时间的生存力，附图2D显示了相对于时间的凋亡细胞。由于凋亡细胞的显著减少(附图2D),与对照细胞相比，FAIM过量表达显著降低了细胞培养物生存力的丧失(附图2C)。附图3A、3B、3C和3D是显示过量表达FADD显性阴性的CHOIFN-y细胞的生长动力学的图表。附图3A显示了相对于时间的活细胞密度(细胞/ml),附图3B显示了相对于时间的总细胞密度，附图3C显示了相对于时间的生存力，附图3D显示了相对于时间的凋亡细胞。由于凋亡细胞显著减少(附图3D)，与对照细胞相比，过量表达FADD显性阴性显著降低了细胞培养物生存力的丧失(附图3C)。附图4A、4B、4C和4D是显示具有PDCD6抑制的CHOIFN-y细月包的生长动力学的图表。附图4A显示了相对于时间的活细胞密度(细胞/ml),附图4B显示了相对于时间的总细胞密度，附图4C显示了相对于时间的生存力，附图4D显示了相对于时间的凋亡细胞。由于凋亡细胞的显著减少(附图4D)，与对照细胞相比，当PDCD6被抑制时，显著降低了细胞培养物生存力的丧失(附图4C)。附图5A、5B、5C和5D是显示具有Requiem抑制的CHOIFN-y细胞的生长动力学的图表。附图5A显示了相对于时间的活细胞密度(细月包/ml),附图5B显示了相对于时间的总细胞密度，附图5C显示了相对于时间的生存力，附图5D显示了相对于时间的凋亡细胞。由于凋亡细胞的显著减少(附图5D)，与对照细胞相比，当Requiem被抑制时，显著降低了细胞培养物生存力的丧失(附图5C)。附图6A、6B、6C、6D和6E是显示CHO细胞培养物中胱天蛋白酶2、3、8和9的活性的图表。附图6A显示了用对照转染的细胞中胱天蛋白酶活性，附图6B显示了在过量表达FAIM的细胞中的胱天蛋白酶活性，附图6C显示了在过量表达FADD显性阴性的细胞中的胱天蛋白酶活性，附图6D显示了具有PDCD6抑制的细胞中胱天蛋白酶活性，附图6E显示了具有Requiem抑制的细胞中胱天蛋白酶活性。靶向FAIM、FADD显性阴性、PDCD6或REQU正M的基因能够抑制和/或延迟培养物中的胱天蛋白酶活性。附图7A、7B、7C和7D是显示了转染的CHOIFN-y细胞的干扰素-y产量的图表。附图7A显示了在过量表达FAIM的细胞中的干扰素-Y活性，附图7B显示了在过量表达FADD显性阴性的细胞中的干扰素-Y活性，附图7C显示了在具有PDCD6抑制的细胞中的干扰素-Y活性，附图7D显示了在具有REQUIEM抑制的细胞中的干扰素-Y活性。通过基因靶向方法可实现干扰素y产量显著改善高达300%。附图8A显示了具有Requiem或PDCD6抑制或者FADDDN或FAIM*过量表达的稳定CHOIFN-y克隆在补料分批培养中的活细胞密度。(呈现的数据是两个一式两份实验的平均值)。附图8B显示了具有Requiem或PDCD6抑制或者FADDDN或FAIM*过量表达的稳定CHOIFN-y克隆在补料分批培养中的活细胞密度。附图9A显示了具有Requiem或PDCD6抑制或者FADDDN*或FAIM*过量表达的稳定CHOIFN-y克隆在补料分批培养中的干扰素y产量。(呈现的数据是两个一式两份实验的平均值)附图9B显示了具有Requiem或PDCD6抑制或者FADDDN*或FAIM*过量表达的稳定CHOIFN-y克隆在补料分批培养中的千扰素y产量。附图10显示了在补料分批培养的指数中期、稳定期和死亡期期间具有Requiem或PDCD6抑制或者FADDDN*或FAIM*过量表达的稳定CHOIFN-y克隆的重组IFN-y的唾液酸化作用。序列表SEQIDNO:1是中国仓鼠FAIM的氨基酸序列的序列。SEQIDNO:2是中国仓鼠FADD的氨基酸序列。SEQIDNO:3是中国仓鼠PDCD6的氨基酸序列。SEQIDNO:4是中国仓鼠Requiem的氨基酸序列。SEQIDNO:5是中国仓鼠FAIM的核酸序列。SEQIDNO:6是中国仓鼠FADD的核酸序列。SEQIDNO:7是中国仓鼠PDCD6的核酸序列。SEQIDNO:8是中国仓鼠R叫uiem的核酸序列。SEQIDNO:9是中国仓鼠FADD显性阴性的氨基酸序列。SEQIDNO:IO是中国仓鼠FADD显性阴性的核酸序列。SEQIDNO:ll是中国仓鼠FADD显性阴性5，-PCR引物的序列。SEQIDNO:12是中国仓鼠FADD显性阴性3'-PCR引物的序列。SEQIDNO:13是中国仓鼠PDCD6抑制载体插入物5，的序列。SEQIDNO:14是中国仓鼠PDCD6抑制载体插入物3，的序列。SEQIDNO:15是中国仓鼠R叫uiem抑制载体插入物5，的序列。SEQIDNO:16是中国仓鼠R叫uiem抑制载体插入物3'的序列。SEQIDNO:17是中国仓鼠FAIM5，PCR引物的序列。SEQIDNO:18是中国仓鼠FAIM3，PCR引物的序列。SEQIDNO:19是中国仓鼠FADD5，PCR引物的序列。SEQIDNO:20是中国仓鼠FADD3，PCR引物的序列。SEQIDNO:21是中国仓鼠PDCD65，PCR引物的序列。SEQIDNO:22是中国仓鼠PDCD63，PCR引物的序列。SEQIDNO:23是中国仓鼠PDCD63，-RACE引物的序列。SEQIDNO:24是中国仓鼠R叫uiem5，PCR引物的序列。SEQIDNO:25是中国仓鼠R叫uiem3，PCR引物的序列。SEQIDNO:26是中国仓鼠Requiem3，-RACE引物的序列。SEQIDNO:27是中国仓鼠FAIM定量实时PCR引物5'的序列。SEQIDNO:28是中国仓鼠FAIM定量实时PCR引物3，的序列。SEQIDNO:29是中国仓鼠FADD定量实时PCR引物5'的序列。SEQIDNO:30是中国仓鼠FADD定量实时PCR引物3，的序列。SEQIDNO:31是中国仓鼠PDCD6定量实时PCR引物5'的序列。SEQIDNO:32是中国仓鼠PDCD6定量实时PCR引物3，的序列。SEQIDNO:33是中国仓鼠Requiem定量实时PCR引物5'的序列。SEQIDNO:34是中国仓鼠R叫uiem定量实时PCR引物3，的序列。SEQIDNO:35是卩-肌动蛋白定量实时PCR引物5，的序列。SEQIDNO:36是卩-肌动蛋白定量实时PCR引物3，的序列。SEQIDNO:37是质粒pcDNA3.1(+)FAIM的核酸序列。SEQIDNO:38是质粒pcDNA3.1(+)FADDDN的核酸序列。SEQIDNO:39是质粒pSUPER.neo.PDCD6siRNA的核酸序列。SEQIDNO:40是质粒pSUPER,neo.RequeimsiRNA的核酸序列。在此描述的方法和组合物可以适当地采用序列表中所示序列的任何一个或多个。详细i兌明中国仓鼠序列本公开一般地提供了来自中国仓鼠，O/cdw/wgn'ww的某些核酸、多肽以及其片段、同源物、变体和衍生物，其能够调节细胞中的凋亡。特别地，我们提供了如序列表中所列的中国仓鼠FADD、FAIM、PDCD6和Requiem多肽和核酸序列。此外，我们提供了这种基因、片段、同源物的用途。特别优选的用途包括，修饰细胞，特别是中国仓鼠卵巢细胞，用于增强的性质，例如提高的生存力、提高的表达蛋白质(特别是重组蛋白质)的能力，和这些蛋白质的提高的糖基化，优选的唾液酸化作用。这样修饰的细胞和这些的衍生物(例如，菌落、克隆、细胞系等等)以下进一步详细描述，可以用作用于生产重组蛋白质的凋亡抗性细胞。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽要理解的是，在此公开的多肽序列不局限于序列表中所列的特定序列、或其片段，或从cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem蛋白质获得的序列，还包括获得自任何来源的同源序列，例如，相关的细^包同源物，来自其他物种的同源物或其变体或衍生物，只要它们视情况具有cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的至少一种生物学活性。本公开进一步包括在序列表中列出的氨基酸序列的变体、同源物或衍生物，以及由在此公开的核苷酸序列编码的氨基酸序列的变体、同源物或衍生物。视情况，这些序列通常被称为"cgFADD序列"、"cgFAIM序列"、"cgPDCD6序列"或"cgR叫uiem序列"。在高度优选的实施方式中，所述序列视情况包含cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的至少一种生物学活性。优选的，对于cgFAIM来说，生物学活性包括凋亡抑制活性，优选的通过胱天蛋白酶活性的减量调节来分析。因此，在这个文件中描述的cgFADD序列优选的能够抑制凋亡，具体地能够在细胞的环境中减量调节胱天蛋白酶活性。在高度优选的实施方式中，当使用这种方法来分析时，与没有用相关的cgFAIM序列如此转染的细胞相比，cgFAIM序列当转染入细胞时能够抑制凋亡至少10%、优选的20%、更优选的30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多。对于cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem来说，所述生物学活性优选的包括凋亡刺激活性，优选的通过胱天蛋白酶活性的增量调节来分析。因》匕，在这个文件中描述的cgFADD、cgPDCD6和cgR叫uiem序列优选的能够增量刺激凋亡，具体地能够在细胞的环境中增量调节胱天蛋白酶活性。在高度优选的实施方式中，当使用这种方法来分析时，与没有用相关的cgFADD、cgPDCD6或cgRequiem序列如此转染的细胞相比，cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem序列当转染入细胞时能够刺激凋亡至少10%、4尤选的20%、更优选的30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多。在高度优选的实施方式中，通过分析胱天蛋白酶活性来分析cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem序列对凋亡的活化或抑制。因此，如上列出的凋亡刺激或抑制百分比在高度优选的实施方式中被解读为胱天蛋白酶活性的刺激或抑制百分比。因此，凋亡活性监视方法，例如使用比色或荧光测定法的胱天蛋白酶活性测量分析可以用于确定cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的生物化学活性。这种方法可以在用合适的表达构建体转染(例如通过本领域已知的手段，或使用实施例中陈述的方案)的细胞中进行，来确定凋亡是否被影响，和/或胱天蛋白酶活性是否被增量或减量调节。胱天蛋白酶是介导凋亡的半胱氨酸蛋白酶的大家族(Nicholson&Thornbeny1997;Thornberry&Littlewood1998)。胱天蛋白酶-8是在受体介导的凋亡途径中最上游起作用的起始胱天蛋白酶。细胞表面受体活化后，胱天蛋白酶-8直接或间接地启动下游效应物胱天蛋白酶例如胱天蛋白酶-3的蛋白水解活性(Srinivasula"1996和Cohen1997)。胱天蛋白酶-9(其为另一种上游胱天蛋白酶)经由细胞色素C向胞质溶胶的线粒体释放一皮活化。释放的细胞色素C与凋亡蛋白酶活化因子(apoptoticproteaseactivatingfactor)APAF-1结合，形成活化胱天蛋白酶-9原(procaspase-9)的复合物(Zouefa/1999和Hu"g/1999)。活性的胱天蛋白酶-9启动蛋白酶级联，该蛋白酶级联也激活胱天蛋白酶-3和其他下游胱天蛋白酶级联。在优选的实施方式中，被分析来确定凋亡活性的增量或减量调节的胱天蛋白酶活性包括胱天蛋白酶-8或胱天蛋白酶-9。分析胱天蛋白酶-8和胱天蛋白酶-9活性的方法是本领域已知的，在例如NicholsonDWandThornberryNA(1997)Caspases:killerproteases,7>ew<iy5/oc/ew5"c/.272:2952-2956和ThomberryNAandLittlewoodY(1998)Caspases:Enemieswithin.5We腳281:1312-1316中具体地描述了。先有技术中列出的任何方案可以被用于分析胱天蛋白酶活性。然而，在优选的实施方式中，以下列出的"胱天蛋白酶分析方案"被采用来分析胱天蛋白酶-8和/或胱天蛋白酶-9活性。應乂蛋^^分浙才黄可以通过利用特异于固定在反应孔中的不同胱天蛋白酶的荧光底物来分析胱天蛋白酶活性。将含有活性胱天蛋白酶的细胞溶胞产物添加到孔中将裂解底物，并释放可以使用标准荧光平板读数器检测的荧光产物。具体地，BDApoAlert胱天蛋白酶分析平板(目录号K2033-1，BDBiosciencesClontech,PaloAlto,California,USAM吏用了由4皮它们的各自活4匕的胱天蛋白酶识别的短肽组成的不同胱天蛋白酶底物。肽被共价连接到荧光染料7-氨基-4-曱基香豆素(AMC)。结合肽的AMC在UV范围(Xmax=380nm)发射，而未结合的AMC在绿色范围中发射(Xmax=460nm)。这使得将460nm处焚光强度的增加与测试样品中相应的胱天蛋白酶的活性增加加以关联成为可能。为了分析胱天蛋白酶-8活性，使用的底物是VDVAD-AMC,而对于胱天蛋白酶-9分析，使用LEHD-AMC作为它的底物。为了使用BDApoAlert胱天蛋白酶分析平板分析胱天蛋白酶活性，通过离心使来自样品的细胞沉淀，然后重悬浮在lx细胞裂解緩冲液(BDBiosciencesClontech)中，并在冰上孵育10分钟。然后通过在4。C离心5分钟除去细胞碎屑。然后将50|iL2x反应緩沖液/DTT混合物添加到将要使用的96孔平板的每个孔。平板在37-C预孵育5分钟。然后将50|iL的合适的细胞溶胞产物添加到孔中并在37。C孵育2小时。然后使用荧光平板读数器来测量释放的AMC的数量(在380nm激发，在460nm发射)。胱天蛋白酶活性被定义为减去参考样品460nm处的绝对发射之后，样品460nm处的绝对发射。参考样品是在零参考时间收集的样品。用cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem表达载体转染的细胞的胱天蛋白酶活性可以与用空载体转染的(或未转染)的细胞相比较来确定凋亡视情况被刺激或抑制的百分比。["胱天蛋白酶分析方案"结束]中，当使用这种方法来分析时，与没有用相关的cgFAIM序列如此转染的细胞相比，cgFAIM序列当转染入细胞时能够抑制胱天蛋白酶-8、或胱天蛋白酶-9、或两者的表达至少10%、优选的20%、更优选的30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多。在高度优选的实施方式中，当使用这种方法来分析时，与没有用相关的cgFADD、cgPDCD6或cgRequiem序列如此转染的纟田胞相比，cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem序列当转染入细胞时能够刺激胱天蛋白酶-8、或胱天蛋白酶-9、或两者的表达至少10%、优选的20%、更优选的30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多。也可以使用检测凋亡相关事件，例如膜改变、DNA片段化和凋亡的其他生物化学标志的其他分析，来代替或补充所描述的分析。公开的多肽包括从任何来源获得的同源序列，例如，相关的病毒/细菌蛋白质，细胞同源物和合成肽，以及其变体或衍生物。因此，多肽还包括来自其他物种包括动物例如哺乳动物(例如，小鼠、大鼠或兔子)特别是嗜齿动物的、编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的同源物的那些。在本文件的上下文中，同源序列或同源物包括视情况与cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem，例如在此的序列表中所示的，在至少30、优选的40、50、60、70、80、90或100个氨基酸上，在氨基酸水平上具有至少60、65、70、75、80、85、86、87、88、89或90%的同一性，优选的至少91、92、93、94、95、96、97、98或99%同一性的氨基酸序列。在这个文件的上下文中，同源序列包括与cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列,优选的在至少15、25、35、50或100，优选的200、300、400或500个氨基酸上在氨基酸水平上具有至少15、20、25、30、40、50、60、65、70、75、80、85、86、87、88、89或90%的同一性，优选的至少91、92、93、94、95、96、97、98或99%同一性的氨基酸序列。例如，序列可以与cgFADD(优选的包含SEQIDNO:1所示的序列)、cgFAIM(优选的包含SEQIDNO:2所示的序列)、cgPDCD6(优选的包含SEQIDNO:3所示的序列)或cgRequiem(优选的包含SEQIDNO:4所示的序列)具有所称的序列同一性。尽管也可以根据相似性来考虑同源性(即，具有相似化学性质/功能的氨基酸残基)，在本文件的上下文中，优选的根据序列同一性来表述同源性。在高度优选的实施方式中，序列同一性相对于相关序列的长度的全部来确定，即，例如在相关基因的完整长度或全长序列上。可以通过目测、或更常见地，借助易获得的序列比较程序来进行同源性比较。这些商业上可获得的计算机程序能计算两个或多个序列之间的同源性％。可以在连续的序列上计算同源性％,即，一个序列与另一个序列比对，一个序列中的每个氨基酸直接与另一个序列中相应氨基酸比较，一次一个残基。这称为"无缺口"比对。一般，这种无缺口比对只在相对短的残基数上进行(例如低于50个连续的氨基酸)。尽管这是非常筒单且一致的方法，但是它没有考虑到，例如，在除此之外相同的序列对中，一个插入或缺失将导致随后的氨基酸残基被逐出序列比对，因此当进行整体排列时，将很可能导致％同源性的大幅度下降。因此，多数序列比较方法被设计成考虑到可能的插入和缺失而不会对整体同源性积分不适当地罚分，从而产生最佳的序列对比。这通过在序列对比中插入"缺口"来试图最大化局部的同源性而实现。