一种ctDNA检测试剂盒及检测方法

文档序号:37587850发布日期:2024-04-18 12:17阅读:4来源:国知局
一种ctDNA检测试剂盒及检测方法

本发明属于生物检测,涉及一种ctdna检测试剂盒及检测方法。


背景技术:

1、近红外电化学发光(nir ecl)已成为一种强大的分析技术,因为它结合了近红外和ecl分析方法的优点,如具有良好的光稳定性,易于控制和零背景信号。尽管人们探索了各种近红外ecl发光团,如半导体量子点(qds)、金属纳米团簇和镧系金属有机骨架,但它们的广泛应用受到重金属、高成本、低效率和生物相容性差等问题的阻碍。因此,开发高效的近红外ecl发光体对于推进生物分析和传感性能仍然至关重要。

2、近来,有机纳米材料,例如有机聚合物和小分子纳米粒子,表现出独特的光学特性,卓越的生物相容性和低毒性等,使它们适用于生物传感和成像。目前,通过调控有机分子结构已经建立了各种放大技术以提高ecl效率(φecl),如增强吸电子基团、共振能量转移(ret)、双ret、聚集诱导发射(aie)和双分子内电子转移。值得注意的是,在光物理中,大多数有机体系都属于荧光范畴,而基于理论考虑,对荧光有机发射体φecl的增强通常受到自旋统计的约束。在电化学激发下,最低单重态(s1)产生激发态(1r*)的比例约为25%,三重态(t1)产生激发态(3r*)的比例约为75%。然而,只有1r*可以通过荧光通道进行辐射跃迁产生ecl。而占主导地位的激发三重态(3r*)则不能从t1跃迁到基态,因此不能产生ecl。相反,它会产生非辐射跃迁。因此,尽管特定的荧光有机发光体具有较高的光致发光量子产率(φpl),但其φecl仍然受到其固有荧光特性的限制。

3、热激活延迟荧光(tadf)在实现100%激子捕获辐射跃迁方面具有巨大的应用潜力,克服了自旋禁阻带来的限制。当s1和t1之间的能带间隙(δest)极低(约0.1ev)时,tadf可以产生,并可通过t1激子到s1激子的快速反向系间窜越(risc)来获得较高的发光效率,即可通过热激活产生延迟荧光(df)和即时荧光(pf)。tadf机制已经在有机发光二极管领域得到验证。近来,在水溶液中也对tadf型共反应剂ecl进行了探索,尽管在水溶液中实现tadf ecl方面取得了重大进展,但该技术仍处于早期阶段。到目前为止,据我们所知,通过引入tadf技术来优化近红外ecl检测的潜力仍未得到探索。


技术实现思路

1、有鉴于此,本发明的目的是提供一种ctdna检测试剂盒及检测方法,引入tadf技术来优化近红外ecl检测。

2、本发明提供的技术方案如下:

3、一种ctdna检测试剂盒,包括:用于靶标扩增的试剂,所述试剂包括第一阶段扩增试剂和第二阶段扩增试剂;所述第一阶段扩增试剂用于对靶标进行第一阶段扩增;所述第二阶段扩增试剂用于对第一阶段扩增的产物进行进一步扩增;所述第一阶段扩增试剂包括h1和exo iii;其中,h1为seq id no.1所示序列;所述第二阶段扩增试剂包括h2、dntp、dna聚合酶、cleaner g和mgcl2;其中,h2为seq id no.2所示序列;信号标记物tpa-dcpp nps,名称为7,1-双(4-(二苯基氨基)苯基)-2,3-双氰基吡嗪并菲纳米粒子;保护探针,所述保护探针为bhq3修饰的seq id no.3所示核酸序列,用于猝灭tpa-dcpp nps的ecl信号;硫代捕获探针,所述硫代捕获探针为巯基修饰的seq id no.4所示核酸序列,用于捕获所述保护探针;所述检测试剂盒用于ctdna的检测或辅助鉴定,所述检测或辅助鉴定以非疾病诊断为目的。

4、本发明还提供了一种不以疾病诊断和治疗为目的的ctdna检测方法,包括以下步骤:

5、s1.将h1、exo iii和含有靶标的溶液在37℃下共孵育50-80min,然后加热使exoiii失活,然后自然冷却至室温,得到含有primer的exo iii辅助反应体系;

6、s2.将所述exo iii辅助反应体系和h2加入到反应溶液中孵育1-3h,所述反应溶液中含有dntp、dna聚合酶、cleaner g和mgcl2,加热使dna聚合酶失活后自然冷却至室温,得到per产物;

7、s3.将硫代捕获探针溶液和保护探针溶液混合,37℃下孵育1h,形成双链捕获probe@protector探针;

8、s4.将信号标记物tpa-dcpp nps滴涂在玻碳电极上,得到tpa-dcpp nps/gce;

9、s5.在所述tpa-dcpp nps/gce上修饰au nps,得到au nps/tpa-dcpp nps/gce;

10、s6.将所述双链捕获probe@protector探针修饰在所述au nps/tpa-dcpp nps/gce上,在4℃下孵育过夜,得到probe@protector/au nps/tpa-dcpp nps/gce;

11、s7.室温下将mch作用于probe@protector/au nps/tpa-dcpp nps/gce,封闭非特异性活性位点;

