用于通过调整bmp-6来调节铁稳态的方法和组合物的制作方法_3

文档序号:9207443阅读:来源:国知局
例如,EP 404,097 ;W0 93/11161 JPHollinger 等,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)中。
[0078] 如本文所使用,"内化"的抗体是在与哺乳动物细胞上的抗原(例如,细胞表面多肽 或受体)结合后被细胞摄取(即,进入细胞)的抗体。内化的抗体当然包括抗体片段、人抗 体或嵌合抗体、和抗体缀合物。对于某些治疗应用,考虑体内内化。被内化的抗体分子的数 目将足以或适于杀死细胞或抑制细胞生长,尤其是感染的细胞。取决于抗体或抗体缀合物 的效力,在一些情况下,单个抗体分子被摄入至细胞中足以杀死所述抗体结合的靶细胞。例 如,某些毒素具有高度有效的杀死作用,使得与抗体缀合的毒素的一个分子的内化就足以 杀死感染的细胞。
[0079] 如本文所使用,如果抗体以可检测到的水平(优选地具有大于或等于约IO4M'或 大于或等于约IO 5M'大于或等于约ΙΟ^Γ1、大于或等于约IO7M'或大于或等于IO8IT 1的亲 合常数Ka)与抗原反应,则该抗体被称为对该抗原是"免疫特异的","特异的"或"特异性 结合"该抗原。抗体对其关联抗原的亲和性也普遍地表示为离解常数K D,并且在某些实施 方案中,如果抗BMP-6抗体以小于或等于10-4Μ,小于或等于约10- 5Μ,小于或等于约10-6Μ, 小于或等于10-7Μ,或者小于或等于KT 8M的Kd结合ΒΜΡ-6,则抗ΒΜΡ-6抗体特异性地结合 ΒΜΡ-6。抗体的亲和性可以容易地使用常规技术,例如由Scatchard等(Ann. Ν. Υ. Acad. Sci. USA 51:660(1949))所述的那些技术来确定。
[0080] 抗体与抗原、细胞或其组织的结合特性通常可以使用免疫检测方法来确定和评 估,所述方法包括,例如,基于免疫荧光的测定,诸如免疫组织化学(IHC)和/或荧光激活细 胞分选(FACS)。
[0081] 具有指定抗体的"生物特性"的抗体是拥有该抗体的使其区别于其他抗体的一种 或多种生物特性的抗体。例如,在某些实施方案中,具有指定抗体的生物特性的抗体将结合 与该指定抗体结合的相同表位和/或具有与该指定抗体共用的效应器功能。
[0082] 术语"拮抗剂"抗体以广义使用,并且包括部分或完全阻断、抑制、或中和其特异性 结合的表位、多肽或细胞的生物活性的抗体。用于鉴定拮抗剂抗体的方法可以包括使被候 选拮抗剂抗体特异性结合的多肽或细胞与候选拮抗剂抗体接触,并测量通常与所述多肽或 细胞相关的一种或多种生物活性的可检测变化。
[0083] 抗体"效应器功能"是指归因于抗体的Fe区(Fe区的天然序列或Fe区的氨基酸 序列变体)并且随着抗体同种型而变化的那些生物活性。抗体效应器功能的实例包括:Clq 结合和补体依赖性细胞毒性;Fe受体结合;抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC);吞噬 作用;细胞表面受体(例如,B细胞受体)的下调;和B细胞激活。
[0084] "Fc受体"或"FeR"描述了结合抗体的Fe区的受体。在某些实施方案中,FcR是 人FcR的天然序列。而且,优选的FcR是结合IgG抗体(一种γ受体)的一种受体,并且 包括Fe γ RI、Fe γ RII和Fe γ RIII亚类的受体,包括这些受体的等位基因变体和选择性 剪接形式。FCyRII受体包括Fe YRIIA(-种"激活受体")和Fe YRIIB (-种"抑制受 体"),其具有类似的氨基酸序列,它们的区别主要在其细胞质结构域中。激活受体Fe γ RIIA 在其细胞质结构域中包含免疫受体酪氨酸活化基序(immunoreceptor tyrosine-based activation motif) (ITAM)。抑制受体FcyRIIB在其细胞质结构域中包含免疫受体酪氨酸抑 制基序(ITIM)(参见综述 M. in Daeron, Annu. Rev. Tmmunol. 