NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达的制作方法

文档序号:14827955发布日期:2018-06-30 09:14阅读:295来源:国知局

本发明涉及NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中的应用,具体为天然核糖核苷酸的用途技术领域。



背景技术:

垂体腺瘤(简称垂体瘤)是人类最常见的颅内肿瘤之一,约占颅内肿瘤的10%-15%。垂体瘤在组织学上属于良性肿瘤,但有些垂体瘤呈侵袭性生长,包绕或侵犯周围组织结构,该部分肿瘤手术难以彻底切除,是肿瘤复发的主要原因之一。根据垂体瘤的生物学行为可分为非侵袭性垂体瘤、侵袭性垂体瘤和垂体癌。侵袭性垂体瘤介于非侵袭性垂体瘤和垂体癌之间,其组织学形态属于良性,生物学特征却似恶性。侵袭性与非侵袭性垂体腺瘤的临床表现、预后均明显不同。侵袭性垂体腺瘤的坏死、卒中、囊变发生率明显高于非侵袭性垂体腺瘤。侵袭性生长使得外科手术难以做到全切肿瘤,而常用药物溴隐停、生长抑素对这类肿瘤的疗效较差;侵袭性生长同样限制了其对放疗的敏感性,且鞍区放疗容易导致正常垂体、下丘脑及视神经等重要结构的损伤。这些因素导致侵袭性垂体腺瘤术后复发率高,肿瘤残余组织增长快。显而易见,对侵袭性垂体瘤的治疗是神经外科领域和肿瘤治疗领域面临的巨大挑战。因此,寻找与垂体腺瘤侵袭性相关的分子标记对于及时治疗和改善预后至关重要。

NR4A2(Nur-related factor 1,核相关因子1)属于核受体家族中孤儿核受体亚家族。孤儿核受体亚家族与参与调控肿瘤细胞的凋亡、增殖与DNA损伤修复等。NR4A2已被证实能够抑制结直肠癌细胞,肺癌细胞的凋亡,促进细胞存活和增殖。此外,还参与调控肿瘤微环境中VEGF(血管生长因子)相关血管生成。

本发明利用实时定量PCR的方法,检测分析NR4A2基因与垂体腺瘤侵袭性有很好相关性,可用于制备垂体腺瘤辅助诊断或者预后判断制剂。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中的应用,NR4A2属于核受体家族中孤儿核受体亚家族,鉴别可能患有垂体腺瘤的对象或垂体腺瘤的侵袭性。

所述方法包括检测来自所述对象的垂体腺瘤组织样本中NR4A2的表达量量,其中较高量的NR4A2为所述对象垂体腺瘤侵袭性强,并与所述对象预后不良可能性增加有关。

本发明还提供NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中表达,所述的表达方法包含以下步骤:

步骤一、侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取;

步骤二、总RNA反转录cDNA;

步骤三、将cDRA进行定时定量PCR检测,反应结束后检测样品中NR4A2的PCR识别序列,然后与PCR产物序列结果进行对比可知NR4A2在垂体腺瘤组织中进行表达。

进一步优选,所述的步骤一中侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取方法是相同的,具体提取方法为:称取2克组织材料,加入250微升RNAiso Plus,手持电动器研磨后,转移至1.5毫升RNase-free的离心管中,12000转4℃离心10分钟,去上清200微升加入1.5毫升RNase-free的离心管中,加入1毫升RNAiso P lus新混匀后室温静置5分钟。加入200微升的氯仿,充分混匀后,室温静置3分钟,12000转4℃离心15分钟,取上清250ul,加入500微升异丙醇混匀后室温静置10分钟,12000转4℃离心10分钟。弃掉上清,加入75%乙醇,颠倒混匀后,7500转4℃离心5分钟,弃掉上清,室温静置5分钟,加入15-20微升Nuclease-Free water溶解。Nanodrop测算所得液体的OD值及浓度。

进一步优选,所述的步骤二中总RNA反转录cDNA的方法为:按照反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser说明,加入1微克RNA进行基因组DNA的去除,具体加入DNA酶、反应缓冲液及Nuclease-Free水补齐10微升反应体系,PCR仪42℃孵育2分钟。而后进行反转录,具体加入反转录所需的随机引物,缓冲液、反转录酶及Nuclease-Free水补齐20微升反应体系,PCR仪37℃孵育15分钟,85℃孵育30秒,4℃保温,将反转录产物1∶10稀释,在冰上制备qPCR混合物。

作为优选,所述的步骤三中将cDNA进行定时定量PCR检测反应条件如下:首先95℃下预变性30秒,然后95℃变性5秒,56℃退火30秒,72℃延伸30秒,40个循环,热融解阶段95℃下变性60秒,56℃下热融解30秒,95℃热融解30秒。

本发明的有益效果是:(1)提出了NR4A2基因的用途。(2)本发明的研究表明异常量的NR4A2为所述对象垂体腺瘤侵袭性强,并与所述对象预后不良可能性增加有关。(3)NR4A2基因在侵袭性垂体腺瘤与非侵袭性垂体腺瘤病人组织中表达量存在差异,因此NR4A2基因具有成为垂体腺瘤生物标志物的应用前景。

