转甲状腺素蛋白表达的调节的制作方法

文档序号:3514836阅读:295来源:国知局
专利名称:转甲状腺素蛋白表达的调节的制作方法
技术领域
本文提供的是用于减少动物中转甲状腺素蛋白mRNA和蛋白的表达的方法、化合物和组合物。此类方法、化合物和组合物可用于例如治疗、预防或减轻转甲状腺素蛋白淀粉样变性。
背景技术
转甲状腺素蛋白(TTR)(也称为前白蛋白、高甲状腺血症、白蛋白异常性甲状腺素;老年全身性淀粉样变性、淀粉样多神经病、淀粉样变性1、PALB ;白蛋白异常性HST2651 ;TBPA ;白蛋白异常性、机能正常的高甲状腺血症)是对甲状腺素和视黄醇的转运负责的血清/血浆和脑脊液蛋白(Sakaki等人,Mol Biol Med. 1989,6 :161_8)。结构上,TTR是同源四聚体;蛋白的点突变和错折叠导致淀粉样原纤维的沉积,并且与例如老年全身性淀粉样变性(SSA)、家族性淀粉样多神经病(FAP)和家族性淀粉样心肌病(FAC)相关。TTR主要由脑的脉络丛和肝,以及在较小程度上由人的视网膜合成(Palha,ClinChem Lab Medd,2002,40,1292-1300)。在肝中合成的转甲状腺素蛋白分泌至血液,而源于脉络丛的转甲状腺素蛋白注定分泌至CSF。在脉络丛中,转甲状腺素蛋白合成表示约20%的总局部蛋白合成以及高达25%的总CSF蛋白(Dickson等人,J Biol Chem, 1986, 261,3475-3478)。

利用基因和免疫组织化学的诊断试验的可用性,已在全世界很多国家中发现患有TTR淀粉样变性。最近研究表明TTR淀粉样变性不是先前所认为的罕见的地方病,并且可影响高达 25% 的老年人群(Tanskanen 等人,Ann Med. 2008 ;40(3) :232-9)。在生物化学水平下,TTR被鉴定为FAP患者的淀粉样沉积物中的主要蛋白组分(Costa 等人,Proc. Natl. Acad. Sc1. USA1978, 75 :4499-4503)并且之后,在该蛋白的30位用蛋氨酸取代缬氨酸被发现是引起疾病的最常用的分子效应(Saraiva等人,J. Clin.1nvest. 1984,74 :104-119)。在FAP中,TTR聚集物和淀粉样原纤维的广泛分布的全身性胞外沉积遍及结缔组织发生,特别是外周神经系统(Sousa和Saraiva, Prog.Neurobiol. 2003,71 =385-400)。TTR沉积后,轴突退化发生,在低直径的无髓鞘和有髓鞘纤维中起始,并且最终导致神经节位点的神经元丧失。本文所述的化合物和治疗方法提供了相比于目前对于TTR相关病症可用的治疗选择的显著优势。TTR淀粉样变性通常在十年内导致死亡,并且直至最近,被认为是不可治愈的。肝移植是在家族性案例中被野生型(WT)等位基因替代疾病相关的等位基因的有效方式,因为肝通常是促淀粉样TTR的来源。尽管肝移植作为基因疗法的形式是有效的,但是其不是没有问题的。移植由于以下因素变得复杂受者和供者的侵入性外科手术的需要、长期移植术后免疫抑制疗法、供者缺乏、其高成本和大量由于其疾病进展而非良好候选者的TR淀粉样变性患者。不幸的是,心脏性淀粉样变性甚至在肝移植后在一些家庭性患者中进展,因为WT TTR经常持续沉积。TTR的中枢神经系统(CNS)沉积也未被移植所缓解,归因于通过脉络丛的合成。移植不是最流行TTR疾病老年全身性淀粉样变性(SSA)的可行选择,影响约25%的由于WT TTR的沉积而引起的超过80的那些。反义技术作为用于减少某些基因产物的表达的有效方法出现并且由此可证明其可独特地用于多种调节TTR的治疗、诊断和研究应用(参见U.S.专利申请No.2008/0039418 和 2007/0299027)。本发明提供了用于调节转甲状腺素蛋白表达的组合物和方法。用于调节转甲状腺素蛋白表达的反义化合物于前述公布的专利申请中公开。然而,仍保持对另外此类化合物的需要。发明概述本文提供的是用于调节转甲状腺素蛋白(TTR)mRNA和蛋白的表达的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中,可用于调节TTRmRNA和蛋白的表达的化合物是反义化合物。在某些实施方案中,反义化合物是反义寡核苷酸。在某些实施方案中,调节可在细胞或组织中发生。在某些实施方案中,细胞或组织是在动物中。在某些实施方案中,动物是人。在某些实施方案中,TTR mRNA水平被减少。在某些实施方案中,TTR蛋白水平被减少。此类减少可以时间依赖性方式或以剂量依赖性方式发生。本文提供的是用于调节转甲状腺素蛋白表达和治疗、预防、延缓或减轻转甲状腺素蛋白淀粉样变性和或其症状的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中的是用于调节表达转甲状腺素蛋白和治疗、预防、延缓或减轻转甲状腺素蛋白淀粉样病或转甲状腺素蛋白淀粉样变性或转甲状腺素蛋白相关淀粉样变性(例如,遗传性TTR淀粉样变性、软脑膜淀粉样变性、转甲状腺素蛋白 淀粉样多神经病、家族性淀粉样多神经病、家族性淀粉样心肌病或老年全身性淀粉样变性)的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID勵25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO :2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID N0:25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。
在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO :2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治 疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO :2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19
或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO : 25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQID NO :25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、
13、14、15、16、17、18、19 或 20 个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID ΝΟ:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。 在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO : 25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于 转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO :25、80、86或87中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、
14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由8至80个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至50个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由12至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由15至25个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由18至21个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个 核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID N0:1或SEQ IDNO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由20至30个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ IDNO 80中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,处于转甲状腺素蛋白淀粉样变性危险或患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQID NO 2中所示的转甲状腺素蛋白核酸互补;或治疗有效量的包含由20个连接核苷组成且具有核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述核碱基序列包含选自SEQ ID N080中所述的任何一个核碱基序列的核碱基序列的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用以下化合物来治疗治疗有效量的包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1或SEQ ID NO :2中所示的转甲状腺素蛋白核酸100%互补;或治疗有效量的包含由20个连接核苷组成且具有SEQ ID N0:80中所述的核碱基序列的经修饰的寡核苷酸的化合物。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用治疗有效量的包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物来治疗,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1中所示的转甲状腺素蛋白核酸100%互补;并且其中所述化合物包含由20个连接核苷组成且具有SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的经修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中,患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的动物通过向动物施用治疗有效量的包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物来治疗,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1中所示的转甲状腺素蛋白核酸100%互补;其中所述化合物包含由20个连接核苷组成且具有SEQ ID NO 80中所述的核碱基序列的经修饰的寡核苷酸;并且其中所述经修饰的寡核苷酸在两个独立地具有5个连接的经修饰的核苷的翼区段之间具有10个连接脱氧核苷的缺口区段。