具有两个表达盒的猿猴腺病毒载体的制作方法

文档序号:21697889发布日期:2020-07-31 22:49阅读:598来源:国知局
具有两个表达盒的猿猴腺病毒载体的制作方法
序列表本申请含有已经以ascii形式电子提交且在此以其整体通过引用并入的序列表。所述ascii拷贝,在2018年10月11日创建,命名为vu66441a_wo_sl.txt,且大小为178,926字节。发明领域本发明处于重组腺病毒载体的领域中。本发明涉及包含两个表达盒的腺病毒载体。具体而言,本发明涉及猿猴腺病毒,诸如黑猩猩(chimp)腺病毒,其包含两个表达盒。发明背景重组腺病毒可用于基因疗法中且可用作疫苗。由于它们的大转基因容量和在各种靶标组织中实现高度有效基因转移的能力,人腺病毒已被广泛用于基因转移应用。然而,大多数人暴露于人腺病毒并发展对人腺病毒的免疫力。因此,需要有效地将分子递送至靶标并使预先存在的对人腺病毒血清型的免疫力的影响最小化的载体。猿猴腺病毒在这方面是有效的;它们与人病毒足够密切相关,以有效地诱导对递送的外源性抗原的免疫力,人对所述递送的外源性抗原几乎没有预先存在的免疫力或没有预先存在的免疫力。因此,基于猿猴腺病毒的病毒载体可以提供人来源的腺病毒载体用于开发基于核酸的疫苗的用途的替代方案。复制缺陷的腺病毒将其基因组递送至细胞的内部,并且因为它们不复制,所以不扩增转基因有效载荷。通常,e1基因被包含选择的启动子和对应于一个或多个目标基因的核酸序列的转基因盒替换,产生复制缺陷的重组病毒。在本领域中需要改进的重组腺病毒。发明概述本发明涉及猿猴腺病毒载体,其包含两个表达盒。具体而言,本发明涉及猿猴腺病毒,诸如黑猩猩(chimp)腺病毒,其包含两个表达盒。合适的黑猩猩腺病毒的实例包括chad155和chad83。本发明的腺病毒载体可用作免疫原性组合物的组分,其用于诱导受试者中的免疫应答,其在治疗中的使用方法和制造方法。术语“载体”是指含有或携带遗传物质且可以用于将外源基因引入生物体的试剂(诸如质粒或病毒)。本发明的腺病毒载体源自非人猿猴腺病毒,也称为“猿猴腺病毒”。优选地,本发明的猿猴腺病毒载体是猿猴腺病毒。本发明的腺病毒载体中的每个表达盒包含转基因和启动子。“转基因”是编码目标多肽的核酸序列,其与侧接所述转基因的载体序列异源。核酸编码序列以允许宿主细胞中的转基因转录、翻译和/或表达的方式可操作连接至调节组分。“启动子”是允许rna聚合酶的结合并指导基因的转录的核苷酸序列。通常,启动子位于靠近转录起始位点的基因的非编码区域中。在本发明的腺病毒载体中,所述第一表达盒被插入病毒的e1区域中,且所述第二表达盒被插入腺病毒载体的第二区域中。在本发明的包含两个表达盒的猿猴腺病毒载体中,所述第一表达盒被插入猿猴腺病毒载体的e1区域中,且所述第二表达盒被插入腺病毒载体的与载体复制相容的区域中。如果腺病毒载体基因组的区域的破坏不会影响腺病毒载体复制的能力,则认为该区域“与载体复制相容”。优选地,在本发明的腺病毒载体中,所述第一表达盒被插入病毒的e1区域中,且所述第二表达盒被插入腺病毒载体的e3、he1或he2区域中。如本领域中众所周知的,e3基因在转导的早期表达,以准备宿主细胞用于病毒复制。e3参与免疫调节。术语“he1”用于描述位于l5和e4的终止密码子之间的位点。术语“he2”已用于定义位于itr的末端和e4mrna的帽位点之间的位点。例如,在chad155腺病毒载体中:•he1chad155:在seqidno:1的bp34611和34612之间的插入位点。•he2chad155:在seqidno:1的bp37662和37663之间的插入位点。在另一个实例中,在chad83腺病毒载体中:•he1chad83:在seqidno:2的bp33535和33536之间的插入位点。•he2chad83:在seqidno:2的bp36387和36388之间的插入位点。当第一表达盒被插入腺病毒载体的e1区域中时,天然e1区域被缺失。为了增加载体的克隆容量,可以从腺病毒载体除去天然e3区域。在其中第二表达盒被插入e3区域中的本发明的实施方案中,或在其中第二表达盒不被插入e3区域中的实施方案中,可以从腺病毒载体缺失天然e3区域。he1或he2位点中的插入不需要缺失载体骨架的任何特定序列。优选地,第二表达盒被插入腺病毒载体的he1或he2区域中。最优选地,第二表达盒被插入腺病毒载体的he2区域中。在一个实施方案中,从腺病毒载体缺失天然e3区域以增加载体的克隆容量,并且第二表达盒被插入腺病毒载体的he1或he2区域中。在本发明的实施方案中,所述腺病毒载体的第一表达盒可以包含人cmv启动子或增强的人cmv启动子,和/或所述第二表达盒可以包含人cmv启动子或增强的人cmv启动子。在一个优选实施方案中,所述第一和第二表达盒包含不同的启动子。例如,在一个实施方案中,所述第一表达盒可以包含人cmv启动子,且所述第二表达盒可以包含增强的人cmv启动子(反之亦然)。在本发明的一个方面,提供了本发明的腺病毒载体,其中所述第一表达盒被插入病毒的e1区域中,且所述第二表达盒被插入腺病毒载体的与载体复制相容的区域中,其中所述第一和第二表达盒中的至少一个包含增强的cmv启动子。在一些实施方案中,所述增强的hcmv启动子可以包括与seqidno:6具有至少约90%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或更多序列同一性的核酸序列。在一些实施方案中,所述启动子包含seqidno:6的核酸序列或由其组成。本发明的腺病毒载体源自猿猴腺病毒载体,例如,源自黑猩猩(黑猩猩(pantroglodytes)),倭黑猩猩(倭黑猩猩(panpaniscus)),大猩猩(大猩猩(gorillagorilla))和猩猩(苏门答腊猩猩(pongoabelii)和婆罗洲猩猩(pongopygnaeus))。黑猩猩腺病毒包括,但不限于ady25、chad3、chad19、chad25.2、chad26、chad27、chad29、chad30、chad31、chad32、chad33、chad34、chad35、chad37、chad38、chad39、chad40、chad63、chad83、chad155、chad15、sadv41、sad4310a、sad4312、sadv31、sadv-a1337、chadox1、chadox2和chad157。优选地,本发明的猿猴腺病毒载体是chad83或chad155腺病毒载体,最优选chad155腺病毒载体。优选地,本发明的腺病毒载体在人受试者中具有小于30%、优选小于10%的血清阳性率,且最优选在人受试者中没有血清阳性率。在一个优选实施方案中,本发明的猿猴腺病毒载体能够感染哺乳动物细胞。在一个实施方案中,本发明的腺病毒载体的第一表达盒和第二表达盒包含来自呼吸道合胞病毒(rsv)的转基因。例如,在一个实施方案中,所述表达盒之一包含rsvf抗原,且另一表达盒包含rsvm和n抗原。在此类实施方案中,所述载体优选编码rsvf0δtm抗原(缺失跨膜和细胞质区域的融合(f)蛋白)以及rsvm2-1(转录抗终止)和n(核衣壳)抗原。本发明还提供了包含猿猴腺病毒载体和药学上可接受的赋形剂的组合物。此外,本发明提供了猿猴腺病毒载体或包含这种腺病毒载体的组合物,其用作药物、疫苗和/或用于治疗或预防疾病。本发明还提供了诱导受试者中的免疫应答的方法,其包括将所述猿猴腺病毒载体或组合物施用于所述受试者。附图描述图1:具有单一表达盒的猿猴腺病毒构建体。反向末端重复区(itr)侧接3'和5'末端;e1是早期基因1;cmv是巨细胞病毒启动子;casi是casi启动子;rg是模型抗原,wpre是土拨鼠肝炎转录后调节元件,∆e3表示早期基因3被缺失;纤突表示编码纤突蛋白的腺病毒基因,且e4是早期基因4。三种不同的猿猴腺病毒载体显示于图1中。通过插入转基因表达盒替代腺病毒基因组的e3区域(“rc1”)来构建图1(i)的载体(顶部小图),通过将转基因表达盒插入he1区域中,即,在纤突基因和e4区域的终止密码子之间(“rc3”)来形成图1(ii)的载体(中间小图),并且通过将转基因表达盒插入he2区域中,即在itr的末端和e4mrna的帽区域之间(“rc2”)来制备图1(iii)的载体(底部小图)。图2a:具有插入e3和he2位点中的转基因盒的chad155和chad83(图1的rc1和rc2载体)在原代人细胞系中的产生。图2b:在感染后两天和七天,具有插入e3、he1和he2中的转基因盒的chad83(图1的rc1、rc2和rc3载体)在人mrc5细胞系中的产生。以250和1250的感染复数感染细胞。图3a:图1的rc1和rc2载体(chad155和chad83)在人原代细胞系中的总病毒基因组拷贝数。图3b:在感染后两天和七天,图1的chad83载体的rc1、rc2和rc3版本在人mrc5细胞系中的总病毒基因组拷贝数。