长链非编码rna基因loc553103的应用_3

文档序号:9447852阅读:来源:国知局
ion, Roche公司),抗地高辛-辣根过氧化物酶复合物检测试剂盒(Anti-Digoxigenin-POD,F油化agments,Roche公司),增强原位表达检测信号的TSA信号放大系统灯SA?Biotin System,肥L700试剂盒,Perki址Imer公司),DAB染色试剂盒(北京中山公司),20x巧樣 酸钢缓冲溶液(salinesodiumcitrate,SSC),硫酸葡聚糖值extransulphate),去离子 甲酯胺值eionizedF'ormamide),多聚腺巧酸(polyadenylicacid,PolyA),多聚脱氧腺 巧酸(polydeo巧aden}dicacid,化lydA),变性剪切的娃精DNA(denaturedandsheared salmonspermDM,ssDNA),酵母转运RNA(yeastt-RNA,tRNA),二硫苏糖醇值TT),50x邓 罕氏缓冲液值enhar化s'ssolution),憐酸缓冲液(PBSbuffer),胃蛋白酶K,牛血清白蛋 白度SA),S乙醇胺灯EA),TNBBuffeHO.IMTris-HCl,抑7. 5,0. 15MNaCL,0. 5%Blocking Reagent),TNTBuffer(0.IMTris-肥 1,抑7.5,0. 15M化化,0.05%Tween20),醋酸酢,阻 iff子式齐ll(Blockin邑reagent曰邑ent,Roche&司)。 阳107] 1.3其他主要试剂和材料
[0108] 无水乙醇、90%酒精、70%酒精、50%酒精、松节油、双蒸水、PBS缓冲液(pH7. 2~ 7. 4,化C1 137mmol/L,KC1 2. 7mmol/L,胞2册〇44. 3mmol/L,KH2PO4I. 4mmol/L) ;3 % 甲 醇-双氧水溶液(80 %甲醇和30 %双氧水配置);0.01mol/L巧樣酸盐缓冲液(citrate buffer,CB,pH6. 0 + 0.l,9ml0. 1M巧樣酸溶液和41ml0. 1M巧樣酸钢溶液加入450ml蒸 馈水中临时配置后再校正工作液抑值);〇.1%膜蛋白酶;苏木素;1%盐酸酒精(1ml浓盐 酸+99ml70%酒精配置);封片胶(PTSCureMountII)。Leica低烙点(58°C)石蜡,国 产蜂蜡,无水酒精,二甲苯,10%中性多聚甲醒化01111〇1/1,抑7.4,06口(:双蒸水和口85缓冲 液配制),苏木素,伊红,中性封片树胶,盖玻片,载玻片。
[0109] 1.4标记探针
[0110] 利用3-tailingDIGOli即ucleutideKit进行寡核巧酸探针标记,反应体系如 下。
[0111]lOOpmololigonucleotide+dd&O=9y1(control:controloligonucleutide 5yl+dd&O4y1) 阳112] Reactionbuffer4jil CoCh 4li1 Dig-dUTP dATPIpl Terminaltransferaseipl 阳11引 混匀,稍离屯、。37°C水浴反应30min,加2yl邸TA(0. 2M,PH8. 0)中止反应。
[0114] 1. 5寡核巧酸探针标记后纯化
[0115] 为了增加标记探针的纯度,需对已标记的探针进行纯化,具体操作如下: 阳116] 1)探针反应混合物(22^1)+2.5^14]?11(:1+75^1100%冷乙醇(-20°(:).
