本申请根据35u.s.c.§119(e)要求提交日为2016年11月18日的美国临时专利申请u.s.s.n.62/423,862的优先权，将其整体内容通过引用并入本申请。
本申请提供4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈及制备方法.
背景技术：
美国专利申请序列号62/163,106特别描述了某些金属酶抑制剂化合物及其作为杀真菌剂的用途。本申请的公开内容明确地通过引用并入本申请。该专利申请描述了产生抑制金属酶的杀真菌剂的各种途径。可以有利的是提供较为直接和有效的制备金属酶抑制杀真菌剂和相关化合物的方法，例如通过使用提供改善的时间和成本效率的试剂和/或化学中间体制备。
技术实现要素：
本申请提供化合物4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(i)及其制备方法。在一种实施方式中，本申请提供制备式i化合物的方法：
所述方法包括将式ii化合物与原甲酸三烷基酯接触。
在一种实施方式中，式ii化合物可以如下制备：将式iii化合物与酸接触。
本申请的另一方面是在本申请方法中制备的新型中间体，即，包括以下物质的化合物：
术语"卤素"或"卤代"是指一种或多种卤素原子，其定义为f、cl、br和i。
术语"有机金属"是指包含金属的有机化合物，特别是其中金属原子直接键合至碳原子的化合物。
室温(rt)在本申请定义为约20℃至约25℃。
在整个公开内容中，提及式i-iii化合物理解为也包括光学异构体和盐。具体地，当式i-iii化合物包含手性碳时，应理解这些化合物包括其光学异构体和消旋体。示例性盐可包括：盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐等。
该文件中公开的某些化合物可以作为一种或多种异构体存在。本领域技术人员将会理解，一种异构体可以比其它异构体更具活性。为清楚起见，本申请中公开的结构仅以一种几何形式绘制，但意在代表分子的所有几何形状和互变异构形式。例如，式i和ia的化学结构是相同分子的互变异构形式。
上述实施方式意在仅仅是示例性的，并且本领域技术人员将会认识到或将能够确定使用不超过常规的实验，特定方法、材料和步骤的众多等同物。所有这样的等同物都认为在本发明的范围内，并且为所附权利要求所涵盖。
具体实施方式
4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(i)为本申请所提供并且可以由1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(ii)如实施例1中所示制备。
实施例1：制备4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(i)
1a：向1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(ii,0.46g,0.936mmol)中加入原甲酸三乙酯(3.12ml,18.72mmol)，将反应混合物在100℃加热5h。将反应冷却至室温，用乙酸乙酯稀释，并且用饱和氯化铵洗涤，然后用饱和碳酸氢钠洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥，过滤，浓缩。将粗制物质溶解在二氯甲烷中并且通过硅胶柱色谱用0-50％乙酸乙酯/己烷作为洗脱剂进行纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(i)，为白色泡沫状物(327.6mg,0.653mmol,70％收率)。1hnmr(400mhz,cdcl3)δ8.44(d,j＝2.7hz,1h),7.72-7.65(m,2h),7.62(s,1h),7.58(d,j＝8.6hz,1h),7.50-7.36(m,2h),7.10-7.02(m,2h),6.80(ddd,j＝11.5,8.6,2.6hz,1h),6.76-6.69(m,1h),5.93(s,1h),5.31-5.21(m,2h)。19fnmr(376mhz,cdcl3)δ-103.15(ddd,j＝31.2,23.4,9.4hz),-108.46(d,j＝29.1hz),-109.02(d,j＝23.2hz),-109.39(d,j＝9.2hz)。esimsm/z502.0[(m+h)+]。
1b：向在乙腈(2.5ml)中的1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(0.25g,0.509mmol)加入原甲酸三乙酯(0.212ml,1.272mmol)，将反应在80℃加热5h。加入另外的原甲酸三乙酯(0.07ml)，将反应在80℃保持另外17h，形成白色浆液。使得反应冷却至室温，将固体通过过滤分离，得到4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(94.3mg,0.181mmol,35.5％收率)。分析数据与1a中制备产物的数据相匹配。
1c：向1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(0.5g,1.017mmol)加入原甲酸三甲酯(2.25ml,20.35mmol)，将反应在95℃加热6h。将反应混合物直接加载至硅胶柱体上并且通过正相色谱(0-55％etoac/己烷)纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈，为白色泡沫状物(380mg,0.606mmol,59.6％收率)。分析数据与1a中制备产物的数据相匹配。