以250和1250的感染复数感染细胞。图4:图1的chad155rc1和rc2以及chad83rc1和rc2载体在鼠细胞系(图4(a),顶部小图)和非人灵长类细胞系(图4(b),底部小图)中的总病毒基因组拷贝数。以50和250的感染复数感染细胞。图5:表达模型狂犬病糖蛋白(rg)转基因的chad155rc1和rc2载体在鼠细胞系中的表达水平的比较,其由在感染后两天和五天的western印迹所证明(图5(a),顶部小图)。表达模型狂犬病糖蛋白(rg)转基因的chad155rc1和rc2载体与chad83rc1和rc2载体在鼠细胞系中的表达水平的比较,其由感染后两天和五天的western印迹所证明(图5(b),底部小图)。以50、250和1250的感染复数感染细胞。图5(c):表达模型狂犬病糖蛋白(rg)转基因的chad83rc1、rc2和rc3载体在人mrc5细胞系中的表达水平的比较,其由在感染后两天和七天的western印迹所证明。以250和1250的感染复数感染细胞。图6:具有单个表达盒的另一猿猴腺病毒构建体。反向末端重复区(itr)侧接3’和5’末端;人cmv(hcmv)是巨细胞病毒启动子;fδtm(f0dtm)和n.m2-1是rsv抗原;2a是自切割连接序列;∆e4表示早期基因4被缺失;纤突表示编码纤突蛋白的腺病毒基因。在图6的载体中,插入转基因表达盒代替腺病毒基因组的e1区域。图7:具有双重表达盒的根据本发明的猿猴腺病毒构建体。反向末端重复区(itr)侧接3'和5'末端;人cmv(hcmv)是巨细胞病毒启动子;增强的hcmv是增强的巨细胞病毒启动子;n-m2-1和fδtm(f0dtm)是rsv抗原;wpre是土拨鼠肝炎转录后调节元件;∆e3表示早期基因3被缺失;纤突表示编码纤突蛋白的腺病毒基因;且ad5e4orf6是在早期基因4(e4)区域中的替代物。图7的载体通过如下构建:插入第一转基因表达盒代替腺病毒基因组的e1区域,且在he2区域中,即在右itr的下游,插入第二转基因表达盒。图8:通过感染后48小时和96小时,在非还原条件下western印迹证明的,mrc5细胞系中表达f0∆tm转基因的载体的表达水平的比较。以500和1250的感染复数感染细胞。图9:通过感染后48小时,在还原条件下western印迹证明的,mrc5细胞系中表达nm2-1转基因的载体的表达水平的比较。以250和1250的感染复数感染细胞。图10:来自表达rsv抗原f0∆tm(f∆tm)的chad155载体的免疫原性的比较。在用5x108个病毒颗粒的剂量接种疫苗后4周和8周收集数据。图11:来自表达m2rsv抗原的chad155载体的免疫原性的比较。在用107或106个病毒颗粒的剂量接种疫苗后3周收集数据。图12a和12b:举例说明来自实施例9的实验的结果,以研究来自chad155载体的肺t细胞应答。图12a显示cd4+应答,且图12b显示cd8+应答。图13a和13b:显示来自实施例9的实验的结果,以研究来自chad155载体的外周t细胞应答。图13a显示pbmccd4+应答,且图13b显示pbmccd8+应答。图14a和14b:还显示来自实施例9的结果。图14a显示rsv中和ab滴度,且图14b举例说明第90天的nab与第0天的nab的比率。图15a、15b和15c:显示实施例10的免疫原性实验的结果。图16a和16b:使用实施例11中的载体在hela细胞中的表达获得的western印迹。图17:举例说明实施例12的crpv实验的结果。图18:显示实施例13的hpv双重盒载体表征的结果。序列的注释seqidno:1–编码野生型chad155的多核苷酸序列seqidno:2–编码野生型chad83的多核苷酸序列seqidno:3–编码casi启动子的多核苷酸序列seqidno:4–编码chad155/rsv的多核苷酸序列seqidno:5–rsvf0∆tm-n-m2-1氨基酸序列seqidno:6–编码增强的hcmv启动子的多核苷酸序列seqidno:7–编码hcmvnm2bgh聚a盒的多核苷酸序列seqidno:8–nm2氨基酸(蛋白)序列seqidno:9–编码hcmvf0wprebgh聚a盒的多核苷酸序列seqidno:10–f0氨基酸(蛋白)序列seqidno:11–柔性接头的氨基酸序列seqidno:12–柔性接头的氨基酸序列。发明详述腺病毒腺病毒是具有近似36kb的线性双链dna基因组的无包膜二十面体病毒。腺病毒可以转导几种哺乳动物物种的许多细胞类型,包括分裂中和非分裂中细胞两者,而不整合至宿主细胞的基因组中。由于它们证明的安全性、在各种靶标组织中实现高度有效基因转移的能力以及大的转基因容量,它们已被广泛用于基因转移应用。人腺病毒载体目前用于基因疗法和疫苗中,但具有在先前暴露于普通人腺病毒后预先存在的免疫力的全世界高度流行的缺点。腺病毒具有拥有二十面体衣壳的特征性形态,所述二十面体衣壳包含三种主要蛋白:六邻体(ii)、五邻体基质(iii)和有节纤突(iv),连同许多其他次要蛋白vi、viii、ix、iiia和iva2。所述六邻体占所述衣壳的结构组分的大部分,所述衣壳由240个三聚的六邻体壳粒和12个五邻体基质组成。所述六邻体具有三个保守双桶(barrel),并且顶部具有三个塔(tower),每个塔含有来自每个亚基的环,所述亚基形成衣壳的大部分。六邻体的基质在腺病毒血清型之间是高度保守的,而表面环是可变的。五邻体是另一种腺病毒衣壳蛋白;其形成纤突所附接的五聚的基质。三聚的纤突蛋白从在衣壳的12个顶点中的每一个处的五邻体基质伸出且是有节的杆状结构。所述纤突蛋白的主要作用是经由节区域与细胞受体的相互作用而将病毒衣壳与细胞表面拴系。纤突的柔性轴以及节区域中的变异是不同腺病毒血清型特征性的。腺病毒基因组已被充分地表征。线性、双链dna与高度碱性蛋白vii和小肽px(也称为mu)缔合。另一种蛋白v与该dna-蛋白复合物一起包装,并经由蛋白vi提供与衣壳的结构连接。就类似地定位的特定开放阅读框(例如每种病毒的e1a、e1b、e2a、e2b、e3、e4、l1、l2、l3、l4和l5基因的位置)而言,在腺病毒基因组的整体组构中存在一般保守性。腺病毒基因组的每个末端包含被称为反向末端重复区(itr)的序列,其是病毒复制所必需的。腺病毒基因组的5'末端含有包装和复制所必需的5'顺式元件;即,5'itr序列(其可以作为复制起点发挥功能)和天然5'包装增强子结构域(其含有包装线性腺病毒基因组所必需的序列和e1启动子的增强子元件)。腺病毒基因组的3'末端包括包装和衣壳化所必需的3'顺式元件(包括itr)。该病毒也包含病毒编码的蛋白酶,其是加工产生感染性病毒粒子所需的结构蛋白中的一些所必需的。基于在宿主细胞转导后表达病毒基因的顺序,描述了腺病毒基因组的结构。更具体地,根据转录在dna复制开始之前还是之后发生,将所述病毒基因称为早期(e)或晚期(l)基因。在转导的早期阶段中,表达腺病毒的e1a、e1b、e2a、e2b、e3和e4基因以制备用于病毒复制的宿主细胞。e1基因被认为是主开关,其充当转录活化剂,并参与早期和晚期基因转录两者。e2参与dna复制;e3参与免疫调节,且e4调节病毒mrna代谢。在感染的晚期阶段期间,编码病毒颗粒的结构组分的晚期基因l1-l5的表达被活化。晚期基因从主要晚期启动子(mlp)转录,并进行选择性剪接。he1和he2位点被鉴定为转基因的潜在插入位点,因为在这些特定点中的插入并不中断黑猩猩腺病毒(诸如c型或e型黑猩猩腺病毒,例如chad155和chad83)的编码序列或重要调节序列。he1和he2位点可以通过在任何黑猩猩腺病毒中的序列比对来鉴定。因此,chad基因组的he1和he2位点中的表达盒的克隆并不影响病毒复制周期。腺病毒复制在历史上,腺病毒疫苗开发已经集中于缺陷的、非复制型载体。通过缺失对于复制必需的e1区域基因,使得它们复制缺陷。通常,非必需的e3区域基因也被缺失,以便为外源转基因腾出空间。然后插入包含在外源启动子的控制下的转基因的表达盒。然后在e1-互补细胞中产生这些复制缺陷的病毒。术语“复制缺陷的”或“不能复制的”腺病毒是指这样的腺病毒,其不能复制,因为其已经被工程改造以至少包含功能缺失(或“功能丧失”突变),即在不将基因完全除去的情况下损害该基因的功能的缺失或突变,例如人工终止密码子的引入,活性位点或相互作用结构域的缺失或突变,基因的调节序列的突变或缺失等,或编码对于病毒复制必需的基因产物的基因的完全除去,诸如选自e1a、e1b、e2a、e2b、e3和e4(诸如e3orf1、e3orf2、e3orf3、e3orf4、e3orf5、e3orf6、e3orf7、e3orf8、e3orf9、e4orf7、e4orf6、e4orf4、e4orf3、e4orf2和/或e4orf1)的腺病毒基因中的一个或多个的完全除去。合适地,e1和任选地e3和/或e4被缺失。