在某些实施方案中,翼区段中的一个或多个经修饰的核苷具有经修饰的糖。在某些实施方案中,经修饰的核苷是2’-取代的核苷。在某些实施方案中,经修饰的核苷是2’ -MOE核苷。在某些实施方案中,调节可在细胞、组织、器官或生物体中发生。在某些实施方案中,细胞、组织或器官是在动物中。在某些实施方案中,动物是人。在某些实施方案中,转甲状腺素蛋白mRNA水平被减少。在某些实施方案中,转甲状腺素蛋白蛋白水平被减少。此类减少可以时间依赖性方式或以剂量依赖性方式发生。还提供的是用于预防、治疗和减轻与转甲状腺素蛋白淀粉样变性相关的疾病、病症和疾患的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中,此类疾病、病症和疾患是转甲状腺素蛋白淀粉样变性相关的疾病、病症`或疾患。在某些实施方案中,治疗方法包括向需要其的个体施用TTR反义化合物。在某些实施方案中,治疗方法包括向需要其的个体施用TTR反义寡核苷酸。在某些实施方案中,治疗方法包括向需要其的个体施用转甲状腺素蛋白反义寡核苷酸和额外疗法。发明详述应理解,前述一般描述和以下详细描述仅仅是示例性的且说明性的,并不限制如要求保护的本发明。在本文,使用的单数包括复数,除非另有明确指出。如本文所用的,使用的“或”意指“和/或”,除非另有指出。而且,使用的术语“包括”以及其它形式例如“包括”和“被包括”并不是限制性的。同时,术语例如“要素”或“组分”包含要素和组分两者,包含一个单元和要素以及包含一个以上亚单元的组分,除非另有明确指出。本文所述的部分标题仅仅是为了组织的目的并不应理解为限制所述的主题。本申请引用的所有文件、或文件的一部分(包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍和书籍)据此通过引用清楚(针对本文所述的文件以及其整体)并入。定义除非提供了明确定义,否则结合本文所述的分析化学、合成有机化学、以及医药和制药化学所用的命名法、以及它们的方法和技术是本领熟知且常用的。标准技术可用于化学合成以及化学分析。当允许时,所有专利、申请、公布的申请和其它公布、GENBANK登记号及可通过数据库例如 National Center for BiotechnologyInformation (NCBI)和其它在本整个公开中提及的数据获得的相关序列信息通过引用(针对本文所论述的文件的部分以及其整体)并入本文。除非另有指出,下列术语具有以下含义“2’ -O-甲氧基乙基”(也称为2’ -MOE和2’ -O(CH2)2-OCH3)是指呋喃糖基环的2’位的O-甲氧基-乙基修饰。2’ -O-甲氧基乙基修饰的糖是经修饰的糖。“2’ -O-甲氧基乙基核苷酸”意指包含2’ -O-甲氧基乙基修饰的糖部分的核苷酸。“ 5-甲基胞嘧啶”意指用与5 ’位连接的甲基修饰的胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶是经修饰的核碱基。“活性药用剂(Active pharmaceutical agent) ”意指当施用于个体时提供了治疗益处的药物组合物中的物质。例如,在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白的反义寡核苷酸是活性药用剂。“活性靶区域”或“靶区域”意指靶向一个或多个活性反义化合物的区域。“活性反义化合物”意指减少靶核酸水平或蛋白水平的反义化合物。“伴随施用(Administered concomitantly) ”是指以两种活性剂的药理学作用在患者中同时出现的任何方式共施用两种活性剂。伴随施用不需要两种活性剂以单一药物组合物、以相同剂量形式或通过相同施用途径施用。两种活性剂的效应不需要同时显示它们自身。效应仅需要在一定时段 内重叠并且不需要共存。“施用”意指给个体提供药用剂,并且包括但不限于通过医学专业人员施用和自身施用。“减轻”是指减轻相关疾病、病症或疾患的至少一个指标、症状或症候。指标的严重度可通过本领域技术人员已知的主观或客观量度来确定。“淀粉样变性”是由各种体组织中的异常蛋白(淀粉样蛋白或淀粉样原纤维)沉积物引起的一组疾病或病症。淀粉样蛋白可沉积在身体的一个特定区域(局限性淀粉样变性)或它们可遍及身体沉积(全身性淀粉样变性)。有三种类型的全身性淀粉样变性原发性(AL)、继发性(AA)和家族性(ATTR)。原发性淀粉样变性与任何其它疾病无关并且被认为其自身的疾病实体。继发性淀粉样变性作为另一种疾病的结果而发生。家族性地中海热是家族性(遗传性)淀粉样变性。“动物”是指人或非-人动物,包括但不限于小鼠、大鼠、兔、狗、猫、猪和非-人灵长类,包括但不限于猴和猩猩。“反义活性”意指归因于反义化合物与其靶核酸的杂交的任何可检测或可测量的活性。在某些实施方案中,反义活性是由此类靶核酸编码的把核酸或蛋白的量或表达的减少。“反义化合物”意指能够通过氢键合经受与靶核酸杂交的寡聚化合物。“反义抑制”意指在与靶核酸互补的反义化合物的存在下靶核酸水平或靶蛋白水平相比于在反义化合物存在下的靶核酸水平或靶蛋白水平的减少。“反义寡核苷酸”意指具有允许与相应的靶核酸区域或区段杂交的核碱基序列的单链寡核苷酸。如本文所用的,术语“反义寡核苷酸”包括本文所述的化合物的药学上可接受的衍生物。“双环糖”意指通过两个非孪位环原子的桥接修饰的呋喃糖基环。双环糖是经修饰的糖。“双环核酸”或“BNA”是指核苷或核苷酸,其中该核苷或核苷酸的呋喃糖部分包括连接呋喃糖环上的两个碳原子的桥,由此形成双环系统。“帽结构”或“端帽部分”意指已在反义化合物的任一末端并入的化学修饰。“中枢神经系统(CNS) ”是指包封在脑膜中的脊椎动物神经系统。其包含大多数神经系统,并且由脑(在具有脑的脊椎动物中)和脊髓组成。CNS包含在背侧腔内,脑在颅腔内,并且脊髓在脊腔内。脑还受颅骨保护,并且脊髓在脊椎动物中还受椎骨保护。“化学上不同的区域”是指以某种方式化学上不同于同一反义化合物的另一区域的反义化合物的区域。例如,具有2’ -O-甲氧基乙基核苷酸的区域化学上不同于具有无2’ -O-甲氧基乙基修饰的核苷酸的区域。“嵌合反义化合物”意指具有至少两个化学上不同的区域的反义化合物。“脉络丛”是产生 脑脊髓液(CSF)的脑室上的区域。“共施用”意指给个体施用两种或更多种药用剂。两种或更多种药用剂可以在单一药物组合物中,或可以在分开的药物组合物中。两种或更多种药用剂中的每一种可通过相同或不同的施用路径施用。共施用包括平行或相继施用。“互补性”意指第一核酸与第二核酸的核碱基之间配对的能力。“连续核碱基”意指彼此直接相邻的核碱基。“稀释剂”意指组合物中缺少药理学活性但是药学上必需或期望的成分。例如,注射型组合物中的稀释剂可以是液体,例如盐水溶液。“剂量”意指在单个施用中或在指定时间内提供的指定量的药用剂。在某些实施方案中,剂量可在一个、两个或多个大丸剂(bolus)、片剂或注射剂中施用。例如,在某些实施方案中,当期望皮下施用时,所需剂量需要不易由单次注射调节的体积,因此,两个或更多个注射可用于实现所需剂量。在某些实施方案中,药用剂通过在延长的时段内或连续地输注来施用。剂量可被陈述为每小时、每天、每周或每月药用剂的量。“有效量”意指足以在需要活性剂的个体中实现所需生理学结果的活性药用剂的量。有效量可在个体间变化,取决于待治疗个体的健康和身体条件、待治疗个体的分类群、组合物的制剂、个体的医疗条件的评价、以及其它相关因素。“家族性淀粉样变性”或“遗传性淀粉样变性”是继承性淀粉样变性的形式。“家族性淀粉样多神经病”或“FAP”是基因遗传的神经退行性病症,其特征在于转甲状腺素蛋白的淀粉样变体的全身性沉积,引起进行性感觉性和运动性多发性神经病变。“完全互补”或“100%互补”意指第一核酸的核碱基序列的每个核碱基在第二核酸的第二核碱基序列中具有互补核碱基。在某些实施方案中,第一核酸是反义化合物且靶核酸是第二核酸。“缺口基体(Gapmer) ”意指其中具有多个支持RNA酶H切割的核苷的内部区域位于具有一个或多个核苷的外部区域的嵌合反义化合物,其中包含内部区域的核苷化学上不同于包含外部区域的核苷。内部区域可被称为“缺口区段”且外部区域可被称为“翼区段”。
“缺口加宽的”意指具有12或更多个连续2’ -脱氧核糖核苷的缺口区段的嵌合反义化合物的位置在具有I至6个核苷的5’和3’翼区段之间和与所述5’和3’翼区段直接相邻。“遗传性转甲状腺素蛋白(TTR)淀粉样变性”是由转甲状腺素蛋白、甲状腺素和维生素A的血浆运输蛋白的突变引起的全身性疾病。其最通常与外周神经病变和限制性心肌病相关,但是遍及身体的血管壁和结缔组织结构中的淀粉样沉积物通常引起其它器官系统的功能障碍。胃肠蠕动异常在具有便秘、腹泻和由延迟胃排空引起的早期饱满感的疾病中是常见的。淀粉样蛋白在腕中的结缔组织沉积物引起腕管综合症。脊血管及周围结构中的淀粉样沉积物引起具有跛行症状的脊柱狭窄。“杂交”意指互补核酸分子的退火。在某些实施方案中,互补核酸分子包括反义化合物和靶核酸。“直接相邻”意指在直接相邻的要素之间没有插入要素。“个体”意指对于治疗或疗法所选定的人或非-人动物。“脑室内施用”或“脑的室内施用”或“脑室施用”意指通过注射或输注到脑的脑室系统中的施用。“腹膜内施用”意指至腹膜腔的施用。“鞘内施用”意指通过注射或输注到沐浴脊髓和脑的脑脊液中的施用。“静脉内施用”意指进入静脉中的施用。“室内施用”意指进入脑室或心室中的施用。“核苷间键合”是指核苷之间的化学键。“软脑膜”意指与柔脑膜无关,两个覆盖脑和脊髓的组织的最内层。“软脑膜淀粉样变性”是指由柔脑膜内的转甲状腺素蛋白淀粉样沉积引起的柔脑膜的淀粉样变性。“连接核苷”意指键合在一起的相邻核苷。“错配”或“非-互补核碱基”是指当第一核酸的核碱基不能与第二靶核酸相应核碱基配对的情况。“经修饰的核苷间键合”是指来自天然存在核苷间键(即磷酸二酯核苷间键)的取代或任何变化。“经修饰的核碱基”是指不是腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸苷或尿嘧啶的任何核碱基。“未经修饰的核碱基”意指嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)。“经修饰的核苷酸”意指不独立地具有一个或多个经修饰的糖部分、经修饰的核苷间键合或经修饰的核碱基的核苷酸。