一种改善单子叶作物对赤霉素抑制剂敏感性的方法及应用与流程

文档序号:17663225发布日期:2019-05-15 22:31阅读:695来源:国知局

本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种改善单子叶作物对赤霉素抑制剂敏感性的方法及应用。



背景技术:

玉米(zeamaysl.)是世界上非常重要的粮食作物、饲料作物、工业原料以及能源作物,在国民经济发展中起到无法取代的作用,世界上玉米产量最大的两个国家分别是美国和中国(ci等,2012)。但是目前由于气候条件的变化及灌溉不合理等因素,玉米倒伏的现象越来越严重,造成玉米收获困难,严重影响其产量,因此可以通过对玉米株型的塑造来解决倒伏的问题,无疑是首要选择。为了提高玉米的产量,可以通过对玉米株型的塑造抑制植株生长和节间缩短,抑制营养生长而促进生殖生长,提高玉米产量和质量。

缩节安(n,n-dimethylpiperidiniumchloride,dpc),其化学名称为1,1-二甲基哌啶鎓氯化物,是一种无害安全又经济的植物生长调节抑制剂,广泛应用于棉花生产上。棉花应用缩节安后,可以按照人们的意愿对棉花植株进行株型塑造,抑制棉株主茎的生长,使棉株节间缩短;减弱植株的顶芽长势,促进侧枝的生长,紧凑株型;从而防止棉花植株旺长,促进营养生长,增加棉絮的产量和质量(田晓莉等,2004;田晓莉等,2006;ren等,2013)。但缩节安对玉米调控效应不显著,应用1000mg/ldpc处理玉米郑单958,株高和茎粗与对照都没有显著的差异(陈吟,2012)。因此改善玉米对缩节安的敏感性是迫切的。



技术实现要素:

本发明的一个目的是提供一种蛋白质。

本发明提供的蛋白(k409yzmcps1),为将蛋白zmcps1氨基酸序列第409位的赖氨酸突变为酪氨酸,得到的蛋白突变体。

所述蛋白质中,所述蛋白zmcps1来源于单子叶植物或双子叶植物;或,所述蛋白zmcps1来源于具体为玉米;

或所述蛋白质为如下1)-5)中任一种:

1)氨基酸序列包括序列表中序列2所示的氨基酸序列的蛋白质;

2)氨基酸序列由序列表中序列2所示的氨基酸残基组成;

3)将1)或2)所限定的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;

4)与1)或2)所限定的氨基酸序列具有99%以上、95%以上、90%以上、85%以上或者80%以上同源性且具有相同功能的蛋白质;

5)1)-4)中任一所限定的蛋白质的n端和/或c端连接标签后得到的融合蛋白。

编码上述蛋白的核酸分子也是本发明保护的范围。

上述核酸分子为如下1)-4)中任一种所示的核酸分子:

1)其编码序列包括序列表中序列1;

2)其编码序列为序列表中序列1;

3)在严格条件下与1)或2)限定的dna分子杂交且编码权利要求1所述蛋白的dna分子;

4)与1)或2)限定的dna分子具有80%以上或90%以上的同源性且编码权利要求1所述蛋白的dna分子。

下述1)-4)中的任一种生物材料也是本发明保护的范围:

1)含有上述核酸分子的表达盒;

2)含有上述核酸分子的重组载体;

3)含有上述核酸分子的重组菌;

4)含有上述核酸分子的转基因细胞系。

上述蛋白质或上述核酸分子或上述的生物材料在提高植物对赤霉素抑制剂敏感性中的应用也是本发明保护的范围。

所述提高植物对赤霉素抑制剂敏感性为降低植物在赤霉素抑制剂诱导下的株高。

本发明的另一个目的是提供一种提高植物对赤霉素抑制剂敏感性的方法。

本发明提供的方法,包括如下步骤:提高目的植物中上述蛋白的表达或含量,得到转基因植物;

所述转基因植物对赤霉素抑制剂敏感性大于所述目的植物对赤霉素抑制剂敏感性。

所述转基因植物对赤霉素抑制剂敏感性大于所述目的植物对赤霉素抑制剂敏感性体现在所述转基因植物在赤霉素抑制剂诱导下的株高低于所述目的植物在赤霉素抑制剂诱导下的株高;