如果缺失,当确定相对于另一个序列的百分比同一性时,合适地将在比对中不考虑前面提及的缺失的基因区域。本发明的载体基于非人猿猴腺病毒的病毒载体代表将人来源的载体用于基因疗法和基因疫苗的替代方案。从非人猿猴分离的某些腺病毒与从人分离的腺病毒密切相关,如它们在人来源的细胞中的有效繁殖所证明。由于人几乎不发展或不发展对猿猴腺病毒的免疫力,因此它们有望为人腺病毒使用提供改进的替代方案。“低血清阳性率”可以意指具有与人腺病毒5(ad5)相比降低的预先存在的中和抗体水平。类似地或可替代地,“低血清阳性率”可以意指小于约30%血清阳性率、小于约20%血清阳性率、小于约15%血清阳性率、小于约10%血清阳性率、小于约5%血清阳性率、小于约4%血清阳性率、小于约3%血清阳性率、小于约2%血清阳性率、小于约1%血清阳性率或无可检测的血清阳性率。使用如hum.genether.(2004)15:293中所述的方法,可以将血清阳性率测量为具有临床相关的中和滴度(定义为50%中和滴度>200)的个体的百分比。本发明的腺病毒载体源自非人猿猴腺病毒,也称为“猿猴腺病毒”。许多腺病毒已分离自非人猿猴,诸如黑猩猩、倭黑猩猩、猕猴、猩猩和大猩猩。源自这些腺病毒的载体可以诱导针对由这些载体编码的转基因的强烈免疫应答。基于非人猿猴腺病毒的载体的某些优点包括在人靶标群体中相对缺乏针对这些腺病毒的交叉中和抗体,因此其使用克服了预先存在的对人腺病毒的免疫力。例如,一些猿猴腺病毒不具有与预先存在的人中和抗体的交叉反应性,并且某些黑猩猩腺病毒与预先存在的人中和抗体的交叉反应仅存在于2%的靶标群体中,相比之下,在某些候选人腺病毒载体的情况下为35%(sci.transl.med.(2012)4:1)。本发明的腺病毒载体源自猿猴腺病毒,例如,源自黑猩猩(黑猩猩(pantroglodytes)),倭黑猩猩(倭黑猩猩(panpaniscus)),大猩猩(大猩猩(gorillagorilla))和猩猩(苏门答腊猩猩(pongoabelii)和婆罗洲猩猩(pongopygnaeus))。它们包括来自组b、组c、组d、组e和组g的腺病毒。黑猩猩腺病毒包括,但不限于ady25、chad3、chad19、chad25.2、chad26、chad27、chad29、chad30、chad31、chad32、chad33、chad34、chad35、chad37、chad38、chad39、chad40、chad63、chad83、chad155、chad15、sadv41和chad157chad3、chad19、chad25.2、chad26、chad27、chad29、chad30、chad31、chad32、chad33、chad34、chad35、chad37、chad38、chad39、chad40、chad63、chad83、chad155、chad15、sadv41、sad4310a、sad4312、sadv31、sadv-a1337、chadox1、chadox2和chad157。或者,腺病毒载体可以源自从倭黑猩猩分离的非人猿猴腺病毒,诸如panad1、panad2、panad3、pan5、pan6、pan7(也称为c7)和pan9。载体可以全部或部分地包括编码非人腺病毒的纤突、五邻体或六邻体的核苷酸。在本发明的腺病毒载体的一个实施方案中,所述腺病毒载体在人受试者中具有小于30%、小于20%、小于10%或小于5%的血清阳性率,优选地在人受试者中没有血清阳性率,且更优选地在先前未与黑猩猩腺病毒载体接触的人受试者中没有血清阳性率。在本发明的腺病毒载体的实施方案中,所述腺病毒dna能够进入哺乳动物靶标细胞,即其为感染性的。本发明的感染性重组腺病毒载体可以用作预防性或治疗性疫苗且用于基因疗法。因此,在一个实施方案中,所述重组腺病毒载体包含用于递送至靶标细胞中的内源性分子。所述靶标细胞是哺乳动物细胞,例如牛细胞、犬细胞、山羊细胞、鹿细胞、黑猩猩细胞、翼手目细胞、马细胞、猫细胞、人细胞、狼细胞、绵羊细胞、猪细胞、啮齿动物细胞、熊细胞或狐狸细胞。用于递送至靶标细胞中的内源性分子是表达盒。在本发明的一个实施方案中,所述载体包含左itr区域,缺失的e1区域,然后缺失的e3区域,以及任选地,额外增强子元件;这些随后为纤突区域、e4区域和右itr。在向右和向左方向发生翻译。在该实施方案中,所述第一表达盒被插入缺失的e1区域中,且所述第二表达盒被插入缺失的e3区域中。在一个进一步实施方案中,所述两个表达盒的启动子是cmv启动子。在又一个进一步实施方案中,所述增强子元件是乙型肝炎翻译后调节元件(hpre)或土拨鼠肝炎翻译后调节元件(wpre)。在本发明的一个实施方案中,所述载体包含左和右itr区域;缺失的e1区域;至少部分缺失的e3区域;纤突区域;e4区域;两个表达盒,各自包含:启动子和至少一个目标抗原和,任选地,一个或多个增强子元件。将所述第一表达盒插入缺失的e1区域中,且将所述第二表达盒插入he1位点处,即,在纤突基因的终止密码子和e4区域之间(“he1位点”)。chad155he1插入位点在野生型chad155序列的bp34611和34612之间。chad83he1插入位点在野生型chad83序列的bp33535和33536之间。在向右和向左方向发生翻译。在一个进一步实施方案中,所述启动子是cmv启动子。在一个优选实施方案中,一个启动子是cmv启动子,且另一个是ecmv启动子。在又一个进一步实施方案中,所述增强子元件是hpre或wpre。在一个进一步实施方案中,所述载体包含左和右itr区域;缺失的e1区域;至少部分缺失的e3区域;纤突区域;e4区域;两个表达盒,各自包含:启动子,至少一个目标抗原和,任选地,一个或多个增强子元件。所述第一表达盒被插入缺失的e1区域中,且所述第二表达盒被插入he2位点处,即,在左itr的末端和e4mrna的帽位点之间(“he2位点”)。chad155he2插入位点在野生型chad155序列的bp37662和37663之间。chad83he2插入位点在野生型chad83序列的bp36387和36388之间。在向右和向左方向发生翻译。在一个进一步实施方案中,所述启动子是cmv启动子。在一个优选实施方案中,一个启动子是cmv启动子,且另一个是ecmv启动子。在又一个进一步实施方案中,所述增强子元件是hpre或wpre(所述增强子元件增加转基因的表达)。所述he1和he2位点被鉴定为转基因的插入位点,因为在这些特定点中的插入并不中断chad155和chad83的编码序列或调节序列。因此,将表达盒插入chad基因组的he1或he2位点并不影响病毒复制周期。在本发明的一个实施方案中,所述载体是腺病毒载体的功能性或免疫原性衍生物。“腺病毒载体的衍生物”意指载体的修饰形式,例如,所述载体的一个或多个核苷酸被缺失、插入、修饰或取代。调节元件调节元件,即,表达控制序列,包括适当的转录起始、终止、启动子和增强子序列;有效的rna加工信号诸如剪接和聚腺苷酸化(聚a)信号,包括兔β-珠蛋白聚a;四环素可调节系统、微rna、转录后调节元件(例如wpre、土拨鼠肝炎病毒的转录后调节元件);稳定细胞质mrna的序列;增强翻译效率的序列(例如,kozak共有序列);增强蛋白稳定性的序列;和当期望时,增强编码的产物的分泌的序列。“启动子”是允许rna聚合酶的结合并指导基因的转录的核苷酸序列。通常,启动子位于靠近转录起始位点的基因的非编码区域中。在转录的起始中发挥功能的启动子内的序列元件经常通过共有核苷酸序列表征。启动子的实例包括但不限于来自细菌、酵母、植物、病毒和哺乳动物(包括猿猴和人)的启动子。大量表达控制序列(包括内部的、天然的、组成型的、诱导型的和/或组织特异性的启动子)是本领域中已知的,并且可以被利用。本发明的启动子通常将是异源启动子。本发明的启动子可以是组成型的。启动子的实例包括但不限于来自细菌、酵母、植物、病毒和哺乳动物(包括人)的启动子。启动子的实例包括但不限于,tbg启动子、逆转录病毒劳斯肉瘤病毒ltr启动子(任选地与增强子一起)、巨细胞病毒(cmv)启动子(任选地与cmv增强子一起,参见,例如,boshart等人,cell,41:521-530(1985))、casi启动子、sv40启动子、二氢叶酸还原酶启动子、β-肌动蛋白启动子、磷酸甘油激酶(pgk)启动子和ef1a启动子(invitrogen)。合适的启动子包括巨细胞病毒(cmv)启动子和casi启动子。所述cmv启动子是强烈且普遍活性的。其具有在许多组织类型中驱动高水平的转基因表达的能力,并且是本领域中众所周知的。所述cmv启动子可以在有或没有cmv增强子的情况下用于本发明的载体中。所述casi启动子是合成启动子,其被描述为cmv增强子、鸡β-肌动蛋白启动子和侧接泛素(ubc)增强子的剪接供体和剪接受体的组合(us8865881)。