“经修饰的核苷”意指独立地具有经修饰的糖部分或经修饰的核碱基的核苷。“经修饰的寡核苷酸”意指包含至少一个经修饰的核苷酸的寡核苷酸。“经修饰的糖”是指天然糖的取代或变化。“基序”意指反义化合物中化学上不同区域的模型。“天然存在核苷间键合”意指3'至5'磷酸二酯键合。“天然糖部分”意指发现于DNA (2’ -H)或RNA (2’ -0H)中的糖。“核酸”是指由单体核苷酸组成的分子。核酸包括核糖核酸(RNA)、脱氧核糖核酸(DNA)、单链核酸、双链核酸、小干扰核糖核酸(siRNA)和微RNA(miRNA)。核酸还可以包含这些要素在单个分子中的组合。“核碱基”意指能够与另一个核酸的碱基配对的杂环部分。“核碱基序列”意指不依赖于任何糖、键合或核碱基修饰的连续核碱基的次序。“核苷”意指与糖连接的核碱基。“核苷模拟物”包括用于替换糖或糖和碱基并且不一定在寡聚化合物的一个或多个位置连接的那些结构;例如具有吗啉代、环己烯基、环己基、四氢呋喃基、二环或三环糖模拟物例如非呋喃糖单元的核苷模拟物。“核苷酸”意指具有共价连接于核苷的糖部分的磷酸基的核苷。“寡聚化合物"或“寡聚物”是指能够与至少核酸分子区域杂交的连接单体亚单位的聚合物。 “寡核苷酸”意指连接核苷的聚合物,每个连接核苷可经修饰或未经修饰,彼此无关。“胃肠外施用”意指通过注射或输注的施用。胃肠外施用包括皮下施用、静脉内施用、肌内施用、动脉内施用、腹膜内施用或颅内施用,例如脑内施用、鞘内施用、室内施用、室施用、脑室内施用、脑的室内施用或脑室施用。施用可以是连续的、或慢性的、或短期或间歇的。“肽”意指通过连接至少两个氨基酸经由酰胺键形成的分子。肽是指多肽和蛋白质。“药物组合物”意指适用于给个体施用的物质的混合物。例如,药物组合物可包含一种或多种药用剂和无菌水溶液。“药学上可接受的盐”意指反义化合物的生理学和药学上可接受的盐,即保留母体寡核苷酸的所需生物活性并且不赋予其不想要的毒理学效应的盐。“硫代磷酸酯键合”意指核苷之间的键合,其中磷酸二酯键通过用硫原子替代非桥接氧原子之一来修饰。硫代磷酸酯键合是经修饰的核苷间键合。“部分”意指核酸的确定数量的连续(即连接)核碱基。在某些实施方案中,部分是靶核酸的确定数量的连续核碱基。在某些实施方案中,部分是反义化合物的确定数量的连续核碱基。“预防”是指延缓或阻止疾病、病症或疾患的发作或发展达到从数分钟至无限期的时段。预防还意指减少疾病、病症或疾患发展的风险。“前药”意指以无活性形式制备的治疗剂,其在体内或其细胞内通过内源性酶或其它化学品或条件的作用被转化为活性形式。“副作用”意指可归因于治疗而不是所需效应的生理学反应。在某些实施方案中,副作用包括注射部位反应、肝功能试验异常、肾功能异常、肝毒性、肾毒性、中枢神经系统异常、肌病和不适。例如,增加的血清氨基转移酶水平可指示肝毒性或肝功能异常。例如,增加的胆红素可包括肝毒性或肝功能异常。“单链寡核苷酸”意指不与互补链杂交的寡核苷酸。“特异性杂交”是指在反义靶核酸和靶核酸之间具有足够的互补性程度以诱导所需效应同时在体内测定和治疗性处理的情况下在需要特异性结合的条件即在生理学条件下对非-靶核酸表现出最低效应或无效应的反义化合物“皮下施用”意指在皮肤正下方的施用。“靶向”或“被靶向”意指设计和选择与靶核酸特异性杂交并且诱导所需效应的反义化合物的方法。“靶核酸”、“靶RNA”和“靶RNA转录物”均是指能够通过反义化合物靶向的核酸。“靶区段”意指反义化合物所靶向的靶核酸的核苷酸的序列。“5’靶位点”是指靶区段的5’最末端核苷酸。“3’靶位点”是指靶区段的3’最末端核苷酸。“治疗有效量”意指给个体提供了治疗益处的药用剂的量。“转甲状腺素蛋白-特异性抑制剂”或“转甲状腺素蛋白抑制剂”意指能够降低转甲状腺素蛋白mRNA或蛋白表达的任何化合物。此类化合物的实例包括核酸、肽、抗体或组蛋白脱乙酰基酶抑制剂。“转甲状腺素蛋白特异性调节剂”或“转甲状腺素蛋白调节剂”意指能够增加或降低转甲状腺素蛋白mRNA或蛋白表达的任何化合物。如本文所用的“转甲状腺素蛋白相关的淀粉样变性”或“转甲状腺素蛋白淀粉样变性”或“转 甲状腺素蛋白淀粉样病”是与导致含转甲状腺素蛋白的淀粉样原纤维的形成的转甲状腺素蛋白的功能障碍或失调相关的任何病理学或疾病。转甲状腺素蛋白淀粉样变性包括但不限于遗传性TTR淀粉样变性、软脑膜淀粉样变性、家族性淀粉样多神经病(FAP)、家族性淀粉样心肌病、家族性眼睛软脑膜淀粉样变性、老年性心脏淀粉样变性或老年全身性淀粉样变性。“治疗”是指施用药物组合物以实现疾病、病症或疾患的改变或提高。“未经修饰的核苷酸”意指由天然存在核碱基、糖部分和核苷间键合组成的核苷酸。在某些实施方案中,未经修饰的核苷酸是RNA核苷酸(即β -D-核糖核苷)或DNA核苷酸(即β -D-脱氧核糖核苷)。某些实施方案某些实施方案提供了用于抑制转甲状腺素蛋白表达的方法、化合物和组合物。某些实施方案提供了靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物。在某些实施方案中,转甲状腺素蛋白核酸是GENBANK登记号ΝΜ_000371.2(以SEQ ID NO:1并入本文)、从核苷酸 2009236 至 2017289 截短的 GENBANK 登记号 NT_010966. 10 (以 SEQ ID NO 2 并入本文);基于与人外显子的类似性从恒河猴基因组序列GENBANK登记号NW_001105671.1提取的外显子1-4 ;和从核苷酸628000至638000截短的GENBANK登记号NW_001105671.1 (以SEQID NO 4并入本文)中所述的任何序列。某些实施方案提供了包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQID NO :25、80、86、87、115、120、122和124中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案 提供了包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID N0:25、80、86和87中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25,80,86和87中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID N0:25、80、86和87中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25,80,86和87中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID N0:25、80、86和87中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25,80,86和87中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。
某些实施方案提供了包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID N0:25、80、86和87中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25,80,86和87中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含选自SEQ ID N0:25、80、86和87中所述的核碱基序列的序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :25,80,86和87中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由8至80个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SE Q ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至50个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含选自SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基。某些实施方案提供了包含由20至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少8个连续核碱基。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸包含SEQ ID NO :80中所述的核碱基序列的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个或至少19个连续核碱基。在某些实施方案中,所述化合物包含由SEQ ID NO 80中所述的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸。某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO :1的核苷酸120-139、212-236、226-245、293-468、293-326、347-381、425-468、425-467、452-478、452-474、459-478、461-519、462-500、500-519、501-535、502-531、505-524、507-526、508-527、514-540、514-539、
515-534、516-535、523-542、544-606、544-564、564-583、578-601、580-608、580-599、
584-606,585-604,587-606或597-617的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,所述区域选自SEQ ID NO :1的507-526、508-527、515-534、
516-535、580-599、585-604、587-606和589-608。在某些实施方案中,所述区域选自SEQIDNO :1的501-535或580-608。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO 1的核苷酸501-535或580-608的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。