上述方法中,所述提高目的植物中蛋白的表达或活性的方法为,将蛋白编码基因导入目的植物中。

上述中,所述赤霉素抑制剂为缩节安;

或,所述植物为单子叶植物或双子叶植物;

或,所述单子叶植物为玉米;

或,所述目的植物为atcps的完全突变体。

本发明另一个目的是提供一种提高zmcps1对赤霉素抑制剂敏感性的方法。

本发明提供的方法,为将zmcps1蛋白氨基酸序列第409位赖氨酸突变为酪氨酸,实现提高zmcps1对赤霉素抑制剂敏感性。

提高zmcps1对赤霉素抑制剂敏感性体现在zmcps1未使ent-cpp含量随着dpc浓度增加没有减少的趋势,k409yzmcps1使ent-cpp产量随着dpc浓度增加而逐渐降低。

本发明的实验证明了,对zmcps1的409位的赖氨酸(k)进行编辑为酪氨酸(y)得到k409yzmcps1突变体,将其转入玉米中,可以改变玉米对缩节安的敏感性,使经济安全的赤霉素合成抑制剂缩节安应用到玉米栽培中,实现对玉米理想株型的有效塑造,最终达到使玉米抗逆增产的效果。

附图说明

图1为ga1-1:zmcps1与ga1-1:k409yzmcps1互补株系对不同浓度dpc敏感性的表型。

图2为体外分析zmcps1与k409yzmcps1在不同浓度dpc下的产物量。

图3为zmcps1和k409yzmcps1的kinetics分析。

图4为zmcps1和k409yzmcps1分别与dpc互作的ic50。

具体实施方式

下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐明本发明,而不是为了限制本发明的范围。

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。

下述实施例中的载体psuper1300为文献(lipidtransferprotein3asatargetofmyb96mediatesfreezinganddroughtstressinarabidopsis,journalofexperimentalbotany,guoetal.,vol.64,no.6,pp.1755–1767,2013)中的psuper1300::gfp,公众可从申请人处获得该生物材料,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。

下述实施例中的根癌农杆菌gv3101为文献(aplasmamembranereceptorkinase,ghr1,mediatesabscisicacid-andhydrogenperoxide-regulatedstomatalmovementinarabidopsis,huaetal.,theplantcell,vol.24:2546–2561,june2012)中的agrobacteriumstraingv3101,公众可从申请人处获得该生物材料,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。

下述实施例中的拟南芥突变体ga1-1为俄亥俄州立大学拟南芥生物资源中心产品,是atcps的完全突变体,为了检测zmcps1以及k409yzmcps1对dpc的反应并不受atcps的干扰所以选择ga1-1。

下述实施例中的0mg/l的缩节安dpc水溶液为超纯水,下述实施例中的30mg/l的dpc水溶液为向1l超纯水中加入30mgdpc得到的溶液,下述实施例中的50mg/l的dpc水溶液为向1l超纯水中加入50mgdpc得到的溶液,下述实施例中的100mg/l的dpc水溶液为向1l超纯水中加入100mgdpc得到的溶液,下述实施例中的500mg/l的dpc水溶液为向1l超纯水中加入500mgdpc得到的溶液,下述实施例中的1000mg/l的dpc水溶液为向1l超纯水中加入1000mgdpc得到的溶液。

下述实施例中拟南芥的生长条件均为:光周期为16h光/8h暗,光强为60μmol/m2/s,湿度60%-70%,温度为22℃的培养室中培养。

下述实施例中的缩节安为江苏润泽农化有限公司公司产品,货号为:hg/t2856-1997,缩节安为赤霉素生物合成抑制剂。

下述实施例中的zmcps1源于玉米(b73)。

实施例1、k409yzmcps1的获得

k409yzmcps1蛋白为将zmcps1蛋白氨基酸序列(序列2)第409位的赖氨酸突变为酪氨酸,得到的蛋白突变体。

k409yzmcps1基因为将zmcps1基因核苷酸序列(序列1)第1225-1227位的aag碱基突变为tat,得到的核酸突变体。

实施例2、k409yzmcps1在改善玉米对赤霉素抑制剂敏感性中的应用

一、重组载体的获得

重组载体psuper1300-zmcps1为将psuper1300载体的spei和kpni间的dna片段替换为zmcps1基因,得到的载体,zmcps1蛋白与载体上的gfp形成的融合蛋白表达;

