花青苷调控基因PyMYB10.2及其应用_2

文档序号:9661467阅读:来源:国知局
但是本领域技术人员将会 理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体 条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为 可以通过市售购买获得的常规产品。
[0040]实施例1
[0041 ]本实施例提供了PyMYBlO. 2基因的克隆方法。
[0042]SI1:采用多糖多酚RNA提取试剂盒进行"早红酥"叶片总RNA提取
[0043] 取50mg新鲜叶片,在液氮中研磨成粉末,转移至1.5ml离心管中,添加500yLSL(含 25μ?3-巯基乙醇),经过去蛋白、除DNA和漂洗,最后溶解至500yLddH20中。
[0044]利用1%浓度的琼脂糖检测RNA的完整性,利用紫外分光光度计测定230nm、260nm 和280nm波长下RNA的吸光值,确定RNA的浓度和纯度。
[0045] S12:RACE-PCR
[0046] 取l-5yg的总RNA,按照SMARTRACEcDNAAmplificationKit(Clontech)的说明 书进行反转录,将反应液稀释10倍作为RACE-PCR的模板。
[0047] 根据已知花青苷调控R2R3-MYB转录因子保守区设计兼并引物(F:5'-TGY ATHRAYAARTAYGGIGARGGIAARTGG-3',R:5'-GTRTTCCARTARTTYTTIACRTCRTTNGC-3')。
[0048]PCR反应体系:总体积50yL,包括cDNA模板2yL,0.2mM dNTP,ΙμΜ兼并引物,1 X Ex Taq Buffer,1U Ex Taq(Takara)〇
[0049] 反应程序为:
[0050]① 94°C 2min
[0051]②94°C 30s
[0052]③ 45°C 30s
[0053]④ 72°C lmin
[0054]⑤go to②③④for 35个循环
[0055]⑥ 72°C 5min
[0056]⑦4°C保存
[0057] PCR产物纯化回收,片段大小约为250bp。
[0058] 将回收片段连接至pMD18_T(Takara)克隆载体,转化至DH5a中,在含氨苄青霉素的 LB培养基培养(LB培养基的配方为:1L培养基中含有10g胰蛋白胨、5g酵母提取物、10g氯化 钠和12g琼脂),取阳性克隆送上海生物工程有限公司测序。将测序结果进行BLAST分析,选 择与已知花青苷调R2R3-MYB转录因子同源性高的序列进行RACE-PCR扩增。
[0059]用于3 'RACE的引物为F:GCACTTCGTTCAACAGCATGGTG,用于5 'RACE的引物为R: CCTACTAGTTTGCGAAGTCTGATC,UPM通用引物由RACE试剂盒提供。按照SMARTRACEcDNA AmplificationKit的说明书进行5'和3'RACEPCR扩增。将获得的PCR产物纯化回收、克隆 测序。对5 '和3 '序列进行比对拼接。设计特异引物F:ATGGAAGAGCGTAATTCGTTGGGAG,R: TCAAATACATGCTTTTGAGTTGTTC,扩增基因全长。
[0060]PCR反应体系总体积50yL,包括2yLcDNA模板,0.2mM(1ΝΤΡ,1μΜ特异引物,5yLTaq Buffer,1UTaq酶(Takara)。反应程序为:
[0061]①94°C 2min
[0062]② 94°C 30s
[0063]③ 56°C 30s
[0064]④ 72°G lmin
[0065]⑤go to②③④for 35个循环
[0066]⑥ 72°C lOmin
[0067]⑦4〇C保存
[0068] PCR产物纯化回收,克隆测序。利用NCBI0RFfinder确定获得的基因具有完整的 开放读码框(序列为SEQIDN0:1),并推导出其编码的氨基酸序列(序列为SEQIDN0:2)。
[0069] S13、序列比对分析
[0070] 对分离的基因序列进行序列分析,发现该序列含有保守的R2R3-MYB结构域,在R3- MYB结构域中有bHLH结合域。Blastx分析发现它与花青苷调控R2R3-MYB转录因子同源性最 高,与AtMYB90有39%的相似性,与PyMYBlO和PyMYBlO. 1的相似性分别为32.7%和43.4%。 认为分离了PyMYB10新的同源基因,命名为PyMYB10.2。进化树将PyMYB10.2与花青苷调控 R2R3-MYB转录因子聚为一类(如图1所示)。
