一种环状RGD肽及其虚拟筛选方法与流程

技术特征：

1.一种环状RGD肽的虚拟筛选方法，其特征在于，步骤如下：

(1)虚拟筛选过程：以RGD三肽为先导化合物，通过计算机辅助药物设计软件Surflex-dock，采用Hammerhead打分函数打分，从合成的现实角度出发，综合静电作用、范德华力、疏水作用和氢键进行打分，根据打分结果排序，初步确定环状RGD肽化合物；

(2)对接过程：从蛋白质数据库PDB中下载编号1L5G蛋白，编号1L5G蛋白包括RGD肽和αvβ3，去除其中的RGD肽，将1L5G蛋白中剩余的αvβ3与步骤(1)中确定的环状RGD肽进行对接，筛选出打分高的六元环肽。

2.一种如权利要求1所述的环状RGD肽，其特征在于，所述环状RGD肽具有RGDfVK、RGDfKV、RGDKfV或RGDf(N-me)VK氨基酸序列。

3.如权利要求2所述的环状RGD肽，其特征在于，所述环状RGD肽为式I所示的c(RGDf(N-me)VK)，或式II所示的c(RGDf(N-me)VK)-C。

4.一种如权利要求2所述的环状RGD肽，其特征在于，所述环状RGD肽为式III所示的c(RGDfVK)，式IV所示的c(RGDfVK)-C，或式V所示的c(RGDfVK)-GDK。

5.一种如权利要求2所述的环状RGD肽，其特征在于，所述环状RGD肽为式VI所示的c(RGDfKV)，式VII所示的c(RGDfKV)-C，或式VIII所示的c(RGDfKV)-GD。

6.一种如权利要求2所述的环状RGD肽，其特征在于，所述环状RGD肽为式IX所示的c(RGDKfV)，或式X所示的c(RGDKfV)-C。