本发明涉及一种通过熵变分析功能基因协同调控物理机制的方法，具体的涉及一种通过DNA分子有效体积和自由体积的概念引入与理论计算、基于熵变函数的定义、生物细胞有效熵变和自由熵变的数学计算、分析生物功能基因在其生长发育中协同调控物理机制的方法。
背景技术：
1850年，德国物理学家鲁道夫·克劳修斯首次提出熵的概念，用来表示任何一种能量在空间中分布的均匀程度，能量分布得越均匀，熵就越大。一个体系的能量完全均匀分布时，这个系统的熵就达到最大值。在克劳修斯看来，在一个系统中，如果听任它自然发展，那么，能量差总是倾向于消除的。让一个热物体同一个冷物体相接触，热量总会自发的从热物体向冷物体流动，热物体将冷却，冷物体将变热，直到两个物体达到相同的温度为止。克劳修斯在研究卡诺热机时，根据卡诺定理得出了对任意可逆循环过程都都适用的一个公式：dS = dQ/T。
1877年，奥地利物理学家玻尔兹曼在研究微观粒子运动统计现象的基础上采用统计学方法建立了熵函数：S=klnΩ，其中，Ω为系统微观粒子的微观状态数，k为玻尔兹曼常数。这个公式反映了熵函数的统计学意义，它将系统的宏观物理量S与微观物理量Ω联系起来，成为联系宏观与微观的重要桥梁之一。基于上述熵与热力学概率之间的关系，可以得出结论：系统的熵值直接反映了它所处状态的均匀程度，系统的熵值越小，它所处的状态越是有序，越不均匀；系统的熵值越大，它所处的状态越是无序，越均匀。系统总是力图自发地从熵值较小的状态向熵值较大（即从有序走向无序）的状态转变，这就是隔离系统“熵增加原理”的微观物理意义。
1906年，德国物理学家、物理化学家瓦尔特·能斯特提出了热力学第三定律：在0K时任何完整晶体中的原子或微观粒子只有一种排列方式，即只有唯一的微观状态，其熵值为零。从熵值为零的状态出发，使体系变化到P=1.013×105Pa和某温度T，如果知道这一过程中的热力学数据，原则上可以求出过程的熵变值，它就是体系的绝对熵值。于是人们求得了各种物质在标准状态下的摩尔绝对熵值，简称标准熵，单位为kJ/mol。
在热力学中，熵是表征物质状态的参量之一，通常用符号S表示。对于可逆过程，熵增定义为dS = dQ/T，若过程是不可逆的，则dS > dQ/T，式中T为物质的热力学温度，dQ为熵增过程中物质吸收的热量。从微观上说，熵是组成系统的大量微观粒子无序度的量度，系统越无序、越混乱，熵就越大。热力学过程不可逆性的微观本质和统计意义就是系统从有序趋于无序，从概率较小的状态趋于概率较大的状态。
基因具有控制生物遗传性状和活性调节的功能。功能基因通过复制把遗传信息传递给下一代，并通过控制结构或功能蛋白的合成来控制生物的个体性状。生物细胞中的DNA分子上有很多基因，但并不是每一基因的特征都表现出来。即使是由同一受精卵发育分化而来的同一生物体不同组织中的细胞，如肌肉细胞、肝脏细胞、骨细胞、神经细胞和红细胞等，它们的细胞形状都是各不相同的，原因在于细胞核中的基因在细胞的一生中并非始终处于活性状态，它们有的处于转录状态，即活性状态，这时基因打开，有的处于非转录状态，即基因关闭。在生物体的不同发育期，基因的活性是不同的，而且基因的活性有严格的程序，基因活性的严格程序是生命周期稳定的基础。
各种不同的生物因其细胞内的基因具有独特的活性调节而呈现不同的形态特征。生物体的一切遗传性状都受基因控制，但是基因并不等于性状，从基因型到表现型（性状）要经过一系列的发育过程。基因控制生物的性状主要通过两条途径，一是通过控制酶的合成来控制生物的性状。这是因为由基因控制的生物性状要表现出来，必需经过一系列的代谢过程，而代谢过程的每一步都离不开酶的催化，所以基因是通过控制酶的合成来控制代谢过程，从而控制生物个体性状的表现的。另一条途径是基因通过控制结构蛋白的成分直接控制生物的形状。蛋白质多肽链上氨基酸序列都受基因的控制，如果控制蛋白质的基因中DNA的碱基发生变化，则可引起信使RNA上相应的碱基的变化，从而导致蛋白质的结构变异。此外，遗传性状的表现，不但要受到内部基因的控制，还受到外部环境的制约。因此，不同基因型的个体在不同的环境条件下可以产生不同的表现型，即使同一基因型的个体，在不同环境条件下，也可以产生不同的表现型，表现型是基因型与环境共同作用的结果。
本申请的发明人经过近年来教学实践中对热力学中熵变机制深入细致的思考结合科研实践中对功能基因协同调控物理机制的潜心研究，设计了一种通过引入DNA分子有效体积和自由体积的概念、基于熵变函数的定义、计算生物细胞有效熵变和自由熵变、分析生物功能基因在其生长发育中协同调控物理机制的方法，实践业已证实该方法是一种简便快捷的分析功能基因协同调控物理机制的新方法。
技术实现要素：
本发明提供了一种通过熵变分析生物功能基因在其生长发育中协同调控物理机制的方法，该方法包括DNA分子有效体积和自由体积概念的引入与理论计算、熵变函数的定义、生物细胞有效熵变和自由熵变的数学计算、功能基因协同调控物理机制的分析等步骤。优选地，在通过熵变分析功能基因协同调控物理机制的步骤中还包括DNA分子有效体积和自由体积概念的引入与理论计算、熵变函数的定义，经过上述对生物细胞有效熵变和自由熵变的数学计算和分析可获得生物功能基因在其生长发育中协同调控的物理机制。
