控制方法、基因测序仪和存储介质与流程

本技术涉及基因测序，特别涉及一种控制方法、基因测序仪和存储介质。

背景技术：

1、第二代基因测序技术目前已经广泛应用于全基因组测序、转录组测序、宏基因组测序等，是分析生化的进化与分类，以及进行体外诊断等的有力工具。

2、目前的基因测序系统包括生化反应装置和光学检测装置。生化反应装置用于实现基因测序芯片的开放式浸泡，实现试剂的重复实用，即生化反应装置内包括用于开放式浸泡基因测序芯片的试剂槽。基因测序系统可以对试剂槽进液和排液，进而便于反应前试剂的灌注、反应过程中试剂的补液以及整个测序完成后试剂的排出。光学检测装置用于对基因测序芯片进行光学检测。

3、目前，对开放式流体系统的试剂槽补液、加液和换液的方法，主要是通过纯手工的方式对试剂槽补液、加液或换液，或者是通过半自动的方法对试剂槽补液、加液或换液，导致对试剂槽补液、加液或换液的效率较低。

技术实现思路

1、有鉴于此，本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的问题之一。为此，本技术的目的在于提供一种控制方法、基因测序仪和存储介质。

2、本技术实施方式提供一种控制方法。所述控制方法包括：

3、根据预设的加液策略、补液策略或换液策略，实时判断是否达到对试剂槽加液、补液或换液对应的触发条件；

4、在达到所述触发条件时对所述试剂槽加液、补液或换液。

5、如此，本技术的控制方法根据预设的加液策略、补液策略或换液策略，可以实时判断是否达到对试剂槽加液、补液或换液对应的触发条件，并在达到触发条件时对试剂槽加液、补液或换液，以实现对试剂槽的自动补液、加液或换液，提高试剂槽补液、加液或换液的效率。

6、在某些实施方式中，所述加液策略包括根据核酸测序流程的不同测序阶段，对应在所述试剂槽中添加不同目标试剂和目标试剂量的策略。所述控制方法包括：

7、实时确定所述核酸测序流程的当前测序阶段；

8、判断所述当前测序阶段是否达到所述目标试剂对应的目标测序阶段；和

9、在所述当前测序阶段达到所述目标试剂对应的目标测序阶段时，按照所述目标试剂量对所述试剂槽添加所述目标试剂。

10、如此，本技术的控制方法通过实时确定核酸测序流程的当前测序阶段，并判断当前测序阶段是否达到目标试剂对应的目标测序，以在当前测序阶段达到目标试剂对应的目标测序阶段时，按照目标试剂量对试剂槽添加目标试剂，进而可以根据核酸测序流程的不同测序阶段，自动在试剂槽中添加不同目标试剂量的目标试剂，避免其他试剂过早加液暴露在空气中导致生化效果减弱。

11、在某些实施方式中，所述补液策略包括根据第一时间间隔进行补液的策略，所述在达到所述触发条件时对所述试剂槽补液包括：

12、以所述加液时间为开始计时点，根据所述第一时间间隔对所述试剂槽补液。

13、如此，本技术的控制方法可以以加液时间为开始计时点，并根据第一时间间隔对试剂槽自动补液，使得用户可以根据不同类型的试剂槽，设置不同的加液时间，自动对试剂槽进行补液。

14、在某些实施方式中，所述在达到所述触发条件时对所述试剂槽补液还包括：

15、以前一次补液时间为开始计时点，根据所述第一时间间隔对所述试剂槽补液。

16、如此，本技术的控制方法可以以前一次补液时间为开始计时点，并根据第一时间间隔对试剂槽补液，实现自动对试剂槽进行补液。

17、在某些实施方式中，所述补液策略包括根据试剂槽中测序芯片的浸泡反应次数进行补液的策略。所述控制方法包括：

18、实时判断所述浸泡反应次数是否大于或等于第一阈值；

19、在所述浸泡反应次数大于或等于所述第一阈值时，对所述试剂槽补液。

20、如此，本技术的控制方法可以根据不同粘度的试剂设置不同的第一阈值，并实时判断测序芯片的浸泡反应次数是否大于或等于第一阈值，以在浸泡反应次数大于或等于第一阈值时对试剂槽自动进行补液，提高试剂槽补液的效率。

21、在某些实施方式中，所述补液策略包括根据液位传感器反馈的电信号进行补液的策略，所述液位传感器设于在所述试剂槽外部且与所述试剂槽连通的软管上，所述控制方法包括：

22、实时获取所述液位传感器输出的电信号；

23、根据所述电信号对所述试剂槽补液。

24、如此，本技术的控制方法可以根据液位传感器输出的电信号，对不同液位的试剂槽配置不同的试剂补液量进行补液。

25、在某些实施方式中，所述补液策略包括根据光机装置的拍照质量的反馈结果进行补液的策略，所述控制方法包括：

26、实时获取所述光机装置对生化反应后的所述试剂槽内移出的测序芯片的浸泡反应面进行拍照得到的预设行数和预设列数对应的多个图像；所述预设行数对应的多个图像为在测序芯片上按照所述试剂槽的竖直方向从下往上依次划分为第1行至第n行的格子对应的多个图像，n大于1；