附图说明

图1为使用NR4A2筛查引物对垂体腺瘤患者组织样本表达量筛选结果图。

具体实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。下面结合具体实施方式对本发明进行进一步描述

1、实验材料,临床样品:19例垂体腺瘤(8例侵袭性垂体腺瘤,9例非侵袭性垂体腺瘤)组织样本有大连医科大学附属第二医院所提供。

试剂:NR4A2筛查引物由Invitrogen公司合成;RNAiso Plus(货号9109)购自Takara公司;

氯仿购自永大化学试剂(天津)有限公司;异丙醇购自永大化学试剂(天津)有限公司;

乙醇购自国药集团化学试剂有限公司;

反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(货号:RR047Q)购自Takara公司;

SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(货号:FP205-02)购自天根生化科技(北京)有限公司;

Nuclease-Free water(货号RT121)购自根生化科技(北京)有限公司。

2、实验方法,称取2克组织材料,加入250微升RNAiso Plus,手持电动器研磨后,转移至1.5毫升RNase-free的离心管中,12000转4℃离心10分钟,去上清200微升加入1.5毫升RNase-free的离心管中,加入1毫升RNAiso Plus新混匀后室温静置5分钟。加入200微升的氯仿,充分混匀后,室温静置3分钟,12000转4℃离心15分钟,取上清250ul,加入500微升异丙醇混匀后室温静置10分钟,12000转4℃离心10分钟。弃掉上清,加入75%乙醇,颠倒混匀后,7500转4℃离心5分钟,弃掉上清,室温静置5分钟,加入15-20微升Nuclease-Free water溶解。Nanodrop测算所得液体的OD值及浓度。

3、表达量筛查,按照反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit withgDNA Eraser说明,加入1微克RNA进行基因组DNA的去除,具体加入DNA酶、反应缓冲液及Nuclease-Free水补齐10微升反应体系,PCR仪42℃孵育2分钟。而后进行反转录,具体加入反转录所需的随机引物,缓冲液、反转录酶及Nuclease-Free水补齐20微升反应体系,PCR仪37℃孵育15分钟,85℃孵育30秒,4℃保温。

配置反应混合物

B.Real-Time PCR(SYRB Green法)

将反转录产物1∶10稀释,在冰上制备qPCR混合物:

将样品放入qPCR仪器中运行,程序如下

4、图1为使用NR4A2筛查引物对垂体腺瘤患者样品表达量筛查的结果图。实验结果表明NR4A2基因在侵袭性垂体腺瘤中的表达显著升高,平均表达量(Ct值)差-2.063,相当于侵袭性垂体腺瘤中NR4A2的表达量是非侵袭性垂体腺瘤中的4.18倍。如此大的表达差异给了NR4A2作为侵袭性垂体腺瘤生物标记物的应用前景。

尽管已经示出和描述了本发明的实施例,对于本领域的普通技术人员而言,可以理解在不脱离本发明的原理和精神的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型,本发明的范围由所附权利要求及其等同物限定。

序列表

<110> 大连医科大学附属第二医院

<120> NR4A2基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达

<141> 2018-01-04

<160> 2

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 3546

<212> DNA

<213> 人类(homo sapiens)

