[0067] 用于干细胞特异性抗体的生成或选择的GTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNL(SEQ ID N0:10)。还更优选的是包含来自GTINVHDVETQFNQY(SEQ ID N0:11)的连续氨基酸的肽。为 了干细胞抗体的生成，本发明还包括用于生成人源化抗体、选择人抗体、或生成抗体样蛋白 的方法，其中肽并不用来免疫所使用的动物，或使用编码它的核酸，以选择抗体或抗体样蛋 白，其识别来自 SEQ ID N0:4、SEQ ID N0:5、SEQ ID N0:6、SEQ ID N0:9、SEQ ID N0:10、SEQ ID NO: 11的肽的至少6个连续氨基酸，其中SEQ ID NO: 10是特别优选的。噬菌体展示技术 可以用来选择抗体或抗体样蛋白，其结合于将其识别为干细胞特异性抗体的肽。
[0068] 在一种优选的实施方式中，属于癌细胞抗体组的抗体将结合于MUCl阳性癌细胞， 如通过ICC、FACS或其它类似分析所确定的，其中上述其它类似分析包括ELISA和噬菌体 展示，其中抗体结合于包含SEQ ID NO: 3的一些或所有氨基酸的肽。在一种优选的实施方 式中，抗体结合于肽，其包含在SEQ ID N0:3的C端处的最后20个氨基酸。在一种更优选 的实施方式中，抗体结合于肽，其仅包含在SEQ ID NO: 3的肽的C端处的最后10个氨基酸。 在一种仍然更优选的实施方式中，属于癌细胞抗体组的抗体结合于MUCl阳性癌细胞但并 不结合于干细胞或祖细胞。此外，借助于它们刺激癌细胞生长（当它们是二价时）和抑制 癌细胞生长（当它们是单价（例如Fab)时）的能力来选择属于癌细胞抗体组的抗体。在 一种还更优选的实施方式中，抗体的二价和单价形式将均不影响干细胞的生长。
[0069] 在一种优选的实施方式中，属于干细胞抗体组的抗体结合于干细胞和/或祖细 胞，如通过ICC、FACS或其它类似分析所确定的，其中上述其它类似分析包括ELISA和噬菌 体展示，其中抗体结合于包含SEQ ID NO: 4的一些或所有氨基酸的肽。在一种优选的实施方 式中，干细胞和/或祖细胞是人起源。在另一种优选实施方式中，抗体结合于肽，其仅包含 在SEQ ID N0:4的N端处的20个氨基酸。在一种更优选的实施方式中，抗体将结合于肽， 其仅包含在SEQ ID NO: 4的肽的N端处的10个氨基酸。可替换地，抗体将结合于SEQ ID N0:5、SEQ ID N0:6的肽，或包含来自组合SEQ ID N0:4和5的连续氨基酸的肽。在一种仍 然更优选的实施方式中，属于干细胞抗体组的抗体将结合于人干细胞和/或祖细胞但并不 结合于MUCl阳性癌细胞。此外，将借助于它们刺激干细胞和/或祖细胞生长（当它们是二 价时）和抑制干细胞和/或祖细胞生长（当它们是单价，例如Fab，时）的能力来选择属于 干细胞抗体组的抗体。在一种还更优选的实施方式中，抗体的二价和单价形式将均不影响 癌细胞的生长。
[0070] 通过标准方法来产生单克隆抗体并基于本文陈述的选择标准来选择产生抗体的 杂交瘤。单克隆抗体2D6C3和2D6C8 (在本文中还被分别称为C3和C8)被确定为干细胞抗 体。它们的序列示于图28至图33。单克隆抗体C2和E6被确定为癌细胞特异性抗体。单 克隆抗体C2(MIN-C2)和E6(MIN-E6)的序列示于图24至图27。
[0071] gaggtccagctggaggagtcagggggaggcttagtgaagcctggagggtccctgaaactctcctgtgca gcctctggattcactttcagtggctatgccatgtcttgggttcgccagactccggagaagaggctggagtgggtcgc aaccattagtagtggtggtacttatatctactatccagacagtgtgaaggggcgattcaccatctccagagacaatg ccaagaacaccctgtacctgcaaatgagcagtctgaggtctgaggacacggccatgtattactgtgcaagacttggg ggggataattactacgaatacttcgatgtctggggcgcagggaccacggtcaccgtctcctccgccaaaacgacacc cccatctgtctat(SEQ ID N0:12)描述了 MIN-C2 重链可变区。
[0072] EVQLEESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSGYAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGGTYIYYPDSVKGRFT ISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCARLGGDNYYEYFDVWGAGTTVTVSSAKTTPPSVY(SEQ ID NO:13)描 述了 MIN-C2重链可变区。
[0073] gacattgtgatcacacagtctacagcttccttaggtgtatctctggggcagagggccaccatctcatgc agggccagcaaaagtgtcagtacatctggctatagttatatgcactggtaccaacagagaccaggacagccacccaa actcctcatctatcttgcatccaacctagaatctggggtccctgccaggttcagtggcagtgggtctgggacagact tcaccctcaacatccatcctgtggaggaggaggatgctgcaacctattactgtcagcacagtagggagcttccgttc acgttcggaggggggaccaagctggagataaaacgggctgatgctgcaccaactgtatcc(SEQ ID NO:14)描 述了 MIN-C2K链可变区。
[0074] DIVITQSTASLGVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQRPGQPPKLLIYLASNLESGVPARF SGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSRELPFTFGGGTKLEIKRADAAPTVS(SEQ ID N0:15)描述了 MIN-C2K链可变区。
[0075] gaggttaagctggaggagtctgggggagacttagtgaagcctggagggtccctgaaactctcctgtgca gcctctggattcactttcagtagatatggcatgtcttgggttcgccagactccagacaagaggctggagtgggtcgc aaccattagtagtggtggtacttacatctactatccagacagtgtgaaggggcgattcaccatctccagagacaatg ccaagaacaccctgtacctgcaaatgagcagtctgaagtctgaggacacagccatgtattactgtgcaagggataac tacggtagtagctacgactatgctatggactactggggtcaaggaacctcagtcaccgtctcctcagccaaaacaac agccccatcggtctat(SEQ ID N0:16)描述了 MIN-E6 重链 _7 可变区D