在一些实施方案中,所述casi启动子可以包括与seqidno:3具有至少约90%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或更多序列同一性的核酸序列。在一些实施方案中,所述启动子包含seqidno:3的核酸序列或由其组成。在一些实施方案中,所述增强的hcmv启动子可以包括与seqidno:6具有至少约90%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或更多序列同一性的核酸序列。在一些实施方案中,所述启动子包含seqidno:6的核酸序列或由其组成。任选地,携带编码治疗上有用的或免疫原性的产物的转基因的载体还可以包括选择标记或报道基因。所述报道基因可以选自本领域中已知的那些。合适的报道基因包括,但不限于,增强的绿色荧光蛋白、红色荧光蛋白、荧光素酶和分泌的胚胎碱性磷酸酶(seap),其可以包括编码遗传霉素、潮霉素或嘌呤霉素抗性的序列,以及其他。此类选择报道物或标记基因(其可以位于或不位于待包装至病毒颗粒中的病毒基因组之外)可以用于发出质粒在细菌细胞中的存在的信号,诸如氨苄青霉素抗性。所述载体的其他组分可以包括复制起点。如本文所用的“转录后调节元件”是这样的dna序列,其在转录时增强通过本发明的病毒载体递送的一种或多种转基因或其片段的表达。转录后调节元件包括但不限于乙型肝炎病毒转录后调节元件(hpre)和土拨鼠肝炎转录后调节元件(wpre)。wpre是三部分顺式作用元件,其已被证明增强由某些(但不是全部)启动子驱动的转基因表达。在本发明的实施方案中,chad155载体可以包含启动子、增强子和报道基因中的一种或多种。例如,本发明的载体可以包含chad155-增强的hcmv-seap、chad155-casi-seap和chad155-hcmv-seap(其任选地具有四环素开/关转录控制),以及chad155–cmv-hferl-chef1-seap(其具有四环素开/关转录控制)。在本发明的实施方案中,chad83载体可以包含启动子、增强子和报道基因中的一种或多种。例如,本发明的载体可以包含chad155-增强的hcmvseap、chad83增强的hcmvseap、chad155-casi-seap和chad83-hcmv-seap(其任选地具有四环素开/关转录控制),以及chad83–cmv-hferl-chef1-seap(其具有四环素开/关转录控制)。使用本文提供的技术,结合本领域技术人员已知的技术,生成本发明的载体。此类技术包括cdna的常规克隆技术(诸如在教科书中描述的那些)、腺病毒基因组的重叠寡核苷酸序列的使用、聚合酶链式反应、和提供期望的核苷酸序列的任何合适方法。转基因“转基因”是编码目标多肽的核酸序列,其与侧接所述转基因的载体序列异源。核酸编码序列以允许宿主细胞中的转基因转录、翻译和/或表达的方式可操作连接至调节组分。在本发明的实施方案中,所述载体以治疗或预防水平表达转基因。转基因多肽的“功能衍生物”是多肽的修饰形式,例如,其中一个或多个氨基酸被缺失、插入、修饰或取代。所述转基因可用于预防或治疗,例如,作为用于诱导免疫应答的疫苗,以通过校正或替换缺陷或缺失的基因来校正遗传缺陷,或作为癌症治疗剂。如本文所用,免疫应答的诱导是指蛋白诱导针对该蛋白的t细胞和/或体液抗体免疫应答的能力。由转基因引发的免疫应答可以是抗原特异性b细胞应答,其产生中和抗体。引发的免疫应答可以是抗原特异性t细胞应答,其可以是全身性应答和/或局部应答。抗原特异性t细胞应答可以包括cd4+t细胞应答,诸如涉及表达细胞因子(例如干扰素γ(ifnγ)、肿瘤坏死因子α(tnfα)和/或白介素2(il2))的cd4+t细胞的应答。可替代地或另外地,所述抗原特异性t细胞应答包括cd8+t细胞应答,诸如涉及表达细胞因子(例如ifnγ、tnfα和/或il2)的cd8+t细胞的应答。转基因序列的组成将取决于将向其中放置所得载体的用途。在一个实施方案中,所述转基因是编码在生物学和医学中有用的产物的序列,诸如预防性转基因、治疗性转基因或免疫原性转基因,例如蛋白或rna。蛋白转基因包括抗原。本发明的抗原性转基因诱导针对引起疾病的生物体的免疫原性应答。本发明的转基因包括,但不限于,狂犬病病毒抗原,例如,狂犬病糖蛋白(rg),呼吸道合胞病毒(rsv)抗原,人免疫缺陷病毒(hiv)抗原或其片段。作为遗传密码中的冗余的结果,多肽可以由各种不同的核酸序列编码。编码偏向于与其他相比更多地使用一些同义密码子(即编码相同氨基酸的密码子)。“密码子优化的”意指在不改变氨基酸序列的情况下对重组核酸的密码子组成进行修饰。密码子优化已用于通过使用生物体特异性的密码子使用频率来提高不同生物体中的mrna表达。除了密码子偏爱之外,且与密码子偏爱无关,比其他更频繁地使用一些同义密码子对。此密码子对偏爱意味着一些密码子对被代表过多,而其他被代表不足。密码子对去优化已被用于减少病毒毒力。例如,已报道,与野生型脊髓灰质炎病毒相比,经修饰以含有代表不足的密码子对的脊髓灰质炎病毒证明降低的翻译效率并且被减毒(science(2008)320:1784)。通过密码子对去优化工程改造合成的减毒病毒可以产生编码与野生型相同的氨基酸序列、但使用同义密码子的不同成对排列的病毒。通过密码子对去优化减毒的病毒生成与野生型相比减少最多达1000倍的噬斑,产生更少的病毒颗粒,并且需要多达约100倍的病毒颗粒来形成噬斑。相反,经修饰以含有在人基因组中过度代表的密码子对的脊髓灰质炎病毒以类似于野生型rna的方式起作用,并且生成大小与野生型rna相同的噬斑(coleman等人(2008)science320:1784)。发生这种情况,尽管存在以下事实:具有过度代表的密码子对的病毒含有与具有不足代表的密码子对的病毒类似数目的突变,并且证明与野生型相比增强的翻译。该观察表明,会预期密码子对优化的构建体以类似于其非密码子对优化的对应物的方式起作用,并且不会期望其提供功能优势。不希望受理论束缚,这可能是因为自然进化已经优化密码子配对。本发明的构建体可以包含密码子优化的核酸序列。可替代地或另外地,本发明的载体包含转基因或其免疫原性衍生物或片段的密码子优化的序列。本发明的构建体可以包含密码子对优化的核酸序列。可替代地或另外地,本发明的载体包含转基因或其免疫原性衍生物或片段的密码子对优化的序列或由其组成。呼吸道合胞病毒(rsv)转基因在一个实施方案中,本发明提供了包含两个表达盒的重组猿猴来源的腺病毒载体在治疗或预防rsv感染中的用途,其中每个表达盒都包含源自人呼吸道合胞病毒(rsv)的免疫原性转基因。在一个实施方案中,本发明的重组猿猴来源的腺病毒载体在所述表达盒之一中包含rsvf抗原,且在另一表达盒中包含另一rsv病毒抗原。合适的抗原在下面进一步讨论。在一个实施方案中,重组猿猴来源的腺病毒载体在第二表达盒中包含rsvm和n抗原。在此类实施方案中,所述载体优选地编码rsvf0δtm抗原(缺失跨膜区和细胞质区的融合(f)蛋白)和rsvm2-1(转录抗终止)和n(核衣壳)抗原。rsv的感染并不赋予完全的保护性免疫力。婴儿期的感染随后为症状性rsv再感染,其在整个成年期继续。这些再感染通常未被诊断,因为它们通常呈现为常见的急性上呼吸道感染。然而,在更脆弱的人(例如,免疫受损的成人或老年人)中,再感染也可导致严重的疾病。免疫系统的两个分支(体液和细胞免疫)均参与免于严重疾病的保护[guvenelak,chiuc和openshawpj.currentconceptsandprogressinrsvvaccinedevelopment.expertrevvaccines.2014;13(3):333-44.]。体液免疫应答能够中和病毒并抑制病毒复制,由此在针对下呼吸道rsv感染和严重疾病的保护中发挥主要作用[piedrapa,jewellam,cronsg,等人,correlatesofimmunitytorespiratorysyncytialvirus(rsv)associated-hospitalization:establishmentofminimumprotectivethresholdlevelsofserumneutralizingantibodies.vaccine.2003;21(24):3479-82.]。预防性给予的免疫球蛋白g(igg)rsv-中和单克隆抗体(synagis)的形式的被动免疫已显示在具有支气管肺发育不良或潜在心肺疾病的早产婴儿和新生儿中在一定程度上预防rsv疾病[cardenass,auaisa和piedimonteg.palivizumabintheprophylaxisofrespiratorysyncytialvirusinfection.expertrevantiinfectther.2005;3(5):719-26]。t细胞也参与rsv疾病的控制。