Rna干扰的目标碱基序列的搜索方法,导致rna干扰的多核苷酸的碱基序列的设计...的制作方法

文档序号:455570阅读:238来源:国知局

专利名称::Rna干扰的目标碱基序列的搜索方法,导致rna干扰的多核苷酸的碱基序列的设计...的制作方法
技术领域
:本发明涉及RNA干扰(RNAinterference),具体地说,涉及提高应用RNA干扰的试验、制备等的效率及产生RNA干扰的多核苷酸序列的设计方法。在本说明书的以下部分中将RNA干扰记为“RNAi”。另外,本发明还涉及碱基序列处理装置、在计算机上执行碱基序列处理方法的程序、记录介质以及碱基序列处理系统,特别是涉及由RNA干扰的目标基因的碱基序列出发高效筛选能对目标基因产生RNA干扰的碱基序列的碱基序列处理装置、在计算机上执行碱基序列处理方法的程序、记录介质以及碱基序列处理系统。
背景技术
:RNA干扰是指一种由和意图阻断其功能的基因的特定区域相同的正义和反义RNA组成的双链RNA(double-strandedRNA)(以下简称为dsRNA)干扰、破坏目标基因的转录产物mRNA的相同部分的现象。1998年在线虫上被首次试验发现,可是,在哺乳动物上,当将30个或30个以上的长双链RNA向细胞内导入时就诱导干扰反应,细胞经细胞凋亡程序而死亡,采用RNA干扰存在困难。但另一方面也发现,在小鼠初期胚胎或哺乳动物培养细胞中也可以产生RNA干扰,RNA干扰的诱导机构本身在哺乳动物中也存在。现在,已经发现,短的、大约21-23碱基对的双链RNA(shortinterferingRNA,siRNA)能够在哺乳动物细胞系中不产生细胞毒性的同时诱导产生RNA干扰,从而使在哺乳动物中利用RNA干扰成为了可能。发明详述RNA干扰是一种值得期待有各种应用的技术,可是,在果蝇、线虫中发现,和某些基因的特定领域相同的双链RNA(dsRNA)以及小干扰RNA(siRNA)几乎所有的序列都可以显示干扰效果,但是在哺乳动物中随机选择的(21碱基的)小干扰RNA的70-80%都不显示RNA干扰效果。这对在哺乳动物中利用RNA干扰进行基因功能解析提出了很大的问题。而且,现有技术在设计小干扰RNA时,依赖试验者的经验、感觉的部分很多,很难高准确率地设计能够产生实际RNA干扰效果的小干扰RNA。另外,因为RNA合成需要时间、费用,所以,为进行RNA干扰而进行徒劳无益地合成小干扰RNA对于RNA干扰的研究以及众多的利用RNA干扰方法的普及都构成了妨碍。在以上这种情况下,提供一种简便、高效地进行RNA干扰的方法就成为了一个课题。为了解决上述课题,本发明者们针对RNA干扰法中最耗劳力、时间、费用的部分之一即如何容易地获得小干扰RNA的方法进行了研究。因为在哺乳动物中小干扰RNA的调节制备非常困难,本发明者们通过采用哺乳动物培养细胞系尝试确定能够有效地产生RNA干扰的序列的规律性,从而发现了有效产生RNA干扰的小干扰RNA的序列规律性,完成了本发明。本发明如下所示(1)搜索RNA干扰的目标碱基序列的方法,从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的序列部位。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。(2)上述(1)所述的目标碱基序列的搜索方法,其中在上述规则(c)中,7碱基中的至少3个或3个以上为从富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。(3)上述(1)或(2)中所述的目标碱基序列的搜索方法,其中在上述规则(d)中,碱基数为13-28。(4)在目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的碱基序列、设计和搜索的碱基序列相同的碱基序列、从而产生RNA干扰的多核苷酸碱基序列设计方法。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。(5)上述(4)所述的碱基序列设计方法,其中在上述规则(c)中,7碱基中的至少3个或3个以上为从富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。(6)上述(4)或(5)中所述的碱基序列设计方法,所设计的相同碱基序列的碱基数为13-28。(7)上述(4)至(6)任意一项所述的碱基序列设计方法,其中经过设计,使得上述所设计的相同碱基序列中至少80%或80%以上的碱基与搜索到的碱基序列一致。(8)上述(4)至(7)任意一项所述的碱基序列设计方法,其中搜索到的碱基序列的3’末端碱基和设计的碱基序列的3’末端碱基相同,而且,搜索到的碱基序列的5’末端碱基和设计的碱基序列的5’末端碱基相同。(9)上述(4)至(8)任意一项所述的碱基序列设计方法,在多核苷酸的3’末端添加突出部。(10)双链多核苷酸的制备方法,包括形成一条链,其在与规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,所述规定序列包含在目标基因的碱基序列中且符合下述规则(a)-(d);形成另一条链,其在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部;合成双链多核苷酸时各链的碱基数设计成15-30,(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。(11)双链多核苷酸,通过以下方法合成从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)、碱基数为13-28的序列部位,形成两条链,其中一条链在与包含在目标基因的碱基序列中且符合下述规则(a)-(d)的规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,另一条链在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部,各链的碱基数设计成15-30。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。(12)基因表达抑制方法,包含搜索步骤,是从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)、碱基数为13-28的序列部位,和双链多核苷酸合成步骤,所述双链中,一条链在与包含在目标基因的碱基序列中且符合下述规则(a)-(d)的规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,另一条链在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部,各链的碱基数设计成15-30,和抑制目的基因表达的步骤,其把合成的双链多核苷酸添加至希望抑制目标基因表达的表达系统中,(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。(13)碱基序列处理装置,其特征是,具备部分碱基序列制作装置,其可取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并制作上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息形成部分碱基序列,和3’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息的3’末端的碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),和5’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息的5’末端的碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),和判定是否包含预定碱基的装置,其判定包含上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端7碱基的上述碱基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基组成的预定碱基,和规定序列选择装置,根据上述3’末端碱基判定装置、上述5’末端碱基判定装置、上述判定是否包含预定碱基的装置而判定的结果,从上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息中筛选上述目标基因中特异地产生RNA干扰的规定序列信息。(14)根据(13)所述的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包括区域特异性碱基序列制作装置,其由上述碱基序列信息中目标基因编码区、或转录区相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。(15)根据(13)或(14)所述的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包括共同碱基序列制作装置,其用于制作在源于不同生物的多个上述碱基序列信息间共有、且具有预定碱基数的上述部分碱基序列信息。(16)上述(13)至(15)任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述富含的碱基序列信息是一种包含上述7碱基的碱基序列信息,所述7碱基中至少含有3个或3个由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选出的1或1种以上的碱基。(17)上述(13)至(16)的任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是上述预定的碱基数是13-28。(18)上述(13)至(17)的任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包含含有突出部碱基序列制作装置,其制作含有突出部的上述部分碱基序列信息。(19)上述(13)至(17)的任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是,其还包括突出部添加装置,其在上述规定序列信息的至少一个末端添加上述突出部。(20)上述(18)至(19)的任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述突出部的碱基数为2。(21)上述(13)至(20)的任意一个记载的碱基序列处理装置,其特征是,其进一步还包括,相同或类似碱基序列搜索装置,其从其它的上述碱基序列信息中搜索和上述规定序列信息相同或类似的上述碱基序列信息,和无关基因靶标评价装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索装置搜索得到的上述相同或类似上述碱基序列信息,评价上述规定序列信息是否靶向与上述目标基因无关的基因。(22)上述(21)记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述无关基因靶标评价装置其进一步包括,总和计算装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索方法搜索得到的相同或类似碱基序列信息中,与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,和总和基准靶标评价装置,其根据由上述总和计算方法算出的总和评价上述规定序列信息是否靶向与目标基因无关的基因。(23)一种在计算机上执行碱基序列处理方法的程序,其特征是,其碱基序列处理方法包含部分碱基序列制作步骤,其取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并制作在上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息,和3’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的3’末端碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),和5’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的5’末端碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),和判定是否包含预定碱基的步骤,其判定包含上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息3’末端7碱基的碱基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,和规定序列选择步骤,根据上述3’末端碱基判定步骤、上述5’末端碱基判定步骤、上述判定是否包含预定碱基的步骤的判定结果,从上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息中选择对目标基因特异地产生RNA干扰的规定序列信息。(24)一种计算机可读取的记录介质,其特征是其记录上述(23)中记载的程序。(25)一种碱基序列处理系统,其特征是,将处理RNA干扰的目标基因的碱基序列信息的碱基序列处理装置和客户机装置通过网络可通讯地连接,上述客户机装置具备碱基序列发送装置,其将上述目标基因的名称或上述碱基序列信息提交给上述碱基序列处理装置,和规定序列取得装置,其取得由上述碱基序列处理装置发送的、对上述目标基因特异地产生RNA干扰的规定序列信息,上述碱基序列处理装置具备部分碱基序列制作装置,其取得由上述客户机装置发送的对应上述目标基因名称的碱基序列信息或者由上述客户机装置发送的上述碱基序列信息,制作与上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位对应的部分碱基序列信息,和3’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),和,5’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息5’末端碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),和判定是否包含预定碱基的装置,其判定包含上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端7碱基的上述碱基序列信息是否富含腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,和规定序列选择装置,其根据上述3’末端碱基判定装置、上述5’末端碱基判定装置、判定是否包含预定碱基的装置的判定结果,从上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息中筛选上述规定序列信息,和规定序列发送装置,其将上述规定序列选择装置筛选的上述规定序列信息向上述客户机装置发送。(26)一种碱基序列处理方法,其特征是,其包含部分碱基序列制作步骤,其取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并制作在上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息,和3’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的3’末端碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),和5’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的5’末端碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),和判定是否包含预定碱基的步骤,其判定包含上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息3’末端7碱基的碱基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,和规定序列选择步骤,根据上述3’末端碱基判定步骤、上述5’末端碱基判定步骤、上述判定是否包含预定碱基的步骤的判定结果,从上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息中选择对目标基因特异地产生RNA干扰的规定序列信息。(27)上述(26)中记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含区域特异性碱基序列制作步骤,其由上述碱基序列信息中目标基因编码区、或转录区相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。(28)上述(26)或(27)中记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含共同碱基序列制作步骤,其用于制作在源于不同生物的多个上述碱基序列信息间共有、且具有预定碱基数的上述部分碱基序列信息。(29)上述(26)至(28)中任一记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述富含的碱基序列信息是一种包含上述7碱基的碱基序列信息,所述7碱基中至少含有3个或3个由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选出的1或1种以上的碱基。(30)上述(26)至(29)中任一记载的碱基序列处理方法,其特征是上述预定的碱基数是13-28。(31)上述(26)至(30)中任一记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含含有突出部碱基序列制作步骤,其制作含有突出部的上述部分碱基序列信息。(32)上述(26)至(31)中任一记载的碱基序列处理方法,其特征是,其还包括突出部添加步骤,其在上述规定序列信息的至少一个末端添加上述突出部。(33)上述(31)或(32)记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述突出部的碱基数为2。(34)上述(26)至(33)中任一记载的碱基序列处理方法,其特征是,其进一步还包括,相同或类似碱基序列搜索步骤,其从其它的上述碱基序列信息中搜索和上述规定序列信息相同或类似的上述碱基序列信息,和无关基因靶标评价步骤,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索步骤搜索得到的上述相同或类似上述碱基序列信息,评价上述规定序列信息是否靶向与上述目标基因无关的基因。(35)上述(34)记载的碱基序列处理方法,其特征是,上述无关基因靶标评价步骤其进一步还包括,总和计算步骤,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索方法搜索得到的相同或类似碱基序列信息中,与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,和总和基准靶标评价步骤,其根据由上述总和计算方法算出的总和评价上述规定序列信息是否靶向与目标基因无关的基因。(36)上述(23)记载的程序,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含区域特异性碱基序列制作步骤,其由上述碱基序列信息中目标基因编码区、或转录区相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。(37)上述(23)或(36)记载的程序,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含共同碱基序列制作步骤,其用于制作在源于不同生物的多个上述碱基序列信息间共有、且具有预定碱基数的部分碱基序列信息。(38)上述(23)、(36)、(37)任一记载的程序,其特征是,上述富含的碱基序列信息是一种包含上述7碱基的碱基序列信息,所述7碱基中至少含有3个或3个由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选出的1或1种以上的碱基。(39)上述(23)、(36)、(37)、(38)任一记载的程序,其特征是上述预定的碱基数是13-28。(40)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)任一记载的程序,其特征是,上述部分碱基序列制作步骤进一步包含含有突出部碱基序列制作步骤,其制作含有突出部的上述部分碱基序列信息。(41)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)任一记载的程序,其特征是,其还包括突出部添加步骤,其在上述规定序列信息的至少一个末端添加上述突出部。(42)上述(40)或(41)记载的程序,其特征是,上述突出部的碱基数为2。(43)上述(23)、(36)、(37)、(38)、(39)、(40)、(41)、(42)任一记载的程序,其特征是,其进一步还包括,相同或类似碱基序列搜索步骤,其从其它的上述碱基序列信息中搜索和上述规定序列信息相同或类似的上述碱基序列信息,和无关基因靶标评价步骤,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索步骤搜索得到的上述相同或类似上述碱基序列信息,评价上述规定序列信息是否靶向与上述目标基因无关的基因。(44)上述(43)记载的程序,其特征是,上述无关基因靶标评价步骤其进一步还包括,总和计算步骤,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索方法搜索得到的相同或类似碱基序列信息中,与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,和总和基准靶标评价步骤,其根据由上述总和计算方法算出的总和评价上述规定序列信息是否靶向与目标基因无关的基因。(45)一种计算机可读取的记录介质,其特征是其记录上述(23)、(36)-(44)中任一记载的程序。(46)上述(25)中记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述部分碱基序列制作装置进一步包括区域特异性碱基序列制作装置,其由上述碱基序列信息中目标基因编码区、或转录区相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。(47)上述(25)或(46)中记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述部分碱基序列制作装置进一步包含共同碱基序列制作装置,其用于制作在源于不同生物的多个上述碱基序列信息间共有、且具有预定碱基数的上述部分碱基序列信息。(48)上述(25)、(46)、(47)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述富含的碱基序列信息是一种包含上述7碱基的碱基序列信息,所述7碱基中至少含有3个或3个由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选出的1或1种以上的碱基。(49)上述(25)、(46)、(47)、(48)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述预定的碱基数是13-28。(50)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述部分碱基序列制作装置进一步包含含有突出部的碱基序列的制作装置,其制作含有突出部的上述部分碱基序列信息。(51)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,其还包括突出部添加装置,其在上述规定序列信息的至少一个末端添加上述突出部。(52)上述(50)或(51)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述突出部的碱基数为2。(53)上述(25)、(46)、(47)、(48)、(49)、(50)、(51)、(52)中任一记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,其进一步包括,相同或类似碱基序列搜索装置,其从其它碱基序列信息中搜索与上述规定序列信息相同或类似的碱基序列信息,和无关基因靶标评价装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索装置搜索得到的相同或类似碱基序列信息,评价上述规定序列信息是否靶向与上述目标基因无关的基因。(54)上述(54)中记载的碱基序列处理系统,其特征是,在上述碱基序列处理装置中,上述无关基因靶标评价装置其进一步还包括,总和计算装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索方法搜索得到的相同或类似碱基序列信息中,与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,和总和基准靶标评价装置,其根据由上述总和计算方法算出的总和评价上述规定序列信息是否靶向与目标基因无关的基因。图1表示人与小鼠的共同序列的siRNA设计图。图2表示显示RNAi效果的siRNA的规律性的图。图3表示人FBP1及小鼠Fbp1的碱基序列中具有规定序列的共同部分(粗体部分)。图4列举人FBP1及小鼠Fbp1中共有的规定序列。图5对人FBP1及小鼠Fbp1中共同的规定序列进行评分。图6表示为了避免目标基因以外的基因敲除,取规定序列中的一个进行BLAST搜索的结果。图7表示为了避免目标基因以外的基因敲除,取规定序列中的一个进行BLAST搜索的结果。图8表示程序的输出结果。图9表示RNA片断的设计(a~p)。图10表示验证a~p的siRNA是否显示RNAi效果的试验结果,[B]为在果蝇培养细胞中的结果,[C]为在人培养细胞中的结果。图11表示a~p的siRNA的序列特征分析结果。图12表示本发明的基本原理的原理构成图。图13的框图表示一例适用于本发明的本发明系统的碱基序列处理装置100的构成。图14表示目标基因碱基序列文件106a中存放的信息的一例。图15表示部分碱基序列文件106b中存放的信息的一例。图16表示判定结果文件106c中存放的信息的一例。图17表示规定序列文件106d中存放的信息的一例。图18表示对照序列数据库106e中存放的信息的一例。图19表示同一性或相似性文件106f中存放的信息的一例。图20表示评价结果文件106g中存放的信息的一例。图21的框图表示一例适用于本发明的本发明系统的部分碱基序列制作部102a的构成。图22的框图表示一例适用于本发明的本发明系统的无关基因标靶评价部102h的构成。图23表示本实施例中本发明系统的主处理的一例的流程图。图24表示本实施例中本发明系统的无关基因标靶评价处理的一例的流程图。图25表示目标基因表达载体pTREC的构造图。图26表示在实施例2的2.(2)中一条引物经设计不夹带有内含子时的PCR的结果。图27表示在实施例2的2.(2)中一条引物经设计夹带有内含子时的PCR的结果。图28表示siRNA;siVIM35的序列及构造的图。图29表示siRNA;siVIM812的序列及构造的图。图30表示siRNA;siControl的序列及构造的图。图31表示siVIM812及siVIM35的RNAi活性的分析结果。图32表示siControl、siVIM812及siVIM35相对于波形蛋白(vimentin)的RNAi活性。图33表示抗体染色的结果。图34表示根据程序设计的siRNA对萤光素酶基因的RNAi活性的测定结果。图35表示根据程序设计的siRNA对SARS病毒序列的RNAi活性的测定结果。实施本发明的优选实施例本发明的实施方案,按以下1至7的顺序说明1、RNA干扰的目标基因序列搜索方法2、产生RNA干扰的多核苷酸的碱基序列设计方法3、双链多核苷酸的制备方法4、基因抑制表达方法5、siRNA序列设计程序6、siRNA序列设计的商务模型系统(businessmodelsystem)7、执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置等1、RNA干扰的目标基因序列搜索方法本发明的搜索方法是一种从目标基因的碱基序列搜索出引起RNA干扰的碱基序列的方法。具体地说,本发明的搜索方法是从RNA干扰的目标基因碱基序列中搜索符合下述规则(a)至(d)的序列部位。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)。(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。所谓“目标基因”中的“基因”是指编码遗传信息的载体。“基因”由诸如DNA、RNA或DNA及RNA的复合体等编码遗传信息的物质构成,作为遗传信息,而不是其物质本身,可以将碱基序列的电子数据在电子计算机上进行处理。“目标基因”可以指编码一个编码区的目标基因、跨越多个编码区的目标基因或者序列明确的所有多核苷酸。想搜索具有具体功能的基因的时候,通过只将此规定基因作为目标基因,可以高效地搜索能够在该规定基因特异性地产生RNA干扰的碱基序列。也即,众所周知RNA干扰是一种通过干扰破坏mRNA的现象,通过选择特定的编码区能够减轻搜索负荷。而且,一组转录区也可以作为目标基因进行搜索。另外,除非作出相反的说明,本说明书中表示的碱基序列均以正义链,即mRNA的序列,作为基准。此外,在本说明书中,将满足符合上述规则(a)至(d)的碱基序列称之为“规定序列”,在上述规则中,胸腺嘧啶(T)对应于DNA序列,而尿嘧啶(U)则对应于RNA序列。在规则(c)中规定,3’末端的附近的序列为富含从腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中任选的碱基,作为搜索时的一个指标,具体规定为在从3’末端开始的7碱基范围内的序列为富含选自腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的碱基。在规则(c)中,所谓“富含序列”意指某一预定碱基出现频率高。概括地,在规定序列的3’末端侧的5-10个碱基、优选7个碱基序列中含有1种或1种以上从腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中任选的碱基,优选含量至少40%或40%以上、更优选至少50%。更具体地说,比如在规定序列为19碱基的情况下,3’末端侧的7碱基中优选含有至少3个碱基、更优选至少4个碱基、特别优选至少5个碱基是从腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中任选的1种或1种以上碱基。对于是否符合规则(c)的确认方法不进行具体的限定,只要能确定7碱基中优选至少3个碱基、更优选至少4个碱基、特别优选至少5个碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)就可以。例如,将3’末端的7碱基序列中含有3个或3个以上从腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中任选的1种或1种以上碱基定义为“富含”时,从3’末端的第1个碱基开始逐个比对是上述三种碱基的哪一个,一直比对至第7个碱基结束,只要出现了3个的情况就认为能够判断其符合规则(c),例如,如果在至第3个碱基处就已经出现了3个碱基,检查3个碱基就足够了。也就是说,在针对规则(c)进行搜索时,没必要必须将3’末端侧的7碱基全部比对。相反的话,比对至第7个碱基仍没有出现3个以上碱基则判定为不富含,不满足规则(c)。众所周知,双链多核苷酸中腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)以氢键互补结合,而且,相对于鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的氢键互补结合(G-C氢键结合)形成三个氢键结合部位,腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的氢键互补结合(A-T/U)只具有2个氢键结合部位,一般而言,相对于G-C氢键结合,A-T/U氢键结合的结合力较弱。在规则(d)中规定了搜索碱基序列的碱基数。搜索碱基序列的碱基数就是产生RNA干扰的碱基数。根据不同的条件,如生物体种类的差异,碱基数过大的siRNA会对细胞产生毒性。碱基数的上限因你想要产生RNA干扰的生物种类而异,但不论任何物种,构成siRNA的单链碱基数也优选为30以下,而且对于哺乳动物而言,优选为24或24以下,更优选为22或22以下。而且,只有RNA干扰能产生,就不对产生RNA干扰的碱基数的下限进行特别限制,优选至少15,更优选至少18,还更优选至少20。单链构成的siRNA的搜索碱基数特别优选21。此外,下面还要说明,siRNA中还要在规定序列的3’末端设突出部。