某些实施方案提供了包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO 1的核苷酸508-527的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。某些实施方案提供了包含由15至25个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599、585-604、587-606和589-608的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。某些实施方案提供了包含由18至21个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599、585-604、587-606和589-608的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。
某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID N0:1的核苷酸507-526、508-527、515-534、
516-535、580-599、585-604、587-606和589-608的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有在本文所述的区域内互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸与编码人转甲状腺素蛋白(TTR)例如SEQ ID No 1的核酸90%、95%、99%或100%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO :1的核苷酸508-527的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸具有与在选自SEQ IDNO 1的核苷酸508-527的区域内的等长部分互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸与编码人转甲状腺素蛋白(TTR)例如SEQ ID No 1的核酸90%、95%、99%或100%互补。某些实施方案提供了包含20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自 SEQ ID NO :1 的核苷酸 507-526、508-527、515-534、516-535、580-599、
585-604,587-606 和 589-608 的区域内 60%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 70%互补。某些实施方案提供了`包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 80%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 90%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 95%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷在选自SEQ ID NO :1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 99%互补。某些实施方案提供了包含由20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,所述连接核苷与在选自SEQ ID NO 1的核苷酸507-526、508-527、515-534、516-535、580-599,585-604,587-606 和 589-608 的区域内 100%互补。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内60%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内70%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内80%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物.某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内90%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内95%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO 1的核苷酸508-527内99%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO :1的核苷酸508-527内100%互补的20个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物或经修饰的寡核苷酸靶向 SEQ ID NO 1 的以下核苷酸区域120-139、212-236、226-245、293-468、293-326、347-381,425-468,425-467,452-478,452-474,459-478,461-519,462-500,500-519,502-531、507-526、505-524、508-527、514-540、514-539、515-534、516-535、523-542、544-606、544-564、564-583、578-601、580-599、584-606、585-604、587-606 或 597-617。在某些实施方案中,反义化合物或经修饰的寡核苷酸靶向转甲状腺素蛋白核酸的区域。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的区域的此类化合物或寡核苷酸具有与该区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。例如,所述部分可以是与本文所述的区域的等长部分互补的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基部分。在某些实施方案中,此类化合物或寡核苷酸靶向SEQ ID N0:1的以下核苷酸区域:120-139、212-236、226-245、293-381、293-366、353-381、293-468、425-468、425-467、452-476、461-481、461-500、500-519、46卜519、502-531、502-539、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-540、523-542、544-606、544-564、544-583 或597-617。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的区域的此类化合物或寡核苷酸具有与SEQ ID NO 1的501-535或580-608的区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 60 % 抑制226-245、293-366、357-467、452-474、457-476、459-478、462-500、500-519、502-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-539、 544-564,564-583,578-60I,584-606 或 597-617。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 65 % 抑制293-366、357-376、425-449、432-467、452-474、459-478、462-500、500-519、502-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-539、544-563、564-583、578-601、585-606 或 597-617。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 70 % 抑制293-366、425-449、432-467、452-474、459-478、462-500、500-519、502-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-539、564-583、578-598、581-600 或 597-617。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 75 % 抑制293-322、347-366、425-449、432-467、452-474、459-478、462-500、500-519、503-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-539,578-598,581-600 或 597-616。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 80 % 抑制:303-322、425-449、432-460、443-467、452-473、481-500、500-519、503-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-536、519-539,579-598,581-600 或 597-616。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 85 % 抑制427-449、432-458、441-460、443-467、452-473、504-531、504-536、505-525、506-530、507-527、508-527、508-536、514-536、519-539 或 581-600。在某些实施方案中,SEQ ID NO :1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 90 % 抑制428-449、432-456、439-458、441-460、445-466、452-473、504-525,508-527 或 515-536。在某些实施方案中,SEQ ID NO 1的以下核苷酸区域当经反义化合物或寡核苷酸靶向时展示至少 95%抑制434-453、436-456、441-460、445-465、505-524 或 516-535。在某些实施方 案中,下列反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸),并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少60 %抑制ISIS NO : 420954、420904、304286、420874、420948、420883、420955、420952、420956、420957、420882、420947、420950、304312、304307、420879、420910、420902、420908、420924、420877、420880、304309、304289、420906、304311、420878、420911、304284、304288、420909、304296、420949、304290、304299、420898、420920、420925、420951、304287、420894、420916、420918、420926、304285、
