DGAT1基因启动子区域变异位点及其在检测猪肉肌内脂肪含量上的应用

文档序号:31053559发布日期:2022-08-06 09:31阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种用于检测猪肌内脂肪含量的snp分子标记,其特征在于:该snp分子标记位于dgat1基因启动子区的转录起始密码子上游379bp处,该位点碱基是c或t。2.权利要求1所述的snp分子标记在检测猪肉肌内脂肪含量中的应用,其特征在于:当所述snp分子标记的基因型为tt型或ct型时,猪肉肌内脂肪含量高于cc型基因型。3.一种用于检测权利要求1所述snp分子标记的引物对,其特征在于:所述引物对的序列分别为:dgat1-3f:5
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ccacaacgcactaggcatttc-3’dgat1-3r:5
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gggcaccactacctcagatcc-3’。4.一种用于对权利要求1所述snp分子标记的c/t突变位点进行基因分型的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求3所述的引物对。5.权利要求3中所述的引物对,或权利要求4中所述的试剂盒在检测猪肉肌内脂肪含量中的应用,其特征在于:对所述snp分子标记的c/t突变位点进行基因分型,基因型为tt或ct的猪肉样品的肌内脂肪含量高于基因型为cc的猪肉样品的肌内脂肪含量。6.一种辅助选育猪高肌内脂肪性状遗传改良的方法,其特征在于:对权利要求1所述snp分子标记的c/t突变位点进行基因分型,基因型为tt或ct的猪肉样品的肌内脂肪含量高于基因型为cc的猪肉样品的肌内脂肪含量。7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:1)提取待检测猪肉样品的dna;2)采用权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒对步骤1)获得的dna进行pcr扩增,获得扩增片段;3)通过pcr-rflp-pvuⅱ方法对扩增片段进行酶切分型,不同基因型的酶切产物会呈现不同的条带数:cc基因型为134bp和581bp两个条带,ct基因型为134bp、581bp和715bp三个条带,tt基因型为715bp一个条带;4)当分型结果为tt型或ct型时,判断其猪肉样品的肌内脂肪含量高于cc型的猪肉样品肌内脂肪含量。8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:步骤2)中pcr扩增反应25μl体系:t3 mix 22μl、上下游引物各1μl、待检测dna 1μl;pcr反应程序:98℃,3min;98℃,10s;65℃,10s退火;72℃,10s;34个循环;72℃,3min。9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述pcr-rflp-pvuⅱ方法的反应体系为:待检测pcr扩增产物17μl、pvuⅱ酶1μl、tango buffer 2μl;反应条件为:37℃,1h。

技术总结
本发明属于分子生物学领域,公开了一种DGAT1基因启动子区变异位点及其在检测猪肉肌内脂肪含量上的应用。该SNP分子标记位于DGAT1基因启动子区的转录起始密码子上游379bp处,该位点碱基是C或T。根据该突变位点的基因型确定猪肉肌内脂肪含量情况。本发明在启动子区域筛选了一个与肌内脂肪含量相关的SNP位点,从而获得了与肌内脂肪含量相关的功能基因和分子遗传标记,通过优选该SNP分子标记的优势等位基因及对该位点的快速检测,能够为猪肉中肌内脂肪含量调控相关的SNP分子标记辅助育种提供参考依据,同时对猪肉品质改良具有重要意义。义。义。


技术研发人员:陈杰 赵金迪 韦伟 张立凡
受保护的技术使用者:南京农业大学
技术研发日:2022.04.02
技术公布日:2022/8/5
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