野生亚麻种子总DNA提取方法与流程

文档序号:11687477阅读:568来源:国知局

本发明属于植物分子育种学领域,具体涉及一种野生亚麻种子总dna提取方法。



背景技术:

目前植物总dna提取方法有ctab法,sds法,高盐低ph值法等。亚麻总dna提取常用方法为高盐低ph法,该方法常以茎叶为提取原材料。由于野生亚麻种子发芽率低,人工条件育苗获得幼茎需要5个月时间,如果提取原料为多年生野生种,那么获得所需的提取材料会更加困难,提取工作也受时间的限制。因此利用种子提取dna的方法便可以打破这种限制。由于野生亚麻种皮上的果胶质远大于茎叶,故而提取难度较茎叶大。故本专利在前人研究基础之上,着重解决利用野生亚麻种子提取总dna,既达到高浓度、高纯度、大量提取的目的,又能克服提取时间的限制,满足分子生物学实验的需要。



技术实现要素:

本发明目的是提供了一种野生亚麻种子总dna提取方法。

本发明通过以下技术方案实现:

一种野生亚麻种子总dna提取方法,包括如下步骤:

步骤1、用液氮将研钵和杵预冷,取0.25g野生亚麻种子置于研钵中,迅速研磨至粉末状,之后向研钵中加入65℃的提取缓冲液10ml,在水浴锅中继续研磨至充分混匀,得到野生亚麻种子匀浆;

步骤2、将步骤1制得的野生亚麻种子匀浆用尼龙网兜过滤;

步骤3、将步骤2过滤后的滤液用1.5ml离心管分装,每个离心管内滤液容积为0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同时轻轻摇动离心管,水浴后将离心管冷却至室温后,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤4、将步骤3得到的上清液加入0.33体积的5mol/l的醋酸钾溶液,混匀后置于0℃冰浴保持30min,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤5、将步骤4得到的上清液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后的溶液在-20℃条件下静置2h得到的混合物,利用微提取器吸取悬浮物,使之与管底部果胶质分离,留悬浮物待用;

步骤6、将步骤5得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加50μl超纯水混匀后在-20℃条件下静置8~10h,得到的溶液中加人300μl超纯水稀释,稀释后加5μlrna酶,混匀后置于水浴锅中37℃水浴1h,得到溶液待用;

步骤7、将步骤6得到的溶液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后在-20℃条件下静置2h,得到的混合物,利用微提取器吸取悬浮物,使之与管底部果胶质分离,留悬浮物待用;

步骤8、将步骤7得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加25~50μl超纯水混匀后,得到野生亚麻种子总dna,置于-80℃保存;

步骤9、将步骤8得到的野生亚麻种子总dna利用琼脂糖检测条带完整性及纯度,分光光度计检测浓度。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤1中所述的提取缓冲液的配方为每1000ml缓冲液中含有100mmol醋酸钠、50mmol乙二胺四乙酸二钠、500mmol氯化钠、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸钠。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤2中的尼龙网兜过滤用纱布过滤代替。尼龙网兜过滤可用纱布代替,但会影响产量,如果不要求大量提取,可以用纱布替代。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤3中的水浴锅中放置浮漂。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤4中醋酸钾溶液的ph值为4.8。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤5中混匀后的溶液在室温下静置8~10h后得到混合物。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤5中的混合物在室温下以转速10000r/min,离心10分钟,得到沉淀物待用。步骤5中的混合物中没有沉淀出现,则采用离心分离的方法得到沉淀物,用来代替微提取器吸取沉淀。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤7中的混合物在室温下以转速10000r/min,离心10分钟,得到沉淀物待用。步骤7中的混合物中没有沉淀出现,则采用离心分离的方法得到沉淀物,用来代替微提取器吸取沉淀。

本发明所述的野生亚麻种子总dna提取方法,经液氮研磨之后,再用缓冲液研磨,使dna充分溶于缓冲液中而不被破坏,有益效果是加大了dna的产率。而经过过滤的dna提取缓冲液在提取初期就先去掉一部分果胶质,直接降低了dna的粘稠度。本发明步骤简单,实验试剂无毒,提取量大,解决了无法获得或者获取茎叶材料困难的难题,打破dna提取在时间上限制,只要有种子且需要dna时,随时可以提取。

附图说明

附图1为具体实施方式一野生亚麻种子总dna提取的电泳检测对比图。

具体实施方式

具体实施方式一:

一种野生亚麻种子总dna提取方法,包括如下步骤:

步骤1、用液氮将研钵和杵预冷,取0.25g野生亚麻种子置于研钵中,迅速研磨至粉末状,之后向研钵中加入65℃的提取缓冲液10ml,在水浴锅中继续研磨至充分混匀,得到野生亚麻种子匀浆;

步骤2、将步骤1制得的野生亚麻种子匀浆用尼龙网兜过滤;