突出部的碱基数为优选为2,因此,不含突出部分,仅仅规定序列的碱基数的上限最好为28或28以下,更优选22或22以下,还更优选20或20以下,而下限优选至少13,更优选至少16,还更优选至少18。规定序列的最优选碱基数为19。在进行RNAi的目标碱基序列搜索的时候,可以包含也可以不包含突出部。符合规定序列的碱基序列产生RNA干扰的可能性极高,因此,本发明的搜索方法能够以极高的可能性搜索到产生RNAi的序列,从而使产生RNAi的多核苷酸设计简化。在又一优选实施例中,规定序列不包含7个或7个以上碱基连续出现的鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列。所谓7个或7个以上碱基连续出现鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列,包括单独鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)连续排列,也包括鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)混合排列的情况,更具体地说,包括GGGGGGG、CCCCCCC以及GCGGCCC等。另外,规定序列的搜索是在碱基数确定以后,利用装有一种程序的计算机高效检出,该程序可以搜索与规则(a)至(d)等相符合的部位。更具体的实施方案在下述5.siRNA序列设计程序和7.执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置中进行描述。2、产生RNA干扰的多核苷酸的碱基序列设计方法本发明的碱基序列设计方法是根据上述搜索方法搜索得到的碱基序列进行产生RNA干扰的多核苷酸(siRNA)的碱基序列的设计。siRNA主要由RNA组成,但siRNA的实施例也包括含有一部分DNA的siRNA,即混合多核苷酸。本发明的碱基序列设计方法是从目标基因碱基序列搜索到上述符合规则(a)至(d)的碱基序列,然后设计出和上述搜索到的碱基序列同源的碱基序列。在又一优选的设计例中,可以考虑规定序列中不包含7个或7个以上碱基连续出现鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的序列的情况。规则(a)至(d)以及搜索方法与上述关于本发明的搜索方法的描述一致。所谓“同源序列”是指相同的序列以及在不丧失产生RNAi功能的范围内含有对相同的序列进行诸如缺失、置换、插入等突变的序列。虽因目标基因的种类、序列而异,但允许突变的范围,以同源性表示的话,优选80%或80%以上、更优选90%或90%以上、还更优选95%或95%以上。在计算允许突变范围内的同源性时,对采用同一搜索算法计算出的数值组进行比较。搜索的算法不进行具体限定,适合于局部序列搜索的搜索算法均可以,更具体地,优选采用BLAST、ssearch等等。如上所述,虽搜索出来的序列可以进行少量改变,但特别优选设计的碱基序列的碱基数和搜索的序列一致。例如,关于碱基数相同的情况下碱基改变的许可度,设计的碱基序列的碱基优选80%或80%以上、更优选90%或90%以上、特别优选95%或95%以上与搜索的序列一致。例如,设计碱基数为19的碱基序列时,优选16个或16个以上碱基、更优选18个或18个以上碱基与搜索序列一致。而且,在设计与搜索的碱基序列同源的序列时,理想地,搜索到的碱基序列的3’末端碱基和设计的碱基序列的3’末端碱基相同,而且理想地,搜索的碱基序列的5’末端碱基和设计的碱基序列的5’末端碱基相同。通常在siRNA分子中设突出部。所谓突出部是指在双链siRNA分子中的各单链的3’末端设置的单链状态的突出部分。突出部的碱基数虽也因生物种类影响,但优选突出部的碱基数为2。突出部的碱基序列虽一般来说可以是任意碱基,但优选采用与搜索的目标基因相同的碱基序列、TT或者UU等。如上所述,通过在设计为和上述搜索到碱基序列同源的规定序列的3’末端设置突出部,设计构成siRNA的正义链。可选择地,也可以通过搜索从最一开始就包含突出部的规定序列来进行设计。突出部的优选碱基数是2。因此,例如,在设计包含碱基数为19的规定序列以及碱基数为2的突出部的单链siRNA时,可以从目标基因中搜索出包含突出部的siRNA的碱基数为21的序列。而且,搜索双链时,也可以搜索碱基数为23的序列。本发明的碱基序列设计方法如上所述,是从所需的目标基因中搜索给定的序列,但产生RNA干扰的对象也可与目标基因的来源不一致。也可以适用于亲缘关系相近的物种。例如,以第1种生物上分离的基因作为目标基因,也可以用于属于第1种生物近缘种的第2种生物的siRNA的设计。进一步,例如通过搜索两种或多种哺乳类动物的共有序列,并从这个共同序列中搜索上述规定序列来进行设计,可以设计能够在广泛适用于哺乳类的siRNA。这样设计的原因是考虑到在两种或多种哺乳类中的共有序列在其它哺乳类动物存在的可能性是很高的。为了对与目标基因无关的基因不产生RNA干扰,优选地,还要搜索一下与设计的序列相同或类似序列是否包含在其它的基因中。与设计的序列相同或类似序列的搜索可采用能够进行一般同源性搜索的软件进行。通过排除这样的相同或类似序列,能够设计出仅对目标基因特异性地产生RNA干扰的序列。根据本发明的设计方法,可以容易地、高几率地设计产生RNA干扰的RNA分子,尽管RNA的合成仍然需要花费劳动、时间和费用,但本发明的设计方法可以使他们最小化。3、双链多核苷酸的制备方法本发明的双链多核苷酸的制备方法是高几率产生RNA干扰的双链多核苷酸的制备方法。本发明的双链多核苷酸的碱基序列遵从上述本发明的碱基序列设计方法进行设计,然后合成符合上述序列设计的双链多核苷酸。序列设计的优选实施方案与上述关于碱基序列设计方法相同。合成双链多核苷酸产生RNA干扰,且已知siRNA就属于这种双链多核苷酸。另外,本发明的制备方法制备的双链多核苷酸优选由RNA构成,也可由含有部分DNA的混合多核苷酸构成。本说明书中,含有部分DNA的双链多核苷酸也被纳入siRNA的概念范畴。而且,根据本发明者的研究,siRNA在构造和功能上具有非对称性倾向,从产生RNA干扰的目的出发的话,正义链的5’末端侧的一半和反义链3’末端侧的一半最好由RNA构成。在双链多核苷酸中,一条链通过在与规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部而形成,所述规定序列包含在目标基因的碱基序列中且符合规则(a)至(d),另一条链则通过在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部而形成,各链的碱基数(包含突出部)为18-24,更优选为20-22,特别优选为21。而且,突出部的碱基数优选为2。全部碱基数为21、其中突出部的碱基数为2的siRNA适用于高几率地产生RNA干扰的同时(甚至在哺乳类中也)不会产生细胞毒性。RNA的合成可以通过化学合成法合成,也可以通过标准的生物技术合成。在一种技术中,制备具有预定序列的DNA链,以产生的DNA链为模板在转录酶的作用下合成RNA单链,合成的单链RNA再形成双链RNA。另外,关于分子生物学的基本技术有很多标准的试验指南,如分子生物学基本方法(1986);Sambrook等编著的分子克隆试验手册,第2版,冷泉港实验室出版社,冷泉港,纽约(1989);细胞工程学手册,黑木登志夫等编著,羊土社(1992);细胞工程学新手册,Muramatsu等编著,羊土社(1992);等等。作为上述本发明的制备方法得到的多核苷酸的一个优选实施方案是用如下方法产生的双链多核苷酸,所述方法是从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合规则(a)至(d)的含有13-28个碱基的序列部位,一条链通过在与符合规则(a)至(d)的上述规定序列相同的碱基序列的3’末端设突出部而形成,另一条链通过在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设突出部而形成,合成各链的碱基数为15-30。得到的多核苷酸为能够高几率地产生RNA干扰的多核苷酸。而且,也可以制备表达siRNA的表达载体,通过一种能够表达含有规定序列的序列的表达载体,在能够进行表达的非细胞系或细胞系条件下,采用表达载体提供预定的siRNA。以前,siRNA的常规设计依赖于试验者的经验或直觉,存在重复试验和试验错误的情况较多。但是,根据本发明的双链多核苷酸的制备方法,能够高几率地制备产生RNA干扰的双链多核苷酸。根据上述本发明的搜索方法、序列设计方法和多核苷酸制备方法,够够大幅降低用于RNA干扰的各种试验、制作等中需要的劳动、时间和成本。也即,本发明能够大幅简化将RNA干扰用于解析基因、为新药开发探索靶标、开发新药、基因治疗、研究生物种间差异时的试验、研究、开发、制造等等,从而提高了效率。4、抑制基因表达方法本发明的抑制基因表达方法包含搜索预定碱基序列的步骤、根据搜索的碱基序列设计合成siRNA碱基序列的步骤、以及将得到的siRNA导入含有目标基因的表达系统的步骤。搜索预定碱基序列的步骤遵从上述RNA干扰的目标碱基序列搜索方法。优选的实施方案与上述一致。而且,根据搜索得到的碱基序列的siRNA碱基序列的设计合成步骤遵从上述产生RNA干扰的多核苷酸碱基序列设计方法、双链多核苷酸的制备方法进行。优选的实施方案也与上述一致。得到的双链多核苷酸添加于目标基因的表达系统中抑制目标基因的表达。所谓目标基因的表达系统即目标基因表达体系,更具体地说,是指由一个至少能形成目标序列的mRNA的反应体系提供的系统,目标基因的表达系统的实施例既包含体外(invitro)系统也包含体内(invivo)系统。作为目标基因的表达系统,除了细胞培养、组织培养、生物活体以外,也包括采用无细胞系。意图抑制其表达的目标基因(抑制目标基因)也不需要与搜索序列源自同一物种,但如果搜索对象基因和抑制对象基因之间的亲缘关系越近,对特定基因的抑制就越具有特异性和高效性。所谓导入表达系统,即进入目标基因的表达反应系统中。具体举例说,在一种方法中,可以将双链多核苷酸转染具有目标基因的培养细胞,并进入细胞内,在另一种方法中,制备具有包含规定序列及突出部的碱基序列的表达载体,再将该表达载体导入具有目标基因的细胞内。根据本发明的抑制基因表达方法,由于可以产生引起RNA干扰的多核苷酸,所以可以高效、简便地对基因进行抑制。5、siRNA序列设计程序以下,通过siRNA序列设计程序的实施方案进行说明5.1程序概述本程序在对还未进行基因组测序的物种例如马、猪等进行RNA干扰时,以已经公开的人、鼠的同源序列信息为基础计算在目标物种中能够使用的siRNA序列。如果利用本程序进行siRNA序列设计,能够不需对目标基因测序而迅速进行RNA干扰。siRNA设计(计算)时,考虑G-C分配规律(即上述规则(a)至(d))高几率选择具有RNAi活性的序列的同时,为了对于无关基因不产生RNA干扰,通过同源性搜索检查核对。在本说明书中,有时将G或者C标记为“G/C”,A或者T标记为“A/T”,而且“A/T(U)”中的“T(U)”表示在脱氧核糖核酸序列的情况下为胸腺嘧啶T,在核糖核酸序列的情况下为尿嘧啶U。5.2siRNA设计的方针假设已知人的基因X以及鼠的同源基因X,本程序读取那些序列,并从编码区(CDS)部分搜索23个或23个以上碱基的完全共同序列,通过从这个共同部分设计siRNA,那个siRNA能够将人和鼠的基因X同时作为靶标。(图1)考虑到人和小鼠完全共同的序列部分在其它哺乳类中也出现的概率很高,上述的siRNA不止对人和鼠的基因X,对其它的哺乳类的基因X也可能具有功能。即,即使在目标基因的序列未知的物种中,只要对应的人和鼠的同源基因序列已知,就可以利用本程序设计siRNA。另外,在哺乳类动物中,已经探明,实际功能性的siRNA具有规律性(图2)。本程序仅筛选符合此规律的序列。图2显示了具有RNA干扰效果的siRNA序列的规律性(siRNA的G/C分布规律)。图2中的siRNA具有21碱基的双链RNA链分别在3’一侧具有2个碱基的突出部,5’一侧的19个碱基间形成碱基对,可以看出,形成碱基对的19个碱基中编码侧的序列必须满足下列条件1)3’末端为A/U,2)5’末端为G/C,3)3’一侧的7个碱基A/U比例较高。特别是1)及2)的条件非常重要。5.3程序构造本程序由三个部分构成,即5.3.1搜索人与小鼠具有共同位点的共同序列的部分,5.3.2根据GC分布规律对序列进行评分的部分,5.3.3通过同源搜索检查是否靶向无关基因的部分5.3.1搜索共同序列部分读取多个碱基序列文件(file1,file2,file3,……),在全部序列文件中找出共同出现的23个字符的全部碱基序列。(计算例)将文件1为人基因FBP1(NM_000507人果糖1,6-二磷酸酶1),文件2为鼠Fbp1基因(NM_019395鼠果糖二磷酸酶1)的序列输入程序,其结果,从两者的序列(图3)找到了15个两者共同具有的23碱基序列(人FBP1和鼠Fbp1的共同序列)(图4)。5.3.2对序列进行评分部分为了仅筛选出适合于前述G/C分布规律的序列,对23碱基序列进行评分(方法)对于23碱基序列进行按以下方式评分评分1从开始第21个碱基是否是A/U?[否为0,是为1]评分2从开始第3个碱基是否是G/C?[否为0,是为1]评分3从开始第15个碱基至第21个碱基的7个碱基的字符为A/U的数总评分评分1-3的积。积为3或3以下计为0。(计算例)对第4图所示的15个序列进行计算的结果如第5图所示,第5图为对人FBP1和鼠Fbp1的共同序列进行评分的图。在第5图的序列后面,按顺序记载的是评分1、评分2、评分3和总评分。5.3.3检查是否将无关基因作为靶标部分为了防止设计的siRNA与和目标基因无关的基因发生作用,对已经公开的人与小鼠所有的mRNA进行同源性搜索,并评价无关基因的一致程度,同源性搜索可以使用各种可能的算法,这里举例说比如可以使用BLAST。另外,使用BLAST时,考虑到搜索序列为23个碱基比较短,最好把字长(WordSize)尽量减小。BLAST搜索后,除目标基因以外,对BLAST的结果中命中的E值为10.0或10.0以下的结果求E值倒数的总和(以下称此值为同源性评分)。即同源性评分(X)由下式求得X=Σallhits1E]]>注意命中结果的E值越低,表示和查询的23个碱基字符的同源性就越高,成为siRNA的靶标的危险性就越高。而且,命中结果越多,将更多的无关基因成为靶标的几率就越高。考虑到这样2点,采用上式评价siRNA靶向与目标基因无关的基因的危险性。(计算例)对于每个具有23个碱基的序列,进行上述同源性搜索和同源性评分的结果(如图6、图7所示),在图6中,对人FBP1和鼠Fbp1的共同序列“caccctgacccgcttcgtcatgg”进行BLAST搜索的结果,最初的两行是鼠FBP1和人FBP1中都命中的结果,同源性评分为5.9,是一个命中结果较少的例子。这个序列的siRNA将其它基因作为靶标的危险性很低。此外,图7中,显示了对人FBP1和鼠Fbp1的共同序列“gccttctgagaaggatgctctgc”进行BLAST搜索的结果,命中结果较多,同源性评分为170.8,将其它基因作为靶标的危险性很高,不适合于作为siRNA。实际上,上述5.3.1、5.3.2、5.3.3的部分可整合为一体,输入第3图所示的人与鼠的序列,直接得到第8图所示的输出结果。这里,在第8图所示的序列后,顺次记载的是评分1、评分2、评分3、总评分以及将同源性评分放大10倍的值。另外,为了缩短处理时间,程序可设计为,当总评分为0时,不计算同源性评分,结果为,片段“36caccctgacccgcttcgtcatgg”显然可以用作siRNA。另外,5.3.1、5.3.2和5.3.3其中的一个部分也可以单独利用。5.4实际计算对应于人与小鼠间的同源染色体上的约6400个基因对,使用本程序实际进行了siRNA的设计,其结果为,其中约7成具有人和鼠的共同序列,而且满足有效siRNA的序列规律性的规律,能够进行不将无关基因作为靶标的siRNA的设计。这些siRNA不仅在人和小鼠中,也在范围宽泛的哺乳动物中也有望可以高效地抑制靶标基因,相信在家畜、宠物等上的利用的产业价值很高。而且,利用本程序,也可以对同种生物内具有两个或两个以上基因的情况,如eIF2C1和eIF2C2同时作为靶标的siRNA进行设计,因此,本程序提供的siRNA的设计方法,应用范围很广,功能强大。在进一步的应用中,如果用人和小鼠共同的序列部分设计PCR引物,可以在范围宽泛的哺乳动物中对目标基因进行扩增。另外,执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置的实施方案,将在下述执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置等一栏里描述。6、siRNA序列设计的商务模型系统在本发明的siRNA序列设计商务模型系统中,当应用siRNA序列设计程序时,系统单独或组合参考基因组数据库、EST数据库、进化系统树数据库,根据本程序的逻辑,对客户提供对应于基因序列信息的可用状态的有效的siRNA。术语“可用状态”(availability)是指信息能够利用的状态。(1)基因组信息虽然可用,但确定ORF比较困难,以EST信息等为基础抽选出对于假设的外显子位点有效的siRNA候选序列,并显示考虑剪切变体的siRNA序列和其评价结果。(2)基因序列、基因名称确定的情况下,输入基因序列或基因名称后,即可搜索出有效的siRNA的候选序列,显示其siRNA序列和其评价结果。(3)基因组信息不可用的情况下,采用保持同种基因功能的近缘生物种(同属或具有同样的起源)的基因序列或者进化系统树中距离短且其基因组序列可用的2种或2种以上的生物种的基因序列,搜索出siRNA的候选序列,显示其siRNA序列和其评价结果。(4)为了解析与侵染性病害相关的基因的功能、探索用于新药开发的靶标,组合利用微生物基因组数据库、进化系统树数据库及微生物的细胞凋亡诱导部位信息、功能表达部位信息,全面地求得siRNA候补序列的技术是比较有效的。7、执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置等以下,结合附图详细说明执行上述siRNA序列设计程序的装置、本发明的碱基序列处理装置、在计算机上执行碱基序列处理方法的程序、记录介质以及碱基序列处理系统的实施方案。但是,易于理解这些实施方案不构成对本发明的限定。本发明概述以下概略说明本发明,然后,详细说明本发明的组成及处理等。图12是本发明的基本原理图。概括地说,本发明具有以下基本特征。即本发明取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,制作出相应于在碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息(步骤S-1)。这里,在步骤S-1中,也可以由碱基序列信息中目标基因的编码区或转录区的相应位置制作出预定碱基数的部分碱基序列信息;也可以由来源于不同生物的多个碱基序列信息(例如人的碱基序列信息和小鼠的碱基序列信息等)间共同的序列制作出预定碱基数的部分碱基序列信息;也可以由同种生物中类似的多个碱基序列间共同的序列制作出预定碱基数的部分碱基序列信息;也可以由来源于不同生物的多个碱基序列信息的目标基因的编码区或转录区的相应位置制作出预定碱基数的部分碱基序列信息;也可以由同种生物中类似的多个碱基序列信息的目标基因的编码区或转录区的相应位置制作出预定碱基数的部分碱基序列信息。由此能够高效地筛选出对目标基因特异性地产生RNA干扰的规定序列,减轻计算负荷。进一步,在步骤S-1中,可以制作含有突出部的部分碱基序列。具体地说,例如可以通过添加表示含有突出部的突出部含有信息制成部分碱基序列信息。即,也可把部分碱基序列信息和突出部含有信息相互连接在一起,这样,就可以从设计的最初就筛选出包含突出部的规定序列。另外,上述预定碱基数的上限在不含突出部的情况下,优选为28或28以下,更优选为22或22以下,还更优选为20或20以下,含有突出部时,优选为32或32以下,更优选为26或26以下,还更优选为24或24以下。预定的碱基数的下限在不含突出部的情况下,优选为至少13,更优选至少16,还更优选至少18,含有突出部时,优选至少17,更优选至少20,还更优选至少22。因此,预定碱基数的最优选在不含突出部的情况下为19,含突出部时为23。这样,可以高效筛选出产生RNA干扰的规定序列的同时(甚至在哺乳动物中)不产生细胞毒性。接下来,判定在步骤S-1制成的部分碱基序列信息的3’末端的碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)(步骤S-2)。具体地说,例如可以在3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的时候输出1、不是的时候输出0的判定结果。接下来,判定在步骤S-1制成的部分碱基序列信息的5’末端的碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)(步骤S-3)。具体地说,例如可以在5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的时候输出1、不是的时候输出0的判定结果。接下来,判定在步骤S-1制成的部分碱基序列信息的3’末端的包含7碱基的碱基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基(步骤S-4)。具体地说,例如可以在3’末端的7碱基是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基的时候输出1、不是的时候输出0的判定结果。步骤S-4的判定规则规定在步骤S-1制成的部分碱基序列信息的3’末端的附近的碱基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,作为具体搜索的一个指标,规定是指包含3’末端7碱基的碱基序列信息是否富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。这里,在步骤S-4中,“富含碱基序列信息”是指在上述“1RNA干扰的目标基因搜索方法”中记载的“富含序列”。具体地说,例如在步骤S-1制成的部分碱基序列信息为19个碱基时,包含该部分碱基序列信息7碱基的碱基序列信息中优选为至少3个碱基,更优选至少4个碱基,特别优选至少5个碱基为由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。从步骤S-2至步骤S-4,判定含有突出部的部分碱基序列信息的时候,将从部分碱基序列信息中除去突出部后的序列部位作为判定对象。接下来,根据步骤S-2、S-3、S-4的判定结果,由步骤S-1制成的部分碱基序列信息中筛选特异性地产生RNA干扰的规定序列信息(步骤S-5)。具体地说,例如,步骤S-2判定3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),在步骤S-3判定5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),在步骤S-4判定包含3’末端7碱基的碱基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,将判定符合上述的部分碱基序列信息作为规定序列信息进行筛选。这里,具体地说,例如计算出步骤S-2、S-3、S-4输出的数值的积,根据该积的值,从步骤S-1制成的部分碱基序列信息中筛选规定序列信息。这样,在哺乳动物等中可以高效而容易地制作出产生RNA干扰的概率极高也即有效产生RNA干扰的siRNA序列。这里,可以在步骤S-5筛选出的规定序列信息的至少一个末端添加突出部。另外,例如,也可以在搜索靶标一侧时在规定序列信息的2个末端都添加突出部。这样,可以简化产生RNA干扰的多核苷酸的设计。另外,上述突出部的碱基数如在上述“2产生RNA干扰的多核苷酸的碱基序列设计方法”所述的碱基数,具体地说,例如为2非常适合。而且,可以从其它碱基序列信息(例如公共数据库中已经公开的碱基序列信息,诸如NCBI的RefSeq(ReferenceSequenceProject))中,通过采用已知的诸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法,搜索到与步骤S-5筛选出的规定序列信息相同或近似的碱基序列信息,并根据搜索到的相同或类似的碱基序列信息,评价规定序列靶向无关基因的可能性。具体地说,例如可以从其它碱基序列信息(例如公共数据库中已经公开的碱基序列信息,诸如NCBI的RefSeq(ReferenceSequenceProject))中,通过采用已知的诸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法,搜索到与步骤S-5筛选出的规定序列信息相同或近似的碱基序列信息,根据搜索到的相同或类似碱基序列信息中的和目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值(例如BLAST、FASTA、ssearch中的E值),计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,根据算出的总和(例如根据算出的总和的大小),评价规定序列信息是否可能靶向与目标基因无关的基因。这样,可以从规定序列信息中筛选出仅对目标基因特异性地产生RNA干扰的序列。以上,根据本发明筛选出的对与目标基因无关的基因不产生RNA干扰的规定序列信息进行RNA合成,与常规技术相比,可以大幅度减低所需的劳动、时间和费用。首先说明本系统的构成。第13图是适用于本发明的本系统的一个构成例的框图。在该构成例中仅将与本发明相关的部分概念性地表示出。概括地说,本系统由处理RNA干扰的目标基因的碱基序列信息的碱基序列处理装置100以及提供关于序列信息和构造信息等的外部数据库以及诸如同源性搜索的外部程序的外部系统200,通过网络300,以可通讯的方式连接构成。在第13图,网络300具有使碱基序列处理装置100和外部系统200相互连接的功能,例如可以为因特网。在第13图,外部系统200通过网络300与碱基序列处理装置100相连接,具有为利用者提供关于序列信息和构造信息等的外部数据库,以及执行外部程序诸如同源性搜索和基序检索的网址的功能。这里,外部程序200也可以由WEB服务器或ASP服务器等构成,其硬件构成可以包括市场上有售的诸如工作站、个人电脑等的信息处理装置以及其附属装置。而且,外部系统200的各个功能通过外部系统200的硬件构成中的CPU、硬盘、存贮装置、输入装置、输出装置、通信控制装置等以及控制这些装置的程序来实现。在第13图中,碱基序列处理装置100概括地说,由整体控制碱基序列处理装置100的诸如CPU等的控制部102;通信控制界面部104,其与和连接通信线路相连的通信装置,诸如路由器(router)相连(图中未示出)的;输入输出控制界面部108,其与输入装置112、输出装置114连接、以及容纳各种数据库和桌面(table)的记忆部(存储部)106构成。上述各部通过通信电路形成可通信的连接,进一步,碱基序列处理装置100通过路由器等通信装置以及有线或无线通信回路以能够通讯的方式与网络300连接。记忆部106容纳的各种数据库、桌面(目的基因碱基序列文件106a~目的基因注释数据库106h)是采用固定硬盘装置等的存储装置,容纳各处理中使用的各种程序、桌面、文件、数据库、网页用文件等。这个记忆部106的各构成要素中,目标基因碱基序列文件106a是容纳RNA干扰的目标基因的碱基序列信息的目标基因碱基序列容纳方法,第14图就是容纳于目标基因碱基序列文件106a的信息的一个示例。如第14图所示,目标基因碱基序列文件106a所容纳的信息由专一识别RNA干扰的目标基因的碱基序列信息的碱基序列识别信息(例如第14图的NM-000507)和碱基序列信息(如第14图的ATGGCTGA...AGTGA)相互关联构成。部分碱基序列文件106b是容纳部分碱基序列信息的装置,所述部分碱基序列即具有RNA干扰目标基因的碱基序列信息中预定数目的碱基的序列片段。第15图即是部分碱基序列文件106b容纳信息的一个示例。如第15图所示,部分碱基序列文件106b容纳的信息由专一识别部分碱基序列信息的部分碱基序列识别信息(例如第15图的NM-00050736)、部分碱基序列信息(如第15图的caccct...tcattg)和表示含有突出端的突出端部位含有信息(例如第15图的“含有”)相互关联构成。判定结果文件106c是容纳后述3’末端碱基判定部102b、5’末端碱基判定部102c、预定碱基含有判定部102d的判定结果的容纳方法。第16图即显示容纳在判定结果文件106c中的信息的一个示例。如第16图所示,判定结果文件106c容纳的信息由部分碱基序列识别信息(例如第16图的NM-00050736)、3’末端碱基判定部102b判定的3’末端的碱基判定结果(例如第16图中的“1”)、5’末端碱基判定部102c判定的的5’末端的碱基判定结果(例如第16图中的“1”)、预定碱基含有判定部102d判定的预定碱基含有判定结果(例如第16图“4”)、以及将3’末端碱基判定部102b、5’末端碱基判定部102c、预定碱基含有判定部102d的综合在一起的判定结果(例如第16图的“4”)相互关联构成。另外,在第16图中,3’末端的碱基判定结果和5’末端的碱基判定结果在由3’末端碱基判定部102b、5’末端碱基判定部102c判定为“含有”时设定为“1”,“不含有”设定为“0”。而且,在第16图中,预定碱基含有判定结果被设定为由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上碱基的数目,其中所述碱基包含在含有位于部分碱基序列信息3’末端的7碱基的碱基序列信息中。将综合判定结果设定为3’末端的碱基判定结果、5’末端的碱基判定结果、预定碱基含有判定结果的积,具体说,例如该积为3以下时设定为0。规定序列文件106是规定序列容纳装置,其容纳能够对目标基因特异产生RNA干扰的部分碱基序列的规定序列信息。第17图即规定序列文件106d所容纳的信息的一个示例。如第17图所示,规定序列文件106d容纳的信息由部分碱基序列识别信息(例如第17图的NM-00050736)、能够对目标基因特异性产生RNA干扰的部分碱基序列的规定序列信息(例如第17图“caccc...tcattg”)相互关联构成。为了通过后述的相同或类似碱基序列搜索部102g搜索与规定序列相同或类似的碱基序列信息,参照序列数据库106e是容纳用于参照的碱基序列信息的参照碱基序列信息的数据库。参照序列数据库106e也可经由因特网进入外部碱基序列数据库,拷贝这些数据库,存纳为原始序列信息,更可以进一步加入独特的注释信息而制成内部数据库(inhousedatabase)。第18图即为参照序列数据库106e所容纳信息的一个示例。如第18图所示,参照序列数据库106e容纳的信息由参照序列识别信息(例如第18图的“ref|NM_015820.1|”)和参照碱基序列信息(例如第18图的“caccct...gcatgg”)相互连接构成。相同类似度文件106f是容纳后述用相同或类似碱基序列搜索部102g搜索相同或类似碱基序列信息所得相同或类似程度值的相同类似度容纳方法。第19图即为相同类似度文件106f容纳信息的一个示例。如第19图所示,相同类似度文件106f中容纳的信息由部分碱基序列识别信息(例如第19图的NM-00050736)、参照序列识别信息(例如第19图的ref|NM_015820.1|以及ref|NM_003837.1|)和相同类似度(例如第19图的0.52)相互连接构成。评价结果文件106g是容纳在后述无关基因靶标评价表部评价是否将与目标基因无关的基因作为靶标的结果评价结果容纳方法。第20图即为容纳在评价结果文件106g的容纳信息的一个示例。如第20图所示,容纳在评价结果文件106g的容纳信息由部分碱基序列识别信息(例如第20图的NM-00050736以及NM-000507441)、后述总和计算部102m计算出的总和(例如第20图的5.9以及170.8)、评价结果(例如第20图的“非靶标”和“靶标”)相互连接构成。在第20图中,“非靶标”意指规定序列信息不将与目标基因无关的基因作为靶标,“靶标”意指规定序列信息将与目标基因无关的基因作为靶标。目标基因注释数据库106h是容纳有关目标基因的注释信息的目标基因注释容纳方法,目标基因注释数据库106h是可经由因特网进入的、容纳相关基因的注释信息的外部注释数据库,或者是通过将这些数据库拷贝下来,容纳原始序列信息,进一步向该数据库添加独特的注释信息而作成的内部数据库(inhousedatabase)。目标基因注释数据库106h容纳的信息由识别目标基因的目标基因识别信息(例如目标基因的基因名称、登录号(accession)等(如第3图最上部记载的NM-000507、FBP1))和有关目标基因的简略信息(例如第3图最上部记载的“人果糖二磷酸酶1,6-二磷酸酶1)相互连接而成。在第13图,控制通信的界面部104进行碱基序列处理装置100和网络300(或者路由器等通信装置)间的通信控制,即控制通信的界面部104通过通信线路与其它末端交流数据。在第13图中,输入输出控制界面部108进行输入装置112或输出装置114的控制,这里,输出装置114处理能够采用监视器(monitor,包含家用电视)外,还可以使用话筒(以下有时将输出装置114记为监视器),输入装置112可采用包括键盘、鼠标、以及麦克风等。另外,监视器和鼠标协同可以实施指示装置功能。