但是，这些更复杂的方法对序列比对中出现的每个缺口指定了"缺口罚分"，这样，对于相同数量的相同氨基酸，带有尽可能少的缺口的序列比对_一反映两个比较序列之间的更高相关性_将比有较多缺口的序列获得更高的积分。一般用"远交缺口计分(Affinegapcosts)"来给缺口的存在扣(charge)较多的计分，给缺口中每个随后的残基扣较少罚分。这是最普遍使用的缺口积分系统。高缺口罚分当然将产生具有较少缺口的最优化的序列对比。多数序列比对程序允许修改缺口罚分。但是当使用这种软件作序列比较时，优选使用缺省值。例如，当使用GCGWisconsinBestfit包时，氨基酸序列的缺省缺口罚分是缺口为-12，每个延伸为-4。因此最大％同源性的计算首先需要产生考虑到缺口罚分的最佳序列对比。用于进行这种比对的合适的计算机程序是GCGWisconsinBestfit软件包(Devereux等，1984,NucleicAcidsResearch12:387)。可以进行序列比较的其他软件的例子包括，但不局限于BLAST软件包(参见Ausubel等，1999,ShortProtocolsinMolecularBiology,第四版，第18章),FASTA(Atschul等，1990,J.Mol.Biol.，403-410)和GENEWORKS比较工具系列。BLAST和FASTA都可得到，用于脱机和联机检索(参见Ausubd等，1999，ShortProtocolsinMolecularBiology,第7-58到7-60页)。然而优选的是使用GCGBestfit程序。尽管最终同源性％可以根据同一性而测量，比对过程自身一般不以全或无成对比较为基础。相反，通常使用按比例绘制的(scaled)相似性评分矩阵将得分分配到每个以化学相似性或进化距离为基础而进行的成对比较。这种常用矩阵的一个例子是BLOSUM62矩阵，即BLAST程序系列的缺省矩阵。GCGWisconsin程序一般用公共默认值或如果已提供，则使用自定义符号比较表(更详细内容见用户手册)。优选将公共默认值用于GCG软件包，或在使用其它软件的情况下，使用缺省矩阵，如BLOSUM62。一旦软件产生最优比对，就有可能计算％同源性，优选％序列同一性。软件一般作为序列比较的一部分进行此计算并产生以数字表示的结果。在优选的实施方式中，根据用于比较的相关序列的完整长度来考虑序列相似性、同一性、同源性或互补性。相对于在此描述的氨基酸序列的术语"变体，，或"衍生物，，包括从所述序列或对所述序列的任何替换、改变、修饰、置换、缺失或添加一个(或多个)氨基酸。优选的，产生的氨基酸序列基本上保持了与未修饰的序列相同的活性，优选的具有至少与序列表中所示cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽相同的活性。因此，优选保持序列的关键特征——即它们能够调节一种或多种凋亡过程。具有实施例中所示氨基酸序列的多肽，或其片段或同源物可以被修饰以用于在此描述的方法和组合物。一般地，进行维持序列的生物学活性的修饰。可以进行氨基酸替换，例如从1、2或3个到10、20或30个替换，只要修饰的序列保持了未修饰序列的生物学活性。氨基酸替换可以包括使用非天然发生的类似物，例如，用来提高治疗性施用的多肽的血浆半衰期。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的天然变体很可能包含保守性氨基酸替换。保守性替换可以例如根据以下的表格定义。第二栏中同一块中的氨基酸，优选第三栏中同一行的氨基酸可以相互替代<table>tableseeoriginaldocumentpage21</column></row><table>^遂在此公开并且作为标记物有用的多肽还包括上述全长多肽的片段和其变体，包括在序列表中列出的序列的片段。多肽还包括cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽的任一个的全长序列的片段。优选的片段包含至少一个表位。鉴定表位的方法是本领域公知的。片段一般将包含至少6个氨基酸，更优选的至少10、20、30、50或100个氨基酸。包括的是片段，其包含，优选的由cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem氛基酉交序歹寸的5、6、7、8>9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150个或更多残基组成。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem蛋白质的多肽片段和其等位和物种变体可以含有一个或多个(例如，5、10、15或20个)替换、缺失或插入，包括保守的替换。当替换、缺失和/或插入发生时，例如在不同的物种中，优选序列表中描绘的氨基酸残基的少于50%、40%或20%被改变。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem,和它们的片段、同源物、变体和衍生物可以通过重组方法来产生。然而，它们也可以使用技术人员公知的技术例如固相合成通过合成方法产生。蛋白质也可以作为融合蛋白生产，例如，来帮助提取和純化。融合蛋白配偶体的实例包括谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、6xHis、GAL4(DNA结合和/或转录活化结构域)和(3-半乳糖苷酶。在融合蛋白配偶体和目标蛋白质序列之间包括蛋白水解裂解位点来容许除去融合蛋白序列也是方便的。优选的融合蛋白将不会阻碍目标蛋白质序列的功能。还可以通过纯化来自'动物细胞的细胞提取物获得蛋白质。在此公开的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6,和cgRequiem多肽，变体、同源物、片段和衍生物可以是基本上分离的形式。要理解的是这种多肽可以与不干扰该蛋白质的预定目的的运载体或稀释剂混合，而仍认为是基本上分离的。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem变体、同源物、片段或衍生物也可以是基本上纯化的形式，在这种情况下一般它将包含在制品中的蛋白质，其中在制品中超过90%,例如95%、98%或99%的蛋白质是蛋白质。在此公开的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽、变体、同源物、片段和衍生物可以用具有显示作用的标记来标记。具有显示作用的标记可以是容许多肽等被检测的任何适合的标记。适合的标记包括放射性同位素，例如1251，酶，抗体，多核苷酸和接头例如生物素。标记的多肽可以在诊断过程例如免疫分析中使用来确定样品中多肽的数量。多肽或标记的多肽也可以用于血清学或细胞介导的免疫分析，用于使用标准方案检测动物和人类对所述多肽的免疫反应性。在此公开的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽、变体、同源物、片段和衍生物，任选的被标记的，也可以固定到固相上，例如免疫分析孔或蘸取棍(dipstick)的表面。这种标记的和/或固定的多肽可以在适合的容器中与适合的试剂、对照物、说明书等等一起被包装在试剂盒中。这种多肽和试剂盒可以用于通过免疫分析来检测针对所述多肽或它们的等位或物种变体的抗体的方法。免疫分析方法是本领域公知的，一般包括(a)提供包含可由针对所述蛋白质的抗体结合的表位的多肽；(b)在容许抗体-抗原复合物形成的条件下孵育生物样品与所述多肽；和(c)确定是否形成包含所述多肽的抗体-抗原复合物。在此7>开的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽、变体、同源物、片段和衍生物可以用于体外或体内细胞培养系统来研究它们的相应基因和其同源物在细胞功能中的作用，包括它们在疾病中的功能。举例来说，截短的或修饰的多肽可以导入细胞来破坏在细胞中存在的正常功能。多肽可以通过多肽从重组表达载体的原位表达来导入细胞中(见下文)。所述表达载体任选的带有可诱导的启动子来控制所述多肽的表达。使用合适的宿主细胞，例如昆虫细胞或哺乳动物细胞，预计提供了这种翻译后修饰(例如，肉豆蔻酰化、糖基化、截断、lapidation以及酪氨酸、丝氨酸或苏氨酸磷酸化)，这可能是赋予重组表达产物最佳生物学活性所需的。表达在此公开的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽、变体、同源物、片段和衍生物的这种细胞培养物系统可以在分析系统中使用来鉴定在所述细胞中干扰或增强所述多肽的功能的候选物质。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem核酸我们一般地提供了许多cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem核酸，连同其片段、同源物、变体和衍生物。这些核酸序列优选的编码在此公开的多肽序列，特别是序列表中的多肽序列。优选的，所述多核芬酸包含cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem核酸，优选的分别选自由SEQIDNO:5、SEQIDNO:6、SEQIDNO:7和SEQIDNO:8组成的组。特别地，我们提供了编码在此公开的任何中国仓鼠多肽的核酸或多核苷酸。因此，术语""cgFADD序列"、"cgFAIM序列"、"cgPDCD6序列，，和"cgRequiem序列，，应被相应地解释。然而，优选的，这些核酸或多核苷酸包含SEQIDNO:5-16和SEQIDNO:37、38、39和40所列的Y壬一序列、或编码任一相应多肽的序列，和这种核酸的片段、同源物、变体或衍生物。因而以上术语优选的应看作是指这些序列。如在本文件中使用，术语"多核苷酸"、"核苷酸"和核酸意欲互相是同义的。"多核苷酸，，一般是指任何多核糖核苷酸或多脱氧核糖核酸，其可以是未修饰的RNA或DNA或修饰的RNA或DNA。"多核苷酸"非限制性地包括单链和双链DNA,单链和双链区域的混合物的DNA，单链和双链的RNA,和单链和双链区域的混合物的RNA,包含可以是单链的或更一般地是双链的DNA和RNA的杂合体分子，或单链和双链区域的混合物。此外，"多核苦酸"指包含RNA或DNA或RNA与DNA两者的三链区域。术语多核香酸还包括含有一个或多个修饰的碱基的DNA或RNA,以及主干为了稳定性或其他理由加以修饰的DNA或RNA。"修饰的，，碱基包括，例如，三苯曱基化的碱基，和不常见的碱基，例如次黄香。已经对DNA和RNA进行了各种修饰，因而"多核苷酸"涵盖如一般在自然中存在的多核苷酸的化学、酶学地或代谢修饰的形式，以及病毒和细胞特有的DNA和RNA的化学形式。"多核苷酸"还涵盖相对短的多核普酸，常常称为寡核苷酸。技术人员要理解的是，由于遗传密码简并性的结果，许多不同的多核芬酸和核酸可以编码相同的多肽。此外，要理解的是，技术人员可以使用常规技术，产生不影响由在此描述的多核苷酸编码的多肽序列的核苷酸替换，来反映所述多肽将要被表达的任何特定宿主有机体的密码子利用率。f》力i教^^源^在此描述的多核苷酸可以包括DNA或RNA。它们可以是单链的或双链的。它们也可以是其中包括合成的或修饰的核苷酸的多核苷酸。对寡核苷酸的许多不同类型的修饰是本领域已知的。这些包括曱基膦酸酯和硫代磷酸酯主干，在分子的3'和/或5'末端添加吖啶或聚赖氨酸链。对于本文件的目的而言，要理解的是在此描述的多核苷酸可以通过本领域可用的任何方法来修饰。可以进行这种修饰来提供多核苷酸的体内活性或寿命期。当多核苷酸是双链时，双链体的两条链独立地或组合地包括在此描述的方法和组合物中。当多核苷酸是单链时，要理解的是也包括该多核苷酸的互4卜序列。相对于核苷S吏序列，术语"变体"、"同源物"或"衍生物"包括从所述序列或对所述序列的任何替换、改变、修饰、置换、缺失或添加一个(或多个)核苷酸。优选的，产生的序列能够编码具有凋亡介导物活性的多肽。如上所述，对于序列同一性，"同源物"优选的与序列表中所示相关序列具有至少5%同一性、至少10°/。同一性、至少15%同一性、至少20%同一性、至少25%同一性、至少30%同一性、至少35%同一性、至少40%同一性、至少45%同一性、至少50%同一性、至少55%同一性、至少60%同一性、至少65%同一性、至少70%同一性、至少75%同一性、至少80%同一性、至少85%同一性、至少90%同一性或至少95%同一性。更优选的，存在至少95%同一性，更优选的至少96%同一性、更优选的至少97%同一性、更优选的至少98%同一性、更优选的至少99%同一性。核苷酸同源性比较可以如上所述进行。优选的序列比较程序是如上所述的GCGWisconsinBestfit程序。默认的计分矩阵对每个相同的核脊酸有10的匹配值，对每个错配为-9。默认的缺口生成罚分是-50，默认的缺口延伸罚分每个核苷酸是-3。在优选的实施方式中，cgFAIM多核苷酸具有与SEQIDNO:5所示序列至少卯％或更高的序列同一性。优选的，cgFAIM多核苷酸具有与SEQIDNO:5所示序列至少91%或更高、优选的92%或更高、93%或更高、94%或更高、95%或更高、96%或更高、97%或更高、98%或更高、99%或更高或99.5%或更高的序列同一性。类似地，在优选的实施方式中，cgFADD序列具有与SEQIDNO:6所示序列的至少90%的序列同一性。优选的，cgFADD多核苷酸具有与SEQIDNO:6所示序列至少91%或更高、优选的92%或更高、93%或更高、94%或更高、96%或更高、96%或更高、97%或更高、98%或更高、99%或更高或99.5%或更高的序列同一性。在优选的实施方式中，cgPDCD6序列具有与SEQIDNO:7所示序列至少93%或更高的序列同一性。优选的，cgPDCD6多核苷酸具有与SEQIDNO:7所示序列94%或更高、95%或更高、96%或更高、97%或更高、98%或更高、99%或更高或99.5%或更高的序列同一性。在优选的实施方式中，cgRequiem多核苷酸具有与SEQIDNO:8所示序列的至少90%或更高的序列同一性。优选的，cgRequiem多核苷酸具有与SEQIDNO:8所示序列90%或更高、优选的91%或更高、92%或更高、93%或更高、94%或更高、95%或更高、96%或更高、97%或更高、98%或更高、99%或更高或99.5%或更高的序列同一性。染Jt我们进一步描述了能与在此呈现的任何序列选择性杂交的cgFAIM，cgFADD,cgPDCD6andcgRequiem核苷酸序列，或其任何变体、片段或衍生物，或上述任何的互补物。核苦酸序列优选的是长度至少15个核苷酸，更优选的长度至少20、30、40或50个核苷酸。在此使用的术语"杂交"应当包括"核酸的链通过碱基配对与互补链连接的过程"，以及如在聚合酶链式反应技术中进行的扩增的过程。能够与在此呈现的核苷酸序列或它们的互补物选择性杂交的多核香酸，一般地在至少20个、优选的至少25或30个，例如至少40、60或100或更多个连续核苷酸的区域上与在此呈现的相应核苷酸序列至少70%、优选的至少80或90%，更优选的至少95%或98%同源。术语"选择性杂交"是指用作探针的多核苷酸在目标多核苷酸被发现以显著高于背景的水平与探针杂交的一定条件下使用。背景杂交可以由于其他多核香酸存在而发生，例如，在被筛选的cDNA或基因组DNA文库中。在这种情况下，背景指由探针和文库的非特异性DNA成员之间的相互作用产生的信号水平，其强度低于用目标DNA观察到的特异性相互作用IO倍、优选的低于100倍。可以通过例如，用32P对探针进行放射性标记，来测量相互作用的强度。杂交条件基于核酸结合复合物的熔融温度(Tm),如BergerandKimmel(1987，GuidetoMolecularCloningTechniques,MethodsinEnzymology，Vol152,AcademicPress,SanDiegoCA)中所教导的，并如以下说明被赋予定义的"严谨度"。最大严谨度一般在约Tm-5°C(低于探针的Tm5°C)发生；高严谨度在低于Tm5。C到10°C;中度严谨度在低于Tm约10T到20°C;低严谨度在低于Tm约20。C到25°C。本领域技术人员将理解的是，最大严谨度杂交可以用于鉴定或检测相同的多核苷酸序列，而中度(或低度)严谨度杂交可以用于鉴定或4企测相似的或相关的多核苷酸序列。在优选的方面，我们公开了能够与cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem核酸、或其片段、同源物、变体或衍生物在严谨条件(例如，65。C和O.lxSSC{lxSSC=0.15MNaCl，0.015M柠檬酸钠pH7.0})下杂交的核香酸序列。当多核苷酸是双链时，双链体的两条链独立地或组合地被本/>开涵盖。当多核苷酸是单链时，要理解的是该多核苷酸的互补序列也被公开和涵盖。可以以多种方式获得与在此公开的序列不是100°/。同源、但落入本公开之内的多核香酸。在此描述的序列的其他变体可以例如通过探查从一系列个体，例如来自不同群体的个体制成的DNA文库来获得。此外，可以获得在其他病毒/细菌，或细胞同源物，特别是在哺乳动物细胞(例如，大鼠、小鼠、牛和灵长类细胞)中发现的细胞同源物，而且这种同源物和其片段一般将能够选冲奪性地与此处的序列表中所示序列杂交。这种序列可以通过如下方法来获得探查从其他动物物种制成的cDNA库或来自其他动物物种的基因组DNA库，在中度至高度严谨的条件下用包含SEQIDNO:1到40的全部或部分的纟果针来^^查这些文库。相似的考虑适用于获得cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的物种同源物和等位变体。在此描述的多核苷酸可以用于产生引物，例如PCR引物，用于选择性的扩增反应的引物；产生探针，例如使用放射性或非放射性标记通过传统方法用具有显示作用的标记标记的探针，或者所述多核苷酸可以被克隆到载体中。这些引物、探针和其他片段长度将是至少15、优选的至少20、例如至少25、30或40个核苷酸，并且也被在此使用的术语多核苷酸涵盖。优选的片段长度低于500、200、100、50或20个核苷酸。多核苷酸例如DNA多核苷酸和探针可以重组地、合成地或通过本领域技术人员可获得的任何方法来产生。