述成套试剂3中，所述检测MECP2基因突变的物质可为由核苷酸序列分别为序 列13和序列14的两个探针组成的探针对；
[0032] 所述检测MUT基因突变的物质为由核苷酸序列分别可为序列15和序列16的两个 探针组成的探针对；
[0033] 所述检测MPZ基因突变的物质为由核苷酸序列分别可为序列17和序列18的两个 探针组成的探针对；
[0034] 所述检测PMP22基因突变的物质为由核苷酸序列可分别为序列19和序列20的两 个探针组成的探针对。
[0035] 为解决上述技术问题，本发明还提供了诊断或辅助诊断肌张力低下患者的试剂或 试剂盒。
[0036] 本发明所提供的诊断或辅助诊断肌张力低下患者的试剂或试剂盒，包括所述成套 试剂1、所述成套试剂2或所述成套试剂3。具体来说，所述诊断或辅助诊断肌张力低下患 者的试剂或试剂盒可由所述成套试剂1、所述成套试剂2或所述成套试剂3与进行基因测序 所需的试剂组成。所述进行基因测序所需的试剂可为illumina公司生产的TruSeqCustom AmpliconKit试剂。
[0037] 为解决上述技术问题，本发明还提供了检测与肌张力低下相关基因突变的方法。
[0038] 本发明所提供的检测与肌张力低下相关基因突变的方法，包括利用所述成套试剂 1、所述成套试剂2或所述成套试剂3检测待测样本的MPZ基因、MTM1基因和/或所述108 个与肌张力低下相关基因这108个基因中的至少一种基因的序列，与相应的基因相比，确 定上述基因是否突变。
[0039] 上述方法中，所述检测与肌张力低下相关基因突变可为检测待测样本与肌张力 低下相关基因中是否存在无义突变（nonsensevariant)、移码突变（frameshift)、选择 性剪切变异（Splicingvariant)、错义突变（missensevariant)、氨基酸截断或插入变异 (nonframeshift)和 / 或密码子丢失（stoplost)。
[0040] 所述检测与肌张力低下相关基因突变具体可为检测待测样本MPZ基因、MTM1基 因、MECP2基因、MUT基因、MPZ基因和/或PMP22基因否突变。所述MPZ基因突变可为MPZ 基因c. 602delA突变，所述MTM1基因突变可为MTM1基因c. 1237A>C突变和/或MTM1基因 c. 231+2T>C突变。
[0041] 与肌张力低下相关基因的突变可导致出现相应基因的单核苷酸多态性，如MPZ基 因c. 602delA突变可导致MPZ基因编码序列的第602位缺失或为A，MTM1基因c. 1237A>C 突变可导致MTM1基因编码序列第1237位出现二等位多态性，该位点为A或C，MTM1基因 c. 231+2T>C突变可导致MTM1基因的第四个内含子的第2位出现二等位多态性，该位点为T 或C。
[0042] 上述方法中，检测MPZ基因c. 602delA突变的方法可包括：
[0043] al)检测待测样本中MPZ基因的cDNA序列，
[0044] a2)将步骤al)的序列与MPZ基因的cDNA序列相比，步骤al)的序列对应于MPZ 基因cDNA序列的第602位缺失A，MPZ基因存在c. 602delA突变。
[0045] 检测MTM1基因c.1237A>C突变的方法可包括：
[0046] bl)检测待测样本中MTM1基因的cDNA序列，
[0047]b2)将步骤bl)的序列与MTM1基因的cDNA序列相比，步骤bl)的序列对应于MTM1 基因cDNA序列的第1237位为C，MTM1基因存在c. 1237A>C突变。
[0048] 检测MTM1基因c.231+2T>C突变的方法可包括：
[0049] cl)检测待测样本中MTM1基因的第四个内含子序列，
[0050] c2)将步骤cl)的序列与MTM1基因的第四个内含子序列相比，步骤cl)的序列对 应于MTM1基因第四个内含子序列的第2位为C，MTM1基因存在c. 231+2T>C突变。
[0051] 上述方法中，所述待测样本可来自于待测个体（如新生儿）的血液或组织，也可来 自于待测胎儿的母体的血液或羊水。
[0052] 为解决上述技术问题，本发明还提供了下述任一应用：
[0053] I、所述成套试剂或所述试剂或试剂盒的下述El)-E10)中任一应用：
[0054] E1)在制备诊断或辅助诊断肌张力低下患者产品中的应用；
[0055]E2)在诊断或辅助诊断肌张力低下患者中的应用；
[0056]E3)在制备筛查或辅助筛查肌张力低下患者产品中的应用；
[0057]E4)在筛查或辅助筛查肌张力低下患者中的应用；
[0058]E5)在制备预测肌张力患病风险产品中的应用；
[0059]E6)在预测肌张力患病风险中的应用；
[0060]E7)在制备检测与肌张力低下相关基因是否突变产品中的应用；
[0061]E8)在检测与肌张力低下相关基因是否突变中的应用；
[0062]E9)在制备检测与肌张力低下相关蛋白质是否突变产品中的应用；
[0063]E10)在检测与肌张力低下相关蛋白质是否突变中的应用；
[0064] II、权利要求1所述产品的所述El) -E6)中任一应用。
[0065] 上述应用中，所述患者可为新生儿、婴幼儿或胎儿。
[0066] 上述应用中，所述与肌张力低下相关基因突变可为MPZ基因、MTM1基因、MECP2基 因、MUT基因、MPZ基因和/或PMP22基因的突变，如MPZ基因c. 602delA突变、MTM1基因 c. 1237A>C突变和/或MTM1基因c. 231+2T>C突变。所述与肌张力低下相关蛋白质突变可为 MPZ、MTM1、MECP2、MUT、MPZ和 / 或PMP22 蛋白质的突变，如MPZ蛋白质p.Lys201AsnfsTer51 突变和/或MTM1蛋白质p.Ser413Arg突变。