15:203-234 (1997))。FcRs 的综 述参见 Ravetch 和 Kinet, Annu. Rev. Tmmunol 9:457-92 (1991) ;Capel 等,Immunomethods 4:25-34(1994);以及de Haas 等,J.Lab.Cl in. Med.126:330-41 (1995)。其他 FeR,包 括未来将被鉴定的那些,包括在本文的术语"FeR"内。该术语还包括新生儿受体FeRn, 其负责母体IgGs至胎儿的转移(Guyer等,J. Immunol. 117:587 (1976)和Kim等,J. Immunol. 24:249(1994)) 〇
[0085] "人效应器细胞"是表达一个或多个FcR并且执行效应器功能的白细胞。优选地,细 胞至少表达Fe γ RIII并且执行ADCC效应器功能。介导ADCC的人白细胞的实例包括PBMC、 NK细胞、单核细胞、细胞毒性T细胞和中性粒细胞;优选PBMC和NK细胞。效应器细胞可以 从天然来源中分离,例如,从血液中分离。
[0086] 用于治疗感染目的的"哺乳动物"是指任何哺乳动物,包括人、家畜和耕畜,和动物 园、运动或宠物动物,诸如犬、猫、牛、马、绵羊、猪、山羊、兔等。优选地,哺乳动物是人。
[0087] "治疗(treating) "或"治疗(treatment) "或"缓解"指治疗性治疗和预防的 (prophylactic)或预防性(preventative)措施两者;其中目标是防止或延缓(减轻)革巴 向的病理状况或失调。需要治疗的那些包括已经患有所述失调的那些以及易于患有所述失 调的那些或要防止所述失调的那些。如果在根据本发明的方法接受治疗量的抗体后患者显 示可观察到的和/或可测量到的下列一种或多种情况的减少或不存在下列一种或多种情 况,则受试者或哺乳动物的感染被成功地"治疗":感染细胞数目的减少或不存在感染细胞; 被感染的全部细胞的百分比减少;和/或与具体感染相关的一种或多种症状减轻至一定程 度;发病率和死亡率减小;和生活质量问题改善。用于评估疾病的成功治疗和改善的上述 参数可容易地通过医生熟悉的常规程序来测量。
[0088] 术语"治疗有效量"是指有效"治疗"受试者或哺乳动物中的疾病或失调的抗体或 药物的量。参见前面对"治疗"的定义。
[0089] "长期(chronic) "施用是指与短期(acute)方式相反,一种或多种药剂以连续的 方式施用,从而将初始的治疗作用(活性)维持延长的时间段。"间断"施用是在不中断的 条件下不连续地完成的治疗,但其本质不是周期性的。
[0090] 与一种或多种另外的治疗剂"联合"施用包括以任何顺序同时的(共同的)和连 续的施用。在本发明的一个实施方案中,使用联合疗法,该疗法使用足以用于以足以改变铁 稳态、血红蛋白水平和/或血细胞比容水平的水平调整BMP-6信号传导的药物组合物,以及 红细胞生成刺激物。此组合可用于治疗具有遗传性血色素沉着病的一种或多种症状的受试 者。在多个实施方案中,红细胞生成刺激物可以用来改善贫血患者的治疗。特别地,对红 细胞生成刺激物疗法(诸如促红细胞生成素或其类似物(α依泊汀、β依泊汀、α达贝泊 汀))低反应、包括无反应的患者将受益于与铁调素活性诘抗剂或铁调素表达抑制剂的共 同治疗。
[0091] 如本文所使用,"红细胞生成刺激物"是指直接地或间接地导致促红细胞生成素 受体激活的化学化合物,例如,通过结合该受体和导致该受体二聚化,或通过刺激内源性促 红细胞生成素表达。红细胞生成刺激物包括促红细胞生成素和其结合并激活促红细胞生 成素受体的变体、类似物或衍生物;结合促红细胞生成素受体并激活该受体的抗体;或结 合并激活促红细胞生成素受体的肽;或结合并激活促红细胞生成素受体的小的有机化学 化合物,其分子量任选地小于约1000道尔顿。红细胞生成刺激物包括,但不限于,α依伯 汀、β依泊汀、δ依泊汀、ω依泊汀、t依泊汀、ζ依泊汀和它们的类似物、聚乙二醇化 促红细胞生成素、氨甲酰化促红细胞生成素、模拟肽(包括EMPl/hematide)、模拟抗体和 HIF抑制剂(参见美国专利公开号2005/0020487,其全部公开内容通过引用合并)。