已经在具有低cd8t细胞计数的患者中描述了致死性rsv感染,如在严重联合免疫缺陷、骨髓和肺移植受体的情况下[hertz,1989]。新生儿的rsv感染的致死性病例的组织病理学显示肺部浸润物中存在相对少量的cd8t细胞[wellivertp,garofalorp,hosakotey,等人,severehumanlowerrespiratorytractillnesscausedbyrespiratorysyncytialvirusandinfluenzavirusischaracterizedbytheabsenceofpulmonarycytotoxiclymphocyteresponses.jinfectdis.2007.195(8):1126-36.]。此外,产生干扰素-γ(ifn-γ)的cd8t细胞的存在已经与rsv的动物模型中的th2应答减少和嗜酸性粒细胞减少相关[castilowem和vargasm.overcomingtcell-mediatedimmunopathologytoachievesafersvvaccination.futurevirol.2008;3(5):445-454;stevensww,sunj,castillojp,等人,pulmonaryeosinophiliaisattenuatedbyearlyrespondingcd8(+)memorytcellsinamurinemodelofrsvvaccine-enhanceddisease.viralimmunol.2009;22(4):243-51]。可用作免疫原以免疫人或非人动物的rsv的合适的抗原可以选自:融合蛋白(f)、附着蛋白(g)、基质蛋白(m2)和核蛋白(n)。术语“f蛋白”或“融合蛋白”或“f蛋白多肽”或“融合蛋白多肽”是指具有rsv融合蛋白多肽的氨基酸序列的全部或部分的多肽或蛋白。类似地,术语“g蛋白”或“g蛋白多肽”是指具有rsv附着蛋白多肽的氨基酸序列的全部或部分的多肽或蛋白。术语“m蛋白”或“基质蛋白”或“m蛋白多肽”是指具有rsv基质蛋白的氨基酸序列的全部或部分的多肽或蛋白,且可以包括m2-1(其可以在本文中书写为m2.1)和m2-2基因产物中的任一种或两种。同样地,术语“n蛋白”或“核衣壳蛋白”或“n蛋白多肽”是指具有rsv核蛋白的氨基酸序列的全部或部分的多肽或蛋白。主要基于g糖蛋白的抗原性的差异,已经描述了两组人rsv毒株,a和b组。迄今为止已经分离了许多rsv毒株,其中任何在本文公开的免疫原性组合的抗原的背景下都是合适的。由genbank和/或embl登录号指示的示例性毒株可以见于美国公开的申请号2010/0203071(wo2008114149),其通过引用并入本文,用于公开适合用于本发明中的rsvf和g蛋白的核酸和多肽序列的目的。在一个实施方案中,所述rsvf蛋白可以是rsvf蛋白的胞外结构域(f0δtm)。示例性的m和n蛋白核酸和蛋白序列可以见于,例如,美国公开的申请号2014/0141042(wo2012/089833),其并入本文,用于公开适合用于本发明中的rsvm和n蛋白的核酸和多肽序列的目的。合适地,为了在本发明中一起使用,转基因核酸编码rsvf抗原和rsvm和n抗原。更具体地,所述核酸编码rsvf0δtm抗原(缺失跨膜和细胞质区域的融合(f)蛋白)和rsvm2-1(转录抗终止)和n(核衣壳)抗原。缺失跨膜和细胞质区域的融合(f)蛋白(f0δtm)rsvf蛋白是主要的表面抗原并且介导病毒与靶标细胞的融合。f蛋白是在rsv亚组和毒株中高度保守的抗原。f蛋白是中和抗体(包括预防性rsv中和单克隆抗体synagis)的靶标。跨膜区域和细胞质尾部的缺失允许f0δtm蛋白的分泌。识别f蛋白的这种可溶形式的中和抗体,包括synagis,在体外抑制rsv感染性[magrom,andreud,gómez-puertasp,等人,neutralizationofhumanrespiratorysyncytialvirusinfectivitybyantibodiesandlow-molecular-weightcompoundstargetedagainstthefusionglycoprotein.jvirol.2010;84(16):7970-82]。核衣壳(n)蛋白n蛋白是内部(未暴露的)抗原,在rsv毒株之间高度保守,并且已知是许多t细胞表位的来源。n蛋白对于rsv基因组的复制和转录是必需的。n蛋白的主要功能是为了rna转录、复制和包装的目的而包装病毒基因组并保护其免受核糖核酸酶的影响。转录抗终止(m2-1)蛋白m2-1蛋白是转录抗终止因子,其对于全长信使rna(mrna)的有效合成以及多顺反子通读mrna(其为非区段负链rna病毒特征性的)的合成是重要的。m2-1是内部(未暴露的)抗原,其在rsv毒株之间高度保守,并且已知是许多t细胞表位的来源。n-m2-1融合蛋白编码接头的多核苷酸位于编码rsvn抗原或其片段的多核苷酸和编码rsvm2.1抗原或其片段的多核苷酸之间。因此,在某些优选实例中,表达盒含有编码融合的rsv病毒蛋白n-接头-m2.1的转基因。优选的是,所述接头是柔性接头,优选包含根据seqidno:11(gly-gly-gly-ser-gly-gly-gly)或seqidno:12(gly-gly-gly-gly-ser-gly-gly-gly-gly)的氨基酸序列的柔性接头。乳头瘤(pv)转基因在一个实施方案中,本发明提供了包含两个表达盒的重组猿猴来源的腺病毒载体在治疗或预防乳头瘤病毒诱导的疾病中的用途,其中每个表达盒都包含源自乳头瘤病毒(pv)的免疫原性转基因。合适地,本发明的重组猿猴来源的腺病毒载体包含所述表达盒之一中的修饰的乳头瘤病毒e1抗原和另一表达盒中的修饰的乳头瘤病毒e2抗原。人乳头瘤病毒(hpv)是小dna病毒,其感染粘膜和/或皮肤(cutaneousskin)并引起多种疾病病况,包括宫颈赘生物、宫颈癌和其他肛殖癌。已知超过40种类型的hpv感染人的肛殖道,并且约15种高风险hpv基因型与人宫颈癌因果相关。大多数宫颈上皮的hpv感染在两年时段内是亚临床的(subclinal),并且是自解决的。然而,高风险hpv类型的持续感染可以引起病变并进展为侵袭性癌症。可用作免疫原的hpv的合适抗原描述于wo2018060288中,并且尤其包括hpve1和e2蛋白。狂犬病(rg)转基因狂犬病病毒是弹状病毒科中的一种有包膜的、单链rna病毒。狂犬病病毒属的成员引起狂犬病,并且具有所有已知的人病毒病原体中最高的死亡率。狂犬病经由受感染哺乳动物的唾液传播。一种嗜神经性病毒,其进入其宿主的神经系统,引起几乎总是致命的脑脊髓炎。目前,全世界每年存在约60,000例狂犬病死亡,主要由亚洲和非洲的发展中国家的狗咬伤以及北美的野生动物和蝙蝠引起。狂犬病以狂怒或麻痹的形式呈现。潜伏期在约五天和几年之间变化,但通常在约20和90天之间。临床疾病最经常始于不适、厌食、疲劳、头痛和发烧的前驱抱怨,随后为在暴露部位处的疼痛或麻木(parathesia)。焦虑、烦乱或易怒在该时段期间可能是明显的,随后是过度活跃、迷失方向、癫痫、恐水病、唾液分泌过多,和最终麻痹、昏迷和死亡。狂犬病抗原可以源自狂犬病病毒糖蛋白(rg)。例如,狂犬病糖蛋白可以用作模型抗原。腺病毒载体的递送在一些实施方案中,本发明的重组腺病毒载体通过表皮施用、皮内施用、肌肉内注射、腹膜内注射、静脉内注射、经鼻施用、经口施用、直肠施用、皮下注射、经皮施用或阴道内施用,而施用于受试者。在本发明的一个实施方案中,所述载体可以肌肉内(im)施用,即,直接注射入肌肉。肌肉血管形成良好,并且摄取通常快速。佐剂建立对特定病原体的强烈且持久的免疫力的方法包括向疫苗中添加佐剂。“佐剂”意指增强、刺激、活化、加强或调节针对组合物的活性成分的免疫应答的试剂。佐剂作用可以在细胞或体液水平或两者上发生。佐剂刺激免疫系统针对实际抗原的应答,但本身没有免疫作用。可替代地或另外地,本发明的佐剂化组合物可以包含一种或多种免疫刺激剂。“免疫刺激剂”意指无论是与抗原一起施用还是分开施用均诱导受试者的免疫应答的总体暂时性增加的试剂。本发明的组合物可以与或不与佐剂一起施用。可替代地或另外地,所述组合物可以包含一种或多种佐剂(例如疫苗佐剂)或与一种或多种佐剂(例如疫苗佐剂)结合施用,具体而言,所述组合物包含免疫学有效量的本发明的编码转基因的载体。使用方法提供了用于在有此需要的受试者中诱导针对由病原体引起的疾病的免疫应答的方法,其包括施用免疫有效量的如本文所公开的构建体或组合物的步骤。在一些实施方案中,提供了本文公开的构建体或组合物用于在有此需要的受试者中诱导针对转基因抗原的免疫应答的用途。本发明的载体可以应用于预防、治疗或改善由于感染导致的疾病。本发明的方法包括本发明的载体在医学中的用途。它们包括本发明的载体用于治疗由病原体引起的疾病的用途。本发明的载体可用于制备用于治疗由病原体引起的疾病的药物。