它们也可以通过标准技术克隆。一般地，引物将通过合成方式来生产，包括一次一个核苷酸地分步式生产期望的核酸序列。使用自动化技术实现这个的技术是本领域中容易获得的。更长的多核苷酸一般将使用重组方式产生，例如，使用PCR(聚合酶链式反应)克隆技术。这将包括制备侧翼于希望被克隆的序列区域的引物对(例如，约15到30个核苷酸)，使引物与从动物或人类细胞获得的mRNA或cDNA接触，在引起希望的区域扩增的条件下进行聚合酶链式反应，分离扩增的片段(例如，通过在琼脂糖凝胶上纯化反应混合物)并回收扩增的DNA。引物可以被设计以含有适合的限制性内切酶识别位点，使得扩增的DNA可以被克隆入适合的克隆载体。CG序列的用途如实施例所示，我们确定了这四个基因涉及细胞中凋亡的介导。降低，并由此改善了细胞生存力。因而基因和多肽和其产物在许多领域，例如在细胞培养中具有实用性。因此，美国专利号6,586,206描述了凋亡抑制物在使用培养的宿主细胞生产重组蛋白质中的用途，具有改善期望的蛋白质产量的效果。相应地，因而中国仓鼠FAIM、FADD、PDCD6和Requiem序列的公开允许在细胞培养中靶向这些基因来增强细胞生存力并促进重组蛋白质生产的产量增强。具体地，我们在此描述的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem修饰的细胞、优选的中国仓鼠细胞、更优选的中国仓鼠卵巢细胞，可以适当地被采用用于以改善的产量生产重组蛋白质。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem修饰的细胞根据在此描述的方法和组合物，在细胞中调节cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的任何一种或多种改善了群体的细胞生存力，优选的中国仓鼠群体。特别地，我们在实施例中显示了降低cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的表达，以及提高cgFAIM的表达，导致细胞生存力改善。然而，要理解的是，除了调节多肽表达，或作为调节多肽表达的替代，可以采用调节任何这些基因的方法，包括调节物实体例如激动剂和拮抗剂的使用。为了方便起见，将调节这些基因的任何一个或多个的表达的细胞称为"修饰的细胞"，虽然要理解的是，这些细胞可能本身不是被物理修饰的，但可以是被修饰的细胞的后代。具体地我们提供了其中cgFAIM表达被增量调节的细胞，以及其中cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem,或其任意组合的表达被减量调节的细胞。因而，要理解的是，cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的一个、两个、三个或全部四个的表达可以在修饰的细胞中被调节。修饰可以是短暂的，或可以是永久或长期的，取决于修饰的方式。^修饰的细胞可以包括哺乳动物细胞，优选的中国仓鼠细胞，最优选的CHO细胞。它们可以包括啮齿动物细胞，优选的小鼠或大鼠细胞。优选的，这种修饰的细胞包括中国仓鼠细胞，最优选的CHO细胞。然而，它们可以包括灵长类细胞，例如猴细胞或人细胞。相关的细胞可以通过本领域已知的任何手段靶向相关的基因来修饰。一种可能的方法是表达4十对cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的反义构建体，来抑制基因功能并防止相关多肽的表达。另一种方法是使用cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽的无功能的变体，其与内源的基因产物竟争细胞死亡机制的细胞成分，产生对功能的抑制。做为选择，可以向细胞施用通过如上述分析鉴定为与cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽结合的化合物，来阻止多肽的功能。例如，这可以通过重组DNA技术，或通过直接施用化合物来进行。针对cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的适合的抗体也可以用作试剂。做为选择，双链的RNA(dsRNA)是在广泛的有机体中干扰基因表达的强大的方法，其近来已经显示在哺乳动物中是成功的(WiannyandZernicka-Goetz，2000，NatCellBiol2000，2,70-75)。相应于cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem多核苷酸的序列的双链RNA可以被导入或在细胞或细胞系中表达来增强细胞生存力。特别地，我们描述了当期望表达降低时通过使用小干扰RNA(singleinterferingRNA)(siRNA)以及使用显性阴性突变体的修饰。我们进一步描述了使用载体，其允许用于提高相关基因的表达的相关序列的过量表达。修饰可以是短暂的，或可以是永久的。因而，我们提供了细胞系，其包含在cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem中具有基因组的和可遗传的修饰的细胞。建立这种细胞系的详细方案在实施例中列出。修饰的细胞可以做单细胞、细胞组、克隆、克隆系、菌落、细胞系或组织来提供。我们进一步提供了转基因动物，其细胞包含cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的减量调节的表达，或cgFADD的增量调节的表达，或这两者。优选的，显性突变体包括cgFADD显性突变，cgFADD显性突变包含SEQIDNO:9中列出的序列。做为选择，或此外，所述序列可以包含FDIVCDNVGRDWKRLARQLKVSEAKIDGIEERYPRSLSEQVREALRVWKIAEREKATVAGLVKALRACRLNLVADLVE显性突变体可以由SEQIDNO:10中所列的序列编码，或作为选择，提高的细胞生存力当与同源的未修饰细胞、或野生型细胞、或衍生它们的亲本细胞相比时，修饰的细胞具有几个有益的性质。它们可能具有改善的细胞生存力的性质。因此，对于世代的时间或数量而言，它们可以在培养中存活更久。优选的，通过测定已经被修饰，即通过耙向cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem修饰的细胞群体的存活细胞密度，来度量细胞生存力。优选的，与没有^L修饰的细胞(例如，对照群体)相比，》务饰的细月包维持了更高的细胞生存力。细胞生存力优选的以相关的细胞群体中存活细胞的百分比来测量。在优选的实施方式中，细胞生存力通过"台盼蓝生存力排阻分析"来测定。这种分析一般用于在细胞培养领域中的细胞生存力测定。在实施例中列出了详细的方案，简言之细胞悬液与磷酸盐緩沖溶液中的0.4%台盼蓝混合，并使用血球计计数。活细胞呈现圆形并且可折射，没有任何蓝色染料着色，而死细胞吸收染料并呈现蓝色。然后将生存力表示为相对于被计数的总细胞数的活细胞百分比。活细胞被定义为其膜完整性仍然能够在台盼蓝排阻生存力分析中阻止台盼蓝吸收的细胞。优选的，修饰的细胞与对照群体相比具有至少5%、优选的10%或更多、更优选的15%、更优选的15%、20%、30%、40%、50%或更多存活细胞。做为选择，或此外，修饰的细胞与未被修饰的细胞相比细胞生存力维持了更长时间。例如，修饰的细胞与对照细胞相比能够维持一定百分比的细胞生存力(例如，95%)更长时间。优选的，修饰的细胞与对照细胞相比细胞生存力延长至少1小时，更优选的至少6小时，最优选的至少12小时或更久，例如，至少24小时，至少36小时或至少48小时。在高度优选的实施方式中，与对照细胞相比，在生存力开始降至低于95%之前，修饰的细胞生存力延长至少24小时。与未修改对照细胞相比，修饰的细胞优选能有更高的存活培养物密度。优选的，与对照细胞相比，修饰的细胞能有高10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%或更高的活细胞密度。例如，修饰的细胞可以达到高达9.6xl(^个细胞/ml的密度。修饰的细胞优选的显示凋亡标记物表达的延迟发作，优选的是胱天蛋白酶2、胱天蛋白酶3或胱天蛋白酶8。就单个细胞更长时间的存活或显示了凋亡的细胞数目而言，修饰的细胞也具有显示降低的凋亡的性质。优选的，它们具有对凋亡有抗性的性质(参见下文)。炎葛的蛋^量方便地，如实施例21中所证明的，与未修改的对照细胞相比，修饰的细胞能有提高的蛋白质产量，优选的提高的重组表达的蛋白质产量。优选的，修饰的细胞与对照细胞相比能有高10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%或更高的产量。更优选的，修饰的细胞与对照细胞相比能有高2.5x、3x、5x、10x或更高的产量。优选的，重组表达的蛋白质包含干扰素y。因而我们提供了在所描述的修饰的细胞中表达重组蛋白质、优选的生物治疗分子的方法。优选的，所述修饰的细胞在分批培养、补料分批培养或两者中显示了它们的性质中的任何一种或多种。提葛的潜差/a与对照的未修饰细胞相比，所述修饰的细胞优选的还能提高表达的蛋白质的糖基化。实施例显示了修饰的细胞能够在延长的细胞培养时间上维持蛋白质糖基化，不管细胞培养物生存力的损失是否发生。在高度优选的实施方式中，糖基化包括唾液酸化作用。修饰的细胞系的这种特征在生物治疗剂的制备中特别有益，因为较低程度的唾液酸化作用会降低基于蛋白质的药物的体内半衰期(Varki，1993，BiotechnolBioeng43:423-428;Grameretal.，1995，Glycobiology3:97-130)。在优选的实施方式中，在细胞培养物的一个或多个生长阶段、优选在指数生长期的至少部分中(优选的至少在指数中期中)，但更优选的还在发生最大存活细胞密度之时，更优选的还在亲本或未修改细胞中将出现细胞死亡之时，维持表达的蛋白质的糖基化。在这种情况下，糖基化的水平优选的被维持在一个水平，而亲本或未修改的细胞中该水平将会降低。在优选的实施方式中，糖基化被维持在至少2.7、优选的至少2.9mole糖/mole表达的蛋白质的水平。在优选的实施方式中，与亲本或未修饰的细胞相比，在生长期中相同的时间点，修饰细胞对表达的蛋白质的糖基化提高。在这种优选的实施方式中，糖基化可以达到至少2.9、优选的至少3、3.1、3.2、3.3、3.4或3.5mole糖/mole表达的蛋白质的水平。我们进一步提供了具有提高的糖基化、优选的提高的唾液酸化作用的重组蛋白质，所述重组蛋白质使用所描述的修饰的细胞制备。与可从不被如此修饰的细胞产生的多肽相比，这种多肽具有^C高的唾液酸化作用。优选的，所述糖基化或唾液酸化作用大于2.9mol唾液酸/mol产生的多肽，优选的约3.5mol唾液酸/mol产生的多肽。在高度优选的实施方式中，表达的蛋白质包含干扰素y。我们进一步提供了通过调节细胞的cgFAIM、gFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem表达、修饰细胞来展示上述任何一种或多种性质的方法。凋亡才艮据本发明，cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem修饰的细胞的细胞生存力的提高源于修饰的细胞群体中凋亡的降低。这种修饰的细胞可以显示降低的凋亡，或对凋亡有抗性。与对照细胞相比，所述修饰的细胞优选的能够维持更高的存活细胞密度，优选的持续更久的时间。优选的，与未修饰的对照群体相比，在修饰的群体中存活细胞数目更高，例如高10%、20%、30%、40%、50%、100%、200%、500%或更多。优选的，与对照细胞相比，修饰的细胞显示生存力延长至少6小时、至少12小时、优选的至少18小时，最优选的至少24小时。在高度优选的实施方式中，与对照细胞相比，胱天蛋白酶2和/或胱天蛋白酶3和/或胱天蛋白酶8表达被延迟这么长时间。因而，优选的，与对照群体相比，^修饰细胞的群体中的凋亡降低至少10%、优选的25%或更多、更优选的40%、50%、75%、95%或更多。在优选的实施方式中，修饰细胞的群体中凋亡细胞的百分比降低这么些数量。在高度优选的实施方式中，修饰的细胞对凋亡有抗性，即，显示了很少的凋亡或没有显著的凋亡。分析凋亡的方法是本领域已知的，在下文和实施例中详细描述了。在实施例14:凋亡分析中列出了分析凋亡的优选的方法。可选择的凋亡的分析包括定量或测量相关细胞中胱天蛋白酶2、胱天蛋白酶3和胱天蛋白酶8的任何一种或多种的水平。因此，优选的，与没有被如此修饰的细胞或群体相比，在修饰的细胞或群体中这些胱天蛋白酶的任何一种或多种的水平被降低10%、20%、30%、50%、70%、80%、90%或更多。优选的，与未被修饰的对照细胞相比，修饰的细胞展现胱天蛋白酶2、胱天蛋白酶3和胱天蛋白酶8的任何一种或多种的表达延迟优选的至少1小时、更优选的至少6小时、最优选的至少12小时或更多，例如，至少24小时、至少36小时、至少48小时、至少72小时、至少144小时、至少288小时或更久的一段时间。胱天蛋白酶水平可以通过本领域已知的任何方法来分析，包括RT-PCR、RNAse保护、SDS-PAGE、免疫分析，等等。细胞死亡可以通过两种不同的机制，坏死或凋亡的任一种来发生。此外，某些化合物和细胞据说对于细胞是细胞毒的，即引起细胞死亡的。"细胞毒性"是指化合物(例如，食物、化妆品或药物)或介导细胞(细胞毒性T细胞)的细胞杀伤性质。与坏死和凋亡相反，术语细胞毒性不必要指特定的细胞死亡机制。举例来说，细胞介导的细胞毒性(也就是由细胞毒T淋巴细胞[CTL]或天然杀伤[NK]细胞介导的细胞死亡)组合了坏死和凋亡的某些方面。"坏死，，(也称为"意外的"细胞死亡)是指当细胞暴露于严重的物理或化学损害时发生的病理过程。当细胞暴露于可能引起对质膜的损害的生理条件的极端改变(例如，低温、氧不足)时，发生坏死。在生理条件下，对质膜的直接损害由如补体和裂解病毒的试剂引起。坏死开始于细胞维持稳态的能力的受损，引起水和细胞外离子的流入。细胞内的细胞器，最值得注意的是线粒体，以及完整的细胞肿胀并破裂(细胞裂解)。由于质膜的最终崩溃，细胞质内容物包括溶酶体酶被释放到细胞外液中。因此，在体内，坏死性细胞死亡常常与引起强烈的炎症性反应的广泛组织损伤相关。"凋亡，，("正常，，或"程序化，，细胞死亡)是指一种生理过程，通过这种过程在发育和其他正常的生物学过程期间不需要的或无用的细胞被清除。凋亡是在正常的生理条件下发生的细胞死亡的模式，细胞在其自己的死亡中是主动参与者("细胞自杀")。这最经常地在标准的细胞更新和组织稳态、胚胎发生、免疫耐受性的诱导和维持、神经系统的发育和内分泌依赖性组织萎缩期间被发现。经历凋亡的细胞显示了特征性形态学和生物化学特征。这些特征包括染色质聚集、核和细胞质的浓缩、细胞质和核分配到含有核糖体的膜结合嚢泡(凋亡体)中、线粒体和核材料的形态上的完整。在体内，这些凋亡体^t巨噬细胞或者邻近的上皮细胞快速地识别和吞噬。由于在体内除去凋亡细胞的这种有效的机制，不引发炎症性的反应。在体外，凋亡体以及剩余的细胞碎片最终肿胀并最后裂解。体外细胞死亡的这种终末期被称为"二次坏死"。表1概括了坏死和凋亡之间各种可观察的差异。优选的，修饰的细胞展现出这些特征的一种或多种的降低。任何这些差异，单独或组合地，可以一皮分才斤以确定细月包死亡是否通过凋亡或通过坏死发生。<table>tableseeoriginaldocumentpage34</column></row><table>丝氨酸从细胞质到膜的细胞外侧的易位)生理意义影响连续细胞的群体由非生理性干扰引起(补体攻击、裂解性病毒、j氐温、氧不足、缺血、代谢毒物)巨噬细胞的吞噬作用显著的炎症性的反应影响单个的细胞由生理学刺激诱导(生长因子的缺乏，激素环境的改变)邻近的细胞或巨噬细胞的吞噬作用没有炎症性反应表1:坏死和凋亡的区别特征和意义参考以下文件，它们详细地描述了凋亡，以及用于凋亡的测量细月包死亡的各种分析Schwartzman,R.A.andCidlowski，J.A.(1993).EndocrineRev.14,133;Vermes,I,andHaa廳，C.(1994)Adv.Clin.Chem.31,177;Berke,G.(1991).Immunol.Today12,396;Kr能enbUhl,O.andTschopp,J.(1991).Immunol.Todayl2,399;VanFurth，R.andVanZwet，T.L.(1988).J.Immunol;Methods108，45.Cohen,J.J.(1993)Apoptosis.Immunol.Todayl4，126;Savill,LS.etal.(1989).J.Clin.Invest.83,865;Wyllie，A.H.(1980).Nature284，555;Leist，M.etal.(1994)BiochemicaNo.3,18-20;Fraser，A.andEvan,G.(1996)Cell85，781-784;Duke,R.C.(1983).Proc.Natl.Acad.Sci.USA80,6361;Duke，R.C.&Cohen,J.J.(1986).LymphokineRes.5，289;Trauth，B.C.etal.(1994)Eur.J.Cell.Biol.63，32,Suppl40;Matzinger,P.(1991).J.Immunol;Methods145，185;Kaeck，M,R.(1993);Anal.Biochem.208,393;Prigent,P.etal.(1993)J.Immunol;Methods160，139;Huang,P.&Plunkett,W.(1992);Anal.Biochem.207，163Bortner,C.D.etal.(1995)TrendsCellBiol.5,21;Gold,R.etal.(1994);Lab.Invest.71，219。凋亡和细胞介导的细胞毒性的特征是在膜崩解之前基因组DNA裂解成分立的碎片。因而，可以通过测量DNA片段化，例如，通过观察DNA阶梯的存在，来分析凋亡。例如，作为来自细胞群体的"阶梯"(180bp的重复作为梯子的"横档")，或通过经由例如ELISA来定量组蛋白复合的DNA片段，可以分析DNA片段。这种分析依靠一步夹心免疫分析来检测核小体。