用于2型糖尿病患病风险评估的遗传位点rs780092及检测试剂盒的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物医药领域，涉及一种用于2型糖尿病患病风险评估的遗传位点 rs780092及检测试剂盒。
【背景技术】
[0002] 我国糖尿病的患病率正呈快速上升的趋势，成为继心脑血管疾病、肿瘤之后另一 个严重危害人民健康的重要慢性非传染性疾病。2013年9月发表于美国医学会杂志JAMA 的一项大型流行病学调查结果显示我国18岁以上人群糖尿病的患病率为11. 6%，已成为 世界上糖尿病患病人数最多的国家。其中，2型糖尿病占90%以上。当前我国已经进入慢 性病的高负担期，具有"患病人数多、医疗成本高、患病时间长、服务需求大"的特点，慢性病 在疾病负担中所占比重达到了 70%。慢性病已经成为影响我国居民健康水平提高、阻碍经 济社会发展的重大公共卫生问题和社会问题。据WHO估计，2005-2015年，中国由于糖尿病 及相关心血管疾病导致的经济损失达5577亿美元。面对慢性病的高发态势，国家有关部门 高度重视，把慢性病防治列为卫生工作的重点加以推进。疾病风险评估是慢性病防治的重 要环节之一。2型糖尿病的发病原因复杂，是遗传与环境因素共同作用的结果，涉及众多风 险因素。
[0003] 血脂被认为是2型糖尿病的重要风险因素之一，血脂升高以及与血脂升高有关的 因素也被列为2型糖尿病的风险因素，例如甘油三酯升高、总胆固醇升高、不健康饮食、缺 乏运动等。其实，血脂不仅与饮食、运动等环境因素有关，还与个体的遗传因素有关。国内 外已有研究发现了一些以单核苷酸多态性（SNP)为主的遗传位点与血脂相关。SNP是由单 个核苷酸的改变而引起的DNA序列改变，造成染色体基因组的多样性。SNP分布广、密度高， 已成为继限制性片段长度多态性（RFLP)标志和微卫星（短串联重复，STR)标记之后的第 三代遗传标记，在肿瘤、糖尿病等复杂疾病的研究中具有重要作用。
[0004] 在评估血脂对2型糖尿病的风险时，目前主要关注甘油三酯、胆固醇等指标的变 化，而血脂相关遗传位点的潜在作用往往没有被考虑在内。具体而言，目前现有的2型糖尿 病风险评估方式具有如下缺陷：其一，血脂相关的遗传位点对2型糖尿病发病风险的影响 目前尚不明确，没有被纳入风险评估体系。因此，现有的2型糖尿病风险评估方式不够全 面。其二，血脂升高相同水平的情况下，由于携带的遗传位点不同，个体之间2型糖尿病的 发病风险也存在差异。因此，现有的2型糖尿病风险评估方式不够个体化。其三，虽然国外 已有相关研究成果，但是中西方人群的遗传基础和生活环境具有明显的差异，国外研究成 果在中国人群中的准确性缺乏大规模前瞻性研究的验证。
【发明内容】
[0005] 本发明的目的是提供一种用于检测rs780092位点的单核苷酸多态性的物质的新 用途，以及提供一种用于评价或辅助评价（特别是早期的评价或辅助评价）待测人患2型 糖尿病的风险性的产品。
[0006] 本发明所提供的新用途具体为：用于检测rs780092位点的单核苷酸多态性的物 质在制备评价或辅助评价（特别是早期的评价或辅助评价）待测人患2型糖尿病的风险性 的产品中的应用。
[0007] 所述rs780092位点位于人源葡萄糖激酶调节蛋白基因（GCKR)上，为：以人基因组 DNA为模板，采用引物对进行PCR扩增得到的扩增产物的自5'末端起第50位核苷酸；所述 rs780092位点的核苷酸为T或C;
[0008] 进一步，以人基因组DNA为模板，采用引物对进行PCR扩增得到的扩增产物的序列 为序列表中序列4。序列4的第50位核苷酸即为所述rs780092位点，为T或C。
[0009] 所述引物对为由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链 DNA组成的引物对。
[0010] 所述用于检测rs780092位点的单核苷酸多态性的物质具体可为如下（1)-(3)中 任一种：
[0011] ⑴由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链DNA组成的 引物对。