本发明的载体可用于制备用于预防或治疗疾病、例如由呼吸道合胞病毒(rsv)引起的疾病的药物。用腺病毒载体的有效免疫取决于腺病毒载体骨架的内在免疫调节能力。免疫学效力较低的腺病毒诱导较少的抗原表达。有效的免疫还取决于启动子驱动强烈且持续的转基因表达的能力。例如,由巨细胞病毒立即早期(cmv-ie)启动子驱动的腺病毒载体并不维持长期的转基因表达,因为它们诱导抑制表达的细胞因子。“受试者”意欲为脊椎动物,诸如哺乳动物,例如人或兽医哺乳动物。在一些实施方案中,所述受试者是人。通用使用本文提供的技术和序列,结合本领域技术人员已知的技术,生成本发明的载体。此类技术包括cdna的常规克隆技术(诸如在教科书中描述的那些)、腺病毒基因组的重叠寡核苷酸序列的使用、聚合酶链式反应、和提供期望的核苷酸序列的任何合适方法。除非另有解释,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本公开所属领域普通技术人员通常理解的相同的含义。单数形式“一个/种(a)”、“一个/种(an)”和“该/所述”包括复数对象,除非上下文另有清楚指出。类似地,词语“或”意欲包括“和”,除非上下文另有清楚指示。术语“多个/种”是指两个/种或更多个/种。此外,关于物质的浓度或水平(诸如溶液组分浓度或其比率)和反应条件(诸如温度、压力和循环时间)给出的数值限值,意欲是近似的。本文使用的术语“约”意指量±10%。现在将借助于以下非限制性实施例进一步描述本发明。实施例实施例1:用单一表达盒构建黑猩猩腺病毒使用标准程序从健康黑猩猩分离野生型黑猩猩腺病毒类型155(chad155)(wo2016/198621)和类型83(chad83)(wo2010/086189),并如scitranslmed(2012)4:1和wo2010/086189中所述进行构建。在实施例1中,通过插入单一转基因表达盒各自构建chad155和chad83载体。表达盒组分使用经典的人cmv启动子或casi启动子,作为模型抗原的狂犬病糖蛋白和任选地wpre增强子。针对转基因盒测试三个不同的插入位点:(i)用转基因盒替换e3区域,(ii)将转基因盒插入纤突和e4区域之间(位点he1),和(iii)将转基因盒插入右itr的下游(位点he2)。这些插入位点的该编号对应于图1的举例说明,其中:(i)顶部小图举例说明rc1载体,其中转基因盒替换e3区域,(ii)中间小图举例说明rc3载体,其中将转基因盒插入在纤突基因的终止密码子和e4区域之间(位点he1),且(iii)底部小图举例说明rc2载体,其中将转基因盒插入右itr的下游(位点he2)。在实施例1中显示的载体中,e1区域在所有构型中都保持完整。通过同源重组技术将转基因插入seqidno:1和seqidno:2的以下位置中:he1chad155:在seqidno:1的bp34611和34612之间的插入位点;he2chad155:在seqidno:1的bp37662和37663之间的插入位点;he1chad83:在seqidno:2的bp33535和33536之间的插入位点;he2chad83:在seqidno:2的bp36387和36388之间的插入位点。当将转基因盒插入he1位点时,chad155无法复制。然而,将转基因盒插入chad83的he1位点产生可行的载体。实施例2:实施例1的载体的病毒产生、载体滴度和表达为了鉴定其中评估载体复制的动物模型,在各种动物来源的细胞中评价实施例1的c型腺病毒chad155rc2和e型腺病毒chad83rc2载体的复制能力,其通过载体滴度和基因组拷贝数测量。结果显示于表1中。表1.实施例1的rc2chad155和rc2chad83的复制和表达如表1中所示,人mrc5细胞和猪pk15细胞产生chad155和chad83两者的高载体滴度和高基因组拷贝数。鼠nmuli和非人灵长类vero细胞也产生rcchad155,但程度低于人或猪细胞。rcchad83在鼠nmuli细胞中以及(令人惊讶地)在非人灵长类vero细胞中无法良好生长。人mrc5、小鼠nmuli和非人灵长类vero细胞支持rcchad155的表达,直至第7天。人mrc5细胞支持rcchad83的表达,直至第7天,如同在小鼠nmuli和非人灵长类vero细胞中一样,但程度低于人细胞。病毒产生图2a显示由以chad155或chad83(其各自包含实施例1的rc1或rc2载体构建体)感染的人原代mrc5细胞产生的病毒的量。感染后7天收获细胞,并且在三个冷冻-解冻循环后获得的细胞裂解物中评估载体滴度。通过用针对相应启动子区域设计的引物的定量pcr(qpcr)分析来测量载体滴度。感染复数(moi)为每个细胞1250个病毒颗粒。在条形上方,病毒产量以病毒颗粒数/细胞(vp/细胞)指示。人mrc5细胞支持包含rc1(2.17x103vp/细胞)或rc2(4.40x103vp/细胞)的chad155的产生,并且还支持包含rc1(1.18x104vp/细胞)或rc2(1.06x105vp/细胞)的chad83的产生。如图2a中所示,chad83以比chad155更高的水平产生;包含rc2的chad83载体是四种病毒/载体组合中最稳健的。图2b显示由以包含实施例1的rc1、rc2或rc3载体构建体的chad83感染的人原代mrc5细胞产生的病毒的量。感染后2天和7天收获细胞。如同图2a,通过用针对相应启动子区域设计的引物的定量pcr(qpcr)分析来测量载体滴度。感染复数(moi)为每个细胞250或1250个病毒颗粒。在条形上方,病毒产量以病毒颗粒数/细胞(vp/细胞)指示。人mrc5细胞支持包含rc1、rc2或rc3的chad83的产生。如图2b中所示,rc2和rc3chad83载体的病毒产量高于rc1载体。chad83rc2he2载体的病毒产量也高于rc3he1载体。载体基因组拷贝数感染后,载体在细胞中复制,并且载体基因组拷贝数可以通过qpcr测量。甚至在不完全允许病毒复制和繁殖的细胞中也可以发生载体dna复制。载体dna的qpcr提供了在感染细胞内的载体复制的量度,其与病毒完成复制周期并作为成熟病毒后代释放的能力无关。因此,可以在不允许chad病毒复制或繁殖的动物物种、组织类型和细胞类型中定量载体复制。与载体滴度平行地测量载体基因组拷贝数,并且结果显示于图3a和图3b中。关于图2a中显示的病毒产量,人mrc5细胞用chad155或chad83(其各自包含实施例1的rc1或rc2载体构建体)感染。感染后7天收获细胞,提取总dna,通过qpcr定量病毒基因组,并且结果表示为每个细胞的载体基因组拷贝。所述感染复数(moi)是每个细胞250个病毒颗粒,并且每个细胞的病毒颗粒数目在表示每个细胞的病毒基因组拷贝数的条形上方指示。所述拷贝数与转基因表达的水平成正比。如图3a中所示,通过chad155的rc1(6.21x103vp/细胞)和rc2(6.71x103vp/细胞)的病毒dna复制的量是相似的。chad83比chad155产生更多的rc1(2.76x104vp/细胞)和rc2(9.19x104vp/细胞)病毒dna。通过chad83rc2观察到最高水平的病毒dna复制。关于图2b中显示的病毒产量,人mrc5细胞用包含实施例1的rc1、rc2或rc3载体构建体的chad83感染。感染后2天和7天收获细胞,提取总dna,通过qpcr定量病毒基因组,并且结果表示为每个细胞的载体基因组拷贝。所述感染复数(moi)是每个细胞250或1250个病毒颗粒,并且每个细胞的病毒颗粒数目在表示每个细胞的病毒基因组拷贝数的条形上方指示。所述拷贝数与转基因表达的水平成正比。如图3b中所示,rc2和rc3chad83载体的病毒dna复制的量高于rc1载体。rc2和rc3chad83载体之间存在相当的病毒dna复制。实施例3:实施例1的载体的腺病毒基因组拷贝数在源自小鼠和非人灵长类两者的细胞培养物中评估具有实施例1的构建体的能够复制的腺病毒载体的效率,其表示为每个细胞的载体拷贝数。图4(a)显示在单层中生长并用chad155rc1、chad155rc2、chad83rc1或chad83rc2以每个细胞250个病毒颗粒的感染复数感染的鼠肝nmuli细胞中生长的能够复制的载体的基因组拷贝数。在感染后五天提取总dna,并通过使用与载体的启动子区域退火的引物的qpcr测量载体复制。表示为每个细胞的载体拷贝数的结果显示于图4(a)中。chad155在nmuli细胞中以高效扩增rc1和rc2载体两者。chad155在近似相同的程度上复制rc1(1.73x104)和rc2(1.92x104)载体。在复制rc1和rc2载体中,chad83没有chad155那么有效。chad83在鼠细胞中仅以少量复制载体dna。rc1载体以每个细胞5.47x102个拷贝的水平复制,且rc2载体以每个细胞6.74x102个拷贝的水平复制。