本发明属于细胞工程和基因工程技术领域,特别涉及一种zeb1在人心脏成纤维细胞中的应用。
背景技术
心肌梗死状动脉的血液流动不畅,心肌长时间缺氧、缺血而导致的局部心肌坏死。在心肌梗死发生的早期,细胞外基质合成和沉积能加强心脏的收缩力,形成瘫痕防止心脏破裂,在一定程度上改善心脏功能;但是在疾病的后期,由于细胞外基质的合成过多,在心脏组织中大量积累,导致心肌纤维化的发生。心脏成纤维细胞在心肌纤维化过程中大量增殖,同时分化为肌成纤维细胞,肌成纤维细胞合成大量胶原等成分堆积于心肌间,致使心肌组织中胶原纤维降解异常、各种胶原比例失衡和间质与血管周围的蛋白积累过度。因此,心脏成纤维细胞是心肌纤维化过程的重要效应细胞,它的功能改变能影响心肌纤维化进程。
锌指e盒结合的同源盒蛋白1(zincfingere-boxbindinghomeobox1,zeb1)位于人染色体10p11.2上,是非常重要的一种细胞核转录因子。tgf-β是重要的致纤维化因子,zeb1的基因结构上含有一个能与smad蛋白结合的区域,可与磷酸化的smad蛋白结合,从而促进tgf-β的活化转录。此结果说明,zeb1可能参与调控器官的纤维化过程。研究发现在肝纤维化的大鼠模型中静脉注射重组zeb1蛋白,he和masson染色结果显示,炎症与肝纤维化程度有所加重,纤维间距变宽,并且tgf-β表达水平上调,这些结果说明了zeb1也许可以通过激活化某些途径促进tgf-β的转录进而促进大鼠肝纤维化进程。
微小核糖核酸(microrna,mirna)是一类内源性非编码单链小分子rna,长度约为22个核苷酸,可通过与信使核糖核酸(messengerribonucleicacid,mrna)的3′非翻译区(untranslatedregion,utr)不同程度的互补配对,诱导靶基因mrna降解或抑制翻译,从而在转录后水平调控靶基因的表达。
技术实现要素:
为了克服现有技术的缺点与不足,本发明的首要目的在于提供一种zeb1在人心脏成纤维细胞中的应用。以确定zeb1对人心脏成纤维细胞功能的调节作用。
通过基因工程技术改变zeb1基因在成纤维细胞的表达量,进而影响成纤维细胞增殖、迁移、胶原合成与分化;通过生物信息学软件预测该基因靶向的mirna,研究该mirna的功能,来达到zeb1在人心脏成纤维细胞中应用的目的。
本发明的另一目的在于提供抑制zeb1基因的小干扰rna片段(sirna)。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
本发明提供一种zeb1在人心脏成纤维细胞中的应用。
本发明提供抑制zeb1基因的sirna,序列如下:
si-zeb1-1:5'-ggcaaguguuggagaauaa-3';
si-zeb1-2:5'-ccagaaauacacaggguua-3';
si-zeb1-3:5'-ggacagcacaguaaaucua-3';
本发明提供靶向zeb1基因的mirna,序列如下:
mir-590-3p:5'-uaauuuuauguauaagcuagu-3';
在心脏成纤维细胞中补充抑制zeb1基因的小干扰rna片段后,能回复由mir-590-3p引起的细胞功能表型。
验证结果如下:
1、合成3对干扰zeb1基因的小片段/对照(si-zeb1/si-zeb1-nc),转染干扰小片段到成纤维细胞中(转染浓度为50nm),qrt-pcr检测其干扰效率,最终确定干扰效果较好的si-zeb1-2小片段进行后续实验。
si-zeb1-1:5'-ggcaaguguuggagaauaa-3';
si-zeb1-2:5'-ccagaaauacacaggguua-3';
si-zeb1-3:5'-ggacagcacaguaaaucua-3';
2、干扰zeb1基因小片段(si-zeb1-2)转染心脏成纤维细胞,研究其对人心脏成纤维细胞增殖、迁移、分化与胶原合成的应用。通过edu法、transwell、qrt-pcr与westernblotting分别检测zeb1受到si-zeb1-2小片段干扰后心脏成纤维细胞增殖、迁移、分化与胶原合成情况,发现zeb1促进纤维细胞增殖与迁移,促进心脏成纤维细胞分化为肌成纤维细胞与合成ⅰ型与ⅲ型胶原。