420919、420923、420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、420889、420892、420901、420914、420897、420899、420888、420895、420896、420913、420922、
420893,420890或 420891。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少65%抑制ISIS NO =420955,420952、420956、420957、420882、420947、420950、304312、304307、420879、420910、420902、420908、420924、420877、420880、304309、304289、420906、304311、420878、420911、304284、
304288、420909、304296、420949、304290、304299、420898、420920、420925、420951、304287、
420894、420916、420918、420926、304285、420919、420923、420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、420889、420892、420901、420914、420897、420899、
420888、420895、420896、420913、420922、420893、420890 或 420891。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少70%抑制ISIS NO =304312,304307、420879、420910、420902、420908、420924、420877、420880、304309、304289、420906、304311,420878,420911,304284,304288,420909,304296,420949,304290,304299,420898,
420920、420925、420951、304287、420894、420916、420918、420926、304285、420919、420923、420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、420889、420892、420901、420914、420897、420899、420888、420895、420896、420913、420922、420893、420890或 420891。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少75%抑制ISIS NO =420877,420878、420880、304284、304285、420884、420885、420886、420887、420888、420889、420890、420891、304287、420892、304288、420893、304289、304290、420894、420895、420896、420897、420898、420899、420900、420901、420902、420906、420908、304296、420909、420911、420912、
420913、420914、304299、420915、420916、420917、420918、420919、420920、420921、420922、420923、420924、420925、420926、304309、420949、420951 或 304311。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少80%抑制ISIS NO =304311,420878、420911、304284、304288、420909、304296、420949、304290、304299、420898、420920、420925、420951、304287、420894、420916、420918、420926、304285、420919、420923、420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、420889、420892、420901、
420914、420897、420899、420888、420895、420896、420913、420922、420893、420890或420891。 在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少85%抑制ISIS NO :304290、304299、420898、420920、420925、420951、304287、420894、420916、420918、420926、304285、420919、420923、420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、
420889、420892、420901、420914、420897、420899、420888、420895、420896、420913、420922、
420893.420890或 420891。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少90%抑制ISIS NO =420923,420886、420900、420912、420915、420917、420921、420884、420885、420887、420889、420892、
420901.420914.420897.420899.420888.420895.420896.420913.420922.420893.420890或 420891。在某些实施方案中,以下反义化合物靶向SEQ ID NO :1的区域(编码人转甲状腺素蛋白的核酸)并且表明转甲状腺素蛋白mRNA的至少95%抑制ISIS NO =420888,
420895、420896、420913、420922、420893、420890 或 420891。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸120-139。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸120-139。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :37的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸120-139的反义化合物选自ISISNO :420872。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸212-236。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸212-236。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :8和38的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸212-236的反义化合物选自ISIS NO :420873或304267。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸226-245。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸226-245。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :39的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸226-245的反义化合物选自ISISNO :420874。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸293-381。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸293-381。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :10、42-48的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸293-381的反义化合物选自ISIS NO =420877,420878、420879、420880、304280、420881、420882 或 420883。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸293-366。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸293-366。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO 42-45的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸293-366的反义化合物选自ISISNO :420877、420878、420879 或 420880。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸353-381。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸353-381。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:10、46-48的核碱基序列。在某些此类实施方案中,SEQ ID NO :1的 核苷酸353-381的反义化合物选自ISISNO :304280、420881、420882或 420883。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO:1的核苷酸293-468。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸293-468。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :10-18,42-63的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸293-468的反义化合物选自ISIS NO =420877,420878、420879、420880、304280、420881、420882、420883、304284、304285、420884、420885、