[0067] 本发明的发明人通过调研疾病数据库和文献，并根据与现有临床检验技术互补的 原则，确定了与新生儿肌张力低下相关的110个致病基因，对110个基因的编码外显子和 选择性剪切位点设计多重探针序列，然后采用新一代高通量靶向重测序技术，对导致新生 儿肌张力低下的110个致病基因的编码外显子和选择性剪切位点进行测序，通过临床样本 验证和生物信息分析，基于人群和疾病数据库系统，筛选出已知的致病基因突变，对数据 库没有收录的基因突变，进行生物信息学功能预测筛查出新的致病基因突变，并在家系及 正常人群中验证排除，发现了三个新发突变--MPZ基因的c. 602delA突变、MTM1基因的 c. 1237A>C突变和MTM1基因的c. 231+2T>C突变与肌张力低下表型相关。
[0068] 本发明的三个新发突变对开展新生儿肌张力低下的分子诊断具有重要意义。
【附图说明】
[0069] 图1为高通量测序的文库制备和数据分析流程。
[0070] 图2为对MPZ基因和MTM1基因突变的检测结果。其中，A为MPZ基因c. 602delA 的杂合突变后测序峰图，B为MPZ基因c. 602delA的杂合突变后的测序结果与MPZ基因的 序列比对图，C为MTM1基因c. 1237A>C的纯合突变后测序峰图，D为MTM1基因c. 1237A>C 的纯合突变后测序的测序结果与MTM1基因的序列比对图，E为MTM1基因c. 231+2T>C的纯 合突变后测序峰图，F为MTM1基因c. 231+2T>C的纯合突变后测序结果与MTM1基因的序列 比对图。
[0071] 图3为变异质量控制的步骤和条件。
【具体实施方式】
[0072] 下面结合【具体实施方式】对本发明进行进一步的详细描述，给出的实施例仅为了阐 明本发明，而不是为了限制本发明的范围。
[0073] 下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。
[0074] 下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
[0075] 实施例1、与新生儿肌张力低下有关的基因突变的发现
[0076] 本实施例用新一代高通量靶向重测序技术，对有肌张力低下表型的71例临床样 本和17例无肌张力低下表型的正常人样本进行了已知110个致病基因的外显子和选择性 剪切位点的高通量测序，结合生物信息分析发现了MPZ基因的c. 602delA突变，MTM1基因 的c. 1237A>C突变和MTM1基因的c. 231+2T>C突变与新生儿肌张力低下有关，并通过正常 人样本筛选和Sanger测序验证了这三个变异。
[0077] -、与新生儿肌张力低下有关的基因突变的发现
[0078] 流程图如图1所示。
[0079] 1.样本采集
[0080] 采集了71例临床具有肌张力低下表型的婴幼儿的外周血样本，并采集了17例无 肌张力低下表型的正常人外周血样本，Η)ΤΑ抗凝，-80摄氏度保存。肌张力低下的诊断标 准为：新生儿期起病呈四肢松软，伴有吸吮无力、喂养困难，称之为"松软儿";在儿童期以云 顶发育迟缓为主，表现独立走路时间推迟，流涎，语言发育延迟，反射减弱以及关节，四肢运 动有关的神经对刺激反应的延迟等。无肌张力低下表型的正常人为不符合上述诊断标准的 人。
[0081] 2.文库制备和测序
[0082] 采用illumia的DesignStudio平台针对110个基因的编码外显子和选择性剪切 位点设计探针，得到一套探针组合物，这110个基因为：AARS、ALG1、ALG11、ALG12、ALG13、 ALG2、ALG3、ALG6、ALG8、ALG9、B4GALT1、CDKL5、CNBP、C0G1、C0G4、C0G5、C0G6、C0G7、C0G8、 C0L6A1、C0L6A2、C0L6A3、DDOST、DHDDS、DMPK、DNAJB2、DOLK、DPAGT1、DPMI、DPM2、DPM3、 DYNC1H1、EGR2、FGD4、FIG4、FKRP、FKTN、F0XG1、GARS、GDAP1、GMPPA、HSPB1、HSPB8、IGHMBP2、 ISPD、KIF1B、LAMA2、LARGE、LITAF、LMNA、LRSAM1、MAGT1、MAN1B1、MARS、MCEE、MECP2、MED25、 MFN2、MGAT2、MMAA、MMAB、MMADHC、MOGS、MPDU1、MPI、MPZ、MTM1、MTMR2、MUT、NDRG1、NEFL、 PEX1、PEX10、PEX12、PEX13、PEX14、PEX16、PEX19、PEX2、PEX26、PEX3、PEX5、PEX6、PGM1、 PMM2、PMP22、P0MGNT1、P0MT1、P0MT2、PRX、RAB7A、RFT1、RYR1、SBF1、SBF2、SEPN1、SH3TC2、SLC35A1、SLC35A2、SLC35C1、SMN1、SMN2、SRD5A3、SSR4、STT3A、STT3B、TAZ、TMEM165、TRPV4 和TUSC3基因。
[0083] 检测MPZ基因突变的探针序列为序列3和序列4 :
[0084] 序列3 (检测MPZ基因c. 602delA突变的上游探针序列）
[0085] 5'TGTCCTCGGGGTGGTGCTGTTGCTG3'
[0086] 序列4 (检测MPZ基因c. 602delA突变的下游探针序列）
[0087] 5'TGAGGGGTGGGATGGGAACAGTCAAG3'
[0088] 检测MTM1基因突变的探针序列为序列7、8、11和12 :
[0089] 序列7 (检测MTM1基因c. 1