一种鉴定周麦23号小麦品种的方法_2

文档序号:8454173阅读:来源:国知局
科院小麦研究所提供或由 市场购得; 及其他引物序列均由上海生工生物有限公司合成提供; 2XTaqPCRMix购于北京汇天东方科技有限公司; PCR反应在BI0-RADS1000-PCR仪(美国伯乐公司)上运行。 实施例
[0013]由于本发明的难点及关键点在于针对周麦23号小麦品种的特异性引物序列 啸]筛选获得,因此本实施例对于该引物序列的筛选过程简要介绍如下。
[0014] 一、特异性引物序列的初步筛选 初步筛选过程包括如下步骤: USSR引物选择 SSR引物选用覆盖小麦21条染色体的340对简单重复序列(simplesequencer巧eat,SSR)引物,包括BARC、CFA、C抑、GDM,WMC系列的SSR引物及CWM、KSUM、C肥M、S肥S,和CNL 系列的EST-SSR引物。引物序列信息在GrainGenes2.0 (ht1:p://wheat.pw.usda.gov/)查 阅获得。
[0015] 相关引物序列均由上海生工生物有限公司合成提供。
[0016] 2、DNA提取、PCR扩增及扩增产物的电泳 W周麦23号及其亲本周麦13号、新麦9号为检测材料进行引物的初步筛选,具体步骤 如下: (1) 采用单巧粒DNA提取法,分别对每个品种的小麦种子提取DNA; (2) W步骤(1)中提取的小麦种子的DNA为模板,分别W步骤1中的SSR引物为引物序 列,分别进行PCR扩增; 15化PCR扩增反应体系设置如下; 2XI'aqPCRMix(含Taq酶 0. 1U/ML、dNTPs500 帕ol/L、Tris-肥 1 20mmol/L、KCl100mmol/L、MgCl23mmol/L) 7. 5 化, 引物(10帕ol/L),上游序列、下游序列各1化, 步骤(1)提取的DNA模板,1. 5化, 超纯水4化; PCR扩增程序;94°C预变性 5min;94°C变性 1min,55°C退火 1min,72°C延伸 1min, 35个循环;72°C延伸7min;PCR扩增产物置于4°C保存备用; (3) 电泳,电泳前,加入指示剂,W步骤(2)中15化PCR扩增产物为例,加入3uL变性 上样指示剂;94°C变性lOmin后,立即放入冰水混合物中冷却lOmin;然后取处理后的样品 6. 5yL在质量浓度为6%的变性聚丙締酷胺凝胶中电泳分离,银染显色; 所述变性上样指示剂组分为;98%无离子甲酯胺、lOmMEDTAp服.0,0. 1 %漠酪藍和 0. 1 %二甲苯青; (4)对步骤(3)显色后样品进行带型统计,最终根据电泳结果,筛选出PCR扩增的周麦 23号的带型与其亲本周麦13号和新麦9号均不相同的引物对。
[0017]筛选结果表明,周麦23号的带型与其亲本周麦13号和新麦9号均不相同的引物 对有7个,具体如下表所示,初步电泳图如图1和图2所示。
【主权项】
1. 一种鉴定周麦23号小麦品种的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤: (1) 采用单籽粒DNA提取法,分别对周麦23号小麦和待测小麦种子提取DNA; (2) 以步骤(1)中提取的周麦23号小麦和待测小麦种子的DNA为模板,以Zc勝成5为引 物序列,分别进行PCR扩增; 所述Ic引物序列为: 上游序列,TCAITGGTGTCATCCCTCGTGT ; 下游序列,GAATAATGCCTTGACCCTGGAC ; (3) 对步骤(2)所得PCR扩增产物进行电泳,电泳前,加入指示剂,电泳结束后显色; (4) 对步骤(3)所得显色后样品进行带型统计,对比判定,如果待测小麦种子的PCR扩 增样品电泳结果与周麦23号小麦的PCR扩增样品结果带型一致,表明待测小麦种子为周麦 23号品种;如果不一致,则表明待测小麦种子非周麦23号品种。
2. 如权利要求1所述鉴定周麦23号小麦品种的方法,其特征在于,步骤(2)中PCR扩 增反应设置如下: 15 ML PCR扩增反应体系设置如下: 2XTaq PCR Mix 7.5 ML,其中包含:Taq 酶 0.1 U/ML、dNTPs 500 Mmol/L、Tris-HCl 20 mmol/L、KCl 100 mmol/L、MgCl2 3 mmol/L ; 引物Ic騰你以10 Mmol/L计,上游序列、下游序列各I ML, 步骤(1)提取的DNA模板,1. 5ML, 超纯水4 ML ; PCR 扩增程序:94°C预变性 5 min;94°C变性 I min,55°C退火 I min,72°C延伸 I min, 35个循环;72°C延伸7 min ;PCR扩增产物置于4°C保存备用。
3. 如权利要求1所述鉴定周麦23号小麦品种的方法,其特征在于,步骤(3)中所述 指示剂为变性上样指示剂,所述变性上样指示剂组分为:98%无离子甲酰胺、IOmMEDTA pH8. 0、0? 1%溴酚蓝和0? 1%二甲苯青。
4. 如权利要求3所述鉴定周麦23号小麦品种的方法,其特征在于,所述步骤(3)具体 为:取步骤(2)所得15MLPCR扩增产物,加入3yL变性上样指示剂;94°C变性IOmin后,立 即放入冰水混合物中冷却IOmin ;然后取处理后的样品6. 5 yL在质量浓度为6%的变性聚 丙烯酰胺凝胶中电泳分离,银染显色。
【专利摘要】本发明属于小麦种质资源品种鉴定技术领域,具体涉及一种鉴定周麦23号小麦品种的方法。该方法包括提取DNA、以Xcwm65为引物序列,PCR扩增、电泳、显色、带型统计、对比判定等步骤。本发明利用SSR技术,通过对小麦21条染色体上的340个SSR引物进行筛选,确认Xcwm65引物序列针对周麦23号小麦品种具有较好的特异性,可以用于周麦23号品种的检测、鉴定。总体而言,本发明技术成熟,快速、简便、准确度较高,能够较为便捷、有效的鉴定出周麦23号品种,有利于新品种推广和种质资源保护,同时也为其他小麦品种的推广利用和保护提供了较好的应用借鉴。
【IPC分类】C12Q1-68
【公开号】CN104774934
【申请号】CN201510151029
【发明人】殷贵鸿, 邹少奎, 唐建卫, 韩玉林, 李楠楠, 李顺成, 黄峰, 王丽娜, 张倩, 高艳
【申请人】周口市农业科学院
【公开日】2015年7月15日
【申请日】2015年4月1日
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