304286、420886、420887、420888、420889、420890、420891、304287、420892、304288、420893、
304289、304290、420894、420895、420896、420897、420898 或 304291。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸425-468。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸425-468。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :11-18、49-63的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向SEQ ID NO:1的核苷酸425-468的反义化合物选自ISIS NO
304284、304285、420884、420885、304286、420886、420887、420888、420889、420890、420891、
304287、420892、304288、420893、304289、304290、420894、420895、420896、420897、420898或 304291。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸425-467。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸425-468。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:ll-17、49-63的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸425-468的反义化合物选自ISIS NO =304284,
304285、420884、420885、304286、420886、420887、420888、420889、420890、420891、304287、420892、304288、420893、304289、304290、420894、420895、420896、420897 或 420898。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸452-476。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸452-476。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO 64-69的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸452-476的反义化合物选自ISISNO :420889、420890、420891、304287、420892、304288、420893、304289、304290、420894、420895、420896、420897、420898、304291、304292、304293、420899、420900、420901、420902、420903 或 420904。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸461-481。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸461-481。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO 72-73的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸461-481的反义化合物选自ISISNO :420907或420908。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸461-500。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸461-500。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:22、72和73的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸461-500的反义化合物选自ISIS NO =420907,420908 或 304296。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸500-519。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸500-519。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :74的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸500-519的反义化合物选自ISISNO :420909。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸461-519。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸461-519。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:22、23、72-74的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸461-519的反义化合物选自ISIS NO =420907,420908,304296 或 420909。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸502-531。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸502-531。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :25、75-84的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸502-531的反义化合物选自ISIS NO =420910,420911、420912、420913、420914、304299、420915、420916、420917、420918 或 420919。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸502-539。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸502-539。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :25、26、75-91的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸502-539的反义化合物选自ISIS NO =420910,420911、420912、420913、420914、304299、420915、420916、420917、420918、420919、304300、420920、420921、420922、420923、420924、420925 或 420926。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸504-536。 在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸504-536。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :25、26、77-88的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸504-536的反义化合物选自ISIS NO =420912,420913、420914、304299、420915、420916、420917、420918、420919、304300、420920、420921、420922 或 420923。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸505-535。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸505-535。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:25、26、78-87的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸505-535的反义化合物选自ISIS NO:
420913、420914、304299、420915、420916、420917、420918、420919、304300、420920、420921或 420922。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸506-530。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸506-530。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :25、79-83的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸506-530的反义化合物选自ISIS NO =420913,
420914、304299、420915、420916、420917、420918或 420919。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸507-527。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸507-527。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :25或80的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸507-527的反义化合物选自ISIS NO =304299或
420915、在某些实施方案中, 靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸508-527。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸508-527。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :80的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸508-527的反义化合物选自ISISNO :420915。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸514-540。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸514-540。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :85-92的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸514-540的反义化合物选自ISISNO :420920、420921、420922、420923、420924、420925、420926 或 420927。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸523-542。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸523-542。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO :94的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO 1的核苷酸523-542的反义化合物选自ISISNO :420929。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸544-606。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸544-606。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:30-33、112-122的核碱基序列。在某些此类实施方案中,SEQ ID NO 1的核苷酸544-606的反义化合物选自ISIS NO =420947,420948、304304、304307、304308、304309、420949、420950、420951、420952、420953、420954、420955、420956 或 420957。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸544-564。在某些实施方案中,反义化合物靶向于核苷酸544-564 of SEQ ID N0:1。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO =112-113的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸544-564的反义化合物选自ISIS NO :420947或420948。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸544-583。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸544-583。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID N0:30、31、112和113的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸544-583的反义化合物选自ISIS NO420947,420948,304304 或 304307。在某些实施方案中,靶区域是SEQ ID NO :1的核苷酸597-617。在某些实施方案中,反义化合物靶向于SEQ ID NO:1的核苷酸597-617。在某些实施方案中,靶向于转甲状腺素蛋白核酸的反义化合物包含选自SEQ ID NO 34-35的核碱基序列。在某些此类实施方案中,靶向于SEQ ID NO :1的核苷酸597-617的反义化合物选自ISISNO :304311或304312。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸由单链经修饰的寡核苷酸组成。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸由20个连接核苷组成。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸的核碱基序列在其整个长度上与SEQ IDNO :1、2或4的核碱基序列至少90%互补。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO :1、2或4的核碱基序列至少95%互补。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸在其整 个长度上与SEQ ID NO :1、2或4至少99%互补。在某些实施方案中,经修饰的寡核苷酸 的核碱基序列在其整个长度上与SEQ ID NO :1、2或4的核碱基序列100%互补。在某些实施方案中,所述化合物具有至少一个经修饰的核苷间键合。在某些实施方案中,核苷间键合是硫代磷酸酯核苷间键合。在某些实施方案中,所述化合物具有至少一个包含经修饰的糖的核苷。在某些实施方案中,至少一种经修饰的糖是双环糖。在某些实施方案中,至少一个双环糖包含4’ -CH(CH3)-0-2’桥。在某些实施方案中,至少一种经修饰的糖包含2’ -O-甲氧基乙基。在某些实施方案中,所述化合物包含至少一个经四氢吡喃修饰的核苷,其中四氢吡喃环代替呋喃糖环。在某些实施方案中,至少一个经四氢吡喃修饰的核苷具有以下结构
权利要求
1.ー种包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的序列的至少8个连续核碱基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸由15至25个连接核苷组成。
3.根据权利要求1所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸由18至21个连接核苷组成。
4.ー种包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述连接核苷包含与在选自SEQ ID NO :1的核苷酸501-535或580-608的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。
5.根据权利要求2所述的化合物,其中所述核碱基序列包含SEQIDN0:25、80、86、87、115、120、122或124中所述的序列的至少15个连续核碱基。
6.根据权利要求3所述的化合物,其中所述核碱基序列包含SEQIDN0:25、80、86、87、115、120、122或124中所述的序列的至少18个连续核碱基。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸是单链寡核苷酸。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少90%互补。
9.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少95%互补。
10.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少100%互补。
11.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中至少ー个核苷间键合是经修饰的核苷间键合。
12.根据权利要求11所述的化合物,其中每个核苷间键合是硫代磷酸酯核苷间键合。
13.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸的至少ー个核苷包含经修饰的糖。
14.根据权利要求13所述的化合物,其中所述至少一种经修饰的糖是双环糖。
15.根据权利要求14所述的化合物,其中至少ー个双环糖中的每ー个包含4’ -CH2-N(R)-0-2’桥,其中R独立地是H、C1-C12烷基或保护基团。
16.根据权利要求14所述的化合物,其中至少ー个双环糖中的每ー个包含4’ -CH(CH3)-0-2’ 桥。
17.根据权利要求13所述的化合物,其中至少ー种经修饰的糖包含2’-O-甲氧基こ基。
18.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其包含至少ー个经四氢吡喃修饰的核苷,其中四氢吡喃环代替所述呋喃糖环。