12、s8.将得到的per产物与probe@protector/au nps/tpa-dcpp nps/gce孵育80-120min,在37℃下测定ecl信号。

13、进一步的,步骤s1中,h1、exo iii和含有靶标的溶液的体积比为10:5:10,其中,exoⅲ的浓度为1u/μl。

14、进一步的,步骤s2中,所述exo iii辅助反应体系、h2和反应溶液的体积比为5:5:20,所述反应溶液中,dna聚合酶的浓度为0.6u/μl。

15、进一步的,上述ctdna检测方法具体包括以下步骤:

16、步骤1、制备tpa-dcpp小分子,名称为7,1-双(4-(二苯基氨基)苯基)-2,3-双氰基吡嗪并菲,供体-共轭桥-受体-共轭桥-供体(d-π-a-π-d)结构;

17、步骤2、纳米沉淀法合成tpa-dcpp nps;所得产物呈现出球状,具有良好的分散性;tpa-dcpp nps具有d-π-a-π-d的结构,其具有优异的共反应剂型ecl。

18、步骤3、tadf增强的近红外电化学发光生物传感器的构建:

19、s1.构建exo iii辅助反应体系:将10μl h1(1μm)、5μl exo iii(1u/μl)和10μl不同浓度的靶标在37℃下共孵育60min,然后在80℃下加热10分钟使exo iii失活,然后自然冷却至室温。

20、s2.制备per产物:将5μl的exo iii辅助反应体系和5μl h2(10nm)加入到20μl的反应溶液中(0.6u/μl dna聚合酶,100nm dntp,100nm cleaner g,1×thermopol缓冲液,10mmmgcl2)孵育2h后,在80℃下热处理20min。

21、s3.将硫代捕获探针capture probe(1μm)和保护探针protector(1.5μm)在37℃下孵育1h,形成双链捕获探针(probe@protector)。

22、s4.用0.05μm al2o3粉将裸玻碳电极(gce)进行抛光打磨,然后在乙醇和二次水中连续超声处理5min。

23、s5.将步骤2中的tpa-dcpp nps(6μl)滴涂到清洗好的电极表面,然后用6μl aunps修饰。

24、s6.将双链捕获probe@protector探针(6μl)修饰在电极表面,通过au-s键进行核酸偶联,并在4℃下孵育过夜。

25、s7.室温下将巯基乙醇(mch,1μm,6μl)修饰到上述电极表面并孵育60min,用于封闭非特异性活性位点。

26、s8.将s2得到的per产物(10μl)与上述修饰的gce孵育100min,在37℃下测定ecl信号。

27、h1序列为:5’-atc tgt tgg act acg cca cta gct cca ac-3’

28、h2序列为:5’-atc tgt tgg amgmg gcc ttt tgg cmcmc tcc aac aga ttc caacag at-3’

29、capture probe序列为:5’-ttt ttt ttt tac gat ctg ttc cct ct-3’

30、protector序列为:5’-taa cca aca gat aga-3’

31、上述序列由生工生物工程(上海)股份有限公司合成并纯化。

32、上述基于tadf增强的d-π-a-π-d结构的新型tpa-dcpp nps的阳极ecl信号检测用于ctdna定量分析应用。发夹dna1(h1)在靶标存在下可被打开形成双链配合物。exoⅲ对双链dna按照3′→5′的方向从3′-oh末端逐渐消化5′-单核苷酸。之后,靶标被释放进行下一轮的exoⅲ的消化扩增反应。同时,也产生了用于per扩增反应的目标替代物(primer)。在发夹dna2(h2)的作用下达到per级联扩增,微量靶标可以在极小的背景信号下进行指数级别扩增。capture probe@protector-bhq3双链探针通过au-s键偶联在tpa-dcpp nps修饰的电极上,而bhq3(发光猝灭剂),由于距离接近tpa-dcpp nps,基于ecl-ret效应,有效地猝灭了tpa-dcpp nps的ecl发射。由于per产物与捕获探针(capture probe)的结合能力大于capture probe@protector-bhq3双链探针的结合能力,导致protector-bhq3从电极表面释放。因此,bhq3和tpa-dcpp nps之间的ecl-ret被破坏,进而tpa-dcpp nps的ecl发射恢复。总之,随着靶标数量的增加,bhq3的猝灭效应逐渐降低,而ecl响应逐渐恢复,为ctdna定量检测提供了一个指标。

33、与现有技术相比,本发明的有益效果:

34、(1)首先合成了tpa-dcpp小分子,之后采用纳米共沉淀法制备了tpa-dcpp nps,所得产物呈现球状,且具有良好的分散性;tpa-dcpp nps具有供体-共轭桥-受体-共轭桥-供体(d-π-a-π-d)的结构,其具有优异的共反应剂ecl行为。

35、(2)以tpa-dcpp nps作为ecl发光体,bhq3作为发光猝灭剂,基于“ecl-ret”效应,以ctdna作为检测靶标构建了ecl生物传感器,借助exoⅲ辅助per级联扩增技术,通过循环放大作用将靶标信号进行了放大,提高了生物传感器的检测灵敏度,有助于痕量ctdna的灵敏检测。此外,所提出的策略在检测水溶液和人血清中的ctdna方面表现出优异的特异性、灵敏度和可靠性。

36、(3)与普通的近红外发光体(bset-bt nps)相比,由于tpa-dcpp nps的tadf特性,显著提高了其ecl发光效率,ecl效率的提高表明tadf在提高ecl效率和促进生物传感应用方面具有重要的应用价值。

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