[0076] EVKLEESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFTFSRYGMSWVRQTPDKRLEWVATISSGGTYIYYPDSVKGRFT ISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAMYYCARDNYGSSYDYAMDYWGQGTSVTVSSAKTTAPSVY(SEQ ID NO:17) 描述了 MIN-E6重链-7可变区。
[0077] gaggtaaagctggaggagtctgggggagacttagtgaagcctggagggtccctgaaactctcctgtg tagtctctggattcactttcagtagatatggcatgtcttgggttcgccagactccaggcaagaggctggagtggg tcgcaaccattagtggtggcggtacttacatctactatccagacagtgtgaaggggcgattcaccatctccagag acaatgccaagaacaccctgtacctgcaaatgagcagtctgaagtctgaggacacagccatgtatcactgtacaa gggataactacggtaggaactacgactacggtatggactactggggtcaaggaacctcagtcaccgtctcctcag ccaaaacaacagccccatcggtctatccactggcccctgtgtgtggagatacaactggctcctcggtgactctag gatgcctggtcaag(SEQ ID N0:18)描述了 MIN-E6 重链 _8 可变区D
[0078] EVKLEESG⑶LVKPGGSLKLSCVVSGFTFSRYGMSWVRQTPGKRLEWVATISGGGTYIYYPDSVKGR FTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAMYHCTRDNYGRNYDYGMDYWGQGTSVTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTG SSVTLGCLVK(SEQ ID N0:19)描述了 MIN-E6 重链-8 可变区。
[0079] gatattgtgatcacccagactacagcaatcatgtctgcatctccaggggaggaggtcaccctaacctgc agtgccacctcaagtgtaagttacatacactggttccagcagaggccaggcacttctcccaaactctggatttatag cacatccaacctggcttctggagtccctgttcgcttcagtggcagtggatatgggacctcttactctctcacaatca gccgaatggaggctgaagatgctgccacttattactgccagcaaaggagtagttccccattcacgttcggctcgggg acaaagttggaaataaaacgggctgatgctgcaccaactgtatcc(SEQ ID N0:20)描述了ΜΙΝ-Ε6κ 链可 变区。
[0080] DIVITQTTAIMSASPGEEVTLTCSATSSVSYIHWFQQRPGTSPKLWIYSTSNLASGVPVRFSGSGYGTS YSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSSPFTFGSGTKLEIKRADAAPTVS(SEQ ID N0:21)描述了 ΜΙΝ-Ε6κ 链 可变区。
[0081] gaggtccagctggaggagtctgggggaggcttagtgaagcctggagggtccctgaaactctcctgtgca gcctctggattcactttcagtggctatgccatgtcttgggttcgccagactccggagaagaggctggagtgggtcgc aaccattagtagtggtggtacttatatctactatccagacagtgtgaaggggcgattcaccatctccagagacaatg ccaagaacaccctgtacctgcaaatgagcagtctgaggtctgaggacacggccatgtattactgtgcaagacttggg ggggataattactacgaatacttcgatgtctggggcgcagggaccacggtcaccgtctcctccgccaaaacgacacc cccatctgtctatccactggcccctggatctgctgcccaaactaactccatggtgaccctgggatgcctggtcaagg gctatttccctgagccagtgacagtgacctggaactctggatccctgtccagcggtgtgcacaccttcccagctgtc ctgcagtctgacctctacactctgagcagctcagtgactgtcccctccagcacctggcccagcgagaccgtcacctg caacgttgcccacccagccagcaggaccgcg(SEQ ID NO:22)描述了 MIN-C2 Fab 重链。
[0082] gacattgtgatcacacagtctacagcttccttaggtgtatctctggggcagagggccaccatctcatgc agggccagcaaaagtgtcagtacatctggctatagttatatgcactggtaccaacagagaccaggacagccacccaa actcctcatctatcttgcatccaacctagaatctggggtccctgccaggttcagtggcagtgggtctgggacagact tcaccctcaacatccatcctgtggaggaggaggatgctgcaacctattactgtcagcacagtagggagcttccgttc acgttcggaggggggaccaagctggagataaaacgggctgatgctgcaccaactgtatccatcttcccaccatccag tgagcagttaacatctggaggtgcctcagtcgtgtgcttcttgaacaacttctaccccaaagacatcaatgtcaagt ggaagattgatggcagtgaacgacaaaatggcgtcctgaacagttggactgatcaggacagcaaagacagcacctac agcatgagcagcaccctcacgttgaccaaggacgagtatgaacgacataacagctatacctgtgaggccactcacaa gacatcaacttcacccattgtcaagagcttcaacaggaatgagtgt (SEQ ID NO: 23)描述了 MIN_C2Fab κ 链。
[0083] EVQLEESG