1d：向1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(0.5g,1.017mmol)加入原甲酸三异丙酯(2.27ml,10.17mmol)，将反应在100℃加热17h。将反应直接加载至硅胶柱体上并且通过正相色谱(0-55％etoac/己烷)纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(400mg,0.798mmol,78％收率)。分析数据与1a中制备产物的数据相匹配。
1e：向1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(0.5g,1.017mmol)加入原甲酸三丙酯(2.19ml,10.17mmol)，将反应在100℃加热2h。将反应直接加载至硅胶柱体上并且通过正相色谱(0-55％etoac/己烷)纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到4-((6-(2-(2,4-二氟苯基)-1,1-二氟-2-羟基-3-(5-巯基-1h-1,2,4-三唑-1-基)丙基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(350mg,0.689mmol,68.6％收率)。分析数据与1a中制备产物的数据相匹配。
实施例1中示例的方法可以在约50℃和约150℃之间用选自如下的原甲酸三烷基酯进行：原甲酸三乙酯、原甲酸三甲酯、原甲酸三丙酯和原甲酸三异丙酯。
可用于该方法步骤的溶剂包括但不限于四氢呋喃(thf)、甲苯、环戊基甲基醚(cpme)、乙腈及其混合物。在某些实施方式中，该方法可以在纯原甲酸三烷基酯中进行而不用添加溶剂。
1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(ii)可以由2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iii)如实施例2中所示制备。
实施例2：制备1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(ii)
向2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iii；2g,3.38mmol)在甲醇(16.90ml)中的浆液加入氯化氢(4m，在二氧六环中；4.23ml,16.90mmol)，将反应在50℃加热1h，其后将反应用饱和碳酸氢钠淬灭，并且用乙酸乙酯萃取。将有机层用水和盐水洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，浓缩，得到黄色泡沫状物(1.65g)。将粗制物质溶解在二氯甲烷中并且通过硅胶柱色谱使用0-40％乙酸乙酯/己烷作为洗脱剂进行纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到1-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-硫代甲酰胺(ii)，为白色泡沫状物(1.38g,2.81mmol,83％收率)。1hnmr(400mhz,cdc13)δ8.33(d,j＝2.7hz,1h),7.74-7.62(m,3h),7.56(d,j＝8.6hz,1h),7.39(dd,j＝8.7,2.7hz,1h),7.08-7.00(m,2h),6.90-6.75(m,2h),6.49(s,1h),5.25(d,j＝15.5hz,1h),4.89(d,j＝15.5hz,1h)。19fnmr(376mhz,cdcl3)δ-104.41(t,j＝26.1hz),-108.49(d,j＝77.7hz),-109.07(d,j＝8.9hz)。esimsm/z492.1[(m+h)+]。
实施例2中示例的方法可以在约25℃和约75℃之间用选自包括以下物质的组的酸进行：盐酸(hcl)、氢溴酸(hbr)、三氟乙酸(tfa)和硫酸(h2so4)。
可用于该方法步骤的溶剂包括但不限于甲醇、乙醇、异丙醇、四氢呋喃、二氧六环及它们的混合物。
2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸酯(iii)可以由2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iv)如实施例3中所示制备。
实施例3：制备2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iii)