非人灵长类vero细胞也以单层生长,并且被chad155rc1、chad155rc2、chad83rc1或chad83rc2感染(图4(b))。使用两种不同的感染复数:每个细胞50和250个病毒颗粒。在感染后五天提取总dna,并通过使用与载体的启动子区域退火的引物的qpcr测量载体复制。表示为每个细胞的载体拷贝数的结果显示于图4(b)中。vero灵长类细胞系对于chad155rc1(在50的moi下为每个细胞3.71x103个拷贝,并且在250的moi下为每个细胞4.93x104个拷贝)和chad155rc2(在50的moi下为每个细胞8.15x103个拷贝,并且在250的moi下为每个细胞7.05x104个拷贝)是容许的。vero灵长类细胞系对于chad83rc1或chad83rc2的容许性差(如果有的话)。在50的moi下,没有检测到从vero细胞表达chad83rc1或chad83rc2载体。在250的moi下,chad83以每个细胞1.13x102个拷贝的水平复制rc1载体,且以每个细胞1.29x103个拷贝的水平复制rc2载体。实施例4:实施例1的载体的来自鼠和非人灵长类细胞的转基因表达进行western印迹分析以比较鼠nmuli细胞中chad155rc1和chad155rc2的转基因表达的水平(图5(a))。用chad155rc1或chad155rc2以每个细胞50、250或1250个病毒颗粒的感染复数感染细胞。在感染后2天和5天收获细胞,使用标准方法制备提取物,并将等量的总细胞提取物上样至sds-page凝胶上。在电泳分离后,将蛋白转移至硝酸纤维素膜上,然后将其用市售的针对狂犬病糖蛋白转基因的单克隆抗体进行探测。图5(a)证明chad155rc1和chad155rc2两者均在鼠nmuli细胞中表达转基因。在感染后2天和5天两者均观察到表达,由约51kda的条带指示,其对应于狂犬病糖蛋白(rg)的预期分子量。在感染后2天和5天两者,chad155rc2载体产生比chad155rc1载体更高水平的转基因表达。然后进行western印迹分析以比较鼠nmuli细胞中chad155rc1、chad155rc2、chad83rc1和chad83rc2的转基因表达的水平(图5(b))。用chad155rc1、chad155rc2、chad83rc1或chad83rc2以每个细胞50、250或1250个病毒颗粒(对于chad83rc1为250和1250)的感染复数感染细胞。处理细胞用于western印迹。在感染后2天和7天收获细胞,使用标准方法制备提取物,并将等量的提取物上样至sds-page凝胶上。在电泳分离后,将蛋白转移至硝酸纤维素膜上,然后将其用市售的针对狂犬病糖蛋白转基因的单克隆抗体进行探测。图5(b)证明chad155rc1、chad155rc2、chad83rc1和chad83rc2在鼠nmuli细胞中表达转基因。在感染后2天和5天两者均观察到表达,由约51kda的条带指示,其对应于狂犬病糖蛋白(rg)的预期分子量。chad155证明比chad83更有效的转基因表达。在感染后2天,甚至在50vp/细胞的低复数,也观察到chad155rc2的稳健的转基因表达,而在较高moi首先观察到chad155rc1的稳健的转基因表达。而且,在chad155和chad83病毒血清型两者中,rc2证明比rc1更有效的转基因表达。在每次直接比较中,rc2比rc1更稳健地表达。进行western印迹分析以比较mrc5细胞中chad83rc1、rc2和rc3的转基因表达的水平(图5(c))。用chad83rc1、rc2或rc3以每个细胞250或1250个病毒颗粒的感染复数感染细胞。在感染后2天和7天收获细胞,使用标准方法制备提取物,并将等量的总细胞提取物上样至sds-page凝胶上。在电泳分离后,将蛋白转移至硝酸纤维素膜上,然后将其用市售的针对狂犬病糖蛋白转基因的单克隆抗体进行探测。图5(c)证明chad83rc1、rc2和rc3全部都在mrc5细胞中表达转基因。在感染后2天和7天两者均观察到表达,由约51kda的条带指示,其对应于狂犬病糖蛋白(rg)的预期分子量。在感染后2天和7天两者,chad83rc2载体产生比chad83rc1和rc3载体更高水平的转基因表达。在第7天,对于rc1和rc3载体没有检测到狂犬病糖蛋白。实施例5:具有单个表达盒的替代黑猩猩腺病毒的构建如实施例1中,使用标准程序从健康黑猩猩分离的野生型黑猩猩腺病毒类型155(chad155)(wo2016/198621)被构建为复制缺陷的病毒,如scitranslmed(2012)4:1和wo2010/086189中所述。在实施例5中,通过插入单个转基因表达盒来构建chad155。该表达盒包含经典人cmv(hcmv)启动子、f0δtm、n和m2-1rsv抗原,以及任选地wpre增强子。该载体显示于图6中。将表达盒插入腺病毒的e1区域中(在e1区域已被缺失之后)。图6中显示的chad155包含编码rsvf0δtm、m2-1和n抗原的全部的转基因,其中在rsvf0δtm抗原和复合rsvn.m2-1抗原之间包括自切割位点(“2a”),其中在rsvm2-1和n抗原之间包括柔性接头。实施例5的chad155rsv载体包含seqidno:4的多核苷酸并编码seqidno:5的多肽。实施例6:具有双重表达盒的黑猩猩腺病毒的构建再次,使用标准程序从健康黑猩猩分离的野生型黑猩猩腺病毒类型155(chad155)(wo2016/198621)被构建为复制缺陷的病毒,如scitranslmed(2012)4:1和wo2010/086189中所述。通过将两个转基因表达盒插入腺病毒中的两个不同位置中来构建实施例6的chad155:(1)第一表达盒组分包含经典的人cmv(hcmv)启动子和n.m2-1rsv复合抗原。将该第一表达盒插入腺病毒的e1区域中(在e1区域已被缺失之后)。(2)第二表达盒包含增强的经典人cmv(增强的hcmv)启动子、f0δtmrsv抗原和wpre增强子。将该第一表达盒插入腺病毒的he2区域中(在he2区域已被缺失之后)。该包含双重表达盒的载体显示于图7中。在图7的构建体中,ad5e4orf6已被取代至早期基因4(e4)区域中。所述取代是增加hek293细胞中的生产率必需的。实施例7:来自实施例6的双重表达盒的转基因表达进行western印迹分析以将mrc5细胞中的实施例6的chad155载体(图中标记为“双重”或“双重盒”)中的转基因表达水平与以下中的转基因表达水平进行比较:(i)包含单个f表达盒的载体(chad155-f0δtm,标记为“f0δtm”),(ii)包含单个nm2表达盒的载体(chad155-nm2,标记为“nm2-1”),和(iii)实施例5的包含含有f和n.m2-1rsv抗原的单个表达盒的载体(chad155-f0δtm.nm2,也标记为“rsv”)。western印迹分析显示于图8和图9中。如图8中所示,用chad155-f0δtm、chad155-f0δtm.nm2(“rsv”)或实施例6的chad155双重盒以每个细胞500个病毒颗粒的感染复数感染细胞。另外,用chad155-f0δtm.nm2(“rsv”)以每个细胞500或1250个病毒颗粒的感染复数感染细胞。在感染后48小时和96小时收获细胞,使用标准方法制备提取物,并将等量的总细胞提取物上样至sds-page凝胶上。图8显示,chad155双重盒在mrc5细胞中提供了与chad155f0δtm相当且比chad155-fδtm.nm2更高的f抗原的表达水平。如图9中所示,用chad155-nm2、chad155-f0δtm.nm2(“rsv”)或实施例6的chad155双重盒以每个细胞250和1250个病毒颗粒的感染复数感染细胞。在感染后48小时收获细胞,使用标准方法制备提取物,并将等量的总细胞提取物上样至sds-page凝胶上。在图9中,chad155双重盒在mrc5细胞中提供了与chad155-nm2单一载体至少相当且比chad155-fδtm.nm2(“rsv”)更高的nm2-1表达水平。实施例8:实施例6的双重表达盒的免疫原性在cd1远交小鼠(每组10只)中评估实施例6的双重表达盒的免疫原性。通过将5x108个病毒颗粒肌肉内注射至小鼠中来进行实验。在免疫后4和8周通过测量rsv中和滴度来测量b-细胞应答。每个点代表单个小鼠中的应答,并且线对应于每个剂量组的平均值。该分析的结果显示于图10中。图10显示,chad155双重盒提供了与chad155f0δtm相当且比由chad155-f0δtm.nm2(“rsv”)产生的b-细胞应答更高的b-细胞应答。还在balb/c近交小鼠(每组48只、11只或8只)中评估实施例6的双重表达盒的免疫原性。通过肌肉内注射107或106个病毒颗粒来进行实验。