重组载体psuper1300-k409yzmcps1为将psuper1300载体的spei和kpni间的dna片段替换为k409yzmcps1基因,得到的载体,k409yzmcps1蛋白与载体上的gfp形成的融合蛋白表达。

二、重组菌的获得

分别将重组载体psuper1300-zmcps1和psuper1300-k409yzmcps1导入根癌农杆菌gv3101中,得到重组菌,将该重组菌命名为gv3101-psuper1300-zmcps1和gv3101-psuper1300-k409yzmcps1;

将对照载体psuper1300导入根癌农杆菌gv3101中,得到重组菌,将该重组菌命名为gv3101-psuper1300。

三、转基因拟南芥的获得

用上述二的重组菌gv3101-psuper1300-k409yzmcps1转化拟南芥突变体ga1-1,得到转k409yzmcps1拟南芥ga1-1(k409yzmcps1::ga1-1)t1代种子,具体方法如下:

1)拟南芥的培养:将突变体ga1-1种子在4℃条件下春化72h,于赤霉素培养基(赤霉素培养基为向ms培养基中加入赤霉素(ga3)得到的ga3浓度为10-4m的固体培养基)中于22℃、16h光/8h暗、光强为60μmol/m2/s、湿度60%-70%的培养室中培养,生长到4片真叶时移栽到营养土与蛭石等比例混合的种植钵中,其中突变体要两天喷一次10-4mga3;

2)农杆菌菌液的制备:取gv3101-psuper1300-k409yzmcps1农杆菌接种于5mlyep液体培养基(含抗生素)中,28℃、220rpm下培养30h,按体积比为1:100将得到的菌液转接到50mlyep(含抗生素)中,28℃,220rpm培养过夜,至od600为0.6-0.8;4℃于6000g离心15min,所收集的菌体重悬于1/2ms+5%蔗糖溶液,转化前加入0.02%-0.05%silwetl-77(一种表面活性剂,为美国amresco公司产品)。

3)转化:待拟南芥突变体ga1-1植株开花后,剪去主枝顶端,促进侧枝发展。在剪枝后的6天内,将上述2)准备好的农杆菌蘸湿拟南芥未露白的花序上。将转化后的拟南芥用充满气的黑色塑料袋包住,暗培养24h后去掉黑色塑料袋。恢复光照按正常方法培养植株至结实,收获成熟的转k409yzmcps1基因ga1-1(k409yzmcps1::ga1-1)t1代种子。

4)k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株获得

①将t1代k409yzmcps1::ga1-1种子播种在含有潮霉素的ms固体培养基上进行筛选,将真叶健康呈深绿色、根伸长至培养基中的抗潮霉素的阳性植株移入土壤中,收获t2代k409yzmcps1::ga1-1种子;②将t2代k409yzmcps1::ga1-1种子播种在含有潮霉素的ms固体培养基上得到t2代k409yzmcps1::ga1-1植株,利用潮霉素进行筛选,选择抗潮霉素:不抗潮霉素=3:1的t2代k409yzmcps1::ga1-1植株并将其中的抗潮霉素植株移入土壤中,收获t3代k409yzmcps1::ga1-1种子(抗潮霉素植株表现为:真叶健康呈深绿色,根伸长至培养基中;不抗潮霉素植株表现为:真叶发黄,根不伸长);③将t3代k409yzmcps1::ga1-1种子播种在含有潮霉素的ms培养基上,得到t3代k409yzmcps1::ga1-1植株,利用潮霉素进行筛选,选择全部为抗潮霉素的t3代k409yzmcps1::ga1-1植株并将其移栽到土壤中,得到k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株。

按照上述方法,将gv3101-psuper1300-k409yzmcps1分别替换为gv3101-psuper1300-zmcps1和gv3101-psuper1300,其他步骤均不变,分别得到名称为zmcps1::ga1-1的转zmcps1基因ga1-1及其纯系植株和名称为psuper1300::ga1-1的转空载体ga1-1及其纯系植株。

四、转基因植株的鉴定

1、转k409yzmcps1纯系拟南芥中k409yzmcps1基因表达量的检测

利用real-timepcr鉴定k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株k409yzmcps1基因的表达水平及zmcps1::ga1-1的纯系植株中zmcps1基因的表达水平,所用的引物为5’-tgcagccacttatcgaccag-3’和5’-aggcgagggtgttgatcatg-3’。