方法a：在0℃向在thf(31.3ml)中的2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iv)(5g,9.39mmol)加入异硫氰酸苯甲酰酯(1.199ml,8.92mmol)。30min后，加入另外的异硫氰酸苯甲酰酯(0.1ml,0.74mmol)。苯甲酰基中间体通过lcms鉴定(esimsm/z696.1[(m+h)+])。另外30min后，加入无水肼(1.47ml,46.9mmol)。将混合物在0℃搅拌1h，然后在室温搅拌30min。将反应用乙酸乙酯稀释并且用饱和氯化铵洗涤。将有机层用无水硫酸钠干燥，过滤，浓缩，得到淡黄色油状物。将甲醇(25ml)加入到油状物中，搅拌几分钟后，形成白色沉淀物。将浆液过滤，将固体用甲醇漂洗，得到2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iii)(4.29g,7.25mmol,77％收率)，为白色固体。1hnmr(400mhz,dmso-d6)δ8.76(s,1h),8.45(d,j＝11.9hz,2h),7.96-7.86(m,2h),7.70(dd,j＝8.6,2.8hz,2h),7.58(d,j＝8.4hz,1h),7.537.40(m,1h),7.22-7.15(m,2h),7.12(t,j＝11.0hz,1h),7.01(d,j＝8.8hz,1h),6.37(s,1h),5.45(d,j＝15.7hz,1h),4.47(d,j＝15.3hz,1h),1.40(s,9h)。19fnmr(376mhz,dmso-d6)δ-104.72(d,j＝122.8hz),-107.49--109.12(m),-111.08--111.85(m)。esimsm/z592.2[(m+h)+]。
方法b：向2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iv,1g,1.596mmol)在乙酸乙酯(9.4ml)中的溶液加入异硫氰酸根合三甲基硅烷(0.540ml,3.83mmol)，将反应在80℃搅拌18h。nmr表明转化不完全，因此加入另外的异硫氰酸根合三甲基硅烷(0.540ml,3.83mmol)，将反应在80℃搅拌6h。nmr表明反应仍不完全，因此加入更多的异硫氰酸根合三甲基硅烷(0.540ml,3.83mmol)，将反应80℃在搅拌17h。使得反应冷却至室温，加入1nhcl(10ml)。分离各相，有机层用无水硫酸钠干燥，过滤，浓缩，得到黄色泡沫状物。将黄色泡沫状物溶解在二氯甲烷中，并且通过硅胶柱色谱用0-60％乙酸乙酯/己烷洗脱进行纯化。收集包含级分的产物，浓缩，得到2-氨基硫代甲酰基-2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iii)，为黄色泡沫状物(460mg,0.778mmol,49％收率)。分析数据与先前得到样品的数据一致。
用于该方法步骤的有机异硫氰酸酯可包括，异硫氰酸酰基酯例如异硫氰酸苯甲酰酯，和异硫氰酸甲硅烷酯例如异硫氰酸三甲基甲硅烷酯。
用于除去来自未分离的中间体的r基团(其中r是苯甲酰基)以制备式iii化合物的裂解试剂可以选自包括以下物质的组：肼、氨、甲醇钠和甲胺。用于除去来自未分离的中间体的r基团(其中r是三甲基甲硅烷基)以制备式iii化合物的裂解试剂可以选自：a)氟化物化合物，例如四烷基氟化铵和氟化钾，和b)酸，例如盐酸(hcl)、氢溴酸(hbr)或硫酸(h2so4)。
式iv化合物与有机异硫氰酸酯的接触可以在约-20℃和约100℃之间进行，式iv化合物与裂解试剂的接触可以在约-20℃和约100℃之间进行。
在该方法步骤中使用的溶剂可包括以下物质中的一种或多种：thf(四氢呋喃)、etoac、2-me-thf、二氧六环、mecn(乙腈)和dme(1,2-二甲氧基乙烷)。
2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(ii)可以由4-((6-((2-(2,4-二氟苯基)环氧乙烷-2-基)二氟甲基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(iii)如实施例2中所示制备。
实施例4：制备2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iv)
向在乙醇(40ml)中的4-((6-((2-(2,4-二氟苯基)环氧乙烷-2-基)二氟甲基)吡啶-3-基)氧基)苄腈(v)(5g,12.49mmol)的浆液加入肼基甲酸叔丁酯(4.13g,31.2mmol)，将反应在80℃加热24h，此时起始的环氧化物(v)完全耗尽。使得反应冷却至45℃并且用产物iv的晶体接种，导致反应呈现浑浊。加入另外的乙醇(40ml)，将反应冷却至室温过夜。将所得浆液用冰浴冷却30min，过滤。将固体用乙醇(30ml)漂洗和在真空下干燥，得到2-(3-(5-(4-氰基苯氧基)吡啶-2-基)-2-(2,4-二氟苯基)-3,3-二氟-2-羟基丙基)肼-1-甲酸叔丁酯(iv)，为白色固体(5.42g,9.67mmol,77％收率)。1hnmr(400mhz,cdcl3)δ8.37(d,j＝2.7hz,1h),7.72-7.64(m,2h),7.55(td,j＝8.8,6.6hz,1h),7.48(d,j＝8.6hz,1h),7.37(dd,j＝8.7,2.7hz,1h),7.10-7.02(m,2h),6.77(dddd,j＝20.9,11.4,8.6,2.6hz,2h),3.83(d,j＝13.7hz,1h),3.74(dd,j＝13.4,2.8hz,1h),1.41(s,9h)。19fnmr(376mhz,cdcl3)δ-105.15,-108.68(d,j＝22.1hz),-109.24,-110.29。esimsm/z533.1[(m+h)+]。
式v化合物与肼基甲酸叔丁酯的接触可以在约25℃至约100℃或约60℃至约90℃进行。
在该方法步骤中使用的溶剂可包括醇，例如甲醇、乙醇和异丙醇；以及非质子溶剂，例如thf(四氢呋喃)、乙腈、dmso(二甲亚砜)、dmf(n,n-二甲基甲酰胺)；以及这些溶剂中任一种的混合物。