在第13图中,控制部102具有容纳OS(OperatingSystem)等的控制程序、规定各种处理顺序的程序、以及所需数据的内部存储器,由这些程序进行执行各种处理的信息处理。控制部102在功能上包括部分碱基序列制作部102a、3’末端碱基判定部102b、5’末端碱基判定部102c、预定碱基含有判定部102d、规定序列筛选部102e、突出端添加部102f、相同或类似碱基搜索部102g以及无关基因靶标评价部102h。其中,部分碱基序列制成部102a是部分碱基序列制作手段,用于获得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并产生具有碱基序列信息中预定数目碱基的序列片段的部分碱基序列信息。如图21所示,部分碱基序列制成部102a包括区域指定碱基序列制成部102i,共碱基序列制成部102j,以及突出部分含有碱基序列制成部102k。第21图是适用于本发明系统的部分碱基序列制成部102a的构成例的框图。在该构成例中仅概念性地示出本发明的相关部分。在第21图中,区域指定碱基序列制成部102i是区域指定碱基序列制作方法,其用于从对应于碱基序列信息中的目标基因编码区或转录区的位置产生具有预定数目碱基的部分碱基序列信息。共同碱基序列制成部102j是一种制作来源于不同生物的多个碱基序列信息间共同的、预定数目碱基的部分碱基序列信息的共同碱基序列制作方法。突出端含有碱基序列制作部102k是一种制作含有突出端的部分碱基序列信息的突出端含有碱基序列制作方法。再回到第13图,3’末端碱基判定部102b是判定部分碱基序列信息的3’末端是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的3’末端的碱基判定方法。5’末端碱基判定部102c是判定部分碱基序列信息的5’末端是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的5’末端碱基判定方法。预定碱基含有判定部102d是判定包含部分碱基序列信息的3’末端的7碱基的碱基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基的预定碱基含有判定方法。规定序列筛选部102e是根据3’末端碱基判定部102b、5’末端碱基判定部102c、预定碱基含有判定部102d的判定结果,从部分碱基序列信息中筛选特异地对目标基因产生RNA干扰的规定序列信息的规定序列信息筛选方法。突出端添加102f是一种在规定序列信息的至少一个末端添加突出端的突出端添加方法。相同类似碱基序列搜索部102g是一种从其它碱基序列信息搜索与规定序列信息相同或类似的碱基序列信息的相同类似碱基序列搜索方法。无关基因靶标评价部102h是一种根据相同或类似的碱基序列信息评价规定序列信息是否将无关基因作为靶标的无关基因靶标评价方法。这里,如第22图所示,无关基因靶标评价部102h进一步包括总和算出部102m以及总和基准评价部102n。第22图是适用于本发明的本系统的无关基因靶标评价部102h的构成例的框图。在该构成例中仅概念性地示出本发明的相关部分。在第22图中,总和算出部102m是一种总和算出方法,其根据相同或类似碱基序列信息中与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和。总和基准评价部102n是一种根据总和算出部102m计算出的总和评价规定序列信息是否可能将无关基因作为靶标的总和基准靶标评价方法。通过上述各部进行处理的详细情形在后述部分会详细说明。接下来,参照第23图以及第24图详细说明对具有本实施形式中所述构成的系统的处理的一个示例。首先,参照第23图详细说明主处理。第23图为表示对本实施形式中的系统的主处理的流程图。首先,碱基序列处理装置100通过部分碱基序列制成部102a进行部分碱基序列制成处理,取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,存放在目标基因碱基序列文件106a所确定的记忆区域,制成对应具有碱基序列信息中的预定数目碱基的序列片段的部分碱基序列信息,将作成的部分碱基序列信息存放在部分碱基序列文件106b所确定的记忆区域。(步骤S-1)。这里,在步骤SA-1中,部分碱基序列制成部102a通过区域指定序列制成部102i的处理,由来自碱基序列信息的目标基因编码区或转录区的相应序列部位制成具有预定数目的部分碱基序列信息,将制得的部分碱基序列信息存放于部分碱基序列文件106b所确定的记忆区。在步骤SA-1中,部分碱基序列制成部102a通过共同碱基序列制成部102i的处理,由来源于不同生物的多个碱基序列信息(例如人的碱基序列信息和小鼠的碱基序列信息)中的共同序列制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息,将制得的部位碱基序列信息存放于部分碱基序列文件106b所确定的记忆区。另外,也可以制得具有同种生物内多个类似的碱基序列信息所共有的、预定数目碱基的共同部分碱基序列信息。在步骤SA-1中,部分碱基序列制成部102a通过区域指定碱基序列制成部102i以及共同碱基序列制成部102j的处理,由来源于不同生物的多个碱基序列信息的目标基因的编码区或转录区的相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息,将制得的部分碱基序列信息存放于部分碱基序列文件106b所确定的记忆区。另外,也可以由同种生物内多个类似的碱基序列信息的目标基因的编码区或转录区的位置制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。在步骤SA-1中,部分碱基序列制成部102a通过含有突出端碱基序列制成部102k的处理制得含有突出端的部分碱基序列信息。具体地说,例如部分碱基序列制成部102a通过含有突出端碱基序列制成部102k的处理,制成表示含有突出端的含有突出端信息的添加部分碱基序列信息,将制得的部分碱基序列信息和含有突出端信息相互关联地存放于部分碱基序列文件106b所确定的记忆区。上述预定碱基数的上限在不含突出端的情况下,最好为28或28以下,更优选22或22以下,更优选20或20以下,含有突出端时,优选32或32以下,更优选26或26以下,更优选24或24以下。预定的碱基数的下限在不含突出端的情况下,最好为13或13以上,更优选16或16以上,更优选18或18以上,含有突出端时,优选17或17以上,更优选20或20以上,更优选22或22以上。因此,最优选预定碱基数在不含突出端的情况下为19,含突出端时为23。接下来,碱基序列处理装置100通过3’末端碱基判定部102b判定在步骤SA-1制成的部分碱基序列信息的3’末端的碱基是否是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),将判定的结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区(步骤SA-2)。具体地说,例如可以碱基序列处理装置100通过3’末端碱基判定部102b的处理,在判定步骤SA-1制得的部分碱基序列信息的3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)的时候输出1、而不是所述情况的时候输出0的判定结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区。接下来,碱基序列处理装置100通过5’末端碱基判定部102c判定在步骤SA-1制成的部分碱基序列信息的5’末端碱基是否是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),将判定的结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区(步骤SA-3)。具体地说,例如可以碱基序列处理装置100通过5’末端碱基判定部102c的处理,在判定步骤SA-1制得的部分碱基序列信息的5’末端碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的时候输出1、而不是所述情况的时候输出0的判定结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区。接下来,碱基序列处理装置100通过预定碱基含有判定部102d判定在步骤SA-1制成的部分碱基序列信息的3’末端7碱基组成的碱基序列信息是否是富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基,将判定的结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区(步骤SA-4)。具体地说,例如可以碱基序列处理装置100通过预定碱基含有判定部102d的处理,将判定步骤SA-1制得的部分碱基序列信息的3’末端的7碱基组成的碱基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基的时候输出1、而不是所述情况的时候输出0的判定结果存放于判定结果文件106c所确定的记忆区。步骤SA-4的判定规则规定在步骤SA-1制成的部分碱基序列信息的3’末端的附近的碱基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基,更具体地作为检索(搜索)的一个指标,规定是指3’末端的7碱基组成的碱基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基。这里,在步骤SA-4中,“富含的碱基序列信息”是指在上述栏<1>RNA干扰的目标基因搜索方法中记载的“富含序列”。具体地说,例如在步骤SA-1制成的部分碱基序列信息包含19个碱基时,包含7碱基的所述部分碱基序列信息的碱基序列信息中由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基最好为至少3或3碱基以上,更优选4或4碱基以上,具体优选5或5碱基以上。从步骤SA-2至步骤SA-4,判定含有突出端的部分碱基序列信息的时候,要以除去部分碱基序列信息中的突出端后的序列部分作为判定对象。接下来,碱基序列处理装置100通过规定序列筛选部102e的处理,根据步骤SA-2、SA-3、SA-4的判定结果,由步骤SA-1制成的部分碱基序列信息中筛选特异产生RNA干扰的规定序列信息,存放于规定序列文件106d所确定的记忆区(步骤SA-5)。具体地说,例如,碱基序列处理装置100通过规定序列筛选部102e的处理,将判定符合下述的部分碱基序列信息作为规定序列信息进行筛选,其中在步骤SA-2中判定3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U),在步骤SA-3中判定5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C),在步骤SA-4中判定3’末端的含7碱基的碱基序列信息富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1种或1种以上的碱基,存放于规定序列文件106d所确定的记忆区。这里,具体地说,例如碱基序列处理装置100通过规定序列筛选部102e的处理,计算出步骤SA-2、SA-3、SA-4输出的数值的积,根据该积值,从步骤SA-1制成的部分碱基序列信息中筛选规定序列信息。这里,碱基序列处理装置100通过突出端添加部102f的处理,可以在步骤SA-5筛选出的规定序列信息的至少一个末端添加突出端,存放于规定序列文件106d所确定的记忆区。具体地说,例如可以通过碱基序列处理装置100通过突出端添加部102f的处理,将规定序列文件106d的规定序列信息项中记载的规定序列信息换写为至少一个末端添加了突出端规定的序列信息,另外,例如,也可以在搜索靶标时在规定序列信息的2个末端添加突出端。另外,上述突出端位置的碱基数如在上述栏<2>中产生RNA干扰的多核苷酸的碱基序列设计方法”所述的碱基数,具体地说,例如为2比较适合。而且,碱基序列处理装置100通过相同类似碱基序列搜索部102g的处理,可搜索与在步骤SA-5中从其它碱基序列信息(诸如NCBI的RefSAeq(ReferenceSequenceProject)等的公共数据库中公开的碱基序列信息)筛选出的规定序列信息相同或近似的碱基序列信息,可以通过采用已知的诸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法进行搜索,通过在无关基因靶标评价部102h中进行的无关基因靶标评价处理,根据搜索到的相同或类似的碱基序列信息,评价规定序列信息将无关基因作为靶标的可能性。具体地说,例如可以碱基序列处理装置100通过相同类似碱基序列搜索部102g的处理,从其它碱基序列信息(例如NCBI的RefSeq等公共数据库公开的碱基序列信息),通过采用已知的诸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法搜索,与步骤SA-5中筛选出的规定序列信息相同或近似的碱基序列信息,无关基因靶标评价部102h通过总和算出部102m的处理,根据搜索到的相同或类似碱基序列信息中与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值(例如BLAST、FASTA、ssearch时的E值),计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和。无关基因靶标评价部102h通过总和基准评价部102n的处理,根据算出的总和,评价规定序列信息是否可能将与目标基因无关的基因作为靶标。这里,参考第24图,详细说明无关基因靶标评价部102h进行的无关基因靶标评价处理。第24图是表示本实施形式的系统的无关基因靶标评价处理的一个示例的流程图。首先,碱基序列处理装置100通过相同类似碱基序列搜索部102g的处理,从其它碱基序列信息(例如NCBI的RefSeq等公共数据库公开的碱基序列信息),通过采用已知的诸如BLAST、FASTA、ssearch等同源性搜索方法搜索与步骤SA-5筛选出的规定序列信息相同或近似的碱基序列信息,将规定序列信息的识别信息(第19图的“部分碱基序列识别信息)、搜索得到的相同或类似碱基序列信息的识别信息(第19图的“参照序列识别信息”)、赋予搜索得到的相同或类似碱基序列信息的、表示同一类似度的值(例如BLAST、FASTA、ssearch时的E值)(第19图的同一类似度)相互关联地存放于相同类似度文件106f所确定的记忆区。接下来,无关基因靶标评价部102h通过总和算出部102m的处理,根据搜索到的相同或类似碱基序列信息中与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数以及赋予与目标基因无关的基因的碱基序列信息表示相同或类似程度的数值(例如BLAST、FASTA、ssearch时的E值),计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,将规定序列信息的识别信息(第20图的部分碱基序列识别信息)和计算出的总和(第20图的“总和”)相互关联,存放于评价结果文件106g所确定的记忆区(步骤SB-1)。接下来,无关基因靶标评价部102h通过总和基准评价部102n的处理,根据步骤SB-1计算出的总和(例如根据步骤SB-1计算出的总和的大小),评价规定序列信息是否可能将无关基因作为靶标,把评价结果(在第20图的“非靶标”和“靶标”)存放于评价结果文件106g所确定的记忆区(步骤SB-2)。到此,主处理结束。至此,虽已经说明了本发明的实施形式,但本发明在上述实施形式以外,在权利要求范围记载的技术思想的范围内还可以具有各种不同的实施形式。例如,以碱基序列处理装置100可以以独立的形式进行处理的一个示例进行说明。碱基序列处理装置100可以由按照以另行构成的客户机端的要求进行处理、将处理结果返回该客户机端的形式构成。具体地说,例如,从客户机端向碱基序列处理装置100发送RNA干扰的目标基因的名称(例如基因名、登录号)或目标基因的相关碱基序列信息,碱基序列处理装置100对该基因名称对应的碱基序列信息或对客户机端发送过来的碱基序列信息通过控制部102进行上述各处理,筛选获得的对目标基因特异产生RNA干扰的规定序列信息,然后对客户机端发送所述规定序列信息。此时,也可以从公共数据库取得序列信息筛选针对查询基因的siRNA。而且,也可以预先计算出全部基因的siRNA,存储记忆起来,在客户机端发送来要求(基因的名称或登录号)时即时地筛选siRNA,将筛选的siRNA向客户端发送。碱基序列处理装置100也可以确认对于与目标基因无关的基因的规定序列信息的特异性。由此,筛选出仅对目的基因特异产生RNA干扰的规定序列信息。而且,对于由客户机端和碱基序列处理装置100构成的本系统来说,网页上的利用者可以反馈siRNA的RNA干扰效果(例如“有效”、“无效”)的结果,在碱基序列处理装置100存贮从利用者反馈回来的试验例,从而也可以导入改善对上述RNA干扰有效的siRNA的序列规律性的界面功能。碱基序列处理装置100可从规定序列信息中计算siRNA的正链碱基序列信息以及与该正链互补的反义链的碱基序列信息。具体地说,例如碱基序列处理装置100进行完上述处理在结果规定序列的两端添加各2个碱基的突出端形成23个碱基的序列信息“caccctgacccgcttcgtcatgg″时,计算正义链的序列信息″5-CCCUGACCCGCUUCGUCAUGG-3″以及反义链的碱基序列信息″5-AUGACGAAGCGGGUCAGGGUG-3″,由此,在订购多核苷酸时,没必要手工整理正义链和反义链,非常便利。在实施形式中说明的各处理中,自动进行的部分也可以手动实施说明的处理中的全部或部分,或者,手动进行的部分可以用共知的方法转换为全部或部分地自动进行。此外,关于包含上述说明书、附图中所示的处理顺序、控制顺序、具体名称、各种登录数据、参数诸如搜索条件等的信息、图例、数据库构成,除特殊情况下可以任意变更。关于碱基序列处理装置100,图中的各构成要素纯是功能概念性的,不必在物理上如图所示那样构成。例如,关于碱基序列处理装置100的各部或各装置所具的处理功能,特别是控制部102进行处理的各处理功能,其全部或任意一部分能够通过CPU(CentralProcessingUnit)以及由该CPU解释执行的程序实现,或者,能够由根据插线逻辑(wiredlogic)的硬件来实现。另外,程序记载在后述的记载载体上,需要时碱基序列处理装置可机械地读取。也即,在ROM或HD等的记忆部106等上记载着与OS(OperatingSystem)协动向CPU发布命令进行各种处理的计算机程序,这些计算机程序通过加载于RAM等上执行,和CPU协动构成控制部102。这些计算机处理程序也可通过网络300记载在与碱基序列处理装置100连接的应用程序服务器上。需要时再下载也可以。而且,本发明有关的程序能够存储在计算机能够读取的记录介质上。这里所谓“记录介质”包含柔性磁碟(flexibledisk)、光盘、ROM、EPROM、EEPROM、CD-ROM、MO、DVD、闪存(flashdisk)等任意“可移动的物理载体”、各种内藏于计算机系统内的ROM、RAM、HD等任意的“固定物理载体”、或者,在程序经由以LAN、WAN、因特网为代表的网络传送时,象通信线路或载波那样的短期保持程序的“通讯载体”。所谓“程序”,指用任意语言、描述方法记述的数据处理方法,而不拘源代码和二进位代码的形式。“程序”未必仅限于单一地构成,也包含作为多个模块(module)或程序库(library)的分散构成系统或如OS(OperatingSystem)的其它程序协同实现其功能。另外,关于在实施形式所述的各装置读取记录介质的具体构成、读取顺序、或者读取后的安装顺序,采用众所周知的构成、顺序进行。在记忆部106存放的各种数据库等(目标基因碱基序列文件106a~目标基因注释数据库106h)采用RAM、ROM等存储装置、硬盘等固定盘装置、柔性磁碟((flexibledisk)、光盘等存储装置,存放有用于各种处理、用于提供给网址的程序、桌面、文件、数据库、网页用文件等等。碱基序列处理装置100可在已知的个人计算机、工作站等的信息处理端等信息处理装置上连接打印机、监视器、扫描仪等外围装置,该信息处理装置由安装有实现本发明的方法的软件(包含程序、数据等)实现其功能。进一步,碱基序列处理装置100的分散/集成的具体形式也不限于本发明说明书及附图所示,其全部或其一部分可以以相应于各种负荷等的任意单位、功能地或物理地分散/集成构成(例如网格计算等)(gridcomputing)。例如,把各数据库作为独立的数据库装置独立构成,处理的一部分采用CGI(CommonGatewayInterface)实现。网络300具有使碱基序列处理装置100和外部系统200相互连接的功能,例如,包含因特网、内联网(intranet)、LAN、(包含有线、无线)、VAN、个人电子计算机通信网、公共电话网(包含模拟、数字两种)、专用线路网(包含模拟、数字两种)、CATV网、IMT2000方式、GSM方式、PDC/PDC-P方式等的手机线路交换网/手机程序包交换网、无线呼出网、蓝牙的局部无线网、PHS网、CS、BS或ISDB等卫星通讯网中的任一均可。即本系统可通过不拘有线、无线的任意网络接受发送各种数据。实施例以下通过实施例具体说明本发明,但本发明并不限于下述实施例。实施例1(1)测定RNAi效应的基因、表达载体为了测定由siRNA引起的RNA干扰效应,采用萤火虫(Photinuspyralis,P.pyralis)的萤光素酶(luc)基因(登录号U47296)作为目标基因,包含此基因的表达载体采用pGL3-对照载体(Promega制造),P.pyralis的luc基因片段在载体中位于SV40启动子和PolyA间,内对照基因采用海蕈(Renillarenifornis,R.reniformis)的luc基因,包含此基因的载体采用载体PRL-TK(Promega制造)。(2)21碱基双链RNA(siRNA)的合成21碱基正义链和21碱基反义链RNA(第9图所示位置的序列,a~p)通过日立计测器服务株式会社委托ジエンセツト株式会社合成。用于阻止P.pyralis的luc基因表达的双链RNA是通过将正义链和反义链混合制作的,结合时,把正义链和反义链在含10MmTris-HCI(PH7.5)、20MmNaCI反应液中、90℃加热3分钟,在37℃孵育1小时,然后室温放置。双链多核苷酸的形成通过在TBE缓冲液中的2%琼脂糖凝胶上进行电泳检测,在上述条件下,几乎所有的单链多核苷酸都结合成双链多核苷酸。(3)哺乳类细胞培养方法哺乳细胞培养采用了人的HeLa细胞和HEK293细胞、中华仓鼠CHO-KI细胞(RIKENCellbank)。培养基中采用在Dulbecco`s改良的Eagle`s培养基(GibcoBRL制造),其中添加10%灭活的胎牛血清(MitsubishiKasei公司制造)以及抗生素青霉素(penicillin)(Meiji公司制造)10单位/毫升、链霉素(Streptomycin)(Meiji公司制造)50微克/毫升。在37℃、5%CO2存在下培养。(4)目标基因、内对照基因、siRNA对哺乳类培养细胞的转染哺乳细胞以0.2~0.3×106细胞/毫升的浓度接种于24孔板,1天以后,用钙-磷酸盐沉淀法(细胞工程学手册,黑木登志夫等编著,羊土社,1992)将1.0μg的pGL3-对照DNA、0.5或1.0μg的pRL-TKDNA、以及分别为0.01、0.1、1、10、100nM的各siRNA导入。(5)果蝇(Drosophila)细胞培养法果蝇细胞培养采用S2细胞(Schneider,I.,etal.,J.EmbryolExp.Morph.,27,353-365(1972),培养基采用Schneider`s果蝇培养基(Gibcobrl社制造),其中加入10%灭活的胎牛血清(MitsubishiKasei社制造)和抗生素青霉素(Meiji公司制造)10单位/毫升、链霉素(Meiji公司制造)50微克/毫升。在25℃、5%CO2存在下培养。(6)目标基因、内对照基因、siRNA向果蝇细胞的转染将此S2细胞以1.0×106细胞/毫升的浓度接种于24孔平板,1天以后,用钙-磷酸盐沉淀法(细胞工程学手册,黑木登志夫等编著,羊土社,1992)将1.0μg的pGL3-对照DNA、0.1μg的pRL-TKDNA、以及分别为0.01、0.1、1、10、100nM的siRNA导入。(7)RNAi效果的测定转染后20个小时,回收转染了siRNA的细胞,采用Dual-LuciferaseReporterAssaySystem(Promega社制造)测定2种萤光素酶(P.Pyralis的luc和R.Reniformis的luc)的表达水平(萤光素酶活性),发光量的测定采用LumatLB9507照度计(luminometer)(EG&GBerthold)进行。(8)结果萤光素酶活性测定的结果如第10图所示,而且,萤光素酶活性和各碱基序列之间的对应性研究结果如第11图所示。在第10图中,B图表示果蝇的结果,C图表示人细胞的结果。如第10图所示,在果蝇中通过产生碱基数为21的RNA,几乎所有序列都能够抑制萤光素酶活性。另外,在人的细胞中,可以看出,仅仅是将碱基数定为21很难得到能够抑制萤光素酶活性的序列。因此,分析了a~p的RNA的碱基序列的规律性,序列分析如第1图所示,对双链RNA的5个位置进行了分析。观察第11图中的表中最上部的a的siRNA,萤光素酶相对活性(RLA)为0.03,对反义链从3’末端顺次看,突出端部(OH)的碱基序列为UC,接着的7碱基(图11中的3’-T)中的G/C含有量(鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的含有量)为57%,再接着的5碱基(第11图中M)的G/C含有量为20%,再接着的7碱基(第11图中的5’-T)G/C含有量为14%,5’末端为U,G/C含有量合计为32%。该表中,RLA的值越低,RLA活性越低,即表示萤光素酶的表达被抑制。从这个结果可以看出,产生RNA干扰的多核苷酸的碱基序列的3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、或尿嘧啶(U),5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的概率极高,而且,3’末端的7碱基序列中富含腺嘌呤(A)、或尿嘧啶(U)。实施例21、目标表达载体pTREC的构建如下述构建了目标表达载体,目标表达分子即使RNAi的目标序列的RNA表达的分子。在PCI-neo(GenebankAccessionNo.U47120,Promega制造)的CMV增强子/启动子下游构建目标mRNA序列(第25图)。合成具有Kozak序列、ATG序列、目标23碱基序列克隆位点(target)以及用于重组的限制酶(NheI、EcoRI、XhoI)识别序列的下述双链寡聚体,该双链寡聚体由与序列表编号为1所示序列的互补序列组成,。将合成的双链寡聚体插入PCI-neo的NheI/XhoI位点,构建成目标表达载体pTREC(第25图)。另外,内含子采用PCI-neo当初构建时具有的来源于β珠蛋白的内含子部位。5′-gctagccaccatggaattcacgcgtctcgagtctaga-3′(SEQIDNO1)如第25图所示的pTREC具有启动子/增强子(pro/enh)、和PCR引物对应的区域PAR(F)1以及PAR(R)1。PAR(F)1中间具有内含子,是为了表达载体本身不要成为PCR的模板。RNA转录后,在真核生物培养细胞的进行剪接的环境条件下,除去pTREC内含子部位以连接两个相邻的PAR(R)1。通过RT-PCR扩增由pTREC形成的RNA,内含子采用PCI-neo当初构建时具有的来源于β珠蛋白的内含子部位。pTREC中还含有作为对照的新霉素抗性基因(neo)。制作对应于新霉素抗性基因内的序列一部分的PCR引物,对所述新霉素抗性基因内的序列一部分进行RT-PCR,将新霉素抗性基因内作为内部标准对照(内对照)进行使用。PAR(F)2和PAR(R)2表示新霉素抗性基因中的PCR引物对应区。另外,第25图并没有示出内含子也可插入PAR(F)2和PAR(R)2的至少一个。2、检测目标mRNA的引物的效果(1)转染培养细胞在24孔板的每一个孔接种0.2~0.3×106细胞的HeLa细胞,1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造),按手册指南转染0.5μgpTREC载体。(2)细胞回收以及mRNA定量转染1天以后,回收细胞,用Trizol(Invitrogen社制造)提取总RNA,用此RNA100ng,以OligodT为引物,用SuperScriptIIRT试剂盒(Invitrogen社制造)逆转录,合成cDNA,将得到的cDNA的1/320量用作PCR模板,用SYBRGreenPCRMasterMix(AppliedBiosystem公司制造)、在50μl反应系统中进行定量PCR,对目标mRNA(称为mRNA(T))以及作为内对照的pTREC中的新霉素抗性基因的mRNA(称为mRNA(C))进行定量。定量PCR采用实时监测装置ABIPRIZM7000(AppliedBiosystem公司制造),mRNA(T)的定量使用引物对T(序列表序列编号2、3),mRNA(C)的定量采用引物对C(序列表序列编号4、5)。引物对Taggcactgggcaggtgtc(SEQIDNO2)tgctcgaagcattaaccctcacta(SEQIDNO3)引物对Catcaggatgatctggacgaag(SEQIDNO4)ctcttcagcaatatcacgggt(SEQIDNO5)第26以及27图表示PCR的结果,第26以及27图纵轴表示PCR产物,横轴表示循环次数。新霉素抗性基因中,在加入逆转录酶进行cDNA合成(RT+)和不加逆转录酶的对照(-RT)时得到的PCR产物量扩增的差是很小的;(第26图),这表示,不只cDNA,细胞内残留的载体也作为PCR模板并被扩增。另一方面,目标序列mRNA在加入逆转录酶(RT+)和不加逆转录酶(-RT)时的差异很大(第27图),这个结果表明由于引物对T中的一个设计为中间夹有内含子的形式,能够高效扩增来源于除去了内含子的mRNA的cDNA,而对尚含有内含子的载体难以作为模板。3、通过siRNA抑制目标mRNA的表达(1)靶向目标表达载体的评价序列的克隆将对应于人波形纤维蛋白基因(VIM)(RefSeqIDNM-003380)编码区的812-834、35-57位置的序列作为评价对象,制作出含有这些序列以及EcoRI、XhoI识别位点的、下述序列表中序列编号6及7所示的合成寡聚核苷酸(评价序列片断)。评价序列VIM35(相应于VIM的35-57)5′-gaattcgcaggatgttcggcggcccgggcctcgag-3′(SEQIDNO6)评价序列VIM812(相应于VIM的812-834)5′-gaattcacgtacgtcagcaatatgaaagtctcgag-3′(SEQIDNO7)利用得到的评价序列片断两端的EcoRI、XhoI位点,将其克隆进pTREC的EcoRI、XhoI位点间,构建形成新的目标序列pTREC-VIM35、pTREC-VIM812。(2)siRNA的制作合成分别相当于各个评价序列VIM35(序列表序列编号8、第28图)、评价序列VIM812(序列表编号9、第29图)、对照序列(siControl、序列编号10、第30图)的siRNA片段,进行退火。在下述各序列的3’末端设突出端。siVIM355′-aggauguucggcggcccgggc-3′(SEQIDNO8)siVIM8125′-guacgucagcaauaugaaagu-3′(SEQIDNO9)作为对照,使用相对于萤光素酶基因的siRNA。SiControl5′-cauucuauccgcuggaagaug-3′(SEQIDNO10)(3)转染进入所培养的细胞在24孔板的每一个孔接种0.2~0.3×106细胞的HeLa细胞,1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造),按手册指南同时转染0.5μg的pTREC-VIM35或者pTREC-VIM812载体和相应于各自VIM来源的序列的100nM的siRNA(siVIM35、siVIM812)。对于对照细胞,同时转染0.5μg的pTREC-VIM35或者pTREC-VIM812载体以及相应于萤光素酶基因的100nM的siRNA(SiControl)。(4)细胞回收以及mRNA定量转染1天以后,回收细胞,用Trizol(Invitrogen社制造)提取总RNA,用此RNA100ng,以OligodT为引物,用SuperScriptIIRT试剂盒(Invitrogen社制造)逆转录,合成cDNA,将得到的cDNA的1/320量用作PCR模板,用SYBRGreenPCRMasterMix(AppliedBiosystem公司制造)、在50μl的反应系统中进行定量PCR,对包含要评价的来自VIM的序列的mRNA(称为mRNA(T))以及作为内对照的来自pTREC的新霉素抗性基因的mRNA(称为mRNA(C))进行定量。定量PCR采用实时监测装置ABIPRIZM7000(AppliedBiosystem公司制造),mRNA(T)的定量使用引物对T(序列表序列编号2、3),mRNA(C)的定量采用引物对C(序列表序列编号4、5)。