3、通过targetscan、miranda、rnahybrid3个生物信息学软件预测调控zeb1的mirna,发现zeb1的3'utr区含有mir-590-3p结合位点,分别扩增zeb1的野生型3'utr区及与mir-590-3p种子区结合位点突变的突变型3'utr区,并将其连接到pmirglo真核表达载体中,通过双荧光素酶报告基因系统检测,发现zeb1野生型(wt-zeb1)3'utr上游报告基因活性受到mir-590-3p调控而表达量下降,而zeb1突变型(mut-zeb1)3'utr上游报告基因活性不受mir-590-3p调控。通过qrt-pcr与westernblotting验证,zeb1在蛋白水平受mir-590-3p调控(mir-590-3pmimic的转染浓度为25nm)。
4、zeb1回复mir-590-3p的功能验证。在心脏成纤维细胞中共转染mir-590-3pinhibitor与si-zeb1-2后,检测能否回复由mir-590-3p引起的细胞迁移改变。通过transwell检测结果显示,mir-590-3pinhibitor的促细胞迁移功能可以被si-zeb1-2回复。
本发明以zeb1为研究对象,采用细胞生物学方法研究其在人心脏成纤维细胞中的应用。关键点和欲保护点:(1)zeb1在人心脏成纤维细胞增殖、迁移、分化与胶原合成中的应用;(2)通过靶基因回复验证,即在心脏成纤维细胞中补充抑制zeb1基因的小干扰rna片段(si-zeb1-2)后,验证能否回复由mir-590-3p引起的细胞功能表型。
成纤维细胞的增殖、迁移、分化与合成胶原的能力是影响心肌纤维化的重要机制,本发明第一次证实zeb1在人心脏成纤维细胞中的应用。本发明补充si-zeb1-2能够回复由mir-590-3p引起的细胞功能表型,进一步表明zeb1在成纤维细胞中是mir-590-3p的一个重要功能靶标,mir-590-3p可以通过zeb1来调节人心脏成纤维细胞的功能。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:
本发明以zeb1为研究对象,合成zeb1干扰小片段,转染心脏成纤维细胞,发现zeb1促进心脏成纤维细胞增殖、迁移、分化与胶原合成,还通过控制其表达的mir-590-3p在心脏成纤维细胞中的功能来进行研究;本发明干扰zeb1后,验证能够回复由mir-590-3p引起的细胞功能表型,表明zeb1在心脏成纤维细胞中是mir-590-3p的一个重要功能靶标,mir-590-3p可通过zeb1来调节成纤维细胞的功能。本发明通过zeb1和其靶向的mirna在心脏成纤维细胞的应用,对于研究心肌梗死后的纤维化机制具有很好的应用价值。
附图说明
图1是qrt-pcr检测3对zeb1干扰小片段的干扰效率结果图。
图2是zeb1干扰小片段(si-zeb1-2)调控心脏成纤维细胞增殖。
图3是zeb1干扰小片段(si-zeb1-2)调控心脏成纤维细胞迁移。
图4是zeb1干扰小片段(si-zeb1-2)调控心脏成纤维细胞分化标志基因α-sma在心脏成纤维细胞中的表达;其中图4a是qrt-pcr结果;图4b是westernblotting结果。
图5是zeb1干扰小片段(si-zeb1-2)调控心脏成纤维细胞胶原合成标志基因col1a1、col3a1在心脏成纤维细胞中的表达;其中图5a是qrt-pcr结果;图5b是westernblotting结果。
图6是验证mir-590-3p靶向zeb1;其中图6a、图6b、图6c分别表示双荧光报告基因验证、qrt-pcr和westernblotting验证。
图7是zeb1回复mir-590-3p抑制心脏成纤维细胞迁移的结果。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。
为了使本发明的目的、技术方案和有益技术效果更加清晰,以下结合实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解的是,本说明书中描述的实施例仅仅是为了解释本发明,并非为了限定本发明,实施例的参数、比例等可因地制宜做出选择而对结果并无实质性影响。实施例中除特殊说明外,均为本领域常规试剂和方法步骤。
实施例1人心脏成纤维细胞的培养
本实验所用的细胞模型人心脏成纤维细胞来自来自美国sciencellresearchlaboratories。所用培养基为美国sciencellresearchlaboratories提供的心脏成纤维细胞培养基(fibroblastmedium-2)。