示例 性的红细胞生成刺激物包括促红细胞生成素、达贝泊汀、促红细胞生成素激动剂变体,和结 合并激活促红细胞生成素受体的肽或抗体(并且包括美国专利申请公开号2003/0215444 和2006/0040858中报道的化合物,其全部公开内容通过引用合并入本文中)以及如下列 专利或专利申请中公开的促红细胞生成素分子或其变体或类似物,这些专利或专利申请 的全部公开内容通过引用合并入本文中:美国专利号4, 703, 008 ;5, 441,868 ;5, 547, 933 ; 5, 618, 698 ;5, 621, 080 ;5, 756, 349 ;5, 767, 078 ;5, 773, 569 ;5, 955, 422 ;5, 830, 851 ; 5, 856, 298 ;5, 986, 047 ;6, 030, 086 ;6, 310, 078 ;6, 391, 633 ;6, 583, 272 ;6, 586, 398 ; 6, 900, 292 ;6, 750, 369 ;7, 030, 226 ;7, 084, 245 ;7, 217, 689 ;PCT[0092] 重组人促红细胞生成素的示例性序列、制备、纯化和用途描述在大量的专利公开 书中,包括但不限于Lin的美国专利号4, 703, 008和Lai等的美国专利号4, 667, 016,它们 每一篇的全部公开内容通过引用合并入本文中。达贝泊汀是一种高糖基化促红细胞生成素 类似物,其在rHuEPO的氨基酸序列中具有5处变化。提供两个附加的碳水化合物链。更具 体地,α达贝泊汀在氨基酸残基30和88处包含两个附加的N-连接的碳水化合物链。达贝 泊汀和其他促红细胞生成素类似物的示例性序列、制备、纯化和用途描述在大量的专利公 开书中,包括 Strickland 等,91/05867, Elliott 等,WO 95/05465, Egrie 等,WO 00/24893, 和Egrie等WO 01/81405,它们每一篇的全部公开内容通过引用合并入本文中。天然存在 的多肽或多肽类似物的衍生物包括已经被化学修饰,例如从而连接水溶性聚合物(例如, 聚乙二醇化)、放射性核素或其他诊断或靶向或治疗用结构部分的那些。
[0093] 术语"红细胞生成活性"是指如在体内测定,例如小鼠脱水性红细胞增多测定 (exhypoxic polycythemic mouse assay)中所证明的刺激红细胞生成的活性。参见,例如, Cotes 和 Bangham, Nature 191:1065 (1961)〇
[0094] 如本文所使用的"载体"包括药学可接受的载体、赋形剂、或稳定剂,它们在所采用 的剂量和浓度下对暴露于其的细胞或哺乳动物是无毒性的。生理学可接受的载体通常是PH 缓冲水溶液。生理学可接受的载体的实例包括缓冲液诸如磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸; 抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(小于约10个残基)多肽;蛋白质,诸如血清白蛋白、明 胶或免疫球蛋白;亲水聚合物诸如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸诸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰 胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、二糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂诸 如EDTA ;糖醇诸如甘露醇或山梨醇;形成盐的抗衡离子诸如钠;和/或非离子表面活性剂 诸如 TWEEN?聚乙二醇(PEG)和 PLUR0NICS?。