将得到的各mRNA的值的比(T/C)作为纵轴(目标mRNA相对量%)列表。(第31图)。对照细胞中,由于相对于萤光素酶基因的siRNA不影响目标mRNA,T/C比几乎为1,对于VIM812siRNA来说T/C比显著下降,这是因为VIM812siRNA切断相应序列的mRNA的缘故;也显示VIM812siRNA具有RNA干扰效应。另一方面,VIM35siRNA的T/C比与对照几乎相同,对VIM35的序列几乎不产生RNA干扰效果。实施例31、由siRNA引起的内源性波形蛋白的表达抑制(1)转染进入所培养的细胞在24孔板的每一个孔接种0.2~0.3×106细胞的HeLa细胞,1天后采用Lipofectamine2000(Invitrogen社制造),按手册指南同时将100nM对应于VIM的siRNA(Sivim35或者siVIM812)、或者对照siRNA(siControl)、作为转染效率对照的0.5μgpEGFP。pEGFP中含有EGFP。(2)内源性波形蛋白mRNA测定转染1天以后,回收细胞,用Trizol(Invitrogen社制造)提取总RNA,用此RNA100ng,以OligodT为引物,用SuperScriptIIRT试剂盒(Invitrogen社制造)逆转录,合成cDNA,将得到的cDNA产物用作PCR模板,采用对应于波形蛋白的引物VIM-F3-84、VIM-R3-274(序列编号11、12)进行PCR。VIM-F3-84;gagctacgtgactacgtcca(SEQIDNO11)VIM-R3-274;gttcttgaactcggtgttgat(SEQIDNO12)作为对照,采用对应于β肌动蛋白的引物ACTB-F2-481、ACTB-R2-664(序列编号13、14)进行PCR,合计各样品β肌动蛋白的常见定量值,评价波形蛋白的表达量。ACTB-F2-481;cacactgtgcccatctacga(SEQIDNO13)ACTB-R2-664;gccatctcttgctcgaagtc(SEQIDNO14)结果如图32所示,将加入siControl(即与目标无关的序列)情况作为100%用于比较,第32图表示在加入对应于VIM的siRNA的情况下,VIM的mRNA减少的程度是多少。结果显示,siVIM812能够高效抑制VIM的mRNA,而采用Sivim35时则几乎不显示RNA干扰效应。(3)细胞的抗体染色转染3日以后,将细胞在3.7%甲醛中固定,根据常规方法进行封闭以后,加入兔抗波形蛋白抗体(α-VIM)或者作为内对照的兔抗Yes抗体(α-Yes),室温反应后,将细胞表面用PBS(phophatebufferedSaline,磷酸缓冲液)洗净,加入作为二抗的荧光标记的抗兔IgG抗体,室温反应以后,将细胞表面用PBS洗净,在荧光显微镜下观察。荧光显微镜观察的结果如第33图所示。在第33图中,9个图中发白的部分为荧光部分,EGFP及Yes在任何细胞中都显示同等程度的表达,在导入siControl、siVIM35的细胞,通过波形蛋白抗体染色观察荧光,确定了内源性波形蛋白的存在。在导入siVIM812的细胞中,比起导入siControl、siVIM35的细胞来,其荧光显著减弱。这个结果揭示,由于siVIM812波形蛋白mRNA受到干扰,从而波形蛋白表达减少,siVIM812对内源性波形蛋白mRNA具有RNAi效果。因为本发明的试验系得到的结果(实施例2)与实际上采用各种siRNA处理内源基因的结果常常一致,所以,这个试验系作为任意的siRNA的RNAi活性的评价方法也是有效的。实施例4根据上述规则(a)~(d)设计碱基序列。碱基序列的设计通过执行上述siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置进行。准备了预测为有RNAi活性的15种序列(序列编号15-29)和预测不具有RNAi活性的5种序列(序列编号30-34)。除根据设计的序列制作目标序列及评价对象的siRNA以外,和上述实施例1一样,通过测定荧光素酶活性,评价RNAi的活性。结果如34图所示,荧光素酶相对活性值低的为有效状态,即其是具备RNAi活性的siRNA。上述经程序预测有RNAi活性的siRNA全部具有荧光素酶的表达抑制效果。5,gacgccaaaaacataaaga(SEQIDNO15)184,gttggcagaagctatgaaa(SEQIDNO16)272,gtgttgggcgcgttattta(SEQIDNO17)309,ccgcgaacgacatttataa(SEQIDNO18)428,ccaatcatccaaaaaatta(SEQIDNO19)515,cctcccggttttaatgaat(SEQIDNO20)658,gcatgccagagatcctatt(SEQIDNO21)695,ccggatactgcgattttaa(SEQIDNO22)734,ggttttggaatgtttacta(SEQIDNO23)774,gatttcgagtcgtcttaat(SEQIDNO24)891,gcactctgattgacaaata(SEQIDNO25)904,caaatacgatttatctaat(SEQIDNO26)1186,gattatgtccggttatgta(SEQIDNO27)1306,ccgcctgaagtctctgatt(SEQIDNO28)1586,ctcgacgcaagaaaaatca(SEQIDNO29)[显示无RNAi活性的序列,规定序列部分,不含突出部]14,aacataaagaaaggcccgg(SEQIDNO30)265,tatgccggtgttgggcgcg(SEQIDNO31)295,agttgcagttgcgcccgcg(SEQIDNO32)411,acgtgcaaaaaaagctccc(SEQIDNO33)1044,ttctgattacacccgaggg(SEQIDNO34)实施例5对SARS病毒进行siRNA设计,检查其RNAi活性。除目标序列以及评价对象序列分别变更以外,RNAi活性采用和上述实施例2同样的分析试验进行评价。从SARS病毒的基因组的3CL-pro、RdRp、Spike糖蛋白、小衣壳E蛋白,膜糖蛋白M、核衣壳蛋白、s2m基序的各处,利用上述siRNA序列设计程序设计符合所述规则的siRNA。第35图试验的结果显示,设计的符合规则的11个siRNA序列以其分别对应的作为靶标高效抑制其RNA。以加入siControl(与SARS无关的序列)的情况作为100%表示加入各siRNA时的相对目标mRNA的量。在加入各siRNA时,目标RNA减少到10%或10%以下,确认其具有RNAi活性。siControl;gggcgcggtcggtaaagtt(SEQIDNO35)3CL-PRO;SARS-10754;ggaattgccgtcttagata(SEQIDNO36)3CL-PRO;SARS-10810;gaatggtcgtactatcctt(SEQIDNO37)RdRp;SARS-14841;ccaagtaatcgttaacaat(SEQIDNO38)刺突蛋白(Spikeglycolprotein);SARS-23341;gcttggcgcatatattcta(SEQIDNO39)刺突蛋白;SARS-24375;cctttcgcgacttgataaa(SEQIDNO40)小包膜(Smallenvelope)E蛋白;SARS-26233;gtgcgtactgctgcaatat(SEQIDNO41)小包膜E蛋白;SARS-26288;ctactcgcgtgttaaaaat(SEQIDNO42)膜糖蛋白M;SARS-26399;gcagacaacggtactatta(SEQIDNO43)膜糖蛋白M;SARS-27024;ccggtagcaacgacaatat(SEQIDNO44)核壳体(Nucleocapsid)蛋白;SARS-28685;cgtagtcgcggtaattcaa(SEQIDNO45)s2m基序;SARS-29606;gatcgagggtacagtgaat(SEQIDNO46)实施例6遵照上述“<5>siRNA序列设计程序”以及“<7>执行siRNA序列设计程序的碱基序列处理装置等”,进行下述siRNA设计。设计的siRNA的序列如序列表序列编号47-序列编号892所示。(RNAi目标基因)NM-000604,人成纤维细胞生长因子受体1(fms-相关的酪氨酸激酶2,Pfeiffer综合症)(FFFR1)(目标序列)NM_000604-807,gtagcaacgtggagttcat(SEQIDNO47)NM_000604-806,ggtagcaacgtggagttca(SEQIDNO48)NM_000604-811,caacgtggagttcatgtgt(SEQIDNO49)NM_000604-880,ggtgaatgggagcaagatt(SEQIDNO50)NM_000604-891,gcaagattggcccagacaa(SEQIDNO51)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000604-818,gagttcatgtgtaaggtgt(SEQIDNO52)(RNAi目标基因)NM_000141,人纤维母细胞生长因子受体(人fibroblastgrowthfactorreceptor)2(细菌表达的激酶(bacteria-expressedkinase),角质化细胞生长因子受体(keratinocytegrowthfactorreceptor),颅面骨发育不全(craniofacialdysostosis)1,Crouzon综合征(Crouzonsyndrome),Pfeffer综合征(Pfeffersyndrome),Jackson-Weiss综合征(Jackson-Weisssyndrome))(FGFR2)(目标序列)NM_000141-612,gaggctacaaggtacgaaa(SEQIDNO53)NM_000141-615,gctacaaggtacgaaacca(SEQIDNO54)NM_000141-637,ctggagcctcattatggaa(SEQIDNO55)NM_000141-574,gaaaaacgggaaggagttt(SEQIDNO56)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000141-595,gcaggagcatcgcattgga(SEQIDNO57)NM_000141-69,ccttcagtttagttgagga(SEQIDNO58)NM_000141-70,cttcagtttagttgaggat(SEQIDNO59)(RNAi目标基因)NM_000142,人纤维母细胞生长因子受体(人fibroblastgrowthfactorreceptor)3(软骨发育不全(achondroplasia),致死性侏儒症(thanatophoricdwarfism))(FGFR3)(目标序列)NM_000142-899,gacggcacaccctacgtta(SEQIDNO60)NM_000142-1925,cacaacctcgactactaca(SEQIDNO61)NM_000142-2154,gcacacacgacctgtacat(SEQIDNO62)NM_000142-678,cctgcgtcgtggagaacaa(SEQIDNO63)NM_000142-2157,cacacgacctgtacatgat(SEQIDNO64)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000142-812,gagttccactgcaaggtgt(SEQIDNO65)(RNAi目标基因)NM_004448,人v-erb-b2成红细胞白血病病毒癌基因同源物2(Homosapiensv-erb-b2erythroblasticleukemiaviraloncogenehomolog2,),神经/胶质母细胞瘤来源的癌基因同源物(鸟类)(neuro/glioblastomaderivedoncogenehomolog(avian))(ERBB2)(目标序列)NM_004448-356,ggagacccgctgaacaata(SEQIDNO66)NM_004448-3645,ccttcgacaacctctatta(SEQIDNO67)NM_004448-3237,gggctggctccgatgtatt(SEQIDNO68)NM_004448-3238,ggctggctccgatgtattt(SEQIDNO69)NM_004448-3240,ctggctccgatgtatttga(SEQIDNO70)(RNAi目标基因)NM_001982,人v-erb-b2成红细胞白血病病毒癌基因同源物3(鸟类)(ERBB3)(目标序列)NM_001982-1347,gtgctgggcgtatctatat(SEQIDNO71)NM_001982-1349,gctgggcgtatctatataa(SEQIDNO72)NM_001982-1548,gcttgtcctgtcgaaatta(SEQIDNO73)NM_001982-1549,cttgtcctgtcgaaattat(SEQIDNO74)NM_001982-2857,cattcgcccaacctttaaa(SEQIDNO75)(RNAi目标基因)NM_005235,人v-erb-a成红细胞白血病病毒癌基因同源物4(鸟类)(ERBB4)(目标序列)NM_005235-295,ggagaatttacgcattatt(SEQIDNO76)NM_005235-2120,gctcaacttcgtattttga(SEQIDNO77)NM_005235-2940,ctcaaagatacctagttat(SEQIDNO78)NM_005235-2121,ctcaacttcgtattttgaa(SEQIDNO79)NM_005235-2880,ctgacagtagacctaaatt(SEQIDNO80)(RNAi目标基因)NM_002227,人Janus激酶1(蛋白酪氨酸激酶)(JAK1)(目标序列)NM_002227-441,ctcagggacagtatgattt(SEQIDNO81)NM_002227-1299,cagaatacgccatcaataa(SEQIDNO82)NM_002227-673,gatgcggataaataatgtt(SEQIDNO83)NM_002227-672,ggatgcggataaataatgt(SEQIDNO84)NM_002227-3385,ctttcagaaccttattgaa(SEQIDNO85)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002227-607,cagctacaagcgatatatt(SEQIDNO86)NM_002227-3042,caattgaaaccgataagga(SEQIDNO87)NM_002227-2944,gggttctcggcaatacgtt(SEQIDNO88)(RNAi目标基因)NM_004972,人Janus激酶2(酪氨酸蛋白激酶)(JAK2)(目标序列)NM_004972-2757,ctggtcggcgtaatctaaa(SEQIDNO89)NM_004972-2759,ggtcggcgtaatctaaaat(SEQIDNO90)NM_004972-2760,gtcggcgtaatctaaaatt(SEQIDNO91)NM_004972-3175,ggaatttatgcgtatgatt(SEQIDNO92)NM_004972-1452,ctgttcgctcagacaatat(SEQIDNO93)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004972-872,ggaaacggtggaattcagt(SEQIDNO94)NM_004972-870,ctggaaacggtggaattca(SEQIDNO95)NM_004972-847,gatttttgcaaccattata(SEQIDNO96)(RNAi目标基因)NM_000215,人Janus激酶3(酪氨酸蛋白激酶,白细胞)(JAK3)(目标序列)NM_000215-2315,gtcattcgtgacctcaata(SEQIDNO97)NM_000215-2522,gacccgctagcccacaata(SEQIDNO98)NM_000215-2524,cccgctagcccacaataca(SEQIDNO99)NM_000215-1788,ccatggtgcaggaatttgt(SEQIDNO100)NM_000215-1825,catgtatctgcgaaaacgt(SEQIDNO101)(RNAi目标基因)NM_003331,人酪氨酸激酶2(TYK2)(目标序列)NM_003331-3213,gcctgaaggagtataagtt(SEQIDNO102)NM_003331-2658,cggaccctacggttttcca(SEQIDNO103)NM_003331-299,ctatatttccgcataaggt(SEQIDNO104)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003331-2674,ccacaagcgctatttgaaa(SEQIDNO105)NM_003331-2675,cacaagcgctatttgaaaa(SEQIDNO106)NM_003331-328,gaactggcatggcatgaat(SEQIDNO107)(RNAi目标基因)NM_001079,人ξ-链(zeta-chain)(TCR)结合的蛋白激酶70kDa(ZAP70)(目标序列)NM_001079-512,gaggccgagcgcaaacttt(SEQIDNO108)NM_001079-1512,ggtacgcacccgaatgcat(SEQIDNO109)NM_001079-242,gagctctgcgagttctact(SEQIDNO110)NM_001079-929,gacacgagcgtgtatgaga(SEQIDNO111)NM_001079-1412,cggcactacgccaagatca(SEQIDNO112)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001079-1566,ggagctatggggtcaccat(SEQIDNO113)(RNAi目标基因)NM_005417,人v-src肉瘤(Schmidt-RuppinA-2)病毒癌基因同源物(鸟类)(SRC)(目标序列)NM_005417-185,ctgttcggaggcttcaact(SEQIDNO114)NM_005417-685,ggtggcctactactccaaa(SEQIDNO115)NM_005417-474,gggagtcagagcggttact(SEQIDNO116)NM_005417-480,cagagcggttactgctcaa(SEQIDNO117)NM_005417-567,cagtgtctgacttcgacaa(SEQIDNO118)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005417-651,cctcccgcacccagttcaa(SEQIDNO119)(RNAi目标基因)NM_002350,人v-yes-1Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物(LYN)(目标序列)NM_002350-610,cagcgacatgattaaacat(SEQIDNO120)NM_002350-533,gttattaagcactacaaaa(SEQIDNO121)NM_002350-606,gtatcagcgacatgattaa(SEQIDNO122)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002350-783,ggatgggttactataacaa(SEQIDNO123)NM_002350-694,gaagccatgggataaagat(SEQIDNO124)NM_002350-541,gcactacaaaattagaagt(SEQIDNO125)(RNAi目标基因)NM_005157,人v-ablAbelson鼠白血病(murineleukemia)病毒癌基因同源物1(ABL1)(目标序列)NM_005157-232,cactctaagcataactaaa(SEQIDNO126)NM_005157-770,gagggcgtgtggaagaaat(SEQIDNO127)NM-005157-262,ccgggtcttaggctataat(SEQIDNO128)NM_005157-264,gggtcttaggctataatca(SEQIDNO129)NM_005157-484,catctcgctgagatacgaa(SEQIDNO130)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005157-217,ggccagtggagataacact(SEQIDNO131)NM_005157-1227,gcctggcctacaacaagtt(SEQIDNO132)NM_005157-680,gtgtcccccaactacgaca(SEQIDNO133)(RNAi目标基因)NM_005158,人v-ablAbelson鼠白血病病毒癌基因同源物2(arg,Abelson-相关的基因)(ABL2)(目标序列)NM_005158-3273,ctcaaactcgcaacaaatt(SEQIDNO134)NM_005158-3272,cctcaaactcgcaacaaat(SEQIDNO135)NM_005158-1425,ctaaggtttatgaacttat(SEQIDNO136)NM_005158-448,gctcagcagtctaatcaat(SEQIDNO137)NM_005158-3110,caggccgctgagaaaatct(SEQIDNO138)(RNAi目标基因)NM_004071,人CDC-样激酶1(CLK1)(目标序列)NM_004071-1215,ccaggaaacgtaaatattt(SEQIDNO139)NM_004071-774,catttcgactggatcatat(SEQIDNO140)NM_004071-1216,caggaaacgtaaatatttt(SEQIDNO141)NM_004071-973,ctttggtagtgcaacatat(SEQIDNO142)NM_004071-463,cgtactaagtgcaagatat(SEQIDNO143)(RNAi目标基因)NM_001291,人CDC-样激酶2(CLK2)(目标序列)NM_001291-202,gtatgaccggcgatactgt(SEQIDNO144)NM_001291-225,gctacagacgcaacgatta(SEQIDNO145)NM_001291-226,ctacagacgcaacgattat(SEQIDNO146)NM_001291-45,ggagttaccgtgaacacta(SEQIDNO147)NM_001291-46,gagttaccgtgaacactat(SEQIDNO148)(RNAi目标基因)NM_001292,人CDC-样激酶3(CLK3)(目标序列)NM_001292-189,gccgtgacagcgatacata(SEQIDNO149)NM_001292-72,cctacagtcgggaacatga(SEQIDNO150)NM_001292-73,ctacagtcgggaacatgaa(SEQIDNO151)NM_001292-188,cgccgtgacagcgatacat(SEQIDNO152)NM_001292-121,gcctcccccacgaagatct(SEQIDNO153)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001292-388,ggtgaaggcacctttggca(SEQIDNO154)(RNAi目标基因)NM_020666,人CDC-样激酶4(CLK4)(目标序列)NM_020666-617,gtattagagcacttaaata(SEQIDNO155)NM_020666-1212,gaaaacgcaagtattttca(SEQIDNO156)NM_020666-1348,cctggttcgaagaatgtta(SEQIDNO157)NM_020666-181,cttgaatgagcgagattat(SEQIDNO158)NM_020666-803,cagatctgccagtcaataa(SEQIDNO159)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_020666-457,cgttctaagagcaagatat(SEQIDNO160)NM_020666-446,caaagtggagacgttctaa(SEQIDNO161)NM_020666-461,ctaagagcaagatatgaaa(SEQIDNO162)(RNAi目标基因)NM_002093,人糖原合酶激酶(glycogensynthasekinase)3beta(GSK3B)(目标序列)NM_002093-326,gtccgattgcgttatttct(SEQIDNO163)NM_002093-307,gctagatcactgtaacata(SEQIDNO164)NM_002093-451,gacgctccctgtgatttat(SEQIDNO165)NM_002093-632,cccaatgtttcgtatatct(SEQIDNO166)NM_002093-623,cgaggagaacccaatgttt(SEQIDNO167)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002093-206,gtatatcaagccaaacttt(SEQIDNO168)NM_002093-195,catttggtgtggtatatca(SEQIDNO169)NM_002093-205,ggtatatcaagccaaactt(SEQIDNO170)(RNAi目标基因)NM_182691,人SFRS蛋白激酶2(SRPK2)(目标序列)NM_182691-1312,gccaaatggacgacataaa(SEQIDNO171)NM_182691-1313,ccaaatggacgacataaaa(SEQIDNO172)NM_182691-1314,caaatggacgacataaaat(SEQIDNO173)NM_182691-1985,ctgatcccgatgttagaaa(SEQIDNO174)NM_182691-233,ggccggtatcatgttatta(SEQIDNO175)(RNAi目标基因)NM_005430,人无翼型MMTV整合位点家族,成员1(Homosapienswingless-typeMMTVintegrationsitefamily,member1)(WNT1)(目标序列)NM_005430-614,ggccgtacgaccgtattct(SEQIDNO176)NM_005430-205,gcgtctgatacgccaaaat(SEQIDNO177)NM_005430-855,cccacgacctcgtctactt(SEQIDNO178)NM_005430-196,caaacagcggcgtctgata(SEQIDNO179)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005430-875,gagaaatcgcccaacttct(SEQIDNO180)NM_005430-863,ctcgtctacttcgagaaat(SEQIDNO181)NM_005430-860,gacctcgtctacttcgaga(SEQIDNO182)(RNAi目标基因)NM_003391,人无翼型MMTV整合位点家族,成员2(WNT2)(目标序列)NM_003391-111,gggtgatgtgcgataatgt(SEQIDNO183)NM_003391-681,ggaaaacgggcgattatct(SEQIDNO184)NM_003391-764,gctaacgagaggtttaaga(SEQIDNO185)NM_003391-765,ctaacgagaggtttaagaa(SEQIDNO186)NM_003391-295,ggtcctactccgaagtagt(SEQIDNO187)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003391-797,gacctcgtgtattttgaga(SEQIDNO188)NM_003391-790,gaaaaatgacctcgtgtat(SEQIDNO189)NM_003391-789,cgaaaaatgacctcgtgta(SEQIDNO190)(RNAi目标基因)NM_004625,人无翼型MMTV整合位点家族,成员7A(WNT7A)(目标序列)NM_004625-92,ctgggcgcaagcatcatct(SEQIDNO191)NM_004625-313,gttcacctacgccatcatt(SEQIDNO192)NM_004625-524,gcccggactctcatgaact(SEQIDNO193)NM_004625-480,gcttcgccaaggtctttgt(SEQIDNO194)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004625-205,cctggacgagtgtcagttt(SEQIDNO195)NM_004625-209,gacgagtgtcagtttcagt(SEQIDNO196)NM_004625-172,catcatcgtcataggagaa(SEQIDNO197)(RNAi目标基因)NM_004626,人无翼型MMTV整合位点家族,成员11(WNT11)(目标序列)NM_004626-543,gatcccaagccaataaact(SEQIDNO198)NM_004626-917,gacagctgcgaccttatgt(SEQIDNO199)NM_004626-915,gcgacagctgcgaccttat(SEQIDNO200)NM_004626-54,ccggcgtgtgctatggcat(SEQIDNO201)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004626-59,gtgtgctatggcatcaagt(SEQIDNO202)NM_004626-560,ctgatgcgtctacacaaca(SEQIDNO203)NM_004626-562,gatgcgtctacacaacagt(SEQIDNO204)(RNAi目标基因)NM_030753,人无翼型MMTV整合位点家族,成员3(WNT3)(目标序列)NM_030753-417,gctgtgactcgcatcataa(SEQIDNO205)NM_030753-483,ctgacttcggcgtgttagt(SEQIDNO206)NM_030753-485,gacttcggcgtgttagtgt(SEQIDNO207)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_030753-887,gaccggacttgcaatgtca(SEQIDNO208)NM_030753-56,ctcgctggctacccaattt(SEQIDNO209)NM_030753-59,gctggctacccaatttggt(SEQIDNO210)(RNAi目标基因)NM_033131,人无翼型MMTV整合位点家族,成员3A(WNT3A)(目标序列)NM_033131-2,gccccactcggatacttct(SEQIDNO211)NM_033131-3,ccccactcggatacttctt(SEQIDNO212)NM_033131-4,cccactcggatacttctta(SEQIDNO213)NM_033131-77,gctgttgggccacagtatt(SEQIDNO214)NM_033131-821,gaggcctcgcccaacttct(SEQIDNO215)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_033131-168,ggaactacgtggagatcat(SEQIDNO216)NM_033131-50,ggcagctacccgatctggt(SEQIDNO217)NM_033131-165,gcaggaactacgtggagat(SEQIDNO218)(RNAi目标基因)NM_003392,人无翼型MMTV整合位点家族,成员5A(WNT5A)(目标序列)NM_003392-91,gtggtcgctaggtatgaat(SEQIDNO219)NM_003392-93,ggtcgctaggtatgaataa(SEQIDNO220)NM_003392-307,ggataacacctctgttttt(SEQIDNO221)NM_003392-57,ccttcgcccaggttgtaat(SEQIDNO222)NM_003392-87,cttggtggtcgctaggtat(SEQIDNO223)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003392-163,ccaactggcaggactttct(SEQIDNO224)NM_003392-116,gttcagatgtcagaagtat(SEQIDNO225)NM_003392-102,gtatgaataaccctgttca(SEQIDNO226)(RNAi目标基因)NM_004196,人细胞周期蛋白-依赖的激酶-样1(Homosapienscyclin-dependentkinase-like1)(CDC2-relatedkinase)(CDKL1)(目标序列)NM_004196-405,cgaaacattccgtgattaa(SEQIDNO227)NM_004196-305,ctcgtgaagagcataactt(SEQIDNO228)NM_004196-458,ggaccgagtgactactata(SEQIDNO229)NM_004196-844,gttgcatcacccatatttt(SEQIDNO230)NM_004196-330,cactgcaagctgtaaattt(SEQIDNO231)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004196-119,gatgaccctgtcataaaga(SEQIDNO232)(RNAi目标基因)NM_003948,人细胞周期蛋白-依赖的激酶-样2(CDC2-相关的激酶)(CDKL2)(目标序列)NM_003948-623,gatcagctatatcatatta(SEQIDNO233)NM_003948-1379,ccatcaggcatttataaca(SEQIDNO234)NM_003948-1380,catcaggcatttataacat(SEQIDNO235)NM_003948-768,ctgaagtggtgatagattt(SEQIDNO236)NM_003948-626,cagctatatcatattatga(SEQIDNO237)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003948-325,gattattaatggaattgga(SEQIDNO238)NM_003948-1012,ggtacaggataccaatgct(SEQIDNO239)(RNAi目标基因)NM_016508,人细胞周期蛋白-依赖的激酶-样3(CDKL3)(目标序列)NM_016508-498,gagctcccgaattagtatt(SEQIDNO240)NM_016508-500,gctcccgaattagtattaa(SEQIDNO241)NM_016508-1290,cacccatcaatctaactaa(SEQIDNO242)NM_016508-1301,ctaactaacagtaatttga(SEQIDNO243)NM_016508-501,ctcccgaattagtattaaa(SEQIDNO244)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_016508-785,gttcatgcttgtttacaaa(SEQIDNO245)NM_016508-555,ctttgggctgtatgatcat(SEQIDNO246)NM_016508-776,gcagatatagttcatgctt(SEQIDNO247)(RNAi目标基因)NM_002745,人有丝分裂原活化的蛋白激酶1(MAPK1)(目标序列)NM_002745-746,gaagacctgaattgtataa(SEQIDNO248)NM_002745-276,caaccatcgagcaaatgaa(SEQIDNO249)NM_002745-849,ccaaagctctggacttatt(SEQIDNO250)NM_002745-749,gacctgaattgtataataa(SEQIDNO251)NM_002745-113,gtgtgctctgcttatgata(SEQIDNO252)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002745-220,cttactgcgcttcagacat(SEQIDNO253)NM_002745-228,gcttcagacatgagaacat(SEQIDNO254)NM_002745-224,ctgcgcttcagacatgaga(SEQIDNO255)(RNAi目标基因)NM_016231,人nemo-样激酶(Homosapiensnemo-likekinase)(NLK)(目标序列)NM_016231-450,gagtagcgctcaaaaagat(SEQIDNO256)NM_016231-1074,gcgctaaggcacatatact(SEQIDNO257)NM_016231-962,ctactaggacgaagaatat(SEQIDNO258)NM_016231-579,ctccacacattgactattt(SEQIDNO259)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_016231-703,gattttgcgaggtttgaaa(SEQIDNO260)NM_016231-1382,gtccgacaggttaaagaaa(SEQIDNO261)NM_016231-1384,ccgacaggttaaagaaatt(SEQIDNO262)(RNAi目标基因)NM_001315,人有丝分裂原活化的蛋白激酶14(MAPK14)(目标序列)NM_001315-401,ctccgaggtctaaagtata(SEQIDNO263)NM_001315-403,ccgaggtctaaagtatata(SEQIDNO264)NM_001315-251,ggtctgttggacgttttta(SEQIDNO265)NM_001315-212,ctgcggttacttaaacata(SEQIDNO266)NM_001315-405,gaggtctaaagtatataca(SEQIDNO267)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001315-664,gtttcctggtacagaccat(SEQIDNO268)(RNAi目标基因)NM_002751,人有丝分裂原活化的蛋白激酶11(MAPK11)(目标序列)NM_002751-366,gcgacgagcacgttcaatt(SEQIDNO269)NM_002751-667,cccgggaagcgactacatt(SEQIDNO270)NM_002751-669,cgggaagcgactacattga(SEQIDNO271)NM_002751-731,gaggttctggcaaaaatct(SEQIDNO272)NM_002751-729,ctgaggttctggcaaaaat(SEQIDNO273)(RNAi目标基因)NM_002969,人有丝分裂原活化的蛋白激酶12(MAPK12)(目标序列)NM_002969-1018,gaagcgtgttacttacaaa(SEQIDNO274)NM_002969-262,gctgctggacgtattcact(SEQIDNO275)NM_002969-1017,ggaagcgtgttacttacaa(SEQIDNO276)NM_002969-578,cccgaggtcatcttgaatt(SEQIDNO277)NM_002969-1013,gaatggaagcgtgttactt(SEQIDNO278)(RNAi目标基因)NM_002754,人有丝分裂原活化的蛋白激酶13(MAPK13)(目标序列)NM_002754-164,ctgagccgaccctttcagt(SEQIDNO279)NM_002754-174,cctttcagtccgagatctt(SEQIDNO280)NM_002754-978,ccttagaacacgagaaact(SEQIDNO281)NM_002754-285,ccctgcgcaacttctatga(SEQIDNO282)NM_002754-287,ctgcgcaacttctatgact(SEQIDNO283)(RNAi目标基因)NM_139049,人有丝分裂原活化的蛋白激酶8(MAPK8)(目标序列)NM_139049-449,gacttaaagcccagtaata(SEQIDNO284)NM_139049-213,gagagctagttcttatgaa(SEQIDNO285)NM_139049-451,cttaaagcccagtaatata(SEQIDNO286)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_139049-525,caggaacgagttttatgat(SEQIDNO287)NM_139049-524,gcaggaacgagttttatga(SEQIDNO288)NM_139049-283,gaaatccctagaagaattt(SEQIDNO289)(RNAi目标基因)NM_002752,人有丝分裂原活化的蛋白激酶9(MAPK9)(目标序列)NM_002752-116,gtttgtgctgcatttgata(SEQIDNO290)NM_002752-204,gagcttatcgtgaacttgt(SEQIDNO291)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002752-878,gccagagatctgttatcaa(SEQIDNO292)NM_002752-879,ccagagatctgttatcaaa(SEQIDNO293)NM_002752-880,cagagatctgttatcaaaa(SEQIDNO294)(RNAi目标基因)NM_002753,人有丝分裂原活化的蛋白激酶10(MAPK10)(目标序列)NM_002753-668,gtggtgacacgttattaca(SEQIDNO295)NM_002753-957,cggactccgagcacaataa(SEQIDNO296)NM_002753-958,ggactccgagcacaataaa(SEQIDNO297)NM_002753-811,gtggaataaggtaattgaa(SEQIDNO298)NM_002753-1212,ctaaaaatggtgtagtaaa(SEQIDNO299)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002753-1167,ggaaagaacttatctacaa(SEQIDNO300)NM_002753-584,gtagtcaagtctgattgca(SEQIDNO301)NM_002753-761,gaaatggttcgccacaaaa(SEQIDNO302)(RNAi目标基因)NM_001786,人细胞分裂中期2,G1到S以及G2到M(Homosapienscelldivisioncycle2,G1toSandG2toM)(CDC2)(目标序列)NM_001786-782,gatttgctctcgaaaatgt(SEQIDNO303)NM_001786-788,ctctcgaaaatgttaatct(SEQIDNO304)NM_001786-658,gggcactcccaataatgaa(SEQIDNO305)NM_001786-696,ctttacaggactataagaa(SEQIDNO306)NM_001786-562,gagtataggcaccatattt(SEQIDNO307)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001786-869,gacaatcagattaagaaga(SEQIDNO308)(RNAi目标基因)NM_001798,人细胞周期蛋白依赖的激酶2(Homosapienscyclin-dependentkinase2)(CDK2)(目标序列)NM_001798-224,ctctacctggtttttgaat(SEQIDNO309)NM_001798-690,cttctatgcctgattacaa(SEQIDNO310)NM_001798-770,gatggacggagcttgttat(SEQIDNO311)NM_001798-226,ctacctggtttttgaattt(SEQIDNO312)NM_001798-36,gcacgtacggagttgtgta(SEQIDNO313)(RNAi目标基因)NM_000075,人细胞周期蛋白依赖的激酶4(CDK4)(目标序列)NM_000075-45,cctatgggacagtgtacaa(SEQIDNO314)NM_000075-616,gatgtttcgtcgaaagcct(SEQIDNO315)NM_000075-161,cgtgaggtggctttactga(SEQIDNO316)NM_000075-35,ggtgtcggtgcctatggga(SEQIDNO317)NM_000075-242,cgaactgaccgggagatca(SEQIDNO318)(RNAi目标基因)NM_052984,人细胞周期蛋白依赖的激酶4(CDK4),转录物变体2,mRNA.,228..563,0(目标序列)NM_052984-248,gaccgggagatcaagagat(SEQIDNO319)NM_052984-251,cgggagatcaagagatgtt(SEQIDNO320)(RNAi目标基因)NM_001799,人细胞周期蛋白依赖的激酶7(MO15同源物,爪蟾(Xenopuslaevis),cdk-活化性激酶)(CDK7)(目标序列)NM_001799-242,ggacataaatctaatatta(SEQIDNO321)NM_001799-104,caaattgtcgccattaaga(SEQIDNO322)NM_001799-490,ccccaatagagcttataca(SEQIDNO323)NM_001799-20,cgggcaaagcgttatgaga(SEQIDNO324)NM_001799-21,gggcaaagcgttatgagaa(SEQIDNO325)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001799-345,cctacatgttgatgactct(SEQIDNO326)(RNAi目标基因)NM_000455,人丝氨酸/苏氨酸激酶11(Peutz-Jegherssyndrome)(STK11)(目标序列)NM_000455-306,ggaggttacggcacaaaaa(SEQIDNO327)NM_000455-307,gaggttacggcacaaaaat(SEQIDNO328)NM_000455-309,ggttacggcacaaaaatgt(SEQIDNO329)NM_000455-1157,cccaaggccgtgtgtatga(SEQIDNO330)NM_000455-1158,ccaaggccgtgtgtatgaa(SEQIDNO331)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000455-916,cagctggttccggaagaaa(SEQIDNO332)(RNAi目标基因)NM_001274,人CHK1检验点同源物(HomosapiensCHK1checkpointhomolog)(粟酒裂殖酵母(S.pombe))(CHEK1)(目标序列)NM_001274-456,cagtatttcggtataataa(SEQIDNO333)NM_001274-361,gcatggtattggaataact(SEQIDNO334)NM_001274-990,gcccctcatacattgataa(SEQIDNO335)NM_001274-1038,ccacatgtcctgatcatat(SEQIDNO336)NM_001274-227,ggcaatatccaatatttat(SEQIDNO337)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001274-573,ggtcctgtggaatagtact(SEQIDNO338)NM_001274-416,gaaagggataacctcaaaa(SEQIDNO339)NM_001274-577,ctgtggaatagtacttact(SEQIDNO340)(RNAi目标基因)NM_002648,人pim-1癌基因(Homosapienspim-1oncogene)(PIM1)(目标序列)NM_002648-831,ggccaaccttcgaagaaat(SEQIDNO341)NM_002648-601,cgatgggacccgagtgtat(SEQIDNO342)NM_002648-602,gatgggacccgagtgtata(SEQIDNO343)NM_002648-293,ggtttctccggcgtcatta(SEQIDNO344)NM_002648-834,caaccttcgaagaaatcca(SEQIDNO345)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002648-96,ccctggagtcgcagtacca(SEQIDNO346)NM_002648-203,gtggagaaggaccggattt(SEQIDNO347)(RNAi目标基因)NM_006875,人pim-2癌基因(PIM2)(目标序列)NM_006875-698,ggggacattccctttgaga(SEQIDNO348)NM_006875-242,ctcgaagtcgcactgctat(SEQIDNO349)NM_006875-245,gaagtcgcactgctatgga(SEQIDNO350)NM_006875-499,gaacatcctgatagaccta(SEQIDNO351)NM_006875-468,gtggagttgtccatcgtga(SEQIDNO352)(RNAi目标基因)NM_021643,人tribbles同源物2(Homosapienstribbleshomolog2)(TRB2)(目标序列)NM_021643-174,cttgtatcgggaaatactt(SEQIDNO353)NM_021643-71,gaagagttgtcgtctataa(SEQIDNO354)NM_021643-177,gtatcgggaaatacttatt(SEQIDNO355)NM_021643-524,ctcaagctgcggaaattca(SEQIDNO356)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_021643-41,gggagatcgcggaacaaaa(SEQIDNO357)NM_021643-382,gttctttgagcgaagctat(SEQIDNO358)NM_021643-143,cccgagactccgaacttgt(SEQIDNO359)(RNAi目标基因)NM_007118,人三重功能结构域(Homosapienstriplefunctionaldomain)(PTPRF相互作用型)(TRIO)(目标序列)NM_007118-1684,caccaatgcggataaatta(SEQIDNO360)NM_007118-1686,ccaatgcggataaattact(SEQIDNO361)NM_007118-3857,gaaatctacgaatttcata(SEQIDNO362)NM_007118-6395,gagcagatcgtcatattca(SEQIDNO363)NM_007118-8531,cctatccgtagcattaaaa(SEQIDNO364)(RNAi目标基因)NM_004938,人死亡相关蛋白激酶1(Homosapiensdeath-associatedproteinkinase1)(DAPK1)(目标序列)NM_004938-917,caatccgttcgcttgatat(SEQIDNO365)NM_004938-1701,ggtgtttcgtcgattatca(SEQIDNO366)NM_004938-1702,gtgtttcgtcgattatcaa(SEQIDNO367)NM_004938-2824,gaaggtacttcgaaatcat(SEQIDNO368)NM_004938-668,gaaacgttagcaaatgtat(SEQIDNO369)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004938-609,gggtaataacctatatcct(SEQIDNO370)NM_004938-2697,gaggcgagtttggatatga(SEQIDNO371)NM_004938-490,ggcccataaaattgacttt(SEQIDNO372)(RNAi目标基因)NM_006252,人蛋白激酶,AMP活化的,α2催化亚基(Homosapiensproteinkinase,AMP-activated,alpha2catalyticsubunit)(PRKAA2)(目标序列)NM_006252-760,gaaacgagcaactatcaaa(SEQIDNO373)NM_006252-148,gaagattcgcagtttagat(SEQIDNO374)NM_006252-1227,gcaaaccgtatgacattat(SEQIDNO375)NM_006252-1338,ctggcaattacgtgaaaat(SEQIDNO376)NM_006252-1340,ggcaattacgtgaaaatga(SEQIDNO377)(RNAi目标基因)NM_002742,人蛋白激酶C,μ(PRKCM)(目标序列)NM_002742-508,ggtacgtcaaggtcttaaa(SEQIDNO378)NM_002742-1332,gattggatagcaaatgtat(SEQIDNO379)NM_002742-509,gtacgtcaaggtcttaaat(SEQIDNO380)NM_002742-370,ggaaggcgatcttattgaa(SEQIDNO381)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002742-1913,caccctggtgttgtaaatt(SEQIDNO382)NM_002742-2041,cataacgaagtttttaatt(SEQIDNO383)NM_002742-2521,ctatcagacctggttagat(SEQIDNO384)(RNAi目标基因)NM_003684,人MAP激酶-相互作用型丝氨酸/苏氨酸激酶1(HomosapiensMAPkinase-interactingserine/threoninekinase1)(MKNK1)(目标序列)NM_003684-218,gagtatgccgtcaaaatca(SEQIDNO385)NM_003684-229,caaaatcatcgagaaacaa(SEQIDNO386)NM_003684-344,gatgacacaaggttttact(SEQIDNO387)NM_003684-192,gtgccgtgagcctacagaa(SEQIDNO388)NM_003684-379,gcaaggaggttccatctta(SEQIDNO389)(RNAi目标基因)NM_004759,人有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(Homosapiensmitogen-activatedproteinkinase-activatedproteinkinase)2(MAPKAPK2)(目标序列)NM_004759-942,ccatcaccgagtttatgaa(SEQIDNO390)NM_004759-836,cgaatgggccagtatgaat(SEQIDNO391)NM_004759-563,cctgagaatctcttataca(SEQIDNO392)NM_004759-669,gttatacaccgtactatgt(SEQIDNO393)NM_004759-362,gatgtgtacgagaatctgt(SEQIDNO394)(RNAi目标基因)NM_172171,人钙/钙调蛋白-依赖的蛋白激酶(Homosapienscalcium/calmodulin-dependentproteinkinase)(CaM激酶)IIγ(CAMK2G)(目标序列)NM_172171-113,gagtacgcagcaaaaatca(SEQIDNO395)NM_172171-422,ctgctgctggcgagtaaat(SEQIDNO396)NM_172171-1075,ggtacacaacgctacagat(SEQIDNO397)NM_172171-474,gcctagccatcgaagtaca(SEQIDNO398)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_172171-425,ctgctggcgagtaaatgca(SEQIDNO399)NM_172171-260,ctcgtgtttgaccttgtta(SEQIDNO400)NM_172171-597,gcggggtcatcctgtatat(SEQIDNO401)(RNAi目标基因)NM_015981,人钙/钙调蛋白-依赖的蛋白激酶(CaM激酶)IIα(CAMK2A)(目标序列)NM_015981-1213,ccatcgattctattttgaa(SEQIDNO402)NM_015981-1210,cttccatcgattctatttt(SEQIDNO403)NM_015981-1067,cggaaacaggaaattataa(SEQIDNO404)NM_015981-1066,gcggaaacaggaaattata(SEQIDNO405)NM_015981-754,gaccattaacccatccaaa(SEQIDNO406)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_015981-1130,gagtcctacacgaagatgt(SEQIDNO407)NM_015981-1416,ggcagatcgtccacttcca(SEQIDNO408)NM_015981-1418,cagatcgtccacttccaca(SEQIDNO409)(RNAi目标基因)NM_020439,人钙/钙调蛋白-依赖的蛋白激酶IG(CAMK1G)(目标序列)NM_020439-1354,ggtcatggtaccagttaaa(SEQIDNO410)NM_020439-1409,ggagtctgtctcattatgt(SEQIDNO411)NM_020439-639,gtggataccccccattcta(SEQIDNO412)NM_020439-823,ctggattgacggaaacaca(SEQIDNO413)NM_020439-662,gaaacggagtctaagcttt(SEQIDNO414)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_020439-85,gggatcaggagctttctca(SEQIDNO415)NM_020439-903,gcaagtggaggcaagcctt(SEQIDNO416)(RNAi目标基因)NM_007194,人CHK2检验点同源物(HomosapiensCHK2checkpointhomolog)(粟酒裂殖酵母(S.pombe))(CHEK2)(目标序列)NM_007194-460,ctcttacattgcatacata(SEQIDNO417)NM_007194-201,ctcaggaactctattctat(SEQIDNO418)NM_007194-1233,gtttaggagttattctttt(SEQIDNO419)NM_007194-398,gataaataccgaacataca(SEQIDNO420)NM_007194-396,cagataaataccgaacata(SEQIDNO421)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_007194-614,gtagatgatcagtcagttt(SEQIDNO422)NM_007194-620,gatcagtcagtttatccta(SEQIDNO423)NM_007194-612,ctgtagatgatcagtcagt(SEQIDNO424)(RNAi目标基因)NM_002610,人丙酮酸脱氢酶激酶,同功酶1(Homosapienspyruvatedehydrogenasekinase,isoenzyme1)(PDK1)(目标序列)NM_002610-1194,gactcccagtgtataacaa(SEQIDNO425)NM_002610-553,catgagtcgcatttcaatt(SEQIDNO426)NM_002610-306,ggacaccatccgttcaatt(SEQIDNO427)NM_002610-1086,gtctttacgcacaatactt(SEQIDNO428)NM_002610-388,ggatgctaaagctatttat(SEQIDNO429)(RNAi目标基因)NM_001619,人肾上腺素,β,受体激酶1(Homosapiensadrenergic,beta,receptorkinase1)(ADRBK1)(目标序列)NM_001619-474,gggacgtgttccagaaatt(SEQIDNO430)NM_001619-317,gagatcttcgactcataca(SEQIDNO431)NM_001619-665,gacaaaaagcgcatcaaga(SEQIDNO432)NM_001619-439,gccatacatcgaagagatt(SEQIDNO433)NM_001619-476,gacgtgttccagaaattca(SEQIDNO434)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001619-1476,caaaaggaatcaagttact(SEQIDNO435)NM_001619-1474,cacaaaaggaatcaagtta(SEQIDNO436)NM_001619-1171,ccggcagcacaagaccaaa(SEQIDNO437)(RNAi目标基因)NM_005160,人肾上腺素,β,受体激酶2(ADRBK2)(目标序列)NM_005160-1779,gagagtcccggcaaaattt(SEQIDNO438)NM_005160-1778,ggagagtcccggcaaaatt(SEQIDNO439)NM_005160-1373,cagcatgtctacttacaaa(SEQIDNO440)NM_005160-307,cagaagtcgacaaatttat(SEQIDNO441)NM_005160-306,gcagaagtcgacaaattta(SEQIDNO442)(RNAi目标基因)NM_003161,人核糖体蛋白S6激酶(HomosapiensribosomalproteinS6kinase),70kDa,多肽1(RPS6KB1)(目标序列)NM_003161-1294,ccgatcacctcgaagattt(SEQIDNO443)NM_003161-1556,cacctgcgtatgaatctat(SEQIDNO444)NM_003161-1296,gatcacctcgaagatttat(SEQIDNO445)NM_003161-831,gtttgggagcattaatgta(SEQIDNO446)NM_003161-1295,cgatcacctcgaagattta(SEQIDNO447)(RNAi目标基因)NM_014496,人核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽6(RPS6KA6)(目标序列)NM_014496-682,gaaggcttactcattttgt(SEQIDNO448)NM_014496-1552,ggaggctagtgatatacta(SEQIDNO449)NM_014496-1553,gaggctagtgatatactat(SEQIDNO450)NM_014496-1551,gggaggctagtgatatact(SEQIDNO451)NM_014496-1481,cttgttacggatttaatga(SEQIDNO452)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_014496-831,gaaatgagaccatgaatat(SEQIDNO453)NM_014496-1411,gatgcgctatggacaacat(SEQIDNO454)NM_014496-927,ggaatccagcaaatagatt(SEQIDNO455)(RNAi目标基因)NM_002953,人核