(1)实验前准备:a.打开水浴锅,调节温度35.8~37℃;b.超净台开紫外灭菌30min。
(2)从液氮中取出冻存管,迅速浸入37℃水浴锅中,并不时摇动使其尽快融化。
(3)从37℃水浴锅中取出冻存管,外部喷洒75%酒精后转移到超净台,小心打开盖子,用移液枪吸出细胞悬液,加到离心管并滴加10倍以上培养液,混匀。
(4)1000rpm,离心5min。
(5)弃上清,加入完全培养基重悬细胞,接种细胞培养瓶,37℃5%co2培养箱静置培养。
(6)24h后更换新的完全培养基,继续培养。
实施例2人心脏成纤维细胞的接种和转染
(1)镜下观察心脏成纤维细胞汇合度达到90%时,弃培养基,用预热的含1%双抗(双抗为青霉素和链霉素)的pbs清洗细胞两次;
(2)预热的0.25%胰酶加入培养瓶,放入培养箱中静置2min,显微镜下观察到细胞大部分细胞飘起时,加入终止液(10%fbs的dmem)终止消化。
(3)用枪头轻轻吹打细胞,制成细胞悬液,转移至15ml离心管,1000rpm离心5min。
(4)适量pbs清洗细胞两次。
(5)适量完全培养基重悬细胞沉淀,细胞计数后,均匀分布到每一个孔中,补足完全培养基至推荐的体积,放入培养箱中继续培养。
(6)24h左右观察细胞形态及汇合度,细胞形态良好且汇合度达到70%~90%时,可以用于转染。本发明取第3或第四代传代的心脏成纤维细胞进行转染,转染步骤参照invitrogen公司的
(7)转染后,细胞在37℃,5%co2培养箱中继续培养;
(8)根据实验目的,在转染后的2~4d收集细胞。
实施例3qrt-pcr
(1)冷pbs清洗贴壁细胞2~3次,倾斜细胞培养皿,吸净pbs,加入1ml的trizol,静置5min,直至镜下观察到细胞全部裂解后,用枪头吹打均匀并转移到1.5mlrnase-freeep管。
(2)每管加入200μl预冷氯仿(trizol组织液:氯仿为5:1),剧烈震荡15~30s,冰上放置5min后,12000rpm,4℃,离心15min;液体分三层:上层为无色的rna,中层为含有酚-氯仿的白色水相,下层为浅红色。小心吸取上层无色液相(避免触及中间相)。将上层液相(约300μl)移入新的1.5mlep管中,加入等量异丙醇溶液(300μl),轻轻上下颠倒摇匀10次,冰上静置10min。12000rpm,4℃,离心10min。
(3)弃上清、留沉淀,沿管壁加入预冷的1ml75%乙醇-depc以洗涤rna,12000rpm,4℃,离心5min后尽量去上清。
(4)将液体吸干,室温自然干燥5~10min,同时避免rna沉淀干燥过度。
(5)根据沉淀量,加入30~50μl的depc水以溶解rna沉淀。分光光度计测定rna浓度和纯度。
逆转录反应采用takara公司的primescripttmrtmastermix(perfectrealtime)kit。qrt-pcr分别采用thermo公司的sybrgreenqrt-pcrmastermix(2x),roxsolutionprovidedmix。以2-△△ct法计算mrna与mirna的相对表达量。
本发明所用到的qrt-pcr引物为:
qrt-pcr-α-smaforward:5'-gacaatggctctgggctctgtaa-3';
reverse:5'-ctgtgcttcgtcacccacgta-3';
qrt-pcr-col1a1forward:5'-cccgggtttcagagacaacttc-3';
reverse:5'-tccacatgctttattccagcaatc-3';
qrt-pcr-col3a1forward:5'-aatcaggtagacccggacga-3';
reverse:5'-tcgagcaccgtcattaccc-3'。
qrt-pcr-gapdhforward:5'-ggatttggtcgtattggg-3';
reverse:5'-ggaagatggtgatgggatt-3';
qrt-pcr-zeb1forward:5'-aacgcttttcccattctggc-3';
reverse:5'-ttgccgtatctgtggtcgtg-3';
实施例4westernblotting
(1)人心脏成纤维细胞总蛋白的提取
细胞转染后48h,用pbs清洗细胞3次,6孔板细胞每孔加入100~200μl蛋白裂解液进行蛋白质裂解,细胞裂解液转移到1.5mlep管中。12000rpm,4℃离心15min,取上清至新的1.5mlep管中,低温保存防止蛋白降解。