[0117] 2)-70°(:沉淀6〇111111,〇尸20°(:化。 阳1化]3) 13. 000Xg4°C离屯、15min。
[0119] 4)弃上清,用50ii1冰冷的70% (V/V)乙醇洗涂。
[0120] 5) 13.OOOxg4°C,离屯、5min。 阳121] 6)弃上清,真空4°C干燥。
[0122] 7)用无菌双蒸水重溶探针。 阳123] 1. 6原位杂交检测存档石蜡切片中BART6-化的表达
[0124] 石蜡切片杂交前处理
[01巧]1)4°C保存的石蜡切片置于58°C烤片30min,烙化表面石蜡。
[0126] 2)二甲苯依次脱蜡3X5min。 阳127] 3)梯级酒精洗涂,100 %酒精2X2min- 95 %酒精1X5min- 70 %酒精 1X5min一 50 % 酒精 1X5min一DEPC水洗涂 2X3min一DEPC-PBS洗涂 2X5min。 阳12引 4)滴加300y1胃蛋白酶K(l〇yg/ml)于切片上,37°C消化20min。
[0129] 5)切片入PBS(0. 1MPBS巧mg/ml谷氨酸)洗涂Imin,中止反应。
[0130] 6)切片入0.2N肥以于37°C反应20-30min,增加组织的通透性。 阳13U 7)切片用4%多聚甲醒化1MPBS溶解)后固定lOmin,室溫。
[0132] 8)为了增加组织阳性杂交强度,对切片进行乙酷处理。切片入0.25%乙酸酢 BufferI(0.IMS乙醇胺),室溫lOmin。 阳133] 9) 1MPBS洗涂 2X5min。
[0134] 预杂交和杂交
[0135] 预杂交:-20°C保存的预杂交液,先置于37°C解育60min,预杂交液的用量为 50iil,石蜡膜履盖切片,37°C湿盒中预杂交2小时。(预杂交液成份包括:2XSSC,10% Dextransulphate,IXDenhardt'ssolution,50mMPhosphateBuffer(PH7.0),50mM DTT, 250y1,100yg/mlpolyA,5jig/mlpolydA, 250yg/mlyeastt-RNA, 500yg/ml ssDNA,47%Deionizedformamide)。
[0136] 1)移去石蜡膜,甩掉预杂交液,切片置于2XSSC中5min。 阳137] 2)杂交反应:37°C杂交过夜(18-20h)。每一切片加入250y1杂交液并用石蜡膜 履盖。预杂交液中加入相应的探针就成为杂交液。杂交液在预杂交时配制,放置37°C解育, 使探针充分溶解于杂交液中,本实验所用杂交液中探针的终浓度为5(K)ng/ml。
[0138] 3)杂交后洗涂,切片浸入2XSSC,10min,掲去石蜡膜。依次于摇床上摇动洗涂, 2XSSC(0. 5%SD巧,2X15min一 0. 25XSSC(0. 5%SD巧,2X15min。
[0139] 杂交后显色检测反应
[0140] 1)采用Anti-Digoxigenin-POD检测地高辛探针与mRNA结合复合物;TSA放大系 统增强原位杂交反应显色反应的阳性信号,DAB显色。 阳141] 2)切片转至TNT缓冲液中,3X5min。 阳1创 3)滴加TNB阻断缓冲液,300y1/TMAs,室溫,30min。
[0143] 4)吸去多余阻断剂,1:100 稀释的Anti-Digoxigenin-POD(TBS+0. 1 %Triton X-100+1 %阻断剂),室溫4小时。
[0144] 5)TNTBuffeHO. 1MTris-CL,pH7. 5,0. 15M化CL,0. 05 %Tween20)洗涂, 3x5min。
[0145] 6)切片上滴加信号放大试剂Biotin}dTyamid,300y1/TMAs,度iotinylTyramid 胆存液:BiotinylTyramid溶解于 0. 2mlDMS0,Biotin}dTyramid工作液:1X稀释液, 1:50稀释Biotin}dTyramid胆存液),室溫10分钟。 阳 146] 7)TNT洗,3X5min。
[0147] 8)切片滴加SA-HRP(链霉卵白素-辣根过氧化物酶),300y1/TMAs,室溫30min。