内参为atubi基因,内参的引物为5’-attacccgatgggcaagtca-3’和5’-cacaaacgagggctggaaca-3’。

分别提取k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株和zmcps1::ga1-1的纯系植株的dna作为模板,用上述引物进行pcr扩增。

结果显示,k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株和zmcps1::ga1-1的纯系植株中均能分别表达k409yzmcps1和zmcps1基因。

2、转k409yzmcps1基因的纯系拟南芥中k409yzmcps1蛋白表达量的检测

利用westernblot鉴定k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株中的k409yzmcps1蛋白以及zmcps1::ga1-1的纯系植株中的zmcps1蛋白,一抗为anti-gfptagrabbit(roche产品,货号为14717400)。

结果显示,k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株有k409yzmcps1蛋白表达,zmcps1::ga1-1的纯系植株中均有zmcps1蛋白表达。

五、dpc降低转基因拟南芥株高体现k409yzmcps1改善植物对dpc的敏感性

dpc对转基因拟南芥株高的影响,实验重复三次,每次重复试验的具体步骤如下:

选取上述获得的k409yzmcps1::ga1-1的纯系植株、zmcps1::ga1-1纯系植株、psuper1300::ga1-1的纯系植株和ga1-1植株;每个株系70株。

将上述各个株系分为如下几组处理,每组10株,在这几组植株自播种(播种当天记为播种第1天)的第33天时分别进行以下处理:

一组喷施水(即0mg/l的dpc水溶液)后,培养12天,得到未处理的k409yzmcps1::ga1-1、未处理的zmcps1::ga1-1、未处理的psuper1300::ga1-1和未处理的ga1-1植株;

一组喷施30mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到30mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、30mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1、30mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和30mg/ldpc处理的ga1-1植株;

一组喷施50mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到50mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、50mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1、50mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和50mg/ldpc处理的ga1-1植株;

一组喷施100mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到100mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、100mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1、100mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和100mg/ldpc处理的ga1-1植株;

一组喷施300mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到300mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、300mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1、300mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和300mg/ldpc处理的ga1-1植株;

一组喷施500mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到500mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、500mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1、500mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和500mg/ldpc处理的ga1-1植株;

一组喷施1000mg/l的dpc水溶液后,培养12天,得到1000mg/ldpc处理的k409yzmcps1::ga1-1、1000mg/ldpc处理的zmcps1::ga1-1和1000mg/ldpc处理的psuper1300::ga1-1和1000mg/ldpc处理的ga1-1植株。

分别测量上述不同处理拟南芥的株高。

结果如图1所示,为不同浓度dpc处理不同株系12天后表型;a:不同浓度dpc处理zmcps121::ga1-1株系(zmcps1::ga1-1一个株系)12天后的表型;b:不同浓度dpc处理zmcps149::ga1-1株系(zmcps1::ga1-1一个株系)12天后的表型;c:不同浓度dpc处理k409yzmcps121::ga1-1株系(k409yzmcps1::ga1-1一个株系)12天后的表型;d:不同浓度dpc处理k409yzmcps134::ga1-1株系1(k409yzmcps1::ga1-1一个株系)2天后的表型;可以看出,k409yzmcps1::ga1-1株系高受dpc浓度而影响,转k409yzmcps1基因拟南芥的株高随dpc浓度的增加而降低,彻底改善了转zmcps1基因拟南芥植株对dpc不敏感。

统计各个株系的平均株高见表1。

表1、不同浓度dpc处理的不同转基因株系拟南芥的株高(cm)