(2)sds-page电泳
bca法蛋白样品初步定量后,每组取20μg总蛋白和5×上样缓冲液按5:1混合,煮沸5min。sds-page电泳至溴酚蓝刚出胶底部止。
(3)转膜
甲醛浸泡聚偏二氟乙烯膜(pvdf膜)5min,清水冲洗后与吸附滤纸一起用转膜液浸泡。从正极开始依次按照吸附滤纸(4张)-凝胶-pvdf膜-吸附滤纸(4张)顺序叠放,合上负极。装入电泳槽中。转膜过程在冰上进行,恒流300ma,根据目的蛋白不同选择转膜时间。
(4)蛋白检测与结果分析
转膜完成后,将膜放入1×tbst中漂洗,用5%脱脂奶粉室温下封闭2h。1×tbst洗膜,用抗体稀释液稀释所需抗体,4℃孵育过夜。回收一抗(zeb1一抗;α-sma一抗;col1a1一抗;col3a1一抗;上述4个一抗均为常规市售产品),1×tbst洗膜。室温孵育二抗(二抗:辣根过氧化物酶标记山羊抗兔igg-hrp,购置美国santacruz公司)2h。1×tbst洗膜。用ecl化学发光法进行检测,用bio-rad曝光系统曝光并采集图片。使用imagej进行电泳条带灰度值测定。
实验例5心脏成纤维细胞增殖实验
本发明中edu细胞增殖实验参照广州市锐博生物科技有限公司的cell-lighttmeduapollo567invitrokit进行。具体步骤如下(以96孔板为例):
(1)用细胞培养基按1000:1的比例稀释edu溶液,制备适量浓度为50μm的edu培养基;
(2)每孔加入100μl浓度为50μm的edu培养基孵育2h,弃培养基;
(3)pbs清洗细胞1~2次,每次5min;
(4)每孔加入50μl细胞固定液(含4%多聚甲醛的pbs)室温孵育30min,弃固定液;
(5)每孔加入50μl浓度为2mg/ml甘氨酸,脱色摇床孵育5min后,弃甘氨酸溶液;
(6)每孔加入100μl的pbs,脱色摇床清洗5min,弃pbs;
(7)每孔加入100μl的1×apollo染色反应液,避光、室温、脱色摇床孵育30min后,弃染色反应液;
(8)加入100μl渗透剂(0.5%tritonx的pbs)脱色摇床清洗2~3次,每次5min,弃渗透剂;
(9)用去离子水按100:1的比例稀释试剂f,制备适量1×hoechst3342反应液,避光保存;
(10)每孔加入100μl的1×hoechst3342反应液,避光、室温、脱色摇床孵育30min后,弃染色反应液;
(11)每孔加入150μl的pbs清洗1~3次;
(12)每孔加入100μl的pbs保存待用;
(13)染色完成后,用荧光显微镜进行照片采集。
实验例6心脏成纤维细胞迁移实验
本发明使用试剂耗材:transwell细胞培养板(bd,ref353097)
(1)将细胞培养板放置于室温,pbs润洗培养板内细胞2次,去除培养板内pbs;
(2)加入不含edta的胰酶消化细胞,用100μl无血清细胞培养基重悬细胞,计数1×105个细胞,加入transwell细胞培养板的小室上室,下室加入600μl完全培养基;
(3)在37℃,5%co2孵育12~48h,取出小室,用棉签擦去上室的细胞,4%多聚甲醛固定细胞20min,pbs洗涤一次,结晶紫染色10min,pbs洗涤一次,显微镜下观察细胞是否穿过小孔,并拍照统计。
实验例7荧光素酶报告基因活性检测
按照promega公司的dual-
(1)5×plb室温解冻后,使用ddh2o按1:4的比例将其稀释成1×plb;
(2)移液枪吸出培养基。沿孔壁慢慢地加入200μl的pbs,轻轻晃动培养板,吸除pbs,此pbs清洗步骤重复两遍,全程注意动作轻柔,防止将细胞吸走;
(3)每孔加入100μl的1×plb;摇床上孵育10min,使细胞充分裂解;
(4)将裂解的细胞取75μl转移到96孔酶标板中,每孔加入75μl的larⅱ溶液,混匀后,摇床孵育10min;检测fireflyluciferase荧光强度;
(5)再加入75μl的stop&glo溶液,混匀后,摇床孵育10min;检测ranillaluciferase荧光强度;
(6)fireflyluciferase与ranillaluciferase的比值即为萤火虫荧光素酶相对活性。(每个组4个重复)。
结果分析:
1、合成3对干扰zeb1基因小片段/对照(si-zeb1/si-zeb1-nc),利用qrt-pcr手段,检测上述片段转染到心脏成纤维细胞之后在细胞中的表达情况(转染浓度为50nm)。结果如图1所示,选择干扰效率最好的si-zeb1-2进行后续实验。后续统一将si-zeb1-2与si-zeb1-nc书写成sizeb1与nc。
si-zeb1-1:5'-ggcaaguguuggagaauaa-3';
si-zeb1-2:5'-ccagaaauacacaggguua-3';
si-zeb1-3:5'-ggacagcacaguaaaucua-3';
上述干扰小片段由广州市锐博生物科技有限公司合成。
2、sizeb1转染到心脏成纤维细胞后,研究靶基因zeb1对心脏成纤维细胞功能的应用。edu结果如图2所示,sizeb1抑制心脏成纤维细胞增殖,即zeb1能够促进心脏成纤维细胞增殖。transwell结果如图3所示,sizeb1抑制心脏成纤维细胞迁移,即zeb1能够促进心脏成纤维细胞迁移。
3、sizeb1转染到心脏成纤维细胞后,qrt-pcr与westernblotting验证靶基因zeb1对心脏成纤维细胞分化标志基因α-sma的作用,结果如图4所示,与对照相比,sizeb1显著抑制α-sma在mrna与蛋白的表达,即zeb1能够促进心脏成纤维细胞中α-sma的mrna与蛋白的表达。
4、qrt-pcr与westernblotting验证靶基因zeb1对心脏成纤维细胞胶原合成标志基因col1a1与col3a1的作用,结果如图5所示,与对照相比,sizeb1显著抑制col1a1与col3a1在mrna与蛋白的表达,即zeb1能够促进心脏成纤维细胞中col1a1与col3a1的mrna与蛋白的表达。
5、利用生物信息学软件预测调控zeb1的mirna,发现zeb1的3'utr中含有mir-590-3p结合位点,将zeb1野生型3'utr和含有种子序列突变的3'utr构建到真核表达载体pmirglo中,通过双荧光素酶报告系统分析,发现zeb1野生型(wt-zeb1)3'utr上游报告基因活性受到mir-590-3p调控而表达量下降,而突变型(mut-zeb1)载体上报告基因活性则不受mir-590-3p调控(mir-590-3pmimic转染浓度为25nm)。通过qrt-pcr与westernblotting验证,zeb1在翻译水平受mir-590-3p的调控(mir-590-3pmimic转染浓度为25nm,mir-590-3pinhibitor转染浓度为50nm),结果如图6所示。
6、zeb1回复mir-590-3p的功能验证。在心脏成纤维细胞同时共转染mir-590-3pinhibitor和sizeb1后,检测能否回复由mir-590-3p引起的细胞功能表型变化。通过transwell检测心脏成纤维细胞迁移情况,发现mir-590-3pinhibitor引起的促迁移功能可以被sizeb1回复,结果如图7所示。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110>华南农业大学
广东省实验动物监测所
<120>zeb1在人心脏成纤维细胞中的应用
<160>14
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>19
<212>rna
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<220>
<223>si-zeb1-1
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ggcaaguguuggagaauaa19
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<212>rna
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<400>2
ccagaaauacacaggguua19
<210>3
<211>19
<212>rna
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ggacagcacaguaaaucua19
<210>4
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<400>4
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