<400> 1

gctgacgcgc gctgacgcgc ggagacttta ggtgcatgtt ggcagcggca gcgcaagcca 60

cataaacaaa ggcacattgg cggccagggc cagtccgccc ggcggctcgc gcacggctcc 120

gcggtccctt ttgcctgtcc agccggccgc ctgtccctgc tccctccctc cgtgaggtgt 180

ccgggttccc ttcgcccagc tctcccaccc ctacccgacc ccggcgcccg ggctcccaga 240

gggaactgca cttcggcaga gttgaatgaa tgaagagaga cgcggagaac tcctaaggag 300

gagattggac aggctggact ccccattgct tttctaaaaa tcttggaaac tttgtccttc 360

attgaattac gacactgtcc acctttaatt tcctcgaaaa cgcctgtaac tcggctgaag 420

ccatgccttg tgttcaggcg cagtatgggt cctcgcctca aggagccagc cccgcttctc 480

agagctacag ttaccactct tcgggagaat acagctccga tttcttaact ccagagtttg 540

tcaagtttag catggacctc accaacactg aaatcactgc caccacttct ctccccagct 600

tcagtacctt tatggacaac tacagcacag gctacgacgt caagccacct tgcttgtacc 660

aaatgcccct gtccggacag cagtcctcca ttaaggtaga agacattcag atgcacaact 720

accagcaaca cagccacctg cccccccagt ctgaggagat gatgccgcac tccgggtcgg 780

tttactacaa gccctcctcg cccccgacgc ccaccacccc gggcttccag gtgcagcaca 840

gccccatgtg ggacgacccg ggatctctcc acaacttcca ccagaactac gtggccacta 900

cgcacatgat cgagcagagg aaaacgccag tctcccgcct ctccctcttc tcctttaagc 960

aatcgccccc tggcaccccg gtgtctagtt gccagatgcg cttcgacggg cccctgcacg 1020

tccccatgaa cccggagccc gccggcagcc accacgtggt ggacgggcag accttcgctg 1080

tgcccaaccc cattcgcaag cccgcgtcca tgggcttccc gggcctgcag atcggccacg 1140

cgtctcagct gctcgacacg caggtgccct caccgccgtc gcggggctcc ccctccaacg 1200

aggggctgtg cgctgtgtgt ggggacaacg cggcctgcca acactacggc gtgcgcacct 1260

gtgagggctg caaaggcttc tttaagcgca cagtgcaaaa aaatgcaaaa tacgtgtgtt 1320

tagcaaataa aaactgccca gtggacaagc gtcgccggaa tcgctgtcag tactgccgat 1380

ttcagaagtg cctggctgtt gggatggtca aagaagtggt tcgcacagac agtttaaaag 1440

gccggagagg tcgtttgccc tcgaaaccga agagcccaca ggagccctct cccccttcgc 1500

ccccggtgag tctgatcagt gccctcgtca gggcccatgt cgactccaac ccggctatga 1560

ccagcctgga ctattccagg ttccaggcga accctgacta tcaaatgagt ggagatgaca 1620

cccagcatat ccagcaattc tatgatctcc tgactggctc catggagatc atccggggct 1680

gggcagagaa gatccctggc ttcgcagacc tgcccaaagc cgaccaagac ctgctttttg 1740

aatcagcttt cttagaactg tttgtccttc gattagcata caggtccaac ccagtggagg 1800

gtaaactcat cttttgcaat ggggtggtct tgcacaggtt gcaatgcgtt cgtggctttg 1860

gggaatggat tgattccatt gttgaattct cctccaactt gcagaatatg aacatcgaca 1920

tttctgcctt ctcctgcatt gctgccctgg ctatggtcac agagagacac gggctcaagg 1980

aacccaagag agtggaagaa ctgcaaaaca agattgtaaa ttgtctcaaa gaccacgtga 2040

ctttcaacaa tggggggttg aaccgcccca attatttgtc caaactgttg gggaagctcc 2100

cagaacttcg taccctttgc acacaggggc tacagcgcat tttctacctg aaattggaag 2160

acttggtgcc accgccagca ataattgaca aacttttcct ggacacttta cctttctaag 2220

acctcctccc aagcacttca aaggaactgg aatgataatg gaaactgtca agagggggca 2280

agtcacatgg gcagagatag ccgtgtgagc agtctcagct caagctgccc cccatttctg 2340

taaccctcct agcccccttg atccctaaag aaaacaaaca aacaaacaaa aactgttgct 2400

atttcctaac ctgcaggcag aacctgaaag ggcattttgg ctccggggca tcctggattt 2460

agaacatgga ctacacacaa tacagtggta taaacttttt attctcagtt taaaaatcag 2520

tttgttgttc agaagaaaga ttgctataat gtataatggg aaatgtttgg ccatgcttgg 2580

ttgttgcagt tcagacaaat gtaacacaca cacacataca cacacacaca cacacacaga 2640

gacacatctt aaggggaccc acaagtattg ccctttaaca agacttcaaa gttttctgct 2700

gtaaagaaag ctgtaatata tagtaaaact aaatgttgcg tgggtggcat gagttgaaga 2760

aggcaaaggc ttgtaaattt acccaatgca gtttggcttt ttaaattatt ttgtgcctat 2820

ttatgaataa atattacaaa ttctaaaaga taagtgtgtt tgcaaaaaaa aagaaaataa 2880

atacataaaa aagggacaag catgttgatt ctaggttgaa aatgttatag gcacttgcta 2940

cttcagtaat gtctatatta tataaatagt atttcagaca ctatgtagtc tgttagattt 3000

tataaagatt ggtagttatc tgagcttaaa cattttctca attgtaaaat aggtgggcac 3060

aagtattaca catcagaaaa tcctgacaaa agggacacat agtgtttgta acaccgtcca 3120

acattccttg tttgtaagtg ttgtatgtac cgttgatgtt gataaaaaga aagtttatat 3180

cttgattatt ttgttgtcta aagctaaaca aaacttgcat gcagcagctt ttgactgttt 3240

ccagagtgct tataatatac ataactccct ggaaataact gagcactttg aatttttttt 3300

atgtctaaaa ttgtcagtta atttattatt ttgtttgagt aagaatttta atattgccat 3360

attctgtagt atttttcttt gtatatttct agtatggcac atgatatgag tcactgcctt 3420

tttttctatg gtgtatgaca gttagagatg ctgatttttt ttctgataaa ttctttcttt 3480

gagaaagaca attttaatgt ttacaacaat aaaccatgta aatgaacaga aaaaaaaaaa 3540

aaaaaa 3546

<210> 2

<211> 164

<212> DNA

<213> 人类(homo sapiens)

<400> 2

acagcgcatt ttctacctga aattggaaga cttggtgcca ccgccagcaa taattgacaa 60

acttttcctg gacactttac ctttctaaga cctcctccca agcacttcaa aggaactgga 120

atgataatgg aaactgtcaa gagggggcaa gtcacatggg caga 164

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