步骤包括通过离心使细胞团化，弃去上清液(其含有在孵育期间从膜漏出的、来自坏死的细胞的DNA)。在裂解緩冲液中重悬浮并孵育细胞。裂解之后，通过离心使完整的核团化。将上清液的等分量转移到链霉抗生物素蛋白包被的微量滴定板的反应孔，上清液中的核小体与两种单克隆抗体结合抗-组蛋白(生物素标记)的单克隆抗体和抗-DNA(过氧化物酶共轭)的单克隆抗体。抗体-核小体复合物通过链霉抗生物素蛋白与微量滴定板结合。洗涤固定化的抗体-组蛋白复合物三次来除去非免疫反应性的细胞成分，样品与过氧化物酶底物(ABTS)孵育。然后用分光光度法测定有颜色的产物的数量(因而，测定固定化的抗体-组蛋白复合物的数量)。几种蛋白酶涉及凋亡的早期阶段。因而，除分析凋亡所诱导的蛋白酶例如胱天蛋白酶，例如胱天蛋白酶3的活性之外，或者不4全测它们的活性，也可以通过纟企测它们的存在分析凋亡。可以按不同的方法，例如，通过例如细胞溶胞产物的体外酶分析，通过捕获胱天蛋白酶并测量适合的底物的蛋白水解裂解，可以分析胱天蛋白酶活化。此外，通过4企测体内胱天蛋白酶底物例如PARP(聚-ADP-核糖-聚合酶)的裂解，可以分析胱天蛋白酶。PARP的裂解的碎片可以用适合的抗体例如抗PARP抗体来检测。蛋白酶分析和DNA片段化分析特别适合于分析细胞群体中的凋亡。研究单个细胞中凋亡的方法也是可用的，例如，ISNT和TUNEL酶促标记分析。如上所述，广泛的DNA降解是在凋亡的早期阶段常常发生的特征性事件。DNA的裂解在高分子量DNA中产生双链的、低分子量的DNA片段(单和寡核小体)以及的单链断裂("切口")。在TUNEL中，这种DNA链断裂通过用适合的修饰的核苷酸(例如，X-dUTP、乂=生物素、DIG或荧光素)来酶促标记游离的3'-OH末端来检测。适合的标记酶包括ISNT("原位切口翁3译")中的DNA聚合酶(缺口翻译)和TUNEL("TdT-mediatedX-dUTPnickendlabeling";Huang,P.&Plunkett,W.，1992,Anal.Biochem.207,163;Bortner,C.D.etal.，1995,TrendsCellBiol.5,21)中的末端脱氧核苷酸转移酶(末端标记)。通过测量膜改变也可以分析凋亡，包括末端唾液酸残基/人细胞表面糖蛋白的侧链丧失，暴露新的糖残基；出现可以充当巨噬细胞分泌的粘附分子例如血小板反应蛋白的受体的表面糖蛋白；细胞膜磷脂不对称性的丧失，膜表面疏水性和电荷的改变。特别地，人类抗凝素膜联蛋白V是35-36千道尔顿、Ca^依赖性磷脂结合蛋白，其具有对磷脂酰丝氨酸(PS)的高亲合力。在正常的存活细胞中，PS位于细胞膜的胞质面。然而，在凋亡的细胞中，PS从质膜的内侧面易位到外侧面，从而将PS暴露于外部的细胞环境。膜联蛋白V因而可以用于检测不对称地暴露在凋亡细胞表面的磷脂酰丝氨酸(Homburg,C.H.E,etal.1995，肠od85，532;Verhoven,B.etal.，1995,■/Mec/.182,1597)。此外，DNA染料例如DAPI、溴化乙4走和硤化丙锭等等，可以用于差异染色以辨别存活的和非存活的细胞。也可以使用DNA含量的分布型；因而，通透的凋亡细胞泄漏出低分子量DNA，可以通过例如流式细胞计来检测"亚-Gl峰"或"A0"细胞(与Gl细胞相比具有更低的DNA染色的细胞)的一企测。也以这种方式4全测凋亡的特征性形态变化。通过4吏用抗体^r测凋亡相关蛋白例如ced-3，ced-4，ced-9(Ellis,H.M.andHorvitz，H.R.，1986，Cell44,817—829;Yuan,J.Y.andHorvitz，H.R.,1990Dev.Biol.138，33—41;Hentgartner，M.O.，Ellis,R.E.andHorvitz,H.R.，1992,Nature356，494-499.)、Fas(CD95/Apo-l;Enarietal"1996，Nature380,723—726)、Bcl隱2(Baffy,G.etal.,1993，J.Biol.Chem.268,6511—6519;Miyashita,T,andReed,J.C.，1993，Blood81，151—157;Oltvai,Z.N.,Milliman,G.L.andKorsmeyer,S.J.,1993,Cell74，609—619)、p53(Yonish-Rouach,E.etal.，1991,Nature352，345-347)等等也可以用于分析凋亡。核苷酸载体多核香酸可以掺入到重组可复制载体中。载体可以用于在相容的宿主细胞中复制所述核酸。因而在进一步的实施方式中，我们提供了通过将多核苷酸导入可复制的载体、将所述载体导入相容的宿主细胞，并在引起所述载体复制的条件下使所述宿主细胞生长来制备多核苷酸的方法。所述载体可以从宿主细胞中回收。适合的宿主细胞包括细菌例如大肠杆菌、酵母、哺乳动物细胞系和其他真核细胞系，例如昆虫Sf9细胞。优选的，载体中的多核苷酸与控制序列可操作地连接，所述控制序列能够使宿主细胞表达编码序列，即，所述载体是表达载体。术语"可^t喿作地连接"是指所描述的组件处在允许它们按照它们预期的方式起作用的相互关系中。"可操作地连接"到编码序列的调节序列以在与所述控制序列相容的条件下实现所述编码序列表达的方式连接。所述控制序列可以被修饰，例如通过添加进一步的转录调节元件，来使得由所述控制序列指导的转录的水平对于转录调节物更有反应性。载体可以被转化或转染到如下所述适合的宿主细胞中来提供蛋白质的表达。这个过程可以包括在使编码蛋白质的编码序列的载体得以表达的条件下、培养用如上所述的表达载体转化的宿主细胞，并且任选的回收所述表达的蛋白质。所述载体可以是，例如，质粒或病毒载体，其具有复制起点，任选的用于所述多核苷酸的表达的启动子，和任选的所述启动子的调节物。载体可以含有一种或多种选择性标记基因，例如对于细菌质粒来说为氨千青霉素抗性基因，对于哺乳动物载体来说为新霉素抗性基因。载体可以用来，例如，转染或转化宿主细胞。与编码蛋白质的序列可操作连接的控制序列包括启动子/增强子和其他表达调节信号。可以选择这些控制序列来与表达载体被设计来在其中表达的宿主细胞相容。术语"启动子"是本领域公知的，涵盖从最小的启动子到包括上游元件和增强子的启动子的在大小和复杂度上不同的核酸区域。启动子一般从在哺乳动物细胞中有功能的启动子中选择，虽然也可以使用原核启动子和在其他真核细胞中有功能的启动子。启动子一般来源于病毒或真核基因的启动子序列。例如，它可以是来自其中将要发生表达的细胞的基因组。对于真核启动子，它们可以是以遍在的方式起作用的启动子(例如，a-肌动蛋白、卩肌动蛋白、微管蛋白启动子)，或作为选择，以组织特异性方式起作用的启动子(例如，丙酮酸激酶的基因的启动子)。它们也可以是响应特定的刺激的启动子，例如，结合甾类激素受体的启动子。也可以使用病毒启动子，例如莫洛尼鼠白血病病毒长末端重复序列(MMLVLTR)启动子、劳氏肉瘤病毒(RSV)LTR启动子或人巨细胞病毒(CMV)正启动子。同样有益的是启动子是可诱导的，从而异源基因的表达水平可以在细胞的生命期期间被调节。"可诱导的"是指使用启动子获得的表达水平可以-陂调节。此外，任何这些启动子可以通过添加进一步的调节序列，例如增强子序列而被修饰。也可以使用包含来自如上所述两个或多个不同启动子的序列元件的嵌合启动子。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽的表达为了表达生物学活性的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽，将中国仓鼠FAIM、FADD、PDCD6或Requiem多核苦酸序列与调控序列相连以使调控序列指导所述多核苷酸的表达。然后使得在所述调控序列的控制下进行多肽的表达。任选的，这样产生的多肽可以被纯化。优选的，调控序列是不与FAIM、FADD、PDCD6或Requiem多核苷酸序列天然相连的调控序列。因此我们描述了生产多肽的方法，包括提供细胞，优选的中国仓鼠细胞，其中中国仓鼠FAIM、FADD、PDCD6或Requiem多核苷酸序列已经与调控序列相连以使得调控序列指导所述多核苷酸的表达，并在使所述多肽得以表达的条件下培养所述细胞，以及任选的纯化所述多肽。我们进一步描述了生产多肽的方法，包括(a)提供表达序列，其是通过使中国仓鼠FAIM、FADD、PDCD6或Requiem多核苷酸序列与调控序列相连使得调控序列指导所述多核苷酸的表达而产生的；(b)使得所述多肽在所述调控序列的控制下从所述表达序列表达，和(c)任选的纯化所述多肽。特别地，编码相应的核酸或其同源物、变体或衍生物的核苷酸序列可以插入到合适的表达载体中，即，含有对于插入的编码序列的转录和翻译所必需的元件的载体。我们还提供了通过任何上述方法产生的多肽。使cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem多肽得以表达的方法在下文列出。要理解的是，这些方法可能适用于在此描述的方法和组合物的实施方式，在这些实施方式中期望对多肽进行增量调节，例如cgFADD的增量调节以实现增强的细胞生存力。提供表达的多肽的一种方法是通过表达载体的方式，即，含有可调控的启动子，任选的具有其他调控序列例如增强子的载体(例如，质粒)，所述调控序列与已经克隆到表达载体中编码目的多肽的序列可操作连接。可以用本领域技术人员公知的方法构建含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的序列和合适的转录和翻i,控制元件的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、合成技术和体内遗传重组。在Sambrook，J.etal.(1989;MolecularCloning,ALaboratoryManual,ch.4，8,and16-17，ColdSpringHarborPress,Plainview,N.Y.)和Ausubel,F.M.etal.(1995andperiodicsupplements;CurrentProtocolsinMolecularBiology,ch.9,13,and16，JohnWiley&Sons,NewYork,N.Y.)中描述了这样的技术。可以利用各种表达载体/宿主系统来包含和表达编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列。这些包括，但不限于，微生物，例如用重组噬菌体、质粒或粘粒DNA表达载体转化的细菌；用酵母表达载体转化的酵母；用病毒表达载体感染的昆虫细胞系统(例如，杆状病毒)；用病毒表达载体(例如，花椰菜花叶病毒(CaMV)或烟草花叶病毒(TMV))或用细菌表达载体(例如，Ti或pBR322质粒)转化的植物细胞系统；或动物细胞系统。可以釆用任何适合的宿主细胞。"控制元件"或"调控序列"是载体的非翻译区域(即，增强子、启动子和5，和3，非翻译区)，其与宿主细胞蛋白质相互作用来进行转录和翻译。这些元件可以在它们的强度和特异性上有所不同。取决于使用的载体系统和宿主，可以使用任何数量的适合的转录和翻译元件，包括组成型和可诱导的启动子。例如，当在细菌系统中克隆时，可以使用可诱导的启动子，例如BLUESCRIPT喧菌粒的杂合体lacZ启动子(Stratagene，LaJolla，Calif.),或PSPORT1质粒(GIBCO/BRL)等等。可以在昆虫细胞中使用杆状病毒多角体蛋白启动子。来自植物细胞基因组(例如，热休克、RUBISCO和贝i藏蛋白基因)的启动子或增强子或来自植物病毒的启动子或增强子(例如，病毒启动子或前导序列)可以克隆到载体中。在哺乳动物细胞系统中，来自哺乳动物基因或来自哺乳动物病毒的启动子是优选的。如果必需产生含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列的多个拷贝的细胞系，可以使用带有合适的选4奪性标记的基于SV40或EBV的载体。在细菌系统中，取决于cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的预定用途，可以选4奪许多表达载体。例如，当需要大量的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem用于抗体诱导时，可以使用指导易于纯化的融合蛋白的高水平表达的载体。这种载体包括，但不限于，多功能的大肠杆菌克隆和表达载体，例如BLUESCRIPT(Stratagene),其中编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列可以与氨基末端Met和随后的P-半乳糖苷酶的7个残基按读码框连接到载体中，具有从而产生杂合体蛋白，pIN载体(VanHeeke，G.andS.M.Schuster(1989)J.Biol.Chem,264:5503-5509)，等等。pGEX载体(Promega，Madison,Wis.)也可以用于将外源多肽表达为与谷胱甘肽S-转移酶(GST)的融合蛋白。一般地，这种融合蛋白是可溶的，通过吸附到谷胱甘肽琼脂糖珠上继之在游离谷胱甘肽存在下洗脱，可以容易地从裂解的细胞纯化。在这种系统中制备的蛋白质可以被设计以包括肝素、凝血酶或因子XA蛋白酶裂解位点，从而克隆的目标多肽可以随意从GST部分释放。在酵母Sacc/zaramycwcereWw'ae中，可以使用含有组成型或可诱导启动子，例如a因子、醇氧化酶和PGH的许多载体。对于综述，参见Ausubel(同上)和Grantetal.(1987;MethodsEnzymol.153:516-544)。在使用植物表达载体的情况下，编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列的表达可以被许多启动子的任一种驱动。例如，病毒启动子，例如CaMV的35S和19S启动子可以单独使用或与来自TMV的Q前导序列组合使用。(Takamatsu，N.(1987)EMBOJ.6:307匿311)做为选纟奪，可以使用植物启动子例如RUBISCO的小亚基或热激启动子。(Coruzzi，G.etal.(1984)EMBOJ.3:1671-1680;Broglie,R.etal.(1984)Science224:838-843;和Winter,J.etal.(1991)ResultsProbl.CellDiffer.17:85-105.)通过直接DNA转化或病原体介导的转染，这些构建体可以一皮导入植物细胞。在许多一般可获得的综述中描述了这些技术。(参见，例如Hobbs，S.orMurry,L.E.inMcGrawHillYearbookofScienceandTechnology(1992)McGrawHill,NewYork,N.Y.;pp.191-196.)。也可以使用昆虫系统来表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem。例如，在一个这样的系统中，苜蓿丫纟丈4l蛾(^Wograp/wca/z^brm.ca)核多角体病病毒(nuclearpolyhedrosisvirus)(AcNPV)#皮用作在草地夜蛾(Spodopterafrugiperda)细胞或4艮纟文夜蛾(Trichoplusia)幼虫中表达外源基因的载体。编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列可以被克隆到病毒的非必需区域，例如核多角体蛋白基因，并置于核多角体蛋白启动子的控制下。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的成功插入将使得核多角体蛋白基因失活，并产生缺乏外壳蛋白的重组病毒。然后所述重组病毒可以用于感染，例如草地夜蛾细胞或4艮紋夜蛾幼虫，在其中cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem可以被表达。(Engelhard,E.K.etal.(1994)Proc.Nat,Acad.Sci.91:3224-3227.)在哺乳动物宿主细胞中，可以利用许多基于病毒的表达系统。在腺病毒用作表达载体的情况下，编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的序列可以连接到由晚期启动子和三联(tripartite)前导序列组成的腺病毒转录/翻译控制复合物中。在病毒基因组非必需El或E3区域中的插入，可以用来获得能在受感染宿主细胞中表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的存活病毒(Logan,J.andT.Shenk(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.81:3655-3659.)。此夕卜，转录增强子，例如劳氏肉瘤病毒(RSV)增强子，可以用来提高在哺乳动物宿主细胞中的表达。因而，例如，在人胚肾293(HEK293)细胞或贴壁dhfrCHO细胞中表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem蛋白质。为了最大化受体表达，一般在插入到pCDN或pCDNA3载体中之前从受体cDNA中除去所有的5，和3'非翻译区域(UTR)。通过lipofectin用单个受体cDNA转染细胞，并在400mg/mlG418存在下选择。在3周的选4奪之后，挑选单个克隆并扩展用于进一步的分析。只用载体转染的HEK293或CHO细胞充当阴性对照。为了分离稳定地表达单个受体的细胞系，一般选择约24个克隆并通过Northern印迹分析来分析。一般在被分析的G418抗性克隆的约50%中可检测到受体mRNA。也可以采用人的人工染色体(HAC)来递送比可在质粒中包含和表达的DNA更大的DNA片段。构建约6kb到10Mb的HAC,并经由常规的递送方法(脂质体、聚阳离子氨基聚合物或嚢泡)来递送用于治疗目的。也可以使用特异性起始信号来实现编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列的更有效的翻译。这些信号包括ATG起始密码子和邻近的序列。在编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列和它的起始密码子和上游序列被插入合适的表达载体的情况下，不需要其他的转录或翻译控制信号。