一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌dna提取方法_2

文档序号:8937858阅读:来源:国知局
管上,将30?10ul Elut1n Buffer直接加到DNA Column的中间,65°C水浴10 ?15min ;13000g,离心 lmin,洗提 DNA ;再次加入 30 ?100 μ L Elut1n Buffer,重复洗提。
[0032]【具体实施方式】二:本实施方式与【具体实施方式】一不同的是:步骤一中取105个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。其它步骤及参数与【具体实施方式】一相同。
[0033]【具体实施方式】三:本实施方式与【具体实施方式】一不同的是:步骤一中取110个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。其它步骤及参数与【具体实施方式】一相同。
[0034]【具体实施方式】四:本实施方式与【具体实施方式】一不同的是:步骤一中取120个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。其它步骤及参数与【具体实施方式】一相同。
[0035]【具体实施方式】五:本实施方式与【具体实施方式】一不同的是:步骤一中取130个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。其它步骤及参数与【具体实施方式】一相同。
[0036]【具体实施方式】六:本实施方式与【具体实施方式】一不同的是:步骤一中取140个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。其它步骤及参数与【具体实施方式】一相同。
[0037]【具体实施方式】七:本实施方式与【具体实施方式】一至六之一不同的是:步骤一中用NaClO进行表面消毒,是采用有效氯为5 %的NaClO进行表面消毒3?5min。其它步骤及参数与【具体实施方式】一至六之一相同。
[0038]【具体实施方式】八:本实施方式与【具体实施方式】一至七之一不同的是:步骤一中4°C条件下用灭菌去离子水浸泡22h。其它步骤及参数与【具体实施方式】一至七之一相同。
[0039]实施例:
[0040]为验证本发明的效果,进行以下实验:
[0041]大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,按以下步骤进行:
[0042]一、取100个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊,用NaClO进行表面消毒,然后装入到已经灭菌的2mL离心管中,4°C条件下用灭菌去离子水浸泡24h,获得胞囊样品;
[0043]二、用土壤DNA抽提试剂盒进行胞囊样品的DNA提取,具体操作参照土壤DNA抽提试剂盒的使用说明书,即完成大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取;
[0044]其中步骤一中大豆胞囊线虫胞囊的寄生率为50%以上。
[0045]DNA提取的具体操作:
[0046]1、取0.5g玻璃珠置于装有胞囊样品的离心管中,加入ImL Buffer SLX Mlus,漩涡振荡3?5min ;
[0047]2、加 10yL Buffer DS,漩涡混匀;
[0048]3、70°C水浴lOmin,在水浴过程中漩祸混样,3000rpm,室温离心3min ;
[0049]4、取上清800 μ L于2ml离心管,加270 μ L Buffer SP2,漩涡混匀;
[0050]5、冰浴5min后,13000g,4°C离心5min,取上清于2mL离心管中,加0.7倍体积的异丙醇,颠倒混匀,4°C,13000g离心1min沉淀DNA ;
[0051]6、弃上清,将离心管倒置在滤纸上Imin吸干液体;
[0052]7、加 200 μ L Elut1n Buffer,旋振 10s,然后 65°C水浴 10 ?20min 溶解 DNA ;
[0053]8、加 50 ?100 μ L HTR Reagent,旋振 10s,室温静置 2min,13000g,离心 2min ;
[0054]9、取清澈上清于新的2mL离心管中,加入等体积的XP2Buffer,漩涡混匀;
[0055]10、将上述样品置于安装在2mL收集管上的HiBind DNA Column ;10000g,室温离心lmin,丢弃收集液^#DNA Column放在收集管上,加入300 μ L XP2Buffer ;10000g,离心Imin ;丢弃收集液和收集管;将DNA Column放在新的2mL收集管上,用700 μ L SPff WashBuffer洗脱柱子;10000g,离心lmin,丢弃收集液;用700 μ I SPff Wash Buffer再次洗脱,丢弃液体,将柱子再次放在空收集管上,13000g,室温离心2min ;将DNA Column放在干净的1.5ml离心管上,将30?10ul Elut1n Buffer直接加到DNA Column的中间,65°C水浴10 ?15min ;13000g,离心 lmin,洗提 DNA ;再次加入 30 ?100 μ L Elut1n Buffer,重复洗提。
[0056]对上述提取后的总DNA的大小和浓度通过0.8%的琼脂糖凝胶电泳进行检查:胞囊寄生菌DNA检测结果条带亮度明显(图1),DNA含量达到20ng.μ L 1Wl, DNA纯度较高。该DNA含量能够进行DGGE多样性分析(图2)。DGGE结果较好,条带明显分开,多样性差异明显。可见本发明易于操作,使用方便,DNA提取快速高效,便于推广应用。
【主权项】
1.一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于它按以下步骤进行: 一、取100?150个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊,用NaClO进行表面消毒,然后装入到已经灭菌的2mL离心管中,4°C条件下用灭菌去离子水浸泡18?24h,获得胞囊样品; 二、用土壤DNA抽提试剂盒进行胞囊样品的DNA提取,具体操作参照土壤DNA抽提试剂盒的使用说明书,即完成大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取; 其中步骤一中大豆胞囊线虫胞囊的寄生率为50%以上。2.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中取105个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。3.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中取110个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。4.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中取120个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。5.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中取130个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。6.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中取140个新鲜的大豆胞囊线虫胞囊。7.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中用NaClO进行表面消毒,是采用有效氯为5%的NaClO进行表面消毒3?5min。8.根据权利要求1所述的一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,其特征在于步骤一中4°C条件下用灭菌去离子水浸泡22h。
【专利摘要】一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌DNA提取方法,它属于核酸提取技术。它要解决目前大豆胞囊线虫胞囊寄生菌的DNA提取过程中有损失,难准确提供出有关寄生菌群落结构和多样性信息,且胞囊用量大,提取时间长的问题。方法:一、取新鲜的大豆胞囊线虫胞囊,表面消毒,去离子水浸泡,获得胞囊样品;二、用土壤DNA抽提试剂盒进行胞囊样品的DNA提取。本发明所需胞囊量少、步骤简单、容易操作,使用方便,DNA提取快速准确高效,便于推广应用。所提取的DNA可用于变性梯度凝胶电泳等微生物多样性分析,也可用于同类寄生微生物DNA的提取,能够更全面的了解胞囊寄生菌多样性及其种类,解决了难于培养微生物无法鉴定的问题。
【IPC分类】C12N15/10
【公开号】CN105154433
【申请号】CN201510594059
【发明人】宋洁, 许艳丽, 姚钦
【申请人】中国科学院东北地理与农业生态研究所
【公开日】2015年12月16日
【申请日】2015年9月17日
当前第2页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1