鉴于功能基因协同调控物理机制急需一种简便快捷的分析方法的现实需要，以生物细胞为研究对象，通过DNA分子有效体积和自由体积的概念引入与理论计算、基于熵变函数的定义、生物细胞有效熵变和自由熵变的数学计算和分析获得功能基因协同调控的物理机制，为分子生物学、基因组学提供了一种全新的分析方法。
其中，DNA分子有效体积和自由体积概念的引入是通过熵变分析功能基因协同调控物理机制最核心的科学问题，因此，DNA分子的有效体积和自由体积如何定义和界定是通过熵变分析功能基因协同调控物理机制首先要解决的问题。DNA分子的有效体积是指包含DNA分子间及内外场对DNA分子作用的空间体积，用表示；DNA分子的自由体积是指不受任何相互作用的分子自由活动的空间体积，用表示。对于一个处于一定生理和外部环境的生物细胞由于每个DNA分子间及内外场对DNA分子作用都不同，每个DNA分子的有效体积都将不同，但每种DNA分子有效体积的平均值即平均有效体积却是一定的，可以通过统计热力学的方法理论计算得到，同理每种DNA分子的平均自由体积也是确定的，可以通过实验测得生物细胞的总体积扣除每种生物分子的平均有效体积数学计算得到。影响DNA分子有效体积的因素主要包括分子自身的理化性质、所处的生理及外部环境，具体来说，一个生物细胞所处的生理或外部环境不同，由于其组成DNA分子所受的作用不同，其有效体积和平均有效体积也将不同。总之，但凡是能改变DNA分子间及内外场对DNA分子作用的因素，都将改变DNA分子的有效体积和平均有效体积，并引起生物细胞的熵变。
熵变函数的定义是通过熵变分析功能基因协同调控物理机制的最关键因素，因此，怎样定义熵变函数直接决定了通过熵变分析功能基因协同调控物理机制的计算方法。基于玻尔兹曼熵函数：S =klnΩ，对于一个生物细胞，由于微观状态数Ω取决于生物细胞的总体积、单位体积、分子的种类n和每种分子的数量，因为单位体积是相对的，因此，熵也是一个相对的物理量。熵变函数被定义为：
式中，K，是玻尔兹曼常数，Ω, 是一个生物细胞的微观状态数， J/mol∙K，是摩尔气体常数， 是第i种生物分子的质量， 是第i种生物分子的摩尔质量，和 分别是第i种生物分子的任意两种状态的平均自由体积，和 分别是第i种生物分子的任意两种状态的平均有效体积， 是有效熵变， 是自由熵变。对于一个给定的生物细胞，由于, 和 都是绝对的，因此，熵变也是绝对的物理量。
有效熵变和自由熵变的计算是通过熵变分析功能基因协同调控物理机制的重要环节，因此，有效熵变和自由熵变的计算显得尤为重要。基于一个生物细胞中各种DNA分子平均有效体积的理论计算、总体积的实验测定和平均自由体积的数学计算，分别代入熵变函数和，可以得到生物细胞的有效熵变和自由熵变。
对功能基因协同调控物理机制的分析是本方法的最核心环节。随着生物细胞中DNA分子所处的生理或外部环境不同，DNA分子构型和空间构象将发生显著的变化，DNA分子的平均有效体积和平均自由体积都将改变，生物细胞的熵变也将不同并最终引起DNA分子中基因的活性状态改变，从而按一定程序通过控制结构及功能蛋白的合成来控制生物性状，遗传性状是基因型与环境共同作用的结果。具体来说，随着生物体的生长发育，生物细胞中DNA分子所处的生理或外部环境将发生显著改变， DNA分子的种类、构型和空间构象也将发生不同的改变，分子的平均有效体积和平均自由体积都将明显不同，生物细胞的熵变也将不同并最终引起DNA分子中基因的活性状态改变，从而按一定程序通过控制结构及功能蛋白的合成来控制生物性状；处在生长发育期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小，但由于DNA分子的种类及数量将显著增加，生物细胞的熵变，DNA分子的种类、构型和空间构象将发生显著改变并使其中功能基因多处于转录状态；处在成熟期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积达到某一临界值，平均自由体积也将不变，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象将稳定不变并使其中功能基因处于转录与非转录平衡状态；处在衰老期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小且，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象也将发生改变并使其中功能基因多处于非转录状态，反之亦然。
功能基因协同调控物理机制是分子有序性和无序性两种倾向相互竞争决定的，相互作用是有序性的起因并引起熵减小，即；分子热运动是无序性的来源并引起自发的熵增加，即。通过熵变分析功能基因协同调控物理机制可以概括为：