六、dpc降低zmcps1产物ent-cpp含量体现k409yzmcps1改善植物对dpc的敏感性

1、dpc降低zmcps1产物ent-cpp含量

1)构建重组载体

k409yzmcps1-pentr/sd/d-topo为将k409yzmcps1基因连接到pentr/sd/d-topo载体(invitrogen,catalognok2420-20,是gateway反应的入门载体)得到。

zmcps1-pentr/sd/d-topo为将zmcps1基因连接到pentr/sd/d-topo载体得到。

将载体k409yzmcps1-pentr/sd/d-topo和zmcps1-pentr/sd/d-topo分别与pdest-17(美国爱荷华州立大学peterslab)进行lr反应,得到重组载体pdest-17-k409yzmcps1和pdest-17-zmcps1。

pdest-17-k409yzmcps1为将k409yzmcps1基因通过lr反应连插入pdest-17载体attl1和attl2位点间得到的载体。

pdest-17-zmcps1为将zmcps1基因通过lr反应连插入pdest-17载体attl1和attl2位点间得到的载体。

2)将pdest-17-k409yzmcps1载体和pdest-17-zmcps1载体分别与pgg(美国爱荷华州立大学peterslab)、pirs(美国爱荷华州立大学peterslab)共同转化到c41大肠杆菌细胞(美国爱荷华州立大学peterslab)中,进行诱导3天(摇菌到od0.6-0.8后加入终浓度为1mmiptg)。

将各个诱导后菌株用有机溶剂hexanes提取ent-cpp产物,上样到gc-ms,仪器参数为:varian3900gc-saturn2100tms;所用的柱子为agilenthp-5ms(agilent,19091s-433);采用8400自动进样器,进样体积1ul,不分流模式,进样口温度设为250℃;载气:高纯氦气,恒流模式,流速:1.2ml/min。柱温:50℃(3min),15℃/min到300℃,保持3min;ms收集范围为90-650;收集时间为:进样13min到终止。

统计各个相应的峰值,计算ent-cpp产物的平均值。

含有pdest-17-k409yzmcps1载体诱导后菌株的ent-cpp产物出峰时间为16.770min;

含有pdest-17-zmcps1载体诱导后菌株的ent-cpp产物出峰时间为16.770min;

ent-cpp标准品的出峰时间为16.770min;证明均得到目的产物ent-cpp。

计算含量如图2所示,为不同浓度dpc处理zmcps1和k409yzmcps1后产物ent-cpp的含量;a为不同浓度dpc处理zmcps1后产物ent-cpp的含量;b:不同浓度dpc处理k409yzmcps1后产物ent-cpp的含量;可以看出,zmcps1产物ent-cpp含量随着dpc浓度增加没有减少的趋势,但k409yzmcps1产物ent-cpp含量随着dpc浓度增加而逐渐降低。说明k409yzmcps1彻底改变了zmcps1对dpc不敏感。

2、k409yzmcps1蛋白酶活性动力学常数研究

将转入pdest-17-k409yzmcps1的c41大肠杆菌细胞和转入pdest-17-zmcps1的c41大肠杆菌细胞进行蛋白表达和纯化,具体如下:

(1)将构建好的原核表达载体pdest17-zmcps1和pdest-17-k409yzmcps1分别转化到c41感受态细胞中,倒置培养16h。

(2)挑取一个单克隆到50ml的培养基过夜培养。

(3)再转化到1lnzy培养基中培养到od600为0.8~1.0左右,加入1mm的iptg进行诱导大约20h。

(4)将1l的菌体进行5000g,4℃离心20min,如果不立即纯化蛋白保存到-80℃冰箱。

(5)用40ml纯化蛋白buffera重悬菌体,加入40μl1mdtt,使菌体充分溶解到buffera中。

(6)将菌体溶液过homogenizer3~4次,直至菌体看起来比较清亮,过程中用的压力为10,000~12,000psi。

(7)用无菌水清洗homogenizer3~4次,然后用20%的乙醇清洗。

(8)将透亮的菌体进行16,000g,4℃离心30min,收集上清液。

(9)打开bio-rad蛋白纯化仪,检查所有的部分都已连接好,先不连柱子用mixbuffer(buffera:bufferb=50%:50%)清洗3min尽量除去整个仪器中的乙醇,然后再用buffera清洗3min。

(10)连接纯化ni柱(10ml),用buffera平衡柱子30min。

(11)运行kpn140程序,共得到14管2ml的蛋白。

(12)程序运行完后,用buffera平衡柱子5min,然后用mesbuffer平衡柱子20min后,用灭菌水平衡柱子20min,最后用20%的乙醇溶液平衡柱子10min后断开柱子。