步骤3、将步骤2过滤后的滤液用1.5ml离心管分装,每个离心管内滤液容积为0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同时轻轻摇动离心管,水浴后将离心管冷却至室温后,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤4、将步骤3得到的上清液加入0.33体积的5mol/l的醋酸钾溶液,混匀后置于0℃冰浴保持30min,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤5、将步骤4得到的上清液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后的溶液在-20℃条件下静置2h得到的混合物,利用微提取器吸取悬浮物,使之与管底部果胶质分离,留悬浮物待用;

步骤6、将步骤5得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加50μl超纯水混匀后在-20℃条件下静置8h,得到的溶液中加人300μl超纯水稀释,稀释后加5μlrna酶,混匀后置于水浴锅中37℃水浴1h,得到溶液待用;

步骤7、将步骤6得到的溶液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后在-20℃条件下静置2h,得到的混合物,利用微提取器吸取悬浮物,使之与管底部果胶质分离,留悬浮物待用;

步骤8、将步骤7得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加25μl超纯水混匀后,得到野生亚麻种子总dna,置于-80℃保存;

步骤9、将步骤8得到的野生亚麻种子总dna利用琼脂糖检测条带完整性及纯度,分光光度计检测浓度。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤1中所述的提取缓冲液的配方为每1000ml缓冲液中含有100mmol醋酸钠、50mmol乙二胺四乙酸二钠、500mmol氯化钠、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸钠。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤3中的水浴锅中放置浮漂。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤4中醋酸钾溶液的ph值为4.8。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,附图1为本实施方式野生亚麻种子总dna提取的电泳检测对比图,其中第1泳道为15000bp的dnamarker,第2、3、4泳道为本方法茎叶提取,第5、6、7、8为本方法种子提取,第9、10、11、泳道为3%ctab法。图1电泳图是dna提取液经过稀释5倍之后上样获得的。从电泳图上可以看出种子总dna的提取量最大,条带清晰无杂质,提取dna长度位于maker之上,提取的dna较完整,rna添加量适合,无污染,达到分子生物学要求,茎叶的提取量较低,条带比较模糊,未达到分子生物学要求。3%ctab法没有检测出条带。

具体实施方式二:

一种野生亚麻种子总dna提取方法,包括如下步骤:

步骤1、用液氮将研钵和杵预冷,取0.25g野生亚麻种子置于研钵中,迅速研磨至粉末状,之后向研钵中加入65℃的提取缓冲液10ml,在水浴锅中继续研磨至充分混匀,得到野生亚麻种子匀浆;

步骤2、将步骤1制得的野生亚麻种子匀浆用纱布过滤;

步骤3、将步骤2过滤后的滤液用1.5ml离心管分装,每个离心管内滤液容积为0.6ml,65℃水浴10min,水浴的同时轻轻摇动离心管,水浴后将离心管冷却至室温后,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤4、将步骤3得到的上清液加入0.33体积的5mol/l的醋酸钾溶液,混匀后置于0℃冰浴保持30min,以转速10000r/min,离心10分钟,离心后取上清液待用;

步骤5、将步骤4得到的上清液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后的溶液在室温下静置2h后得到的混合物,在室温下以转速10000r/min,离心10分钟,得到的沉淀物待用;

步骤6、将步骤5得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加50μl超纯水混匀后在-20℃条件下静置8h,得到的溶液中加人300μl超纯水稀释,稀释后加5μlrna酶,混匀后置于水浴锅中37℃水浴1h,得到溶液待用;

步骤7、将步骤6得到的溶液加入0.6倍体积的预冷异丙醇,混匀后在-20℃条件下静置2h,得到的混合物,在室温下以转速10000r/min,离心10分钟,得到的沉淀物待用;

步骤8、将步骤7得到的沉淀物用无水乙醇洗涤2次后,自然晾干后,加50μl超纯水混匀后,得到野生亚麻种子总dna,置于-80℃保存;

步骤9、将步骤8得到的野生亚麻种子总dna利用琼脂糖检测条带完整性及纯度,分光光度计检测浓度。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤1中所述的提取缓冲液的配方为每1000ml缓冲液中含有100mmol醋酸钠、50mmol乙二胺四乙酸二钠、500mmol氯化钠、2%聚乙烯吡咯烷酮、1.4%十二烷基磺酸钠。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤3中的水浴锅中放置浮漂。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,步骤4中醋酸钾溶液的ph值为4.8。

本实施方式所述的野生亚麻种子总dna提取方法,表1列举了不同方法提取dna的分光光度计检测结果。

表1不同方式提取dna分光光度计检测结果对比表

从表1中明确看出,利用种子提取的dna浓度达到217ng/ul,浓度远远大于其他方法,该方法od260/od280为1.808,接近理论值1.80,表明提取的dna没有蛋白质污染,满足分子生物学的实验需要。

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