19.根据权利要求18所述的化合物,其中所述至少ー个经四氢吡喃修饰的核苷中的每ー个具有以下结构
20.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中至少ー个核苷包含经修饰的核碱基。
21.根据权利要求20所述的化合物,其中所述经修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶。
22.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸包含 由连接脱氧核苷组成的缺ロ区段; 由连接核苷组成的5’翼区段;和 由连接核苷组成的3’翼区段; 其中所述缺ロ区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含经修饰的糖。
23.根据权利要求22所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸包含 由10个连接脱氧核苷组成的缺ロ区段; 由5个连接核苷组成的的5’翼区段;和 由5个连接核苷组成的的3’翼区段; 其中所述缺ロ区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间,其中每个翼区段的每个核苷包含2’ -0-甲氧基こ基糖;并且其中每个核苷间键合是硫代磷酸酯键合。
24.根据权利要求22所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸包含 由8个连接脱氧核苷组成的缺ロ区段; 由5个连接核苷组成的的5’翼区段;和 由5个连接核苷组成的的3’翼区段; 其中所述缺ロ区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间,其中每个翼区段的每个核苷包含2’ -0-甲氧基こ基糖;并且其中每个核苷间键合是硫代磷酸酯键合。
25.根据权利要求22所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸包含 由8个连接脱氧核苷组成的缺ロ区段; 由6个连接核苷组成的的5’翼区段;和 由6个连接核苷组成的的3’翼区段; 其中所述缺ロ区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间,其中每个翼区段的每个核苷包含2’ -0-甲氧基こ基糖;并且其中每个核苷间键合是硫代磷酸酯键合。
26.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸由20个连接核苷组成。
27.一种组合物,其包含根据权利要求1-26中任一项所述的化合物或其盐和至少ー种药学上可接受的载体或稀释剂。
28.ー种方法,其包括向动物施用根据权利要求1-26中任一项所述的化合物或组合物。
29.根据权利要求28所述的方法,其中所述动物是人。
30.根据权利要求28所述的方法,其中施用所述化合物预防、治疗、减轻或延缓转甲状腺素蛋白淀粉样变性的进展。
31.根据权利要求28所述的方法,包括共施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
32.根据权利要求31所述的方法,其中伴随施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
33.根据权利要求28所述的方法,其中所述施用是针对脉络丛。
34.ー种减少动物中的转甲状腺素蛋白mRNA或蛋白表达的方法,其包括向所述动物施用根据权利要求1-26中任一项所述的化合物或组合物以减少动物中的转甲状腺素蛋白mRNA或蛋白表达。
35.根据权利要求34所述的方法,其中所述动物是人。
36.根据权利要求34所述的方法,其中减少转甲状腺素蛋白mRNA或蛋白表达预防、治疗、减轻或延缓转甲状腺素蛋白淀粉样变性的进展。
37.根据权利要求34所述的方法,包括共施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
38.根据权利要求37所述的方法,其中伴随施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
39.根据权利要求34所述的方法,其中所述施用是针对脉络丛。
40.ー种用于治疗患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的人的方法,包括鉴定所述患有转甲状腺素蛋白淀粉样变性的人和向所述人施用治疗有效量的根据权利要求1-26中任ー项所述的化合物或组合物,从而治疗所述人的转甲状腺素蛋白淀粉样变性。
41.根据权利要求40所述的方法,其中所述治疗減少所述人中以下的至少ー种坐立不安、缺乏协调、眼球震颤、痉挛性下肢轻瘫、缺乏肌肉协调、视觉受损、失眠症、罕见感觉、肌阵挛、失明、失语症、腕管综合征、癫痫发作、蛛网膜下腔出血、脑的中风和出血、脑水肿、共济失调、和痉挛性麻痹、昏迷、感觉性神经病变、感觉异常、感觉减退、运动神经病变、自身性神经病变、直立性神经病变、直立性低血压、循环便秘、循环腹泻、恶心、呕吐、减少出汗、阳痿、胃排空延迟、尿潴留、尿失禁、进展性心脏病、疲劳、呼吸急促、体重减轻、食欲缺乏、麻木、发麻、虚弱、舌肿大、肾病变综合征、充血性心カ衰竭、运动性呼吸困难、外周性水肿、心律不齐、心悸、头晕、晕厥、直立性低血压、外周神经问题、感觉运动受损、下肢神经病变、痛觉过敏、改变的温度感觉、下肢衰弱、恶病质、外周性水肿、肝肿大、紫癜、舒张期功能障碍、早产J L心室收缩、颅神经病变、深部肌腱反射减少、玻璃体中的淀粉样沉积、玻璃体混浊、干目艮、青光眼、斜瞳孔中的齿状外观或由水分保持引起的足肿胀。
42.根据权利要求40所述的方法,包括共施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
43.根据权利要求42所述的方法,其中伴随施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
44.根据权利要求40所述的方法,其中所述施用是针对脉络丛。
45.一种用于減少或预防转甲状腺素蛋白淀粉样变性的方法,其包括向人施用治疗有效量的根据权利要求1所述的化合物,由此减少或预防转甲状腺素蛋白淀粉样变性。
46.根据权利要求45所述的方法,包含共施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
47.根据权利要求46所述的方法,其中伴随施用所述化合物或组合物和第二活性剤。
48.根据权利要求45所述的方法,其中所述施用是针对脉络丛。
49.一种用于减轻转甲状腺素蛋白淀粉样变性的症状的方法,包括向需要其的人施用包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1特异性杂交,由此减轻所述人中转甲状腺素蛋白淀粉样变性的症状。
50.一种用于減少与转甲状腺素蛋白淀粉样变性相关的症状的进展的速率的方法,包括向需要其的人施用包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1特异性杂交,由此减少所述人中转甲状腺素蛋白淀粉样变性的症状的进展的速率。
51.ー种用于逆转由与转甲状腺素蛋白淀粉样变性相关的症状指示的退化的方法,包括向需要其的人施用包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸的化合物,其中所述经修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO :1特异性杂交,由此逆转所述人中由与转甲状腺素蛋白淀粉样变性相关的症状指示的退化。
52.根据权利要求49、50或51所述的方法,其中所述经修饰的寡核苷酸是单链寡核苷酸。
53.根据权利要求49、50或51所述的方法,其中所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少90%互补。
54.根据权利要求49、50或51所述的方法,其中所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少95%互补。
55.根据权利要求49、50或51所述的方法,所述经修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO I至少100%互补。
56.根据权利要求49、50或51所述的方法,其中所述经修饰的寡核苷酸由20个连接核苷组成。
57.根据权利要求49、50或51所述的方法,其中所述症状是至少ー种身体症状、至少ー种认知症状、至少ー种精神症状和至少ー种外周症状中的至少ー种。
58.根据权利要求57所述的方法,其中所述至少ー种身体症状选自由以下组成的组坐立不安、缺乏协调、无意引发的运动、无意未完成的运动、不稳定步态、舞蹈病、僵硬、扭体运动、异常姿势、不稳定性、异常面部表达、咀嚼困难、吞咽困难讲话困难、癫痫发作和睡眠紊乱。
59.根据权利要求57所述的方法,其中所述至少一种认知症状选自由以下组成的组记忆受损、判断受损和思考、计划受损、灵活性受损、抽象思维受损、规则获取受损、适当行动起始受损、不适当行动受损、短时记忆受损、长期记忆受损、偏执狂、定向障碍、混乱、幻觉和痴呆。
60.根据权利要求57所述的方法,其中所述至少ー种精神症状选自由以下组成的组痴呆;焦虑症、抑郁症、感情迟钝、自我中心症、攻击性、強迫行为、易怒、人格改变(包括记忆カ受损、判断和思考)以及自杀观念。
61.根据权利要求57所述的方法,其中所述至少ー种外周症状选自由以下组成的组脑质量減少、肌肉萎縮、心カ衰竭、葡萄糖耐量受损、体重减轻、骨质疏松症和睾丸萎縮。
62.根据权利要求49-61中任一项所述的方法,其中所述化合物包含由12至30个连接核苷组成的经修饰的寡核苷酸,其中所述连接核苷包含SEQ ID NO :25、80、86、87、115、120、122或124中所述的序列的至少12个连续核碱基。
全文摘要
本发明提供的是用于减少动物中转甲状腺素蛋白mRNA和蛋白的表达的方法、化合物和组合物。此类方法、化合物和组合物可用于治疗、预防、延缓或减轻转甲状腺素蛋白淀粉样变性或其症状。
文档编号C07H21/04GK103038345SQ201180021445
公开日2013年4月10日 申请日期2011年4月29日 优先权日2010年4月29日
发明者B·P·莫尼亚, S·M·弗赖尔, A·M·西科夫斯基 申请人:Isis制药公司
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