[0148] 9)TNT洗,3X5min。 阳1例10)蒸溜水洗涂,1XImin。 阳150] 11)DAB显色,显微镜下巧制显色反应。 阳151] 12)苏木素复染, 阳152] 13)酒精梯级脱水,切片干燥。 阳153] 14)滴加封片胶,相应规格的盖玻片盖化紫外灯下交联切片Imin。
[0154] 1.7结果判断及标准
[0155] 应用光学显微镜分别在低倍和高倍镜下进行观察,首先观察目标RNA的阳性表达 信号在观察目标细胞内的定位:位于细胞核、细胞浆或细胞膜。
[0156] 再分别W该检测RNA表达部位阳性信号的强度和阳性表达的细胞数两种标准进 行综合评分,判断标准为:(1)依据阳性细胞染色强度判断:a.细胞无染色,记0分;b.细 胞染成浅栋色为弱阳性,记1分;C.细胞染成栋色且无背景着色,或细胞染成深栋色并有浅 栋色背景为中等阳性,记2分;d.细胞染成深栋色且无背景着色为强阳性,记3分。(2)依 据阳性细胞表达数计分:a.无阳性细胞表达,记0分;b.阳性表达细胞数《25%,记1分; C.25 % <阳性细胞数< 50 %,记2分;d.阳性表达细胞数> 50 %,记3分。 阳157] 为了尽量降低评分结果的主观因素,由两位病理学专家分别按上述标准之一各自 进行判断和评分,再将两者评分相乘,结果为:①0分者最终计为0分,认为阴性表达;②1 分和2分者最终计为1分,认为弱阳性表达;③3分和4分者最终计为2分,认为中等阳性 表达;④6分到9分者最终计为3分,认为强阳性表达。
[0158] 1.8分析和统计软件
[0159] 应用SPSS13.0统计软件对实验结果进行统计学分析,两两比较用x2test或 Fisherexacttest,相关性分析义用Spearmencorrelation方法;P< 0. 05即差异有统 计学意义。生存曲线分析采用Kaplan-Meiermethod及log-ranktest;多变量分析采用 Cox'Sproportionalhazardsmodel;P< 0. 05 即差异有统计学意义。 阳160] 2结果 阳16U 2. 1BART6-化在鼻咽癌中的表达比癌旁对照组织中的表达显著升高
[0162]在40例癌旁鼻咽上皮(Adjacent化ithelialofNPC)中有:34例BART6-化的 表达低化OW)或者基本检测不到(negative),而在115例鼻咽癌(NPC)中57例检测到有 BART6-化的低表达化OW),其余58例为高表达Oii曲),P<0. 001 (图2和图3)。 阳163] 2. 2BART6-化的表达水平与鼻咽癌转移密切相关性 阳164]我们查询了 115例鼻咽癌患者的临床资料,比如发病年龄、性别、TNM分期等,并 对他们进行了电话随化详细询问了他们的首发时间、治疗情况、有无复发、有无再患其他 疾病、复发及死亡时间等,并登记了生存时间和状态。我们发现在鼻咽癌组织中检测到 BART6-化的表达水平与鼻咽癌患者的远处转移(Distance metastasis)呈负相关关系, 即远处转移组BART6-化的表达水平比原位复发组化ocal relapse)相对较低,(图4, P<0. 0巧。 阳1化]2. 3BART6-化低表达的鼻咽癌患者预后较差
[0166]我们对鼻咽癌组织中BART6-化的表达与病人的生存时间和状态进行的生存分 析,发现鼻咽癌中BART6-化的表达与鼻咽癌患者的预后密切相关,BART6-化高表达化i曲) 的患者生存时间要明显长于BART6-化低表达化OW)的患者(图5)。 阳167] 2. 4BART6-化在胃癌中的表达比癌旁对照组织中的表达显著升高 阳16引在37例胃癌组织中29例检测到有BART6-化的低表达化OW),另外8例为高表达Oii曲),而在运些胃癌样本对应的癌旁组织中有35例BART6-化的表达低化OW)或者基本 检测不到(negative),仅2例为BART6-化阳性,P<0. 05 (图6)。
[0169] 2. 5BART6-化低表达的胃癌患者预后较差
[0170] 我们对胃癌组织中BART6-化的表达与病人的生存时间和状态进行的生存分析, 发现胃癌中BART6-化的表达与胃癌患者的预后密切相关,BART6-化高表达化i曲)的患者 生存时间要明显长于BART6-化低表达化0W)的患者(图7)。 阳171]实施例3,
当前第3页1 2 3 4 5 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1