然而，在仅插入编码序列或其片段的情况下，应当提供外源的翻i奪控制信号，包括ATG起始密码子。此外，起始密码子应该处在正确的阅读框中以确保完整插入物的翻:^奪。外源的翻"^奪元件和起始密码子可以是各种来源的，天然的和合成的。通过包含适合于所使用的特定细胞系统的增强子，例如在文献中描述的那些，可以增强表达的效力。(Scharf,D.etal,(1994)ResultsProbl.CellDiffer.20:125-162.)此外，可以选择宿主细胞菌林调节插入的序列的表达，或以期望的方式加工表达的蛋白质的能力。多肽的这种修饰包括但不限于，乙酰化、羧化作用、糖基化、磷酸化、脂质化和酰化作用。也可以使用裂解蛋白质的"前原"形式的翻译后加工来促进正确的插入、折叠和/或功能。具有翻译后活性的特异性细胞系统和特征性机制的不同的宿主细胞(例如，CHO、HeLa、MDCK、HEK293和WI38)可以从美国典型培养物保藏所(ATCC,Bethesda，Md.)获得，并可以选择来确保外源蛋白的正确修饰和加工。对于重组蛋白质的长期、高产量生产，优选稳定的表达。例如，能稳定表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的细胞系可以使用在同一个或分开的载体上含有病毒复制起点和/或内源表达元件和选择性标记基因的表达载体来转化。在导入外源载体之后，可以使细胞在富集培养基中生长约1_2天，然后转移到选择培养基。选择性标记的目的是赋予对选择的抗性，它的存在使得成功表达导入的序列的细胞得以生长和回收。稳定地转化的细胞的抗性克隆可以使用适合于该细胞类型的组织培养技术来增殖。可以使用许多选择系统来回收转化的细胞系。这些包括但不限于，单纯性疱渗病毒胸苷激酶基因(Wigler，M,etal.(1977)Cell11:223-32)和腺噤呤磷酸核糖转移酶基因(Lowy,I.etal.(1980)Cell22:817-23)，其可以分别应用于tk-或apf细胞。同样，可以使用抗代谢物、抗生素或除草剂抗性作为选"t奪的基础。例如，dhfr赋予对氨曱蝶呤的抗性(Wigler,M.etal.(1980)Proc.Natl.Acad.Sci.77:3567-70);npt赋予对氨基糖苷类新霉素和G-418的抗性(Colbere-Garapin,F.etal(1981)J.Mol.Biol.150:1-14);以及als或pat分别赋予对氯石黄隆(chlorsulfuron)和phosphinotricin转乙酰酶的抗性(Murry，同上)。已经描述了其他的可选择基因，例如，trpB，其使得细胞利用吲味而不是色氨酸，或hisD,其容许细胞利用histinol而不是组氨酸。(Hartman，S.C.andR.C.Mulligan(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85:8047-51.)近来，可见标记的使用变得流行，这种标记物如花色素苷，卩-葡糖醛酸酶和它的底物，和荧光素酶和它的底物萤光素。可以使用这些标记来不仅是鉴定转化体，还定量可归因于特定载体系统的短暂的或稳定的蛋白质表达的数量。(Rhodes,C.A.etal.(1995)MethodsMol.Biol.55:121-131.)虽然标记基因表达的存在/缺乏表明目标基因也存在，可能需要确认基因的存在和表达。例如，如果编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列被插入到标记基因序列内，可以通过标记基因功能的缺乏来鉴定含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列的转化细胞。做为选择，标记基因可以在单个启动子的控制下与编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列串联。响应于诱导或选4奪的标记基因表达通常表明串联的基因也表达。做为选择，含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的核酸序列并且表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的宿主细胞可以通过本领域技术人员已知的各种步骤来鉴定。这些步骤包括但不限于，DNA-DNA或DNA-RNA杂交和蛋白质生物分析或免疫分析4支术，其包括基于膜、溶液或芯片的技术，用于核酸或蛋白质序列的检测和/或定量。编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的多核苷酸序列的存在可以通过使用编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的多核苷酸的片段的探针或片段的DNA-DNA或DNA-RNA杂交或扩增来4全测。基于核酸扩增的分析包括使用基于编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列的寡核苷酸或寡聚物来检测含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的DNA或RNA的转化体。使用特异于蛋白质的多克隆或单克隆抗体、用于检测和测量cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的表达的各种方案是本领域已知的。这些技术的实例包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫分析(RIA)和荧光活化的细胞分选(FACS)。优选双位点、基于单克隆的免疫分析，该分片斤利用与cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem上两个互不干扰的表位反应的单克隆抗体，但也可以采用竟争性结合分析。本领域例如在Hampton,R.etal.(1990;SerologicalMethods,aLaboratoryManual,SectionIV，APSPress,StPaul,Minn.)中和Maddox,D.E.etal.(1983;J.Exp.Med.158:1211-1216)中^f艮好地描述了这些和其他的分析。各种标记和偶联技术是本领域技术人员已知的，可以用于各种核酸和氨基酸分析中。产生标记的杂交物或PCRJ笨针用于检测与编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的多核苷酸相关的序列的方法包括寡核苦S菱标记(oligolabeling)、切口翻译、末端标i己或4吏用标记的核苷酸的PCR扩增。估文为选4奪，编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列或其任何片段，可以被克隆到载体中用于mRNA探针的产生。这些载体是本领域已知的，是商业上可获得的，可以用于通过添加合适的RNA聚合酶例如T7、T3或SP6和标记的核苷酸来体外合成RNA探针。这些步骤可以使用各种商业上可获得的试剂盒来进行，例如由Pharmacia&Upjohn(Kalamazoo,Mich.)、Promega(Madison,Wis.)和U.S.BiochemicalCorp.(Cleveland,Ohio)提供的那些。可以用来易化检测的适合的报告物分子或标记包括放射性核素、酶、焚光剂、化学发光剂或显色剂，以及底物、辅助因子、抑制物、；兹性粒子，等等。用编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的核苷酸序列养。取决于使用的序列和/或载体，通过转化细胞产生的蛋白质可以位于细胞膜中、是分泌的或被包含于细胞内。本领域技术人员将理解的是，含有编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem的多核苷酸的表达载体可以被设计以含有信号序列，其指导cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem穿过原核或真核细胞膜的分泌。其他构建体可以用来将编码cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的序列连接到编码多肽结构域的核苷酸序列，所述多肽结构域将便于可溶蛋白质的纯化。这种促进纯化的结构域包括但不限于，金属螯合肽例如组氨酸-色氨酸模块，其容许在固定化的金属上纯化；蛋白A结构域，其容许在固定化的免疫球蛋白上纯化；和在FLAGS延伸/亲合纯化系统中使用的结构域(ImmunexCorp.,Seattle,Wash.)。在纯化结构域和cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem编码序列之间包括可裂解接头序列，例如特异于因子XA或肠激酶(Invitrogen，SanDiego，Calif.)的序列，可以用来便于纯化。一种这样的表达载体提供了融合蛋白的表达，所述融合蛋白含有cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem和在碌u氧还蛋白或肠激酶裂解4立点之前的编码6个组氨酸残基的核酸。组氨酸残基便于在固定化的金属离子亲和层析上纯化(IMIAC;describedinPorath，J.etal.(1992)Prot.Exp.Purif,3:263-281)，而肠激酶裂解位点提供了从融合蛋白纯化cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的手段。在Kroll,D.J.etal.(1993;DNACellBiol.12:441-453)中提供含有融合蛋白的载体的论述。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的片孚爻，以及全长多肽，不仅可以通过重组生产来产生，还可以通过使用固相技术的直接的肽合成来产生。(MerrifieldJ.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:2149-2154.)可以利用手工技术或通过自动装置进行蛋白质合成。例如，使用AppliedBiosystems431A肽合成仪(PerkinElmer)可以实现自动化的合成。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的各种片段可以分开合成，然后组合来产生全长分子。其他表达方法也是已知的，例如，可以采用称为"基因活化"的方法来调节cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的活性或表达。这种方法在US专利号5,641,670中详细描述了，通过引用合并在此。大体上，基因活化方法是基于这样的认识，细胞中目的内源基因的调节或活性可以通过在细胞基因组中预定位点通过同源重组插入适合的DNA构建体来改变，所述合适的DNA构建体包括(a)目标序列；(b)调控序列；(c)外显子和(d)不配对的剪接-供体位点，其中所述目标序列指导元件(a)-(d)的整合，从而元件(b)-(d)可操作地连接到内源基因。所述DNA构建体做为选择可以包含(a)目标序列，(b)调控序列，(c)外显子，(d)剪接-供体位点，(e)内含子和(f)剪接-受体位点，其中所述目标序列指导元件(a)-(f)的整合，从而元件(b)-(f)可操作地连接到内源基因的第一外显子。参考其中将要插入DNA的位点来选择使用的目标序列。在两种方案中，使用靶向事件来产生新的转录单位，其是由所述靶向DNA构建体导入的序列和内源细胞基因的融合产物。例如，新的转录单位的形成容许通过向宿主细胞的基因组中导入所描述的DNA构建体来使转录沉默基因(在转染前在细胞中不表达的基因)被活化。如所获得的在细胞中被表达的内源基因例如cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6或cgRequiem的表达可以祐:改变，即它被提高、降低，包括被消除，或者可以通过使用基因活化方法改变调控或诱导模式。抗体可被用来调节这些蛋白质的活性的cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的特异性拮抗剂可以包括针对一种或多种所述蛋白质的抗体。特别地，能够结合cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem的抗体，优选的能够抑制其任何生物学活性的抗体，适合用于减量调节相关蛋白质的表达，以增强细胞生存力。因此我们特别地提供了抗-cgFADD、抗-cgFAIM、抗-cgPDCD6和抗-cgRequiem抗体，以及产生它们的方法。如在此使用的，抗体是指完整的抗体或能够结合选择的目标的抗体片段，包括Fv、ScFv、Fab'和F(ab')2，单克隆和多克隆的抗体，工程化的抗体，包括嵌合的、CDR移植的和人源化的抗体，和使用噬菌体展示或可选择的技术产生的人工选择的抗体。小的片段，例如Fv和ScFv，由于它们尺寸很小和随之的优越的组织分布，具有用于诊断和治疗应用的有益性质。在此描述的抗-cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem抗体可以用于例如在细胞的环境中相关蛋白质的检测。因而，它们可以是包含效应物蛋白例如标记的改变的抗体。特别优选的是能够为抗体的体内或体外分布成4象的标记。这些标记可以是方文射性标记或不透射线的标记，例如金属微粒，其在胚或细胞团块内是可以容易地看见的。此外，它们可以是荧光标记或在组织样品上可见的其他标记。重组DNA技术可以用于改进在此描述的抗体。因而，可以构建嵌合抗体来降低其在诊断或治疗应用中的免疫原性。此外，通过CDR移植[参见欧洲专利申请0239400(Winter)]和任选的,骨架修饰[EP0239400]来人源化抗体，可以使免疫原性最小化。抗-cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和cgRequiem抗体可以/人动物血清获得，或对单克隆抗体或其片段来说，可以在细胞培养物中产生。DNA重组技术可以用来根据规定程序在细菌或优选哺乳动物细胞培养物中产生抗体。所选4奪的细胞培养物系统优选地分泌抗体产物。因而，我们公开了用于抗体的生产的过程，包括培养宿主，例如大肠杆菌或哺乳动物细胞，其已经用包含表达盒的杂合体载体转化，所述表达盒包含与编码信号肽的第一DNA序列可操作连接的启动子，所述第一DNA序列按适当的读码框与编码所述抗体蛋白质的第二DNA序列连接，以及分离所述蛋白质。在适合的培养基中进行杂交瘤细胞或哺乳动物宿主细胞的体外扩增，所述培养基是惯用的标准培养基，例如Dulbecco'sModifiedEagleMedium(DMEM)或RPMI1640培养基，任选的补充有哺乳动物血清，例如胎牛血清，或痕量元素和生长维持添加剂，例如饲养细胞如正常的小鼠腹腔渗出物细胞、脾细胞、骨髓巨噬细胞、2-氨基乙醇、胰岛素、转铁蛋白、低密度脂蛋白、油酸，等等。本身是细菌细胞或酵母细胞的宿主细胞增殖同样地在本领域已知的适合培养基中进行，例如对于细菌，在LB培养基、NZCYM培养基、NZYM培养基、NZM培养基、TerrificBroth、SOB培养基、SOC培养基、2xYT培养基或M9基本培养基中进行，对于酵母在YPD培养基、YEPD培养基、基本培养基或CompleteMinimalDropout培养基中进行。体外生产提供了相对纯的抗体制备物，并且容许规模扩大来得到大量的期望抗体。细菌细胞、酵母或哺乳动物细胞培养的技术是本领域已知的，包括均匀悬浮培养，例如在气升式反应器中或在连续搅拌反应器中，或者固定化的或捕集的(entrapped)细胞培养，例如空心纤维、微嚢中，在琼脂糖微J朱或陶资筒(cartridge)上。也可以通过体内扩增哺乳动物细胞来获得大量的期望抗体。为此，将产生期望的抗体的杂交瘤细胞注射到组织相容的哺乳动物中来引起生产抗体的肿瘤生长。任选的，在注射之前，动物用烃、特别是矿物油例如姥鲛烷(四曱基-十五烷)预处理(prime)。在一到三周后，将抗体从这些哺乳动物的体液中分离。例如，向任选的用异十八烷预处理的BALB/c小鼠腹膜内注射杂交瘤细胞或转染的细胞，一到两周后，从动物采集腹水；其中所述杂交瘤细胞通过融合适合的骨髓瘤细胞和来自Balb/c小鼠的生产抗体的脾细胞获得，所述转染的细胞来自产生期望抗体的杂交瘤细胞系Sp2/0。在例如KohlerandMilstein，(1975)Nature256:495-497;US4,376,110;HarlowandLane,Antibodies:aLaboratoryManual,(1988)ColdSpringHarbor中讨论了上述的和其他的技术，通过参考在此引用。制备重组抗体分子的技术在上述参考文献中描述了，并且也在例如EP0623679;EP0368684和EP0436597中描述了，通过参考将它们在此引用。例如，通过免疫印迹、通过酶免疫分析，例如夹心分析或斑点分析，或放射免疫分析，来筛选细胞培养物上清液中期望的抗体。为了分离抗体，可以浓缩培养物上清液或腹水中的免疫球蛋白，例如，通过用硫酸铵沉淀、相对吸湿性材料例如聚乙二醇透析、通过选择性膜过滤，等等。如果必要和/或希望，通过常规的层析方法来纯化抗体，例如凝胶过滤、离子交换层析、在DEAE-纤维素上层析和/或(免疫)亲和层析，例如使用cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem或其片段或使用蛋白-A的亲和层析。还提供了分泌单克隆抗体的杂交瘤。优选的杂交瘤细胞是遗传上稳定的，分泌具有期望的特异性的单克隆抗体，并可以通过解冻和重克隆从深度冷冻的培养物中激活。还包括制备分泌针对cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的单克隆抗体的杂交瘤细胞系的方法，其特征在于，用一种或多种cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽、或其抗原性片羊爻免疫适合的哺乳动物，例如BALB/c小鼠；将被免疫动物的生产抗体的细胞与适合的骨髓瘤细胞系的细胞融合，克隆融合中所获得的杂交细胞，选择分泌期望的抗体的细胞克隆。