(13)最后用20%的乙醇溶液清洗整个仪器10min后,关掉仪器。

(14)将收集的各管蛋白上样到sds-page胶,检测每管蛋白纯化的情况。

(15)选择纯度较高且浓度较高的蛋白在冷室中进行透析两次,每次至少6h。

(16)提前准备离心管放到冷室中,分别分装200μl蛋白到每个离心管。

(17)利用nanodrop检测蛋白的浓度后,用液氮速冻蛋白,保存至-80℃冰箱以备用,得到zmcps1纯化蛋白和k409yzmcps1纯化蛋白。

将zmcps1纯化蛋白和k409yzmcps1纯化蛋白分别与底物ggpp的酶活性动力学的分析,具体如下:

(1)打开30℃的水浴锅,平衡过夜。

(2)准备蛋白反应buffer(最后反应浓度为:50mmhepes,ph7.75;100mmkcl;10%甘油;0.1mmmgcl2)。

(3)加入反应buffer、底物ggpp和无菌水总体积为1ml在水浴锅平衡10min。

(4)开始反应加入蛋白,快速涡旋混匀立即放入水浴锅,开始计时。

(5)反应结束后立即加入110μl20mm的nem,75℃平衡5min。

(6)冷却到室温后加入20μl1m的dtt,室温平衡15min目的是灭活nem以免影响下一步反应。

(7)加入60μl1m的hcl平衡ph。

(8)再加入134μl10xciapbuffer。

(9)加入15upromegaciap,37℃平衡至少14h。

(10)用有机溶剂hexanes提取3次,用氮气吹干。

(11)重新溶解到50μlhexanes中,上样到gc-fid。

(12)检测完后,统计产物、底物以及副产物的面积值。

结果如图3所示,为zmcps1和k409yzmcps1蛋白酶活性动力学分析;a:zmcps1酶动力学分析;b:k409yzmcps1蛋白酶活性动力学分析;经过分析zmcps1蛋白酶活性动力学常数为:kcat=0.25405s-1;km=0.60173um;ki=162.74um;r2=0.95857。k409yzmcps1蛋白酶活性动力学常数为:kcat=0.27013s-1;km=0.71842um;ki=58.014um;r2=0.92721;表明,zmcps1和k409yzmcps1的酶活性常数在催化效率基本一致。

3、k409yzmcps1与dpc反应的ic50

挑选酶活最强所对应的底物浓度5um进行与不同浓度dpc反应,具体如下:

(1)打开30℃的水浴锅,平衡过夜。

(2)准备蛋白反应buffer(最后反应浓度为:50mmhepes,ph7.75;100mmkcl;10%甘油;0.1mmmgcl2)。

(3)加入反应buffer及相应浓度的dpc、底物ggpp和无菌水总体积为1ml在水浴锅平衡10min。

(4)开始反应加入蛋白,快速涡旋混匀立即放入水浴锅,开始计时。

(5)反应结束后立即加入110μl20mm的nem,75℃平衡5min。

(6)冷却到室温后加入20μl1m的dtt,室温平衡15min目的是灭活nem以免影响下一步反应。

(7)加入60μl1m的hcl平衡ph。

(8)再加入134μl10xciapbuffer。

(9)加入15upromegaciap,37℃平衡至少14h。

(10)用有机溶剂hexanes提取3次,用氮气吹干。

(11)重新溶解到50μlhexanes中,上样到gc-fid。

(12)检测完后,统计产物、底物以及副产物的面积值。

统计k409yzmcps1和zmcps1分别与dpc反应的ic50,结果如图4所示,为zmcps1和k409yzmcps1蛋白酶-dpcic50分析;a:zmcps1-dpcic50分析;b:k409yzmcps1-dpcic50分析;zmcps1-dpc的ic50为3.594*10-3mdpcr2=0.95558;而k409yzmcps1-dpc的ic50为4.642*10-5mdpcr2=0.99392;可以看出k409yzmcps1提高了zmcps1对dpc敏感100倍,增加了zmcps1对dpc的敏感性。

