单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用

文档序号:8442341阅读:341来源:国知局
单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物医学领域中单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应 用。
【背景技术】
[0002] 垂体腺瘤(Pituitary adenomas)是人体最常见的神经内分泌性肿瘤,也是最常 见的脑肿瘤之一。功能性垂体腺瘤会异常分泌激素,导致患者出现不孕不育、肢端肥大、 Cushing综合症、甲亢等显著的内分泌紊乱症状,进而严重损害心肝肾等重要脏器功能。垂 体腺瘤发病隐匿,生长缓慢,当患者出现临床症状前往就诊时,肿瘤往往已体积巨大,或呈 侵袭性生长,压迫邻近重要解剖结构,导致患者出现垂体功能低下、双眼视力下降和颅神经 麻痹等神经功能缺失症状,甚至发展为不可逆神经功能损害,严重影响患者的生活质量,甚 至危及生命。
[0003]目前垂体腺瘤的临床治疗以手术切除为主,药物和立体定向放疗为辅。但该病并 非是一种简单的神经外科疾病,而是一种牵涉内分泌科、妇产科、男性科、眼科、放疗科、影 像医学科等多学科的复杂疾病,在临床诊疗中仍存在诸多的瓶颈难题。垂体腺瘤的发病机 制不清,早期诊断困难,如能早期诊断出垂体腺瘤,并对其采取分层的二级预防及诊治,对 于及时终止因肿瘤异常分泌激素对患者心肝肾等重要脏器产生的严重功能损害、防止因肿 瘤持续隐匿生长压迫所致的不可逆神经功能损害以及降低治疗风险均有着非常重要的临 床意义。目前临床上用于确诊垂体腺瘤的核磁共振检查(MRI),不仅费用较昂贵,难以用于 临床病例的大规模筛检,且由于受到分辨率的限制,难以发现直径〈〇. 5cm的微腺瘤。故目 前急需简便、价廉的垂体腺瘤早期诊断工具和方法。

【发明内容】

[0004] 本发明所要解决的技术问题是如何筛查垂体腺瘤患者。
[0005] 为解决上述技术问题,本发明首先提供了下述Al)-A6)中的任一用途:
[0006] A1)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备 筛查垂体腺瘤患者产品中的应用;
[0007] A2)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备 检测垂体腺瘤易感性产品中的应用;
[0008] A3)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备 检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用;
[0009] A4)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备 鉴定或辅助鉴定与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用;
[0010] A5)人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型在制备筛查垂体腺 瘤患者产品中的应用;
[0011] A6)人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型在制备检测垂体腺 瘤易感性产品中的应用。
[0012] rs2359536是人染色体10pl2. 31上的一个二等位多态性的SNP位点,该变异 是转换(A/G,在其互补链上则为T/C)。所述rs2359536基因型是AA、AG或GG。所述AA 是rs2359536位点为A的纯合型,所述GG是rs2359536位点为G的纯合型,所述AG是 rs2359536位点为A和G的杂合型。所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基 因)或基因型具体可为检测rs2359536的核苷酸种类。
[0013] 上述用途中,所述产品包括扩增包括rs2359536在内的基因组DNA片段的PCR引 物和/或单碱基延伸引物;
[0014]和 / 或,
[0015] 所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为所 述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。
[0016] 上述用途中,所述GG和所述AG基因型的个体在垂体腺瘤患者群体中的比例分别 高于对应的基因型在正常健康人群体中的比例。
[0017] 上述用途中,所述垂体腺瘤具体为中国人群垂体腺瘤。
[0018] 为解决上述技术问题,本发明还提供了含有检测人基因组中rs2359536的多态性 (即等位基因)或基因型的物质的产品。
[0019] 本发明所提供的含有检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因 型的物质的产品,为a) -d)中的任一种产品:
[0020] a)检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的产品;
[0021]b)鉴定或辅助鉴定与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的 广品;
[0022] c)筛查垂体腺瘤患者产品;
[0023]d)检测垂体腺瘤易感性产品。
[0024] 上述产品中,所述产品包括扩增包括所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物;
[0025]和 / 或,
[0026] 所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为所 述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。
[0027] 上述产品中,所述GG和所述AG基因型的个体在垂体腺瘤患者群体中的比例分别 高于对应的基因型在正常健康人群体中的比例。
[0028] 在本发明的实施例中,所述垂体腺瘤具体为中国人群垂体腺瘤。
[0029] 本发明中,所述扩增包括rs2359536在内的基因组DNA片段的PCR引物对可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的单链DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的单链DNA组成;所述 单碱基延伸引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No. 7所示。
[0030] 实验证明,rs2359536的风险等位基因为G,该等位基因在病例组(由垂体腺瘤 患者组成)中的比例比该等位基因在对照组(由正常健康人组成)中的比例高2. 76%。 rs2359536的P值是2. 25 X KT1。,且rs2359536的相对危险度是1. 44,说明rs2359536是与 垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性。rs2359536的三个基因型中,GG基因型和AG基因型的个 体在病例组垂体腺瘤患者群体中的比例分别高于对应基因型的个体在对照组正常健康人 群体中的比例;AA基因型的个体在病例组垂体腺瘤患者群体中的比例低于该基因型的个 体在对照组正常健康人群体中的比例。
[0031] 在实际应用中,可将检测rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质与 其它物质(如检测其它的与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起 制备筛查垂体腺
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