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽1(RPS6KA1)(目标序列)NM_002953-739,ctatggggtgttgatgttt(SEQIDNO456)NM_002953-1331,gctgtcaaggtcattgata(SEQIDNO457)NM_002953-1332,ctgtcaaggtcattgataa(SEQIDNO458)NM_002953-735,ggtcctatggggtgttgat(SEQIDNO459)NM_002953-738,cctatggggtgttgatgtt(SEQIDNO460)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002953-666,gcgggacagtggagtacat(SEQIDNO461)NM_002953-832,gctaggcatgccccagttt(SEQIDNO462)NM_002953-1315,caccaacatggagtatgct(SEQIDNO463)(RNAi目标基因)NM_001626,人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物2(Homosapiensv-aktmurinethymomaviraloncogenehomolog2)(AKT2)(目标序列)NM_001626-141,ctctaccccccttaaacaa(SEQIDNO464)NM_001626-35,cacaagcgtggtgaataca(SEQIDNO465)NM_001626-143,ctaccccccttaaacaact(SEQIDNO466)NM_001626-41,cgtggtgaatacatcaaga(SEQIDNO467)NM_001626-420,gcaaggcacgggctaaagt(SEQIDNO468)(RNAi目标基因)NM_005163,人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物1(AKT1)(目标序列)NM_005163-1294,gactgacaccaggtatttt(SEQIDNO469)NM_005163-1296,ctgacaccaggtattttga(SEQIDNO470)NM_005163-1292,gagactgacaccaggtatt(SEQIDNO471)NM_005163-751,cttctatggcgctgagatt(SEQIDNO472)NM_005163-630,cagccctgaagtactcttt(SEQIDNO473)(RNAi目标基因)NM_005465,人v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物3(蛋白激酶B,γ)(AKT3)(目标序列)NM_005465-229,ccagtggactactgttata(SEQIDNO474)NM_005465-99,cattcataggatataaaga(SEQIDNO475)NM_005465-402,cctctacaacccatcataa(SEQIDNO476)NM_005465-1283,gagacagatactagatatt(SEQIDNO477)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005465-733,ggaccgcacacgtttctat(SEQIDNO478)NM_005465-1317,cagctcagactattacaat(SEQIDNO479)NM_005465-1319,gctcagactattacaataa(SEQIDNO480)(RNAi目标基因)NM_005627,人血清/糖皮质激素调节的激酶(Homosapiensserum/glucocorticoidregulatedkinase)(SGK)(目标序列)NM_005627-875,ggcctgccgcctttttata(SEQIDNO481)NM_005627-97,gggtctgaacgactttatt(SEQIDNO482)NM_005627-99,gtctgaacgactttattca(SEQIDNO483)NM_005627-190,ggagcctgagcttatgaat(SEQIDNO484)NM_005627-413,gaggagaagcatattatgt(SEQIDNO485)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005627-649,catcgtttatagagactta(SEQIDNO486)NM_005627-367,ctatgcagtcaaagtttta(SEQIDNO487)NM_005627-307,gatcggaaagggcagtttt(SEQIDNO488)(RNAi目标基因)NM_170693,人血清/糖皮质激素调节的激酶2(SGK2)(目标序列)NM_170693-163,gtctgatggggcgttctat(SEQIDNO489)NM_170693-840,cagactttcttgagattaa(SEQIDNO490)NM_170693-842,gactttcttgagattaaga(SEQIDNO491)NM_170693-582,gtggtacccctgagtactt(SEQIDNO492)NM_170693-183,cagtgaaggtactacagaa(SEQIDNO493)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_170693-287,gtgggcctgcgctactcct(SEQIDNO494)(RNAi目标基因)NM_013257,人血清/糖皮质激素调节的激酶-样(SGKL)(目标序列)NM_013257-273,caggactaaacgaattcat(SEQIDNO495)NM_013257-944,gacaccactaccacatttt(SEQIDNO496)NM_013257-1388,gtatcttctgactattcta(SEQIDNO497)NM_013257-946,caccactaccacattttgt(SEQIDNO498)NM_013257-790,gttttacgctgctgaaatt(SEQIDNO499)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_013257-693,caactgaaaagctttattt(SEQIDNO500)NM_013257-225,gaatatttggtgataattt(SEQIDNO501)NM_013257-38,ccaagtgtaagcattccca(SEQIDNO502)(RNAi目标基因)NM_002744,人蛋白激酶C(HomosapiensproteinkinaseC),zeta(PRKCZ)(目标序列)NM_002744-1233,gcggaaccccgaattacat(SEQIDNO503)NM_002744-398,caagccaagcgctttaaca(SEQIDNO504)NM_002744-1447,caaagcctcccatgtttta(SEQIDNO505)NM_002744-823,ccaaatttacgccatgaaa(SEQIDNO506)NM_002744-1100,cacgagagggggatcatct(SEQIDNO507)(RNAi目标基因)NM_006254,人蛋白激酶C,δ(PRKCD)(目标序列)NM_006254-1524,gcggcacccctgactatat(SEQIDNO508)NM_006254-1339,ctaccgtgccacgttttat(SEQIDNO509)NM_006254-992,gggacctacggcaagatct(SEQIDNO510)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_006254-172,gttcgacgcccacatctat(SEQIDNO511)NM_006254-659,cagaaagaacgcttcaaca(SEQIDNO512)NM_006254-761,gtgaagcagggattaaagt(SEQIDNO513)(RNAi目标基因)NM_002737,人蛋白激酶C,α(PRKCA)(目标序列)NM_002737-1571,ggcgtcctgttgtatgaaa(SEQIDNO514)NM_002737-393,gtgacacctgcgatatgaa(SEQIDNO515)NM_002737-711,gacgactgtctgtagaaat(SEQIDNO516)NM_002737-1085,gaactgtatgcaatcaaaa(SEQIDNO517)NM_002737-1924,gctggttattgctaacata(SEQIDNO518)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002737-1958,gaagggttctcgtatgtca(SEQIDNO519)NM_002737-1835,ccattcaagcccaaagtgt(SEQIDNO520)NM_002737-1234,gctgtacttcgtcatggaa(SEQIDNO521)(RNAi目标基因)NM_002738,人蛋白激酶C,β1(PRKCB1)(目标序列)NM_002738-573,cagatccctacgtaaaact(SEQIDNO522)NM_002738-1791,catttttccggtatattga(SEQIDNO523)NM_002738-1384,catttaccgtgacctaaaa(SEQIDNO524)NM_002738-575,gatccctacgtaaaactga(SEQIDNO525)NM_002738-1315,ggagccccatgctgtattt(SEQIDNO526)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002738-1006,gatgaaactgaccgatttt(SEQIDNO527)NM_002738-1961,gaattcgaaggattttcct(SEQIDNO528)NM_002738-1233,ccatggaccgcctgtactt(SEQIDNO529)(RNAi目标基因)NM_015282,人细胞质接头结合的蛋白(Homosapienscytoplasmiclinkerassociatedprotein)1(CLASP1)(目标序列)NM_015282-2447,gagccgtatgggatgtatt(SEQIDNO530)NM_015282-4151,gccgagctgacgattatga(SEQIDNO531)NM_015282-4152,ccgagctgacgattatgaa(SEQIDNO532)NM_015282-1786,gcgatctcgaagtgatatt(SEQIDNO533)NM_015282-635,cagtcccggttgaatgtaa(SEQIDNO534)(RNAi目标基因)NM_006287,人组织因子途径抑制物(脂蛋白结合的凝固抑制物)(Homosapienstissuefactorpathwayinhibitor(lipoprotein-associatedcoagulationinhibitor))(TFPI)(目标序列)NM_006287-225,ctcgacagtgcgaagaatt(SEQIDNO535)NM_006287-227,cgacagtgcgaagaattta(SEQIDNO536)NM_006287-228,gacagtgcgaagaatttat(SEQIDNO537)NM_006287-230,cagtgcgaagaatttatat(SEQIDNO538)NM_006287-393,gaatatgtcgaggttatat(SEQIDNO539)(RNAi目标基因)NM_004073,人细胞因子诱导型激酶(Homosapienscytokine-induciblekinase)(CNK)(目标序列)NM_004073-1283,gttgactactccaataagt(SEQIDNO540)NM_004073-138,gcgcctacgctgtcaaagt(SEQIDNO541)NM_004073-239,cgccacatcgtgcgttttt(SEQIDNO542)NM_004073-1281,gggttgactactccaataa(SEQIDNO543)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004073-192,gcgagaagatcctaaatga(SEQIDNO544)NM_004073-183,cgcatcagcgcgagaagat(SEQIDNO545)NM_004073-190,gcgcgagaagatcctaaat(SEQIDNO546)(RNAi目标基因)NM_003384,人痘苗病毒相关的激酶(Homosapiensvacciniarelatedkinase)1(VRK1)(目标序列)NM_003384-776,ccttgggaggataatttga(SEQIDNO547)NM_003384-773,cttccttgggaggataatt(SEQIDNO548)NM_003384-195,caccttgtgttgtaaaagt(SEQIDNO549)NM_003384-777,cttgggaggataatttgaa(SEQIDNO550)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003384-372,gttacaggtttatgataat(SEQIDNO551)NM_003384-463,gcagctaagcttaagaatt(SEQIDNO552)NM_003384-977,ggactaaaagctataggaa(SEQIDNO553)(RNAi目标基因)NM_006296,人痘苗病毒相关的激酶2(VRK2)(目标序列)NM_006296-366,gactaggaatagatttaca(SEQIDNO554)NM_006296-165,caagacatgtagtaaaagt(SEQIDNO555)NM_006296-874,ggtatgtgctcatagttta(SEQIDNO556)NM_006296-541,ggtttatcttgcagattat(SEQIDNO557)NM_006296-113,ggatttggattgatatatt(SEQIDNO558)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_006296-560,ggactttcctacagatatt(SEQIDNO559)NM_006296-626,cataatgggacaatagagt(SEQIDNO560)NM_006296-568,ctacagatattgtcccaat(SEQIDNO561)(RNAi目标基因)NM_004672,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶激酶(Homosapiensmitogen-activatedproteinkinasekinasekinase)6(MAP3K6)(目标序列)NM_004672-2221,ctttctcctccgaactttt(SEQIDNO562)NM_004672-1489,gatgttggagtttgattat(SEQIDNO563)NM_004672-814,caaagagctccggctaata(SEQIDNO564)NM_004672-51,ccctgcgggaggatgtttt(SEQIDNO565)NM_004672-503,gccgagcagcataatgtct(SEQIDNO566)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004672-442,ggactactcggccatcatt(SEQIDN0567)NM_004672-277,ctatttccgggagaccatt(SEQIDNO568)NM_004672-1929,ggctgctcaagatttctga(SEQIDNO569)(RNAi目标基因)NM_005923,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶激酶5(MAP3K5)(目标序列)NM_005923-3294,gatccactgaccgaaaaat(SEQIDNO570)NM_005923-838,caggaaagctcgtaattta(SEQIDNO571)NM_005923-840,ggaaagctcgtaatttata(SEQIDNO572)NM_005923-1525,gtacctcaagtctattgta(SEQIDNO573)NM_005923-2517,ctggtaccctccagtatat(SEQIDNO574)(RNAi目标基因)NM_020998,人巨噬细胞刺激1(肝细胞生长因子样)(Homosapiensmacrophagestimulating1(hepatocytegrowthfactor-like))(MST1)(目标序列)NM_020998-943,ccgatttacgccagaaaaa(SEQIDNO575)NM_020998-944,cgatttacgccagaaaaat(SEQIDNO576)NM_020998-945,gatttacgccagaaaaata(SEQIDNO577)NM_020998-698,ggtctggacgacaactatt(SEQIDNO578)NM_020998-1827,ccaaaggtacgggtaatga(SEQIDNO579)(RNAi目标基因)NM_003576,人丝氨酸/苏氨酸激酶(Homosapiensserine/threoninekinase)24(STE20同源物,酵母)(STK24)(目标序列)NM_003576-348,gctccgcactagatctatt(SEQIDNO580)NM_003576-349,ctccgcactagatctatta(SEQIDNO581)NM_003576-351,ccgcactagatctattaga(SEQIDNO582)NM_003576-352,cgcactagatctattagaa(SEQIDNO583)NM_003576-437,ctccattcggagaagaaaa(SEQIDNO584)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_003576-148,gttcaaaggcattgacaat(SEQIDNO585)(RNAi目标基因)NM_016542,人Mst3和SOK1-相关的激酶(HomosapiensMst3andSOK1-relatedkinase)(MST4)(目标序列)NM_016542-857,ctgatagatcgttttaaga(SEQIDNO586)NM_016542-139,gcaagtcgttgctattaaa(SEQIDNO587)NM_016542-1133,gaagaactcgagaaaagta(SEQIDNO588)NM_016542-556,ggctcctgaagttattcaa(SEQIDNO589)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_016542-613,gggaattactgctattgaa(SEQIDNO590)NM_016542-669,caatgagagttctgtttct(SEQIDNO591)NM_016542-1063,gataatcacacctgcattt(SEQIDNO592)(RNAi目标基因)NM_002576,人p21/Cdc42/Rac1-活化的激酶(Homosapiensp21/Cdc42/Rac1-activatedkinase)1(STE20同源物,酵母)(PAK1)(目标序列)NM_002576-38,gcccctccgatgagaaata(SEQIDNO593)NM_002576-788,ggcgatcctaagaagaaat(SEQIDNO594)NM_002576-3,caaataacggcctagacat(SEQIDNO595)NM_002576-154,ccgattttaccgatccatt(SEQIDNO596)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002576-1020,gggttgttatggaatactt(SEQIDNO597)NM_002576-1165,catcaagagtgacaatatt(SEQIDNO598)NM_002576-1015,gctgtgggttgttatggaa(SEQIDNO599)(RNAi目标基因)NM_002577,人p21(CDKN1A)-活化的激酶(Homosapiensp21(CDKN1A)-activatedkinase)2(PAK2)(目标序列)NM_002577-721,cataggtgaccctaagaaa(SEQIDNO600)NM_002577-908,cccaacatcgttaactttt(SEQIDNO601)NM_002577-909,ccaacatcgttaacttttt(SEQIDNO602)NM_002577-557,ccggatcatacgaaatcaa(SEQIDNO603)NM_002577-558,cggatcatacgaaatcaat(SEQIDNO604)(RNAi目标基因)NM_002578,人p21(CDKN1A)-活化的激酶3(PAK3)(目标序列)NM_002578-458,catccttcgagtacaaaaa(SEQIDNO605)NM_002578-1467,ctgtattccgtgacttttt(SEQIDNO606)NM_002578-1469,gtattccgtgactttttaa(SEQIDNO607)NM_002578-706,cacagatcggcaaagaaaa(SEQIDNO608)NM_002578-3,ctgacggtctggataatga(SEQIDNO609)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002578-1376,cccccttaccttaatgaaa(SEQIDNO610)NM_002578-219,cagactttgagcatacgat(SEQIDNO611)NM_002578-254,gcagtcaccggggaattca(SEQIDNO612)(RNAi目标基因)NM_005884,人p21(CDKN1A)-活化的激酶4(PAK4)(目标序列)NM_005884-1502,gggataatggtgattgaga(SEQIDNO613)NM_005884-1503,ggataatggtgattgagat(SEQIDNO614)NM_005884-883,gccacagcgagtatcccat(SEQIDNO615)NM_005884-77,cagcacgagcagaagttca(SEQIDNO616)NM_005884-1494,ggtcgctggggataatggt(SEQIDNO617)(RNAi目标基因)NM_002755,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶1(MAP2K1)(目标序列)NM_002755-280,ggccagaaagctaattcat(SEQIDNO618)NM_002755-402,gcgatggcgagatcagtat(SEQIDNO619)NM_002755-404,gatggcgagatcagtatct(SEQIDNO620)NM_002755-682,ctacatgtcgccagaaaga(SEQIDNO621)NM_002755-1128,ccaccatcggccttaacca(SEQIDNO622)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002755-912,gacctcccatggcaatttt(SEQIDNO623)NM_002755-915,ctcccatggcaatttttga(SEQIDNO624)NM_002755-911,cgacctcccatggcaattt(SEQIDNO625)(RNAi目标基因)NM_030662,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶2(MAP2K2)(目标序列)NM_030662-1136,gccggctggttgtgtaaaa(SEQIDNO626)NM_030662-184,caaggtcggcgaactcaaa(SEQIDNO627)NM_030662-959,ctcctggactatattgtga(SEQIDNO628)NM_030662-183,ccaaggtcggcgaactcaa(SEQIDNO629)NM_030662-711,ggttgcagggcacacatta(SEQIDNO630)(RNAi目标基因)NM_002756,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶3(MAP2K3)(目标序列)NM_002756-257,cgcacggtcgactgtttct(SEQIDNO631)NM_002756-258,gcacggtcgactgtttcta(SEQIDNO632)NM_002756-289,ctacggggcactattcaga(SEQIDNO633)NM_002756-285,ccttctacggggcactatt(SEQIDNO634)NM_002756-44,gactcccggaccttcatca(SEQIDNO635)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002756-129,gagcctatggggtggtaga(SEQIDNO636)NM_002756-41,ctggactcccggaccttca(SEQIDNO637)NM_002756-89,gaggctgatgacttggtga(SEQIDNO638)(RNAi目标基因)NM_002758,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶6(MAP2K6)(目标序列)NM_002758-394,ggatacatcactagataaa(SEQIDNO639)NM_002758-395,gatacatcactagataaat(SEQIDNO640)NM_002758-755,cttcgatttccctatgatt(SEQIDNO641)NM_002758-340,cttttatggcgcactgttt(SEQIDNO642)NM_002758-399,catcactagataaattcta(SEQIDNO643)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002758-312,ggacggtggactgtccatt(SEQIDNO644)NM_002758-418,caaacaagttattgataaa(SEQIDNO645)NM_002758-415,ctacaaacaagttattgat(SEQIDNO646)(RNAi目标基因)NM_003010,人有丝分裂原活化的蛋白激酶激酶4(MAP2K4)(目标序列)NM_003010-543,ctacctcgtttgataagtt(SEQIDNO647)NM_003010-1130,gcatgctatgtttgtaaaa(SEQIDNO648)NM_003010-1056,ccaaaaggccaaagtataa(SEQIDNO649)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003010-1129,cgcatgctatgtttgtaaa(SEQIDNO650)NM_003010-1057,caaaaggccaaagtataaa(SEQIDNO651)NM_003010-452,gtaatgcggagtagtgatt(SEQIDNO652)(RNAi目标基因)NM_016123,人白介素-1受体结合的激酶4(Homosapiensinterleukin-1receptor-associatedkinase)4(IRAK4)(目标序列)NM_016123-1299,gccaatgtcggcatgaaaa(SEQIDNO653)NM_016123-1073,gctttgcgtggagaaataa(SEQIDNO654)NM_016123-38,ctcaatgttggactaatta(SEQIDNO655)NM_016123-769,cctctgcttagtatatgtt(SEQIDNO656)NM_016123-1180,gttattgctagatattaaa(SEQIDNO657)(RNAi目标基因)NM_002880,人v-raf-1鼠白血病病毒癌基因同源物(Homosapiensv-raf-1murineleukemiaviraloncogenehomolog)1(RAF1)(目标序列)NM_002880-1703,gatcttagtaagctatata(SEQIDNO658)NM_002880-232,gcatgactgccttatgaaa(SEQIDNO659)NM_002880-1597,ctatggcatcgtattgtat(SEQIDNO660)NM_002880-1706,cttagtaagctatataaga(SEQIDNO661)NM_002880-568,cagacaactcttattgttt(SEQIDNO662)(RNAi目标基因)NM_000020,人活化素A受体II型样1(HomosapiensactivinArecepttypeII-like1)(ACVRL1)(目标序列)NM_000020-1453,caagaagacactacaaaaa(SEQIDNO663)NM_000020-722,gagactgagatctataaca(SEQIDNO664)NM_000020-1456,gaagacactacaaaaaatt(SEQIDNO665)NM_000020-728,gagatctataacacagtat(SEQIDNO666)NM_000020-846,gctccctctacgactttct(SEQIDNO667)(RNAi目标基因)NM_001105,人活化素A受体,I型(ACVR1)(目标序列)NM_001105-1456,cacagcactgcgtatcaaa(SEQIDNO668)NM_001105-428,gttgctctccgaaaattta(SEQIDNO669)NM_001105-431,gctctccgaaaatttaaaa(SEQIDNO670)NM_001105-1460,gcactgcgtatcaaaaaga(SEQIDNO671)NM_001105-1458,cagcactgcgtatcaaaaa(SEQIDNO672)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001105-1306,caatgacccaagttttgaa(SEQIDNO673)NM_001105-1381,gttctcagacccgacatta(SEQIDNO674)NM_001105-281,caaggggactggtgtaaca(SEQIDNO675)(RNAi目标基因)NM_004302,人活化素A受体,IB型(ACVR1B)(目标序列)NM_004302-609,cccgaaccatcgttttaca(SEQIDNO676)NM_004302-610,ccgaaccatcgttttacaa(SEQIDNO677)NM_004302-897,caattgaggggatgattaa(SEQIDNO678)NM_004302-857,cacgggtccctgtttgatt(SEQIDNO679)NM_004302-859,cgggtccctgtttgattat(SEQIDNO680)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004302-1119,gggtggggaccaaacgata(SEQIDNO681)NM_004302-1063,cctggctgtccgtcatgat(SEQIDNO682)NM_004302-1121,gtggggaccaaacgataca(SEQIDNO683)(RNAi目标基因)NM_145259,人活化素A受体,IC型(ACVR1C)(目标序列)NM_145259-1419,ctgctcttcgtattaagaa(SEQIDNO684)NM_145259-956,gctcatcgagacataaaat(SEQIDNO685)NM_145259-825,gctccttatatgactattt(SEQIDNO686)NM_145259-959,catcgagacataaaatcaa(SEQIDNO687)NM_145259-1237,gtaccaattgccttattat(SEQIDNO688)(RNAi目标基因)NM_004612,人转化型生长因子,β受体I(活化素A受体II型-样激酶,53kDa)(Homosapienstransforminggrowthfactor,betareceptorI(activinAreceptortypeII-likekinase,53kDa))(TGFBR1)(目标序列)NM_004612-236,cgagataggccgtttgtat(SEQIDNO689)NM_004612-1451,gcattgcggattaagaaaa(SEQIDNO690)NM_004612-463,ccatcgagtgccaaatgaa(SEQIDNO691)NM_004612-492,cattagatcgcccttttat(SEQIDNO692)NM_004612-1449,cagcattgcggattaagaa(SEQIDNO693)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004612-829,gttggtgtcagattatcat(SEQIDNO694)NM_004612-288,caacatattgctgcaatca(SEQIDNO695)NM_004612-839,gattatcatgagcatggat(SEQIDNO696)(RNAi目标基因)NM_004836,人真核转位起始因子2-α激酶3(Homosapienseukaryotictranslationinitiationfactor2-alphakinase3)(EIF2AK3)(目标序列)NM_004836-1594,catagcaacaacgtttatt(SEQIDNO697)NM_004836-1419,catatgataatggttatta(SEQIDNO698)NM_004836-1900,ggtaatgcgagaagttaaa(SEQIDNO699)NM_004836-1248,ctaatgaaaacgcaattat(SEQIDNO700)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004836-784,ctttgaacttcggtatatt(SEQIDNO701)NM_004836-782,cactttgaacttcggtata(SEQIDNO702)NM_004836-983,gaatgggagtaccagtttt(SEQIDNO703)(RNAi目标基因)NM_001433,人ER到细胞核信号1(HomosapiensERtonucleussignalling1)(ERN1)(目标序列)NM_001433-2407,cattgcacgagaattgata(SEQIDNO704)NM_001433-2277,caggctgcgtcttttacta(SEQIDNO705)NM_001433-2530,cgtgagcgacagaatagaa(SEQIDNO706)NM_001433-1149,ccaaacatcgggaaaatgt(SEQIDNO707)NM_001433-364,ggacatctggtatgttatt(SEQIDNO708)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001433-319,cccatgccgaagttcagat(SEQIDNO709)NM_001433-2254,ctacacggtggacatcttt(SEQIDNO710)NM_001433-324,gccgaagttcagatggaat(SEQIDNO711)(RNAi目标基因)NM_001278,人保守的螺旋-环-螺旋遍在激酶(Homosapiensconservedhelix-loop-helixubiquitouskinase)(CHUK)(目标序列)NM_001278-746,ggagaagttcggtttagta(SEQIDNO712)NM_001278-1879,ggccctcagtaatatcaaa(SEQIDNO713)NM_001278-864,gacctgttgaccttacttt(SEQIDNO714)NM_001278-2150,ggccatttaagcactatta(SEQIDNO715)NM_001278-2151,gccatttaagcactattat(SEQIDNO716)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001278-645,ctggatataggcctttctt(SEQIDNO717)NM_001278-1354,gttaagtcttcttagatat(SEQIDNO718)NM_001278-1203,gtttatctgattgtgtaaa(SEQIDNO719)(RNAi目标基因)NM_014002,B细胞中的人κ轻多肽基因增强子,激酶ε(HomosapiensinhibitorofkappalightpolypeptidegeneenhancerinB-cells,kinaseepsilon)(IKBKE)(目标序列)NM_014002-2107,catcgaacggctaaataga(SEQIDNO720)NM_014002-1724,ctggataaggtgaatttca(SEQIDNO721)NM_014002-535,cctgcatcccgacatgtat(SEQIDNO722)NM_014002-1220,ctgcaggcggattacaaca(SEQIDNO723)NM_014002-1726,ggataaggtgaatttcagt(SEQIDNO724)(Targetsequenceeffectiveformousehomolog)NM_014002-54,ccactgccagtgtgtacaa(SEQIDNO725)(RNAi目标基因)NM_003177,人脾酪氨酸激酶(Homosapiensspleentyrosinekinase)(SYK)(目标序列)NM_003177-1222,caatgaccccgctcttaaa(SEQIDNO726)NM_003177-713,cagctagtcgagcattatt(SEQIDNO727)NM_003177-849,ggtcagcgggtggaataat(SEQIDNO728)NM_003177-715,gctagtcgagcattattct(SEQIDNO729)NM_003177-1389,gacatgtcaaggataagaa(SEQIDNO730)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_003177-1559,gctgatgaaaactactaca(SEQIDNO731)NM_003177-1028,gacacagaggtgtacgaga(SEQIDNO732)NM_003177-1560,ctgatgaaaactactacaa(SEQIDNO733)(RNAi目标基因)NM_153831,人PTK2蛋白酪氨酸激酶2(HomosapiensPTK2proteintyrosinekinase2)(PTK2)(目标序列)NM_153831-451,gaagagcgattatatgtta(SEQIDNO734)NM_153831-1889,gtaatcggtcgaattgaaa(SEQIDNO735)NM_153831-93,caatggagcgagtattaaa(SEQIDNO736)NM_153831-2747,ctggaccggtcgaatgata(SEQIDNO737)NM_153831-92,gcaatggagcgagtattaa(SEQIDNO738)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_153831-1767,ctccagagtcaatcaattt(SEQIDNO739)NM_153831-1766,gctccagagtcaatcaatt(SEQIDNO740)NM_153831-599,gttggtttaaagcgatttt(SEQIDNO741)(RNAi目标基因)NM_173174,人PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β(PTK2B)(目标序列)NM_173174-1273,ggtcctgaatcgtattctt(SEQIDNO742)NM_173174-1776,ccccagagtccattaactt(SEQIDNO743)NM_173174-1723,ggacgaggactattacaaa(SEQIDNO744)NM_173174-2486,gaccccatggtttatatga(SEQIDNO745)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_173174-378,ggaggtatgaccttcaaat(SEQIDNO746)NM_173174-1182,gcagcatagagtcagacat(SEQIDNO747)NM_173174-376,gtggaggtatgaccttcaa(SEQIDNO748)(RNAi目标基因)NM_002944,人v-rosUR2肉瘤病毒癌基因同源物1(sarcomavirusoncogenehomolog1)(avian)(ROS1)(目标序列)NM_002944-417,gaagctggacttatactaa(SEQIDNO749)NM_002944-2123,gacatggattggtataaca(SEQIDNO750)NM_002944-2163,cgaaaggcgacgtttttgt(SEQIDNO751)NM_002944-1385,caagccaagcgaatcattt(SEQIDNO752)NM_002944-416,ggaagctggacttatacta(SEQIDNO753)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002944-3048,ctgtcactccttataccta(SEQIDNO754)NM_002944-3044,ctttctgtcactccttata(SEQIDNO755)NM_002944-1051,caacatgtctgatgtatct(SEQIDNO756)(RNAi目标基因)NM_004304,人退行性淋巴瘤激酶(Homosapiensanaplasticlymphomakinase)(Ki-1)(ALK)(目标序列)NM_004304-2469,ccacctacgtatttaagat(SEQIDNO757)NM_004304-4067,cctgtataccggataatga(SEQIDNO758)NM_004304-2468,gccacctacgtatttaaga(SEQIDNO759)NM_004304-4183,cgctttgccgatagaatat(SEQIDNO760)NM_004304-2922,gccacggggaagtgaatat(SEQIDNO761)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004304-3258,ccatcatgaccgactacaa(SEQIDNO762)NM_004304-2833,caatgaccccgaaatggat(SEQIDNO763)NM_004304-3156,ccggcatcatgattgtgta(SEQIDNO764)(RNAi目标基因)NM_000245,人met原癌基因(Homosapiensmetproto-oncogene)(肝细胞生长因子受体(MET)(目标序列)NM_000245-2761,gaacagcgagctaaatata(SEQIDNO765)NM_000245-1271,cagcgcgttgacttattca(SEQIDNO766)NM_000245-1086,gtgcattccctatcaaata(SEQIDNO767)NM_000245-725,gattcttaccccattaagt(SEQIDNO768)NM_000245-3619,caaagcgatgaaatatctt(SEQIDNO769)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000245-2987,catttggataggcttgtaa(SEQIDNO770)NM_000245-801,ctctagatgctcagacttt(SEQIDNO771)NM_000245-2660,gttaaaggtgaagtgttaa(SEQIDNO772)(RNAi目标基因)NM_002529,人神经营养性酪氨酸激酶,受体,1型(Homosapiensneurotrophictyrosinekinase,receptor,type1)(NTRK1)(目标序列)NM_002529-2091,gcatcctgtaccgtaagtt(SEQIDNO773)NM_002529-345,ggctcagtcgcctgaatct(SEQIDNO774)NM_002529-347,ctcagtcgcctgaatctct(SEQIDNO775)NM_002529-953,ggctccgtgctcaatgaga(SEQIDNO776)NM_002529-1987,ggtcaagattggtgatttt(SEQIDNO777)(RNAi目标基因)NM_006180,人神经营养性酪氨酸激酶,受体,2型(NTRK2)(目标序列)NM_006180-358,caattttacccgaaacaaa(SEQIDNO778)NM_006180-1642,catcaagcgacataacatt(SEQIDNO779)NM_006180-663,gtgatccggttcctaatat(SEQIDNO780)NM_006180-665,gatccggttcctaatatgt(SEQIDNO781)NM_006180-792,cttgtgtggcggaaaatct(SEQIDNO782)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_006180-562,cctgcagatacccaattgt(SEQIDNO783)NM_006180-898,ctggtgcattccattcact(SEQIDNO784)NM_006180-735,cacagggctccttaaggat(SEQIDNO785)(RNAi目标基因)NM_000208,人胰岛素受体(Homosapiensinsulinreceptor)(INSR)(目标序列)NM_000208-2562,gccctgtgacgcatgaaat(SEQIDNO786)NM_00208-2565,ctgtgacgcatgaaatctt(SEQIDNO787)NM_000208-3492,gcatggtcgcccatgattt(SEQIDNO788)NM_000208-3493,catggtcgcccatgatttt(SEQIDNO789)NM_000208-329,ggatcacgactgttcttta(SEQIDNO790)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000208-2911,gattggaagtatttatcta(SEQIDNO791)NM_000208-902,caccaatacgtcattcaca(SEQIDNO792)NM_000208-1514,cggacatcttttgacaaga(SEQIDNO793)(RNAi目标基因)NM_000323,人ret原癌基因(多内分泌肿瘤和甲状腺髓样癌1,Hirschsprung病)(Homosapiensretproto-oncogene(multipleendocrineneoplasiaandmedullarythyroidcarcinoma1,Hirschsprungdisease))(RET)(目标序列)NM_000323-2679,gcttgtcccgagatgttta(SEQIDNO794)NM_000323-3066,catctgactccctgattta(SEQIDNO795)NM_000323-3069,ctgactccctgatttatga(SEQIDNO796)NM_000323-2680,cttgtcccgagatgtttat(SEQIDNO797)NM_000323-2728,gggtcggattccagttaaa(SEQIDNO798)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000323-3159,ccacatggattgaaaacaa(SEQIDNO799)NM_000323-3156,cttccacatggattgaaaa(SEQIDNO800)NM_000323-3155,ccttccacatggattgaaa(SEQIDNO801)(RNAi目标基因)NM_006293,人TYRO3蛋白酪氨酸激酶(HomosapiensTYRO3proteintyrosinekinase)(TYRO3)(目标序列)NM_006293-1494,gcatcagcgatgaactaaa(SEQIDNO802)NM_006293-2207,gaaaacgctgagatttaca(SEQIDNO803)NM_006293-2394,gccaggaccccttatacat(SEQIDNO804)NM_006293-2399,gaccccttatacatcaaca(SEQIDNO805)NM_006293-1493,ggcatcagcgatgaactaa(SEQIDNO806)(RNAi目标基因)NM_82925,人fms-相关的酪氨酸激酶(Homosapiensfms-relatedtyrosinekinase)4(FLT4)(目标序列)NM_182925-758,gtgtgggctgagtttaact(SEQIDNO807)NM_82925-756,ccgtgtgggctgagtttaa(SEQIDNO808)NM_82925-1217,ggcctgaggcgcaacatca(SEQIDNO809)NM_82925-1827,gcaagaacgtgcatctgtt(SEQIDNO810)NM_182925-908,gacctgggctcgtatgtgt(SEQIDNO811)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_182925-2033,cggctcacgcagaacttga(SEQIDNO812)NM_182925-330,gctactacaagtacatcaa(SEQIDNO813)(RNAi目标基因)NM_004119,人fms-相关的酪氨酸激酶3(FLT3)(目标序列)NM_004119-1569,gtgagacgatccttttaaa(SEQIDNO814)NM_004119-2490,gattggctcgagatatcat(SEQIDNO815)NM_004119-1571,gagacgatccttttaaact(SEQIDNO816)NM_004119-32,ccgctgctcgttgtttttt(SEQIDNO817)NM_004119-730,gttcacaatagatctaaat(SEQIDNO818)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_004119-92,gtgatcaagtgtgttttaa(SEQIDNO819)NM_004119-1483,ggtgtcgagcagtactcta(SEQIDNO820)NM_004119-1456,ggctaacagaaaagtgttt(SEQIDNO821)(RNAi目标基因)NM_002253,人激酶插入结构域受体(Homosapienskinaseinsertdomainreceptor)(III型受体酪氨酸激酶)(KDR)(目标序列)NM_002253-617,gaaagttaccagtctatta(SEQIDNO822)NM_002253-865,gagcaccttaactatagat(SEQIDNO823)NM_002253-2020,gaatcagacgacaagtatt(SEQIDNO824)NM_002253-815,gtaaaccgagacctaaaaa(SEQIDNO825)NM_002253-2586,ggacagtagcagtcaaaat(SEQIDNO826)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002253-3032,gtggctaagggcatggagt(SEQIDNO827)NM_002253-3627,ccaaattccattatgacaa(SEQIDNO828)NM_002253-3626,cccaaattccattatgaca(SEQIDNO829)(RNAi目标基因)NM_002609,人血小板来源的生长因子受体,β多肽(Homosapiensplatelet-derivedgrowthfactorreceptor,betapolypeptide)(PDGFRB)(目标序列)NM_002609-961,ggtgggcacactacaattt(SEQIDNO830)NM_002609-2881,gttgggcgaaggttacaaa(SEQIDNO831)NM_002609-409,ctttctcacggaaataact(SEQIDNO832)NM_002609-278,gacacgggagaatactttt(SEQIDNO833)NM_002609-3048,gtgacaacgactatatcat(SEQIDNO834)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_002609-633,catccatcaacgtctctgt(SEQIDNO835)NM_002609-2784,cctccgacgagatctatga(SEQIDNO836)(RNAi目标基因)NM_005433,人v-yes-1Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源物1(Homosapiensv-yes-1Yamaguchisarcomaviraloncogenehomolog1)(YES1)(目标序列)NM_005433-525,gaaatcaacgaggtatttt(SEQIDNO837)NM_005433-670,cacaaccagagcacaattt(SEQIDNO838)NM_005433-1333,gtatggtcggtttacaata(SEQIDNO839)NM_005433-1331,ctgtatggtcggtttacaa(SEQIDNO840)NM_005433-416,ggttatatcccgagcaatt(SEQIDNO841)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_005433-953,caagaagctcagataatga(SEQIDNO842)NM_005433-1,gggctgcattaaaagtaaa(SEQIDNO843)NM_005433-4,ctgcattaaaagtaaagaa(SEQIDNO844)(RNAi目标基因)NM_002005,人猫肉瘤癌基因(Homosapiensfelinesarcomaoncogene)(FES)(目标序列)NM_002005-1696,gattggacgggggaacttt(SEQIDNO845)NM_002005-2181,cacctgaggcccttaacta(SEQIDNO846)NM_002005-1553,ggctttcctagcattcctt(SEQIDNO847)NM_002005-683,gaatacctggagattagca(SEQIDNO848)NM_002005-74,ctactggagggcatgagaa(SEQIDNO849)(RNAi目标基因)NM_000633,人B-细胞CLL/淋巴瘤2(BCL2)(目标序列)NM_000633-43,gatgaagtacatccattat(SEQIDNO850)NM_000633-41,gtgatgaagtacatccatt(SEQIDNO851)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_000633-452,gagttcggtggggtcatgt(SEQIDNO852)NM_000633-454,gttcggtggggtcatgtgt(SEQIDNO853)NM_000633-525,ggatgactgagtacctgaa(SEQIDNO854)(RNAi目标基因)NM_001167,人杆状病毒IAP重复-含有4(HomosapiensbaculoviralIAPrepeat-containing4)(BIRC4)(目标序列)NM_001167-302,gccacgcagtctacaaatt(SEQIDNO855)NM_001167-794,gaagcacggatctttactt(SEQIDNO856)NM_001167-485,gaagaagctagattaaagt(SEQIDNO857)NM_001167-402,cacatgcagactatctttt(SEQIDNO858)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_001167-71,gaagagtttaatagattaa(SEQIDNO859)NM_001167-68,gtagaagagtttaatagat(SEQIDNO860)NM_001167-1354,ctgtatggatagaaatatt(SEQIDNO861)(RNAi目标基因)NM_139317,人杆状病毒IAP重复-含有7(livin)(BIRC7)(目标序列)NM_139317-458,ctgctccggtcaaaaggaa(SEQIDNO862)NM_139317-457,cctgctccggtcaaaagga(SEQIDNO863)NM_139317-743,gagaggacgtgcaaggtgt(SEQIDNO864)NM_139317-774,ccgtgtccatcgtctttgt(SEQIDNO865)NM_139317-417,cctggacggagcatgccaa(SEQIDNO866)(RNAi目标基因)NM_005036,人过氧化物酶体增生性活化的受体,α(Homosapiensperoxisomeproliferativeactivatedreceptor,alpha)(PPARA)(目标序列)NM_005036-922,gctaaaatacggagtttat(SEQIDNO867)NM_005036-1243,ccacccggacgatatcttt(SEQIDNO868)NM_005036-711,cttttgtcatacatgatat(SEQIDNO869)NM_005036-498,cacacaacgcgattcgttt(SEQIDNO870)NM_005036-988,gctggtagcgtatggaaat(SEQIDNO871)(RNAi目标基因)NM_138712,人过氧化物酶体增生性活化的受体,γ(PPARG)(目标序列)NM_138712-953,ggagtccacgagatcattt(SEQIDNO872)NM_138712-304,ctccctcatggcaattgaa(SEQIDNO873)NM_138712-954,gagtccacgagatcattta(SEQIDNO874)NM_138712-445,ctgtcggatccacaaaaaa(SEQIDNO875)NM_138712-409,cagattgaagcttatctat(SEQIDNO876)(对鼠的同源基因有效的目标序列)NM_138712-239,gcatctccaccttattatt(SEQIDNO877)NM_138712-688,ggcgagggcgatcttgaca(SEQIDNO878)NM_138712-664,gtccttcccgctgaccaaa(SEQIDNO879)(RNAi目标基因)NM_004421,人凌乱的,dsh同源物1(Homosapiensdishevelled,dshhomolog1)(果蝇(Drosophila))(DVL1)(目标序列)NM_004421-1173,ccgtcgtccgggtcatgca(SEQIDNO880)(RNAi目标基因)NM_004422,人凌乱的,dsh同源物2(Drosophila)(DVL2)(目标序列)NM_004422-1253,gtccatacggacatggcat(SEQIDNO881)(RNAi目标基因)NM_004423,人凌乱的,dsh同源物3(果蝇)(DVL3)(目标序列)NM_004423-1197,gcctagacgacttccactt(SEQIDNO882)(RNAi目标基因)NC_001802,人免疫缺陷病毒1,完整基因组(Humanimmunodeficiencyvirus1,completegenome)。(目标序列)NC_001802-8242,ggacagatagggttataga(SEQIDNO883)NC_001802-340,gcgagagcgtcagtattaa(SEQIDNO884)NC_001802-1222,gtagaccggttctataaaa(SEQIDNO885)NC_001802-1818,cgacccctcgtcacaataa(SEQIDNO886)NC_001802-4973,gccctaggtgtgaatatca(SEQIDNO887)NC_001802-5224,gcttagggcaacatatcta(SEQIDNO888)NC_001802-550,gaagaacttagatcattat(SEQIDNO889)NC01802-1777,gaactgtatcctttaactt(SEQIDNO890)NC01802-3244,gaaagactcctaaatttaa(SEQIDNO891)NC01802-5225,cttagggcaacatatctat(SEQIDNO892)发明效果根据本发明,可以高概率地获得实际显示RNAi效果的siRNA,因此,在制备新的siRNA的时候,大幅降低了由于试验者经验等原因在需要确认实际合成的siRNA是否具有RNAi效果时反复试验和试验错误造成的劳动,也即,本发明极其适于新序列siRNA的搜索。进一步,根据本发明,能够在短时间得到多种希望的siRNA,同时因为减低了没有必要的、用于试行错误的实际制作siRNA的数量,RNA干扰试验中的成本也大幅下降。另外,本发明在大幅简化有关利用RNAi效果的所有试验、制作等的方法的同时,也大幅提高了方法本身的确定性。本发明在以哺乳类高等动物为对象进行RNA干扰时特别有效。产业上的利用可能性如上所述,本发明涉及RNA干扰,更详细地说,涉及提高RNA干扰的试验、制作效率以及能够产生RNA干扰的多核苷酸的序列设计方法。