微孔中通过DNA纳米技术进行单分子检测或定量的制作方法

文档序号:21697901发布日期:2020-07-31 22:49阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种检测靶标结构体的方法,包括:

p1)将包括具有靶标结构体的宿主体的一组宿主体引入微孔阵列中,使得恰好一个宿主体存在于至少一个微孔中;

p2)将至少两种3ddna纳米结构体引入所述至少一个微孔中,其中每种所述3ddna纳米结构体包含一种或多种向内布置的荧光染料分子;

a)在所述至少一个微孔中形成识别结构体,包括:

(i)所述靶标结构体,和

(ii)所述至少两种3ddna纳米结构体,其中每种所述3ddna纳米结构体特异性结合于所述靶标结构体,并且其中所述3ddna纳米结构体结合于所述靶标结构体的成对的不同区域;

b)通过测量至少一种荧光信号检测所述靶标结构体,

其中,选择所述3ddna纳米结构体和荧光测量的参数,使得a)中形成的所述识别结构体的至少一种测量的荧光信号与至少两种分离的3ddna纳米结构体在它们未结合于相应的识别结构体中时的每一种的所述荧光信号可区分,其中所述识别结构体结合于第一表面,优选所述至少一个微孔的底部。

2.如权利要求1所述的方法,其中,所述宿主体是细胞、病毒、外体、囊泡和/或液滴。

3.如权利要求1或2所述的方法,其中,所述靶标结构体存在于宿主体中,其中所述方法还包括:

c)破坏所述宿主体,优选通过用破坏缓冲液进行液体交换,从而将所述靶标结构体从所述宿主体中释放。

4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,所述靶标结构体包含或者是多核苷酸,优选部分单链的多核苷酸,优选单链的多核苷酸,并且特别优选mrna。

5.一种用于荧光显微术的微孔阵列,其包括多个微孔,其中,每个微孔包括底部和周壁,其中所述底部适合于荧光显微术,并且其中每个所述微孔具有优选开口的顶侧,

其中,所述微孔阵列还包括:

第一层,其形成所述微孔的所述底部,其中所述第一层适合于荧光显微术并且优选是盖玻片;

第二层,其施加在所述第一层上,其中所述第二层形成所述微孔的所述壁。

6.如权利要求5所述的微孔阵列,其中,一种或多种载体接头结合于至少一个所述微孔的所述底部。

7.如权利要求5至6中任一项所述的微孔阵列,其中,所述第二层包含su-8,优选peg-da,特别优选pdms,更优选cytop,并且特别优选液体玻璃和/或由其组成。

8.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列是权利要求5至7中任一项所述的微孔阵列,并且其中所述第一表面是所述至少一个微孔的所述底部,其中优选所述靶标结构体通过与所述靶标结构体特异性结合的载体接头的介导结合于和/或将结合于所述微孔的所述底部。

9.如权利要求8所述的方法,还包括:

f)通过将油层施加于所述第二层来封闭所述微孔阵列的所述顶侧;

其中,油可选地包含脂质并且所述方法可选地还包括:

g)通过在所述微孔阵列上倾倒水溶液来排出所述油,其中所述水溶液可选地包含膜通道。

10.如权利要求1至4或8至9中任一项所述的方法,其中,所述方法另外还适合于检测彼此不同的一种或多种其他靶标结构体,其中不同的靶标结构体是成对不同的,

其中,对于每种所述靶标结构体,步骤p1)中的宿主体的组包含具有相关靶标结构体的至少一个宿主体;

并且,其中所述方法还包括:

c)对于每种所述彼此不同的一种或多种其他靶标结构体:

形成相应的已分配的识别结构体,其中每种其他识别结构体包含:

(i)相应的已分配的其他靶标结构体,和

(ii)至少两种3ddna纳米结构体,其中所述至少两种3ddna纳米结构体中的每种包含一种或多种向内布置的荧光染料分子,并且其中所述至少两种3ddna纳米结构体中的每种特异性结合于相应的其他靶标结构体,并且其中所述至少两种3ddna纳米结构体结合于相应的靶标结构体的成对的不同区域;

并且,其中步骤a)还包括:

d)通过测量所述至少一种荧光信号检测所述一种或多种其他靶标结构体,

其中,选择所有3ddna纳米结构体和所述荧光测量的参数,使得a)和c)中形成的所述识别结构体的所述至少一种测量的荧光信号与所有分离的3ddna纳米结构体在它们未结合于识别结构体之一中时的所述荧光信号可区分,并所有所形成的识别结构体的所述测量的荧光信号成对彼此不同,其中每种所述不同的靶标结构体可存在多次并且所述方法可包括对一种或多种所述不同的靶标结构体的多重检测。

11.如权利要求8至10中任一项所述的方法,其中,在步骤p1)中,通过将一定体积的含有所述宿主体的液体施加在所述微孔阵列的开口侧上,并使所述宿主体由于重力影响以一定时间沉入所述微孔的所述底部,从而将所述宿主体分离。

12.如权利要求1至4或8至11中任一项所述的方法,其中,所述方法还包括:

aa)在所述至少一个微孔中制备载体基质;和可选地

bb)使载体接头附着于所述载体基质。

13.如权利要求1至4或9至12中任一项所述的方法,

h)在步骤p1)和a)之间或a)和b)之间,从所述底部上去除所述微孔的所述周壁,优选所述第二层的所述周壁。

14.一种试剂盒,包括:

微孔阵列,优选权利要求5至7中任一项所述的微孔阵列;

至少两种3ddna纳米结构体,其中所述3ddna纳米结构体中的每种包含至少一种向内布置的荧光染料分子。

15.如权利要求14所述的试剂盒,其中,对于所述至少两种3ddna纳米结构体中的每种,所述至少一种向内布置的荧光染料分子至所述3ddna纳米结构体的边缘的距离是至少2nm,优选至少3nm,并且特别优选至少5nm,其中可选地至少一种所述3ddna纳米结构体包含至少2种向内布置的荧光染料分子,并且其中所述至少两种向内布置的荧光染料分子的成对距离是至少2nm,优选至少5nm,并且特别优选至少9nm。


技术总结
本发明涉及用于检测靶标结构体的方法和DNA纳米结构体。本发明具体涉及DNA纳米结构体,其通过巧妙地选择DNA纳米结构体的形状和固定在其上的标记物分子的位置,不依赖于多种这样的DNA纳米结构体的局部排列,确保了对标记物分子的数量和测量信号的优选线性依赖性。本发明还涉及在用于借助于多重方法优选同时定量多种靶标分子的方法中,使用所述DNA纳米结构体和其他纳米报告子,优选与接头组合以定量,特异性结合于靶标分子。本方法具体涉及单细胞分析。

技术研发人员:海因里希·格拉布迈尔;约翰内斯·贝内迪克特·韦尔施泰因
受保护的技术使用者:慕尼黑路德维希马克西米利安斯大学
技术研发日:2018.12.14
技术公布日:2020.07.31
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