序列表

<110>中国农业大学

<120>一种改善单子叶作物对赤霉素抑制剂敏感性的方法及应用

<160>2

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>2568

<212>dna

<213>人工序列

<220>

<223>

<400>1

atgaagctcctctcgccggcggccgcaccgtcgtcctcgccgttgttccctcctcgcatc60

gtcgaagctgcagctcgtcaatcaggtccatgccgtatccgcatccgtatccgtggcaaa120

gcagcagcagcaggaggaggaggaggcgcgggcgcgacggggccccgcggcagcctcagg180

ctcgccgggtggtggagagcgcagcagcaggccccggccacggcgacgacaacgcagcag240

cctgacaacgtctccagtgctaaagtgttccagaccagccgtgtggaaaccgagtccgaa300

attgcgaaatggccagggaaaccacaagaccttgaggatgagcaccaggctgaggaggca360

gagctgcagccacttatcgaccaggtgagggcgatgctacggtcgatgaacgacggggat420

accagcgcctcggcgtacgacacggcgtgggtggcgatggtgccgaaggtgggcggcgac480

ggcggcgcccagccccagttcccggccaccgtgcgctggatcgtggaccaccagctgccc540

gacggctcctggggcgactcggccctgttctccgcctacgaccgcatgatcaacaccctc600

gcctgcgtcgtcgcgctgaccaagtggtcgctggagcccgcgaggtgcgaggcggggctc660

tcgttcctgcacgagaacatgtggaggctagcggaggaggaggcggagtcgatgcccatc720

ggcttcgagatcgccttcccttctctcatccagacggctagggacctgggcgtcgtcgac780

ttcccgtacggacacccggcgctgcagagcatatacgccaacagggaagtcaagctgaag840

cggatcccaagggacatgatgcacagggtcccgacgtccatcctgcacagccttgaaggg900

atgcctgacctggactggccgaggcttctgaacctccagtcctgcgacggctccttcttg960

ttctctccttcggctaccgcttacgcgctgatgcaaaccggtgacaagaagtgcttcgaa1020

tacatcgacaggattgtcaaaaaattcaacgggggagtccccaatgtttatccggtcgat1080

cttttcgagcacatctgggttgtggatcggttggagcgactcgggatctcccgctacttc1140

caacgagagattgagcagtgcatggactatgtgaacaggcactggactgaagatgggatt1200

tgctgggctaggaaatccaatgtgaaggatgtggatgacacagctatggctttccgacta1260

ctaaggctacatggatacaatgtctctccaagtgtgtttaagaactttgagaaagatgga1320

gagttcttttgttttgtgggccaatcgactcaagccgtcactgggatgtataacctcaac1380

agagcctctcagataagttttcaaggagaggatgtattgcatcgtgctagggttttctcg1440

tatgagtttctgagacagagagaagaacaaggcatgatccgtgataaatggatcgttgcc1500

aaggatctacctggcgaggtgcaatatacactagacttcccttggtatgcaagcttgcct1560

cgtgtagaggcaagaacctatctagatcaatatggtggtaaagatgacgtttggattgga1620

aagacactctacaggatgcctcttgtgaataacgacacatatctagagttggcaataagg1680

gatttcaaccattgccaagctctgcatcagcttgagtgtaatgggctgcaaacgtggtac1740

aaggataattgccttgacgcttttggagtagaaccacaagatgttttaagatcttacttt1800

ttagctgctgcttgcatttttgaacctagccgtgctgctgagcggcttgcatgggctaga1860

acgtcaatgattgccaatgccatttctacacatcttcgtgacatttcggaagacaagaag1920

agattggaatgtttcgtgcactgtctctatgaagaaaacgatgtatcatggcttaaacga1980

aatcctaatgatgttattcttgagagggcacttcgaagattaattaacttattagcacaa2040

gaagcattgccaattcatgaaggacaaagattcatacacagtctattgagtcttgcatgg2100

accgaatggatgttgcaaaaggcaaataaagaagaaaacaaatatcacaaatgcagtggt2160

atagaaccacaatacatggttcatgataggcaaacatacttacttttagttcaggttatt2220

gagatttgtgctggacgaattggtgaggctgtgtcaatgataaacaacaaggataatgat2280

tggtttattcaactcacatgtgctacttgtgacagtcttaaccataggatgttactgtcc2340

caggatactatgaagaatgaagcaagaataaattggattgagaaggaaatcgagttgaat2400

atgcaagagcttgctcaatctctccttttgagatgtgatgagaaaactagcaataagaag2460

accaagaaaaccttatgggatgtcctaagaagtttatactatgctactcattccccacaa2520

catatgatcgatagacatgtttccagagttatctttgagcctgtttaa2568

<210>2

<211>855

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>

<400>2

metlysleuleuserproalaalaalaproserserserproleuphe

151015

proproargilevalglualaalaalaargglnserglyprocysarg

202530