序列表<110>生物智囊团株式会社(BIO-THINKTANKCO.,LTD)<120>RNA干扰的目标碱基序列的搜索方法,导致RNA干扰的多核苷酸的碱基序列的设计方法,双链多核苷酸的制备方法,抑制基因表达的方法,碱基序列处理装置,操作碱基序列处理方法的计算机程序,记录介质,以及碱基序列处理系统<130>PC/B-18-1<140>PCT/JP2003/014893<141>2003-11-21<150>JP2002-340053<151>2002-11-22<160>892<210>1<211>37<212>DNA<213>人工<220><223>包含NheI位点,EcoRI位点和XhoI位点的低聚物<400>1gctagccaccatggaattcacgcgtctcgagtctaga37<210>2<211>18<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物T<400>2aggcactgggcaggtgtc18<210>3<211>24<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物T<400>3tgctcgaagcattaaccctcacta24<210>4<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物C<400>4atcaggatgatctggacgaag21<210>5<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物C<400>5ctcttcagcaatatcacgggt21<210>6<211>35<212>DNA<213>人工<220><223>目标序列VIM35<400>6gaattcgcaggatgttcggcggcccgggcctcgag35<210>7<211>35<212>DNA<213>人工<220><223>目标序列VIM812<400>7gaattcacgtacgtcagcaatatgaaagtctcgag35<210>8<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>siRNA作为评价对象;siVIM35<400>8aggauguucggcggcccgggc21<210>9<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>siRNA作为评价对象;siVIM812<400>9guacgucagcaauaugaaagu21<210>10<211>21<212>RNA<213>人工<220><223>对照siRNA;siControl<400>10cauucuauccgcuggaagaug21<210>11<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物VIM-F3-84<400>11gagctacgtgactacgtcca20<210>12<211>21<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物VIM-R3-274<400>12gttcttgaactcggtgttgat21<210>13<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物ACTB-F2-481<400>13cacactgtgcccatctacga20<210>14<211>20<212>DNA<213>人工<220><223>PCR引物ACTB-R2-664<400>14gccatctcttgctcgaagtc20<210>15<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>15gacgccaaaaacataaaga19<210>16<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>16gttggcagaagctatgaaa19<210>17<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>17gtgttgggcgcgttattta19<210>18<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>18ccgcgaacgacatttataa19<210>19<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>19ccaatcatccaaaaaatta19<210>20<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>20cctcccggttttaatgaat19<210>21<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>21gcatgccagagatcctatt19<210>22<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>22ccggatactgcgattttaa19<210>23<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>23ggttttggaatgtttacta19<210>24<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>24gatttcgagtcgtcttaat19<210>25<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>25gcactctgattgacaaata19<210>26<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>26caaatacgatttatctaat19<210>27<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>27gattatgtccggttatgta19<210>28<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>28ccgcctgaagtctctgatt19<210>29<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>29ctcgacgcaagaaaaatca19<210>30<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>30aacataaagaaaggcccgg19<210>31<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>31tatgccggtgttgggcgcg19<210>32<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA标序列<400>32agttgcagttgcgcccgcg19<210>33<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>33acgtgcaaaaaaagctccc19<210>34<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>萤火虫萤光素酶的siRNA目标序列<400>34ttctgattacacccgaggg19<210>35<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>35gggcgcggtcggtaaagtt19<210>36<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>36ggaattgccgtcttagata19<210>37<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>37gaatggtcgtactatcctt19<210>38<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>38ccaagtaatcgttaacaat19<210>39<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>39gcttggcgcatatattcta19<210>40<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>40cctttcgcgacttgataaa19<210>41<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>41gtgcgtactgctgcaatat19<210>42<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>42ctactcgcgtgttaaaaat19<210>43<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>43gcagacaacggtactatta19<210>44<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>44ccggtagcaacgacaatat19<210>45<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>45cgtagtcgcggtaattcaa19<210>46<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>SARS冠状病毒的siRNA目标序列<400>46gatcgagggtacagtgaat19<210>47<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>47gtagcaacgtggagttcat19<210>48<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>48ggtagcaacgtggagttca19<210>49<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>49caacgtggagttcatgtgt19<210>50<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>50ggtgaatgggagcaagatt19<210>51<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>51gcaagattggcccagacaa19<210>52<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR1的siRNA目标序列(NM_000604).<400>52gagttcatgtgtaaggtgt19<210>53<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>53gaggctacaaggtacgaaa19<210>54<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>54gctacaaggtacgaaacca19<210>55<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>55ctggagcctcattatggaa19<210>56<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>56gaaaaacgggaaggagttt19<210>57<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>57gcaggagcatcgcattgga19<210>58<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>58ccttcagtttagttgagga19<210>59<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR2的siRNA目标序列(NM_000141).<400>59cttcagtttagttgaggat19<210>60<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>F6FR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>60gacggcacaccctacgtta19<210>61<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>61cacaacctcgactactaca19<210>62<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>62gcacacacgacctgtacat19<210>63<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>63cctgcgtcgtggagaacaa19<210>64<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>64cacacgacctgtacatgat19<210>65<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>FGFR3的siRNA目标序列(NM_000142).<400>65gagttccactgcaaggtgt19<210>66<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目标序列(NM_004448).<400>66ggagacccgctgaacaata19<210>67<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目标序列(NM_004448).<400>67ccttcgacaacctctatta19<210>68<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目标序列(NM_004448).<400>68gggctggctccgatgtatt19<210>69<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目标序列(NM_004448).<400>69ggctggctccgatgtattt19<210>70<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB2的siRNA目标序列(NM_004448).<400>70ctggctccgatgtatttga19<210>71<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目标序列(NM_001982).<400>71gtgctgggcgtatctatat19<210>72<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目标序列(NM_001982).<400>72gctgggcgtatctatataa19<210>73<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目标序列(NM_001982).<400>73gcttgtcctgtcgaaatta19<210>74<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目标序列(NM_001982).<400>74cttgtcctgtcgaaattat19<210>75<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB3的siRNA目标序列(NM_001982).<400>75cattcgcccaacctttaaa19<210>76<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB4的siRNA目标序列(NM_005235).<400>76ggagaatttacgcattatt19<210>77<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>ERBB4的siRNA目标序列(NM_005235).<400>77gctcaacttcgtat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)<220><223>PPARA的siRNA目标序列(NM_005036).<400>867gctaaaatacggagtttat19<210>868<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目标序列(NM_005036).<400>868ccacccggacgatatcttt19<210>869<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目标序列(NM_005036).<400>869cttttgtcatacatgatat19<210>870<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目标序列(NM_005036).<400>870cacacaacgcgattcgttt19<210>871<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARA的siRNA目标序列(NM_005036).<400>871gctggtagcgtatggaaat19<210>872<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的MRNA目标序列(NM_138712).<400>872ggagtccacgagatcattt19<210>873<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>873ctccctcatggcaattgaa19<210>874<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>874gagtccacgagatcattta19<210>875<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>875ctgtcggatccacaaaaaa19<210>876<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>876cagattgaagcttatctat19<210>877<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>877gcatctccaccttattatt19<210>878<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>878ggcgagggcgatcttgaca19<210>879<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>PPARG的siRNA目标序列(NM_138712).<400>879gtccttcccgctgaccaaa19<210>880<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL1的siRNA目标序列(NM_004421).<400>880ccgtcgtccgggtcatgca19<210>881<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL2的siRNA目标序列(NM_004422).<400>881gtccatacggacatggcat19<210>882<211>19<212>DNA<213>人(Homosapiens)<220><223>DVL3的siRNA目标序列(NM_004423).<400>882gcctagacgacttccactt19<210>883<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>siRNA目标序列forHumanimmunodeficiencyvirus1.<400>883ggacagatagggttataga19<210>884<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>884gcgagagcgtcagtattaa19<210>885<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>885gtagaccggttctataaaa19<210>886<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>886cgacccctcgtcacaataa19<210>887<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>887gccctaggtgtgaatatca19<210>888<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>888gcttagggcaacatatcta19<210>889<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>889gaagaacttagatcattat19<210>890<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>890gaactgtatcctttaactt19<210>891<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>891gaaagactcctaaatttaa19<210>892<211>19<212>DNA<213>人工<220><223>人免疫缺陷病毒1的siRNA目标序列.<400>892cttagggcaacatatctat19权利要求1.一种搜索RNA干扰的目标碱基序列的方法,其从RNA干扰的目标基因碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的序列部位(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。2.权利要求1记载的搜索目标碱基序列的方法,其中在上述规则(c)中,7碱基中的至少3个或3个以上为从腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。3.权利要求1或2记载的搜索目标碱基序列的方法,其中在上述规则(d)中,碱基数为13-28。4.设计用于产生RNA干扰的多核苷酸碱基序列方法,其包括,在目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的碱基序列,并设计与搜索到的碱基序列相同的碱基序列(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。5.权利要求4记载的碱基序列设计方法,其中在上述规则(c)中,7碱基中的至少3个或3个以上为从腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。6.权利要求4或5记载的碱基序列设计方法,其中所设计的相同碱基序列的碱基数为13-28。7.权利要求4至6任意一项记载的碱基序列设计方法,其中经过设计,使得上述所设计的相同碱基序列中至少80%或80%以上的碱基与搜索到的碱基序列一致。8.权利要求4至7任意一项记载的碱基序列设计方法,其中搜索到的碱基序列的3’末端碱基和设计的碱基序列的3’末端碱基相同,而且,搜索到的碱基序列的5’末端碱基和设计的碱基序列的5’末端碱基相同。9.权利要求4至8任意一项记载的碱基序列设计方法,其中在多核苷酸的3’末端添加突出部。10.双链多核苷酸的制作方法,包括形成一条链,其在与规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,所述规定序列包含在目标基因的碱基序列中且符合下述规则(a)-(d);形成另一条链,其在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部;合成双链多核苷酸时各链的碱基数设计成15-30,(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。11.双链多核苷酸,通过以下方法合成从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)、碱基数为13-28的序列部位,形成两条链,其中一条链在与包含在目标基因碱基序列中且符合下述规则(a)-(d)的规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,另一条链在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部,且各链的碱基数设计成15-30,(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。12.基因表达抑制方法,包含搜索步骤,是从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)、碱基数为13-28的序列部位,和合成双链多核苷酸的步骤,所述双链中,一条链在与包含在目标基因碱基序列中且符合下述规则(a)-(d)的规定序列相同的碱基序列的3’末端设一突出部,另一条链在与上述规定序列相同的碱基序列的互补序列的3’末端设一突出部,各链的碱基数设计成15-30,和抑制目的基因表达的步骤,其把合成的双链多核苷酸添加至想要抑制目标基因表达的表达系统中(a)3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶,(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,(d)碱基数在能够产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。13.碱基序列处理装置,其特征是,具备部分碱基序列制作装置,其可取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并制作上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息形成部分碱基序列,和3’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息的3’末端的碱基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,和5’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息的5’末端的碱基是否是鸟嘌呤或胞嘧啶,和判定是否包含预定碱基的装置,其判定包含上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端7碱基的碱基序列信息是否富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基预定碱基,和规定序列选择装置,根据上述3’末端碱基判定装置、上述5’末端碱基判定装置、上述判定是否包含预定碱基的装置而判定的结果,从上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息中筛选上述目标基因中特异地产生RNA干扰的规定序列信息。14.权利要求13记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包括区域特异性碱基序列制作装置,其由上述碱基序列信息中目标基因编码区、或转录区相应部位制成具有预定碱基数的部分碱基序列信息。15.权利要求13或14记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包括共同碱基序列制作装置,其用于制作在源于不同生物的多个上述碱基序列信息间共有、且具有预定碱基数的上述部分碱基序列信息。16.权利要求13至15任意一项记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述富含的碱基序列信息是一种包含上述7碱基的碱基序列信息,所述7碱基中至少含有3个或3个由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选出的1或1种以上的碱基。17.权利要求13至16任意一项记载的碱基序列处理装置,其特征是上述预定的碱基数是13-28。18.权利要求13至17任意一项记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述部分碱基序列制作装置进一步包含含有突出部的碱基序列的制作装置,其制作含有突出部的上述部分碱基序列信息。19.权利要求13至17任意一项记载的碱基序列处理装置,其特征是,其还包括突出部添加装置,其在上述规定序列信息的至少一个末端添加上述突出部。20.权利要求18或19记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述突出部的碱基数为2。21.权利要求13至20任意一项记载的碱基序列处理装置,其特征是,其进一步包括,相同或类似碱基序列搜索装置,其从其它碱基序列信息中搜索与上述规定序列信息相同或类似的碱基序列信息,和无关基因靶标评价装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索装置搜索得到的相同或类似碱基序列信息,评价上述规定序列信息是否靶向与上述目标基因无关的基因。22.权利要求21记载的碱基序列处理装置,其特征是,上述无关基因靶标评价装置其进一步包括,总和计算装置,其根据由上述相同或类似碱基序列搜索方法搜索得到的相同或类似碱基序列信息中,与目标基因无关的基因的碱基序列信息的总数,以及与目标基因无关的基因的碱基序列信息所附带的相同或类似程度的数值,计算出表示相同或类似程度的数值的倒数的总和,和总和基准靶标评价装置,其根据由上述总和计算方法算出的总和评价上述规定序列信息是否靶向与目标基因无关的基因。23.一种在计算机上执行碱基序列处理方法的程序,其特征是,其碱基序列处理方法包含部分碱基序列制作步骤,其取得RNA干扰的目标基因的碱基序列信息,并制作在上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位的部分碱基序列信息,和3’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的3’末端碱基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,和5’末端碱基判定步骤,其判定上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息的5’末端碱基是否是鸟嘌呤或胞嘧啶,和判定是否包含预定碱基的步骤,其判定包含上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息3’末端7碱基的碱基序列信息是否富含由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,和规定序列选择步骤,根据上述3’末端碱基判定步骤、上述5’末端碱基判定步骤、上述包含预定碱基判定步骤的判定结果,从上述部分碱基序列制作步骤中制作得到的部分碱基序列信息中选择对目标基因特异地产生RNA干扰的规定序列信息。24.一种计算机可读取的记录介质,其特征是其记录权利要求23中记载的程序。25.一种碱基序列处理系统,其特征是,将处理RNA干扰的目标基因的碱基序列信息的碱基序列处理装置和客户机装置通过网络可通讯地连接,上述客户机装置具备碱基序列发送装置,其将上述目标基因的名称或上述碱基序列信息提交给上述碱基序列处理装置,和规定序列取得装置,其取得由上述碱基序列处理装置发送的、对上述目标基因特异地产生RNA干扰的规定序列信息,上述碱基序列处理装置具备部分碱基序列制作装置,其取得由上述客户机装置发送的对应上述目标基因名称的碱基序列信息或者由上述客户机装置发送的上述碱基序列信息,制作与上述碱基序列信息中具有预定碱基数的序列部位对应的部分碱基序列信息,和3’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端的碱基是否是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶,和5’末端碱基判定装置,其判定由上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息5’末端的碱基是否是鸟嘌呤或胞嘧啶,和判定是否包含预定碱基的装置,其判定包含上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息3’末端7碱基的上述碱基序列信息是否富含腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基,和规定序列选择装置,其根据上述3’末端碱基判定装置、上述5’末端碱基判定装置、上述判定是否包含预定碱基的装置而判定的结果,从上述部分碱基序列制作装置制作的部分碱基序列信息中筛选上述规定序列信息,和规定序列发送装置,将上述规定序列选择装置筛选的上述规定序列信息向上述客户机装置发送。全文摘要本发明从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的序列部位,根据搜索结果进行能够产生RNA干扰的小干扰RNA(siRNA)的设计、合成等。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)。(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。(d)碱基数在产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。文档编号C12M1/00GK1742086SQ200380109108公开日2006年3月1日申请日期2003年11月21日优先权日2002年11月22日发明者西乡薰,程久美子,内藤雄树申请人:生物智囊团株式会社
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