免疫后3周通过使用在balb/c小鼠中作图的m2肽t细胞表位的离体ifn-γ酶联免疫斑点(elispot)测量t-细胞应答。结果显示于图11中,表示为每百万个脾细胞的ifn-γ斑点形成细胞数(sfc)。每个点代表单个小鼠中的应答,并且线对应于每个剂量组的平均值。在x轴上显示以病毒颗粒的数目计的注射剂量。结果显示于图11中。图11显示,chad155双重盒提供了比由单一盒chad155-f0δtm.nm2(“三重rsv”,其结果从历史数据获得)产生的t-细胞应答更高的t-细胞应答。对于106vp剂量,应答的该差异更大。图11涉及“#阳性小鼠”,即对疫苗应答的小鼠的数目。实施例9:实施例6的双重表达盒在母牛中的免疫原性研究设计在下表2中详述:组母牛数疫苗途径剂量免疫研究结束gp14chad155单一rsv肌肉内(im)1x1011d0d90gp24chad155双重rsv肌肉内(im)1x1011d0d90gp34盐水肌肉内(im)n/ad0d90“chad155单一rsv”是实施例5的chad155,且“chad155双重rsv”是实施例6的chad155。研究中纳入总共12只成年母牛。母牛年龄范围为2.7岁至7.8岁,且具有4.8岁的平均范围。在将它们纳入研究之前,将母牛通过elisa针对牛rsv(brsv)抗体进行预筛选。这允许建立具有相似分布和平均brsvab滴度的研究组(以便不偏重任何组)。在接种疫苗前(d-5或d0)和接种疫苗后(d7、10、14、28、60、90)从母牛收集样品。在该研究中,在第0天(d0),将母牛用两种疫苗之一的1x10^11个病毒颗粒或用盐水接种疫苗。在接种疫苗后的第-5、7、10或28天进行支气管肺泡灌洗(bal),以分离母牛的肺中的t细胞。然后使用细胞内细胞因子染色(ics)检测用疫苗中编码的rsv抗原(以肽合并物的形式)刺激后的cd4+和cd8+t细胞的ifn-γ细胞因子产生(即ifnɣics用于检测动物中的肺t细胞应答)。该实验的结果显示于图12a和12b中。从该实验可以得出结论,chad155-双重rsv诱导支气管肺泡灌洗物(bal)中的一致的rsv-特异性cd4+和cd8+应答。还在接种疫苗后第0、14、28、60和90天从母牛取血液样品,以便使用细胞内细胞因子染色(ics)检测外周血单核细胞(pbmc)的rsv-特异性cd4+和cd+应答的ifn-γ细胞因子产生(即ifnɣics用于检测外周t细胞应答)。该实验的结果显示于图13a和13b中。基于这些结果,可以得出结论,chad155-双重rsv一致地扩增pbmc中的预先存在的rsv-特异性cd4+和cd8+应答。血液样品还用于检测血清中的rsv的中和抗体(nabs)(即检测到外周体液应答)。该实验的结果显示于图14a和14b中。这些结果显示,chad155-双重rsv加强血清中的rsvnab,其在接种疫苗后3个月维持在高于基线的水平。实施例10:编码狂犬病g和rsvnm2蛋白的chad155双重的免疫原性该实验中构建的使用的三种不同的chad155载体:•编码狂犬病g(rg)和rsvnm2蛋白两者的chad155(在该实施例中称为“chad155双重”,和chad155双重hcmvnm2-1–casirgwpre);•仅编码狂犬病g(rg)蛋白的chad155(在该实施例中称为“chad155rg”,和chad155(∆e4)casirgwpre);和•图6中显示的chad155载体,即具有编码rsvf0δtm、m2-1和n抗原的全部的转基因的载体(称为“chad155rsv”)。将三种不同剂量的chad155双重腺病毒施用于小鼠:最高剂量的107个病毒颗粒,和中等剂量的106个病毒颗粒和最低剂量的105个病毒颗粒。将两种不同剂量的chad155rg和chad155rsv载体施用于小鼠。对于chad155rsv,这是较高剂量的107个疫苗颗粒,和较低剂量的106个疫苗颗粒。对于chad155rg,这是较高剂量的106个疫苗颗粒,和较低剂量的105个疫苗颗粒。3周后处死小鼠,并通过ifnγelispot测试脾细胞的对疫苗编码的抗原的t细胞应答。该实验的结果显示于图15a、15b和15c中。从图15a、15b和15c可以看出,chad155双重rg-nm2载体显示与单独编码rg和nm2抗原各自的载体总体相当的免疫应答。图15c比较用于所有三种不同载体的通用106vp剂量下对所有编码的抗原的累积应答。狂犬病g蛋白被列出两次(g1和g2),因为重叠肽的两种合并物用于覆盖该蛋白的整个序列。因此,将两种抗原置于同一载体中仍产生相当的免疫应答,同时允许在同一载体中提供不同病原体的抗原。实施例11:编码狂犬病g和rsvnm2蛋白的chad155双重在hela细胞中的表达在实施例11的实验中,用实施例10中使用的纯化的“chad155双重”、“chad155rg”和“chad155rsv”感染hela细胞。在该实验中使用50、250和1250的感染复数(moi)。为了获得图16a中显示的western印迹(在还原条件下获得),感染后48小时收获细胞裂解物。nm2-1的估计大小为65kda。图16a显示chad155双重盒和chad155nm2-1的相当的表达水平。另外,chad155双重盒的nm2-1表达水平高于chad155rsv载体。为了获得图16b中显示的western印迹,在感染后48小时收获上清液。狂犬病糖蛋白的估计大小为57.6kda。图16b显示chad155双重和chad155rg腺病毒的相当的表达水平。此外,还使用四种不同的载体收集感染性数据。通过六邻体免疫染色法在附着的procell92细胞中评估纯化病毒的感染性。结果在下表3中给出(vp=病毒颗粒,ifu=感染单位,且r是这两个数字之间的比率)。感染性结果表明所有载体都具有相似的感染性。此外,由于所有r值都低于300,所以所有载体的感染性都被认为在可接受的范围内。表3:实施例12:编码crpve2和e1蛋白的chad155双重的免疫原性在该实验中构建两种不同的chad155载体:•编码第一表达盒中的修饰的crpve2蛋白和第二表达盒中的修饰的crpve1蛋白的chad155(称为“crpv双重”);和•编码单个表达盒中的修饰的crpve2和e1蛋白的融合体的chad155(称为“crpv融合体”)向小鼠施用两种不同剂量的两种腺病毒载体:较高剂量的107个病毒颗粒,和较低剂量的106个病毒颗粒。该实验的结果显示于图17中。图17是接种疫苗后3周对脾细胞进行的ifnγelispot。对结果进行统计分析,并且来自不同载体的应答之间的差异不被认为是统计学显著的。然而,如从图17可以看出,与crpv融合载体相比,chad155crpv双重载体在最低剂量下的应答小鼠的频率增加(对于106剂量的crpv双重载体,6/6阳性应答小鼠,但对于106剂量的crpv融合载体,只有4/6阳性应答小鼠。实施例13:编码crpve2和e1蛋白的chad155双重的表达在实施例13中还使用实施例12中使用的两种不同的chad155载体。该实验中使用250和1250的感染复数(moi)。感染后48小时收获细胞裂解物。修饰的e1蛋白的估计大小为48kda,修饰的e2蛋白为35kda,且包含修饰的e1和e2蛋白两者的融合蛋白为88kda。图18显示western印迹(在还原条件下获得),其举例说明crpv双重载体的修饰的e1和e2蛋白的表达比crpv融合载体更好。图18中显示的“pvj”列是使用的对照。此外,使用两种不同的载体收集感染性数据。通过六邻体免疫染色法在附着的procell92细胞中评估纯化病毒的感染性。结果在下表4中给出(vp=病毒颗粒,ifu=感染单位,且r是这两个数字之间的比率)。感染性结果表明两种载体具有相似的感染性。此外,由于所有r值都低于300,所以所有载体的感染性都被认为在可接受的范围内。表4:。序列描述seqidno:1编码野生型chad155的多核苷酸序列seqidno:2编码野生型chad83的多核苷酸序列seqidno:3编码casi启动子的多核苷酸序列seqidno:4编码chad155/rsv的多核苷酸序列seqidno:5rsvf0∆tm-n-m2-1氨基酸序列seqidno:6编码增强的hcmv启动子的多核苷酸序列seqidno:7编码hcmvnm2bgh聚a盒的多核苷酸序列cmv启动子序列:粗体转基因序列nm2:斜体bgh聚a聚a信号:斜体+下划线seqidno:8nm2蛋白序列seqidno:9编码hcmvf0wprebgh聚a盒的多核苷酸序列增强的cmv启动子序列:粗体转基因序列f0:斜体wpre序列:下划线的粗体bgh聚a聚a信号:斜体+下划线seqidno:10f0蛋白序列seqidno:11柔性接头的氨基酸序列seqidno:12柔性接头的氨基酸序列当前第1页12
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