[0095] 如本文使用的"标记"是指可检测到的化合物或组合物,其与抗体直接或间接缀合 以便生成"标记的"抗体。该标记可以本身是可检测到的(例如,放射性同位素标记或荧光 标记),或者,在酶标记的情况下,可以催化底物化合物或组合物的化学改变,该改变是可检 测到的。
[0096] 如本文所使用的术语"带标签的表位"是指一种嵌合多肽,其包含与"标签多肽"融 合的多肽。所述标签多肽具有足够的残基从而提供这样的表位,针对所述表位可以制备抗 体,然而其又足够短使得其不会干扰与其融合的多肽的活性。标签多肽也优选是相当独特 的使得该抗体基本上不会与其他表位交叉反应。合适的标签多肽通常具有至少6个氨基酸 残基,并且通常具有约8-50个氨基酸残基(优选地,约10-20个氨基酸残基)。
[0097] "小分子"在本文中被定义为具有低于约500道尔顿的分子量。
[0098] 术语"核酸"和"多核苷酸"在本文中可以互换使用,其指单链或双链RNA、DNA、PNA 或混合的聚合物。多核苷酸可以包括基因组序列、基因组外和质粒序列,和较小的改造的基 因区段,它们表达或可以适于表达多肽。
[0099] "分离的核酸"是基本上与其他基因组DNA序列以及天然地伴随天然序列的蛋白质 或复合物诸如核糖体和聚合酶分开的核酸。该术语包涵已经从其天然存在的环境中移除的 核酸序列,并且包括重组的或克隆的DNA分离物和化学合成的类似物或由异源系统生物合 成的类似物。基本上纯的核酸包括所述核酸的分离形式。当然,这指初步分离的核酸并且 不排除后来被人工地添加至所述分离的核酸中的基因或序列。
[0100] 术语"多肽"以其常规含义使用,即,用作氨基酸的序列。多肽不限于具体长度的产 物。肽、寡肽和蛋白质包括在多肽的定义内,并且这些术语在本文中可以互换使用,除非另 外具体指明。此术语也不指或不包括多肽的表达后修饰,例如,糖基化、乙酰化、磷酸化等, 以及本领域中已知的其他修饰作用,无论天然存在的和非天然存在的。多肽可以是整个蛋 白,或其子序列。在本发明的背景下感兴趣的特定多肽是包含CDRs并且能够结合抗原或甲 型流感感染的细胞的氨基酸子序列。
[0101] "分离的多肽"是已经被鉴定和与其天然环境的组分分开和/或从其天然环境的组 分中回收的多肽。在优选的实施方案中,分离的多肽将(1)如通过Lowry法测定,被纯化至 大于95重量%多肽,和最优选大于99重量% ; (2)通过利用自旋杯序列分析仪被纯化至足 以获得N末端或内部氨基酸序列的至少15个残基的程度;或(3)在还原或非还原条件下使 用考马斯蓝或优选地银染通过SDS-PAGE被纯化至均质。分离的多肽包括重组细胞内的原 位多肽,因为不存在该多肽的天然环境的至少一个组分。然而,通常,分离的多肽将通过至 少一个纯化步骤制备。
[0102] "天然序列"多核苷酸是具有与来源于自然界的多核苷酸相同的核苷酸序列的多 核苷酸。"天然序列"多肽是具有与来源于自然界(例如,来自任何物种)的多肽(例如,抗 体)相同的氨基酸序列的多肽。这样的天然序列多核苷酸和多肽可以从自然界中分离,或 可以通过重组或合成手段制备。
[0103] 作为本文中使用的术语,多核苷酸"变体"是典型地与本文具体公开的多核苷酸的 不同之处在于一个或多个置换、缺失、添加和/或插入的多核苷酸。这种变体可以是天然存 在的或可以是合成产生的,例如,通过修饰本发明的多核苷酸序列中的一个或多个并且如 本文所述和/或使用本领域中公知的多种技术评价所编码的多肽的一种或多种生物活性。
[0104] 作为本文中使用的术语,多肽"变体"是典型地与本文具体公开的多肽的不同之处 在于一个或多个置换、缺失、添加和/或插入的多肽。这种变体可以是天然存在的或可以 是合成产生的,例如,通过修饰本发明的上述多肽序列中的一个或多个并且如本文所述和/ 或使用本领域中公知的多种技术评价多肽的一种或多种生物活性。
[0105] 可以在本发明的多核苷酸和多肽的结构中作出修饰作用,并且仍然获得功能分 子,所述功能分子编码具有所需特性的变体或衍生物多肽。当需要改变多肽的氨基酸序列 以建立本发明的多肽的等效的、或甚至改进的变体或一部分时,本领域技术人员将典型地 改变编码DNA序列的一个或多个密码子。