例如，用cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem免疫的BALB/c小鼠的脾细胞与骨髓瘤细胞系PAI或骨髓瘤细胞系Sp2/0-Ag14的细胞融合，筛选获得的杂交细胞的期望抗体的分泌，克隆阳性的杂交瘤细胞。优选的是制备杂交瘤细胞系的方法，其特征在于，在几个月内，例如在两个月和四个月之间，通过皮下和/或腹膜内注射10和107和108之间个表达cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的细胞和适合的佐剂凄史次，例如四到六次，在最后一次注射后两到四天从被免疫小鼠采集脾细胞，并在存在融合启始物、优选的聚乙二醇的情况下与骨髓瘤细胞系PAI的细胞融合。优选的，骨髓瘤细胞在含有约30%到约50%、分子量约4000的聚乙二醇的溶液中与三到二十倍过量的来自被免疫小鼠的脾细胞融合。融合之后，细胞如上所迷以一定的间隔在补充有选4奪培养基，例如HAT培养基的适合的培养基中扩展，以防止正常的骨髓瘤细胞生长超过期望的杂交瘤细胞。还公开了包含插入物的重组DNA，所述插入物编码针对如上所述cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的抗体的重链可变区和/或轻链可变区。根据定义，这种DNA包括编码单链的DNA、由所述编码DNA和其互补DNA组成双链的DNA，或这些互补(单链的)DNA本身。此夕卜，编码4十对cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的4元体的重链可变区和/或轻链可变区的DNA可以是酶学或化学合成的DNA,其具有编码重链可变区和/或轻链可变区的真正(authentic)DNA序列或其突变体。真正DNA的突变体是编码上述抗体的重链可变区和/或轻链可变区的DNA，所述抗体中一个或多个氨基酸被缺失或用一种或多种其他氨基酸替换。优选的，所述一个或多个修饰在抗体的重链可变区和/或轻链可变区的CDR之外。这种突变DNA还意指沉默突变，其中一个或多个核苷酸寻皮具有编码相同的一个或多个氨基酸的新密码子的其他核苷酸替换。这种突变序列也是简并序列。简并序列在遗传密码的意义上是简并的，其中无限数量的核普酸被其他核苷酸替换而不引起最初编码的氨基酸序列的改变。由于它们不同的限制性位点和/或为特定的宿主、特别是大肠杆菌所偏爱的特定密码子频率，这种简并序列可用于获得重链鼠可变区和/或轻链鼠可变区的最佳的表达。术语突变体意图包括通过根据本领域已知方法对真正DNA体外诱变获得的DNA突变体。对于完整的四聚免疫球蛋白分子的组装和嵌合抗体的表达，将编码重《连和轻《连可变区的重组DNA插入物与编码重《连和轻链恒定区的相应DNA融合，然后例如在掺入杂合体载体之后，转移到合适的宿主细胞内。还公开的是重组DNA，其包含插入物，所述插入物编码与人类恒定区，例3口yl、丫2、或丫4,伊乙选的yl或y4融合的、4十乂于cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的抗体的重链鼠可变区。同样地还公开了重组DNA,其包含编码与人类恒定区k或X,优选的k融合的、针对cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem的抗体的轻链鼠可变区的插入物。在另一个实施方式中，我们^^开了编码重组多肽的重组DNA，其中重链可变区和轻链可变区通过间隔区基团的方式连接，任选的包含便于抗体在宿主细胞中加工的信号序列和/或编码便于抗体纯化的肽的DNA和/或裂解位点和/或肽间隔区和/或效应物分子。编码效应物分子的DNA意图是编码在诊断或治疗应用中有用的效应物分子的DNA。因而，特别指明是毒素或酶，特别是能催化前体药物的活化的酶的效应物分子。编码这种效应物分子的DNA具有编码天然发生的酶或毒素的DNA的序列，或其突变体，并且可以通过本领域公知的方法制备。制剂和施用肽和多肽，例如cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem肽和多肽，核酸和多核苷酸和激动剂和拮抗剂肽或小分子，可以与适合的药物运载体一同配制。这种制剂包含治疗有效量多肽或化合物，和药学上可接受的运载体或赋形剂。这种运载体包括但不限于，盐水、緩冲盐水、葡萄糖、水、甘油、乙醇和其组合。制剂应当适合于施用方式，并且是本领域技术人员能力范围内的。我们进一步描述了药物包装和试剂盒，其包含装有上述的组合物的一种或多种成分的一个或多个容器。所述多肽和其他化合物可以单独使用，或与其他化合物例如治疗化合物一同4吏用。药物组合物的全身性施用的优选的形式包括注射，一般为静脉内注射。可以使用其他注射途径，例如皮下的、肌肉内的或腹膜内的。全身性施用的可选择的方法包括经粘膜和经表皮施用，使用渗透剂例如胆汁盐或羧链孢酸或其他洗涤剂。此外，如果适当地配制在肠的或胶嚢的制剂中，口服施用也是可能的。这些化合物的施用也可以是局部的和/或局部化的，以药膏、膏剂、凝胶剂等等的形式。所需的剂量范围取决于肽的选择、给药途径、制剂的性质、受试者病症的性质和主治医师的判断。然而，适合的剂量在0.1-100吗/kg受试者的范围内。然而，考虑到可用化合物的种类和各种给药途径的不同效率，预料所需剂量存在很大变化。例如，预计口服施用比静脉内注射需要更高的剂量。这些剂量水平的变化可以使用本领域充分了解的经验性规则来调整以优化。用于治疗的肽也可以在以如上所述的常称为"基因治疗，，的治疗模式中在受试者中内源地产生。因而，例如，受试者的细胞可以用多核苷酸，例如DNA或RNA,加以工程化，来先体外后体内(exvivo)编码多肽，并且例如，通过使用逆转录病毒质粒载体。然后将细胞导入受试者中。药物组合物我们还提供了药物组合物，包括施用治疗有效量的多肽、多核苷酸、肽、载体或抗体(例如cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem多肽，等等)和任选的药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂(包括其组合)。所述药物组合物可以在人和兽医学中用于人类或动物使用，一般将包括任何一种或多种药学上可接受的稀释剂、运载体或赋形剂。用于治疗用途的可接受的运载体或稀释剂是药物领域公知的，在例如Remington'sPharmaceuticalSciences,MackPublishingCo.(A.R.Gennaroedit.1985)中描述了。药物运载体、赋形剂或稀释剂的选择也可以根据预定的施用途径和标准的药物实践来选择。药物组合物可以包含作为运载体、赋形剂或稀释剂的，或除运载体、赋形剂或稀释剂之外的任何适合的一种或多种粘合剂、一种或多种润滑剂、一种或多种悬浮剂、一种或多种包被剂、一种或多种增溶剂。可以在药物组合物中提供防腐剂、稳定剂、染料和甚至调味剂。防腐剂的实例包括苯曱酸钠、山梨酸和对羟基苯曱酸酯。还可以使用抗氧化剂和悬浮剂。取决于不同的递送系统存在着不同的组合物/制剂需求。举例来说，在作为用于吸入或可摄取溶液的鼻喷雾或气雾剂，或胃肠外地递送，其中组合物以可注射的形式配制，用于通过例如静脉内的、肌肉内的或皮下的途径来递送。做为选择，可以对制剂进行设计来通过两种途径递送。当试剂要通过胃肠粘膜来经粘膜递送时，在通过胃肠道转运期间它应当能保持稳定；例如，它应当对蛋白水解降解有抗性、在酸性pH下稳定并且对胆汁的去污剂作用有抗性。在合适时，可以通过吸入施用、以栓剂或阴道栓的形式施用、以洗液、溶液、乳膏剂、软膏剂或朴粉形式的局部施用、通过使用皮肤贴片施用、以含有赋形剂例如淀粉或乳糖的片剂形式口服施用、单独的或与赋形剂混合在胶嚢或嚢泡(ovule)中、或以含有增味剂或着色剂的酏剂、溶液或悬浮液的形式、或它们可以胃肠外注射，例如静脉内、肌内内或皮下注射。对于肠胃外施用，组合物可以最好以无菌水溶液的形式使用，其可以含有其他物质，例如足够的盐或单糖来使溶液与血液等渗。对于颊或舌下的施用，组合物可以以可按照常规的方式配制的片剂或锭剂的形式施用。疫苗另一个实施方式涉及在哺乳动物中诱导免疫反应的方法，其包括用cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽或其片段接种所述哺乳动物，其足以产生抗体和/或T细胞免疫反应来保护所述动物免于cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem相关的疾病。又一个实施方式涉及在哺乳动物中诱导免疫反应的方法，其包括经由指导cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多核苦酸的体内表达的载体来递送cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem多肽，以诱导这种免疫反应来产生抗体以保护所述动物免于疾病。进一步的实施方式涉及免疫的/疫苗制剂(组合物)，当被导入哺乳动物宿主时，其在该哺乳动物中诱导针对cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽的免疫学反应，其中所述组合物包含cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽或cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem基因。疫苗制剂可以进一步包含适合的运载体。由于cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgR叫uiem多肽可以在胃中被降解，优选的是胃肠外施用(包括皮下的、肌肉内的、静脉内的、皮内的注射等等)。适合于肠胃外施用的制剂包括含水和无水的无菌注射溶液，其可以含有抗氧化剂、緩沖液、抑菌剂和使得制剂与接受者的血液等渗的溶质；以及含水和无水的无菌悬浮液，其可以包括悬浮剂或增稠剂。制剂可以存在于单位剂量或多剂量容器中，例如，密封的安瓿瓶和小瓶，并可以保存在冻干的条件中，仅需要在使用前即时添加无菌的液体运载体。疫苗制剂还可以包括用于增强制剂的免疫原性的佐剂系统，例如水包油系统或本领域已知的其他系统。剂量将取决于疫苗的比活性，可以通过常规实验容易地确定。疫苗可以^v在此描述的一种或多种多肽或肽来制备。制备含有免疫原性的一种或多种多肽或肽作为一种或多种活性成分的疫苗是本领域技术人员已知的。一般地，这种疫苗被制备为作为液体溶液或悬浮液的注射剂；也可以制备适合于在注射之前溶解于或悬浮于液体的固体形式。制品也可以是乳化的，或是封装入脂质体中的蛋白质。活性免疫原性成分常常与药学上可接受的并且与活性成分相容的赋形剂混合。适合的赋形剂是，例如，水、盐水、葡萄糖、甘油、乙醇等等，和其组合。此外，如果希望，疫苗可以含有微量的辅助物质，例如湿润剂或乳化剂、pH值緩沖剂和/或增强疫苗的有效性的佐剂。可能有效的佐剂的实例包括但不限于氢氧化铝、N-乙酰-胞壁酰基-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰-正-胞壁酰基-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺(CGP11637,称为nor-MDP)、N-乙酰胞壁酰基-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺酰-L-丙氨酸-2-(r-2，-二棕榈酰基-sn-甘油基-3-羟基磷酰氧)-乙胺(CGP19835A，称为MTP-PE)、和RIBI,其含有在2。/。角鲨烯/Tween80乳剂中的从细菌提取的三种成分单磷酰基脂质A、海藻糖二霉菌酸酯和细胞壁骨架(MPL+TDM+CWS)。佐剂和其他试剂的进一步的实例包括氢氧化铝、磷酸铝、>琉酸铝钾(明矾)、硫酸铍、硅土、高岭土、碳、油包水乳剂、水包油乳剂、胞壁酰二肽、纟田菌内毒素、月旨质X、短小才奉状4干菌(Co^yweZ)acfen'MwparvMm)(4分刺丙酸菌(/Vo//owo6a"en^w))、百日咳牙干菌(5onie/e〃a)、多核糖核苷酸、海藻酸钠、羊毛脂、溶血卵磷脂、维生素A、鬼角苷、脂质体、左旋咪唑、DEAE-葡聚糖、嵌段共聚物或其他合成的佐剂。这些佐剂可以从各种来源商业上获得例如，MerckAdjuvant65(MerckandCompany,Inc.,Rahway,N丄)，或弗氏不完全佐剂和完全佐剂(DifcoLaboratories,Detroit,Michigan)。一般地，使用佐剂例如Amphigen(水包油)、Alhydrogel(氢氧化铝)或Amphigen和Alhydrogel的混合物。仅仅氢氧化铝被批准用于人类。免疫原和佐剂的比例可以在宽的范围上变化，只要两者都以有效量存在。例如，氢氧化铝可以以疫苗混合物的约0.5%的数量存在(八1203基础)。方便地，配制疫苗来含有范围从0.2到200吗/ml、优选的5到50(xg/ml、最优选的15吗/ml的免疫原终浓度。在制剂之后，疫苗可以被掺入无菌容器，其然后被密封并保存在低温，例如4。C，或它可以被冻干。冻干法允许以稳定的形式长期保存。疫苗通过注射，例如皮下地或肌内地，常规胃肠外施用。适合于其他施用方式的另外的制剂包括栓剂，和在某些情况下，口服制剂。对于栓剂，传统的粘合剂和运载体可以包括，例如，聚亚烷基二醇或甘油三酯；这些栓剂可以由含有范围为0.5%到10%、优选的1%到2%的活性成分的混合物形成。口服制剂可以包括通常釆用的赋形剂，例如药物级别的甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、纤维素、碳酸镁等等。这些组合物采取溶液、悬浮液、片剂、药丸、胶嚢、緩释制剂或粉未的形式，并含有10%到95%、优选25%到70%的活性成分。当疫苗组合物是冻干的时，可以例如作为悬浮液在施用之前重构冻干的材料。重构优选的在緩沖液中进行。用于给患者口服施用的胶嚢、片剂和丸剂可以具有肠溶包衣，其包含，例如，Eudragit"S"、Eudragit"L"、醋酸纤维素、苯二曱酸醋酸纤维素或羟基丙基曱基纤维素。在此描述的多肽可以以中性或盐形式被配制为疫苗。药学上可接受的盐包括酸加成盐(由肽的游离氨基形成)，其由无机酸例如盐酸或磷酸，或这样的有机酸例如乙酸、草酸、酒石酸和马来酸形成。与游离羧基形成的盐也可以来自无机碱，例如，钠、钾、铵、钙或铁的氢氧物，和这样的有机碱如异丙胺、三曱胺、2-乙胺乙醇、组氨酸和普鲁卡因。施用一般地，医师将决定最适合于个体受试者的实际剂量，它将随特定患者的年龄、体重和反应变化。以下的剂量是平均情况的示范。当然，也可以有单独的例子，其中更高的或更低的剂量范围是有益的。在此公开的药物和疫苗组合物可以通过直接注射施用。组合物可以配制用于胃肠外、粘膜、肌肉内、静脉内、皮下、眼内或经表皮施用。一般地，每种蛋白质可以以0.01到30mg/kg体重、优选的0.1到10mg/kg、最优选的0.1到1mg/kg体重的剂量施用。术语"施用"包括通过病毒或非病毒技术的递送。病毒递送机制包括但不限于腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、疱渗病毒载体、逆转录病毒载体、慢病毒载体和杆状病毒载体。非病毒的递送机制包括脂质介导的转染、脂质体、免疫脂质体、lipofectin、阳离子表面的两亲化合物(cationicfacialamphiphile)(CFA)和其组合。这种给药机制的途径包括但不限于粘膜的、鼻的、口服、胃肠外的、胃肠的、局部的或舌下的途径。术语"施用的"包括但不限于通过粘膜途径的递送，例如，作为用于吸入的鼻部喷雾或气雾剂，或作为可摄取的溶液；胃肠外的途径，其中递送通过可注射的形式，例如，静脉内的、肌肉内的或皮下的途径。术语"共施用"是指每种例如多肽和其他的实体如佐剂的能实现免疫系统的必要的调节的施用部位和时间。因此，虽然多肽和佐剂可以乂人时间上在同一时刻并在相同部位施用，在与佐剂不同的时间和不同的部位使用多肽也可能是有益的。多肽和佐剂甚至可以在相同的运载工具中递送，多肽和抗原可以是偶联的和/或不偶联的和/或遗传上偶联的和/或不偶联的。cgFAIM、cgFADD、cgPDCD6和/或cgRequiem多肽、多核苷酸、肽、核苦酸、抗体等等和任选的佐剂，可以作为单剂或多剂独立地施用或共同施用给宿主受试者。在此描述的疫苗组合物和药物组合物可以通过许多不同的途径，例如注射(包括胃肠外的、皮下的和肌肉注射)、鼻内的、粘膜的、口服的、阴道内的、尿道的或眼睛的施用。在此描述的疫苗和药物组合物可以常规地胃肠外施用，通过注射，例如皮下或肌内注射。适合于其他施用方式的另外的制剂包括栓剂，和在某些情况下，口服制剂。对于栓剂，传统的粘合剂和运栽体可以包括，例如，聚亚烷基二醇或甘油三酯；这样的栓剂可以由含有范围为0.5%到10%、可以是1%到2%的活性成分的混合物形成。口服制剂可以包括通常采用的赋形剂，例如药物级别的甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、纤维素、碳酸镁等等。这些组合物采取溶液、悬浮液、片剂、丸剂、胶嚢、緩释制剂或粉末的形式，并含有10%到95%、优选25%到70%的活性成分。当疫苗组合物是冻干的时，可以例如，作为悬浮液在施用之前重构冻干的材料。重构优选的在緩冲液中进行。实施例实施例1.细胞系与细胞培养物CHOIFN-y是适应于在悬浮液中生长的中国仓鼠卵巢细胞系。它最初来源于二氢叶酸还原酶阴性(DHFR-)、Dukx细胞(Urlaub&Chasin1980)。CHOIFN-y已用DHFR和人类干扰素-y的基因共转染(ScahillWa/.1983)。CHOIFN-y^皮维持在补充有4mM谷氨酰胺、20mM葡萄糖和0.25|iM氨曱蝶呤(Sigma,St.Louis,MO)的无葡萄糖/谷氨酰胺的HyQCHOMPS培养基(Hyclone，Logan,UT)中。实施例2.总RNA提取与第一链cDNA合成使用Trizol(Invitrogen)从CHOKl细胞提取总RNA。所有逆转录试剂来自Promega。