. 随着生物体的生长发育，生物细胞中DNA分子所处的生理或外部环境将发生显著改变， DNA分子的种类、构型和空间构象也将发生不同的改变，分子的平均有效体积和平均自由体积都将明显不同，生物细胞的熵变也将不同并最终引起DNA分子中基因的活性状态改变，从而按一定程序通过控制结构及功能蛋白的合成来控制生物性状；
. 处在生长发育期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小，但由于DNA分子的种类及数量将显著增加，生物细胞的熵变，DNA分子的种类、构型和空间构象将发生显著改变并使其中功能基因多处于转录状态；处在成熟期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积达到某一临界值，平均自由体积也将不变，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象将稳定不变并使其中功能基因处于转录与非转录平衡状态；处在衰老期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小且，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象也将发生改变并使其中功能基因多处于非转录状态，反之亦然。
该方法业已在实践中验证，结果表明该方法是一种简便快捷的分析功能基因协同调控物理机制的新方法。
具体实施方式
实施例 通过熵变分析生物功能基因在其生长发育中协同调控物理机制的方法
通过熵变分析生物功能基因在其生长发育中协同调控物理机制的方法包括DNA分子有效体积和自由体积概念的引入与理论计算、熵变函数的定义、生物细胞有效熵变和自由熵变的数学计算、功能基因协同调控物理机制的分析几个步骤，基于上述有效体积和自由体积概念的引入和熵变函数的定义、通过对生物细胞有效熵变和自由熵变的计算和分析可获得功能基因协同调控的物理机制。
（1）DNA分子有效体积和自由体积概念的引入与理论计算
DNA分子的有效体积是指包含DNA分子间及内外场对DNA分子作用的空间体积，用表示；DNA分子的自由体积是指不受任何相互作用的分子自由活动的空间体积，用表示。对于一个处在一定生理和外部环境的生物细胞，由于每个DNA分子间及内外场对分子作用都不同，每个DNA分子的有效体积都将不相同，但每种DNA分子有效体积的平均值即平均有效体积却是一定的，可以通过统计热力学的方法理论计算得到，同理每种DNA分子平均自由体积也是确定的，可以通过实验测得生物细胞的总体积扣除每种生物分子平均有效体积数学计算得到。
（2）熵变函数的定义
熵变函数被定义为：
式中，K，是玻尔兹曼常数Ω, 是一个生物细胞的微观状态数， J/mol∙K，是摩尔气体常数， 是第i种生物分子的质量， 是第i种生物分子的摩尔质量，和 分别是第i种生物分子的任意两种状态的平均自由体积，和 分别是第i种生物分子的任意两种状态的平均有效体积， 是有效熵变， 是自由熵变。
（3）生物细胞有效熵变和自由熵变的计算
基于步骤(1)中生物细胞各种生物分子平均有效体积的理论计算和平均自由体积的数学计算结果，分别代入熵变函数和，可以分别得到生物细胞的有效熵变和自由熵变。
（4）功能基因协同调控物理机制的分析
功能基因协同调控物理机制是DNA分子有序性和无序性两种倾向相互竞争决定的，相互作用是有序性的起因并引起熵减小，即；DNA分子热运动是无序性的来源并引起自发的熵增加，即。通过熵变分析功能基因协同调控物理机制可以概括为：
. 随着生物体的生长发育，生物细胞中DNA分子所处的生理或外部环境将发生显著改变， DNA分子的种类、构型和空间构象也将发生不同的改变，分子的平均有效体积和平均自由体积都将明显不同，生物细胞的熵变也将不同并最终引起DNA分子中基因的活性状态改变，从而按一定程序通过控制结构及功能蛋白的合成来控制生物性状；
. 处在生长发育期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小，但由于DNA分子的种类及数量将显著增加，生物细胞的熵变，DNA分子的种类、构型和空间构象将发生显著改变并使其中功能基因多处于转录状态；处在成熟期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积达到某一临界值，平均自由体积也将不变，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象将稳定不变并使其中功能基因处于转录与非转录平衡状态；处在衰老期的生物细胞中DNA分子的平均有效体积将增大而平均自由体积将减小且，生物细胞的熵变，DNA分子构型和空间构象也将发生改变并使其中功能基因多处于非转录状态，反之亦然。
通过上述具体的实施例，更容易理解本发明。上述实施例只是举例性的描述，而不应当被理解为用来限制本发明的范围。