ileargileargileargglylysalaalaalaalaglyglyglygly

354045

glyalaglyalathrglyproargglyserleuargleualaglytrp

505560

trpargalaglnglnglnalaproalathralathrthrthrglngln

65707580

proaspasnvalserseralalysvalpheglnthrserargvalglu

859095

thrglusergluilealalystrpproglylysproglnaspleuglu

100105110

aspgluhisglnalagluglualagluleuglnproleuileaspgln

115120125

valargalametleuargsermetasnaspglyaspthrseralaser

130135140

alatyraspthralatrpvalalametvalprolysvalglyglyasp

145150155160

glyglyalaglnproglnpheproalathrvalargtrpilevalasp

165170175

hisglnleuproaspglysertrpglyaspseralaleupheserala

180185190

tyraspargmetileasnthrleualacysvalvalalaleuthrlys

195200205

trpserleugluproalaargcysglualaglyleuserpheleuhis

210215220

gluasnmettrpargleualaglugluglualaglusermetproile

225230235240

glyphegluilealapheproserleuileglnthralaargaspleu

245250255

glyvalvalasppheprotyrglyhisproalaleuglnseriletyr

260265270

alaasnarggluvallysleulysargileproargaspmetmethis

275280285

argvalprothrserileleuhisserleugluglymetproaspleu

290295300

asptrpproargleuleuasnleuglnsercysaspglyserpheleu

305310315320

pheserproseralathralatyralaleumetglnthrglyasplys

325330335

lyscyspheglutyrileaspargilevallyslyspheasnglygly

340345350

valproasnvaltyrprovalaspleuphegluhisiletrpvalval

355360365

aspargleugluargleuglyileserargtyrpheglnarggluile

370375380

gluglncysmetasptyrvalasnarghistrpthrgluaspglyile

385390395400

cystrpalaarglysserasnvallysaspvalaspaspthralamet

405410415

alapheargleuleuargleuhisglytyrasnvalserproserval

420425430

phelysasnpheglulysaspglygluphephecysphevalglygln

435440445

serthrglnalavalthrglymettyrasnleuasnargalasergln

450455460

ileserpheglnglygluaspvalleuhisargalaargvalpheser

465470475480

tyrglupheleuargglnargglugluglnglymetileargasplys

485490495

trpilevalalalysaspleuproglygluvalglntyrthrleuasp

500505510

pheprotrptyralaserleuproargvalglualaargthrtyrleu

515520525

aspglntyrglyglylysaspaspvaltrpileglylysthrleutyr

530535540

argmetproleuvalasnasnaspthrtyrleugluleualailearg

545550555560

asppheasnhiscysglnalaleuhisglnleuglucysasnglyleu

565570575

glnthrtrptyrlysaspasncysleuaspalapheglyvalglupro

580585590

glnaspvalleuargsertyrpheleualaalaalacysilepheglu

595600605

proserargalaalagluargleualatrpalaargthrsermetile

610615620

alaasnalaileserthrhisleuargaspilesergluasplyslys

625630635640

argleuglucysphevalhiscysleutyrglugluasnaspvalser

645650655

trpleulysargasnproasnaspvalileleugluargalaleuarg

660665670

argleuileasnleuleualaglnglualaleuproilehisglugly

675680685

glnargpheilehisserleuleuserleualatrpthrglutrpmet

690695700

leuglnlysalaasnlysglugluasnlystyrhislyscyssergly

705710715720

ilegluproglntyrmetvalhisaspargglnthrtyrleuleuleu

725730735

valglnvalilegluilecysalaglyargileglyglualavalser

740745750

metileasnasnlysaspasnasptrppheileglnleuthrcysala

755760765

thrcysaspserleuasnhisargmetleuleuserglnaspthrmet

770775780

lysasnglualaargileasntrpileglulysgluilegluleuasn

785790795800

metglngluleualaglnserleuleuleuargcysaspglulysthr

805810815

serasnlyslysthrlyslysthrleutrpaspvalleuargserleu

820825830

tyrtyralathrhisserproglnhismetileasparghisvalser

835840845

argvalilephegluproval

850855

当前第1页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1