[0106] 例如,在其结合其他多肽(例如,抗原)或细胞的能力没有显著的损失的条件下, 蛋白质结构中的某些氨基酸可以替代为其他的氨基酸。由于是蛋白质的结合能力和特性确 定该蛋白质的生物功能活性,因此可以在蛋白序列中并且当然可以在其基础的DNA编码序 列中作出某些氨基酸序列置换,并且仍然获得了具有类似特性的蛋白质。因此考虑在其生 物效用或活性没有明显的损失的条件下可以在公开的组合物的肽序列或编码所述肽的相 应DNA序列中作出多种改变。
[0107] 在许多情况下,多肽变体将含有一个或多个保守置换。"保守置换"是其中一个氨 基酸被置换为具有类似特性的另一个氨基酸,使得肽化学领域中的技术人员能够预期基本 上不会改变多肽的二级结构和亲水(hydropathic)性质。
[0108] 本领域中已知某些氨基酸可以被具有类似亲水指数(hydropathic index)或评分 的其他氨基酸置换并且仍然产生具有类似生物活性的蛋白质,即,仍然获得生物功能等效 的蛋白质。在作出这些改变时,优选其亲水指数在±2内的氨基酸的置换,特别优选在±1 内的那些,并且甚至更优选在±0. 5内的那些。在本领域中还能够理解,可以基于亲水性有 效地作出类似氨基酸的置换。美国专利4, 554, 101描述,蛋白质的最大局部平均亲水性受 其邻近氨基酸的亲水性支配,其与蛋白质的生物特性相关。
[0109] 如上所概述,因此氨基酸置换通常基于氨基酸侧链取代基的相对相似性,例如,其 疏水性、亲水性、电荷、尺寸等等。考虑到多种前述特征的示例性置换作用是本领域技术人 员所公知的,并且包括:精氨酸和赖氨酸;谷氨酸和天冬氨酸;丝氨酸和苏氨酸;谷氨酰胺 和天冬酰胺;以及缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸。
[0110] 氨基酸置换可以进一步基于残基的极性、电荷、溶解度、疏水性、亲水性和/或两 亲性质来作出。例如,带负电荷的氨基酸包括天冬氨酸和谷氨酸;带正电荷的氨基酸包括 赖氨酸和精氨酸;并且含有不带电荷的极性头基一一具有相似亲水性值一一的氨基酸包括 亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸;甘氨酸和丙氨酸;天冬酰胺和谷氨酰胺;以及丝氨酸、苏氨酸、 苯丙氨酸和酪氨酸。可以代表保守改变的其他组氨基酸包括:(I)ala、pro、gly、glu、asp、 gin、asn、ser、thr ; (2) cys、ser、tyr、thr ; (3) val、ile、leu、met、ala、phe ; (4) lys、arg、 his;和(5)phe、tyr、trp、his。变体还可以,或备选地,包含非保守改变。在优选的实施方 案中,变体多肽与天然序列的不同之处在于5个氨基酸或更少的置换、缺失或添加。变体还 可以(或备选地)通过例如对多肽的免疫原性、二级结构和亲水性质具有最小影响的氨基 酸的缺失或添加来修饰。
[0111] 多肽可以包含蛋白质的N末端处的信号(或前导)序列,其在共同被翻译时或在 翻译后引导蛋白质的迀移。多肽还可以与接头或利于多肽的合成、纯化或鉴定的其他序列 (例如,聚-His)或增强多肽与固相载体的结合的其他序列缀合。例如,多肽可以与免疫球 蛋白Fc区缀合。
[0112] 序列比较的最优比对可以使用生物信息学软件的Lasergene套件(Lasergene suite of bioinformatics software) (DNASTAR, Inc. ,Madison, WI)中的 Megalign 程序 使用缺省参数来进行。此程序体现了下列参考文献中所述的几种比对方案:Dayhoff,M. 0. (1978)A model of evolutionary change in proteins-Matri
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