一种鉴定胡桃木细小蠹的引物、试剂盒及其方法_2

文档序号:9541150阅读:来源:国知局
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[0036]体形微小,身体全长1. 5-1. 9mm,约为体宽的2. 8-3. 1倍,雌虫体色黄褐,雄虫近黑 色。触角键状部第1、第2节间有嵌隔。额面轻微向口上片边缘抬起,侧缘突成半圆状,与眼 缘的距离为小眼直径的2-3倍;雌虫额面平或稍凹,表面光滑,刻点细密匀称,茸毛密集,近 边缘的茸毛较长;雄虫额面宽而下凹,刻点粗糖,茸毛短且疏,较不显眼。刚毛最长约达一半 眼距。
[0037] 前胸背板:长约为宽的1. 10-1. 16倍,自基部起一半侧缘横直,前缘弓成宽半圆 形。前缘有约18个银齿。背板顶部位于中部或中部偏前,前半部为鱗状瘤区,瘤多有缺刻, 呈4-6排清晰的近同屯、圆状排列,背板前缘着生的鱗状瘤数目超过12,同排相邻的鱗状瘤 常在基部相连,常于背中线附近出现重叠。背板后半部分为刻点区,表面平缓而光滑,刻点 稍大且密。背板前部表被刚毛较长,随鱗状瘤整齐排列,后部刚毛较疏细。
[0038]銷翅:长约为宽的1. 8-1. 9倍,约为前胸背板1. 7倍长,自基部起3/4侧缘横直,銷 翅末端纯圆。銷翅斜面较睹,刻点较大,排列成行形成刻点沟,其中第1、第2沟刻点较浅, 除第1刻点沟于斜面处下陷外,其余刻点沟不下陷。沟间部平滑,宽度约为刻点沟的1倍或 I. 5倍;第I沟间部十分宽,并明显向上隆起;第2沟间部与I等宽,平滑略呈革质;第1、第 3沟间部上各有1列极疏的刻点。位于刻点沟内短且细的刚毛延伸至翅銷基部,沟间部刚毛 大部分较疏地排列于銷翅斜面的基数刻点沟上。雄虫第1、第2沟间部各有1列小颗粒。
[0039] 先对待检测样品进行形态学鉴定,W节约成本;然后对与胡桃木细小蠢形态特别 接近不容易区分的样本结合分子生物学鉴定技术鉴定,W进行区分,降低了对鉴定工作者 的要求,使得鉴定工作更方便易行。
[0040] 为了使鉴定更方便易行,并且降低外界因素对结果的干扰,优选地,所述第一引物 对、第二引物对、第立引物对和第四引物对的PCR扩增同时进行。一般是将各引物对的PCR 体系在同一台PCR仪中进行PCR扩增。
[0041] 优选地,所述PCR扩增所用的退火溫度为50°C±rc。经试验验证,W该退火溫度 进行PCR扩增,特异性好。
[0042] 进一步地,所述PCR反应体系的体积为15-50y1。优选地,所述PCR反应体系的体 积为 20-25 ^1。
[004引如,PCR体系的体积为25y1,其成分如下:
[0044]
[0045]
[0046] 其中,若是第一引物对的PCR体系,则PrimerF为P1-F,PrimerR为Pl-R;若是 第二引物对的PCR体系,则PrimerF为P2-F,PrimerR为P2-R;若是第S引物对的PCR体 系,则PrimerF为P3-F,PrimerR为P3-R;若是第四引物对的PCR体系,则PrimerF为 P4-F,PrimerR为P4-R。
[0047] 其中,各引物的浓度可W有小幅度的变动,如10%上下的浮动均能得到很好的 PCR扩增效果。
[004引另外,相应地,PCR体系的体积还可W为15iil、20iil、30yl、50iil等等,相应地, 体系内的各成分相应的缩小或扩大即可。
[0049] 待检测样品的基因组提取物是将整个待检测样品提取基因组,提取方法按照常规 的方法或是市售产品推荐的方法进行即可。由于胡桃木细小蠢及其相似物均是成群出现, 每群个体均是一致的,因此,取其中的一只进行检测,即可判断整群个体是否为胡桃木细小 晶。
[0050] 由于待检测样品个体比较小,提取得到的基因组的含量有限,优选地,所述PCR反 应体系中,待检测样品的基因组提取物的含量为50ngW上,优选为100-2(K)ng。W该含量的 基因组提取物作为模板进行PCR检测,即可得到明显的条带,从而进行判定。
[0051] 优选地,所述PCR扩增的程序为:94-95 °C预变性3-5min,进入扩增循环;每个循环 中先于94-95°C变性28-30S,后降溫至50°C±rC退火30-35S,再升溫至72°C延伸45-50S, 共35-40个循环;最后于72°C保持5-lOmin。
[0052] 与现有技术相比,本发明的有益效果为:
[005引 (1)本发明采用组合PCR对引物特异性要求较低即允许引物扩增几个物种,因此, 弓I物设计相对容易,运种设计引物的理念,不仅增加了引物的选择空间降低引物设计的难 度,而且可W充分利用基因不同区域的进化差异,使分析更加客观准确。
[0054] (2)本发明通过分析物种亲缘关系,设计了四对引物,运些引物特异性强,敏感度 高,重复性好,能很稳定、快速的鉴定是否为胡桃木细小蠢,方便快捷,可靠性高。
[00巧](3)本发明先对物种进行形态学鉴定,准确度高,鉴定周期短,方便易行,为了进一 步确保对物种鉴定的准确性,区分形态相似的近缘物种,采用分子生物学鉴别的方法加W 辅助,鉴定结果可靠性高,适合大众检测。
[0056] (4)本发明还限定了PCR体系的一些具体参数,W使PCR结果更为稳定可靠。
【附图说明】
[0057]为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,W下将对实施例或现 有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。
[0058] 图1为本发明实施例1中胡桃木细小蠢与Pityophthorus lau1:us Eichhoff的 PCR产物电泳结果图。
【具体实施方式】
[0059] 下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会 理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体 条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为 可W通过市售获得的常规产品。
[0060] 实施例1
[0061] 一、取胡桃木细小蠢白标准样品和其近缘物种Pityophthorus Iau化S Eichhoff 样品,进行形态学鉴定,形态学鉴定依据具体如下:
[0062] 体形微小,身体全长1. 5-1. 9mm,约为体宽的2. 8-3. 1倍,雌虫体色黄褐,雄虫近黑 色。触角键状部第1、第2节间有嵌隔。额面轻微向口上片边缘抬起,侧缘突成半圆状,与眼 缘的距离为小眼直径的2-3倍;雌虫额面平或稍凹,表面光滑,刻点细密匀称,茸毛密集,近 边缘的茸毛较长;雄虫额面宽而下凹,刻点粗糖,茸毛短且疏,较不显眼。刚毛最长约达一半 眼距。
[0063] 前胸背板:长约为宽的1. 10-1. 16倍,自基部起一半侧缘横直,前缘弓成宽半圆 形。前缘有约18个银齿。背板顶部位于中部或中部偏前,前半部为鱗状瘤区,瘤多有缺刻, 呈4-6排清晰的近同屯、圆状排列,背板前缘着生的鱗状瘤数目超过12,同排相邻的鱗状瘤 常在基部相连,常于背中线附近出现重叠。背板后半部分为刻点区,表面平缓而光滑,刻点 稍大且密。背板前部表被刚毛较长,随鱗状瘤整齐排列,后部刚毛较疏细。
[0064] 銷翅:长约为宽的1. 8-1. 9倍,约为前胸背板1. 7倍长,自基部起3/4侧缘横直,銷 翅末端纯圆。銷翅斜面较睹,刻点较大,排列成行形成刻点沟,其中第1、第2沟刻点较浅, 除第1刻点沟于斜面处下陷外,其余刻点沟不下陷。沟间部平滑,宽度约为刻点沟的1倍或 1. 5倍;第1沟间部十分宽,并明显向上隆起;第2沟间部与1等宽,平滑略呈革质;第1、第 3沟间部上各有1列极疏的刻点。位于刻点沟内短且细的刚毛延伸至翅銷基部,沟间部刚毛 大部分较疏地排列于銷翅斜面的基数刻点沟上。雄虫第1、第2沟间部各有1列小颗粒。
[0065] 二、胡桃木细小蠢白标准样品和其近缘物种PityophthorusIau化SEichhoff样 品均符合上述形态特征,然后进行分子生物学鉴定。
[0066] 1、提取待测样品基因组
[0067] 提取待测样品基因组采用杭州新景生物基因组DNA小量试剂盒提取,提取步骤参 照产品说明书进行,具体步骤如下:
[0068] 1)将整个待检测样本进行液氮研磨;
[0069] 2)加入 250 "BufferSl;
[0070] 3)加入等体积的BufferS2,混匀;
[0071] 4)加入 350Ji1BufferS3 混匀,12000Xg离屯、IOmin;
[0072] 5)吸取上清并转移至制备管(置于2ml离屯、管中),12000Xg离屯、Imin,弃滤液;
[007引6)将制备管置回离屯、管,加500 Buff
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