在含有lx逆转录緩冲液、10mM每种dNTP和25单位的重组RNAsh^核糖核酸酶抑制物的反应混合物中，使用莫洛尼鼠白血病病毒(MoloneyMurineLeukaemiaVirus)逆專争录酶以42°C、1小时合成全长cDNA。实施例3.基因特异性PCR从CHOKl总RNA制备的cDNA用作基因特异性PCR的模板。所有PCR试剂来自Promega。实施例4.中国仓鼠FAIM的基因特异性克隆使用5TCR引物5'陽GCCGCGAGAGCTGCTGACTACGTCGTGG-3，和3'PCR引物5'-GTTACTGTG-GTGAGATATGAATGGGTTTGG-3，扩增FAIM的编码区。PCR反应混合物含有l|iLcDNA模板，lx反应缓沖液，200pM每种dNTP、2.0mMMgCl2、lpM每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。PCR条件是94°C5分钟，随后进行31个94。C1分钟、58°C1分钟和72。C2分钟的循环，最终在72。C延伸10分钟。然后将PCR产物亚克隆到pCR-TOPO(Invitrogen,GrandIsland,NY)中用于测序。cgFAIM的序列在SEQIDNO:1和SEQIDNO:5中列出。中国仓鼠序列编码179个氨基酸的蛋白质。也称为CD95或APO-l的Fas是来自在受体介导的凋亡途径中起重要作用的肺瘤坏死因子(TNF)受体家族的受体。TNF受体家族的细胞外区域具有2-6个富含半胱氨酸的亚结构域的重复。Fas活化通过胱天蛋白酶8的寡聚反应启动细胞内信号转导级联。胱天蛋白酶8已经显示是负责效应物胱天蛋白酶的级联样活化的起始胱天蛋白酶之一(Srinivasula"a/.1996)。Fas还显示促使线粒体细胞色素C释放，其引起胱天蛋白酶9和其他效应物胱天蛋白酶的活化(Li"a/.1997)。已经发现Fas凋亡抑制分子(FasapoptosisinhibitorymoleculeXFAIM)是可以赋予对Fas诱导的凋亡的抗性的可诱导蛋白质(Schneideretal.1999;Rothsteinetal.2000)。已经显示FAIM在B细胞中的表达与slg信号一起能够阻断Fas杀伤，并且这是通过阻断Fas信号转导途径中胱天蛋白酶3活化之前的步骤来完成的(Schneideretal.1999)。已经显示了FAIM存在两种可选择的剪接形式，其中FAIM-S广泛地表达，而FAIM-L是脑组织特异性的(Zhong"a/，2001)。FAIM序列看来在不同物种中也是高度保守的，表明了重要的系统发育作用。实施例5.中国仓鼠FADD的基因特异性克隆使用5'PCR引物5'-CCATGGACCCATTCCTGGTGC-3，和3'PCR引物5，-TTCTTCCACCAGGTCAGC-CACC-3，扩增FADD的部分编码区。PCR反应混合物含有l)iLcDNA模板，lx反应緩沖液，200pM每种dNTP、1.5mMMgCl2、l)iM每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。PCR条件是94°C5分钟，随后进行31个94°C1分钟、55°C1分钟和72。C2分钟的循环，最终在72。C延伸10分钟。然后将PCR产物亚克隆到pCR-TOPO(Invitrogen，GrandIsland,NY)中用于测序。cgFADD的序列在SEQIDNO:2和SEQIDNO:6中列出。FADD是CD95(Fas/APO-1)和肿瘤坏死因子(TNF)受体诱导的凋亡的共同介导者(Chinnaiyane/a/1996)。含有死亡和死亡效应物结构域的FADD是Fas参加后胱天蛋白酶8活化的重要介导者(Chinnaiyan"a/.1995)。我们描述了通过使用人工工程化的FADD分子——仅含有FADD的凋亡受体结合死亡结构域、而不含死亡效应物结构域的FADDDN，而对cgFADD表达所进行的调节。效应物结构域通过募集胱天蛋白酶到诱导死亡的信号转导复合物来引起更下游的凋亡级联的活化。在此描述的方法允许过量表达工程化形式的FADD——即显性失活，以及这种工程化的分子通过与天然FADD竟争、并因而中断凋亡级联在防止胱天蛋白酶募集中的用途。实施例6.中国仓鼠PDCD6的基因特异性克隆使用5'PCR引物5，-GCCCATGGCTGCCTACTCCTA-3，和3，PCR引物5，-AATCCAGCCATCCTGAT-CCGT-3，扩增PDCD6的部分编码区。PCR反应混合物含有lpLcDNA模板，lx反应缓冲液，200^iM每种dNTP、1.5mMMgCl2、1pM每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。PCR条件是94°C5分钟，随后进行31个94°C1分钟、52°C1分钟和72。C2分钟的循环，最终在72。C延伸IO分钟。然后将PCR产物亚克隆到pCR-TOPO(Invitrogen,GrandIsland,NY)中用于测序。纯化获得的PCR产物并克隆到pCR2.1-Topo载体中并测序。3，-RACE引物是5，-CAGCGGGTTGATAAAGACAGGAGTGGAGTG-3，。通过在含有溴化乙锭的1%琼脂糖凝胶中电泳来分离3'-RACEPCR产物，切除相关的条带并使用Qiagen试剂盒提取凝胶，之后克隆到pCR-TOPO(Invitrogen,GrandIsland,NY)中用于测序。cgPDCD6的序列在SEQIDNO:3和SEQIDNO:7中列出。中国仓鼠序列编码191个氨基酸的蛋白质。PDCD6也称为凋亡连锁基因2(apoptosis-linkedgene2)(ALG-2)，其编码属于panta-EF-hand蛋白质家族的钙结合蛋白质。有迹象表明它参与受体、Fas和糖皮质激素诱导的凋亡(Vitoo/.1996;Krebs&Klemenz,2000andJungWa/.,2001)。有趣的是，Jangetal.2002证明了ALG-2缺乏不引起TCR、FAS或地塞米松信号转导诱导的凋亡的阻断。实施例7.中国仓鼠Requiem的基因特异性克隆使用5TCR引物5'陽ATG誦GCGGCTGTGGTGGAGAAT-3，和3'PCR引物5，-GGAGTTCTGGTTCTGGTAG-ATGG-3，扩增Requiem的部分编码区。PCR反应混合物含有1(iLcDNA模板，1x反应緩沖液，200pM每种dNTP、2.0mMMgCl2、1每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。PCR条件是94°C5分钟，随后进行60个94°C1分钟、44°C1分钟和72。C2分钟的循环，最终在72。C延伸IO分钟。然后将PCR产物亚克隆到pCR⑧-TOPO⑧(Invitrogen,GrandIsland,NY)中用于测序。纯化获得的PCR产物并克隆到pCR2.1-T叩o载体中并测序。3，-RACE引物是5，-GCCTCAGTTACCACTATGCCCATTCCCACC-3，。通过在含有溴化乙锭的1%琼脂糖凝胶中电泳来分离3'-RACEPCR产物，切除相关的条带并使用Qiagen试剂盒提取凝胶，之后克隆到pCR-TOPO(Invitrogen,GrandIsland,NY)中用于测序。房含Jtie(^emfcg^e《w/e附jcgRequiem的序列在SEQIDNO:4和SEQIDNO:8中列出。中国仓鼠序列编码391个氨基酸的蛋白质。Requiem也称为ubi-d4,是髓样细胞中胱天蛋白酶的活化所必需的锌指基因(Gabig"a/.1994)。已提示Requiem很可能编码存活因子(survivalfactor)撤退后凋亡应答所需的转录因子(Gabigetal.1994)。此外，Gabigetal.(1998)后来在鼠髓样细胞和人类K562白血病细胞的细胞质和核亚细胞部分中检测到了该蛋白质，从而表明该蛋白质可能具有不同于转录因子的功能。实施例8.中国仓鼠FAIM表达载体构建概括地说，被克隆到pCR-TOPO(Invitrogen,GrandIsland,NY)中(+)(Invitrogen)中并再次测序。然后4吏用MaxiPlasmidPurificationKit(Qiagen，Hilden,Germany)纯化最终的质粒pcDNA3,1(+)FAIM,对其浓度进行定量，用于向CHOIFN-y中转染。详细地，通过使用5，-PCR引物5，陽GAATTCGCC4CCATGACAGATCTTGTAGC-3，和3，-PCR引物5，-GAATTCGTGAACACATTTAATTACCA-3，来创建具有人工kozak序列和接头区域的cgFAIM。下划线的序列由EcoRI限制性位点组成，而斜体的序列由人工kozak组成，以便于FAIM的"读码框内，，表达。cgFAIM的掺入区域是粗体的。PCR反应混合物含有1pCR2.1-TOPOcgFAIM模板，1x反应緩沖液，200|iM每种dNTP、2.0mMMgCl2、l(iM每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。PCR条件是94°C5分钟，随后进行60个94°C1分钟、44°C1分钟和72°C2分钟的循环，最终在72。C延伸10分钟。然后在37。C用EcoRI限制性内切酶消化"i正实的PCR产物大约4小时来产生具有用于进一步连接的粘性末端的cgFAIM插入物。空白pcDNA3.1(+)载体(Invitrogen)则在37。C用EcoRI限制性内切酶消化大约4小时。然后通过添加12的插入物到3载体、2|jL无Dnase的水、210xT4DNA连接酶缓冲液(Invitrogen)和1T4DNA连接酶(3U/|liLXInvitrogen)中，将EcoRI消化的cgFAIM插入物连接到EcoRI消化的pcDNA3.1(+)中。然后在室温下孵育此连接混合物大约16小时。然后将10连接混合物转化到感受态DH5a细菌细胞中用于质粒增殖。通过在具有用于选择的氨千青霉素的LB琼脂平板上培养，选择阳性转化体。然后对各个DH5a克隆进行质粒提取，用于测序来证实插入到pcDNA3.1(+)表达载体中的cgFAIM序列。然后使用MaxiPlasmidPurificationKit(Qiagen，Hilden，Germany)纯化来自证实的克隆的质粒pcDNA3.1(+)cgFAIM,测定它的浓度用于向CHOIFN-y中转染。实施例9.中国仓鼠FADD显性阴性表达载体构建通过使用5，-PCR引物5'-GATATCGGATCCGCC4CC"rGGCCTTTGACATTGTATGCGACAATGTGGGG-3，和3，-PCR引物5-CCCGGG-CTCGAGTGCCTCCC-TTCCACCAGGTCAG-3，来创建具有kozak序列的FADD显性阴性(FADDdominantnegative)(FADDDN)片段。下划线的序列分别由BamHI和Xhol限制性位点组成，而斜体序列由人工kozak和起始密码子组成，以便于cgFADD显性阴性的"读码框内，，表达。掺入的cgFADD的编码区域是粗体的。PCR反应混合物含有1cDNA模板，1x反应緩冲液，200pM每种dNTP、1.5mMMgCl2、l(aM每种引物和TaqDNA聚合酶混合物(总共5U)。亚克隆到pCI^-TOPO㊣中的部分FADD序列被用作模板。PCR条件是94°C5分钟，随后进行31个94°C1分钟、50°C1分钟和72°C2分钟的循环，最终在72'C延伸10分钟。然后在37。C用BamHI和Xhol限制性内切酶.消化证实的PCR产物大约4小时来产生具有用于进一步连接的粘性末端的cgFADDDN插入物。空白pcDNA3.1(+)载体(Invitrogen)则在37。C用BamHI和Xhol限制性内切酶消化大约4小时。然后通过添加12pL的插入物到3fiL载体、2pL无Dnase的水、2|iL10xT4DNA连接酶緩沖液(Invitrogen)和1pLT4DNA连接酶(3U/|iL)(Invitrogen)中，将BamHI/XhoI消化的cgFADDDN插入物连接到BamHI/XhoI消化的pcDNA3.1(+)中。然后在室温下孵育此连接混合物大约16小时。然后将10连接混合物转化到感受态DH5a细菌细胞中用于质粒增殖。通过在具有用于选择的氨千青霉素的LB琼脂平板上培养，选择阳性转化体。然后对各个DH5a克隆进行质粒提取，用于测序来证实插入到pcDNA3.1(+)表达载体中的cgFADDDN序列。然后使用MaxiPlasmidPurificationKit(Qiagen，Hilden,Germany)纯化来自证实的克隆的质粒pcDNA3.1(+)FADD显性阴性，测定它的浓度用于向CHOIFN-y中转染。实施例10.中国仓鼠PDCD6抑制载体构建根据获得的cgPDCD6序列设计寡聚插入物。使用BLAST将寡聚插入物设计与基因组数据库比较来消除与其他基因的任何显著的同源性。5，寡聚插入物5'-GATCCCGTGAGCTTCAGCAAGCATTATTCAAGAGATAATGCTTGCTGAAGC-TCATTTTTTGGAAA-3'与合成的3，寡聚插入物TGCTTGCTGAAGCTCACG-3'退火，然后连接到Hindlll/Bglll消化的pSUPER.neo载体(OligoEngine，Seattle,WA)中。将4|iL退火的寡聚插入物添加到3(iLHindlll/Bglll消化的pSUPER.neo、13无Dnase的水、2juL10xT4DNA连接酶緩沖液(Invitrogen)和1jiLT4DNA连接酶(3U/(aL)(Invitrogen)中。然后在室温下孵育此连接混合物大约16小时。然后将10pL连接混合物转化到感受态DH5a细菌细胞中用于质粒增殖。通过在具有用于选择的氨千青霉素的LB琼脂平板上培养，选择阳性转化体。然后对各个DH5a克隆进行质粒提取，用于测序来证实插入到pSUPER.neo表达载体中的cgPDCD6siRNA序列。然后使用MaxiPlasmidPurificationKit(Qiagen,Hilden，Germany)纯化来自证实的克隆的质粒pSUPER.neocgPDCD6siRNA，测定它的浓度用于向CHOIFN^中转染。实施例11.中国仓鼠Requiem抑制载体构建根据获得的cgRequiem序列设计寡聚插入物。5'寡聚插入物5ATCCGC-TTTTTTGGAAA-3'与3，寡聚插入物AGGTTCAAGGATCCGCGG-3'退火，然后连接到HindIII和BglII消化的pSUPER.neo载体(OligoEngine,Seattle,WA)中。将4(iL退火的寡聚插入物添加到3jiLHindlll/Bglll消化的pSUPER.neo、13|iL无Dnase的水、210xT4DNA连接酶緩冲液(Invitrogen)和1T4DNA连接酶(3U/pL)(Invitrogen)中。然后在室温下孵育此连接混合物大约16小时。然后将10连接混合物转化到感受态DH5cc细菌细胞中用于质粒增殖。通过在具有用于选择的氨千青霉素的LB琼脂平板上培养，选择阳性转化体。然后对各个DH5a克隆进行质粒提取，用于测序来证实插入到pSUPER.neo表达载体中的cgRequiemsiRNA序列。然后使用MaxiPlasmidPurificationKit(Qiagen，Hilden，Germany)纯化来自证实的克隆的质粒pSUPER.neocgRequiemsiRNA，测定它的浓度用于向CHOIFN-y中转染。实施例12.转染与选择寸吏用Lipofectamine试剂(Invitrogen)进4亍转染。以每孔50万个细月包在6孔平板中使细胞生长过夜，次日每孔用大约1(ig线性化的质粒转染。才艮据厂家的说明书以Lipofectamine(|iL)与DNA(吗)的比例为3:1制备Lipofectamine-DNA复合物。为了产生稳定的细胞，使细胞生长24小时，之后将培养基转换为含有1000吗/mL遗传霉素的选择培养基。将细胞维持在选择培养基中4周，其中未转染的细胞在选择培养基中于一周内死亡。实施例12A.稳定整合的单细胞克隆通过将细胞连续稀释到96孔平板中使得在每个孔中仅有一个细胞，获得稳定整合的单细胞克隆。在光学显微镜下检查加样孔，标出仅含单个细胞的那些孔。然后将单个克隆扩展入24孔板中，随后是6孔板，之后进入摇瓶培养。实施例12B.分批培养和补料分批培养在5.0L生物反应器(B.Braim，Melsungen,Germany)中以2.5x105细胞/mL的接种密度来接种4.0L初始工作体积的培养基。使用补充有20mM葡萄糖和4mM谷氨酰胺的无葡萄糖/谷氨酰胺的HyQCHOMPS培养基(Hyclone,Logan，UT)进行分批培养，而补料分批培养补充有4mM葡萄糖和0.5mM谷氨酰胺。溶解的氧气浓度维持在50%空气饱和度，通过间歇性将C02添加到气体混合物中和/或使用7.5%(w/v)NaHC03溶液(Sigma),将培养物pH维持在7.15。使用改良的在线动态补料策略进行补料分批操作(Leee/a/.，2003)。每1.5小时使用自动化的无菌在线进样环管进行相关的受控营养物水平的浓度在线监视。用于补料分批培养的基础进料培养基(basalfeedmedia)用定制的含lx盐(Hyclone)的10x无钙、无葡萄糖和无谷氨酰胺的DMEM/F12制备，补充有10g/L大豆蛋白质水解产物、Hysoy(QuestInternational,HoffmanEstate,IL)、10mL/L化学限定的脂质(chemicallydefinedlipids)(GibcoBRL,GrandIsland,NY)、lmg/Ld-生物素(Sigma)、2mML-天冬氨酸、2mML-天冬酰胺、4mML-半胱氨酸、ImML-谷氨酸、lmML-曱硫氨酸和5mML-丝氨酸(Sigma)。基础进料培养基进一步补充有100mM谷氨酰胺(Sigma)和500mM葡萄糖(Sigma)。每1.5小时，进行残余谷氨酰胺浓度的自动化在线测量。如果残余谷氨酰胺浓度低于设定点控制浓度，用进料培养基进行进料注射，来提高培养物谷氨酰胺浓度到0.3mM。实施例13.使用实时PCR的基因表达定量从稳定的细胞收集大约IOOO万个细胞，使用TrizolTM试剂(Invitrogen)提取总RNA。然后使用GeneQuantProRNA/DNACalculator(AmershamBiosciences,Piscataway，NJ)定量RNA样品。