[0071] 实施例2
[0072]为了检测PyMYB10.2对花青苷结构基因AtDFR是否具有调控能力,本申请在实施例 2中提供了双荧光素酶检测试验。
[0073]本试验使用的转录因子为梨PyMYB 10.2、拟南芥AtbHLH2和杨梅MrbHLHl,使用的启 动子为拟南芥AtDFR(Tair accession:AT5G42800)〇 [0074] S21、报告载体的构建
[0075]利用DNA提取试剂盒(Tiangen)提取哥伦比亚生态型拟南芥的基因组DNA,以提取 的基因组DNA为模板扩增AtDFR的启动子,引物为:
[0076] F:GAGATTGGCACCACCTTCGCCTC;
[0077] R:TTTTGTGGTTATATG ATAGATTGTGCT。
[0078] 将AtDFR的启动子连接至pMD 18-T(Takara)克隆载体,转化至DH5a中,在含氨苄青 霉素的LB培养基上挑取阳性克隆,进行测序。将测序正确的克隆提取质粒,Sac I和ΚρηΙ双 酶切。将双酶切后的AtDFR启动子克隆至报告载体pGreen II0800-LUC中,进行重组质粒的 酶切鉴定和测序鉴定,提取序列正确的重组质粒存放至_20°C备用。
[0079] S22、激活载体的构建
[0080] 克隆梨PyMYB10.2、拟南芥AtbHLH2和杨梅MrbHLHl的0RF序列,所用引物如下:
[0081]PyMYB10.2.F:SEQ ID N0:3,PyMYB10.2.R:SEQ ID N0:4;
[0084]将扩增PCR产物进行纯化、回收测序。挑选测序正确的克隆提取质粒,然后利用Sac I/ΚρηΙ双酶切将PyMYB10.2和AtbHLH2克隆至激活载体pGreen II62-SK中,利用EcoRI/ Hindlll双酶切将MrbHLHl克隆至pGreen II62-SK载体中,并对重组质粒进行酶切和测序鉴 定序列的正确性。最后通过利用电击转化方法将构建好的载体导入农杆菌GV3101中。在添 加25111〖/1^利福平(1^1^111卩;[0;[11)和2511^/1^庆大霉素(6611丨3111;[0;[11)以及5011^/1^卡那霉素 (Kanamycin)的YEP培养基上进行抗性筛选,通过PCR对抗性农杆菌进行鉴定。将转化成功的 农杆菌保存在_20°C或_80°C备用。
[0085] S23、转基因烟草的构建
[0086]农杆菌侵染的烟草材料为本式烟草,具体的侵染方法如下:烟草种植在温室中,温 室的条件为平均光强为100μ molπ^?Γ1,光照/黑暗的时数为16h/8h,温度为25°C。同时播种 且至少含有6片叶片的成熟烟草用于瞬时表达,选择幼嫩的叶片作为侵染对象。制备农杆菌 侵染夜,将含有构建好表达载体的GV3101单克隆挑至含有50mg/L卡那霉素(Kanamycin)液 体YEP中,28°C过夜培养。取出部分农杆菌培养液与10mMMgCl2和0.5μΜ乙酰丁香酮混合,调 整0D至0.2,室温放置2h后即可进行侵染。含有报告载体的农杆菌与含有激活载体的农杆菌 菌液按体积比1:9的比例混合,取300yL的农杆菌混合液针注射到烟草幼叶上,每个叶片上 注射2~3个点。侵染后3d,利用双焚光素酶检测试剂盒(promega公司)测定萤火虫焚光素酶 (fireflyluciferase)和海肾焚光素酶(reni11aluciferase)的酶活性。方法为:取大小 为2cm左右的烟草叶片,放在500yL裂解液中研磨,取5yL的粗提液(稀释100倍)与40yL luciferaseassaybuffer混合,利用OrionMieroplateLuminomete(BerthoId NetectionSystem)测定焚光强度,然后再加40yLStopandGlowbuffer,测定焚光强度, Luc/Ren的比值作为衡量转录因子对AtDFR启动子调控能力的指标。以仅侵染AtDFR启动子 报告载体农杆菌的烟草作为对照,每个处理设置3个重复。试验结果表明PyMYBlO.2能够调 控AtDFR启动子活性,在花青苷调控相
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