27、根据预设算法计算所述多个图像的亮度；

28、若第n行对应的所述多个图像的亮度低于预设亮度值，则对所述试剂槽补液。

29、如此，本技术的控制方法可以实时获取光机装置对生化反应后的从试剂槽内移出的测序芯片的浸泡反应面进行拍照得到的预设行数和预设列数对应的多个图像，并根据预设算法计算多个图像的亮度，若呈现出在测序芯片上按照试剂槽的竖直方向从下往上依次划分的第n行即测序芯片的最上层行对应的多个图像的亮度低于预设亮度值时，认为试剂槽内的试剂液面高度不够，自动对试剂槽进行补液。

30、在某些实施方式中，所述换液策略包括根据第二时间间隔进行换液的策略，所述控制方法包括：

31、以所述加液时间为开始计时点，根据所述第二时间间隔对所述试剂槽换液。

32、如此，本技术的控制方法可以以加液时间为开始计时点，并根据第二时间间隔对试剂槽换液，使得用户可以根据不同类型的试剂槽，设置不同的加液时间，自动对试剂槽进行换液。

33、在某些实施方式中，所述换液策略包括根据试剂槽中测序芯片的浸泡反应次数进行换液的策略，所述控制方法包括：

34、实时判断所述浸泡反应次数是否大于或等于第二阈值；

35、在所述浸泡反应次数大于或等于所述第二阈值时，对所述试剂槽换液。

36、如此，本技术的控制方法可以根据不同粘度的试剂设置不同的第二阈值，并实时判断测序芯片的浸泡反应次数是否大于或等于第二阈值，以在浸泡反应次数大于或等于第二阈值时对试剂槽自动进行换液，提高试剂槽换液的效率。

37、在某些实施方式中，所述换液策略包括根据光机装置的拍照质量的反馈结果进行换液的策略，所述控制方法包括：

38、实时获取所述光机装置对生化反应后的从所述试剂槽内移出的测序芯片的浸泡反应面进行拍照得到的预设行数和预设列数对应的多个图像；

39、根据预设算法计算所述多个图像的亮度，并计算所述多个图像的亮度平均值；

40、若当前轮图像的亮度平均值小于上一轮图像的亮度平均值，则对所述试剂槽换液。

41、如此，本技术的控制方法可以实时获取生化反应后的从试剂槽内移出的测序芯片的浸泡反应面进行拍照得到的预设行数和预设列数对应的多个图像，并根据预设算法计算多个图像的亮度后，计算多个图像的亮度平均值，在当前轮图像的亮度平均值小于上一轮图像的亮度平均值时，可以对试剂槽自动进行换液。

42、在某些实施方式中，述换液策略包括根据生化不同阶段进行换液的策略，所述控制方法包括：

43、实时确定核酸测序流程的当前测序阶段；

44、判断所述当前测序阶段是否达到目标试剂对应的目标测序阶段；

45、在所述当前测序阶段达到所述目标试剂对应的目标测序阶段时，排空所述试剂槽中原有液体，并按照所述目标试剂量在所述试剂槽中加入所述目标试剂。

46、如此，本技术的控制方法通过实时确定核酸测序流程的当前测序阶段，并判断当前测序阶段是否达到目标试剂对应的目标测序，以在当前测序阶段达到目标试剂对应的目标测序阶段时，排空所述试剂槽中原有液体，并按照目标试剂量对试剂槽中加入目标试剂，进而可以根据核酸测序流程的不同测序阶段，自动排空试剂槽中原有液体，并按照目标试剂量对试剂槽中加入目标试剂，以提高试剂槽的重复利用率。

47、本技术还提供一种基因测序仪。所述基因测序仪包括控制装置和试剂槽。所述控制装置包括判断模块和执行模块。所述判断模块用于根据预设的加液策略、补液策略或换液策略，实时判断是否达到对所述试剂槽加液、补液或换液对应的触发条件；所述执行模块用于在达到所述触发条件时对所述试剂槽加液、补液或换液。

48、如此，本技术的基因测序仪根据预设的加液策略、补液策略或换液策略，可以实时判断是否达到对试剂槽加液、补液或换液对应的触发条件，并在达到触发条件时对试剂槽加液、补液或换液，以实现对试剂槽的自动补液、加液或换液，提高试剂槽补液、加液或换液的效率。

49、本技术还提供一种计算机可读存储介质。所述计算机可读存储介质存储有计算机程序，当所述计算机程序被一个或多个处理器执行时，实现上述实施方式中所述的控制方法。

50、如此，本技术的计算机可读存储介质根据预设的加液策略、补液策略或换液策略，可以实时判断是否达到对试剂槽加液、补液或换液对应的触发条件，并在达到触发条件时对试剂槽加液、补液或换液，以实现对试剂槽的自动补液、加液或换液，提高试剂槽补液、加液或换液的效率。