hsa_circ_0017469在制备结直肠癌早筛及预后评估的产品中的应用

文档序号:36644045发布日期:2024-01-06 23:28阅读:来源:国知局

技术特征:

1.检测hsa_circ_0017469的试剂在制备结直肠癌早筛或预后评估的产品中的应用,其特征在于,所述产品包括检测hsa_circ_0017469的试剂。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测hsa_circ_0017469的试剂包括qrt-pcr检测用试剂、northern blot检测用试剂、液滴数字pcr检测用试剂、crispr/cas13a-rpa检测用试剂、高通量测序技术检测用试剂、核酸杂交技术检测用试剂、基因芯片技术检测用试剂中的一种或多种。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述qrt-pcr检测用试剂包括序列为seqid no.1~2的引物。

4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述crispr/cas13a-rpa检测用试剂包括序列为seq id no.5~6的引物和序列为seq id no.7的crrna。

5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品还包括检测cea的试剂。

6.一种基于crispr/cas13a-rpa技术可视化检测hsa_circ_0017469的方法,其特征在于,采用的引物的序列为seq id no.5~6,采用的crrna为seq id no.7,反应完成后,置蓝光中观察。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,采用的反应体系包括ntp、crrna、cas 13a、rnase抑制剂、t7 rna聚合酶、引物、ssrna reporter、dna模板、mgoac、t4 uvsx重组酶、ssb和链置换dna聚合酶;优选包括如下含量的组分:2μl t4 uvsx(1mm)、3μl ssb(0.5mm)、2μlbsu(0.5mm)、3μl ntp(1mm)、2μl crrna(40nm)、1μl正向引物(10μm)、1μl反向引物(10μm)、2μl ssrna reporter(80nm)、1μl模板、4μl cas13a(80nm)、1μl rnase抑制剂(40u)、1μl t7rna聚合酶(30u)和2μl mgoac(0.1mm)。

8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,采用的反应程序为37℃15min。

9.一种结直肠癌早筛或预后评估的系统,其特征在于,包括:

10.根据权利要求9所述的系统,其特征在于,所述检测hsa_circ_0017469表达量的模块是基于qrt-pcr、northern blot、液滴数字pcr、crispr/cas13a-rpa、高通量测序技术、核酸杂交技术、基因芯片技术中的一种或多种构建获得。


技术总结
本发明提供了hsa_circ_0017469在制备结直肠癌早筛及预后评估的产品中的应用。本发明采用Arraystar CircRNA芯片对CRC癌和癌旁组织的CircRNA进行筛选、鉴定,并进一步扩大组织样本量及临床血浆样本进行验证,证明了hsa_circ_0017469在CRC患者癌组织中表达显著上升,可用于结直肠癌筛查及术后预后风险评估,并研制出可视化检测以及实时定量PCR检测hsa_circ_0017469的方法和产品,对结直肠癌筛查及术后预后风险评估提供了手段。

技术研发人员:汪骅,李敏,徐靖嵩
受保护的技术使用者:上海交通大学医学院附属仁济医院
技术研发日:
技术公布日:2024/1/5
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