[0012] (2)由序列表中序列1所示的单链DNA、序列表中序列2所示的单链DNA和序列表 中序列3所示的单链DNA组成的成套单链DNA。
[0013] (3)含有⑴中所述引物对或⑵中所述成套单链DNA的试剂盒。
[0014] 所述试剂盒还可含有如下物质中的至少一种：dNTP、DNA聚合酶（如Taq酶）、虾碱 性磷酸酶（SAP)。当然，所述试剂盒中还可含有PCR扩增缓冲液和/或配合所述虾碱性磷酸 酶（SAP)使用的所述虾碱性磷酸酶反应缓冲液（SAPbuffer)等。
[0015] 另外，所述试剂盒还可含有用于检测血脂的物质。所述用于检测血脂的物质为用 于检测血液中总胆固醇（TC)和/或低密度脂蛋白胆固醇的试剂和/或仪器。
[0016] 所述试剂盒中还可含有记载有如下（a)或（b)的可读性载体：
[0017] (a)所述rs780092位点携带T等位基因的待测人患2型糖尿病的风险低于所述 rs780092位点不携带T等位基因的待测人；
[0018] 即若待测人的所述rs780092位点携带T等位基因，则所述待测人患2型糖尿病的 风险相对较低，若待测人的所述rs780092位点不携带T等位基因，则所述待测人患2型糖 尿病的风险相对较高；
[0019] (b)所述rS780092位点为TT基因型的待测人患2型糖尿病的风险低于所述 rs780092位点为TC基因型的待测人；所述rs780092位点为TC基因型的待测人患2型糖 尿病的风险低于所述rs780092位点为CC基因型的待测人。
[0020] 所述试剂盒中还可含有记载有如下（c)或（d)的可读性载体：
[0021] (c)仅考虑所述rs780092位点的基因分型对患2型糖尿病的风险的影响（不考虑 所述待测人的年龄、性别、BMI、糖尿病家族史、吸烟、饮酒、血压、血脂水平对患2型糖尿病 的风险的影响），所述rs780092位点的每个T等位基因可降低2型糖尿病的发病风险14%;
[0022] (d)既考虑所述待测人的血脂水平对患2型糖尿病的风险的影响，也考虑所述 rs780092位点的基因分型对患2型糖尿病的风险的影响（不考虑年龄、性别、BMI、糖尿病 家族史、吸烟、饮酒、血压的影响），为如下（dl)-(d3)中至少一种：
[0023] (dl)将总胆固醇与低密度脂蛋白胆固醇作为连续变量进行分析，在所述 rs780092位点为CC基因型的待测人中，总胆固醇在2. 39mmol/L的基础上每升高1个标准 差（1SD= 0. 91mmol/L)，所述待测人患2型糖尿病的风险增加58% (与所述rs780092位 点为CC基因型且总胆固醇小于2. 39mmol/L的人相比）；低密度脂蛋白胆固醇在0. 49mmol/ L的基础上每升高1个标准差（1SD= 0. 66mmol/L)，所述待测人患2型糖尿病的风险增加 43% (与所述rs780092位点为CC基因型且低密度脂蛋白胆固醇小于0. 49mmol/L的人相 比）；
[0024] (d2)将总胆固醇与低密度脂蛋白胆固醇作为连续变量进行分析，在所述 rs780092位点为CT基因型的待测人中，总胆固醇在2. 39mmol/L的基础上每升高1个标准 差（1SD= 0. 91mmol/L)，所述待测人患2型糖尿病的风险增加28% (与所述rs780092位 点为CT基因型且总胆固醇小于2. 39mmol/L的人相比）；低密度脂蛋白胆固醇在0. 49mmol/ L的基础上每升高1个标准差（1SD= 0. 66mmol/L)，所述待测人患2型糖尿病的风险增加 35% (与所述rs780092位点为CT基因型且低密度脂蛋白胆固醇小于0. 49mmol/L的人相 比）；
[0025] (d3)将总胆固醇与低密度脂蛋白胆固醇作为连续变量进行分析，在所述 rs780092位点为TT基因型的待测人中，总胆固醇在2. 39mmol/L的基础上每升高1个标准 差（1SD= 0. 91mmol/L)，所述待测人患2型糖尿病的风险仅增加19% (与所述rs780092位 点为TT基因型且总胆固醇小于2. 39mmol/L的人相比）；低密度脂蛋白胆固醇在0. 49mmol