4吏用260nm比280nm的吸光度比值来评定RNA质量，比例1.8和以上被认为是足够纯的RNA样品。使用定量实时PCR来确定转染实验之后的目标基因相对过量表达或抑制。为了产生转录物拷贝的标准曲线，连续稀释含有FAIM、FADD、PDCD6或Requiem的定量的pCR-TOPO(Invitrogen)质粒，并用于定量实时PCR。使用5，引物5，-TGGAGCTGCGAAAACCAAAG-3，和3，引物5'-AAACTCGCCTGCTGTCTCCAT-3，进行FAIM转录物的定量实时PCR。使用5，引物5'-GATATCGGATCCGCCACCATGG-3，和3，引物5'-TGCCTCCCTTCCACCAG-GTCAG-3，进行FADD显性阴性转录物的定量实时PCR。使用5'引物5'-CAGCGGGTTGATAAAGACAGG-3，和3'引物5，-GCCAGCCTTG-TTTTCTCGG-3，进行PDCD6转录物的定量实时PCR。使用5，引物5'-TGGAGTAGCCCAGAGCAATTG-3，和3，引物5'-TCGACGCTTTTTACGCCAG-3，进行Requiem转录产物的定量实时PCR。然后针对(3-肌动蛋白转录物的表达将每个样品标准化。使用5，引物5，-AGCTGAGAGGGAAATTGTGCG-3'和3'引物5'-GCAACGG-AACCGCTCATT-3，进行|3-肌动蛋白转录物的定量实时PCR。最后，转染的细胞中标准化的定量基因表达除以空载体转染的细胞中标准化的定量基因表达来得出标准化的相对基因表达。实施例14.凋亡分析使用溴化乙锭/吖啶橙分析将收集的样品中的细胞分类为凋亡的或非凋亡的群体。在PBS溶液(Sigma)中制备100[ig/mL的溴化乙锭(Sigma)和吖啶橙(Sigma)的贮存液。从样品中取样约&106个细胞，在100(iL的1:1溴化乙锭:吖咬橙贮存液中重悬浮，在室温下孵育5分钟。然后将样品加载到玻璃载玻片上，在荧光显微镜下检查大约400个细胞。然后具有核凝缩的凋亡形态学的细胞被相应地分类。除了形态学分析之外，才艮据厂家的方案使用BDApoAlertCaspaseAssayPlates(BDBiosciencesClontech，CA)测量胱天蛋白酶2、3、8和9的活性。胱天蛋白酶的活化被认为是凋亡的生物化学标志。实施例15.IFN-y定量-使用酶联免疫吸附(ELISA)分析(HyCultBiotechnology,Uden，Netherlands)来分析连续稀释的上清液样品的IFN-y浓度。在高生存力(>95%)期间和在低生存力(70-80%)期间具有最高IFN-Y浓度的样品被送去进行免疫亲和纯化和进一步的N-糖基化表征。实施例16.实时PCR用于基因表达检测为了确定目标基因在细胞中的表达，进行定量实时PCR。实时PCR被认为是检测转录物水平的敏感方法。基因表达分析显示用pcDNA3.1(+)Faim转染的细胞过量表达FAIM比用pcDNA3.1(+)空白转染细胞多三倍(附图1)。用pcDNA3.1(+)FADD显性阴性转染的细胞过量表达FADD显性阴性高达4倍(附图1)。附图1中数据还显示可以有效地使用siRNA抑制基因表达。用pSUPERPDCD6siRNA转染引起PDCD6表达被抑制大约60%,而pSUPERR叫uiemsiRNA能够抑制Requiem表达高达70%(附图1)。实施例17.扭向中国仓鼠FAIM基因赋予的凋亡抗性用FAIM表达载体(实施例8)和作为对照的空白载体来转染细胞，分析对凋亡的抗性。与仅用空白载体转染的细胞相比，过量表达FAIM的细胞能够将高存活细胞密度维持更长时间(附图2A)。FAIM过量表达的细胞还显示了生存力在开始降至低于95%之前，被显著延长至少24小时(附图2B)。凋亡细胞的百分比也显著^f氐于没有FAIM过量表达的对照细胞(附图2D)。与对照细胞相比，胱天蛋白酶2和3活性的提高也延迟了大约24小时(附图6B)。这显示了FAIM过量表达可以在抑制细胞培养过程中的凋亡中非常有效。实施例18.靶向中国仓鼠FADD基因赋予的凋亡抗性用FADD表达载体(实施例9)和作为对照的空白载体来转染细胞，并分析对凋亡的抗性。与仅用空白载体转染的细胞相比，过量表达FADD显性阴性的细胞能够将高存活细胞密度维持更长时间(附图3A)。FADD显性阴性过量表达的细胞还显示在生存力开始降至低于95%之前生存力显著延长约24小时(附图3B)。凋亡细胞的百分比也显著低于没有FADD过量表达的对照细胞(附图3D)。胱天蛋白酶2、3和8的活性的提高也显著地延迟(附图6C)。数据显示培养物中的胱天蛋白酶2和8活性仅在144小时后提高，而胱天蛋白酶3活性的提高被显著地抑制。这显示了輩巴向FADD信号转导有效抑制细胞培养过程中的凋亡。实施例19.革巴向中国仓鼠PDCD6基因赋予的凋亡抗性用PDCD6表达载体(实施例IO)和作为对照的空白载体来转染细胞，并分析对凋亡的抗性。与仅用空白siRNA载体转染的细胞相比，具有PDCD6抑制的细胞能够将高存活细胞密度维持更长时间(附图4A)。具有PDCD6抑制的细胞还显示生存力丧失率显著下降(附图4B)。凋亡细胞的百分比也显著低于没有PDCD6抑制的对照细胞(附图4D)。胱天蛋白酶2、3、8和9活性的提高也显著地延迟(附图6D)。数据显示培养物中胱天蛋白酶2、3和8活性仅在144小时后提高，而胱天蛋白酶9活性总是低于参考点。这显示靶向PDCD6信号转导可以有效抑制细胞培养过程中的凋亡。实施例20.靶向中国仓鼠Requiem基因赋予的凋亡抗性用Requiem表达载体(实施例11)和作为对照的空白载体来转染细胞，并分析对凋亡的抗性。与仅用空白siRNA载体转染的细胞相比，具有Requiem抑制的细胞能够将更高的存活细胞密度维持更长时间(附图5A)。具有Requiem抑制的细胞还显示了生存力丧失率显著下降(附图5B)。凋亡细胞的百分比也显著低于没有Requiem抑制的对照细胞(附图5D)。胱天蛋白酶2、3和9的活性的提高也显著地延迟(附图6E)。数据显示了胱天蛋白酶活性显著地低于对照的活性。这显示靶向Requiem信号转导可以有效抑制细胞培养过程中的凋亡。实施例21.重组蛋白质产量的改善附图7显示了基因耙向就最终产物产量而言改善了细胞培养过程。与对照细胞中所见的典型的2.3mg/L产量相比，FAIM过量表达的细胞使得干扰素Y产量高达3.3mg/L(附图7A)。靶向FADD信号转导甚至使得干扰素Y产量达5.0mg/L，呈现出超过200%的提高(附图7B)。PDCD6和Requiem的抑制分别使得干扰素y产量改善到4.2和5.8mg/L。工程化的细胞对凋亡诱导的耐性(robustness)提高，伴随最终重组蛋白质产量的有效提高，表明FADD、FAIM、PDCD6和Requiem的基因靶向是用于改善细胞培养系统中生物治疗剂产量的有效的新策略。实施例22.在补料分批培养中除生存力增强之外存活培养物密度的提高进行实验来确定在不同的分批和补料分批应激/营养物环境下工程化的凋亡抗性细胞系进行补料分批培养的能力。附图8A显示了具有Requiem或PDCD6抑制的稳定整合的CHOIFN-y细胞系的存活细胞密度。PDCD6和Requiem抑制使得在补料分批培养期间活细胞密度的显著提高。与在没有任何凋亡靶向的细胞中一般所见到的5x106个细胞/mL相比，可以达到高达9x106个细胞/mL的存活细胞密度。用显示FADDDN或FAIM过量表达的稳定整合的CHOIFN-y细胞系重复实验，观察到相似的结果。这证明了，通过Requiem或PDCD6抑制或者FAIM和FADDDN过量表达所进行的凋亡抗性工程化不仅使得培养物生存力延长，而且由于它们针对抑制细胞生长的一种或多种因子的耐性，赋予了生长至高得多的存活细胞密度的能力。实施例23.在补料分批培养中提高的重组蛋白质产量附图9A显示了基因靶向使得干扰素y生产和产量进一步显著改善。与在标准补料分批培养中所见的一般20昭/mL相比，具有稳定抑制的R叫uiem或PDCD6的细胞分别得到高达49和41jig/mL的干扰素y产量。这代表重组蛋白质产量的改善大于200%。用过量表达FAIM的细胞重复该实验，看到了相似的结果。实施例24.在修饰的CHO细胞系中重组人类IFN-y的唾液酸化作用提高-唾液酸含量分析如上所述从亲本CHO细胞系产生表达IFN-y的修饰的CHO细胞系。从指数生长中期收集的样品中和在当高生存力(>95%)期间和在低生存力(70-80%)期间检测到最高IFN-y浓度时收集的样品中纯化重组IFN-y。然后使用如Wong"a/.(2005a),肠/ec/z"。/5/固g89:164-177中描迷的改良的石克代巴比妥酸分析来测定IFN-y的唾液酸含量。实施例25.在修饰的CHO细胞系中重组人类IFN-y的增强的唾液酸化作用一_结果附图10显示了对修饰的CHOIFN-y细胞系和亲本CHOIFN-丫细胞系而言，在补料分批培养期间三个时间点，即指数中期(>95%生存力)、稳定期(>95%生存力)和死亡期(70-80%生存力)，收获的重组人类IFN-y的唾液酸化作用。对于后者，随着培养物从指数中期(2.9molSA/molIFN-y)进展到稳定期(2.3molSA/molIFN-y)再到死亡期(2.1molSA/molIFN-y),重组人类IFN-y的唾液酸含量降低。相比之下，对于四个修饰的CHOIFN-y细胞系而言，在三个时间点收获的IFN-y的唾液酸含量被维持，甚至显示了唾液酸化作用的提高，范围为2.7-3.5molSA/molIFNj。这些结果显示了凋亡抗性CHO细胞的另一种潜在益处是在延长的培养时间中维持/增强蛋白质糖基化质量，尽管存在培养物生存力损失(70-80%)。对于用来制造生物治疗剂的细胞系来说这是明显的益处，因为较低的唾液酸化作用程度可以降低基于蛋白质的药物的体内半衰期(Varki，1993,肠&c/wo/万/固g43:423-428;Gramerda/"1995，G/戶6油gy3:97-130)。参考文献AltschulSF,ThomasLM,AlejandroAS,JinghuiZ,ZhengZ，WebbM,andDavidJL(1997)GappedBLASTandPSI-BLAST:anewgenerationofproteindatabasesearchprograms.vVwc/e/c^c油25:3389-3402.Chestkov,A.V.，Baka,I.D.,Kost，M.V.，Georgiev,G.P.,Buchman,V.L.(1996)Thed4genefamilyinthehumangenome.Gew函/cs36:174-177ChinnaiyanAM,O'RourkeK,TewariMandDixitVM.(1995)FADD，anoveldeathdomain-containingprotein,interactswiththedeathdomainofFasandinitiatesapoptosis.Ce〃'May81(4):505-12Chi腿iyanAM，TepperCG，SeldinMF,O'RourkeK,KischkelFC，HellbardtS,KrammerPH,PeterME，andDixitVM.(1996)FADD/MORTlisacommonmediatorofCD95(Fas/APO-1andTNFreceptor-inducedapoptosis.77zeJowma/C/zem^^y.271(9):4961-4965CohenGM(1997)Caspases:theexecutionersofapoptosis.5/oc/2渭■/326:1-16FusseneggerM.,FassnachtD.，SchwartzR.，ZanghiJ.A.，GrafM.，BaileyJ.E.andPortnerR.(2000)Regulatedover-expressionofthesurvivalfactorbcl-2inCHOcellsincreasesviablecelldensityinbatchcultureanddecreaseDNAreleaseinextendedfixed-bedcultivation.Qvtofec/wo/ogy32:45-61GabigTG，MantelPL,RosliRandCreanCD.(1994)Requiem:anovelzincfingergeneessentialforapoptosisinmyeloidcells./5/o/.CTem.269(47):29515-9Gabig，T.G.，Crean,C,D.,Klenk,A.,Long,H,Copeland，N.G.，Gilbert,D.J.，Jenkins,N.A"Quincey,D.，Parente，F.,Lespinasse,F"Carle，G.F.,Gaudray，P.，a/,(1998)ExpressionandchromosomallocalizationoftheRequiemgene.Mamma/fawGe"o膨9:660-665GoswamiJ.，SinskeyA丄,StellerH.，StephanopoulosandWangDIC.(1999)ApoptosisinbatchculturesofChinesehamsterovarycells.所o/ec/"o/5/麵g,62:632-640GramerMJ,GoocheeCF.1994.Glycosidaseactivitiesofthe293andNSOcelllinesandofanantibody-producinghybridomacellline.BiotechnolBioeng43:423-428HuY,BenedictMA,DingLandNunezG(1999)RoleofcytochromecanddATP/ATPhydrolysisinAPAF-lmediatedcaspase-9activationandapoptosis.五MBOJ.18:3586-3595Jang,I.K.，Hu,R.,Lacana,E.，D'Adamio，L.，Gu,H.(2002)Apoptosis-linkedgene2-deficientmiceexhibitnormalT-celldevelopmentandfunction,Mo/ec.Ce〃.肠/.22:4094-4100Jung,Y.S.,Kim，K.S.，Kim,K.D.,Lim，J.S.,Kim，J.W.andKim，E.(2001)Apoptosis-linkedgene2bindstothedeathdomainofFasanddissociatesfromFasduringFas-mediatedapoptosisinJurkatcells,5/oc/ze附.ies.O顯肌288(2):420-426KerrJFR,WyllieAHandCurrieAR(1972)Apoptosis:abasicbiologicalphenomenonwithwide-rangingimplicationsintissuekinetics./Ca"cer26:239-257Krebs，J.andKlemenz,R.(2000)TheALG-2/AIP-complex,amodulatorattheinterfacebetweencellproliferationandcelldeathAhypothesis.历—,1498(2-3):153-161LakenHAandLeonardMW.(2001)Understandingandmodulationapoptosisinindustrialcellculture.CQp/m'o".B/o/ec/mo/.12:1/5-1/9LeeYY,YapMGS,HuWSandWongKTY.2003,Low匿glutaminefed-batchculturesof293-HEKserum-freesuspensioncellsforadenovirusproduction.Biotechnol.Prog.19:501-509LiP，NijhawanD.,BudihardjoI.,SrinivasulaS.M.,AhmadM.，AlnemriE.S.andWangX.(1997)CytochormecanddATP-dependentformationofApaf隱l/caspase-9complexinitiatesanapoptoticproteasecascade.Ce〃.91:479-489MastrangeloA.J.，HardwichJ.M.，ZouS.andBetenbaughM.J.(2000)Over-expressionofbcl-2familymembersenhancessurvivalofmammaliancellsinresponsetovariouscultureinsults.万/otec/wo/67:555-564NicholsonDWandThombe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产蛋白质的用途，所述蛋白质优选异源蛋白质，更优选来自外源引入的序列，最优选重组蛋白质，优选干扰素-Y。26.生产重组蛋白质，优选干扰素-Y的方法，所述方法包括提供根据权利要求19或20的细胞，用能表达所述重组蛋白质的表达载体转染所述细胞，并4吏所述重组蛋白质在所述细胞中表达。27.包含具有SEQIDNO:9的cgFADD显性阴性序列的多肽、或能够编码这种多肽的多核香酸，优选SEQIDNO:10，或其片段、同源物、变体或衍生物。28.可通过权利要求25或26的方法生产的多肽，优选重组蛋白质，更优选干扰素-Y，其中与可由未经如此修饰的细胞产生的多肽相比，所述多肽具有提高的唾液酸化作用。29.根据权利要求28的多肽，其中所述唾液酸化作用大于2.9mol唾液酸/mol产生的多肽，优选约3.5mol唾液酸/mol产生的多肽。全文摘要本发明提供能够介导细胞凋亡的分离的中国仓鼠基因和多肽。所披露的多肽为FAIM、FADD、PDCD6和Requiem。还披露了调节所述多肽表达以增强细胞生存力、重组蛋白质产量和蛋白质糖基化的方法。文档编号C07K14/435GK101133156SQ200580048811公开日2008年2月27日申请日期2005年12月28日优先权日2004年12月30日发明者米兰达·G·S·亚普,黄智宏申请人:科学、技术与研究机构